Viral protein
وائرل پروٹین کی اصطلاح وائرس کے جینوم کی مصنوعات اور وائرل ذرہ میں شامل کسی بھی میزبان پروٹین دونوں سے مراد ہے۔ وائرل پروٹین کو ان کے افعال کے مطابق گروپ کیا جاتا ہے، اور وائرل پروٹین کے گروپوں میں ساختی پروٹین، غیر ساختی پروٹین، ریگولیٹری پروٹین، اور آلات پروٹین شامل ہیں۔ وائرس غیر زندہ ہوتے ہیں اور ان کے پاس اپنے طور پر دوبارہ پیدا کرنے کے ذرائع نہیں ہوتے ہیں، اس کے بجائے ایسا کرنے کے لیے ان کے میزبان خلیے کی مشینری پر انحصار کرتے ہیں۔ اس طرح، وائرس اپنی نقل اور وائرل پروٹین میں اپنے ایم آر این اے کے ترجمہ کے لیے درکار زیادہ تر پروٹین کے لیے کوڈ نہیں کرتے، لیکن اس مقصد کے لیے میزبان خلیے کے ذریعے انکوڈ کردہ پروٹین کا استعمال کرتے ہیں۔ وائرل ساختی پروٹین زیادہ تر وائرل ساختی پروٹین کیپسڈ اور وائرس کے لفافے کے اجزاء ہوتے ہیں۔ کیپسڈ وائرس کا جینیاتی مواد وائرل پروٹین کے ڈھانچے میں محفوظ ہوتا ہے جسے کیپسڈ کہا جاتا ہے۔ کیپسڈ ایک "ڈھال" ہے جو وائرل نیوکلک ایسڈ کو میزبان انزائموں یا دیگر قسم کے کیڑے مار ادویات یا وباؤں کے ذریعے خراب ہونے سے بچاتا ہے۔ یہ وائیرون کو اس کے میزبان سے منسلک کرنے کا بھی کام کرتا ہے، اور وائیرون کو میزبان خلیے کی جھلی میں گھسنے کے قابل بناتا ہے۔ ایک وائرل پروٹین کی بہت سی کاپیاں یا متعدد مختلف وائرل پروٹین کیپسیڈ بناتے ہیں، اور ان وائرل پروٹینوں میں سے ہر ایک کو وائرل جینوم کے ایک جین کے ذریعے کوڈ کیا جاتا ہے۔ کیپسڈ کی ساخت وائرس کو ایک بڑی کیپسڈ بنانے کے لیے وائرل جین کی ایک چھوٹی سی تعداد کا استعمال کرنے کی اجازت دیتی ہے۔ کئی پروٹومرز، اولیگومیرک (وائرل) پروٹین ذیلی اکائیاں، مل کر کیپسومیرز بناتی ہیں، اور کیپسومیرز مل کر کیپسیڈ بناتے ہیں۔ کیپسومیرس ایک آئکوساہیڈرل، ہیلیکل، یا پیچیدہ کیپسڈ میں ترتیب دے سکتے ہیں، لیکن بہت سے وائرسوں میں، جیسے کہ ہرپس سمپلیکس وائرس، ایک آئکوساہیڈرل کیپسڈ جمع کیا جاتا ہے۔ تین غیر متناسب اور غیر متناسب وائرل پروٹین اکائیاں آئکوساہیڈرل کیپسیڈ میں بیس ایک جیسے مثلث چہروں میں سے ہر ایک کو تشکیل دیتی ہیں۔ وائرل لفافہ کچھ وائرس کا کیپسڈ ایک جھلی میں بند ہوتا ہے جسے وائرل لفافہ کہا جاتا ہے۔ زیادہ تر معاملات میں وائرل لفافہ میزبان خلیے کی پلازما جھلی سے کیپسڈ کے ذریعے حاصل کیا جاتا ہے جب کوئی وائرس اپنے میزبان خلیے کو بڈنگ نامی عمل کے ذریعے چھوڑتا ہے۔ وائرل لفافہ وائرل گلائکوپروٹین سمیت وائرل پروٹین کے ساتھ سرایت شدہ لپڈ بائی لیئر سے بنا ہوتا ہے۔ یہ وائرل گلائکوپروٹین میزبان خلیوں کی جھلی پر مخصوص ریسیپٹرز اور کورسیپٹرز سے جڑے ہوتے ہیں، اور وہ وائرس کو اپنے ہدف میزبان خلیوں سے منسلک ہونے دیتے ہیں۔ ان میں سے کچھ گلائکوپروٹینز میں شامل ہیں: ہیماگگلوٹینن، نیورامینڈیز، اور انفلوئنزا وائرس جی پی 160 میں ایم 2 پروٹین، جو ہیومن امیونو ڈیفیشینسی وائرس (ایچ آئی وی) میں ذیلی یونٹس جی پی 120 اور جی پی 41 پر مشتمل ہے۔ وائرل گلائکوپروٹین وائرس سے سیل فیوژن میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ وائرس سے سیل فیوژن اس وقت شروع ہوتا ہے جب وائرل گلائکوپروٹین سیلولر ریسیپٹرز سے جڑے ہوتے ہیں۔ وائرل جھلی فیوژن پروٹین سیلولر جھلی کے ساتھ وائرل لفافے کے فیوژن کے لیے زیادہ توانائی کی ضرورت ہوتی ہے۔ وائرل جھلی فیوژن پروٹین اس اعلی توانائی کی رکاوٹ پر قابو پانے کے لیے اتپریرک کے طور پر کام کرتے ہیں۔ سیلولر ریسیپٹرز کے ساتھ وائرل گلائکوپروٹین کے پابند ہونے کے بعد، وائرل جھلی فیوژن پروٹین ساخت کی تشکیل میں تبدیلی سے گزرتے ہیں۔ تشکیل میں یہ تبدیلی پھر وائرل لفافے کو سیلولر جھلی کے ساتھ غیر مستحکم کرنے اور فیوژن میں سہولت فراہم کرتی ہے جس کے لیے وائرل لفافے پر فیوژن لوپس (ایف ایل) یا ہائیڈروفوبک فیوژن پیپٹائڈز (ایف پی) کو سیل جھلی کے ساتھ تعامل کرنے کی اجازت دی جاتی ہے۔ زیادہ تر وائرل جھلی فیوژن پروٹین فیوژن کے بعد ہیئر پن جیسی تشکیل میں ختم ہو جاتے ہیں، جس میں ایف ایل/ایف پی اور ٹرانس میمبرین ڈومین سبھی پروٹین کے ایک ہی طرف ہوتے ہیں۔ وائرل گلائکوپروٹینز اور ان کے تین جہتی ڈھانچوں نے، فیوژن سے پہلے اور بعد میں، ساختی تشکیل کی ایک وسیع رینج کو دریافت کرنے کی اجازت دی ہے۔ وائرل میمبرین فیوژن پروٹین کو چار مختلف کلاسوں میں تقسیم کیا گیا ہے، اور ہر کلاس کی شناخت خصوصیت کی ساختی تشکیل کے ذریعے کی جاتی ہے: کلاس I: پوسٹ فیوژن تشکیل میں ایک الگ مرکزی کنڈلی کنڈلی ڈھانچہ ہوتا ہے جو α-ہیلکل ہیئر پنوں کے دستخطی ٹرمر پر مشتمل ہوتا ہے۔ کلاس I وائرل فیوژن پروٹین کی ایک مثال ایچ آئی وی گلائکوپروٹین، جی پی 41 ہے۔ کلاس II: پروٹین میں مرکزی کنڈلی کنڈلی کی ساخت کا فقدان ہے۔ ایک خاص لمبا β-شیٹ آکٹوڈومین ڈھانچہ پر مشتمل ہے جو ہیئر پنوں کا ٹرائمر دینے کے لیے دوبارہ جوڑتا ہے۔ کلاس II وائرل فیوژن پروٹین کی مثالوں میں ڈینگی وائرس ای پروٹین، اور ویسٹ نیل وائرس ای پروٹین شامل ہیں۔ کلاس III: ساختی تشکیل کلاس I اور کلاس II وائرل جھلی فیوژن پروٹین کی خصوصیات کا ایک مجموعہ ہے۔ کلاس III وائرل فیوژن پروٹین کی ایک مثال ریبیز وائرس گلائکوپروٹین ہے، جی۔ کلاس IV: کلاس IV وائرل فیوژن پروٹین فیوژن سے وابستہ چھوٹے ٹرانس میمبرین (ایف اے ایس ٹی) پروٹین ہیں۔ وہ خود ہیئر پنز یا ہیئر پن ڈھانچوں کے ٹرائمر نہیں بناتے ہیں، اور وہ سب سے چھوٹے معلوم وائرل فیوژن پروٹین ہیں۔ فاسٹ پروٹین کو وائرس کے غیر ڈھکے ہوئے ریووائریڈی خاندان کے اراکین کے ذریعے کوڈ کیا جاتا ہے۔ وائرل غیر ساختیاتی پروٹین وائرل غیر ساختیاتی پروٹین ہوتے ہیں جو وائرس کے جینوم کے ذریعہ کوڈ کیے جاتے ہیں اور متاثرہ خلیوں میں ظاہر ہوتے ہیں۔ تاہم، یہ پروٹین وائریون میں جمع نہیں ہوتے ہیں۔ وائرس کی نقل کے دوران، کچھ وائرل غیر ساختی پروٹین اہم کام انجام دیتے ہیں جو خود نقل کے عمل کو متاثر کرتے ہیں۔ اسی طرح، وائرس کی اسمبلی کے دوران، ان میں سے کچھ پروٹین بھی اہم کام انجام دیتے ہیں جو اسمبلی کے عمل کو متاثر کرتے ہیں۔ ان وائرل غیر ساختی پروٹین افعال میں سے کچھ ریپلیکن کی تشکیل، امیونو ماڈیولیشن، اور وائرل ساختی پروٹین انکوڈنگ جینز کی ٹرانس ایکٹیویشن ہیں۔ ریپلیکن تشکیل وائرل غیر ساختی پروٹین میزبان سیل پروٹین کے ساتھ تعامل کرتے ہوئے ریپلیکن بناتے ہیں، بصورت دیگر ریپلیکیشن کمپلیکس کے نام سے جانا جاتا ہے۔ ہیپاٹائٹس سی وائرس میں، وائرل غیر ساختی پروٹین سیلولر ویسیکل جھلی ٹرانسپورٹ پروٹین، ایچ وی اے پی-33 کے ساتھ تعامل کرتے ہیں، تاکہ نقل کو جمع کیا جا سکے۔ وائرل نان اسٹرکچرل 4 بی (این ایس 4 بی) پروٹین میزبان خلیے کی جھلی کو بدل دیتا ہے اور ریپلیکیشن کمپلیکس کی تشکیل کا عمل شروع کرتا ہے۔ دیگر وائرل غیر ساختی پروٹین جیسے این ایس 5 اے، این ایس 5 بی، اور این ایس 3 کو بھی کمپلیکس میں بھرتی کیا جاتا ہے، اور این ایس 4 بی ان کے ساتھ تعامل کرتا ہے اور وائرل آر این اے سے جڑا رہتا ہے۔ امیونوموڈولیشن متاثرہ خلیے کے لیے میزبان کے مدافعتی ردعمل کو وائرل غیر ساختی پروٹین کی امیونوموڈولیٹری خصوصیات کے ذریعے ایڈجسٹ کیا جا سکتا ہے۔ بڑے ڈی این اے وائرس کی بہت سی انواع پروٹین کو انکوڈ کرتی ہیں جو میزبان مدافعتی ردعمل کو ختم کرتی ہیں، جس سے وائرس کے پھیلاؤ کی اجازت ملتی ہے۔ اس طرح کے پروٹین انسانوں میں سوزش کی بیماری کے لیے نئے بائیو فارماسیوٹیکل علاج تیار کرنے کی صلاحیت رکھتے ہیں، کیونکہ پروٹین سوزش مدافعتی ثالثوں کو ختم کرنے کے لیے ثابت ہوئے ہیں۔ ویسٹ نیل وائرس میں وائرل غیر ساختی پروٹین این ایس 1 ایک تکمیلی کنٹرول پروٹین، فیکٹر ایچ کے پابند ہونے کے ذریعے تکمیلی سرگرمی کو روکتا ہے۔ اس کے نتیجے میں، متاثرہ خلیوں کی تکمیلی شناخت کم ہو جاتی ہے، اور متاثرہ خلیات میزبان کے مدافعتی نظام سے غیر محفوظ رہتے ہیں۔ وائرل ریگولیٹری اور لوازمات پروٹین وائرل ریگولیٹری اور آلات پروٹین کے بہت سے کام ہوتے ہیں۔ یہ وائرل پروٹین وائرل جینوم میں وائرل جین کے تاثرات کو کنٹرول اور متاثر کرتے ہیں، بشمول وائرل ساختی جین ٹرانسکرپشن کی شرح۔ وائرل ریگولیٹری اور لوازمات پروٹین میزبان خلیے کے سیلولر افعال کو بھی متاثر کرتے ہیں اور ایڈجسٹ کرتے ہیں، جیسے جینوں کا ضابطہ، اور اپوپٹوسس۔ ڈی این اے وائرس اور ریٹرو وائرس میں وائرل ریگولیٹری پروٹین وائرل جین ٹرانسکرپشن کو بڑھا سکتے ہیں، اسی طرح یہ پروٹین میزبان سیلولر جین ٹرانسکرپشن کو بھی بڑھا سکتے ہیں۔ وائرل آلات پروٹین، جنہیں معاون پروٹین بھی کہا جاتا ہے، کو ریٹرو وائرس کے جینوم کے ذریعے کوڈ کیا جاتا ہے۔ زیادہ تر وائرل آلات پروٹین صرف مخصوص قسم کے خلیوں میں اپنے کام انجام دیتے ہیں۔ نیز، وائرس کی نقل پر ان کا زیادہ اثر نہیں ہوتا ہے۔ تاہم، بعض صورتوں میں، وائرس کی نقل کو برقرار رکھنے کے لیے وائرل آلات پروٹین کی مدد (اور فنکشن) کی ضرورت ہوگی۔ اینڈوجینس ریٹرو وائرل پروٹین سنسیٹن ایک اینڈوجینس ریٹرو وائرس پروٹین ہے جسے ممالیہ جینوم میں پکڑا گیا ہے تاکہ پلیسینٹل مورفوجینیسیس میں جھلی کے فیوژن کی اجازت دی جا سکے۔ حوالہ جات بیرونی روابط یونیپروٹ کے بی وائرس منٹ وائرولوجی میں تمام معروف وائرل پروٹین کی فہرست