TREX complex
ٹریکس (ٹرانسکرپشن-ایکسپورٹ) کمپلیکس ایک محفوظ یوکرائیوٹک ملٹی پروٹین کمپلیکس ہے جو ایم آر این اے ٹرانسکرپشن اور نیوکلیئر ایکسپورٹ کو جوڑتا ہے۔ ٹریکس کمپلیکس آر این اے پولیمریز II کے ساتھ نقل شدہ جینوں میں سفر کرتا ہے۔ ٹریکس ایم آر این اے کو باندھتا ہے اور ٹرانسپورٹ پروٹین این ایکس ایف 1 اور این ایکس ٹی 1 (خمیر میکس 67 اور ایم ٹی آر 2) کو بھرتی کرتا ہے، جو ایم آر این اے کو مرکزے سے باہر نکالتے ہیں۔ ٹریکس کمپلیکس جینوم استحکام اور نیوروڈیجینریٹو بیماریوں میں اہم کردار ادا کرتا ہے۔ ایم آر این اے جوہری برآمد میں کردار نقل کی لمبائی کے دوران، ٹی ایچ او کمپلیکس آر این اے پولیمریز II کی پیروی کرتا ہے اور پورے نقل شدہ خطے کے ساتھ نقل کے عوامل کے ساتھ تعامل کرتا ہے۔ پھر، آر این اے پولیمرس II کا کاربوکسی ٹرمینل ڈومین (سی ٹی ڈی) 3 'اینڈ پروسیسنگ فیکٹرز/ٹرانسکرپشن ٹرمینیشن فیکٹرز کو بھرتی کرتا ہے، جو ڈیڈ باکس آر این اے ہیلیکیس یو اے پی 56 اور آر این اے ایکسپورٹ اڈاپٹر ALYREF کو لوڈ کرتے ہیں۔ یہ مکمل ٹریکس کمپلیکس بناتا ہے۔ ٹرانسکرپشن کے اختتام پر، ایم آر این اے کے 3 '-اینڈ کے بننے اور ٹرانسکرپشن سائٹ سے ایم آر این اے کے خارج ہونے کے بعد، ایم آر این اے کو یو اے پی 56 سے اے ایل وائی آر ای ایف میں منتقل کیا جاتا ہے۔ یو اے پی 56 پھر الگ ہو جاتا ہے، جس سے ہیٹروڈائمیرک ایکسپورٹ ریسیپٹر این ایکس ایف 1-این ایکس ٹی 1 کو پابند ہونے کی اجازت ملتی ہے کیونکہ یہ ایل وائی آر ای ایف کے ذریعے بالواسطہ طور پر ایم آر این اے کو پہچانتا ہے۔ ایم آر این اے کے مزید انتظامات کے نتیجے میں ALYREF کی رہائی ہوتی ہے۔ آخر میں، این ایکس ایف 1-این ایکس ٹی 1 ڈائمر نیوکلیئر پور کمپلیکس کے ساتھ براہ راست تعامل کے ذریعے سائٹوپلازم تک ایم آر این اے نیوکلیئر ٹرانسپورٹ کی سہولت فراہم کرتا ہے۔ یوکرائیوٹک پرجاتیوں میں ساخت اور تحفظ ٹی ایچ او کمپلیکس انسانی ٹی ایچ او کمپلیکس چھ ذیلی اکائیوں، ٹی ایچ او سی 1،-2،-3،-5،-6، اور-7 پر مشتمل ہے۔ ان میں سے چار کے Saccharomyces cerevisiae میں ہم منصب ہیں: THOC1 (خمیر Hpr1)، −2 (خمیر Tho2)، −3 (خمیر Tex3)، اور −7 (خمیر Mft1)۔ ٹی ایچ او سی 1 ٹی ایچ او کمپلیکس میں پہچانا جانے والا پہلا پروٹین ہے۔ THOC2 ٹریکس کی سب سے بڑی ذیلی اکائی ہے۔ یہ کمپلیکس کی تشکیل کے لیے سہارے کے طور پر کام کرتا ہے۔ ٹی ایچ او سی 2 کا سی-ٹرمینل ڈومین براہ راست نیوکلک ایسڈ کے ساتھ تعامل کرتا ہے۔ ٹی ایچ او سی 2 کی تغیراتی شکلیں سنڈرومک دانشورانہ معذوریوں سے وابستہ ہیں، جس کی وجہ سے دورے، جھٹکے، تقریر میں تاخیر اور بہت کچھ ہوتا ہے۔ ٹی ایچ او سی 3 اور 6 دونوں میں ڈبلیو ڈی 40 ریپیٹ موفٹس ہوتے ہیں جو دوسرے ٹی ایچ او پروٹین کے ساتھ تعامل کی اجازت دیتے ہیں۔ ٹی ایچ او سی 5 اور ٹی ایچ او سی 7 مضبوطی سے باندھتے ہیں اور اپنے کنڈلی کنڈلی ڈومین (سی سی ڈی) پر ایک ڈائمر بناتے ہیں۔ چار ٹی ایچ او کمپلیکس ایک ٹیٹریمر بناتے ہیں، اور ہر ٹی ایچ او کمپلیکس ٹی ایچ او سی 2 اور ٹی ایچ او سی 1 پر ایک یو اے پی 56 پروٹین کے ساتھ جڑا ہوتا ہے۔ ڈی ڈی ایکس 39/یو اے پی 56 ڈی ڈی ایکس 39، یا یو 2 اے ایف 65 سے وابستہ پروٹین 56 (یو اے پی 56، خمیر میں ذیلی 2) ایک ڈیڈ باکس اے ٹی پی ایز ہے جو پری-ایم آر این اے اسپلیسنگ کے لیے ضروری ہے، لیکن یہ ٹریکس کمپلیکس کا ایک کلیدی جزو بھی ہے۔ ڈی ڈی ایکس 39 یو اے پی 56 سے بہت ملتا جلتا ہے، جو امینو ایسڈ کی ترتیب کا 90 فیصد حصہ بناتا ہے۔ یو اے پی 56 ٹی ایچ او کمپلیکس کے ساتھ جینوں کے ساتھ سفر کرتا ہے، جہاں یہ ایم آر این اے کی شوگر فاسفیٹ ریڑھ کی ہڈی کے ساتھ تعامل کرتا ہے۔ یو اے پی 56 ایل وائی آر ای ایف، ایک آر این اے ایکسپورٹ اڈاپٹر، کو اسپلیسڈ یا انٹرن لیس ایم آر این اے میں بھرتی کرنے کے لیے کام کرتا ہے۔ یو اے پی 56 سے اے ایل وائی آر ای ایف میں ایم آر این اے کی منتقلی کے بعد، یو اے پی 56 کمپلیکس سے الگ ہو جاتا ہے، جس سے اسی سائٹ پر ایکسپورٹ فیکٹر این ایکس ایف 1 کو اے ایل وائی آر ای ایف پر پابند کرنے کی اجازت ملتی ہے۔ ڈی ڈی ایکس 39 اے ممالیہ خلیوں میں، ڈی ڈی ایکس 39 بی، ڈی ڈی ایکس 39 اے کا ایک پیرالاگ موجود ہے، اور کسی حد تک فعال طور پر بے کار ہے۔ ایم آر این اے کی برآمد کو روکنے کے لیے دونوں پیرالوگوں کی ناک ڈاؤن کی ضرورت ہوتی ہے، لیکن کسی بھی پیرالوگ کی کمی ایم آر این اے کی مختلف شکلوں کو متاثر کرتی ہے۔ ڈی ڈی ایکس 39 بی کو ٹی ایچ او اور اے ایل وائی آر ای ایف کے ساتھ، اور ڈی ڈی ایکس 39 اے کو سی آئی پی 29 اور اے ایل وائی آر ای ایف کے ساتھ منسلک دکھایا گیا ہے۔ ALYREF ALYREF (خمیر میں Yra1) ایک ضروری RNA ایکسپورٹ اڈاپٹر ہے جو اسپلیسڈ اور انٹرنلیس mRNA دونوں کی برآمد میں شامل ہے۔ ALYREF کے N اور C-ٹرمینی دونوں میں UAP56-بانڈنگ موفٹس (UBMs) ہوتے ہیں، جو UAP56 کے ساتھ اس کے تعامل کے لیے ضروری ہیں۔ ALYREF میں ایک آر این اے ریکگنیشن موٹف (آر آر ایم) بھی ہوتا ہے جو آر این اے کو کمزور طور پر باندھتا ہے، اور دو ارجنائن سے بھرپور آر این اے بائنڈنگ سائٹس سے گھرا ہوا ہے۔ اکیلے ALYREF مؤثر طریقے سے mRNA کو باندھ نہیں سکتا، اور TREX کمپلیکس میں mRNA کو باندھنے کے لیے UAP56 کے ساتھ تعامل کی ضرورت ہوتی ہے (شکل 3 دیکھیں)۔ یہ ارجنائن سے بھرپور مقامات ALYREF کے ایکسپورٹ ریسیپٹر NXF1 کے ساتھ تعامل کے لیے بھی ضروری ہیں، جو ALYREF سے NXF1 میں mRNA کی منتقلی کو متحرک کرتا ہے۔ یو اے پی 56 کی طرح، اے ایل وائی آر ای ایف ایم آر این اے کی جوہری برآمد سے پہلے الگ ہو جاتا ہے۔ ALYREF کی غیر ساختہ اور لچکدار نوعیت اس بات کی نشاندہی کرتی ہے کہ یہ جوہری برآمد کے لیے ایم آر این اے اور پروٹین کو میسنجر ربنیوکلیئر پروٹین (ایم آر این پی) میں پیک کرنے میں کلیدی کردار ادا کر سکتا ہے۔ یو آئی ایف/ایف وائی ٹی ٹی ڈی 1 یو آئی ایف، جس کی شناخت ایل وائی آر ای ایف کے یو اے پی 56 بائنڈنگ ڈومین کے جین ہومیولوجی کے ذریعے کی گئی ہے، ایل وائی آر ای ایف کے ساتھ فعال طور پر بے کار ہے۔ ممالیہ خلیوں میں ALYREF کی ناک ڈاؤن کے نتیجے میں UIF کی بڑی حد تک ریگولیشن ہوتی ہے۔ یو آئی ایف آر این اے سے آزاد طریقے سے ٹریکس کے دیگر پیچیدہ اجزاء کے ساتھ منسلک ہو سکتا ہے۔ یو آئی ایف کے بارے میں قیاس کیا جاتا ہے کہ وہ ایل وائی آر ای ایف کی جگہ متبادل ٹریکس کمپلیکس کے ساتھ منسلک ہوتا ہے، شاید بعض اقسام یا ایم آر این اے پر کام کرتا ہے۔ سی ایچ ٹی او پی اصل میں سیل سائیکل ریگولیشن میں شامل آر این اے بائنڈنگ پروٹین کے طور پر پہچانا جاتا ہے، سی ایچ ٹی او پی میں دو یو بی ایم ہوتے ہیں جیسے ALYREF اور UIF میں ہوتے ہیں، اور خیال کیا جاتا ہے کہ یہ ALYREF کی طرح کام کرتا ہے۔ سی ایچ ٹی او پی کو یو اے پی 56 اے ٹی پی ایز سرگرمی کو متحرک کرنے کے لیے بھی دکھایا گیا ہے۔ سی ایچ ٹی او پی کے بارے میں قیاس کیا جاتا ہے کہ وہ یو اے پی 56 کی جگہ متبادل ٹریکس کمپلیکس کے ساتھ منسلک ہوتا ہے، شاید مخصوص اقسام یا ایم آر این اے پر کام کرتا ہے۔ ایس اے آر این پی/سی آئی پی 29 ایس اے آر این پی/سی آئی پی 29 (خمیر تھو 1)، جس کی شناخت خمیر تھو 2 کے ساتھ کی گئی ہے، یو اے پی 56 اور اے ایل وائی آر ای ایف کے ساتھ ایک ٹرائمرک کمپلیکس بناتا ہے، اور اسے ترجیحی طور پر ڈی ڈی ایکس 39 اے کے ساتھ منسلک دکھایا گیا ہے۔ ایس اے آر این پی یو اے پی 56 اے ٹی پی ایز سرگرمی کو متحرک کرتا ہے۔ ایسوسی ایٹڈ پروٹین این ایکس ایف 1 این ایکس ایف 1 (خمیر میں میکس 67 پی)، جسے نیوکلیئر آر این اے ایکسپورٹ فیکٹر 1 بھی کہا جاتا ہے، ایک ملٹی ڈومین پروٹین ہے جو ایک محفوظ این-ٹرمینل آر این اے شناخت اور چار لیوسین سے بھرپور ریپیٹ موفٹس، ایک مرکزی این ٹی ایف 2 جیسا ڈومین، اور ایک سی-ٹرمینل یوبیکیوٹین سے وابستہ ڈومین پر مشتمل ہے جو نیوکلیوپورن کے ساتھ تعاملات میں ثالثی کرتا ہے۔ این ٹی ایف 2 جیسا ڈومین این ٹی ایف 2 سے متعلق ایکسپورٹ پروٹین-1 (این ایس ٹی 1) کے ساتھ ہیٹروڈائمر بنانے کے قابل ہے۔ ہیٹروڈائمر ٹریکس کمپلیکس کے ذریعے پروسیس شدہ ایم آر این اے کو باندھتا ہے اور جوہری برآمدی عمل میں ٹریکس کمپلیکس کی مدد کرتا ہے۔ NXT1 NXT1 (خمیر میں Mtr2p) کو p15 کے نام سے بھی جانا جاتا ہے۔ یہ نیوکلئس اور سائٹوپلازم کے درمیان گھومتا ہے جو ایک فعال نیوکلیئر ٹرانسپورٹ پروٹین کے طور پر کام کرتا ہے۔ NXT1 خاص طور پر رن-جی ٹی پی سے جڑا ہوا ہے اور ممالیہ خلیوں میں نیوکلیئر پور کمپلیکس میں مقامی ہوتا ہے۔ یہ این ایکس ایف 1 کے ساتھ ہیٹروڈائمرز کو بھی مستحکم اور تشکیل دیتا ہے۔ ہیٹروڈائمر ٹریکس کمپلیکس کے ذریعے پروسیس شدہ ایم آر این اے کو باندھتا ہے اور جوہری برآمدی عمل میں ٹریکس کمپلیکس کی مدد کرتا ہے۔ این سی بی پی 1 اور این سی بی پی 3 این سی بی پی 1 اور این سی بی پی 3 دونوں کیپ بائنڈنگ کمپلیکس کا حصہ ہیں۔ نیوکلئس سے سائٹوپلازم تک ایم آر این اے کی برآمد کو آسان بنانے میں دونوں پروٹین ایک دوسرے کے ساتھ ساتھ ٹریکس کمپلیکس کے ساتھ تعامل کرتے ہیں۔ این سی بی پی 3 ایم آر این اے اسپلیسنگ اور استحکام کے لیے ایکسن جنکشن کمپلیکس پروٹین کے ساتھ مزید تعامل کرتا ہے۔ جینوم استحکام، تغیرات اور بیماریوں میں کردار ٹریکس کمپلیکس ایک محفوظ پروٹین کمپلیکس ہے جو جوڑے ایم آر این اے برآمد کرنے کے لیے نقل کرتے ہیں اور جینوم استحکام اور کئی عوارض سے منسلک ہوتا ہے۔ جینوم استحکام ٹریکس کمپلیکس جینوم استحکام میں اہم کردار ادا کرتا ہے۔ نئے بنے ہوئے آر این اے اسٹرینڈز نقل کے دوران سنگل اسٹرینڈڈ ٹیمپلیٹ ڈی این اے سیکوینس کے ساتھ ہائبرڈائز ہو سکتے ہیں، جس سے آر-لوپ ہوتا ہے۔ آر-لوپ مخالف ڈی این اے اسٹرینڈ کو کلیویج کے لیے زیادہ حساس بناتا ہے، جو خلیوں میں ڈی این اے کو نقصان پہنچا سکتا ہے۔ ٹریکس کمپلیکس آر این اے پولیمریز اور نو تشکیل شدہ آر این اے کے ساتھ وابستہ ہوتا ہے، جو آر این اے کو الگ کرتا ہے اور اس وجہ سے، ڈی این اے اسٹرینڈ میں اس کی ہائبرڈائزیشن کو روکتا ہے، جس سے جینوم کے استحکام میں بہتری آتی ہے۔ نیوروڈیجینریٹو بیماریاں ٹریکس کمپلیکس کئی نیوروڈیجینریٹو اور نیورو ڈیولپمنٹل عوارض سے وابستہ ہے۔ یہ عوارض خود ٹریکس کمپلیکس یا دیگر جینوں میں تغیرات کی وجہ سے ہوتے ہیں۔ ٹریکس ذیلی اکائیوں میں براہ راست تغیرات ٹی ایچ او سی 2 جین میں کئی تغیرات، جو ٹی ایچ او کمپلیکس کا حصہ ہیں، بیماری سے وابستہ ہیں۔ مثال کے طور پر، مس سینس میوٹیشن، یا نیوکلیوٹائڈ میں تبدیلی جس کے نتیجے میں ایک مختلف امینو ایسڈ کی انکوڈنگ ہوتی ہے، اس جین میں اور ایکس کروموسوم پر ٹرانسلوکیشنز دانشورانہ معذوریوں سے وابستہ ہیں۔ ٹی ایچ او سی 6 جین، جو ٹی ایچ او کمپلیکس کا حصہ ہے، دماغ اور دیگر اعضاء کی نشوونما میں کردار ادا کرتا ہے۔ اس جین پر تغیرات سائٹوپلازم میں پروٹین کی غلط لوکلائزیشن کا باعث بنتے ہیں، جو اعصابی اور اعضاء کی نشوونما کے لیے ایک ضروری عمل ہے۔ اس جین میں ہوموزائگس میوٹیشن نہ صرف ذہنی معذوری کا باعث بن سکتا ہے بلکہ دل کی خرابی اور دماغ کی خرابی کا باعث بھی بن سکتا ہے۔ دیگر جینوں میں تغیرات دیگر جینوں میں تغیرات کا ٹریکس کمپلیکس پر بالواسطہ انحصار بھی ہو سکتا ہے اور بیماری کا باعث بن سکتا ہے، بشمول فیملیئل امییوٹروفک لیٹرل سکلیروسیس (اے ایل ایس)۔ اے ایل ایس ایک نایاب نیوروڈیجینریٹو بیماری ہے جو دماغ میں موٹر نیوران کی موت کا باعث بنتی ہے، جس کے نتیجے میں رضاکارانہ حرکت کا نقصان ہوتا ہے۔ بیماری کی خاندانی شکل میں، سی 9 او آر ایف 72 جین کے انٹرن میں جی جی جی سی سی ریپیٹ کو پری ایم آر این اے میں بڑھایا جاتا ہے، جو سائٹوپلازم میں برآمد ہوتا ہے اور آر این اے فوکی بناتا ہے۔ ALYREF بار بار توسیع کا پابند ہے، اور ایک اضافی بھرتی اس کی برآمد کو فروغ دیتی ہے۔ ایک تغیر جو اس کی سرگرمی میں خلل ڈالتا ہے نیوروڈی جنریشن کو دبا دیتا ہے، اور اسے سی ایچ ٹی او پی اور این ایکس ایف 1 کے ذریعے بڑھایا جاتا ہے۔ یہ بھی دیکھیں کہ THOC1 THOC2 THOC5 BAT1 DDX39 ALYREF SARNP NXT1 NXF1 حوالہ جات