癌组织与癌旁正常组织中的差异表达基因与非小细胞肺癌的发生发展密切相关.本文基于肺腺癌和肺鳞状细胞癌的RNA-Seq数据,首先利用R包DESeq2初步筛选得到2种亚型癌组织与正常组织的差异表达基因;然后运用方差分析鉴别了这些基因表达水平的组内差异和组间差异,构建了5个差异与非差异表达基因集合.参考COSMIC、CCGD和DISEASES数据库已有癌基因信息,统计分析了各数据集中癌基因的分布.参考COSMIC、TSGene 2.0数据库中原癌和抑癌基因信息,利用韦恩图求交集法获得2种癌症亚型的潜在原癌和抑癌基因.结果 发现在肺鳞状细胞癌中,癌基因在5个集合中所占比例分别为:47.2％,38.7％,61.6％,55.6％,38.2％;在肺腺癌中,其所占比率分别为:43.9％,32.3％,64.6％,52.1％,40.5％.研究表明方差分析进一步筛选的上下调、组间差异集合中含有较多癌基因,获得肺鳞状细胞癌潜在原癌基因72个,抑癌基因244个;肺腺癌潜在原癌基因43个,抑癌基因159个.
肺鳞状细胞癌 肺腺癌 差异表达基因 原癌基因 抑癌基因