TMEM269
ٹرانس میمبرین پروٹین 269 (ٹی ایم ای ایم 269) ایک پروٹین ہے جسے انسانوں میں ٹی ایم ای ایم 269 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ جین پلس اسٹرینڈ پر 1p34.2 کے سائٹوجنیٹک مقام کے ساتھ واقع ہے اور اس کا الحاق نمبر A0A1B0GVZ9.1 ہے۔ جین کا دورانیہ تقریبا 160,000 بیس جوڑوں کا ہوتا ہے۔ اس میں ایک متفرق نقل ہے جس کا اظہار ٹی ایم ای ایم 269 کی مخالف سمت میں منفی اسٹرینڈ پر ہوتا ہے۔ ٹرانسکرپٹ آر این اے-سی کیو ڈیٹا انسانوں میں ٹشو کی قسم کے مطابق آر این اے-سی کیو ڈیٹا کے مطالعے میں ٹی ایم ای ایم 269 کا اظہار خصیوں، دماغ، اینڈومیٹریم اور گردے میں سب سے زیادہ پایا گیا۔ اعداد و شمار سے پتہ چلتا ہے کہ ٹی ایم ای ایم 269 ٹشو کی اقسام میں ہر جگہ کافی کم شرح پر نقل کیا جاتا ہے جس میں ٹشو کی کوئی قسم نہیں ہوتی ہے جس میں 0.4 ریڈز فی کلو بیس فی ملین ریڈز میپ کیے جاتے ہیں۔ ٹشو کی اقسام میں RNA-SEQ ڈیٹا کے ایک علیحدہ مطالعے سے دماغ، ایڈرینل گلینڈ، اور ٹیسٹس ریگولیشن آف ٹرانسلیشن میں TMEM269 کے لیے سب سے زیادہ اظہار کا اشارہ ملتا ہے۔ ماؤس کے ماڈلز میں ذیابیطس گردے کی بیماری (DKD) کے ایک مطالعے سے پتہ چلتا ہے کہ miRNA-181b-5b، ایک miRNA جو DKD چوہوں میں ڈرامائی طور پر کم ریگولیٹ ہوتا ہے، نے TMEM269 (-4.52 گنا فرق یا 22.12% کل اصل اظہار، p-ویلیو <0.01) کے اظہار کو ڈرامائی طور پر کم کر دیا۔ اصل مطالعہ سے ٹیبل IIIa کا ایک ذیلی حصہ TMEM269 سے متعلق اقدار کے ساتھ ذیل میں شامل کیا گیا ہے۔ ٹی ایم ای ایم 269 ان 27 جینوں میں سے ایک ہے جس میں جانچ شدہ جینوں کے اظہار میں نمایاں طور پر (4 گنا فرق) کمی واقع ہوئی تھی۔ یہ ان جینوں میں سب سے مضبوط اثر کے لیے 18 ویں نمبر پر ہے۔ TMEM269 کو تجرباتی طور پر اعلی فاسفولیپیڈ مائکروڈیٹس (ہائی-پی ایل) کے مقابلے میں پیلیجک واحد لاروا میں کم فاسفولیپیڈ مائکروڈیٹس (لو-پی ایل) کے ذریعے کم ریگولیٹ ہونے کا تعین کیا گیا تھا۔ ٹی ایم ای ایم 269 کم پی ایل غذائی نمائش کے مطابق شناخت شدہ 15 مختلف اظہار شدہ نقل میں سے ایک تھا (12 کے گروپ میں جو کم منظم تھے)۔ پروٹین TMEM269 میں دو آئسوفارم ہوتے ہیں، جن میں زیادہ عام قسم 245 امینو ایسڈ کی لمبائی ہوتی ہے۔ اس میں پروٹین کی پوری لمبائی میں 5 ٹرانس میمبرین ڈومینز ہوتے ہیں اور ایک بڑے خطے میں فاسفیٹائڈیلسرین سنتھس کی ترتیب سے مماثلت ہوتی ہے۔ ٹی ایم ای ایم 269 کی دو آئسوفارم میں دوسرے، کم عام، آئسوفارم کے علاوہ ایک جیسی ترتیب ہوتی ہے جس میں پہلے 42 امینو ایسڈ کو حذف کیا جاتا ہے جو پہلے آئسوفارم کی ترتیب میں پائے جاتے ہیں۔ دیگر انسانی پروٹینوں سے متعلق، ٹی ایم ای ایم 269 میتھیونائن، سیرین، فینائلالینائن اور لیوسین سے بھرپور ہے، جبکہ اس میں گلوٹامک ایسڈ، گلوٹامین اور ارجنائن کا فیصد کم ہے۔ ٹی ایم ای ایم 269 کا پیشین گوئی شدہ سالماتی وزن 26.9 کے ڈی اے ہے اور پیشین گوئی شدہ آئسو الیکٹرک پوائنٹ 6.7 ہے۔ ترجمہ کے بعد کی تبدیلیاں ٹی ایم ای ایم 269 کے لیے این-میریسٹولیشن کی چار پیش گوئی شدہ سائٹیں ہیں (امینو ایسڈ پوزیشنوں پر 89-94، 102-107، 113-118، 137-142)۔ این-میریسٹائیلیشن سگنل ٹرانسڈکشن، پروٹین استحکام، اور جھلی میں پروٹین کی اسمگلنگ میں شامل ہو سکتا ہے۔ ان این-میریسٹولیشن سائٹس کی پیش گوئی انسانوں کے علاوہ مختلف ماڈل حیاتیات میں کی جاتی ہے جن میں چوہے، مرغیاں اور زیبرا فش شامل ہیں۔ ٹی ایم ای ایم 269 پروٹین پر او سے منسلک گلائکوسیلیشن کے دو پیش گوئی شدہ مقامات ہیں۔ اس قسم کی ترمیم پروٹین کی تشکیل، استحکام، اور ملٹی میرک پروٹین اسمبلی کو منظم کر سکتی ہے۔ یہ پیش گوئیاں ان سائٹوں پر مبنی ہیں جو ینو یانگ پوسٹ ٹرانسلیشنل ترمیم پیشن گوئی الگورتھم پر 0.5 نیٹفوس کی حد کو عبور کرتی ہیں۔ یہ سائٹیں پروٹین پر امینو ایسڈ پوزیشن 35 اور 125 پر واقع ہیں۔ سب سیلولر لوکلائزیشن سب سیلولر لوکلائزیشن کی پیش گوئیاں اس بات کی نشاندہی کرتی ہیں کہ TMEM269 میں اینڈوپلاسمک ریٹیکولم اور پلازما جھلی میں واقع ہونے کا سب سے زیادہ امکان ہے۔ سائٹپلاسمک/نیوکلیئر امتیازی سلوک کے لیے رین ہارٹ کا طریقہ انسانی ٹی ایم ای ایم 269 پروٹین کے 94.1 کے وشوسنییتا اسکور کے ساتھ سائٹوپلاسمک ہونے کی پیش گوئی کرتا ہے۔ ایک مطالعہ نے ٹی ایم ای ایم 269 کو خمیر دو ہائبرڈ اسکریننگ کے ذریعے پروٹین ایف اے ایم 183 بی کے ساتھ غیر پرومسکوس تعامل کا امیدوار قرار دیا۔ Fam183b کو زینوپس میں متحرک سیلیا کے لیے ضروری قرار دیا گیا ہے لیکن Fam183b کے فنکشن کے نقصان کے مطالعے سے چوہوں کا استعمال کرتے ہوئے تجربات میں کوئی نقائص (سیلیا یا دوسری صورت میں) نہیں ملے ہیں۔ ٹی ایم ای ایم 269 ان دو پروٹینوں میں سے ایک تھا جن کی شناخت اس پروٹین کے ساتھ ممکنہ تعامل کے طور پر کی گئی تھی۔ ارتقاء TMEM269 تمام جبڑے والے ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں محفوظ ہے لیکن سائکلوسٹومی، invertebrates، یا غیر جانوروں کی زندگی کی شکلوں میں آرتھولوج نہیں ہے۔ کونڈرچتھیس یا کارٹلیجینس مچھلی حیاتیات کا وہ گروہ ہے جو انسانوں سے سب سے زیادہ دور سے متعلق ہیں جن کا اب بھی TMEM269 آرتھولوگ ہے۔ زیادہ تر کارٹلیجینس مچھلیوں کے لیے ہومو سیپینز سے انحراف کی تقریبا ارتقائی تاریخ کا تخمینہ 46.4 کروڑ سال پہلے لگایا گیا ہے۔ آرتھولوگس کے سلسلے سے حاصل ہونے والی معلومات کی بنیاد پر، پروٹین کا انسانی ورژن مچھلیوں میں اپنے سب سے دور آرتھولوگس کے ساتھ تقریبا 50-60% کی امینو ایسڈ شناخت کا اشتراک کرتا ہے اور ممالیہ جانوروں میں قریبی آرتھولوگس کے لیے 70 سے 98 فیصد تک (زیادہ قریب سے متعلق گروہوں جیسے پرائمیٹس کے لیے زیادہ فیصد)۔ TMEM269 میں کوئی واضح طور پر قابل شناخت پیرالاگ نہیں ہے۔ ارتقاء کی شرح کو سمجھنے کا ایک پیمانہ یہ طے کرنا ہے کہ دوسرے پروٹینوں کے مقابلے میں ترتیب کتنی تیزی سے مختلف ہو رہی ہے۔ تیزی سے مختلف ہونے والے پروٹین فبرینوجن الفا چین اور آہستہ آہستہ مختلف ہونے والے پروٹین سائٹوکروم سی کے مقابلے میں ٹی ایم ای ایم 269 اعتدال پسند شرح سے آرتھولوگس میں مختلف ہو رہا ہے۔