B-box zinc finger
سالماتی حیاتیات میں بی-باکس قسم کا زنک فنگر ڈومین لمبائی میں تقریبا 40 امینو ایسڈ کے باقیات کا ایک مختصر پروٹین ڈومین ہے۔ بی-باکس زنک انگلیوں کو دو گروپوں میں تقسیم کیا جا سکتا ہے، جہاں ٹائپ 1 اور 2 بی-باکس ڈومینز اپنی اتفاق رائے کی ترتیب اور 7-8 زنک بائنڈنگ باقیات کے فاصلے میں مختلف ہوتے ہیں۔ کئی پروٹینوں میں دونوں قسم کے 1 اور 2 بی بکس ہوتے ہیں، جو ان دونوں ڈومینز کے درمیان کچھ حد تک تعاون کی تجویز کرتے ہیں۔ آکورنس بی-باکس ڈومینز مختلف حیاتیات کے 1500 سے زیادہ پروٹینوں میں پائے جاتے ہیں۔ وہ ٹرم (سہ فریقی موٹف) پروٹین میں پائے جاتے ہیں جو ایک این-ٹرمینل رنگ فنگر (جسے اصل میں اے-باکس کہا جاتا ہے) پر مشتمل ہوتے ہیں، اس کے بعد 1-2 بی-باکس ڈومینز اور ایک کنڈلی-کنڈلی ڈومین (جسے رنگ، بی-باکس، کنڈلی-کنڈلی کے لیے آر بی سی سی بھی کہا جاتا ہے)۔ ٹرم پروٹین میں ٹائپ 2 بی باکس ڈومین ہوتا ہے، اور اس میں ٹائپ 1 بی باکس بھی ہو سکتا ہے۔ ان پروٹینوں میں جن میں رنگ یا کنڈلی کنڈلی والے ڈومین نہیں ہوتے ہیں، بی-باکس ڈومین بنیادی طور پر ٹائپ 2 ہوتا ہے۔ بہت سے ٹائپ 2 بی-باکس پروٹین یوبیکیوٹینیلیشن میں شامل ہوتے ہیں۔ بی-باکس زنک فنگر ڈومین پر مشتمل پروٹین میں ٹرانسکرپشن فیکٹرز، ربنیوکلیوپروٹینز اور پروٹو-آنکوپروٹینز شامل ہیں۔ مثال کے طور پر، ایم آئی ڈی 1، ایم آئی ڈی 2، ٹی آر آئی ایم 9، ٹی این ایل، ٹی آر آئی ایم 36، ٹی آر آئی ایم 63، ٹی آر آئی ایف آئی سی، این سی ایل 1 اور کونسٹینس جیسے پروٹین۔ مائکرو ٹیوبل سے وابستہ ای 3 لیگز ایم آئی ڈی 1 (ای سی) میں ٹائپ 1 بی باکس زنک فنگر ڈومین ہوتا ہے۔ ایم آئی ڈی 1 خاص طور پر الفا-4 کو باندھتا ہے، جو بدلے میں فاسفیٹیس 2 اے (پی پی 2 اے سی) کی اتپریرک ذیلی اکائی کو بھرتی کرتا ہے۔ یہ کمپلیکس پروٹیسوم کی ثالثی سے ہونے والے انحطاط کے لیے پی پی 2 اے سی کے ہدف کے لیے ضروری ہے۔ ایم آئی ڈی 1 بی-باکس دو زنک آئنوں کو مربوط کرتا ہے اور زیڈ زیڈ، پی ایچ ڈی، رنگ اور ایف وائی وی ای زنک انگلیوں کی طرح بیٹا/بیٹا/الفا کراس بریس ڈھانچہ اپناتا ہے۔ ڈومین کے پروکیریوٹک ہومیولوگس کئی بیکٹیریل نسلوں اور میتھانوجینک آرکیا میں موجود ہیں، اور اکثر پیپٹائڈیز ڈومینز جیسے رومبوئڈ نما سیرائن پیپٹائڈیز، اور زیڈ این پر منحصر میٹالوپیپٹائڈیز میں فیوژن دکھاتے ہیں۔ دیگر ورژن عام طور پر ٹرانس میمبرین ہیلیکس پر مشتمل ہوتے ہیں اور ڈی این اے جے، ایف ایچ اے، ایس ایچ 3، ڈبلیو ڈی 40 اور ٹیٹراٹریکوپیپٹائڈ ریپیٹس جیسے ڈومینز میں فیوژن بھی دکھا سکتے ہیں۔ یہ انجمنیں مل کر پروٹولائٹک پروسیسنگ، فولڈنگ یا جھلی سے وابستہ پروٹین کے استحکام میں بی-باکس زنک فنگر ڈومین کے پروکیریوٹک ہومولوگس کے لیے ایک کردار تجویز کرتی ہیں۔ ڈومین آرکیٹیکچرل نحو قابل ذکر طور پر اسی طرح کی ہے جو اے این 1 زنک فنگر اور ایل آئی ایم ڈومینز کے پروکیریوٹک ہومولوگس میں دیکھا جاتا ہے۔ حوالہ جات بیرونی روابط پلانٹ ٹی ایف ڈی بی پر سی او نما خاندان، ڈی بی بی خاندان: پلانٹ ٹرانسکرپشن فیکٹر ڈیٹا بیس مزید دیکھیں زنک فنگر پروٹین ڈومینز