利用ISSR-PCR方法对条斑紫菜(Porphyra yezoensis) 5个栽培品系进行遗传多态性分析,优化了PCR反应体系和反应参数.从100个ISSR引物中筛选23个引物扩增了217个DNA片段,其中201个片段呈现多态性,占总扩增片段的92.6%.依据扩增结果进行遗传相似性和遗传距离分析,构建分子树状图.结果表明,在条斑紫菜5个品系中,采自南通海区的2个品系首先聚在一起,其遗传距离为0.389 7;接着依次和来自青岛的2个野生品系聚类,两个野生品系间的距离为0.429 9;原种来自日本的样品与其他4个样品相距最远,平均遗传距离为0.446 9.同时,5个紫菜品系的ISSR分析中产生了一些特有的指纹图谱,可进一步应用于种质分析的研究.