采用磁珠富集法,以生物素标记的(cA)12寡核苷酸为探针,构建了日本蟳基因组微卫星富集文库.通过PCR法从文库中共筛选出89个微卫星位点,其中完全型(perfect)共75个,占84.27%;不完全型(imperfect)12个,占13.48%;复合型(compound)2个,占2.25%.根据微卫星位点的侧翼序列,设计筛选出9对具有稳定多态性的微卫星引物,引物荧光标记后对日本蟳舟山群体进行遗传多样性分析.结果表明,9个微卫星位点的等位基因数为12-25;观察杂合度和期望杂合度分别为0.5806-0.9032和0.8383-0.9449;9个微卫星位点的PIC值为0.8092-0.9259.本研究筛选的9个微卫星位点可作为日本蝎遗传多样性、种群遗传结构等研究的理想分子标记.