为研究渤海海域病毒群落总体状况,本文以渤海的B47站表层海水为代表,对两个时间点(2010年9月,2011年12月)的病毒宏基因组做出全面分析.采集海水样品后过滤并经过切相流系统浓缩,提取DNA测序,再进行生物信息学分析,包括病毒组的种群分类、功能基因分析、系统进化分析等.分析结果指明,这两个时间点的病毒群落均由双链DNA病毒(97.75％,scaffold百分比)占据优势地位,其中尤以有尾噬菌体(80.86％,scaffold百分比)居多.按宿主区分,最大的一类病毒为聚球藻噬藻体(10.29％,scaffold百分比).渤海病毒群落最为丰富的功能基因为复制、结合和修复基因,且冬季(33.77％,ORF百分比)大于秋季(16.39％,ORF百分比).结果表明:在渤海病毒组中,(1)存在理论上只出现在亚热带海域的原绿球藻噬藻体;(2)物种组成、物种多样性、功能基因比例呈现季节变化;(3)相比远洋病毒组有一定独特性;(4)可能存在未知的T4-1ike病毒分支.
宏基因组 病毒组 海洋病毒 病毒多样性 渤海