DREAM Challenges
ڈریم چیلنجز (ڈائیلاگ فار ریورس انجینئرنگ اسسمنٹ اینڈ میتھڈز) ہجوم سے حاصل کردہ مقابلوں کے ذریعے بائیو میڈیکل اور سسٹمز بائیولوجی کی تحقیق کو آگے بڑھانے کے لیے ایک غیر منافع بخش پہل ہے۔ 2006 میں شروع ہونے والے ڈریم چیلنجز نے سنیپس پلیٹ فارم پر چلنے والے مقابلوں کے لیے ایک پلیٹ فارم فراہم کرنے کے لیے سیج بائیو نیٹ ورکس کے ساتھ تعاون کیا۔ 15 سال سے زیادہ کے عرصے میں 60 سے زیادہ ڈریم چیلنجز کا انعقاد کیا گیا ہے۔ ڈریم چیلنجز کی بنیاد 2006 میں آئی بی ایم ریسرچ سے گستاوو اسٹولوویزکی اور کولمبیا یونیورسٹی سے اینڈریا کیلیفانو نے رکھی تھی۔ ڈریم تنظیم کے موجودہ سربراہ یونیورسٹی آف کیلیفورنیا کے پال بوتروس ہیں۔ مزید تنظیم ایمریٹس چیئرز جسٹن گینی اور گستاوو اسٹولوویزکی، اور متعدد ڈریم ڈائریکٹرز پر محیط ہے۔ انفرادی چیلنجز ایک مخصوص بائیو میڈیکل ریسرچ کے سوال سے نمٹنے پر مرکوز ہوتے ہیں، جو عام طور پر ایک مخصوص بیماری تک محدود ہوتے ہیں۔ ایک نمایاں بیماری کا فوکس اونکولوجی پر رہا ہے، جس میں متعدد ماضی کے چیلنجز چھاتی کے کینسر، ایکیوٹ مائیلوئڈ لیوکیمیا، اور پروسٹیٹ کینسر یا اسی طرح کی بیماریوں پر مرکوز ہیں۔ انفرادی چیلنج میں شامل اعداد و شمار بیماری کے سیاق و سباق کی عکاسی کرتے ہیں ؛ جبکہ کینسر میں عام طور پر انسانی جینوم میں تغیرات، ٹرانسکرپٹومیکس میں جین کے اظہار اور جین نیٹ ورک، اور بڑے پیمانے پر پروٹومکس جیسے اعداد و شمار شامل ہوتے ہیں، نئے چیلنجز سنگل سیل سیکوینسنگ ٹیکنالوجیز کے ساتھ ساتھ ابھرتے ہوئے گٹ مائکرو بایوم سے متعلق تحقیقی سوالات کی طرف منتقل ہو گئے ہیں، اس طرح وسیع تر تحقیقی برادری کے رجحانات کی عکاسی ہوتی ہے۔ ڈریم چیلنجز کے لیے تحریک یہ ہے کہ مقابلوں کے ذریعے بڑے سامعین تک ہجوم سے حاصل ہونے والے ڈیٹا کے ذریعے، بہتر ماڈل اور بصیرت حاصل کی جاتی ہے اگر تجزیہ کسی ایک ادارے کے ذریعے کیا گیا ہو۔ ماضی کے مقابلے ایسے سائنسی مقامات پر شائع کیے گئے ہیں جیسے کہ نیچر پورٹ فولیو اور پی ایل او ایس پبلشنگ گروپوں کے فلیگ شپ جریدے۔ ڈریم چیلنجز کے نتائج کا اعلان ویب پلیٹ فارم کے ذریعے کیا جاتا ہے، اور اعلی کارکردگی کا مظاہرہ کرنے والے شرکاء کو آئی ایس سی بی کے زیر اہتمام آر ایس جی/ڈریم کے ساتھ سالانہ آر ای سی او ایم بی/آئی ایس سی بی کانفرنسوں میں اپنے نتائج پیش کرنے کے لیے مدعو کیا جاتا ہے۔ اگرچہ ڈریم چیلنجز نے کھلی سائنس اور ڈیٹا پر زور دیا ہے، لیکن مریضوں کے گروپوں میں جینومکس جیسے انتہائی حساس ڈیٹا سے پیدا ہونے والے مسائل کو کم کرنے کے لیے "ماڈل ٹو ڈیٹا" کے طریقوں کو اپنایا گیا ہے۔ اس طرح کے چیلنجوں میں شرکاء ڈوکر یا سنگلریٹی جیسے کنٹینرز کے ذریعے اپنے ماڈل جمع کراتے ہیں۔ یہ اصل ڈیٹا کی رازداری کو برقرار رکھنے کی اجازت دیتا ہے کیونکہ یہ کنٹینر پھر منتظمین کے ذریعہ خفیہ ڈیٹا پر چلائے جاتے ہیں۔ یہ زیادہ روایتی اوپن ڈیٹا ماڈل سے مختلف ہے، جہاں شرکاء فراہم کردہ اوپن ڈیٹا کی بنیاد پر براہ راست پیش گوئیاں پیش کرتے ہیں۔ چیلنج تنظیم ڈریم چیلنج ایک بنیادی ڈریم/سیج بائیو نیٹ ورکس تنظیم گروپ کے ساتھ ساتھ ایک توسیعی سائنسی ماہر گروپ پر مشتمل ہے، جس نے چیلنج کی تخلیق اور تصور میں یا کلیدی ڈیٹا فراہم کرکے تعاون کیا ہوگا۔ مزید برآں، وسیع تر تحقیقی برادری کے ذریعہ نئے ڈریم چیلنجز تجویز کیے جا سکتے ہیں۔ دوا ساز کمپنیاں یا دیگر نجی ادارے بھی ڈریم چیلنجوں میں ملوث ہو سکتے ہیں، مثال کے طور پر ڈیٹا فراہم کرنے میں۔ کلیدی مراحل کے لیے چیلنج ڈھانچہ ٹائم لائنز (جیسے تعارف ویبینار، ماڈل جمع کرانے کی آخری تاریخ، اور شرکت کے لیے آخری آخری تاریخ) پیشگی فراہم کی جاتی ہیں۔ فاتحین کے اعلان کے بعد، منتظمین مقابلے کے اہم نتائج کو بیان کرنے والی اشاعت کے لیے پوسٹ ہاک تجزیہ کرنے کے لیے اعلی کارکردگی کا مظاہرہ کرنے والے شرکاء کے ساتھ تعاون کرنا شروع کر دیتے ہیں۔ چیلنجوں کو ذیلی چیلنجوں میں تقسیم کیا جا سکتا ہے، ہر ایک تحقیقی سوال کے اندر ایک مختلف ذیلی موضوع سے خطاب کرتا ہے۔ مثال کے طور پر، کینسر کے علاج کی افادیت کی پیش گوئیوں کے حوالے سے، یہ ترقی سے پاک بقا، مجموعی بقا، RECIST کے مطابق بہترین مجموعی ردعمل، یا واقعہ (ترقی یا موت) تک کے عین وقت کے لیے الگ الگ پیش گوئیاں ہو سکتی ہیں۔ ڈریم چیلنجز کے دوران شرکت، شرکاء عام طور پر فراہم کردہ ڈیٹا پر ماڈل بناتے ہیں، اور پیش گوئیاں یا ماڈل پیش کرتے ہیں جن کی منتظمین کی طرف سے ہولڈ آؤٹ ڈیٹا پر توثیق کی جاتی ہے۔ اگرچہ ڈریم چیلنجز شرکاء کو توثیق کا ڈیٹا لیک کرنے سے بچتے ہیں، لیکن عام طور پر مڈ چیلنج سبمیشن لیڈر بورڈز دستیاب ہوتے ہیں جو شرکاء کو ذیلی نمونے یا اسکرینبلڈ ڈیٹا سیٹ پر ان کی کارکردگی کا جائزہ لینے میں مدد کرتے ہیں۔ ڈریم چیلنجز شرکاء کے لیے مفت ہیں۔ کھلے مرحلے کے دوران کوئی بھی انفرادی طور پر یا ایک ٹیم کے طور پر حصہ لینے کے لیے سنیپس کے ذریعے اندراج کر سکتا ہے۔ ایک شخص صرف ایک بار اندراج کر سکتا ہے اور کوئی عرفیت استعمال نہیں کر سکتا ہے۔ کچھ مستثنیات ہیں، جو کسی فرد کو حصہ لینے سے نااہل قرار دیتے ہیں، مثال کے طور پر: شخص کو مخصوص چیلنج کے لیے ڈیٹا تک رسائی حاصل کرنے کا استحقاق حاصل ہے، اس طرح انہیں غیر منصفانہ فائدہ فراہم ہوتا ہے۔ شخص پکڑا گیا ہے یا پچھلے ڈریم چیلنجز کو دھوکہ دینے یا غلط استعمال کرنے کے شبہ میں ہے۔ فرد نابالغ ہے (18 سال سے کم عمر یا رہائش کے دائرہ اختیار میں اکثریت کی عمر)۔ والدین کی رضامندی سے اس میں کمی لائی جا سکتی ہے۔ یہ بھی دیکھیں کراؤڈ سورسنگ پروجیکٹوں کی فہرست فنکشن اینوٹیشن کی تنقیدی تشخیص (سی اے ایف اے) جینوم تشریح کی تنقیدی تشخیص (سی اے جی آئی) تعاملات کی پیش گوئی کی تنقیدی تشخیص (سی اے پی آر آئی) پروٹین ڈھانچے کی پیش گوئی کی تنقیدی تشخیص (سی اے ایس پی) کیگل حوالہ جات اطلاقی مشین لرننگ بائیو انفارمیٹکس کمپیوٹر سائنس مقابلے کراؤڈ سورسنگ پیشن گوئی مقابلے مالیکیولر ماڈلنگ پروگرامنگ مقابلے