Thermotogota
تھرموٹوگوٹا بیکٹیریا ڈومین کا ایک فیلم ہے۔ فایلم تھرموٹوگوٹا گرام نیگیٹیو سٹیننگ، اینیروبک، اور زیادہ تر تھرموفیلک اور ہائپر تھرموفیلک بیکٹیریا پر مشتمل ہوتا ہے۔ خصوصیات اس فیلم کا نام ان میں سے بہت سے حیاتیات کے اعلی درجہ حرارت پر موجود ہونے کے ساتھ ساتھ ان پرجاتیوں کے خلیوں کے گرد موجود خصوصیت والی مٹھی کی ساخت، یا "ٹوگا" سے ماخوذ ہے۔ حال ہی میں، معتدل درجہ حرارت پر موجود کچھ تھرموٹوگوٹا کی بھی نشاندہی کی گئی ہے۔ اگرچہ تھرموٹوگوٹا پرجاتیوں میں گرام منفی داغ کی نمائش ہوتی ہے، لیکن وہ ایک واحد یونٹ لپڈ جھلی سے جڑے ہوتے ہیں، اس لیے وہ مونوڈرم بیکٹیریا ہوتے ہیں۔ کچھ تھرموٹوگوٹا پرجاتیوں کی اعلی درجہ حرارت پر پھلنے پھولنے کی صلاحیت کی وجہ سے، انہیں صنعتی عمل میں استعمال کے لیے پرکشش ہدف سمجھا جاتا ہے۔ ہائیڈروجن گیس کی پیداوار کے لیے مختلف پیچیدہ کاربوہائیڈریٹ کو استعمال کرنے کی تھرموٹوگوٹا کی میٹابولک صلاحیت کی وجہ سے ان پرجاتیوں کو جیواشم ایندھن کے متبادل توانائی کی پیداوار کے لیے ممکنہ بائیوٹیکنالوجیکل ذریعہ کے طور پر حوالہ دیا گیا۔ سالماتی اشارے حال ہی تک، کوئی بائیو کیمیکل یا سالماتی مارکر معلوم نہیں تھے جو پرجاتیوں کو فیلم تھرموٹوگوٹا سے دوسرے تمام بیکٹیریا سے ممتاز کر سکیں۔ تاہم، ایک حالیہ تقابلی جینومک مطالعہ نے اہم پروٹینوں میں بڑی تعداد میں محفوظ دستخطی انڈلز (سی ایس آئی) کی نشاندہی کی ہے جو یا تو تمام تھرموٹوگوٹا پرجاتیوں یا اس کے متعدد ذیلی گروپوں کے لیے مخصوص ہیں۔ ان میں سے بہت سے سی ایس آئی اہم ہاؤس کیپنگ پروٹین جیسے پول 1، ریکا، اور ٹی آر پی آر ایس، اور رائبوسومل پروٹین ایل 4، ایل 7/ایل 12، ایس 8، ایس 9، وغیرہ میں ہیں۔ مختلف ترتیب شدہ تھرموٹوگوٹا پرجاتیوں میں منفرد طور پر موجود ہیں جو اس فیلم کے لیے نئے سالماتی مارکر فراہم کرتے ہیں۔ ان مطالعات میں ہر آرڈر اور ہر خاندان کے لیے مخصوص سی ایس آئی کی بھی نشاندہی کی گئی۔ یہ انڈلز تھرموٹوگوٹا کی موجودہ درجہ بندی تنظیم کی بنیاد ہیں، اور فائیلوجینومک تجزیوں کے ذریعے مضبوطی سے تعاون یافتہ ہیں۔ اضافی سی ایس آئی بھی پائے گئے ہیں جو تھرموٹوگا، سیوڈوتھرموٹوگا، فرویڈوبیکٹیریم، اور تھرموسیفو کے لیے مخصوص ہیں۔ یہ سی ایس آئی ہر متعلقہ نسل کے اندر تمام پرجاتیوں کے لیے مخصوص ہیں، اور دیگر تمام بیکٹیریا میں غیر حاضر ہیں، اس طرح مخصوص مارکر ہیں۔ گہری شاخوں والی انواع پیٹروٹوگا موبلس، کوسموٹوگا اولیریا، اور تھرموٹوگلز بیکٹیریم میس جی 1 پر مشتمل ایک کلاڈ کو بھی سات سی ایس آئیز نے سپورٹ کیا۔ مزید برآں، کچھ سی ایس آئی جنہوں نے تھرموٹوگوٹا اور دیگر پروکیریوٹک گروپوں کے درمیان ایل جی ٹی کا ثبوت فراہم کیا، بھی رپورٹ کیے گئے۔ نئے دریافت شدہ سالماتی مارکر سالماتی لحاظ سے فایلم سے پرجاتیوں کی شناخت اور ان کا احاطہ کرنے اور مستقبل میں اس کی درجہ بندی میں ترمیم کے لیے نئے ذرائع فراہم کرتے ہیں۔ مزید برآں، ایک 51 اے اے اندراج سی ایس آئی کی شناخت تمام تھرموٹوگلز کے ساتھ ساتھ ایکویفیکلز کے لیے مخصوص ہونے کے لیے کی گئی تھی، جو ہائپر تھرموفیلک پرجاتیوں پر مشتمل ایک اور ترتیب ہے۔ فائیلوجنیٹک مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ بیکٹیریا کے ان دو غیر متعلقہ گروپوں میں ایک ہی CSI کی موجودگی لیٹرل جین کی منتقلی کی وجہ سے نہیں ہے، بلکہ CSI ممکنہ طور پر انتخابی دباؤ کی وجہ سے تھرموفائل کے ان دو گروپوں میں آزادانہ طور پر تیار ہوا ہے۔ داخل کرنا اے ٹی پیز ڈومین میں پروٹین کی سطح پر، اے ڈی پی/اے ٹی پی کے بائنڈنگ سائٹ کے قریب واقع ہے۔ سالماتی متحرک محرکات نے پانی کے مالیکیولز، CSI کے اندر بقیہ اور ADP/ATP مالیکیول کے درمیان بننے والے ہائیڈروجن بانڈز کے نیٹ ورک کا انکشاف کیا۔ یہ خیال کیا جاتا ہے کہ یہ نیٹ ورک اعلی درجہ حرارت پر ایس ای سی اے پروٹین کے ساتھ اے ڈی پی/اے ٹی پی کے پابند ہونے کو برقرار رکھنے میں مدد کرتا ہے، جس سے کچھ تھرموٹوگلز پرجاتیوں کے مجموعی تھرموسٹیبل فینوٹائپ میں مدد ملتی ہے۔ فائیلوجینی ٹیکسونومی یہ فیلم فی الحال ایک واحد کلاس (تھرموٹوگی)، چار آرڈرز (تھرموٹوگیلز، کوسموٹوگیلز، پیٹروٹوگیلز، اور میسواسیڈیٹوگیلز) اور پانچ خاندانوں (تھرمیٹوگیسی، فرویڈوبیکٹیریاسی، کوسموٹوگیسی، پیٹروٹوگیسی، اور میسواسیڈیٹوگیسی) پر مشتمل ہے۔ اس میں کل 15 نسلیں اور 52 انواع شامل ہیں۔ 16 ایس آر آر این اے کے درختوں میں، تھرموٹوگوٹا کو آرکیئل-بیکٹیریل برانچ پوائنٹ کے قریب ایکویفوٹا (ہائپر تھرموفیلک حیاتیات پر مشتمل ایک اور فیلم) کے ساتھ شاخ کرتے ہوئے دیکھا گیا ہے۔ تاہم، تھرموٹوگوٹا کا ایکویفوٹا کے ساتھ قریبی تعلق، اور انواع کے مؤخر الذکر گروپ کی گہری شاخ سازی، دوسرے جین/پروٹین کے سلسلے کی بنیاد پر فائیلوجنیٹک مطالعات کی حمایت نہیں کرتی ہے۔ اور کئی انتہائی محفوظ شدہ عالمگیر پروٹینوں میں محفوظ شدہ دستخطی انڈلز کے ذریعے بھی۔ تھرموٹوگوٹا کی آرکیئل حیاتیات کے ساتھ ان کی مبینہ طور پر بہت زیادہ لیٹرل جین کی منتقلی کے لیے بھی جانچ پڑتال کی گئی ہے۔ تاہم، زیادہ مضبوط طریقوں پر مبنی حالیہ مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ تھرموٹوگوٹا اور آرکیا سمیت دیگر گروپوں کے درمیان ایل جی ٹی کے واقعات اتنے زیادہ نہیں ہیں جتنے پہلے کے مطالعات میں تجویز کیے گئے تھے۔ فی الحال قبول شدہ درجہ بندی نامیات میں کھڑے ہونے والے پروکیریوٹک ناموں کی فہرست (ایل پی ایس این) اور نیشنل سینٹر فار بائیوٹیکنالوجی انفارمیشن (این سی بی آئی) کلاس تھرموٹوگی ریسنباخ 2002 جینس؟ کالڈوٹوگا زو اور دیگر پر مبنی ہے۔ 1999 آرڈر کوسموٹوگلس بھنڈاری اور گپتا 2014 فیملی کوسموٹوگیسی بھنڈاری اور گپتا 2014 جینس کوسموٹوگا دیپیپو اور دیگر۔ 2009 [تھرموکوائڈز فینگ اور دیگر۔ 2010] جینس میسوٹوگا نیسبو اور دیگر۔ 2013 آرڈر Mesoaciditogales Ith et al. 2015 خاندان Mesoaciditogaceea Ith et al. 2015 جینس اتھالسوٹوگا ایتوہ اور دیگر۔ 2015 جینس میسواسیڈیٹوگا ریسنباخ اور دیگر۔ 2013 آرڈر پیٹروٹوگلس بھنڈاری اور گپتا 2014 فیملی پیٹروٹوگیسی بھنڈاری اور گپتا 2014 ٹرائب "مارینیٹوگی" پیلٹیئر 2012 جینس مارینیٹوگا ویری اور دیگر۔ 2001 ٹرائب "پیٹروٹوجی" پیلٹیئر 2012 جینس ڈیفلوویٹوگا بین ہانیہ اور دیگر۔ 2012 جینس جیوٹوگا ڈیوے اور دیگر۔ 1993 جینس اوشیانوٹوگا جے سنگھیراچی اور لال 2011 جینس پیٹروٹوگا ڈیوی اور دیگر۔ 1993 جینس ٹیپیڈیٹوگا موری اور دیگر۔ 2021 آرڈر تھرموٹوگلس ریسنباخ 2002 فیملی فرویڈوبیکٹیریا بھنڈاری اور گپتا 2014 جینس فرویڈوبیکٹیریم پٹیل اور دیگر۔ 1985 جینس تھرموسیفو ہیوبر اور دیگر۔ 1989 نان کینٹور اور دیگر۔ 2013 فیملی تھرموٹوگیسی ریسنباخ 2002 ["سیوڈوتھرموٹوگیسی" پیلن، روڈریگز-آر اور علیخان 2022] جینس سیوڈوتھرموٹوگا بھنڈاری اور گپتا 2014 جینس؟ تھرموپیلیم ڈک ورتھ اور دیگر۔ 1996 جینس تھرموٹوگا سٹیٹر اور ہیوبر 1986 حوالہ جات برجی کا حجم 1 تھرموفائلز تھرموزوا بیکٹیریا فائیلا