研究了41个水稻β-1,3-葡聚糖酶的疏水簇(HC)的结构特点、HC的疏水氨基酸的突变倾向、密码子使用类型与偏好、为同种氨基酸二连体组合编码的密码子二连体组合使用类型与偏好.研究结果显示,水稻β-1,3-葡聚糖酶至少有20个保守性较高的基本的HC,HC内至少含有≥1个疏水核心或有≥2个高度保守的疏水氨基酸位点.HC内似乎有I易向L、V、F突变,M易向I、V突变,W易向F突变,而反向突变较难的倾向.HC中的疏水氨基酸位点和为丙氨酸(A)编码的密码子使用频率与水稻基因组的统计数据出现明显偏差,为部分同种氨基酸二连体组合编码的正反两种密码子匹配组合方式,如GCCGCG和GCGGCC,的出现频率有明显差异.
水稻 β-1 3-葡聚糖酶 HCA 密码子使用偏好