tokens
listlengths 1
179
| ner_tags
listlengths 1
179
|
---|---|
[
"Palmoplantar",
"pustulosis",
"(",
"PPP",
")",
"is",
"a",
"recalcitrant",
"chronic",
"inflammatory",
"skin",
"disease",
"."
] |
[
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O"
] |
[
"Data",
"relevant",
"for",
"the",
"medical",
"care",
"of",
"patients",
"with",
"PPP",
"are",
"scarce",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"I-T033",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"the",
"aim",
"of",
"this",
"work",
"was",
"to",
"investigate",
"the",
"disease",
"burden",
",",
"clinical",
"characteristics",
",",
"and",
"comorbidity",
"of",
"PPP",
"patients",
"in",
"Germany",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"B-T082",
"O"
] |
[
"PPP",
"patients",
"were",
"examined",
"in",
"a",
"crosssectional",
"study",
"at",
"seven",
"specialized",
"psoriasis",
"centers",
"in",
"Germany",
"."
] |
[
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T082",
"O"
] |
[
"Of",
"the",
"172",
"included",
"patients",
"with",
"PPP",
",",
"79.1",
"%",
"were",
"female",
"and",
"69.8",
"%",
"were",
"smokers",
".In",
"addition",
",",
"25.0",
"%",
"suffered",
"from",
"psoriasis",
"vulgaris",
",",
"28.2",
"%",
"had",
"documented",
"psoriatic",
"arthritis",
",",
"and",
"30.2",
"%",
"had",
"a",
"family",
"history",
"of",
"psoriasis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T098",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"I-T033",
"I-T033",
"I-T033",
"O"
] |
[
"In",
"77",
"patients",
"the",
"mean",
"Dermatology",
"Life",
"Quality",
"Index",
"(",
"DLQI",
")",
"was",
"12.2",
"±",
"7.7",
"(",
"mean",
"±",
"SD",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T170",
"I-T170",
"I-T170",
"I-T170",
"O",
"B-T170",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mean",
"Psoriasis",
"Palmoplantar",
"Pustulosis",
"Area",
"and",
"Severity",
"Index",
"(",
"PPPASI",
")",
"was",
"12.6",
"±",
"8.6",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T038",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"PPP",
"patients",
"had",
"previously",
"received",
"an",
"average",
"of",
"2.6",
"±",
"2.1",
"different",
"anti",
"-",
"psoriatic",
"systemic",
"drugs",
"or",
"UV",
"-",
"therapies",
"."
] |
[
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"I-T058",
"O"
] |
[
"The",
"systemic",
"drugs",
"that",
"had",
"been",
"used",
"most",
"frequently",
"were",
"corticosteroids",
"in",
"40.1",
"%",
"of",
"patients",
",",
"followed",
"by",
"acitretin",
"(",
"37.8",
"%",
")",
",",
"and",
"methotrexate",
"(",
"27.9",
"%",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"PPPASI",
"was",
"13.4",
"±",
"8.9",
"in",
"patients",
"without",
"current",
"systemic",
"therapy",
"and",
"10.4",
"±",
"7.9",
"in",
"patients",
"with",
"systemic",
"therapy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"O"
] |
[
"Many",
"PPP",
"patients",
"had",
"a",
"concomitant",
"diagnosis",
"of",
"psoriasis",
"vulgaris",
"and/or",
"psoriatic",
"arthritis",
"or",
"had",
"a",
"family",
"history",
"of",
"psoriasis",
"."
] |
[
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"I-T033",
"I-T033",
"I-T033",
"O"
] |
[
"Despite",
"the",
"fact",
"that",
"many",
"of",
"the",
"patients",
"were",
"using",
"anti",
"-",
"psoriatic",
"therapies",
",",
"there",
"was",
"still",
"a",
"high",
"burden",
"of",
"disease",
"within",
"this",
"PPP",
"cohort",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"insufficient",
"control",
"of",
"symptoms",
"demonstrates",
"the",
"urgent",
"need",
"for",
"new",
"PPP",
"treatments",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"I-T058",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"B-T058",
"O"
] |
[
"Platelet",
"proteome",
"reveals",
"novel",
"pathways",
"of",
"platelet",
"activation",
"and",
"platelet",
"-",
"mediated",
"immunoregulation",
"in",
"dengue"
] |
[
"B-T017",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"B-T038"
] |
[
"Dengue",
"is",
"the",
"most",
"prevalent",
"human",
"arbovirus",
"disease",
"worldwide",
"."
] |
[
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"B-T082",
"O"
] |
[
"Dengue",
"virus",
"(",
"DENV",
")",
"infection",
"causes",
"syndromes",
"varying",
"from",
"self",
"-",
"limiting",
"febrile",
"illness",
"to",
"severe",
"dengue",
"."
