目的对前列腺特异膜抗原(PSMA)进行结构模建并尝试其小分子抑制物的设计.方法通过网络资源和分子设计软件SYBYL(R)进行PSMA的三维模建和小分子抑制物的设计.结果以气单胞菌氨肽酶(AMP)的晶体结构为模板使用Composer模块,获得PSMA胞外区三维结构模型.采用分子对接方法,以AMP和ρ-碘基-D-苯丙酸-氧肟酸(AIDPH)的复合物晶体结构1IGB为参照,将AIDPH对接到PSMA的结构上,相对应形成疏水作用一端的残基为Y279、Y294、Y298及Y301,与1IGB的晶体结构中的蛋白-抑制剂间的疏水作用非常相似,相对应于另一端形成氢键的4个残基中有3个相同,说明两个复合物氢键形成的方式大体一致.结论成功获得PSMA三维结构的理论模型.AIDPH有望作为设计PSMA靶向性药物的前导基团.
前列腺特异膜抗原 串线法 计算机 药物设计