He went into hiding in June 2001, shortly after the International Criminal Tribunal for the former Yugoslavia (ICTY) indicted him over his alleged involvement in atrocities committed against Krajina Serbs towards the end of the 1991-1995 conflict in Croatia.
Ante Gotovina, eski Yugoslavya ile ilgili Uluslararası Ceza Mahkemesi'nin (ICTY) kendisini 1991-1995 yılları arasında Hırvatistan'da yaşanan çatışmalar sırasında Krajinalı Sırplara yapılan zulümlere katılmakla suçlamasından hemen sonra 2001 yılının Temmuz ayında ortadan kaybolmuştu.