Immune repertoire
مدافعتی ذخیرے میں مختلف ذیلی اقسام شامل ہیں جو کسی جاندار کا مدافعتی نظام امیونوگلوبلن یا ٹی سیل ریسیپٹرز سے بنتا ہے۔ یہ زیادہ تر ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں پیتھوجینز کو پہچاننے میں مدد کرتے ہیں۔ ذیلی اقسام، جو سب ایک دوسرے سے قدرے مختلف ہیں، کسی مخصوص جاندار میں دسیوں ہزار، یا لاکھوں تک ہو سکتی ہیں۔ اس طرح کی وسیع تنوع ایک ذیلی قسم ہونے کی مشکلات کو بڑھاتا ہے جو کسی جاندار کا سامنا کرنے والے بہت سے پیتھوجینز میں سے ایک کو پہچانتا ہے۔ بہت کم ذیلی اقسام اور پیتھوجین مدافعتی نظام سے بچ سکتے ہیں، بغیر کسی چیلنج کے، بیماری کا باعث بن سکتے ہیں۔ ڈویلپمنٹ لمفوسائٹس وی (ڈی) جے ریکومبینیشن کے ذریعے امیونوگلوبلن اور ٹی سیل ریسیپٹرز کو انکوڈنگ کرنے والے جینوں کو دوبارہ ملا کر مدافعتی ذخیرہ پیدا کرتے ہیں۔ اگرچہ ان میں سے صرف چند ہی جین ہیں، لیکن ان کے تمام ممکنہ امتزاج کے نتیجے میں مدافعتی ذخیرے کے پروٹین کی وسیع اقسام پیدا ہو سکتی ہیں۔ انتخاب کے ذریعے، آٹوری ایکٹیو پروٹین والے خلیات (اور اس طرح آٹو امیونٹی کا سبب بن سکتے ہیں) کو ہٹا دیا جاتا ہے، جبکہ وہ خلیات جو دراصل کسی حملہ آور جاندار کا پتہ لگا سکتے ہیں، رکھے جاتے ہیں۔ مدافعتی ذخیرہ کئی عوامل سے متاثر ہوتا ہے: عمر: جیسے جیسے مدافعتی نظام زندگی بھر ترقی کرتا ہے، لمفوسائٹس اپنے منفرد جین کے سلسلے پیدا کرتے ہیں۔ تیار شدہ خلیات بالآخر مر جاتے ہیں، لیکن ہو سکتا ہے کہ ان کی جگہ نئی ذیلی اقسام نہ لیں۔ بیماریوں کی نمائش مدافعتی ذخیرے کی مزید ترقی کو متحرک کرتی ہے، اور اس طرح مدافعتی ردعمل کو بہتر بناتی ہے۔ میموری بی سیل اور میموری ٹی سیل کسی بیماری کے گزرنے کے بعد مدافعتی ذخیرے کی استقامت کو یقینی بناتے ہیں۔ جینیاتی بیماریاں (بنیادی امیونو ڈیفیشینسی امیونو ریپرٹری پروٹین کی تخلیق اور نشوونما میں رکاوٹ بن سکتی ہے)۔ مدافعتی نظام کو متاثر کرنے والے علاج مثلا ہیماٹوپوئیٹک سٹیم سیل ٹرانسپلانٹیشن، جہاں مدافعتی ذخیرے کو شروع سے دوبارہ پیدا کرنا پڑتا ہے۔ سائز تکنیکی مشکلات کی وجہ سے، مدافعتی ذخیرے کی پیمائش کرنے کی کوشش شاذ و نادر ہی کی گئی تھی۔ تخمینے مدافعتی خلیوں کی عین مطابق قسم یا 'ڈبے' اور مطالعہ شدہ پروٹین پر منحصر ہوتے ہیں، لیکن متوقع اربوں کے امتزاج ایک حد سے زیادہ تخمینہ ہو سکتے ہیں۔ ٹی سی آر لوکس کی دوبارہ ترتیب کو کنٹرول کرنے والے جینیاتی اسپاٹیو-عارضی اصول کا مطلب یہ ہے کہ وی (ڈی) جے کی دوبارہ ترتیبات بے ترتیب نہیں ہیں، اس لیے اس کے نتیجے میں وی (ڈی) جے کا تنوع کم ہوتا ہے۔ ٹی سی آر گاما جین، خون میں سی ڈی 8 + سی ڈی 45 آر او + میموری ٹی خلیوں میں: تخمینے صحت مند نوجوان بالغوں میں 40,000 سے 100,000 ذیلی اقسام اور صحت مند بوڑھے بالغوں میں 3,600 سے 97,000 تک ہوتے ہیں۔ سی ڈی 4 +/سی ڈی 8 + ٹی خلیوں میں ٹی سی آر الفا اور ٹی سی آر بیٹا کا تخمینہ تقریبا 100,000 ذیلی اقسام پر لگایا گیا ہے۔ مستقبل کی پیش رفت اگلی نسل کی ترتیب کا بڑا اثر پڑ سکتا ہے۔ یہ تیزی سے، ایک ہی وقت میں، نسبتا سستے طریقے سے، مختلف جینوں سے ہزاروں ڈی این اے کے سلسلے حاصل کر سکتا ہے۔ اس طرح یہ ممکن ہو سکتا ہے کہ کسی کے مدافعتی نظام سے خلیوں کا ایک بڑا نمونہ لیا جائے، اور نمونے میں موجود ذیلی اقسام کی حد کو جلدی سے دیکھا جائے۔ دسیوں یا سیکڑوں ہزاروں خلیوں سے تیزی سے ڈیٹا حاصل کرنے کی صلاحیت، ایک وقت میں ایک خلیہ، شخص کے مدافعتی ذخیرے کے سائز کا ایک اچھا خیال فراہم کرنا چاہیے۔ ان بڑے پیمانے پر انکولی امیون ریسیپٹر سیکوینسنگ (اے آئی آر آر-ایس ای کیو) ڈیٹا کا مؤثر طریقے سے تجزیہ کرنے کے لیے خصوصی بائیو انفارمیٹکس پائپ لائنز کی ضرورت ہوتی ہے۔ اس مقصد کے لیے بہت سے کمپیوٹیشنل ٹولز تیار کیے جا رہے ہیں، جن میں شامل ہیں: ایم آئی ایکس سی آر ہائی تھرو پٹ ٹی سیل اور بی سیل ریسیپٹر سیکوینسنگ ڈیٹا کے تجزیے کے لیے سب سے زیادہ حوالہ شدہ پلیٹ فارم میں سے ایک ہے۔ امکینٹیشن فریم ورک ہائی تھرو پٹ اے آئی آر آر-سی کیو ڈیٹا تجزیہ کے لیے اسٹارٹ ٹو فائنش تجزیاتی ماحولیاتی نظام فراہم کرتا ہے۔ ٹی اور بی سیل رسیپٹر ڈیٹا سمیت سنگل سیل سیکوینسنگ ڈیٹا کے تجزیے کے لیے سیل رینجر سافٹ ویئر۔ اے آئی آر آر کمیونٹی کمیونٹی پر مبنی تنظیم ہے جو مدافعتی کارکردگی کا مطالعہ کرنے کے لیے اگلی نسل کی سیکوینسنگ ٹیکنالوجیز کے استعمال میں اسٹیک ہولڈرز کو منظم اور مربوط کر رہی ہے۔ 2017 میں، اے آئی آر آر کمیونٹی نے میٹا ڈیٹا کے کم سے کم سیٹ کے لیے سفارشات شائع کیں جنہیں اے آئی آر آر-سی کیو ڈیٹا سیٹ کو بیان کرنے کے لیے استعمال کیا جانا چاہیے جب اسے شائع کیا جائے اور عوامی ذخیرے میں جمع کیا جائے۔ امیونوسیکوینسنگ حوالہ جات بیرونی لنکس امیونوجینٹکس سائٹ-سی این آر ایس، فرانس بھی دیکھیں۔ ایم پی لیفرینک کے زیر انتظام۔ امیونولوجی