从酶蛋白质loop分类数据库ArchDB_EC中整理得到了1397个含配体结合位点β-发夹,对β-发夹中的配体结合位点进行了统计分析.在此基础上,提取序列片段的氨基酸组分、位点氨基酸组分和位点亲疏水特征组分为参数集,采用mRMR方法对该参数集进行优化筛选,将优化后的最优参数子集输入支持向量机,对酶蛋白质β-发夹中几种常见配体结合位点类型进行了初步预测.
酶 β-发夹模体 配体结合位点 支持向量机 mRMR