Methyl-CpG-binding domain
سالماتی حیاتیات میں میتھائل-سی پی جی-بائنڈنگ ڈومین (ایم بی ڈی) ڈی این اے سے منسلک ہوتا ہے جس میں ایک یا زیادہ ہم آہنگی سے میتھیلیٹڈ سی پی جی ہوتے ہیں۔ ایم بی ڈی کا غیر میتھیلیٹڈ ڈی این اے کے لیے نہ ہونے کے برابر غیر مخصوص تعلق ہے۔ کروموسومل پروٹین ایم ای سی پی 2 کے ساتھ ان وٹرو فٹ پرنٹنگ سے پتہ چلتا ہے کہ ایم بی ڈی میتھائل سی پی جی جوڑے کے ارد گرد 12 نیوکلیوٹائڈ کے علاقے کی حفاظت کر سکتا ہے۔ سی پی جی ڈینیوکلیوٹائڈز میں ڈی این اے میتھیلیشن، یوکیریوٹس میں سب سے عام ڈی این اے ترمیم، مختلف مظاہر سے وابستہ ہے جیسے کرومیٹن کی ساخت میں تبدیلی، جینومک امپرنٹنگ، ٹرانسپوسن اور کروموسوم ایکس کی غیر فعالیت، تفریق، اور کینسر۔ ڈی این اے میتھیلیشن کے اثرات پروٹین کے ذریعے ثالثی کی جاتی ہیں جو ہم آہنگی سے میتھیلیٹڈ سی پی جی سے جڑے ہوتے ہیں۔ اس طرح کے پروٹین میں ~ 70 باقیات کا ایک مخصوص ڈومین ہوتا ہے، میتھائل-سی پی جی-بائنڈنگ ڈومین (ایم بی ڈی)، جو کرومیٹن سے وابستہ اضافی ڈومینز سے منسلک ہوتا ہے، جیسے بروموڈومین، اے ٹی ہک موٹف، ایس ای ٹی ڈومین، یا پی ایچ ڈی فنگر۔ ایم بی ڈی پر مشتمل پروٹین ساختی پروٹین کے طور پر کام کرتے دکھائی دیتے ہیں، جو مختلف قسم کے ہسٹون ڈیسیٹیلیز (ایچ ڈی اے سی) کمپلیکس اور کرومیٹن ری ماڈلنگ عوامل کو بھرتی کرتے ہیں، جس کی وجہ سے کرومیٹن کمپکشن ہوتا ہے اور اس کے نتیجے میں ٹرانسکرپشنل جبر ہوتا ہے۔ ایم ای سی پی 2، ایم بی ڈی 1، ایم بی ڈی 2، ایم بی ڈی 4 اور بی اے زیڈ 2 کا ایم بی ڈی ڈی این اے کے پابند ہونے میں ثالثی کرتا ہے، اور ایم ای سی پی 2، ایم بی ڈی 1 اور ایم بی ڈی 2 کے معاملات میں، ترجیحی طور پر میتھیلیٹڈ سی پی جی کے لیے۔ انسانی ایم بی ڈی 3 اور ایس ای ٹی ڈی بی 1 میں، ایم بی ڈی کو پروٹین-پروٹین تعاملات میں ثالثی کے لیے دکھایا گیا ہے۔ ایم بی ڈی ڈی این اے ڈیمیتھیلیز میں بھی پائے جاتے ہیں۔ ایم بی ڈی ایک الفا/بیٹا سینڈوچ ڈھانچے میں جوڑتا ہے جس میں مڑی ہوئی بیٹا شیٹ کی ایک پرت ہوتی ہے، جس کی پشت پر الفا 1 ہیلکس کی تشکیل شدہ ایک اور پرت اور سی ٹرمینس پر ہیئر پن لوپ ہوتا ہے۔ یہ پرتیں دونوں ایمفی پیتھک ہیں، جن میں الفا 1 ہیلکس اور بیٹا شیٹ متوازی ہیں اور ہائیڈروفوبک چہرے ایک دوسرے کے خلاف مضبوطی سے بھرے ہوئے ہیں۔ بیٹا شیٹ دو لمبے اندرونی تاروں (بیٹا 2 اور بیٹا 3) پر مشتمل ہے جو دو چھوٹے بیرونی تاروں (بیٹا 1 اور بیٹا 4) کے ذریعے سینڈوچ کیے گئے ہیں۔ میتھیلیٹڈ ڈی این اے سے منسلک ایم بی ڈی ڈومین کی ساخت کو حل کر لیا گیا ہے ()۔ یہ میتھیلیٹڈ سائٹس پر بڑے نالی کی ہائیڈریشن کو تسلیم کرتا ہے۔ حوالہ جات پروٹین ڈومینز