利用线粒体DNA的细胞色素b(cytb)和控制区(D-loop)的部分序列来研究大泷六线鱼4个群体(包括野生和养殖群体)的遗传多样性.PCR扩增后分别得到365 bp(cytb)和387 bp(D-loop)的碱基序列.Mega计算结果显示cytb中A+T的含量(52.6%)高于G+C的含量(47.3%);D-loop中A+T的含量(69.3%)同样高于G+C的含量(30.7%).4个群体平均的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数,cytb基因分别为10,7.75,0.739,0.0073和2.656;D-loop区分别为18.25,12.75,0.846,0.0121和4.673.4个群体的遗传多样性由高到低分别为舟山、大连、琅琊台、即墨养殖群体,养殖群体的多样性低于野生群体.基于野生群体cytb和D-loop的分子变异分析(AMOVA)得出的F st分别为0.3186和0.2714,显示了变异主要发生在群体内部.基于Kimura 2-parameter模型构建的NJ树结果表明3个野生群体间没有显著的分化.线粒体cytb基因和D-loop区均可作为检测大泷六线鱼遗传多样性的有效标记.
大泷六线鱼 野生和养殖群体 线粒体DNAcytb基因和D-loop 遗传多样性