Datasets:

scikit-fingerprints
/

TDC_carcinogens_lagunin

SMILES string	Y int64
CC(CCl)OC(C)CCl	1
COc1ccc(C(=O)/C(Br)=C\C(=O)O)cc1	1
O=S(=O)(O)c1cc(S(=O)(=O)O)c2c(/N=N/c3ccccc3)c(O)ccc2c1	1
O=S(=O)(O)c1ccc(/N=N/c2cc(S(=O)(=O)O)c3ccccc3c2O)c2ccccc12	1
ClCc1ccccn1	1
NCCNc1cccc2ccccc12	1
O=S(=O)(O)c1ccc(/N=N/c2c(O)ccc3cc(S(=O)(=O)O)ccc23)cc1	1
Nc1ccc(/N=N/c2ccc(-c3ccc(/N=N/c4c(S(=O)(=O)O)cc5cc(S(=O)(=O)O)c(/N=N/c6ccccc6)c(O)c5c4N)cc3)cc2)c(N)c1	1
Nc1cc(S(=O)(=O)O)cc2cc(S(=O)(=O)O)c(/N=N/c3ccc(-c4ccc(/N=N/c5c(S(=O)(=O)O)cc6cc(S(=O)(=O)O)cc(N)c6c5O)cc4)cc3)c(O)c12	1
CC1(C)SC2C(NC(=O)[C@H](N)c3ccccc3)C(=O)N2[C@@H]1C(=O)O	1
N=C1C=CC(=C(c2ccc(N)cc2)c2ccc(N)cc2)C=C1	1
O=C/C=C\O	1
C[C@](N)(Cc1ccc(O)c(O)c1)C(=O)O	1
C=CCNN	1
CCC1NC(=O)C2C(Cl)C(Cl)CN2C(=O)C(C(C)O)NC(=O)CC(c2ccccc2)NC(=O)C(CO)NC1=O	1
CCCCNNCCCC	1
CCCCNN	1
CCN(Cc1cccc(S(=O)(=O)O)c1)c1ccc(C(=C2C=CC(=[N+](CC)Cc3cccc(S(=O)(=O)[O-])c3)C=C2)c2ccc(N(C)C)cc2)cc1	1
Cc1cc(C)c(/N=N/c2cc(S(=O)(=O)O)c3ccccc3c2O)c(S(=O)(=O)O)c1	1
O=S(=O)(O)c1ccc2c(/N=N/c3ccc(S(=O)(=O)O)c4ccccc34)c(O)c(S(=O)(=O)O)cc2c1	1
Cc1cc(C)c(/N=N/c2c(O)c(S(=O)(=O)O)cc3cc(S(=O)(=O)O)ccc23)cc1C	1
Cc1ccc(/N=N/c2c(O)c(S(=O)(=O)O)cc3cc(S(=O)(=O)O)ccc23)c(C)c1	1
CCN(Cc1cccc(S(=O)(=O)O)c1)c1ccc(C(=C2C=CC(=[N+](CC)Cc3cccc(S(=O)(=O)[O-])c3)C=C2)c2ccc(S(=O)(=O)O)cc2)cc1	1
CCN(Cc1cccc(S(=O)(=O)O)c1)c1ccc(C(=C2C=CC(=[N+](CC)Cc3cccc(S(=O)(=O)[O-])c3)C=C2)c2ccccc2)cc1	1
CCNN	1
C=C/C1=C/C(C)(C)[C@](C)(OC(C)=O)C(=O)OC/C2=C/CN(C)CC[C@@H](OC1=O)C2=O	1
Cn1cc(C(=O)O)c(=O)c2ccc(/C=C/c3ccc([N+](=O)[O-])o3)nc21	1
CCCCCNN	1
CCCNN	1
CCC1(c2ccccc2)C(=O)N=C(O)NC1=O	1
Nc1nc2c(ncn2[C@H]2CC(O)[C@@H](CO)O2)c(=S)[nH]1	1
CC/N=c1\cc2oc3cc(NCC)c(C)cc3c(-c3ccccc3C(=O)OCC)c-2cc1C	1
Nc1c(F)c(N)c(F)c(F)c1F	1
Cc1ccc(S(=O)(=O)Oc2ccc(/N=N/c3ccc(-c4ccc(/N=N/c5c(O)ccc6cc(S(=O)(=O)O)cc(S(=O)(=O)O)c56)c(C)c4)cc3C)cc2)cc1	1
COc1cc(-c2ccc(/N=N/c3c(S(=O)(=O)O)cc4cc(S(=O)(=O)O)cc(N)c4c3O)c(OC)c2)ccc1/N=N/c1c(S(=O)(=O)O)cc2cc(S(=O)(=O)O)cc(N)c2c1O	1
Cc1cc(C)cc(S(=O)(=O)O)c1	1
Nc1cc(S(=O)(=O)O)cc2cc(S(=O)(=O)O)c(/N=N/c3ccc(-c4ccc(/N=N/c5c(S(=O)(=O)O)cc6cc(S(=O)(=O)O)cc(N)c6c5O)c(O)c4)cc3O)c(O)c12	1
