为了解南海栉江珧(Atrina pectinata)的群体遗传变异特征,研究利用线粒体DNA COⅠ(细胞色素氧化酶亚单位Ⅰ)基因部分序列对7个群体共191个栉江珧个体进行群体遗传多样性和遗传结构分析.结果显示:在600 bp长的序列中,共检测到113个核苷酸变异位点,定义了73个单倍型.南海北部栉江珧总体呈现较高的单倍型多样性(0.8996)和较高的核苷酸多样性(0.0257),但L1组内6个群体(汕头、阳江、湛江、海口、琼海、北海)呈现较高的单倍型多样性(0.8133—0.9286)和较低的核苷酸多样性(0.0033—0.0045).单倍型系统发育树和网络支系图将7个群体划分为L1和L2(防城港群体)两大类群,但L1组单倍型并未表现出与地理位置相对应的谱系结构.Fst分析显示,L1组内6个群体间不存在明显的遗传分化(Fst=-0.0200—-0.0055,P>0.05),但L1组与L2组间存在极显著的遗传分化(Fst=0.8729—0.8821,P<0.01).L1组的Tajima's D检验(D=-2.3190,P=0)和Fu's Fs检验(Fs=-26.8316,P=0)均为显著负值,核苷酸不配对分布呈明显的单峰分布;L2组的Tajima's D检验(D=-1.4320,P=0.0565)为不显著负值,Fu's Fs检验(Fs=4.9540,P=0.9620)为不显著正值.以上数据说明,L1组和L2组栉江珧可能已经分化为两个群体,L1组内6个群体具有频繁的基因交流,导致了较高的遗传同质性.