利用基于混合模型的QTL定位方法研究了由籼稻品种IR64和粳稻品种Azucena杂交衍生的DH群体在4个环境中的QTL上位性效应和环境互作效应。结果表明，上位性是数量性状的重要遗传基础，并揭示了上位性的几个重要特点。所有的QTL都参与了上位性效应的形成，64%的QTL还具有本身的加性效应。因此传统方法对QTL加性效应的估算会由于上位性的影响而有偏。其他36%的QTL没有本身的加性效应，却参与了48%的上位性互作，这些位点可能通过诱发和修饰其他位点而起作用。上位性的特点还包括，经常发现一个QTL与多个QTL发生互作；大效应的QTL也参与上位性互作；上位性互作受环境影响。QTL与环境的互作效应比QTL的主效应更多地被检测到，表明数量性状基因的表达易受环境影响。
数量性状位点 上位性效应 环境互作效应 水稻株高