Transmembrane protein 89
ٹرانس میمبرین پروٹین 89 (ٹی ایم ای ایم 89) ایک پروٹین ہے جسے انسانوں میں ٹی ایم ای ایم 89 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ جین کی ساخت TMEM89 جین کروموسوم 3 (3p21.31) کے مائنس اسٹرینڈ پر 48,658,192 سے 48,659,288 تک پایا جاتا ہے اور 1,011 نیوکلیوٹائڈز لمبا ہوتا ہے۔ جین میں دو ایکسون ہوتے ہیں۔ ان دونوں ایکسون کے متبادل طور پر جڑے ہونے کی پیش گوئی نہیں کی گئی ہے۔ جین کا اظہار ٹی ایم ای ایم 89 جین خصیوں میں سب سے زیادہ ظاہر ہوتا ہے۔ ٹی ایم ای ایم 89 کا اظہار دیگر بافتوں جیسے پیٹ، گردے، دل، بیضہ دانی، تائیرائڈ، بڑی آنت، بون میرو اور ایڈرینل بافتوں میں بھی کم سطح پر پایا جاتا ہے۔ یہ جین جنین کے دل، معدے، گردے اور آنتوں کے بافتوں میں بھی ظاہر ہوتا ہے۔ امیونوہسٹو کیمسٹری کے اعداد و شمار سے یہ بھی معلوم ہوا ہے کہ ٹی ایم ای ایم 89 بڑی آنت، فیلوپین ٹیوب، گردے اور خصیوں کے بافتوں کی خلیے کی جھلیوں میں واقع ہے۔ ٹی ایم ای ایم 89 جین کا اظہار بھی ماؤس سیریبلم سے دماغ کے بافتوں میں کم مقدار میں پایا گیا ہے۔ جین ایکسپریشن پڑوس ہیومن ٹی ایم ای ایم 89 ہیومن پروٹین اٹلس ایکسپریشن کلسٹر 23: سپرمیٹڈس-فلیگیلم اینڈ گولگی تنظیم کا ایک حصہ ہے۔ 15 قریب ترین اظہار پڑوسیوں میں او آر 4 ایم 1، اے این ٹی ایکس آر ایل، ٹی جی آئی ایف 2 ایل ایکس، سی پی ایکس سی آر 1، سی 3 آرف 84، سی ایکس آرف 66، سی ایل ڈی این 17، سی 11 آرف 94، یو ایس پی 50، ایس پی ڈی وائی ای 4، ایم ایم پی 20، ایس ایس ایم ای ایم 1، سی 17 آرف 98، ایس پی اے سی اے 1، اور ایل وائی زیڈ ایل 1 شامل ہیں۔ غیر متفرق جین اظہار ٹی ایم ای ایم 89 کا اظہار امنیٹک سیال سے ماخوذ ایچ اے کے پی سی-پی خلیوں میں لافانی ایچ آئی پوڈ لائن خلیوں کے مقابلے میں بہت زیادہ ہے۔ ٹی ایم ای ایم 89 کا اظہار ان خلیوں میں زیادہ ہوتا ہے جن میں میکروفیج مائیگریشن انابائٹری فیکٹر (ایم آئی ایف) کنٹرول کے مقابلے میں نیچے گر جاتا ہے۔ انسانی جنین اسٹیم خلیوں سے کارڈیومیوسائٹس میں TMEM89 کا اظہار سب سے کم ہے، اس کے مقابلے میں انسانی جنین اسٹیم خلیوں، دھڑکتے ہوئے کارڈیومیوسائٹس کے ساتھ جنین کے جسم، اور جنین کے دلوں سے کارڈیومیوسائٹس میں اظہار ہوتا ہے۔ کلینیکل اہمیت TMEM89 کے جین کے اظہار کو اوپری ٹریکٹ یوروتھیلیل کارسنوما میں اپ ریگولیٹ کیا گیا تھا، اور اس وجہ سے اس قسم کے کارسنوما کے لیے ممکنہ بائیو مارکر سیکرٹری پروٹین کے طور پر پیش گوئی کی گئی تھی۔ ایس این پی کے تجزیے میں ٹی ایم ای ایم 89 جین آٹزم سپیکٹرم ڈس آرڈر کی شدت میں ممکنہ ترمیم کرنے والا پایا گیا۔ ٹی ایم ای ایم 89 کا جین اظہار ایک ایسے ماڈل میں بھی استعمال کیا گیا تھا جس میں اسٹیج 1 ٹیسٹکیولر جرم سیل ٹیومر میں ممکنہ دوبارہ ہونے کے خطرے کے اسکور کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ پروٹین کی ساخت بنیادی انسانی TMEM89 پروٹین 159 امینو ایسڈ لمبا ہے۔ اس پروٹین کی سالماتی کمیت ~ 17.5kDa اور آئسو الیکٹرک پوائنٹ ~ 10 پی آئی ہے۔ زیادہ بنیادی پی آئی والے پروٹین عام طور پر مائٹوکونڈریا یا پلازما جھلی سے وابستہ ہوتے ہیں اور ان میں پروٹین کا تعامل کم ہوتا ہے۔ پروٹین کی ساخت میں دو ٹپوولوجیکل ڈومینز (ایکسٹرا سیلولر اور سائٹوپلاسمک) اور ایک ہیلیکل ٹرانس میمبرین ڈومین شامل ہیں۔ انسانی TMEM89 پروٹین امینو ایسڈ ہسٹائڈائن، لیوسین اور ٹرپٹوفین سے بھرپور ہوتا ہے۔ انسانی TMEM89 پروٹین میں امینو ایسڈ ایسپرٹیٹ، ایسپرگین، اور فینائلالینائن کم مقدار میں موجود ہوتے ہیں۔ امینو ایسڈ کے نمونے جیسے ای ڈی انسانی ٹی ایم ای ایم 89 پروٹین میں کم مقدار میں موجود ہوتے ہیں، جبکہ پیٹرن کے آر-ای ڈی زیادہ مقدار میں موجود ہوتا ہے۔ انسانی TMEM89 پروٹین کے ایکسٹرا سیلولر ڈومین کے اندر، باقاعدہ فاصلے کے ساتھ 3 سسٹین ہوتے ہیں۔ سائٹوپلاسمک ڈومین میں، امینو ایسڈ 3-5 اور 25-27 سے دو مثبت امینو ایسڈ چلتے ہیں۔ ان مختلف امینو ایسڈ کے نمونوں اور پروٹین ڈومینز کو دائیں طرف کے اعداد و شمار میں دیکھا جا سکتا ہے۔ ثانوی TMEM89 پروٹین صرف α-ہیلسیس اور اسٹرینڈز سے بنا ہے۔ α-ہیلسیس تینوں ڈومینز میں پورے پروٹین میں تقسیم ہوتے ہیں۔ ترتیری انسانی ٹی ایم ای ایم 89 کے ترتیری ڈھانچے کی پیش گوئی الفافولڈ اور آئی-ٹیسر سافٹ ویئر کا استعمال کرتے ہوئے کی گئی تھی۔ ان ڈھانچوں کو دائیں طرف دیکھا جا سکتا ہے۔ ترجمہ کے بعد کی تبدیلیاں TMEM89 پروٹین میں امینو ایسڈ 47-52 سے ایک پیش گوئی شدہ N-میریسٹیلیشن سائٹ، امینو ایسڈ 106-111 سے ایک پیش گوئی شدہ Src ہومیولوجی 3 (SH3) بائنڈنگ ڈومین، اور امینو ایسڈ S117 پر ایک محفوظ پیش گوئی شدہ فاسفوریلیشن سائٹ ہے۔ این-مائرسٹیلیشن ایک پروٹین لپڈ ترمیم ہے جس میں پروٹین-پروٹین کے تعاملات، سیل سگنلنگ، اور پروٹین کو اینڈو میمبرینز اور پلازما جھلی کو نشانہ بنانے میں کردار ہے۔ ایس ایچ 3 بائنڈنگ ڈومینز والے پروٹین عام طور پر سگنل ٹرانسڈکشن کے راستوں، سائٹوسکیلیٹن تنظیم، جھلی کی اسمگلنگ، یا آرگنیل اسمبلی میں شامل ہوتے ہیں۔ پروٹین فاسفوریلیشن ایک اہم عمل ہے جس میں سگنل ٹرانسڈکشن، پروٹین کی ترکیب، خلیوں کی تقسیم، خلیوں کی نشوونما، نشوونما اور بڑھاپے شامل ہیں۔ تعاملات انسانی ٹی ایم ای ایم 89 پروٹین سی 4 اے، آر بی ایم 15 بی، جی او ایل جی اے 6 اے، پی ایف کے ایف بی 4، ڈی او سی کے 3، ایم اے پی کے اے پی کے 3، زیڈ این ایف 557، اور زیڈ بی ٹی بی 47 پروٹین کے ساتھ تعاملات کرتا ہے۔ TMEM89 کے آرتھولوگ صرف ممالیہ جانوروں میں پائے جاتے ہیں۔ واحد ممالیہ ٹیکسون جس میں TMEM89 آرتھولوگ نہیں ہے وہ مونوٹریمس ہے۔ ذیل میں انسانی TMEM89 کے کچھ آرتھولوگس کے بارے میں معلومات کے ساتھ ایک ٹیبل ہے۔ یہ آرتھولوگس ایک سے زیادہ ترتیب کی صف بندی اور دائیں طرف این-میریسٹیلیشن سائٹ کی صف بندی کرنے کے لیے استعمال کیے گئے تھے۔ انسانی TMEM89 پروٹین کے سائٹوپلاسمک اور ایکسٹرا سیلولر ڈومینز کے اندر محفوظ علاقوں کے علاقے سب سے زیادہ محفوظ نظر آتے ہیں، جیسا کہ دائیں طرف کے اعداد و شمار میں دیکھا گیا ہے۔ ان میں سے کچھ محفوظ امینو ایسڈ سائٹوپلاسمک اور ایکسٹرا سیلولر علاقوں میں α-ہیلسیس کا حصہ ہیں۔ انسانی کروموسوم 3 پر جینز کے حوالے