] |
[
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O"
] |
[
"Although",
"dengue",
"pathophysiology",
"is",
"not",
"completely",
"understood",
",",
"it",
"is",
"widely",
"accepted",
"that",
"increased",
"inflammation",
"plays",
"important",
"roles",
"in",
"dengue",
"pathogenesis",
"."
] |
[
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"B-T038",
"O"
] |
[
"Platelets",
"are",
"blood",
"cells",
"classically",
"known",
"as",
"effectors",
"of",
"hemostasis",
"which",
"have",
"been",
"increasingly",
"recognized",
"to",
"have",
"major",
"immune",
"and",
"inflammatory",
"activities",
"."
] |
[
"B-T017",
"O",
"B-T017",
"I-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Nevertheless",
",",
"the",
"phenotype",
"and",
"effector",
"functions",
"of",
"platelets",
"in",
"dengue",
"pathogenesis",
"are",
"not",
"completely",
"understood",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T017",
"O",
"B-T038",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"used",
"quantitative",
"proteomics",
"to",
"investigate",
"the",
"protein",
"content",
"of",
"platelets",
"in",
"clinical",
"samples",
"from",
"patients",
"with",
"dengue",
"compared",
"to",
"platelets",
"from",
"healthy",
"donors",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"B-T098",
"O"
] |
[
"Our",
"assays",
"revealed",
"a",
"set",
"of",
"252",
"differentially",
"abundant",
"proteins",
"."
] |
[
"O",
"B-T058",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O"
] |
[
"In",
"silico",
"analyses",
"associated",
"these",
"proteins",
"with",
"key",
"molecular",
"events",
"including",
"platelet",
"activation",
"and",
"inflammatory",
"responses",
",",
"and",
"with",
"events",
"not",
"previously",
"attributed",
"to",
"platelets",
"during",
"dengue",
"infection",
"including",
"antigen",
"processing",
"and",
"presentation",
",",
"proteasome",
"activity",
",",
"and",
"expression",
"of",
"histones",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"B-T038",
"B-T038",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"B-T103",
"O"
] |
[
"From",
"these",
"results",
",",
"we",
"conducted",
"functional",
"assays",
"using",
"samples",
"from",
"a",
"larger",
"cohort",
"of",
"patients",
"and",
"demonstrated",
"evidence",
"for",
"platelet",
"activation",
"indicated",
"by",
"P",
"-",
"selectin",
"(",
"CD62P",
")",
"translocation",
"and",
"secretion",
"of",
"granule",
"-",
"stored",
"chemokines",
"by",
"platelets",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T098",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"B-T033",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T038",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T017",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"we",
"found",
"evidence",
"that",
"DENV",
"infection",
"triggers",
"HLA",
"class",
"I",
"synthesis",
"and",
"surface",
"expression",
"by",
"a",
"mechanism",
"depending",
"on",
"functional",
"proteasome",
"activity",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"B-T082",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"we",
"demonstrate",
"that",
"cell",
"-",
"free",
"histone",
"H2A",
"released",
"during",
"dengue",
"infection",
"binds",
"to",
"platelets",
",",
"increasing",
"platelet",
"activation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"B-T038",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O"
] |
[
"These",
"findings",
"are",
"consistent",
"with",
"functional",
"importance",
"of",
"HLA",
"class",
"I",
",",
"proteasome",
"subunits",
",",
"and",
"histones",
"that",
"we",
"found",
"exclusively",
"in",
"proteome",
"analysis",
"of",
"platelets",
"in",
"samples",
"from",
"dengue",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"study",
"provides",
"the",
"first",
"in",
"-",
"depth",
"characterization",
"of",
"the",
"platelet",
"proteome",
"in",
"dengue",
",",
"and",
"sheds",
"light",
"on",
"new",
"mechanisms",
"of",
"platelet",
"activation",
"and",
"platelet",
"-",
"mediated",
"immune",
"and",
"inflammatory",
"responses",
"."
] |
[
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T103",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O"
] |
[
"Compensatory",
"and",
"decompensatory",
"alterations",
"in",
"cardiomyocyte",
"Ca(2",
"+",
")",
"dynamics",
"in",
"hearts",
"with",
"diastolic",
"dysfunction",
"following",
"aortic",
"banding"
] |
[
"O",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T017",
"B-T058"
] |
[
"At",
"the",
"cellular",
"level",
"cardiac",
"hypertrophy",
"causes",
"remodelling",
",",
"leading",
"to",
"changes",
"in",
"ionic",
"channel",
",",
"pump",
"and",
"exchanger",
"densities",
"and",
"kinetics",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Previous",
"studies",
"have",
"focused",
"on",
"quantifying",
"changes",
"in",
"channels",
",",
"pump",
"s",
"and",
"exchangers",
"without",
"quantitatively",
"linking",
"these",
"changes",
"with",
"emergent",
"cellular",
"scale",
"functionality",
"."
