MatrixDB
میٹرکس ڈی بی ایک حیاتیاتی ڈیٹا بیس ہے جو ایکسٹرا سیلولر پروٹین اور پولیسیکرائڈز کے درمیان سالماتی تعاملات پر مرکوز ہے۔ میٹرکس ڈی بی ایکسٹرا سیلولر پروٹین کی کثیر جہتی نوعیت کو مدنظر رکھتا ہے (مثال کے طور پر، کولیجن، لیمینن اور تھرومبوسپونڈن ملٹیمر ہیں)۔ یہ ڈیٹا بیس ابتدائی طور پر 2009 میں جاری کیا گیا تھا اور اسے یو ایم آر 5246، کلاڈ برنارڈ یونیورسٹی لیون 1 میں سلوی ریکارڈ بلم کے تحقیقی گروپ نے برقرار رکھا ہے۔ میٹرکس ڈی بی یونی جین اور ہیومن پروٹین اٹلس سے منسلک ہے۔ یہ صارفین کو اپنی مرضی کے مطابق ٹشو اور بیماری سے متعلق مخصوص تعامل کے نیٹ ورک بنانے کی بھی اجازت دیتا ہے، جس کا سائٹوسکیپ یا میڈوسا کا استعمال کرتے ہوئے مزید تجزیہ اور تصور کیا جا سکتا ہے۔ میٹرکس ڈی بی انٹرنیشنل مالیکیولر ایکسچینج کنسورشیم (آئی ایم ای ایکس) کا ایک فعال رکن ہے، جو انٹرایکشن ڈیٹا کے بڑے عوامی فراہم کنندگان کا ایک گروپ ہے۔ حصہ لینے والے دیگر ڈیٹا بیس میں بائیو مالیکیولر انٹرایکشن نیٹ ورک ڈیٹا بیس (بی آئی این ڈی)، انٹ ایکٹ، مالیکیولر انٹرایکشن ڈیٹا بیس (ایم آئی این ٹی)، ایم آئی پی ایس، ایم پیکٹ، اور بائیو جی آر آئی ڈی شامل ہیں۔ آئی ایم ایکس کے ڈیٹا بیس کوشش کی نقل کو روکنے، غیر اوور لیپنگ ذرائع سے ڈیٹا اکٹھا کرنے اور کیوریٹڈ انٹرایکشن ڈیٹا کا اشتراک کرنے کے لیے مل کر کام کرتے ہیں۔ آئی ایم ایکس کنسورشیم نے انٹرایکشن ڈیٹا کی تشریح اور تبادلے کے لیے ایچ یو پی او-پی ایس آئی-ایم آئی ایکس ایم ایل معیاری فارمیٹ تیار کرنے کے لیے بھی کام کیا۔ میٹرکس ڈی بی میں دستی علاج کے ذریعے ادب سے نکالا گیا تعامل کا ڈیٹا شامل ہے اور یہ پی ایس آئی سی کیو یو آئی سی ویب سروس کے ذریعے آئی ایم ایکس پارٹنر ڈیٹا بیس کے ذریعے فراہم کردہ ماورائے سیلولر پروٹینوں پر مشتمل متعلقہ ڈیٹا تک رسائی کے ساتھ ساتھ ہیومن پروٹین ریفرنس ڈیٹا بیس سے ڈیٹا تک رسائی فراہم کرتا ہے۔ حوالہ جات بیرونی روابط http://matrixdb.univ-lyon1.fr http://www.icbms.fr/aspe حیاتیاتی ڈیٹا بیس پولیسیکرائڈز