研究旨在分析玫瑰高原鳅(Triplophysa rosa)肠道微生物的结构组成和多样性,探索其肠道微生物的潜在功能.提取了5尾玫瑰高原鳅的肠道总DNA,运用Illumina Miseq平台对肠道微生物16S rRNA的V3—V4区进行了测序,统计样品肠道微生物的操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs)数量,分析物种组成、丰度及Alpha多样性,并预测肠道微生物的功能.结果显示,玫瑰高原鳅的肠道微生物有19门、31纲、87目、146科、253属、320种,451个OTUs.在门水平上,优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actino-bacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes);在属水平上,优势菌群为气单胞菌属(Aeromonas)、爱德华菌属(Ed-wardsiella)、邻单胞菌属(Plesiomonas)和希瓦氏菌属(Shewanella).功能预测表明,肠道微生物编码的大多数基因与新陈代谢相关,其中"碳水化合物运输和代谢"和"氨基酸转运与代谢"功能类群的相对丰度较高.玫瑰高原鳅肠道内微生物组成复杂,其功能分析有助于理解肠道微生物对玫瑰高原鳅摄食的影响,为进一步研究玫瑰高原鳅的食性提供了理论基础.
玫瑰高原鳅 肠道微生物 16SrRNA 多样性 功能