试验旨在研究从江香猪γ干扰素(interferon gamma,IFN-γ)基因克隆与序列分析.试验提取贵州从江香猪肝脏组织总RNA,反转录生成cDNA,采用2对特异性引物进行巢式PCR扩增从江香猪IFNγ(CJ poIFN-γ)基因编码区,将其克隆至pUCm-T载体上,获得重组质粒pUCm CJpoIFN-γ,并测序鉴定;利用NCBI、SOPMA、SignalP-4.1等在线服务器软件、DNAStar软件对CJ-poIFN-γ进行序列分析.结果表明,CJ poIFNγ基因编码区长501 bp,编码166个氨基酸;核苷酸序列比对结果显示,CJ-poIFN-γ与梅山猪、剑白猪、藏猪、成华猪、荣昌猪、印度猪、长白猪、内江猪同源性为99.4％～100.0％;进化树分析结果显示,CJ-poIFN-γ与梅山猪、剑白猪、藏猪、成华猪亲缘关系较近;CJ-poIFN-γ基因编码蛋白不存在跨膜结构,为分泌蛋白,前23个氨基酸为信号肽序列;CJ-poIFNγ基因编码蛋白二级结构主要以α-螺旋(50.60％)和无规则卷曲(33.14％)为主,B细胞表位主要位于62-65、84-87、113 115、144-156和162-166位氨基酸.试验结果为进一步研究IFN γ的生物活性、加快从江香猪品种资源的有效利用奠定基础.
从江香猪 γ干扰素(IFN-γ)基因 克隆 序列分析