One of the tribunal's three most-wanted indictees, he went into hiding in mid-2001, shortly after UN prosecutors charged him with war crimes over his alleged role in the killings of 150 Krajina Serbs and the expulsion of 150,000 others towards the close of the 1991-1995 conflict in Croatia.
Mahkemenin en azılı üç zanlısından biri olan Gotovina, BM savcılarının kendisini Hırvatistan'daki 1991-1995 ihtilafının sonlarına doğru en az 150 Krajinalı Sırp'ın öldürülmesi ve 150 bin diğerinin sürülmesi olayındaki rol oynadığı iddiasıyla savaş suçu işlemekle suçlamasından kısa bir süre sonra, 2001 ortalarında ortadan kayboldu.