CN(C)c1ccc(/N=N/S(=O)(=O)O)cc1	1
Cc1c(N(C)CS(=O)(=O)O)c(=O)n(-c2ccccc2)n1C	1
CC(=O)Nc1ccc(S(=O)(=O)O)c2cc(S(=O)(=O)O)c(/N=N/c3ccc(/N=N/c4ccc(S(=O)(=O)O)cc4)c4ccc(S(=O)(=O)O)cc34)c(O)c12	1
CCN(Cc1cccc(S(=O)(=O)O)c1)c1ccc(C(=C2C=CC(=[N+](CC)Cc3cccc(S(=O)(=O)[O-])c3)C=C2)c2ccccc2S(=O)(=O)O)cc1	1
O=C1/C(=C2\Nc3ccc(S(=O)(=O)O)cc3C2=O)Nc2ccc(S(=O)(=O)O)cc21	1
CC(O)CNC(=O)N(N=O)C(C)Cl	1
C=CCNNCC=C	1
CCC(OC(C)=O)C(CC(C)N(C)C)(c1ccccc1)c1ccccc1	1
CN(C)CCN(CCN=O)C(N)=O	1
CCCCCCCCCCCCNC(=N)N	1
C#C[C@@]1(O)CC[C@]2(C)[C@]1(C)CC[C@]1(C)c3ccc(O)cc3CC[C@]12C	1
CCN(Cc1cccc(S(=O)(=O)O)c1)c1ccc(C(=C2C=CC(=[N+](CC)Cc3cccc(S(=O)(=O)[O-])c3)C=C2)c2ccc(O)cc2S(=O)(=O)O)cc1	1
CCN(CC)CCCNC(=O)Cn1ncc(-c2ccccc2)c1-c1ccccc1	1
CNCCc1ccc(OC(=O)C(C)C)c(OC(=O)C(C)C)c1	1
O=NCNc1ncnc2[nH]cnc12	1
Cc1ccc(S(=O)(=O)OCC(N)CN=O)cc1	1
CC(O)CN(C)c1ccc(NN)nn1	1
Cc1ccccc1OCC(O)CNCCn1cc(C)c(=O)[nH]c1=O	1
O=S(=O)(O)c1cc(S(=O)(=O)O)c2c(/N=N\c3ccc(S(=O)(=O)O)c4ccccc34)c(O)ccc2c1	1
O=S(=O)(O)c1c(/N=N/c2c(O)ccc3ccccc23)ccc2ccccc12	1
CC(=O)C(/N=N\c1ccc(Cl)cc1Cl)C(=O)Nc1ccc(-c2ccc(NC(=O)C(/N=N/c3ccc(Cl)cc3Cl)C(C)=O)c(C)c2)cc1C	1
O=C(O)C1=NN(c2ccc(S(=O)(=O)O)cc2)C(=O)C1/N=N/c1ccc(S(=O)(=O)O)cc1	1
CN1C2CCC1CC(NC(=O)c1cc(Cl)cc3c1OC(C)(C)C3)C2	1
CC(=O)Nc1cc2ccccc2oc1=O	0
CCN1C[C@@]2(COC)C3[C@@H](OC)[C@H]4[C@@H]1[C@@]3(C1C[C@@]3(O)[C@H](OC(=O)c5ccccc5)C1[C@]4(OC(C)=O)[C@@H](O)[C@H]3OC)[C@@H](OC)C[C@H]2O	0
COC(=O)C1=CO[C@@H](C)[C@H]2CN3CCc4c([nH]c5ccccc45)[C@@H]3C[C@H]12	0
CC[C@H](CC[C@@H](C)[C@H]1CC[C@H]2[C@@H]3CC=C4C[C@@H](O)CC[C@]4(C)[C@H]3CC[C@@]21C)C(C)C	0
CO[C@@]1(NC(=O)Cc2cccs2)C(=O)N2C(C(=O)O)=C(COC(N)=O)CS[C@@H]21	0
Cc1c(N)c(=O)n(-c2ccccc2)n1C	0
CC[C@@H](C(=O)[C@@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)CCc1ccc(C)c(O)c1C(=O)O)[C@H]1O[C@](CC)([C@H]2CC[C@](O)(CC)[C@H](C)O2)C[C@@H]1C	0
CC1(C)[C@@H](OC(=O)CCC(=O)O)CC[C@@]2(C)[C@H]1CC[C@]1(C)[C@@H]2C(=O)C=C2[C@@H]3C[C@@](C)(C(=O)O)CC[C@]3(C)CC[C@]21C	0
CO[C@@]1(NC(=O)CSCC#N)C(=O)N2C(C(=O)O)=C(CSc3nnnn3C)CS[C@@H]21	0
Cn1nnnc1SCC1=C(C(=O)O)N2C(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](O)c3ccccc3)[C@H]2SC1	0
