利用NCBI数据库中小鼠Embryonic Stem Cells (ESC)与Neural Progenitor Cells (NPC)的基因芯片结果及NPC时期的RFX1ChIP-Seq数据,进行有关RFX1的分析,结果表明:RFX1结合位点富集在1,2,4,5,7,9,11染色体上,Y染色体上最少,其他染色体上比较均衡；在基因组中结合位点分布区域主要在基因的promoter区域,约有53.2％,其次是intergentic,占22.5％,body区域,占13.1％,enhancer区域,占11.2％.说明RFX1是以结合在基因的promoter区为主要形式对目的基因进行调控.同时在DAVID数据库中用生物信息学方法探索了RFX1靶基因的生物学功能分类.
神经先祖细胞 RFX1 ChIP-Seq