指出了在生命科学领域,非模式生物具有越来越重要的地位,对非模式生物的研究大幅拓宽了生命科学研究的广度,促进发现更多新的科学问题,弥补模式生物在研究中的不足之处.传统的转录组分析存在流程操作复杂、工作效率低、入门门槛高等问题.基于Snakemake的转录组分析框架,能够运用数据标签批量处理多个数据,无需使用者多次设置参数,大大提高了工作效率.利用Snakemake初步搭建转录组分析框架,在野生型和FUL基因型番茄样品的RNA—Seq转录本数据进行测试.本研究工作为非计算机背景的研究人员进行转录组分析提供了方便,对相关转录组数据分析研究具有一定参考意义.
分析框架 非模式生物 Snakemake转录组分析