CRM domain
سالماتی حیاتیات میں، سی آر ایم ڈومین تقریبا 100 امینو ایسڈ آر این اے بائنڈنگ ڈومین ہے۔ نام سی آر ایم (کلوروپلاسٹ آر این اے اسپلیسنگ اور رائبوسوم کی پختگی) خاندان کے چار مخصوص اراکین کے لیے قائم کردہ افعال کی عکاسی کرنے کے لیے تجویز کیا گیا ہے: زی میز (مکئی) سی آر ایس 1، سی اے ایف 1 اور سی اے ایف 2 پروٹین اور ایسچریچیا کولی پروٹین وائی ایچ بی وائی۔ سی آر ایم ڈومین پر مشتمل پروٹین یوبیکٹیریا، آرکیا اور پودوں میں پائے جاتے ہیں۔ سی آر ایم ڈومین کو آرکیا اور بیکٹیریا میں اور پودوں میں سنگل اور ملٹی ڈومین پروٹین میں اسٹینڈ ایلون پروٹین کے طور پر پیش کیا جاتا ہے۔ یہ تجویز کیا گیا ہے کہ پروکیریوٹک سی آر ایم پروٹین آرکیا اور بیکٹیریا کے انحراف سے پہلے رائبوسوم سے وابستہ پروٹین کے طور پر موجود تھے، اور یہ کہ انہیں پودوں کے نسب میں متنوع پروٹین کے سیاق و سباق میں شامل کرکے آر این اے بائنڈنگ ماڈیولز کے طور پر شریک کیا گیا تھا۔ پلانٹ سی آر ایم ڈومینز کے نہ صرف کلوروپلاسٹ میں، بلکہ مائٹوکونڈرین اور نیوکلیو/سائٹوپلاسمک ڈبے میں بھی رہنے کی پیش گوئی کی جاتی ہے۔ پودوں میں سی آر ایم ڈومین فیملی کا تنوع آر این اے کے اہداف کے متنوع سیٹ کی نشاندہی کرتا ہے۔ سی آر ایم ڈومین ایک کمپیکٹ الفا/بیٹا ڈومین ہے جو الفا-بیٹا-الفا-بیٹا-الفا-بیٹا ٹوپولوجی کے ساتھ چار پھنسے ہوئے بیٹا شیٹ اور تین الفا ہیلیکس پر مشتمل ہے۔ بیٹا شیٹ کا چہرہ بنیادی ہے، جو آر این اے بائنڈنگ میں کردار کے مطابق ہے۔ بنیادی بیٹا شیٹ کے چہرے کے قریب ایک اور حصہ ہے جو نیوکلک ایسڈ کی شناخت میں معاون ثابت ہوسکتا ہے۔ سٹرینڈ بیٹا 1 اور ہیلکس الفا 2 کو جوڑنا چھ امینو ایسڈ موٹف کے ساتھ ایک لوپ ہے، جی ایکس ایکس جی بڑے الیفاٹک باقیات سے بھرا ہوا ہے، جس کے اندر ایک 'ایکس' عام طور پر ایک بنیادی باقیات ہوتا ہے۔ Escherichia coli YhbY 50S سے پہلے کے ربوسومل ذیلی اکائیوں سے وابستہ ہے، جو ربوسوم اسمبلی میں ایک فنکشن کا اشارہ کرتا ہے۔ جی ایف پی مکئی کے لوکلائز سے نیوکلیولس تک سنگل ڈومین سی آر ایم پروٹین سے جڑا ہوا ہے، جس سے یہ پتہ چلتا ہے کہ پودوں میں بھی اسی طرح کی سرگرمی برقرار رکھی جا سکتی ہے۔ پلانٹ کلوروپلاسٹ میں پروٹین پر مشتمل ایک سی آر ایم ڈومین کو گروپ I اور II انٹرن اسپلیسنگ میں کام کرنے کے لیے دکھایا گیا ہے۔ مکئ کے الگ تھلگ سی آر ایم ڈومین کے ساتھ ان وٹرو تجربات سے پتہ چلا ہے کہ اس میں آر این اے بائنڈنگ سرگرمی ہے۔ ان اور دیگر نتائج سے پتہ چلتا ہے کہ سی آر ایم ڈومین آرکیا اور بیکٹیریا کے انحراف سے پہلے رائبوسوم فنکشن کے تناظر میں تیار ہوا، کہ یہ فنکشن موجودہ پروکیریوٹس میں برقرار رکھا گیا ہے، اور یہ کہ ڈومین کو پودوں کے جینوم کے ارتقاء کے دوران آر این اے بائنڈنگ ماڈیول کے طور پر کام کرنے کے لیے بھرتی کیا گیا تھا۔ YhbY میں ٹرانسلیشن انیشی ایشن فیکٹر 3 (IF3C) کے C-ٹرمینل ڈومین کی طرح ایک فولڈ ہے، جو 30S رائبوسوم میں 16S rRNA سے جڑا ہوتا ہے۔ حوالہ جات پروٹین ڈومینز