选取对数生长期的海洋饵料微藻——角毛藻(Chaetoceros sp.)和扁藻(Platymonas sp.)藻液,经无菌混合纤维素酯膜抽滤,获得游离和粘附的藻际细菌,并提取基因组DNA进行16S rDNA高通量测序,测序区间为16S rDNA的V3~V4可变区,测序结果经过数据质控获得有效序列数分别为44222和40721,用Uclust v1.1.579对序列进行OTU聚类,获得有效OTU数分别为3747和3809;用RDP classifier进行物种注释,分析藻际环境的细菌多样性.结果表明,2种微藻的藻际细菌主要分布于变形菌门(Proteobacteria).角毛藻藻际细菌优势种群主要分布于γ-变形菌纲(34.3%)和 α-变形菌纲(16.3%),扁藻藻际细菌优势种群主要分布于 γ-变形菌纲(36.9%)、α-变形菌纲(17.7%)和β-变形菌纲(11.4%).细菌群落Alpha多样性指数表明,角毛藻覆盖率为96.4%,香农指数为6.28,ACE指数为7247.64,Chao1指数为6046.91;扁藻覆盖率为98.0%,香农指数为5.99,ACE指数为7166.06,Chao1指数为6172.99.2藻种的藻际细菌群落内菌种均匀性和多样性相近.
角毛藻 扁藻 藻际环境 高通量测序