SCRN3
سیکرنن-3 (ایس سی آر این 3) ایک پروٹین ہے جسے انسانی ایس سی آر این 3 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ ایس سی آر این 3 کا تعلق پیپٹائڈیز سی 69 خاندان اور سیکرنن ذیلی خاندان سے ہے۔ اس خاندان کے ایک حصے کے طور پر، پروٹین کی پیش گوئی کی جاتی ہے کہ وہ سسٹین قسم کی ایکسوپیپٹیڈیز سرگرمی اور ڈپپٹیڈیز سرگرمی کو فعال کرنے کے ساتھ ساتھ پروٹیولیسس میں بھی شامل ہوگا۔ یہ دماغ، تائیرائڈ اور 25 دیگر بافتوں میں ہر جگہ ظاہر ہوتا ہے۔ مزید برآں، ایس سی آر این 3 مختلف قسم کی انواع میں محفوظ ہے، جن میں ممالیہ جانور، پرندے، مچھلی، امفیبیئن اور invertebrates شامل ہیں۔ ایس سی آر این 3 کے سائٹوپلازم کا ایک لازمی جزو ہونے کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ جین ایس سی آر این 3 عام طور پر ایف ایل جے 23142 اور ایس ای ایس 3 کے نام سے بھی جانا جاتا ہے۔ لوکس ہومو سیپینز سیکرنن-3 (ایس سی آر این 3) ایک پروٹین کوڈنگ جین ہے۔ یہ کروموسوم 2 پر پایا جا سکتا ہے، جس کا مخصوص مقام 2q31.1 ہے، '+' اسٹرینڈ پر۔ یہ جین 33,846 بیس جوڑوں پر مشتمل ہے اور اس میں 8 ایکسون ہوتے ہیں۔ ٹرانسکرپٹ ایس سی آر این 3 پروٹین کوڈنگ جین کا سب سے عام ٹرانسکرپٹ ٹرانسکرپٹ ویرینٹ 1 ہے، جو 3052 بیس جوڑے لمبا ہے۔ ایس سی آر این 3 کا اظہار اعلی سطح پر کیا جاتا ہے، جو اس ریلیز میں اوسط جین سے 2.4 گنا زیادہ ہے۔ انسانی ایس سی آر این 3 میں 8 مختلف آئسوفارم ہیں۔ اظہار ایس سی آر این 3 کا ایم آر این اے انسانوں میں معتدل پایا گیا۔ ایس سی آر این 3 کا اظہار زیادہ تر بڑے بافتوں میں ہوتا ہے۔ ایم آر این اے کا اظہار دوسرے بافتوں کے مقابلے میں دماغ، تائیرائڈ، دل اور پروسٹیٹ میں قدرے اونچی سطح پر ہوتا ہے، حالانکہ بنیادی رجحان مختلف بافتوں میں نسبتا مستقل ہر جگہ ظاہر ہوتا تھا۔ ماؤس کے دماغ اور جنین دونوں کی سیٹو ہائبرڈائزیشن میں ایس سی آر این 3 کے تجزیے میں، مضبوط اظہار کے کوئی مخصوص علاقے نہیں پائے گئے، اس کے بجائے پورے اعتدال پسند اظہار کو ظاہر کرتے ہوئے، اس بات کی تصدیق کرتے ہوئے کہ ایس سی آر این 3 ممکنہ طور پر زیادہ تر بافتوں میں ہر جگہ اظہار کرتا ہے۔ امیونوہسٹو کیمسٹری کے اعداد و شمار نے یہ بھی اشارہ کیا کہ انسانی ایس سی آر این 3 میں کم ٹشو، سنگل سیل، امیون سیل، اور دماغ کے علاقے کی خاصیت ہوتی ہے، جس سے ایک بار پھر ہر جگہ اظہار کے ثبوت میں اضافہ ہوتا ہے۔ ایس سی آر این 3 جین کا پروٹین ٹرانسکرپٹ ورژن 1 سب سے عام پروٹین آئسوفارم، سیکرنن-3 آئسوفارم 1 کو انکوڈ کرتا ہے، جو 424 امینو ایسڈ لمبا ہوتا ہے۔ غیر تبدیل شدہ ایس سی آر این 3 پروٹین کا سالماتی وزن تقریبا 48.413 کے ڈی اے ہے اور ایس سی آر این 3 کا نظریاتی آئسو الیکٹرک پوائنٹ (پی آئی) 5.38 ہے۔ نظریاتی آئسو الیکٹرک نقطہ، پروٹین کی ساخت میں تیزابیت والے امینو ایسڈ کی برتری کے ساتھ مل کر، تجویز کرتا ہے کہ ایس سی آر این 3 نسبتا تیزابیت والا پروٹین ہے۔ مزید برآں، انسانوں میں ایس سی آر این 3 کی نسبتا پروٹین کی کثرت دیگر انسانی پروٹین کے مقابلے میں 6.13 پی پی ایم پر معتدل طور پر زیادہ پائی گئی۔ ڈومینز ایس سی آر این 3 کا ایک واحد قابل ذکر ڈومین ہے، جس کی شناخت پیپٹیڈیز _ سی 69 ڈومین، یا مختصر طور پر پیپ ڈی ڈومین کے طور پر کی گئی ہے۔ یہ ڈومین پروٹین کے امینو ایسڈ پوزیشن 5 سے 226 تک پھیلا ہوا ہے۔ اس ڈومین کے اندر پائے جانے والے سلسلے پیپٹیڈیز C69 خاندان کی خصوصیت ہیں، اور خاص طور پر سیکرنن ذیلی خاندان، جو بنیادی طور پر ڈائپٹیڈیز کے طور پر جانا جاتا ہے۔ اس خاندان کے اندر، تقابلی ترتیب اور ساختی تجزیہ نے ایک سسٹین کو اتپریرک نیوکلیوفائل کے طور پر ظاہر کیا، یہ ایک خصوصیت ہے جو سیکرنن-3 پر پائی جا سکتی ہے۔ ساخت ایس سی آر این 3 کی پیش گوئی شدہ ترتیری ساخت کے اندر، سب سے زیادہ محفوظ امینو ایسڈ بنیادی طور پر پروٹین کے اندرونی حصے میں پائے گئے۔ اس سے پتہ چلتا ہے کہ سب سے زیادہ محفوظ امینو ایسڈ، اندر ہونے کی وجہ سے، پروٹین کی ساخت فراہم کرنے کے ساتھ ساتھ اندرونی فعالیت فراہم کرنے کے لیے بھی اہم ہیں۔ سیل کے اندر لوکلائزیشن، ایس سی آر این 3 کے بنیادی طور پر سائٹوپلازم میں ظاہر ہونے کی پیش گوئی کی جاتی ہے۔ سائٹوپلاسمک لوکلائزیشن کی پیش گوئی 5 اضافی آرتھولوگس (موریمز ریوسی، گیلس گیلس، مائیکروسیسلیا یونیکولر، ڈینیو ریریو، اور انوفیلس گیمبیا) کے درمیان مستقل تھی، جو انسانی ایس سی آر این 3 کی پیش گوئی شدہ سائٹوپلاسمک سب سیلولر لوکلائزیشن کی تصدیق کرتی ہے۔ ترجمہ کے بعد کی تبدیلیاں ایس سی آر این 3 ترجمہ کے بعد کی کئی پیش گوئی شدہ ترامیم سے مشروط ہے، جن میں فاسفوریلیشن، یوبیکیوٹیلیشن، سومیولیشن، لائسین ایسیٹیلیشن، اور او-بیٹا-جی ایل سی این اے سی منسلک سائٹیں شامل ہیں۔ مزید برآں، سیسرنن-3 نے ریورس پولرٹی ایکٹیویٹی پر مبنی پروٹین پروفائلنگ (آر پی-اے بی پی پی) کے استعمال کے ذریعے قدرتی طور پر پیش گوئی شدہ این-ٹرمینل گلائی آکسیلیل (گلوکس) الیکٹروفائل کی پہلی مثال فراہم کی۔ ہائیڈرازین تحقیقات کا استعمال کرتے ہوئے، اس بات کی تصدیق کی گئی کہ سسٹین (سیس) کے باقیات کو ترجمہ کے بعد گلوکس میں تبدیل کر دیا گیا تھا۔ اس نے سیکرنن-3 میں پہلی بار ایک الیکٹروفیلک این-ٹرمینل گلائی آکسیلیل گروپ کی نشاندہی کی، حالانکہ کوفیکٹر کے طور پر پروٹین اور گلوکس دونوں کے افعال کی ابھی تک تجرباتی طور پر توثیق نہیں کی گئی ہے۔ ہومیولوجی/ایوولوشن پیرالاگ ایس سی آر این 3 میں دو معروف پیرالاگ ہیں، ایس سی آر این 2 اور ایس سی آر این 1، جو بالترتیب ایس سی آر این 3 پروٹین کی ترتیب سے 67.4% اور 63.8% مماثلت رکھتے ہیں۔ دونوں پیرالاگ ایس سی آر این 3 سے معتدل طور پر متعلق ہیں۔ ایس سی آر این 2 اسی پرجاتیوں کے گروپوں میں پایا گیا تھا جیسے ایس سی آر این 3۔ ایس سی آر این 1 کو کم پرجاتیوں کے گروپوں میں محفوظ کیا گیا تھا، جن میں ممالیہ جانور، پرندے، رینگنے والے جانور، امفیبیئن اور کارٹلیجینس مچھلی شامل ہیں، لیکن دوسری مچھلیوں یا الٹی جانوروں میں نہیں۔ آرتھولوج انسانی جین ایس سی آر این 3 کے لیے 100 سے زیادہ آرتھولوج موجود ہیں۔ معروف آرتھولوگس ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں اور غیر ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں موجود پائے گئے، لیکن پودوں، بیکٹیریا یا فنگی میں نہیں۔ پائے جانے والے 20 آرتھولوگس کی انحراف کی تاریخ کا موازنہ ہومو سیپینز سے کیا گیا۔ invertebrates انسانی SCRN3 سے سب سے زیادہ دور سے متعلق آرتھولوگس ہیں، جس میں آرتھولوگس کے اس سیٹ سے انحراف کی سب سے دور میڈین تاریخ 694 ملین سال پہلے ہے۔ ارتقاء ایس سی آر این 3 کے لیے سالماتی ارتقاء کی نسبتا شرح معتدل حد تک زیادہ تھی، جو فائبرینوجن الفا کے ارتقاء کی شرح سے قدرے کم تھی، اور سائٹوکروم سی کے ارتقاء کی شرح سے زیادہ تیز تھی۔ ایس سی آر این 3 کا تخمینہ لگ بھگ 69.4 ملین سال پہلے invertebrates میں پہلی بار ظاہر ہوا تھا، جو بالآخر انسانوں میں پائے جانے کے لیے تیار ہوا۔ تعامل پروٹین پی ایس سی کیو یو آئی سی کی تلاش نے 5 پروٹینوں کی نشاندہی کی جو انسانی ایس سی آر این 3 پروٹین کے ساتھ تعامل کرتے ہیں۔ حوالہ جات انسانی کروموسوم 2 پر جینیات پروٹین