提出了一种基于小生境进化（种群进化）的模型确认方法，采用模式置信准则（Signature Assurance Criteri-on，SAC）和模式比例因子（Crossing Signature Scale Factor，CSSF）与频响测试约束状态下的固有频率相结合的输出特征作为模型确认的输出响应，以降低输出特征个数并可利用全部频响分析的试验数据。参数修正过程中，采用距离判别方法分析和计算实验与仿真两个数据集之间的统计学差异，并通过逐步迭代、小生境进化达到模型确认的目的。算例仿真结果表明：所提出的基于小生境进化方法可用于结构动力学的频响函数模型确认，相关的频响函数输出特征作为动力学响应输出可以得到较高精度的确认结果。