为了克隆人高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白(high affinity sodium-dependent dicarboxylate transporter,SDCT2,或NaDC3)基因并研究其生理功能,用大鼠SDCT2基因序列作为电子杂交探针对人EST数据库进行电子筛选,得到了一系列与大鼠SDCT2序列具有高度同源性的人EST序列,将它们拼接成2个基因重叠群,设计特异性PCR引物通过RT-PCR扩增得到2条杂交探针用于筛选人肾cDNA文库.从肾组织中同时克隆出了人SDCT2基因2种mRNA变异体的全长cDNA(SDCT2 α和SDCT2 β),两者5'端前3 435 bp序列完全一致,但3'端长度不同,SDCT2 β在第3435 bp以后比SDCT2 α多出了585 bp的序列.Northern杂交和RT-PCR显示,SDCT2 α在人肾中的表达丰度最高,在肝、脾、胎盘、脑及结肠中也有低水平的表达.而SDCT2 β主要在肾脏中表达,在脾也有低水平的表达.基因组结构分析表明,虽然两种mRNAs均由13个外显子组成,但是SDCT2 α的第13外显子含有1个poly(A)加尾信号AATAAA,而SDCT2 β的第13外显子含有2个poly(A)加尾信号.这表明在肾脏和脾脏组织中,人SDCT2基因可能通过选择性使用位于第13外显子不同位置的2个poly(A)信号而转录出2种不同长度的mRNA变异体.
SDCT2基因 选择性转录终止 选择性剪接 转录产物 变异体