SET domain
SET ڈومین ایک پروٹین ڈومین ہے جس میں عام طور پر میتھائل ٹرانسفرس سرگرمی ہوتی ہے۔ اس کی شناخت اصل میں ڈروسفیلا ٹرائتھوریکس پروٹین میں موجود ایک بڑے محفوظ علاقے کے حصے کے طور پر کی گئی تھی اور بعد میں اس کی شناخت ڈروسفیلا ایس یو (ور) 3-9 اور 'اینہانسر آف زیسٹے' پروٹین میں کی گئی، جس سے ایس ای ٹی کا مخفف [ایس یو (ور) 3-9، اینہانسر آف زیسٹے اور ٹرائتھوریکس] اخذ کیا گیا ہے۔ ساخت SET ڈومین عام طور پر ایک بڑے ملٹی ڈومین پروٹین کے ایک حصے کے طور پر ظاہر ہوتا ہے، اور حال ہی میں مختلف ڈومین کمپوزیشن کے ساتھ بہت مختلف پروٹین کے تین ڈھانچے بیان کیے گئے ہیں: نیوروسپورا کراسا DIM-5، ہسٹون لائسین میتھائل ٹرانسفرسز (HKMTs) کے سو (وار) خاندان کا ایک رکن ہے جو لیسین 9 پر ہسٹون H3 کو میتھیلیٹ کرتا ہے، انسانی SETD7 (جسے SET7 یا SET9 بھی کہا جاتا ہے)، جو لیسین 4 باغ مٹر روبسکو LSMT پر H3 کو میتھیلیٹ کرتا ہے، ایک انزائم جو ہسٹونز میں ترمیم نہیں کرتا ہے، بلکہ اس کے بجائے انزائم روبسکو کے بڑے ذیلی یونٹ کی لچکدار دم میں لیسین 14 کو میتھیلیٹ کرتا ہے۔ SET ڈومین خود ایک غیر معمولی ڈھانچہ ثابت ہوا۔ اگرچہ تینوں مطالعات میں، الیکٹران کثافت کے نقشوں نے ایڈومیٹ یا ایڈو ایچسی کوفیکٹر کے مقام کا انکشاف کیا، لیکن سیٹ ڈومین کینونکل/ایڈومیٹ پر منحصر میتھائل ٹرانسفرس فولڈ سے بالکل مماثلت نہیں رکھتا ہے۔ سیٹ ڈومین کے سی-ٹرمینل موٹف میں سختی سے محفوظ ٹائروسین سبسٹریٹ لائسین کے پروٹونیٹڈ امینو گروپ سے ایک پروٹون کو خلاصہ کرنے میں شامل ہو سکتا ہے، جس سے ایڈومیٹ کوفیکٹر کے سلفونیم میتھائل گروپ پر اس کے نیوکلیوفیلک حملے کو فروغ ملتا ہے۔ کلاسیکی قسم کے ایڈومیٹ پر منحصر پروٹین میتھائل ٹرانسفرسز کے برعکس، جو اپنے پولی پیپٹائڈ سبسٹریٹس کو کوفیکٹر کے اوپر باندھتے ہیں، روبسکو ایل ایس ایم ٹی ڈھانچے سے یہ نوٹ کیا گیا ہے کہ ایڈومیٹ ایک علیحدہ پھٹے میں جڑا ہوا لگتا ہے، جس سے یہ پتہ چلتا ہے کہ کس طرح ایک پولی پیپٹائڈ سبسٹریٹ کو انزائم سے خارج کیے بغیر میتھیلیشن کے متعدد دوروں کا نشانہ بنایا جا سکتا ہے۔ اس کے برعکس، SET7/9 اپنے سبسٹریٹ میں صرف ایک میتھائل گروپ کو شامل کرنے کے قابل ہے۔ فنکشن یہ ظاہر کیا گیا ہے کہ ایس ای ٹی ڈومین اور میوٹوبولرن سے متعلق پروٹین کی ایسوسی ایشن نمو کے کنٹرول کو تبدیل کرتی ہے۔ ایس ای ٹی ڈومین پر مشتمل ڈروسفیلا میلانوگاسٹر (فروٹ فلائی) پروٹین، جو زیسٹ کو بڑھاتا ہے، حصے کے تعین میں ایک کام کرتا ہے اور ممالیہ ہومولوگ جین ٹرانسکرپشن اور کرومیٹن ڈھانچے کے ضابطے میں شامل ہو سکتا ہے۔ ہسٹون لائسین میتھیلیشن ہسٹون کوڈ کا حصہ ہے جو کرومیٹن فنکشن اور جین فنکشن کے ایپیجینیٹک کنٹرول کو منظم کرتا ہے۔ ہسٹون لائسین میتھائل ٹرانسفرسز (ایچ ایم ٹیز) مختلف قبولیت لائسینوں کے لیے ان کی سبسٹریٹ کی خاصیت کے ساتھ ساتھ میتھائل گروپوں (ایک، دو، یا تین) کی تعداد کے لیے ان کی مصنوعات کی خاصیت دونوں میں مختلف ہیں۔ صرف ایک رعایت کے ساتھ، ایچ ایم ٹیسیس کا تعلق ایس ای ٹی خاندان سے ہے جس کی درجہ بندی ایس ای ٹی ڈومین کے ارد گرد کے ترتیبات کے مطابق کی جا سکتی ہے۔ انسانی SET7/9، ایک مونو میتھیلیز پر ساختی مطالعات نے ہسٹون ہدف کے لیے انزائم کی خاصیت کے لیے سالماتی بنیاد اور میتھیلیشن کی خصوصیات کا تعین کرنے میں SET ڈومین میں غیر متغیر باقیات کے کردار کا انکشاف کیا ہے۔ ایسوسی ایٹڈ ڈومینز این-ٹرمینل پری-ایس ای ٹی ڈومین ()، جیسا کہ ایس یو وی 39 ایس ای ٹی فیملی میں پایا جاتا ہے، نو غیر متغیر سسٹین کے باقیات پر مشتمل ہوتا ہے جو متغیر لمبائی کے علاقے سے الگ دو حصوں میں تقسیم ہوتے ہیں۔ یہ 9 سسٹین 3 زنک آئنوں کو ایک سہ رخی کلسٹر بنانے کے لیے مربوط کرتے ہیں، جہاں زنک آئنوں میں سے ہر ایک کو 4 چار سسٹینوں کے ذریعے مربوط کیا جاتا ہے تاکہ ٹیٹراہیڈرل ترتیب دی جا سکے۔ اس ڈومین کا کام ساختی ہے، جو بے ترتیب کنڈلی کے 2 لمبے حصوں کو ایک ساتھ رکھتا ہے۔ سی-ٹرمینل علاقہ بشمول پوسٹ-ایس ای ٹی ڈومین () اس وقت بے ترتیب ہوتا ہے جب ہسٹون دم کے ساتھ تعامل نہیں ہوتا ہے اور زنک کی عدم موجودگی میں ہوتا ہے۔ ایس ای ٹی کے بعد کے ڈومین میں تین محفوظ سسٹین ایک زنک بائنڈنگ سائٹ بناتے ہیں جب ایس ای ٹی ڈومین فعال سائٹ کے قریب گرہ جیسی ساخت میں چوتھے محفوظ سسٹین کے ساتھ جوڑے جاتے ہیں۔ ایس ای ٹی کے بعد کا منظم خطہ سی-ٹرمینل کے باقیات لاتا ہے جو ایس-اڈینوسیل-ایل-میتھیونائن-بائنڈنگ اور ہسٹون دم کے تعاملات میں حصہ لیتے ہیں۔ تین محفوظ سسٹین کے باقیات ایچ ایم ٹیز سرگرمی کے لیے ضروری ہیں، کیونکہ سیرائن کے ساتھ تبدیلی ایچ ایم ٹیز سرگرمی کو ختم کر دیتی ہے۔ اس ڈومین پر مشتمل انسانی جین کوڈنگ پروٹین کی مثالوں میں شامل ہیں: ASH1L، SET ڈومین (AWS) EHMT1 (FP13812)، EHMT2 (BAT8)، EZH1، EZH2MLL، MLL2، MLL3، MLL5NSD1 PRDM1، PRDM2، PRDM5SETD1A، SETD2، SETD3، SETD4، SETD5، SETD6، SETD7، SETD8، SETDB1، SETDB2، SETMAR، SMYD1، SMYD3 سے بھی وابستہ ہے۔