Hippo信号通路在动物生长发育过程中起到关键作用.根据已知的Hippo通路组成基因序列,利用BLAST软件同源鉴定野桑蚕(Bombyx mandarina)转录组中的Hippo通路组成基因序列,利用生物信息学工具(ORFinder、web CD-search tool、Expasy-protparam、EMBL-EBI、MEME)分析蛋白质相对分子质量、等电点、二级结构、保守结构域和保守基序等.利用Clustalx和MEGA 6.0进行同源序列比对并构建系统进化树.在野桑蚕中鉴定了salvador、warts、mats、yorkie和scalloped同源基因,并预测了ORF框和编码蛋白.结果表明,野桑蚕Warts、Sav和Mats与家蚕同源蛋白的一致性均在98％以上,Yki和Scalloped与家蚕一致性分别为89.02％和79.13％.比较两者差异,家蚕Yki、Sd蛋白分别缺失了近WW2结构域和在YAP结合结构域中存在蛋白片段插入,野桑蚕Sd蛋白缺失了核定位信号基序和脯氨酸富集基序之间的铰链区.Yki和Sd可按照物种科属分别聚类,野桑蚕与家蚕聚为一支,表明这些同源蛋白在功能相似的同时,也具有基于物种的功能特异性.本研究为深入研究野桑蚕Hippo通路的作用机制提供理论基础.
野桑蚕(Bombyxmandarina) Hippo通路 聚类分析