近些年来，随着科学研究手段的进步和技术水平的提高，海洋生态学研究取得了若干重大突破，并导致了一系列新认识、新发现，正在推动着学科的迅速发展，并影响着相关学科的发展。海洋超微型生物生态学就是一个十分活跃、正在崛起的新领域。Waterbury在1979年发现聚球藻(Synechococcus)和Chisholm在1988年发现原绿球藻(Prochlorococcus)，大大改变了以往人们对海洋初级生产者结构的认识。而90年代海洋浮游古菌的发现与确认改写了早期认为古菌只存在于极端环境的论断，并由此产生了对海洋生态系统功能上（如物质循环、资源环境效应）的新观点、新认识。这三大发现被称为新近海洋生态学发展的三大里程碑[13,18]。显然，对微型生物的研究发展到今天，我们再也不能把微型生物作为一个黑箱来对待，也不能仅仅停留在分粒级测定其生物量和生产力上，而应该更进一步地探讨微型生物群落的组成。海洋微型生物作为海洋环境中的最重要组分之一，历来被作为海洋生态学调查研究的重要内容。然而由于过去方法手段上的限制，其研究基本停留在总体计数水平上。事实上，它们不仅种类繁多，而且不同类群生态功能各异。Delong在1992年、1994年和Huber在1995年的研究均表明,70年代末以来一直认为只在极端生境（如高盐、极热、极端厌氧等环境）下存在的古菌类，最近几年已被证实在大洋、近海、沿岸海区都有大量分布，且在生态系统中扮演着举足轻重的独特的角色[13,14,19,22,23]。