] |
[
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O"
] |
[
"Two",
"biophysical",
"cardiac",
"cell",
"models",
"were",
"created",
",",
"parameterized",
"and",
"validated",
"and",
"are",
"able",
"to",
"simulate",
"electrophysiology",
"and",
"calcium",
"dynamics",
"in",
"myocytes",
"from",
"control",
"sham",
"operated",
"rats",
"and",
"aortic",
"-",
"banded",
"rats",
"exhibiting",
"diastolic",
"dysfunction",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T017",
"I-T017",
"B-T170",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"O",
"B-T017",
"O",
"B-T058",
"B-T204",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O"
] |
[
"The",
"contribution",
"of",
"each",
"ionic",
"pathway",
"to",
"the",
"calcium",
"kinetics",
"was",
"calculated",
",",
"identifying",
"the",
"L",
"-",
"type",
"Ca(2",
"+",
")",
"channel",
"and",
"sarco",
"/",
"endoplasmic",
"reticulum",
"Ca(2",
"+",
")",
"ATPase",
"as",
"the",
"principal",
"regulators",
"of",
"systolic",
"and",
"diastolic",
"Ca(2",
"+",
")",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Results",
"show",
"that",
"the",
"ability",
"to",
"dynamically",
"change",
"systolic",
"Ca(2",
"+",
")",
",",
"through",
"changes",
"in",
"expression",
"of",
"key",
"Ca(2",
"+",
")",
"modelling",
"protein",
"densities",
",",
"is",
"drastically",
"reduced",
"following",
"the",
"aortic",
"banding",
"procedure",
";",
"however",
"the",
"cells",
"are",
"able",
"to",
"compensate",
"Ca(2",
"+",
")",
"homeostasis",
"in",
"an",
"efficient",
"way",
"to",
"minimize",
"systolic",
"dysfunction",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"B-T062",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T058",
"I-T058",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O"
] |
[
"Elevated",
"left",
"ventricular",
"afterload",
"leads",
"to",
"myocardial",
"hypertrophy",
",",
"diastolic",
"dysfunction",
",",
"cellular",
"remodelling",
"and",
"compromised",
"calcium",
"dynamics",
"."
] |
[
"B-T033",
"I-T033",
"I-T033",
"I-T033",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O"
] |
[
"At",
"the",
"cellular",
"scale",
"this",
"remodelling",
"of",
"the",
"ionic",
"channels",
",",
"pumps",
"and",
"exchangers",
"gives",
"rise",
"to",
"changes",
"in",
"the",
"Ca(2",
"+",
")",
"transient",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"the",
"relative",
"roles",
"of",
"the",
"underlying",
"subcellular",
"processes",
"and",
"the",
"positive",
"or",
"negative",
"impact",
"of",
"each",
"remodelling",
"mechanism",
"are",
"not",
"fully",
"understood",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"B-T033",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Biophysical",
"cardiac",
"cell",
"models",
"were",
"created",
"to",
"simulate",
"electrophysiology",
"and",
"calcium",
"dynamics",
"in",
"myocytes",
"from",
"control",
"rats",
"(",
"SHAM",
")",
"and",
"aortic",
"-",
"banded",
"rats",
"exhibiting",
"diastolic",
"dysfunction",
"."
] |
[
"O",
"B-T017",
"I-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"O",
"B-T017",
"O",
"B-T058",
"B-T204",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O"
] |
[
"The",
"model",
"parameters",
"and",
"framework",
"were",
"validated",
"and",
"the",
"fitted",
"parameters",
"demonstrated",
"to",
"be",
"unique",
"for",
"explaining",
"our",
"experimental",
"data",
"."
