首先利用RT-PCR技术扩增出一个核盘菌的Ⅲ型PKS基因,而后将该片段克隆到T载体中进行测序验证,并将其命名为SspksⅢ.同时,利用生物信息学技术,从理化性质、疏水性、亚细胞定位、跨膜结构域、磷酸化位点、信号肽、二级结构和三级结构等方面对该基因编码蛋白SpksⅢ进行预测和分析.结果表明:SspksⅢ蛋白的相对分子量为49031.8,理论等电点为5.54,氨基酸数目为456,亚细胞定位于细胞质,磷酸化位点主要在丝氨酸残基上,不舍信号肽,为非分泌蛋白,在二级和三级结构分析中发现无规则卷曲和α螺旋占主要部分.
核盘菌 聚酮合酶 基因克隆 生物信息学