分析武汉市9个湖泊中枝角类微型裸腹蟤（Moina micrura）细胞色素氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）基因的多样性情况，对种群遗传多样性进行分析，了解不同地理距离对枝角类种群遗传分化的影响。形态鉴定表明，9个湖泊26个样点中共有8个湖泊17个样点检出微型裸腹蟤，牛山湖设置的3个样点均未检测出微型裸腹蟤。通过基因测序共得到66条微型裸腹蟤 COⅠ基因序列。由 COⅠ基因序列构建的邻接树及 Network 分析显示，武汉8个湖泊中所得到的微型裸腹蟤序列分为3大枝并具有14种不同的单倍体型。曼－惠特尼检验及科尔莫格罗夫－斯米尔诺夫检验均表明，湖泊内和湖泊间的微型裸腹蟤遗传距离存在极显著差异。武汉市不同湖泊间微型裸腹蟤存在遗传分化倾向。微型裸腹蟤 COⅠ基因在选择上是中性的，并且积累了相对较多的突变位点，可以用于种群遗传结构尤其是大尺度上的种群遗传结构分析。