通过高通量测序技术,对采自贺兰山的20只阿拉善马鹿粪便进行测序及菌群多样性分析.结果表明,20个样品共获得1564112条序列,有效序列1399562条和2740个OTUs.其中样品包含24个门和283个属,在门水平上核心菌门,分别是厚壁菌门(Firmicutes)76.71％、拟杆菌门(Bacteroidetes)14.16％、变形菌门(Proteobacteria)3.51％.在属水平上,核心菌属有11个,占肠道菌群的31.46％,分别为孢子杆菌属(Sporobacter)7.38％、拟杆菌属(Bacteroides)4.15％、梭菌属系列(Clostridium IV、Clos-tridium XlV)3.63％、罗氏菌属(Roseburia)3.00％、胃瘤球菌(Ruminococcus)1.85％、奥氏杆菌(Oscillibacter)1.80％、Intestinimonas 1.56％、Akkermansia 1.50％、Alistipes 1.49％、Flavonifractor 1.47％.由此可知,阿拉善马鹿肠道菌群复杂多样,为进一步研究阿拉善马鹿肠道菌群功能提供理论依据.
阿拉善马鹿 肠道菌群 16SrRNA