用RT-PCR方法从陆地棉遗传标准系 " TM-1"的纤维细胞RNA中克隆了一种纤维细胞优势表达的mRNA (cDNA, 记为TM-E6基因), 该基因不含内含子, 可读框长为771 bp, 可编码246个氨基酸的多肽. 从4个纤维突变体中分别克隆同源性基因, 并与野生型"TM-1"的TM-E6基因进行了同源性分析, 发现纤维突变体不但在基因结构而且在密码组成上有明显变异. 在距转录起始位点的第279碱基对处有GGCTCA (Gly-Ser)串连重复序列的结构;无长、短纤维突变体的F1-E6基因密码子变异率最大(7.05%), 其次是只有短纤维突变体的Li-E6基因 (4.98%),再次是无短纤维突变体的N-E6基因和纤维形态正常的"棕色棉"B1-E6基因 (均为4.15%);无长纤维的两个突变体基因的肽链在第1～174的氨基酸序列间有高度相似(99.4%)的变异, 而无短纤维的两个突变体则在第116～220的氨基酸序列变异完全相同;Li-E6和B1-E6基因除了在纤维细胞中高效表达外,在种皮中也有部分表达.
棉花 纤维突变体 纤维mRNA克隆