目的 研究2015年山东省烟台地区手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)的病原谱,并分析病原谱中柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16CV-A16)流行株的进化及VP1区重要氨基酸位点的变异情况.方法 采用实时荧光逆转录聚合酶链反应方法,对2015年烟台地区采集于HFMD患者的696份样品进行肠道病毒(enterovims,EV)核酸检测和分子定型.根据EV的优势血清型,选取10株CV-A16扩增VP1区,并进行核苷酸序列及系统发育分析.结果 从696份标本中检出EV 412株,其中101株为CV-A16,76株为EV-A71型.10株CV-A16的核苷酸序列相似性为88.4％ ～ 99.9％,氨基酸序列相似性为98.6％～100％.10株CV-A16烟台株分别属于B基因型的Bla和Blb进化分支,其中Blb进化分支为优势株.与参考株Tainan/5079/98(AF177911)相比,10株CV-A16分离株氨基酸序列的第1 1、23、99、145、289位氨基酸出现突变,10株分离株的这些位点也有不同,表明烟台地区的CV-A16有其独特的突变位点.结论 CV-A16是引起2015年烟台地区HFMD发病的常见病原体,本次分离到的CV-A16均属于B基因型的Bla和Blb进化分支.
手足口病 柯萨奇病毒A组16型 系统发育