基于最大熵模型,构建一种简单的预测蛋白质序列结构分类的算法.不同性质的氨基酸组合,在特定结构的蛋白质二级结构中,出现的频率不同,通过在模体数据库Prosite中查找蛋白质序列匹配的模体,以10种氨基酸组合在序列中出现的频率,表示蛋白质序列的特征,构建相应的结构分类预测模型.最大熵模型用来确定蛋白质结构分类预测模型的参数.以自身一致性和Jackknife测试方法验证分类模型的准确性.结果表明新构建的方法简单、准确,综合性能优于一般的预测方法.
蛋白质 结构类预测 最大熵模型 模体