从已知蛋白质结构的氨基酸序列出发,利用DSSP和PROMTIF构建了蛋白质复杂超二级结构strand-loop-helix-loop-strand模体数据集.数据集含1458条蛋白质链,其中βaβ模体数为3632个,非βαβ模体数为3148个.将亲疏水组分、优化的位点氨基酸组分、预测的模体信息和二级结构信息共同作为序列特征输入支持向量机,5交叉检验的预测总精度和马氏相关系数达到了79.7％和0.59;独立检验的预测总精度和马氏相关系数达到了73.4％和0.47.
βαβ模体 SVM算法 位点氨基酸 亲疏水组分 超二级结构