Iron dependent repressor
سالماتی حیاتیات میں، آئرن پر منحصر ریپریسرز بیکٹیریل اور آرکیئل ٹرانسکرپشنل ریپریسرز کا ایک خاندان ہیں۔ ان کے این-ٹرمینس پر وہ ایک ڈی ٹی ایکس آر قسم کے ایچ ٹی ایچ ڈومین پر مشتمل ہوتے ہیں۔ یہ ڈی ٹی ایکس آر/ایم این ٹی آر خاندان کے میٹالوریگولیٹرز میں موجود تقریبا 65 امینو ایسڈ کا ڈی این اے بائنڈنگ، ونگڈ ہیلکس ٹرن ہیلکس (ڈبلیو ایچ ٹی ایچ) ڈومین ہے۔ ڈومین کا نام کورینبیکٹیریم ڈپتھیریا ڈی ٹی ایکس آر، ایک آئرن مخصوص ڈپتھیریا ٹاکسن ریپریسر، اور بیسیلس سبٹیلس ایم این ٹی آر، ایک مینگنیز ٹرانسپورٹ ریگولیٹر کے نام پر رکھا گیا ہے۔ آئرن رسپانسیو میٹالوریگولیٹر جیسے ڈی ٹی ایکس آر اور آئی ڈی آر ہائی جی سی برانچ کے گرام مثبت بیکٹیریا میں پائے جاتے ہیں، جبکہ ایم این ٹی آر جیسے مینگنیز رسپانسیو میٹالوریگولیٹر گرام مثبت اور گرام منفی بیکٹیریا کی متنوع نسلوں میں اور آرکیا میں بھی بیان کیے جاتے ہیں۔ ڈی ٹی ایکس آر/ایم این ٹی آر جیسے میٹالوریگولیٹر عام طور پر این-ٹرمینل حصے میں ڈی این اے بائنڈنگ ڈی ٹی ایکس آر قسم کے ایچ ٹی ایچ ڈومین پر مشتمل ہوتے ہیں۔ سی-ٹرمینل حصہ دو دھاتی بائنڈنگ سائٹس کے ساتھ ایک ڈائمرائزیشن ڈومین پر مشتمل ہے، حالانکہ بنیادی دھاتی بائنڈنگ سائٹ Mn (II)-ریگولیٹرز میں کم محفوظ ہے۔ فی (II)-ریگولیٹڈ پروٹین میں سی-ٹرمینل ایکسٹینشن کے طور پر ایس ایچ 3 جیسا ڈومین ہوتا ہے، جو ایم این (II)-ریگولیٹڈ ایم این ٹی آر میں موجود نہیں ہے۔ دھاتی آئن پر منحصر ریگولیٹرز کئی اہم انسانی پیتھوجینز کی شدت کو منظم کرتے ہیں۔ ڈی ٹی ایکس آر پروٹین ماحولیاتی آئرن کے ارتکاز کے جواب میں ڈپتھیریا ٹاکسن کے اظہار کو منظم کرتا ہے۔ مزید برآں، ڈی ٹی ایکس آر اور آئی ڈی آر آئرن کی کھپت کو کنٹرول کرتے ہیں۔ مینگنیز کا ہومیوسٹاسس، جو ایک ضروری غذائیت ہے، ایم این ٹی آر کے ذریعے منظم کیا جاتا ہے۔ ایک عام ڈی ٹی ایکس آر قسم کا میٹالوریگولیٹر فی مونومر دو ڈیویلینٹ میٹل ایفیکٹرز کو باندھتا ہے، جس پر ایلوسٹرک تبدیلیاں ہوتی ہیں جو علمی ڈی این اے آپریٹرز کے ساتھ اعتدال پسند پابند ہوتی ہیں۔ آئرن باؤنڈ ڈی ٹی ایکس آر ہوموڈائمرز 19 بی پی کے رکاوٹ پیلینڈروم سے جڑے ہوتے ہیں، جو ~ 30 بی پی کی ترتیب کی حفاظت کرتے ہیں۔ آئرن ریگولیٹڈ اور مینگنیز ریگولیٹڈ ریپریسرز کے کرسٹل ڈھانچے سے پتہ چلتا ہے کہ ڈی این اے بائنڈنگ ڈومین میں تین الفا-ہیلسیس اور اینٹی پیریلل بیٹا اسٹرینڈز کا ایک جوڑا ہوتا ہے۔ ہیلسیس 2 اور 3 ہیلکس-ٹرن-ہیلکس موٹف پر مشتمل ہوتے ہیں اور بیٹا اسٹرینڈز کو ونگ کہا جاتا ہے۔ یہ ڈبلیو ایچ ٹی ایچ ٹوپولوجی لائسر قسم کے ایچ ٹی ایچ سے ملتی جلتی ہے۔ زیادہ تر ڈی ٹی ایکس آر قسم کے میٹالوریگولیٹر ڈی این اے میجر نالی سے ڈائمر کے طور پر جڑے ہوتے ہیں۔ کئی پروٹین ڈی ٹی ایکس آر قسم کے ایچ ٹی ایچ ڈومین پر مشتمل ہونے کے لیے جانے جاتے ہیں۔ ان میں شامل ہیں: کورینبیکٹیریم ڈپتھیریا ڈی ٹی ایکس آر، ایک ڈپتھیریا ٹاکسن ریپریسر، جو ہائی ایفینیٹی آئرن اپٹیک سسٹم، دیگر آئرن حساس جینز، اور بیکٹیریوفیج ٹاک جین کے اظہار کو منظم کرتا ہے۔ میٹل باؤنڈ ڈی ٹی ایکس آر ٹاک آپریٹر کو باندھ کر ٹرانسکرپشن کو دباتا ہے۔ اگر آئرن محدود ہو رہا ہے، تو ڈبلیو ایچ ٹی ایچ کی تشکیلی تبدیلیاں ڈی این اے بائنڈنگ میں خلل ڈالتی ہیں اور ڈپتھیریا ٹاکسن پیدا ہوتا ہے۔ مائیکوبیکٹیریم ٹیوبرکلوسس آئی ڈی آر، ایک آئرن پر منحصر ریگولیٹر جو اس پیتھوجین کے لیے ضروری ہے۔ ریگولیٹر لوہے کے حصول کے لیے جینوں کو دباتا ہے اور لوہے کے ذخیرہ کرنے والے جینوں کو چالو کرتا ہے، اور آکسیڈیٹیو تناؤ کے ردعمل کا ایک مثبت ریگولیٹر ہے۔ بیسیلس سبٹیلس ایم این ٹی آر، ایک مینگنیز ٹرانسپورٹ ریگولیٹر، ایم این 2 + کو ایک ایفیکٹر کے طور پر باندھتا ہے اور مینگنیز کی درآمد کے لیے ٹرانسپورٹرز کا ٹرانسکرپشنل ریپریسر ہے۔ ٹریپونیما پیلیڈم ٹرو آر، ایک دھات پر منحصر ٹرانسکرپشنل ریپریسر۔ آرکیگلوبس فلجیڈس ایم ڈی آر 1 (ٹرو آر)، ایک دھات پر منحصر ٹرانسکرپشنل ریپریسر، جو اپنی نقل کو منفی طور پر منظم کرتا ہے۔ حوالہ جات پروٹین ڈومینز