采用人SRY基因保守序列的特异性引物,对奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)和尼罗罗非鱼(O.nilotica)雌、雄个体基因组进行PCR扩增,回收其中的600bp片段,分离克隆并双向测序.用DNAStar分析比较所得序列,表明克隆的600bp片段为SRY基因的同源序列.对两种罗非鱼雌、雄个体SRY同源序列进行多序列比较分析(CLUSTAL W分析),表明罗非鱼间SRY同源序列的相似性非常高,但仍存在性别间、种间差异.奥利亚罗非鱼雌、雄间序列相似性为99.5%,尼罗罗非鱼雌、雄间为99.5%,奥利亚罗非鱼与尼罗罗非鱼种间则为98.7%,罗非鱼与人类SRY基因间只有7.1%,结果为进一步研究罗非鱼SRY同源基因与性别决定的关系提供了可能性.根据这些结果构建了罗非鱼系统分类树,表明奥利亚罗非鱼与尼罗罗非鱼具有很近的亲缘关系.