HIV-1 Gp120及其5个高变区的多态性是HIV-1能够逃逸宿主免疫反应和耐药性的主要原因.下载了现有数据库中记载的包括B '、C、CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC 5种亚洲主要流行亚型和重组型的所有Gp120及其5个高变区序列,分析了HIV-1Gp120及其5个高变区序列的长度多态性,糖基化位点数以及序列特征.结果显示,绝大部分的HIV-1Gp120序列长度为496 ～515个氨基酸之间,这提示Gp120长度为496～515个氨基酸的HIV-1毒株可能是疫苗研究的理想毒株.比较5个高变区,V3区表现出了最低的长度多态性,几乎没有糖基化位点,表明受到较强的功能限制.不同亚型和重组型的V3区一致序列比较发现,所有的HIV-1亚型均表现为R5型.这提示阻断HIV-1病毒结合CCR5受体是治疗艾滋病的有效途径,R5型毒株可以作为艾滋病疫苗研究的理想毒株.另外,V1和V4区展现了很高的长度多态性,糖基化位点也较多；而V2和V5区的长度多态性和糖基化位点都较低.这些结果表明降低这4个高变区的多态性和糖基化位点数目可能解决HIV-1病毒对疫苗的逃逸,从而研究出真正有效的疫苗.
HIV-1 Gp120 高变区 长度多态性 糖基化位点 序列特征