基于氨基酸的物理化学性质,将氨基酸分为4类,疏水,带电荷,有极性,甘氨酸,在此基础上给出DNA序列一种新的图形表示方法:将1列DNA序列表示为二维空间中的3条特征曲线,利用计算C(i,j)矩阵的主特征值,给出DNA序列的3维特征向量,得到相似距离矩阵.最后计算10种不同物种β-球蛋白第一段外显子的欧式空间距离矩阵D(i,j),并利用UPGMA算法给出了这10种不同物种基于这种相似关系的系统发生树.
DNA序列 图形表示 氨基酸 相似性分析 进化树