CCC(=O)OC1(C(=O)CCl)[C@@H](C)C[C@H]2[C@@H]3CCC4=CC(=O)C=C[C@]4(C)[C@@]3(F)[C@@H](O)C[C@@]21C	0
CCCC(=O)Nc1ncnc2c1ncn2[C@@H]1O[C@@H]2OP(=O)(O)OC[C@H]2[C@H]1OC(=O)CCC	0
CO[C@@]1(NC(=O)[C@H](C(=O)O)c2ccc(O)cc2)C(=O)N2C(C(=O)O)=C(CSc3nnnn3C)CO[C@@H]21	0
CCCCCN(CCCCC)C(=O)C(CCC(=O)O)NC(=O)c1ccc(Cl)c(Cl)c1	0
CNCC(O)C(O)C(O)C(O)CO	0
Nc1nc2[nH]nnc2c(=O)[nH]1	0
Cn1cnc([N+](=O)[O-])c1Sc1ncnc2[nH]cnc12	0
CC1(C)S[C@@H]2[C@H](NC(=O)[C@H](NC(=O)N3CCNC3=O)c3ccccc3)C(=O)N2[C@H]1C(=O)O	0
CN(C)CCC(c1ccc(Cl)cc1)c1ccccn1	0
NCCC(O)C(=O)N[C@@H]1C[C@H](N)[C@@H](OC2O[C@H](CN)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]2N)[C@H](OC2O[C@H](CO)C(O)[C@H]2O)[C@H]1O	0
CN(C)[C@@H]1C(O)=C(C(N)=O)C(=O)[C@@]2(O)C(O)=C3C(=O)c4c(O)ccc(Cl)c4[C@@](C)(O)C3C[C@@H]12	0
C=C[C@H]1CN2CC[C@H]1C[C@H]2[C@H](O)c1ccnc2ccccc12	0
C/C(=C(\CCOP(=O)(O)O)SC(=O)c1ccccc1)N(C=O)Cc1cnc(C)nc1N	0
C[C@H]1[C@H]2[C@H](C[C@H]3[C@@H]4CC[C@H]5C[C@@H](O)CC[C@]5(C)[C@H]4CC(=O)[C@@]32C)O[C@]12CC[C@@H](C)CO2	0
C[C@H](CCC(=O)O)[C@H]1CC[C@H]2[C@@H]3CC[C@@H]4C[C@H](O)CC[C@]4(C)[C@H]3CC[C@@]21C	0
CNC(C)(C)Cc1ccccc1	0
C=C(C)[C@@H]1CC[C@]2(C(=O)O)CC[C@]3(C)[C@H](CC[C@@H]4[C@@]5(C)CC[C@H](O)C(C)(C)[C@@H]5CC[C@]43C)[C@@H]12	0
CN1CCc2cc3c(cc2[C@H]1[C@@H]1OC(=O)c2c1ccc1c2OCO1)OCO3	0
CC1(O)CCOC(=O)C1	0
CC[C@@]1([C@@H]2O[C@@H]([C@H]3O[C@@](O)(CO)[C@H](C)C[C@@H]3C)C[C@@H]2C)CC[C@H]([C@]2(C)CC[C@]3(C[C@H](O)[C@@H](C)[C@@H]([C@@H](C)[C@@H](OC)[C@H](C)C(=O)O)O3)O2)O1	0
O=C1OC2(c3cc(Br)c(O)cc3Oc3c2cc(Br)c(O)c3[Hg]O)c2ccccc21	0
O=C(/C=C/c1ccc(O)c(O)c1)O[C@@H]1C[C@](O)(C(=O)O)C[C@@H](O)[C@H]1O	0
C[C@]12CC[C@H]3[C@@H](CC[C@]4(O)C[C@@H](O)CC[C@]34C=O)[C@@]1(O)CC[C@@H]2C1=CC(=O)OC1	0
COc1ccc(C(=O)OC2C[C@H]3CC[C@H](C2)N3C)cc1OC	0
OC(CCN1CCCCC1)(c1ccccc1)c1ccccc1	0
O=c1cccc2n1C[C@@H]1CNC[C@H]2C1	0
C=C(C)[C@@H]1C2C(=O)O[C@H]1[C@H]1OC(=O)[C@@]34OC3C[C@]2(O)[C@@]14C	0
COc1ccc(C(=O)/C(Br)=C\C(=O)O)cc1	0
CC1=CC(=O)C2=C(C)C[C@H](O)[C@H]3[C@H](C)C(=O)O[C@@H]3[C@@H]12	0
CCN1C[C@]2(COC)CC[C@H](OC)[C@@]34C1[C@]1(OCO[C@@]15C[C@H](OC)[C@H]1C[C@@H]3[C@@H]5[C@H]1OC)[C@@H](O)[C@H]24	0