] |
[
"O",
"B-T170",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"contribution",
"of",
"each",
"ionic",
"pathway",
"to",
"the",
"calcium",
"kinetics",
"was",
"calculated",
",",
"identifying",
"the",
"L",
"-",
"type",
"Ca(2",
"+",
")",
"channel",
"(",
"LCC",
")",
"and",
"the",
"sarco",
"/",
"endoplasmic",
"reticulum",
"Ca(2",
"+",
")",
"-ATPase",
"(",
"SERCA",
")",
"as",
"the",
"principal",
"regulators",
"of",
"systolic",
"and",
"diastolic",
"Ca(2",
"+",
")",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"aortic",
"banding",
"model",
",",
"the",
"sensitivity",
"of",
"systolic",
"Ca(2",
"+",
")",
"to",
"LCC",
"density",
"and",
"diastolic",
"Ca(2",
"+",
")",
"to",
"SERCA",
"density",
"decreased",
"by",
"16",
"-",
"fold",
"and",
"increased",
"by",
"23",
"%",
",",
"respectively",
",",
"relative",
"to",
"the",
"SHAM",
"model",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T058",
"B-T170",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"O"
] |
[
"The",
"energy",
"cost",
"of",
"ionic",
"homeostasis",
"is",
"maintained",
"across",
"the",
"two",
"models",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T170",
"O"
] |
[
"The",
"models",
"predict",
"that",
"changes",
"in",
"ionic",
"pathway",
"densities",
"in",
"compensated",
"aortic",
"banding",
"rats",
"maintain",
"Ca(2",
"+",
")",
"function",
"and",
"efficiency",
"."
] |
[
"O",
"B-T170",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T058",
"B-T204",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"B-T038",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"ability",
"to",
"dynamically",
"alter",
"systolic",
"function",
"is",
"significantly",
"diminished",
",",
"while",
"the",
"capacity",
"to",
"maintain",
"diastolic",
"Ca(2",
"+",
")",
"is",
"moderately",
"increased",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"I-T103",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Sensitivity",
"and",
"Specificity",
"of",
"Plasma",
"ALT",
",",
"ALP",
",",
"and",
"Bile",
"Acids",
"for",
"Hepatitis",
"in",
"Labrador",
"Retrievers"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T038",
"O",
"B-T204",
"I-T204"
] |
[
"Biochemical",
"indicators",
"for",
"diagnosing",
"liver",
"disease",
"are",
"plasma",
"alanine",
"aminotransferase",
"activity",
"(",
"ALT",
")",
",",
"alkaline",
"phosphatase",
"activity",
"(",
"ALP",
")",
",",
"and",
"bile",
"acid",
"concentration",
"(",
"BA",
")",
"."
] |
[
"B-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T033",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"I-T058",
"O",
"B-T103",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"determine",
"the",
"sensitivity",
"and",
"specificity",
"of",
"ALT",
",",
"ALP",
",",
"and",
"BA",
"for",
"detecting",
"primary",
"hepatitis",
"(",
"PH",
")",
"in",
"clinically",
"healthy",
"Labrador",
"retrievers",
"and",
"investigate",
"whether",
"ALT",
"and",
"ALP",
"can",
"discriminate",
"between",
"dogs",
"with",
"PH",
"and",
"nonspecific",
"reactive",
"hepatitis",
"(",
"RH",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T033",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"191",
"clinically",
"healthy",
"and",
"51",
"clinically",
"ill",
"Labrador",
"retrievers",
"with",
"hepatic",
"histopathology",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"I-T033",
"B-T204",
"I-T204",
"O",
"B-T082",
"O",
"O"
] |
[
"Retrospective",
"study",
"."
] |
[
"B-T062",
"I-T062",
"O"
] |
[
"Medical",
"records",
"were",
"reviewed",
"for",
"ALT",
",",
"ALP",
",",
"preprandial",
"BA",
",",
"liver",
"histopathology",
",",
"and",
"hepatic",
"copper",
"concentrations",
"."
] |
[
"B-T170",
"I-T170",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"64",
"%",
"(",
"122/191",
")",
"of",
"the",
"clinically",
"healthy",
"Labrador",
"retrievers",
",",
"hepatic",
"histology",
"revealed",
"inflammatory",
"infiltrates",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"O",
"B-T033",
"I-T033",
"O",
"B-T033",
"I-T033",
"O"
] |
[
"This",
"frequency",
"might",
"be",
"biased",
"because",
"part",
"of",
"them",
"was",
"included",
"as",
"first",
"-",
"line",
"relatives",
"of",
"dogs",
"with",
"copper",
"-",
"associated",
"hepatitis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O"
] |
[
"Sensitivity",
"of",
"ALT",
",",
"ALP",
",",
"and",
"BA",
"in",
"this",
"population",
"for",
"detecting",
"acute",
"hepatitis",
"was",
"45",
",",
"15",
",",
"and",
"15",
"%",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"B-T062",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"For",
"chronic",
"hepatitis",
",",
"sensitivity",
"was",
"71",
",",
"35",
",",
"and",
"13",
"%",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Specificity",
"of",
"ALT",
",",
"ALP",
",",
"and",
"BA",
"was",
">",
"90",
"%",
"for",
"AH",
",",
"CH",
",",
"and",
"RH",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"When",
"increased",
"liver",
"enzymes",
"were",
"present",
",",
"median",
"ALT",
"was",
"significantly",
"higher",
"in",
"PH",
"cases",
"(",
"312",
"U",
"/",
"L",
",",
"range",
"38",
"-",
"1,369",
")",
"compared",
"to",
"RH",
"cases",
"(",
"91",
"U",
"/",
"L",
",",
"range",
"39",
"-",
"139",
")",
"(",
"P",
"<",
".001",
")",
"."
