CRISPR RNA
سی آر آئی ایس پی آر آر این اے یا سی آر آر این اے سی آر آئی ایس پی آر لوکس سے ایک آر این اے نقل ہے۔ سی آر آئی ایس پی آر-سی اے ایس (کلسٹرڈ، باقاعدگی سے انٹر اسپیسڈ شارٹ پیلینڈرومک ریپیٹس-سی آر آئی ایس پی آر سے وابستہ نظام) بیکٹیریا اور آرکیا میں پایا جانے والا ایک انکولی مدافعتی نظام ہے جو موبائل جینیاتی عناصر، جیسے وائرس، پلازمیڈز اور ٹرانسپوسن سے بچاتا ہے۔ سی آر آئی ایس پی آر لوکس منفرد سپیسروں کے ساتھ وقفے وقفے کی ایک سیریز پر مشتمل ہے۔ یہ منفرد سپیسرز ایم جی ایز سے حاصل کیے جا سکتے ہیں۔ پری-سی آر آر این اے سی آر آئی ایس پی آر لوکس کی نقل کے بعد اور سی اے ایس پروٹین کے ذریعے پروسیس کیے جانے سے پہلے بنتا ہے۔ بالغ سی آر آر این اے نقل میں ریپیٹ کا جزوی محفوظ حصہ اور سپیسر کا ایک سلسلہ ہوتا ہے جو ہدف ڈی این اے کی تکمیل کرتا ہے۔ سی آر آر این اے ایک ایفیکٹر کمپلیکس بناتا ہے جس میں ایک واحد نیوکلیز یا متعدد سی اے ایس پروٹین ہوتے ہیں جنہیں کاسکیڈ (اینٹی وائرل دفاع کے لیے سی آر آئی ایس پی آر سے وابستہ کمپلیکس) کہا جاتا ہے۔ ایک بار ایفیکٹر کمپلیکس بننے کے بعد ایک کاس نیوکلیز یا سنگل ایفیکٹر پروٹین سی آر آر این اے میچ کی رہنمائی میں مداخلت کا سبب بنے گا۔ فنکشن ٹائپ-I ٹائپ-I سی آر آئی ایس پی آر سسٹمز کی خصوصیت کاس 3، ایک نیوکلیز-ہیلیکیز پروٹین، اور ملٹی سب یونٹ کاسکیڈ (اینٹی وائرل دفاع کے لیے سی آر آئی ایس پی آر سے وابستہ کمپلیکس) ہے۔ سی آر آر این اے جھرن میں کاس پروٹین کے ساتھ ایک کمپلیکس تشکیل دے سکتا ہے اور کمپلیکس کو ہدف ڈی این اے ترتیب کی طرف رہنمائی کر سکتا ہے۔ Cas3 کو نیوکلیز-ہیلیکیز سرگرمی کے لیے بھرتی کیا جاتا ہے۔ عام طور پر کاسکیڈ میں، کاس 6 پختہ سی آر آر این اے تیار کرتا ہے جبکہ کاس 5 اور کاس 7 عمل کرتے ہیں اور سی آر آر این اے کو مستحکم کرتے ہیں۔ ٹائپ-II ٹائپ-II CRISPR نظاموں کی خصوصیت واحد دستخطی نیوکلیز Cas9 ہے۔ ٹائپ-II سی آر آئی ایس پی آر سسٹمز میں سی آر آر این اے اور ٹری سی آر آر این اے (ٹرانس ایکٹیویٹنگ سی آر آئی ایس پی آر آر این اے) ایک کمپلیکس تشکیل دے سکتے ہیں جسے گائیڈ آر این اے یا جی آر این اے کہا جاتا ہے۔ جی آر این اے کے اندر سی آر آر این اے وہ ہے جو پی اے ایم ملنے کے بعد ٹارگٹ سیکوینس یا پروٹو اسپیسر سے میل کھاتا ہے۔ ایک بار میچ ہونے کے بعد Cas9 ایک ڈبل اسٹرینڈڈ بریک بنائے گا۔ ٹائپ-III ٹائپ-III سی آر آئی ایس پی آر سسٹم کی خصوصیت کاس 10 ہے، جو ایک آر این اے کلیونگ پروٹین ہے۔ ٹائپ-I کی طرح، ایک بڑا سب یونٹ ایفیکٹر کمپلیکس بنتا ہے اور سی آر آر این اے کمپلیکس کو ٹارگٹ سیکوینس کی طرف رہنمائی کرتا ہے۔ کاس 6 بالغ سی آر آر این اے پیدا کرنے میں مدد کرتا ہے۔ ٹائپ-IV ٹائپ-IV سی آر آئی ایس پی آر سسٹمز میں ایفیکٹر نیوکلیز نہیں ہوتا ہے اور یہ پلازمیڈز اور پروفیجز سے وابستہ ہوتے ہیں۔ کاس 6 جیسا انزائم سی آر آر این اے کی پختگی سے وابستہ ہے۔ تمام ٹائپ-IV سسٹمز میں سی آر آئی ایس پی آر لوکس نہیں ہوتا ہے اور اس لیے ان میں سی آر آر این اے نہیں ہوتا ہے۔ ٹائپ-V ٹائپ-V CRISPR نظام کی خصوصیت Cas12 ہے، جو ایک نیوکلیز ہے جو ssDNA، dsDNA، اور RNA کو الگ کر سکتا ہے۔ Cas9 کی طرح، Cas12 سنگل ایفیکٹر نیوکلیز ہے۔ ٹائپ-V سسٹم ٹریکر آر این اے کے بغیر پری-سی آر آر این اے پر کارروائی کرتے ہیں۔ کاس 12 کے ساتھ کمپلیکس میں پختہ سی آر آر این اے دلچسپی کے ڈی این اے تسلسل کو نشانہ بناتا ہے اور ڈی این اے کو الگ کرتا ہے۔ ٹائپ-VI ٹائپ-VI CRISPR سسٹمز کی خصوصیت Cas13 ہے، جو ایک واحد ایفیکٹر پروٹین ہے جو RNA کو نشانہ بناتا ہے۔ ٹائپ-V سسٹم کی طرح، Cas13 ٹریکر آر این اے کے بغیر پری-سی آر آر این اے پر کارروائی کر سکتا ہے۔ کاس 13 کے ساتھ کمپلیکس میں پختہ سی آر آر این اے کمپلیکس کو ہدف آر این اے کی طرف رہنمائی کرتا ہے اور اسے خراب کرتا ہے۔ حوالہ جات آر این اے