End of preview. Expand in Data Studio

TDC Carcinogens Lagunin

Carcinogens Lagunin dataset dataset [1] [2], part of TDC [3] benchmark. It is intended to be used through scikit-fingerprints library.

The task is to predict whether the drug is a carcinogen.

Characteristic	Description
Tasks	1
Task type	classification
Total samples	280
Recommended split	scaffold
Recommended metric	AUROC

References

[1] Lagunin, Alexey, et al. Computer-Aided Prediction of Rodent Carcinogenicity by PASS and CISOC-PSCT" QSAR & Combinatorial Science 28.8 (2009): 806-810 https://doi.org/10.1002/qsar.200860192

[2] Cheng, Feixiong, et al. "admetSAR: A Comprehensive Source and Free Tool for Assessment of Chemical ADMET Properties" Journal of Chemical Information and Modeling 52.11 (2012): 2840-2847 https://doi.org/10.1021/ci300367a

[3] Huang, Kexin, et al. "Therapeutics Data Commons: Machine Learning Datasets and Tasks for Drug Discovery and Development" Proceedings of Neural Information Processing Systems, NeurIPS Datasets and Benchmarks, 2021 https://openreview.net/forum?id=8nvgnORnoWr

Downloads last month: 153

Size of downloaded dataset files:

17 kB

Size of the auto-converted Parquet files:

9.91 kB

Number of rows:

280