三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)是乳腺癌中恶性程度较高的一种病理分型,因其病理呈现雌激素受体、孕激素受体和人类表皮生长因子受体2均为阴性的特殊性,使得目前药物治疗效果不甚理想,探究与TNBC病变过程相关的病理标志物是当前乳腺癌研究领域的热点之一.通过高通量基因表达(gene expression omnibus,GEO)数据库获取TNBC相关的基因集,并进行主成分分析、差异基因筛选、基因功能和信号通路的富集分析、蛋白互作网络构建以及加权基因共表达网络分析等转录组学分析.结果 表明,TNBC和非TNBC具有明显不同的基因表达模式,这些差异基因主要富集于表皮生长和分化、乳腺上皮细胞生长和发育等相关生物学过程,还富集于转录因子结合相关分子功能与雌激素信号转导相关通路.整合蛋白互作网络和共表达网络的结果,可以预测TFF1、FOXA1、AGR2和AGR3可能是涉及TNBC病理表型的关键基因.研究结果为揭示TNBC潜在的病理标志物以及由此衍生的疾病诊疗靶标或分子调控机制,提供一定的理论研究依据.
转录组学 三阴性乳腺癌 公共数据库 基因芯片 生物信息学分析 病理标志物