目前使用机器学习方法对稀有的PPII二级结构进行预测工作还比较少见.本文在分析数据集的特征基础之上,采用加强局部信息的改进编码方法,并使用生物信息学中常用的BP神经网络来预测PPII二级结构.通过对不同输入窗口长度与不同隐层节点数的神经网络进行训练和测试,得出在输入窗口长度为5个氨基酸残基和隐结点数为8时PPII螺旋结构能够被很好地预测出来,此时的预测敏感度为82.5%.
神经网络 BP-模型 蛋白质二级结构 多聚脯氨酸二型结构预测