以细菌和古茵基因组5'UTR序列作为研究对象,分析在5'UTR的3个不同阅读框架中三联体AUG的分布,发现无论是细菌还是古茵基因组都在阅读框l中有非常明显的AUG缺失(depletion).AUG的缺失表明在起始密码子上游的AUG很可能会对基因的翻译起始产生影响.分析得知:绝大部分的AUG都是以uORF(upstream open reading frame)的形式出现的,uAUG(upstream AUG)的数量很少,特别是在阅读框1中,而且在细菌基因组的阅读框1中uAUG较多地出现在了舍有SD序列的基因上游.比较发现,uAUG引导的序列在同义密码子使用上的偏好性较真正的编码序列差,这可能表明细菌和古茵在同义密码子使用上的偏好性也是决定基因准确地翻译起始的重要因素之一.
AUG缺失 翻译起始 密码子偏好 基因组