Nucleotide diversity
نیوکلیوٹائڈ تنوع سالماتی جینیات میں ایک تصور ہے جو آبادی کے اندر پولیمرفزم کی ڈگری کی پیمائش کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ نیوکلیوٹائڈ تنوع کی ایک عام طور پر استعمال ہونے والی پیمائش پہلی بار نی اور لی نے 1979 میں متعارف کرائی تھی۔ اس پیمائش کو نمونے کی آبادی میں تمام ممکنہ جوڑوں میں دو ڈی این اے کے سلسلے کے درمیان فی سائٹ نیوکلیوٹائڈ کے فرق کی اوسط تعداد کے طور پر بیان کیا گیا ہے، اور اس کی طرف اشارہ کیا گیا ہے۔ اس کے لیے ایک تخمینہ اس طرح دیا جاتا ہے: جہاں th اور th ترتیب کی متعلقہ تعدد ہیں، th اور th ترتیب کے درمیان فی نیوکلیوٹائڈ سائٹ میں نیوکلیوٹائڈ کے فرق کی تعداد ہے، اور نمونے میں ترتیب کی تعداد ہے۔ رقم کے سامنے کی اصطلاح ایک غیر جانبدار تخمینہ کار کی ضمانت دیتی ہے، جو اس بات پر منحصر نہیں ہے کہ آپ کتنے ترتیبات کا نمونہ لیتے ہیں۔ نیوکلیوٹائڈ تنوع جینیاتی تغیر کی ایک پیمائش ہے۔ یہ عام طور پر آبادی کے تنوع کے دیگر شماریاتی اقدامات سے وابستہ ہے، اور متوقع ہیٹروزائگوسیٹی سے ملتا جلتا ہے۔ اس اعداد و شمار کا استعمال ماحولیاتی آبادیوں کے اندر یا ان کے درمیان تنوع کی نگرانی، فصلوں اور متعلقہ انواع میں جینیاتی تغیر کی جانچ پڑتال، یا ارتقائی تعلقات کا تعین کرنے کے لیے کیا جا سکتا ہے۔ نیوکلیوٹائڈ تنوع کا حساب براہ راست ڈی این اے کے سلسلے کی جانچ کر کے کیا جا سکتا ہے، یا سالماتی مارکر ڈیٹا سے اندازہ لگایا جا سکتا ہے، جیسے کہ رینڈم ایمپلیفائیڈ پولیمورفک ڈی این اے (آر اے پی ڈی) ڈیٹا اور ایمپلیفائیڈ فریگمنٹ لینتھ پولیمورفزم (اے ایف ایل پی) ڈیٹا۔ سافٹ ویئر ڈی این اے ایس پی-ڈی این اے سیکوینس پولیمورفزم، منسلک ڈی این اے سیکوینس ڈیٹا سے نیوکلیوٹائڈ پولیمورفزم کے تجزیے کے لیے ایک سافٹ ویئر پیکیج ہے۔ ایم ای جی اے، مالیکیولر ایوولوشنری جینیٹکس اینالیسس، ایک سافٹ ویئر پیکیج ہے جو سالماتی ارتقاء کی شرحوں کا اندازہ لگانے کے ساتھ ساتھ فائیلوجنیٹک درختوں کو پیدا کرنے اور ڈی این اے کے سلسلے کو سیدھا کرنے کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ ونڈوز، لینکس اور میک او ایس ایکس کے لیے دستیاب ہے۔ 5. x)۔ آرلیکون 3 سافٹ ویئر کو نیوکلیوٹائڈ تنوع کے حساب کتاب اور انٹرا آبادی اور بین آبادی کے تجزیے کے لیے مختلف قسم کے دیگر شماریاتی ٹیسٹوں کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ ونڈوز کے لیے دستیاب ہے۔ ویریسکن آر پیکیج پاپ جینوم پکسی آر پیکیج کیو سوٹیلس حوالہ جات سالماتی جینیات