Vitamin B12-binding domain
سالماتی حیاتیات میں، وٹامن بی 12 بائنڈنگ ڈومین ایک پروٹین ڈومین ہے جو کوبالامین (وٹامن بی 12) سے منسلک ہوتا ہے۔ یہ کوبالامین کوفیکٹر کی دو مختلف شکلوں کو باندھ سکتا ہے، جس میں کوبالٹ یا تو میتھائل گروپ (میتھائل کوبالامین) یا 5 '-ڈیوکسیڈینوسین (اڈینوسائل کوبالامین) سے جڑا ہوا ہے۔ کوبالامین بائنڈنگ ڈومینز بنیادی طور پر جانوروں اور پروکیریوٹس میں موجود انزائموں کے دو خاندانوں میں پائے جاتے ہیں، جو کوبالٹ-کاربن بانڈ پر مختلف قسم کے رد عمل انجام دیتے ہیں۔ انزائمز جن کے لیے میتھائل کوبالامین کی ضرورت ہوتی ہے، میتھائل منتقلی کے رد عمل انجام دیتے ہیں۔ انزائمز جن کے لیے اڈینوسائلکوبالامین کی ضرورت ہوتی ہے وہ رد عمل کو متحرک کرتے ہیں جس میں پہلا قدم اڈینوسائلکوبالامین کا کوب (II) الامین اور 5 '-ڈیوکسیڈینوسیل ریڈیکل بنانے کے لیے پھٹنا ہوتا ہے، اور اس طرح ریڈیکل جنریٹرز کے طور پر کام کرتے ہیں۔ دونوں قسم کے انزائموں میں B12 بائنڈنگ ڈومین کوبالامین کوفیکٹرز کے کوبالٹ ایٹم کو باندھنے کے لیے ہسٹائڈائن کا استعمال کرتا ہے۔ یہ ہسٹائڈائن ایک DXHXXG ترتیب میں سرایت شدہ ہے، جو ڈومین کا سب سے زیادہ محفوظ شدہ بنیادی ترتیب ہے۔ کوبالامین بائنڈنگ ڈومین پر مشتمل پروٹین میں شامل ہیں: اینیمل اور پروکیریوٹک میتھیونائن سنتھس ()، جو میتھائل گروپ کی میتھائل کوبالامین سے ہومو سسٹین میں منتقلی کو متحرک کرتے ہیں، انزائم باؤنڈ کوب (I) الامین اور میتھیونائن پیدا کرتے ہیں۔ جانوروں اور پروکیریوٹک میتھائل مالونیل-سی او اے میوٹیز ()، جو کئی امینو ایسڈ، اوڈ چین فیٹی ایسڈ اور کولیسٹرول کو پروپیونیل-سی او اے کے ذریعے ٹرائکاربکسیلک ایسڈ سائیکل میں انحطاط میں ملوث ہیں۔ پروکیریوٹک لائسین 5,6-امینوموٹیس ()۔ پروکیریوٹک گلوٹامیٹ میوٹیز ()۔ پروکیریوٹک میتھیلینگلوٹاریٹ میوٹیس ()۔ پروکیریوٹک آئسوبوٹیرل-کو اے میوٹیز ()۔ کوبالامین بائنڈنگ ڈومین کی بنیادی ساخت کی خصوصیت پانچ پھنسے ہوئے الفا/بیٹا (راسمین) فولڈ کی ہوتی ہے، جو 5 متوازی بیٹا شیٹس پر مشتمل ہوتی ہے جس کے گرد تین تہوں (الفا/بیٹا/الفا) میں 4 سے 5 الفا ہیلیسیس ہوتے ہیں۔ کوبالامین کو باندھنے پر، بائنڈنگ سائٹ کے اہم عناصر منظم ہوتے دکھائی دیتے ہیں، بشمول ایک الفا ہیلکس جو کوفیکٹر کے نیوکلیوٹائڈ 'دم' کو ایڈجسٹ کرتے ہوئے پھٹے کے ایک طرف بنتا ہے۔ کوبالامین میں، کوبالٹ ایٹم یا تو آزاد (ڈی ایم بی-آف) ہو سکتا ہے یا پی ایچ کے مطابق ڈائیمیتھائل بینزیمیڈازول (ڈی ایم بی-آن) سے منسلک ہو سکتا ہے۔ جب کوبالامین بائنڈنگ ڈومین سے منسلک ہوتا ہے، تو ڈائیمیتھائل بینزیمیڈازول لگینڈ کو ڈی ایکس ایچ ایکس ایکس جی موٹف کے فعال ہسٹائڈائن (اس-آن) سے تبدیل کیا جاتا ہے۔ ہسٹائڈائن کے ذریعہ ڈائیمیتھائل بینزیمیڈازول کی تبدیلی اتپریرک اور ایکٹیویشن سائیکلوں کے درمیان تبدیلی کی اجازت دیتی ہے۔ میتھیونائن سنتھس میں کوبالامین کوفیکٹر کوبالامین بائنڈنگ ڈومین اور تقریبا 90 بقیہ این-ٹرمینل ڈومین کے درمیان سینڈوچ کیا جاتا ہے جو ایک ہیلیکل بنڈل بناتا ہے جس میں دو جوڑے اینٹی پیریلل ہیلیسیس ہوتے ہیں۔ یہ این-ٹرمینل ڈومین ایک 4-ہیلکل بنڈل کیپ بناتا ہے، اس انزائم کی فعال تشکیل میں تبدیلی میں، 4-ہیلکل کیپ کوبالامین کوفیکٹر کو ایکٹیویشن ڈومین کو باندھنے کی اجازت دینے کے لیے گھومتی ہے۔ حوالہ جات پروٹین ڈومینز