Elongation factor P
ای ایف-پی (لانگشن فیکٹر پی) ایک ضروری پروٹین ہے جو بیکٹیریا میں پروٹین کی ترکیب میں پہلے پیپٹائڈ بانڈ کی تشکیل کو متحرک کرتا ہے۔ مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ ای ایف-پی مسلسل پرولین پر مشتمل پروٹین کی ترکیب کے دوران رائبوسومز کو رکنے سے روکتا ہے۔ ای ایف-پی پیپٹائڈائل ٹی آر این اے (پی سائٹ) اور باہر نکلنے والے ٹی آر این اے (ای سائٹ) کے لیے بائنڈنگ سائٹ کے درمیان واقع سائٹ سے منسلک ہوتا ہے۔ یہ اپنے امینو-ٹرمینل ڈومین کے ساتھ دونوں رائبوسومل ذیلی اکائیوں میں پھیلا ہوا ہے جو امینو ایسیل قبولیت اسٹیم سے متصل ہے اور اس کا کاربوکسیل-ٹرمینل ڈومین پی سائٹ سے منسلک ابتدائی ٹی آر این اے کے اینٹی کوڈن اسٹیم لوپ کے ساتھ واقع ہے۔ ای ایف-پی پروٹین کی شکل اور سائز ٹی آر این اے سے بہت ملتا جلتا ہے اور 30 ایس ذیلی یونٹ پر ایگزٹ "ای" سائٹ اور 50 ایس ذیلی یونٹ کے پیپٹائڈائل-ٹرانسفرس سینٹر (پی ٹی سی) کے ذریعے رائبوسوم کے ساتھ تعامل کرتا ہے۔ ای ایف-پی ایک نامعلوم فنکشن کا ترجمہ پہلو ہے، لہذا یہ شاید بالواسطہ طور پر امینو ایسیل-ٹی آر این اے کے لیے رائبوسوم کی وابستگی کو تبدیل کر کے کام کرتا ہے، اس طرح پیپٹائڈائل ٹرانسفرس کے لیے قبولیت کے طور پر ان کی رد عمل میں اضافہ ہوتا ہے۔ ای ایف-پی تین ڈومینز پر مشتمل ہے: ایک این-ٹرمینل کے او ڈبلیو جیسا ڈومین ایک مرکزی او بی ڈومین، جو ایک اولیگونیوکلیوٹائڈ بائنڈنگ فولڈ بناتا ہے۔ یہ واضح نہیں ہے کہ آیا یہ خطہ نیوکلک ایسڈ اے سی-ٹرمینل ڈومین کو پابند کرنے میں ملوث ہے جو او بی-فولڈ کو اپناتا ہے، جس میں پانچ بیٹا اسٹرینڈز یونانی کلیدی ٹوپولوجی یوکیریوٹس میں بیٹا بیرل بناتے ہیں اور آرکیا میں ای ایف-پی کی کمی ہوتی ہے۔ ان ڈومینز میں، اسی طرح کا کام آرکیو-یوکرائیوٹک ابتدائی عنصر، a/eIF-5A کے ذریعے انجام دیا جاتا ہے، جو EF-P کے ساتھ کچھ معمولی ترتیب اور ساختی مماثلت ظاہر کرتا ہے۔ تاہم، ای ایف-پی اور ای آئی ایف-5 اے کے درمیان اہم اختلافات ہیں۔ (a) ای ایف-پی کا ڈھانچہ ایل کی شکل کے ٹی آر این اے سے ملتا جلتا ہے اور اس میں تین (I، II اور III) β-بیرل ڈومینز ہوتے ہیں۔ اس کے برعکس، ای آئی ایف-5 اے میں صرف دو ڈومینز (سی اور این) ہوتے ہیں جن میں اسی سائز کا فرق ہوتا ہے۔ (ب) مزید برآں، ای آئی ایف-5 اے کے برعکس، جس میں غیر پروٹینوجینک امینو ایسڈ ہائپوسین ہوتا ہے جو اس کی سرگرمی کے لیے ضروری ہے، ای ایف-پی ینالاگس پوزیشن (β-لائسین کے باقیات کا لائسیلیشن، ارجنائن کے باقیات کا رامنوسیلیشن، یا بالکل نہیں) پر نقل کے بعد کی تبدیلیوں کا تنوع ظاہر کرتا ہے۔ فنکشن یوبیکٹیریا میں، پروٹین کی ترکیب کو فروغ دینے والے عوامل کے تین گروپ ہوتے ہیں: ابتدائی عوامل، طول و عرض کے عوامل اور اختتامی عوامل۔ ترجمہ کے طول و عرض کے مرحلے کو تین عالمگیر طول و عرض کے عوامل، ای ایف-ٹو، ای ایف-ٹی ایس، اور ای ایف-جی کے ذریعے فروغ دیا جاتا ہے۔ ای ایف-پی کو 1975 میں گلک اور گانزا نے دریافت کیا تھا، ایک ایسے عنصر کے طور پر جس نے ابتدائی ایف میٹ-ٹی آر این اے (ایف میٹ) اور اے اے-ٹی آر این اے، پورومیسن (پی ایم این) کی نقل کے درمیان پیپٹائڈ بانڈ کی تشکیل کی پیداوار میں اضافہ کیا۔ ای ایف-پی کی عدم موجودگی میں مصنوعات کی تشکیل کی کم پیداوار کو رکے ہوئے رائبوسوم سے پیپٹائڈائل-ٹی آر این اے کے نقصان سے بیان کیا جا سکتا ہے۔ اس طرح، ای ایف-پی ترجمہ کے نظام کے کم سے کم ان وٹرو کا ایک ضروری جزو نہیں ہے، تاہم، ای ایف-پی کی عدم موجودگی ترجمہ کی شرح کو محدود کر سکتی ہے، اینٹی بائیوٹک حساسیت میں اضافہ کر سکتی ہے، اور ترقی کو سست کر سکتی ہے۔ اپنے کام کو مکمل کرنے کے لیے، ای ایف-پی ای-سائٹ کے ذریعے رکے ہوئے رائبوسومز میں داخل ہوتا ہے اور پی-سائٹ ٹی آر این اے کے ساتھ تعاملات کے ذریعے پیپٹائڈ بانڈ کی تشکیل کو آسان بناتا ہے۔ ای ایف-پی اور ای آئی ایف-5 اے دونوں تمام خلیوں میں پرولین اسٹریچ پر مشتمل پروٹین کے ذیلی سیٹ کی ترکیب کے لیے ضروری ہیں۔ یہ تجویز کیا گیا ہے کہ ابتدائی ٹی آر این اے کو پی/آئی سائٹ پر بائنڈ کرنے کے بعد، ای ایف-پی کو ای سائٹ پر بائنڈ کرکے اسے پی سائٹ پر صحیح طریقے سے رکھا جاتا ہے۔ مزید برآں، ای ایف-پی کو تین یا اس سے زیادہ مسلسل پرولین باقیات کے موثر ترجمہ میں مدد کرنے کے لیے دکھایا گیا ہے۔ ساخت ای ایف-پی ایک 21 کے ڈی اے پروٹین ہے جسے ای ایف پی جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ ای ایف-پی تین β-بیرل ڈومینز (I، II اور III) پر مشتمل ہے اور اس میں ایل شکل کا ٹی آر این اے ڈھانچہ ہے۔ ای ایف-پی کے ڈومین II اور III ایک دوسرے سے ملتے جلتے ہیں۔ ٹی آر این اے کے ساتھ ای ایف-پی کی ساختی مماثلت کے باوجود، مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ ای ایف-پی کلاسیکی ٹی آر این اے بائنڈنگ سائٹ پر رائبوسوم سے پابند نہیں ہوتا ہے، بلکہ اس الگ پوزیشن پر ہوتا ہے جو پی اور ای سائٹس کے درمیان واقع ہے۔ پروکیریوٹک طول و عرض کے عوامل EF-Ts (طول و عرض عنصر تھرمو مستحکم) EF-टु (طول و عرض عنصر تھرمو غیر مستحکم) EF-G (طول و عرض عنصر G) EIF5A پروٹین ترجمہ GTPase حوالہ جات پروٹین ڈومینز بھی دیکھیں۔