He faces five counts of crimes against humanity and three counts of violations of the laws or customs of war for the persecutions, killings, plunder of property, deportation, wanton destruction of cities, towns, or villages, and other inhumane acts he and the forces under his command and control allegedly committed during the operation, dubbed "Storm".
Gotovina, kendisi ile emir ve komutası altındaki kuvvetlerin "Fırtına" harekatı sırasında işlediği iddia edilen zulüm, cinayet, yağma, sınır dışı etme, il, ilçe ve kasabaların nedensizce yıkıma uğratılması ve diğer insanlık dışı eylemler nedeniyle beş adet insanlığa karşı suç ve üç adet savaş yasaları veya adetlerinin ihlaliyle itham ediliyor.