] |
[
"O",
"B-T033",
"I-T033",
"I-T033",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"There",
"was",
"no",
"difference",
"in",
"ALP",
"between",
"dogs",
"with",
"a",
"PH",
"and",
"a",
"RH",
"(",
"P",
"=",
".361",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Histopathologic",
"abnormalities",
"in",
"the",
"liver",
"were",
"present",
"in",
"the",
"majority",
"of",
"apparent",
"clinically",
"healthy",
"Labrador",
"retrievers",
"."
] |
[
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"O"
] |
[
"The",
"sensitivity",
"of",
"ALT",
",",
"ALP",
",",
"and",
"BA",
"for",
"detecting",
"acute",
"and",
"chronic",
"hepatitis",
"in",
"this",
"population",
"was",
"low",
"."
] |
[
"O",
"B-T062",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"More",
"sensitive",
"biomarkers",
"are",
"needed",
"for",
"early",
"detection",
"of",
"liver",
"disease",
"in",
"apparent",
"clinically",
"healthy",
"dogs",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"O"
] |
[
"A",
"Conserved",
"Role",
"for",
"VEGF",
"Signaling",
"in",
"Specification",
"of",
"Homologous",
"Mesenchymal",
"Cell",
"Types",
"Positioned",
"at",
"Spatially",
"Distinct",
"Developmental",
"Addresses",
"in",
"Early",
"Development",
"of",
"Sea",
"Urchins"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T017",
"I-T017",
"B-T082",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"B-T082",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T204",
"I-T204"
] |
[
"Comparative",
"studies",
"of",
"early",
"development",
"in",
"echinoderms",
"are",
"revealing",
"the",
"tempo",
"and",
"mode",
"of",
"alterations",
"to",
"developmental",
"gene",
"regulatory",
"networks",
"and",
"to",
"the",
"cell",
"types",
"they",
"specify",
"."
] |
[
"B-T062",
"I-T062",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"I-T017",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"euechinoid",
"sea",
"urchins",
",",
"skeletogenic",
"mesenchyme",
"(",
"SM",
")",
"ingresses",
"prior",
"to",
"gastrulation",
"at",
"the",
"vegetal",
"pole",
"and",
"aligns",
"into",
"a",
"ring",
"-",
"like",
"array",
"with",
"two",
"bilateral",
"pockets",
"of",
"cells",
",",
"the",
"sites",
"where",
"spiculogenesis",
"will",
"later",
"occur",
"."
] |
[
"O",
"B-T204",
"B-T204",
"I-T204",
"O",
"B-T017",
"I-T017",
"O",
"B-T017",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T082",
"I-T082",
"I-T082",
"I-T082",
"O",
"O",
"B-T082",
"B-T017",
"I-T017",
"I-T017",
"O",
"O",
"B-T082",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"cidaroid",
"sea",
"urchins",
",",
"the",
"anciently",
"diverged",
"sister",
"clade",
"to",
"euechinoid",
"sea",
"urchins",
",",
"a",
"homologous",
"SM",
"cell",
"type",
"ingresses",
"later",
"in",
"development",
",",
"after",
"gastrulation",
"has",
"commenced",
",",
"and",
"consequently",
"at",
"a",
"distinct",
"developmental",
"address",
"."
] |
[
"O",
"B-T204",
"B-T204",
"I-T204",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"O",
"B-T204",
"B-T204",
"I-T204",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T017",
"I-T017",
"B-T038",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"B-T082",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"a",
"heterochronic",
"shift",
"of",
"ingression",
"of",
"the",
"SM",
"cell",
"type",
"occurred",
"in",
"one",
"of",
"the",
"echinoid",
"lineages",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T017",
"I-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"euechinoids",
",",
"specification",
"and",
"migration",
"of",
"SM",
"are",
"facilitated",
"by",
"vascular",
"endothelial",
"growth",
"factor",
"(",
"VEGF",
")",
"signaling",
"."
