目的 利用全基因组测序技术构建稀有细菌Leifsonia flava SYP-B2174T的基因组草图,解析其基因特性,挖掘次级代谢产物基因的资源.方法 以Illumina HiSeq PE150测序平台对菌株SYP-B2174T进行全基因组测序,使用生物信息软件对测序数据进行基因组组装、基因预测与注释.使用琼脂扩散法对菌株的代谢产物进行抗菌活性测定.结果 菌株SYP-B21741基因组测序得到16个contig,总长为3 782 833 bp,G+C含量为68.6 mol％,注释到3 543个基因,包含3 455个蛋白,46个tRNA,3个其他RNA,35个假定蛋白,GenBank登录号为SPQZ00000000.预测得到聚酮类、非核糖体多肽样合酶和萜类化合物的生物合成基因簇,与现有基因簇相似度≤21％.拮抗实验结果表明菌株SYP-B2174T的代谢产物对6种人类致病菌的生长有抑制作用.结论 Leifsonia tlava中具有众多次级代谢产物的合成基因簇且与已知基因簇相似度低,并且代谢物具有抗菌活性,可为今后开展活性化合物分类鉴定、基因改造、合成生物学的研究奠定基础.
Leifsonia flava 全基因组测序 基因注释 抗菌活性