在密度泛函（DFT）理论6-31G水平下,运用不同泛函方法对黄芩素分子结构进行几何优化,并在B3LYP/6-311＋＋G＊＊水平下对几何优化后的分子结构模型进行1H NMR计算。通过各模型的1H核磁计算值变化趋势辅助确定实验谱中H的化学位移,并以与实验值最吻合的分子模型作为直接空间法解析黄芩素晶体结构的初始模型,通过蒙特卡洛/模拟退火全局搜索及Rietveld精修技术精修,表征黄芩素晶体结构,结果为：单斜晶系,P21/c空间群,晶胞参数a=0.787 351 nm、b=1.333 318 nm、c=1.165 971 nm、β=100.150°,Z=4。