] |
[
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O"
] |
[
"We",
"describe",
"spatiotemporal",
"expression",
"of",
"vegf",
"and",
"vegfr",
"and",
"experimental",
"manipulations",
"targeting",
"VEGF",
"signaling",
"in",
"the",
"cidaroid",
"Eucidaris",
"tribuloides",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"O"
] |
[
"Spatially",
",",
"vegf",
"and",
"vegfr",
"mRNA",
"localizes",
"similarly",
"as",
"in",
"euechinoids",
",",
"suggesting",
"conserved",
"deployment",
"in",
"echinoids",
"despite",
"their",
"spatially",
"distinct",
"development",
"addresses",
"of",
"ingression",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"B-T103",
"B-T103",
"B-T082",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"B-T082",
"O",
"B-T038",
"O"
] |
[
"Inhibition",
"of",
"VEGF",
"signaling",
"in",
"E.",
"tribuloides",
"suggests",
"its",
"role",
"in",
"SM",
"specification",
"is",
"conserved",
"in",
"echinoids",
"."
] |
[
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"O"
] |
[
"Temporal",
"discrepancies",
"between",
"the",
"onset",
"of",
"vegf",
"expression",
"and",
"SM",
"ingression",
"likely",
"result",
"in",
"previous",
"observations",
"of",
"SM",
"\"",
"random",
"wandering",
"\"",
"behavior",
"."
] |
[
"B-T082",
"B-T033",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"B-T038",
"O",
"B-T017",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"indicate",
"that",
",",
"although",
"the",
"SM",
"cell",
"type",
"in",
"echinoids",
"ingresses",
"into",
"distinct",
"developmental",
"landscapes",
",",
"it",
"retains",
"a",
"signaling",
"mechanism",
"that",
"restricts",
"their",
"spatial",
"localization",
"to",
"a",
"conserved",
"developmental",
"address",
"where",
"spiculogenesis",
"later",
"occurs",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T017",
"I-T017",
"O",
"B-T204",
"B-T038",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"B-T082",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Epistatic",
"influence",
"in",
"tomato",
"Ve1",
"-",
"mediated",
"resistance"
] |
[
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"B-T038"
] |
[
"Resistance",
"to",
"Verticillium",
"wilt",
"disease",
"is",
"associated",
"with",
"the",
"tomato",
"Ve",
"-",
"locus",
";",
"however",
",",
"the",
"individual",
"functional",
"roles",
"of",
"Ve1",
"and",
"Ve2",
"in",
"host",
"plants",
"remain",
"controversial",
"."
] |
[
"B-T038",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"I-T017",
"I-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"As",
"a",
"first",
"step",
"towards",
"Ve",
"mutational",
"analyses",
"in",
"planta",
",",
"the",
"Ve1",
"coding",
"region",
"from",
"a",
"resistant",
"tomato",
"near",
"-",
"isoline",
"(",
"cv",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"I-T058",
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T103",
"I-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"35S",
":",
"Ve1",
"plants",
"segregated",
"into",
"two",
"distinct",
"classes",
";",
"roughly",
"half",
"were",
"resistant",
"and",
"half",
"were",
"susceptible",
"."
] |
[
"B-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"O",
"O",
"O",
"B-T170",
"I-T170",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Ve1",
"transcript",
"levels",
"were",
"upregulated",
"in",
"both",
"classes",
"compared",
"to",
"wild",
"-",
"type",
"plants",
",",
"showing",
"stable",
"transgenic",
"expression",
"."
] |
[
"B-T017",
"B-T103",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"B-T170",
"O",
"O",
"B-T017",
"I-T017",
"I-T017",
"B-T204",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T038",
"O"
] |
[
"Expression",
"analysis",
"of",
"Ve2",
"revealed",
"that",
"mRNA",
"levels",
"were",
"similar",
"between",
"35S",
":",
"Ve1",
"and",
"wild",
"-",
"type",
"tomatoes",
",",
"demonstrating",
"that",
"Ve1",
"transgene",
"introduction",
"does",
"not",
"alter",
"endogenous",
"Ve2",
"expression",
"."
