背景与目的:肺鳞癌的发生发展是一个多因素、多步骤的过程,虽然从基因和转录水平已对肺癌进行了许多成功的研究,但其癌变机制仍不十分明确,目前尚缺乏有效的用于肺鳞癌早期诊断和预后监测的特异性分子标志物.本研究的目的是利用蛋白质组学方法,建立分辨率高和重复性好的人肺鳞癌组织及其癌旁正常支气管上皮组织的双向凝胶电泳图谱,并识别鉴定其差异表达的蛋白质.方法:利用固相pH梯度(immobilized pH gradient,IPG)双向凝胶电泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE),分离人肺鳞癌组织及癌旁正常支气管上皮组织的总蛋白质,用图像分析软件比较分析,以识别差异表达的蛋白质;应用质谱仪(mass spectrometry)得到相应的肽质指纹图谱(peptide mass fingerprint,PMF),然后搜索数据库鉴定部分差异蛋白质点.结果:(1)建立双向凝胶电泳图谱:癌组织和癌旁正常支气管上皮组织3块凝胶的平均蛋白质点数分别为1 349±67和1 297±73,平均匹配的点数分别为1 235±48和1 183±56,匹配率达91.5%和91.2%;同一癌组织的3块胶在蛋白质点位置上有较好的重复性,不同胶间蛋白质点在等电聚焦(Isoelectric focusing,IEF)方向的偏差是(0.873±0.125)mm,在十二烷基磺酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳SDS-PAGE方向上的偏差为(1.025±0.213)mm.(2)肽质指纹图分析:比较分析15例肺鳞癌组织及癌旁正常支气管上皮组织的双向凝胶电泳图谱,平均匹配的点数为1 069±45,对40个差异蛋白质点进行肽质指纹图分析,鉴定出一些与瘤基因、细胞周期调控、信号转导等有关的蛋白质.结论:建立了分辨率高且重复性较好的人肺鳞癌组织与癌旁正常支气管上皮组织的双向凝胶电泳图谱,并识别鉴定出一些与肺鳞癌癌变相关的差异表达的蛋白质,为进一步筛选肺鳞癌特异性的分子标志物打下了坚实的基础.
人类 肺肿瘤 鳞状细胞癌 支气管上皮 双向凝胶电泳 MALDI-TOF-MS 蛋白质组