TRIM5alpha
سہ فریقی موٹف پر مشتمل پروٹین 5 جسے رنگ فنگر پروٹین 88 بھی کہا جاتا ہے ایک پروٹین ہے جسے انسانوں میں ٹرم 5 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ اس پروٹین کی الفا آئسوفارم، TRIM5α، ایک ریٹرو وائرس کی پابندی کا عنصر ہے، جو ایک نوع کے مخصوص ابتدائی بلاک کو ریٹرو وائرس انفیکشن میں ثالثی کرتا ہے۔ TRIM5α 493 امینو ایسڈ پر مشتمل ہے جو زیادہ تر پرائمیٹس کے خلیوں میں پایا جاتا ہے۔ TRIM5α ایک اندرونی مدافعتی عنصر ہے جو پروٹین، ٹیتھیرین اور TRIM22 کے APOBEC خاندان کے ساتھ ساتھ ریٹرو وائرس کے خلاف پیدائشی مدافعتی دفاع میں اہم ہے۔ ساخت TRIM5α کا تعلق TRIM پروٹین خاندان سے ہے (TRIM کا مطلب TRIPARTITE Motif ہے) ؛ اس خاندان کی شناخت سب سے پہلے ریڈی نے 1992 میں پروٹین کے ایک سیٹ کے طور پر کی تھی جس میں رنگ قسم کا زنک فنگر ڈومین، ایک B-باکس زنک بائنڈنگ ڈومین، اس کے بعد کنڈلی-کنڈلی کا علاقہ ہوتا ہے۔ TRIM5α دوسرے ڈومینز کے علاوہ C-ٹرمینل PRY-SPRY یا B30.2 ڈومین رکھتا ہے۔ فنکشن اور عمل کے ذرائع جب ایک ریٹرو وائرس میزبان سیل سائٹوسول میں داخل ہوتا ہے تو، ریٹرو وائرل کیپسیڈ کے بارے میں پہلے یہ خیال کیا جاتا تھا کہ وہ ان کوٹنگ سے گزرتا ہے، حالانکہ اس (مکمل ان کوٹنگ تھیوری) پر اب شک ہے ؛ بلکہ حقیقی تصویر یہ سمجھی جاتی ہے کہ کیپسیڈ ان کوٹنگ درحقیقت سائٹوسول میں ہوتی ہے لیکن یہ ایک ایسا عمل ہے جو آہستہ آہستہ ہوتا ہے جیسے جیسے کیپسیڈ نیوکلئس کے قریب اور قریب ہوتا جاتا ہے، حالانکہ عام طور پر ان کوٹنگ کا عمل، لیکن ہمیشہ نہیں، نیوکلئس میں مکمل ہوتا ہے۔ مزید برآں، کیپسڈ میں وائرل جینوم کو وائرل کیپسڈ کے اندر ریورس ٹرانسکرائب کیا جاتا ہے تاکہ ڈٹر وائرینز کی پیداوار کو قابل بنایا جا سکے۔ TRIM5α سائٹوسول میں موجود ہوتا ہے۔ یہ وائرل کیپسڈ پروٹین کے اندر موجود نقشوں کو پہچانتا ہے، جس کی وجہ سے TRIM5α جالی دار طریقے سے (ابھی تک غیر لیپت) کیپسڈ کو دبانے کا سبب بنتا ہے تاکہ ایک بار بار باقاعدہ ہیکساگونل نیٹ تشکیل پائے، ہر ہیکساگون کے دو رخ تین طرفہ مرکز کے دو ترجمانوں سے بنے ہوتے ہیں اور ٹرائمر کو بولتے ہیں اور اس کے نتیجے میں وائرل کیپسڈ ان کوٹنگ کے عمل میں مداخلت کرتے ہیں، اس طرح (1) وائرل جینوم کو میزبان خلیے کے مرکزے میں منتقل ہونے اور (2) کامیاب ریورس ٹرانسکرپشن کو روکا جاتا ہے۔ عمل کا صحیح طریقہ کار حتمی طور پر نہیں دکھایا گیا ہے، لیکن محدود وائرس سے کیپسیڈ پروٹین (یعنی وائرس جو TRIM5α مداخلت کا موضوع ہیں) کو پروٹیسوم پر منحصر انحطاط کے ذریعے ہٹا دیا جاتا ہے۔ TRIM5α، جو ایک بار اس کے انتہائی باقاعدہ ریٹیکولیٹری نیٹ میں تشکیل پاتا ہے، اس مقصد کے لیے ubiquitin کو بھرتی کرتا ہے، جو بدلے میں پروٹیسوم کو شامل کرتا ہے۔ TRIM5α کی ثالثی میں ہونے والی روک تھام میں دیگر سیلولر پروٹین کی شمولیت کا شبہ ہے لیکن ابھی تک اس کا مظاہرہ نہیں ہوا ہے۔ تاہم، سائکلوفیلن اے پرانی دنیا کے بندروں کی انواع میں TRIM5α کے ذریعے ایچ آئی وی-1 کی روک تھام کے لیے اہم ہے۔ پابندی کی "خاصیت"، یعنی، آیا کسی دیئے گئے ریٹرو وائرس کو TRIM5α کے ذریعے نشانہ بنایا جا سکتا ہے، اس کا تعین مکمل طور پر پروٹین کے C-ٹرمینل ڈومین کے امینو ایسڈ کی ترتیب سے ہوتا ہے، جسے B30.2/PRY-SPRY ڈومین کہا جاتا ہے۔ امینو ایسڈ 332، جو اس ڈومین کے اندر پایا جاتا ہے، ریٹو وائرس کی پابندی کی خاصیت کا تعین کرنے میں اہم کردار ادا کرتا ہے۔ TRIM5α نے تقریبا 4 ملین سال پہلے انسانی مدافعتی دفاعی نظام میں ایک اہم کردار ادا کیا ہوگا، جب ریٹرو وائرس PtERV1 جدید چمپینزی کے آباؤ اجداد کو متاثر کر رہا تھا۔ اگرچہ ابھی تک انسانی جینوم میں پی ٹی ای آر وی 1 کا کوئی سراغ نہیں ملا ہے، لیکن جدید چمپینزی کے جینوم میں پی ٹی ای آر وی 1 ڈی این اے کے تقریبا 130 نشانات پائے گئے ہیں۔ پی ٹی ای آر وی 1 ریٹرو وائرس کے حصے کو دوبارہ بنانے کے بعد، یہ بتایا گیا کہ TRIM5α وائرس کو انسانی خلیوں میں داخل ہونے سے روکتا ہے۔ اگرچہ یہ سیلولر دفاعی طریقہ کار 40 لاکھ سال پہلے پی ٹی ای آر وی 1 کی وبا کا سامنا کرتے وقت بہت مفید رہا ہوگا، لیکن اس کا مضر اثر خلیوں کو ایچ آئی وی-1 ریٹرو وائرس کے حملے کا زیادہ شکار ہونے کا ہوتا ہے۔ حال ہی میں ان نتائج پر شکوک و شبہات پیدا ہوئے ہیں۔ پی ٹی ای آر وی 1 کیپسڈ کا استعمال کرتے ہوئے، جو اعلی ٹائٹر وائرس جیسے ذرات پیدا کرتا ہے، پیریز-کیبلرو اور دیگر۔ اطلاع دی گئی ہے کہ PtERV1 انسان یا چمپینزی TRIM5α کے ذریعہ محدود نہیں ہے۔ طبی اہمیت ریسس مکاکس، پرانی دنیا کے بندروں کی ایک نوع، انسانوں میں ایڈز کا سبب بننے والے وائرس ایچ آئی وی-1 کے خلاف تقریبا مکمل طور پر مزاحم دکھائی دیتی ہے۔ TRIM5α کا ریسس مکاکس ورژن بہت تیز تھا اور آنے والے ایچ آئی وی کیپسول سے اس کا اتنا زیادہ لگاؤ تھا کہ یہ اسے تیزی سے باندھ سکتا تھا اور اسے خراب کر سکتا تھا تاکہ وائرس کو بے اثر کیا جا سکے۔ انسانوں میں بھی ایک TRIM5α ہوتا ہے، لیکن یہ کافی ردعمل میں ثالثی کے لیے کافی نہیں ہے۔ تاہم، TRIM5α کا انسانی ورژن میورین لیوکیمیا وائرس (ایم ایل وی) کے ساتھ ساتھ ایکون متعدی انیمیا وائرس (ای آئی اے وی) کے تناؤ کو روک سکتا ہے۔ ایک اینٹی وائرل پروٹین کے طور پر TRIM5α کی دریافت سے پہلے، انبیشن فینوٹائپ کو بیان کیا گیا تھا اور اسے ریف 1 (انسانی خلیوں میں) اور ایل وی 1 (بندر کے خلیوں میں) بنایا گیا تھا۔ یہ اصطلاح اب بڑی حد تک ترک کر دی گئی ہے۔ ایک متعلقہ پروٹین، جسے TRIMCyp (یا TRIM5-CypA) کہا جاتا ہے، الو بندر، نیو ورلڈ بندر کی ایک نوع میں الگ کیا گیا تھا، اور ایچ آئی وی-1 کے ذریعے انفیکشن کو طاقتور طریقے سے روکتا ہوا دکھایا گیا تھا۔ اسی طرح کا پروٹین اولڈ ورلڈ بندروں میں آزادانہ طور پر پیدا ہوا ہے اور مکاک کی کئی انواع میں اس کی نشاندہی کی گئی ہے۔ حال ہی میں یہ بیان کیا گیا تھا کہ امیونوپروٹیسوم کی انٹرفیرون-α-ثالثی محرک انسانی TRIM5α کو ایچ آئی وی-1 ڈی این اے کی ترکیب اور انفیکشن کی موثر کیپسڈ پر منحصر روک تھام کے قابل بناتی ہے۔ نوٹ اور حوالہ جات بیرونی لنکس یہ بھی دیکھیں پیپٹائڈیل پرولیل آئسومیرس اے پروٹینز امیون سسٹم وائرولوجی