Unlike light, which has to be sent down an optic fibre to the desired location inside the brain, low frequency ultrasound waves can pass through tissue unhindered, and so can be sent into the brain from on top of the skull.
Valo on tutkimuksen kohteena oleviin aivoihin ohjataan valoa valokuitujen avulla. Matalataajuuksiset ultraäänet sen sijaan läpäisevät solun helposti, joten ultraääntä voidaan ohjata aivoihin kallon läpi.