越来越多的研究表明,长非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)可以调节蛋白质编码基因的表达、稳定性及亚细胞定位,参与众多重要的生物过程.由于lncRNAs是一类新发现的非编码RNAs,挖掘各物种的IncRNAs仍然是一个值得研究的问题.其中,利用生物信息学方法挖掘和鉴定lncRNAs已经成为当前生物信息学家研究的一个热点.现就基于生物信息学方法对lncRNAs的鉴定研究作一综述,主要内容分为两大类:基于测序和基于特征的计算机预测方法.基于测序又包括EST测序、cDNA测序及二代转录组RNA测序;而基于特征的计算机预测则主要包含基于序列保守性、基于碱基排列顺序及基于表观遗传修饰特征.通过以上几方面的论述,来阐明目前lncRNAs鉴定方法的现状和进展.