应用PCR结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对长江口外低氧区的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.对25条DGGE条带进行了克隆、测序,所得到的细菌16S rDNA基因V3区序列进行了系统进化分析.结果显示这25条条带分别归属于4个细菌类群:变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobacteria).其中有16条分别与变形细菌亚群的γ-Proteobacteria和δ-Proteobacteria相似.时空分析发现,低氧水体的细菌群落组成与非低氧水体的组成不同,低氧水体包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroides)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝细菌门(Cyanobacteria),非低氧水体中没有发现蓝细菌门(Cyanobacteria).并且8月份低氧水体中Flavobacteria为优势菌群.
细菌群落组成 16S rDNA序列分析 PCR-DGGE 长江口低氧区