] |
[
"B-T062",
"I-T062",
"O",
"B-T017",
"O",
"O",
"B-T103",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"O",
"B-T017",
"I-T017",
"I-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T038",
"O"
] |
[
"Overall",
",",
"the",
"results",
"of",
"this",
"study",
"confirm",
"the",
"functional",
"role",
"of",
"Ve1",
"protein",
"in",
"resistance",
"to",
"the",
"vascular",
"fungal",
"pathogen",
"V.",
"dahliae",
"race",
"1",
"(",
"Vd1",
")",
",",
"but",
"suggest",
"that",
"a",
"yet",
"undefined",
"factor",
"exerts",
"an",
"epistatic",
"influence",
"on",
"the",
"Ve1",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T103",
"I-T103",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"B-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"I-T017",
"O"
] |
[
"The",
"impact",
"of",
"noninvasive",
"follicular",
"thyroid",
"neoplasm",
"with",
"papillary",
"-",
"like",
"nuclear",
"features",
"on",
"the",
"performance",
"of",
"the",
"Afirma",
"gene",
"expression",
"classifier"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"I-T062",
"I-T062",
"I-T062"
] |
[
"A",
"recent",
"revision",
"in",
"thyroid",
"tumor",
"nomenclature",
"has",
"resulted",
"in",
"a",
"change",
"from",
"a",
"malignant",
"diagnosis",
"(",
"noninvasive",
"follicular",
"variant",
"of",
"papillary",
"thyroid",
"carcinoma",
")",
"to",
"one",
"that",
"is",
"nonmalignant",
"(",
"noninvasive",
"follicular",
"thyroid",
"neoplasm",
"with",
"papillary",
"-",
"like",
"nuclear",
"features",
"[",
"NIFTP",
"]",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"B-T170",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"objective",
"of",
"the",
"current",
"study",
"was",
"to",
"evaluate",
"the",
"impact",
"of",
"this",
"change",
"on",
"the",
"performance",
"of",
"the",
"Afirma",
"gene",
"expression",
"classifier",
"(",
"GEC",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"I-T062",
"I-T062",
"I-T062",
"O",
"B-T062",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"authors",
"retrospectively",
"analyzed",
"consecutive",
"thyroid",
"fine",
"-",
"needle",
"aspiration",
"specimens",
"with",
"indeterminate",
"diagnoses",
"on",
"which",
"GEC",
"was",
"performed",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T062",
"I-T062",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"I-T058",
"I-T058",
"I-T058",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Surgical",
"pathology",
"material",
"was",
"reviewed",
"with",
"the",
"reclassification",
"of",
"nodules",
"into",
"NIFTP",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T170",
"O",
"B-T017",
"O",
"B-T038",
"O"
] |
[
"GEC",
"testing",
"was",
"performed",
"on",
"384",
"fine",
"-",
"needle",
"aspiration",
"specimens",
"diagnosed",
"as",
"atypia",
"of",
"undetermined",
"significance",
"(",
"AUS",
")",
"(",
"304",
"cases",
")",
"and",
"suspicious",
"for",
"a",
"follicular",
"neoplasm",
"(",
"SFN",
")",
"(",
"80",
"cases",
")",
"and",
"yielded",
"a",
"suspicious",
"result",
"in",
"152",
"of",
"the",
"AUS",
"cases",
"(",
"50",
"%",
")",
"and",
"50",
"of",
"the",
"SFN",
"cases",
"(",
"63",
"%",
")",
"."
] |
[
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"I-T058",
"I-T058",
"O",
"B-T033",
"O",
"B-T033",
"I-T033",
"I-T033",
"I-T033",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"I-T038",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thyroidectomy",
"was",
"performed",
"on",
"177",
"patients",
"."
] |
[
"B-T058",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"After",
"reclassifying",
"NIFTP",
",",
"the",
"positive",
"predictive",
"value",
"of",
"GEC",
"decreased",
"from",
"42",
"%",
"(",
"95",
"%",
"confidence",
"interval",
"[",
"95",
"%",
"CI",
"]",
",",
"39%-45",
"%",
")",
"to",
"24",
"%",
"(",
"95",
"%",
"CI",
",",
"22%-26",
"%",
")",
"in",
"the",
"AUS",
"group",
"and",
"from",
"23",
"%",
"(",
"95",
"%",
"CI",
",",
"19%-27",
"%",
")",
"to",
"13",
"%",
"(",
"95",
"%",
"CI",
",",
"9%-18",
"%",
")",
"in",
"the",
"SFN",
"group",
"."
] |
[
"O",
"B-T170",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O"
] |
[
"Total",
"thyroidectomy",
"was",
"performed",
"more",
"frequently",
"than",
"a",
"partial",
"thyroidectomy",
"in",
"patients",
"with",
"AUS",
"with",
"a",
"suspicious",
"GEC",
"result",
"compared",
"with",
"pre",
"-",
"GEC",
"controls",
"(",
"68",
"%",
"vs",
"49",
"%",
";",
"P",
"=",
".037",
")",
"."
] |
[
"O",
"B-T058",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Reclassification",
"of",
"NIFTP",
"significantly",
"decreases",
"the",
"positive",
"predictive",
"value",
"of",
"GEC",
"in",
"indeterminate",
"thyroid",
"nodules",
"."
