利用60个SSR位点对来自华南地区9个省份的191份南方夏大豆(Glycine max)进行分析,结果显示:在191份材料中共检测到663个等位变异,平均每个位点的等位变异数为11.05个;Shannon-Weaver指数平均值为1.67,材料的成对相似系数范围为0.19～0.95,平均相似系数为0.29,说明华南地区南方夏大豆材料间的相似程度高,与表型性状表现相一致;在聚类分析中,以相似系数0.26为划分标准,可将夏大豆分为4个类别,但9个省(市)之间并没有明显的界限,相近纬度和同一流域夏大豆趋向于聚在一起;通过等位变异数及遗传多样性指数分析发现,华南地区南方夏大豆分子遗传多样性中心可分成2个:一个以安徽省为中心的长江流域,另一个以广西壮族自治区为中心的珠江流域.由于多数相同来源的夏大豆分别聚在不同的类别中,为充分利用本地资源拓宽育种遗传基础提供了理论依据.