药物处理后显著抑制一个蛋白的表达（利用蛋白质组学分析），并且也抑制了其mRNA水平，如何继续深入研究？
如果药物处理后显著抑制一个蛋白的表达，并且也抑制了其mRNA水平，可以进一步研究以下几个方面：

1.确定药物作用机制：药物抑制蛋白表达和mRNA水平，说明该药物作用于蛋白的合成或稳定过程。进一步研究可以确定药物作用的分子机制，如作用靶点、作用方式等，这将有助于深入理解药物的作用机制，为后续开发提供有价值的信息。

2.确定蛋白和mRNA的调控机制：了解蛋白和mRNA的调控机制，可以进一步确定药物的作用位置。如果药物抑制了蛋白和mRNA的表达，可以研究蛋白和mRNA的转录、翻译和稳定等过程，以确定药物作用的环节。这将有助于了解蛋白和mRNA的生物学功能，为深入研究提供基础信息。

3.研究蛋白和mRNA的生物学功能：研究蛋白和mRNA的生物学功能，可以进一步了解其作用于生物体内的生理和病理过程。可以通过基因敲除、基因编辑等技术，进一步验证蛋白和mRNA的生物学功能，并研究药物抑制后对生理和病理过程的影响，这将有助于研究药物的作用机制和应用前景。

4.研究药物对其他分子的影响：药物的作用可能不仅仅局限于蛋白和mRNA，还可能涉及到其他分子的调控。因此，可以通过蛋白质组学、转录组学等技术，研究药物对其他分子的影响，进一步了解其作用机制和应用前景。

综上所述，药物处理后抑制一个蛋白的表达和mRNA水平，提供了深入研究的契机。通过进一步研究药物的作用机制、分子调控机制、生物学功能和其他分子的影响，可以获得更多的信息，为药物的开发和应用提供有价值的支持。