从蛋白质折叠成自由能最小的稳定结构类型为研究的出发点,为揭示蛋白质空间折叠的动力学本质,对非同源蛋白质数据库,以蛋白质序列的氨基酸频率和自协方差函数为特征矢量,求出表征特征矢量中各分量耦合作用与协同作用的协方差矩阵所对应的特征值.与Chou[1]的方法相比,更全面地反映了蛋白质折叠密码的简并性、全局性和多意性[2],为定量表征折叠成不同结构类的蛋白质,提供了一种动力学参数分析方法.
折叠类型 非同源蛋白质 氨基酸频率 自协方差函数 协方差矩阵的特征值