] |
[
"B-T170",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T017",
"O"
] |
[
"Nevertheless",
",",
"the",
"majority",
"of",
"patients",
"with",
"indeterminate",
"thyroid",
"nodules",
"with",
"a",
"suspicious",
"GEC",
"result",
"in",
"the",
"study",
"institution",
"have",
"undergone",
"total",
"thyroidectomy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T017",
"B-T017",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"O"
] |
[
"This",
"finding",
"raises",
"concerns",
"over",
"reliance",
"on",
"a",
"suspicious",
"GEC",
"result",
"by",
"clinicians",
"to",
"justify",
"total",
"thyroidectomy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"O"
] |
[
"Behavioral",
"Processes",
"in",
"Long",
"-",
"Lag",
"Intervention",
"Studies"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-T170",
"I-T170",
"I-T170",
"I-T170",
"I-T170"
] |
[
"We",
"argue",
"that",
"psychologists",
"who",
"conduct",
"experiments",
"with",
"long",
"lags",
"between",
"the",
"manipulation",
"and",
"the",
"outcome",
"measure",
"should",
"pay",
"more",
"attention",
"to",
"behavioral",
"processes",
"that",
"intervene",
"between",
"the",
"manipulation",
"and",
"the",
"outcome",
"measure",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Neglect",
"of",
"such",
"processes",
",",
"we",
"contend",
",",
"stems",
"from",
"psychology",
"'s",
"long",
"tradition",
"of",
"short",
"-",
"lag",
"lab",
"experiments",
"where",
"there",
"is",
"little",
"scope",
"for",
"intervening",
"behavioral",
"processes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"I-T062",
"I-T062",
"I-T062",
"I-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Studying",
"process",
"in",
"the",
"lab",
"invariably",
"involves",
"studying",
"psychological",
"processes",
",",
"but",
"in",
"long",
"-",
"lag",
"field",
"experiments",
"it",
"is",
"important",
"to",
"study",
"causally",
"relevant",
"behavioral",
"processes",
"as",
"well",
"as",
"psychological",
"ones",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"illustrate",
"the",
"roles",
"that",
"behavioral",
"processes",
"can",
"play",
"in",
"long",
"-",
"lag",
"experiments",
"we",
"examine",
"field",
"experiments",
"motivated",
"by",
"three",
"policy",
"-relevant",
"goals",
":",
"prejudice",
"reduction",
",",
"health",
"promotion",
",",
"and",
"educational",
"achievement",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"I-T062",
"I-T062",
"I-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T170",
"O",
"B-T170",
"O",
"O",
"B-T058",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"O",
"O",
"B-T033",
"I-T033",
"O"
] |
[
"In",
"each",
"of",
"the",
"experiments",
"discussed",
"we",
"identify",
"various",
"behavioral",
"pathways",
"through",
"which",
"the",
"manipulated",
"psychological",
"state",
"could",
"have",
"produced",
"the",
"observed",
"outcome",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"argue",
"that",
"if",
"psychologists",
"conducting",
"long",
"-",
"lag",
"interventions",
"posited",
"a",
"theory",
"of",
"change",
"that",
"linked",
"manipulated",
"psychological",
"states",
"to",
"outcomes",
"via",
"behavioral",
"pathways",
",",
"the",
"result",
"would",
"be",
"richer",
"theory",
"and",
"more",
"practically",
"useful",
"research",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T058",
"I-T058",
"I-T058",
"I-T058",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O"
] |
[
"Movement",
"in",
"this",
"direction",
"would",
"also",
"permit",
"more",
"opportunities",
"for",
"productive",
"collaborations",
"between",
"psychologists",
"and",
"other",
"social",
"scientists",
"interested",
"in",
"similar",
"social",
"problems",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-T082",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T033",
"I-T033",
"O"
] |
[
"An",
"example",
"of",
"host",
"plant",
"expansion",
"of",
"host",
"-",
"specialized",
"Aphis",
"gossypii",
"Glover",
"in",
"the",
"field"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"I-T204",
"O",
"O",
"B-T082"
] |
[
"The",
"host",
"plant",
"expansion",
"of",
"host",
"-",
"specialized",
"Aphis",
"gossypii",
"(",
"Glover",
")",
"has",
"been",
"well",
"studied",
"in",
"the",
"laboratory",
";",
"however",
",",
"this",
"phenomenon",
"is",
"poorly",
"understood",
"in",
"the",
"field",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-T204",
"B-T038",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"I-T204",
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T062",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T038",
"O",
"O",
"B-T082",
"O"
] |
[
"Here",
",",
"we",
"provide",
"a",
"series",
"of",
"laboratory",
"and",
"field",
"experiments",
"to",
"assess",
"the",
"role",
"of",
"zucchini",
"in",
"the",
"host",
"plant",
"expansion",
"of",
"cotton",
"-",
"specialized",
"aphids",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-T204",
"B-T038",
"O",
"B-T204",
"O",
"O",
"B-T204",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.