作者分析了老鼠基因组中各染色体及其内含子、外显子和基因间区上各种类型的微卫星(1-6个碱基的重复序列)的数量及其密度.SSR约占老鼠基因组的2.85%,其中46.2%存在于基因间区,4.75%存在于外显子,49.05%在内含子区域,即非编码区富含微卫星.微卫星的数量与染色体或基因区域的大小有关,但密度与染色体或基因区域的大小的关系并不十分密切.第4染色体的外显子区域中6种类型的SSR含量都比其它区域少.A,T,AC,AG,AT,AAC,AAG ,AGG,AAAC,AAAG,AAAT,AACC,AAAAC,AAAAG,AAAAT,AAACC, AAAGG,AAGAG,AAAAAC,AAAAAG,AAAAAT ,AAAGAG,ACACAT,ACAGAG,ACAGGC,ACATAT是老鼠基因组中主要的SSR类型,而一些5碱基重复单元的SSR在老鼠基因组的某一条甚至某几条染色体都不存在[动物学报52(1):138-152,2006].
老鼠 微卫星 数量 分布 密度 基因组