目的:通过支持向量机算法预测蛋白质序列中的磷酸化修饰位点信息.方法:从最新版Swiss-Prot数据库中提取人类磷酸化数据并构建样本集,提取筛选四类序列特征并利用支持向量机算法进行预测.结果:十倍交叉验证结果表明,丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸上的磷酸化修饰位点识别准确率分别达93.00％、82.25％、81.50％,马太相关系数(MCC)达0.86、0.65、0.63.独立测试集验证结果中识别准确率整体优于同类预测工具RF-Phos,苏氨酸样本集上性能表现最优,准确率达86.59％,MCC值达0.63.结论:通过支持向量机整合序列特征对磷酸化修饰位点定位,为进一步的生物学实验提供较为准确的信息.
磷酸化 支持向量机 物理化学属性 F值检验