根据已报道的鲑鳟鱼类MHCⅠ基因序列设计了扩增虹鳟鱼MHCⅠ ORF的引物对, 采用RT- PCR克隆了18个虹鳟鱼的MHCⅠ基因, 用Southern blot和Northern blot分析了其基因组中MHCⅠ的结构和在组织中的表达情况. 结果显示10个MHCⅠ克隆序列与已报道的虹鳟鱼MHCⅠ基因序列(Onmy-UA-C32)有92.7%的同源性; 而8个克隆序列与此仅有71.4%同源性, 其代表克隆Onmy-UBA1长1140 bp, 含一完整的信号肽序列、成熟MHCⅠ区域和3′末端不转录区. Onmy-UBA1 a2链序列分别与鲤科鱼类MHCⅠ有58.1%的同源性, 与鲑鳟鱼类MHCⅠ则有75.3%的同源性. 并且Onmy-UBA1在a2区域明显不同于已报道的Onmy-UA-C32. Southern blot分析结果表明, 同源于鲤科鱼MHCⅠa2 区域的基因探针(M1)和同源于鲑科鱼MHCⅠa2区域的基因探针(M2)其杂交带的大小和位置明显不同, 这揭示了Onmy-UBA1与Onmy-UA-C32分别属于同一或不同基因座的等位基因. 即研究发现了一新MHCⅠ类等位基因存在于最低等脊椎动物--虹鳟鱼.
虹鳟鱼 主要组织相容性复合体 MHCⅠ类等位基因