采用RAPD分子标记技术对采自福建东张水库(DZ)、浙江楠溪江(N8、N9)和浙江省海洋水产养殖研究所清江试验场(QJ)的香鱼4个群体进行遗传多样性和遗传关系分析.筛选出15条RAPD引物在4个群体72个样品中共检测到106个稳定清晰的位点,其中多态性位点47个,多态位点比例(PPL)为44.34％.群体遗传多样性分析结果表明,香鱼4个群体的多态性位点比例为23.58％～35.85％,Nei's基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I)分别在0.0868～0.1410和0.1285～0.2049之间,表明其遗传多样性水平不高,应加大对香鱼种质资源的保护力度.根据群体间遗传距离指数,UPMG方法聚类分析显示,N8和N9香鱼群体亲缘关系最近,首先聚为一支,DZ群体和QJ群体聚类在另一分支.