Plant virus
پودوں کے وائرس وہ وائرس ہیں جو پودوں کو متاثر کرتے ہیں۔ دیگر تمام وائرسوں کی طرح، پودوں کے وائرس لازمی انٹرا سیلولر پرجیویوں ہیں جن کے پاس میزبان کے بغیر نقل کرنے کے لیے سالماتی مشینری نہیں ہوتی ہے۔ پودوں کے وائرس ویسکولر پودوں ("اعلی پودوں") کے لیے روگجنک ہو سکتے ہیں۔ زیادہ تر پودوں کے وائرس چھڑی کی شکل کے ہوتے ہیں، پروٹین ڈسکس وائرل جینوم کے ارد گرد ایک ٹیوب بناتے ہیں۔ آئسومیٹرک ذرات ایک اور عام ساخت ہیں۔ ان کے پاس شاذ و نادر ہی لفافہ ہوتا ہے۔ بڑی اکثریت میں آر این اے جینوم ہوتا ہے، جو عام طور پر چھوٹا اور سنگل اسٹرینڈڈ (ایس ایس) ہوتا ہے، لیکن کچھ وائرس میں ڈبل اسٹرینڈڈ (ڈی ایس) آر این اے، ایس ایس ڈی این اے یا ڈی ایس ڈی این اے جینوم ہوتے ہیں۔ اگرچہ پودوں کے وائرس کو ان کے جانوروں کے ہم منصبوں کی طرح اچھی طرح سے نہیں سمجھا جاتا ہے، لیکن پودوں کا ایک وائرس بہت پہچاننے کے قابل ہو گیا ہے: تمباکو موزیک وائرس (ٹی ایم وی)، دریافت ہونے والا پہلا وائرس۔ یہ اور دیگر وائرس ہر سال دنیا بھر میں فصلوں کی پیداوار میں اندازا 60 بلین امریکی ڈالر کے نقصان کا سبب بنتے ہیں۔ پودوں کے وائرس کو 73 نسلوں اور 49 خاندانوں میں تقسیم کیا گیا ہے۔ تاہم، یہ اعداد و شمار صرف کاشت شدہ پودوں سے متعلق ہیں، جو پودوں کی انواع کی کل تعداد کا صرف ایک چھوٹا سا حصہ ہیں۔ جنگلی پودوں میں وائرس کا اچھی طرح سے مطالعہ نہیں کیا گیا ہے، لیکن جنگلی پودوں اور ان کے وائرس کے درمیان تعامل اکثر میزبان پودوں میں بیماری کا سبب نہیں بنتا ہے۔ ایک پودے سے دوسرے پودے میں اور ایک پودے کے خلیے سے دوسرے پودے میں منتقل ہونے کے لیے، پودوں کے وائرس کو ایسی حکمت عملی استعمال کرنی چاہیے جو عام طور پر جانوروں کے وائرس سے مختلف ہوں۔ زیادہ تر پودے حرکت نہیں کرتے، اور اس لیے پودے سے پودے کی منتقلی میں عام طور پر ویکٹر (جیسے کیڑے مکوڑے) شامل ہوتے ہیں۔ پودوں کے خلیات ٹھوس خلیات کی دیواروں سے گھرا ہوا ہوتا ہے، اس لیے پلاسموڈسماٹا کے ذریعے نقل و حمل پودوں کے خلیات کے درمیان منتقل ہونے کے لیے وائرینز کے لیے ترجیحی راستہ ہے۔ پودوں میں پلازموڈسماتا کے ذریعے ایم آر این اے کی نقل و حمل کے لیے خصوصی میکانزم ہوتے ہیں، اور خیال کیا جاتا ہے کہ یہ میکانزم آر این اے وائرس کے ذریعے ایک خلیے سے دوسرے خلیے میں پھیلنے کے لیے استعمال ہوتے ہیں۔ وائرل انفیکشن کے خلاف پودوں کے دفاع میں، دیگر اقدامات کے علاوہ، ڈی ایس آر این اے کے جواب میں ایس آئی آر این اے کا استعمال شامل ہے۔ زیادہ تر پودوں کے وائرس اس ردعمل کو دبانے کے لیے پروٹین کو انکوڈ کرتے ہیں۔ پودے چوٹ کے جواب میں پلازموڈسماتا کے ذریعے نقل و حمل کو بھی کم کرتے ہیں۔ بیماری پیدا کرنے والے پودوں کے وائرس کی دریافت کو اکثر نیدرلینڈ میں کام کرنے والے اے میئر (1886) سے تسلیم کیا جاتا ہے جس سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ تمباکو کے پتوں سے حاصل ہونے والے موزیک کے رس میں صحت مند پودوں میں انجکشن لگانے پر موزیک کی علامت پیدا ہوتی ہے۔ تاہم رس کو ابالنے پر اس کا انفیکشن ختم ہو گیا۔ اس نے سوچا کہ وجہ ایجنٹ بیکٹیریا ہے۔ تاہم، بڑی تعداد میں بیکٹیریا کے ساتھ بڑے ٹیکے لگانے کے بعد، وہ موزیک کی علامت پیدا کرنے میں ناکام رہا۔ 1898 میں، مارٹنس بیجینک، جو نیدرلینڈز کی ٹیکنیکل یونیورسٹی میں مائکروبیولوجی کے پروفیسر تھے، نے اپنے تصورات پیش کیے کہ وائرس چھوٹے ہوتے ہیں اور اس بات کا تعین کیا کہ چیمبر لینڈ فلٹر موم بتی سے گزرنے پر "موزیک بیماری" متعدی رہتی ہے۔ یہ بیکٹیریا مائکروجنزموں کے برعکس تھا، جنہیں فلٹر کے ذریعے برقرار رکھا گیا تھا۔ بیجینک نے متعدی فلٹریٹ کو "کانٹیجیمیم ویوم فلوئیڈم" کہا، اس طرح جدید اصطلاح "وائرس" کا سکےج۔ 'وائرل تصور' کی ابتدائی دریافت کے بعد منتقلی کے طریقے کی بنیاد پر کسی بھی دیگر معروف وائرل بیماریوں کی درجہ بندی کرنے کی ضرورت تھی حالانکہ خوردبین مشاہدہ بے نتیجہ ثابت ہوا۔ 1939 میں ہومز نے پودوں کے 129 وائرسوں کی درجہ بندی کی فہرست شائع کی۔ اس میں توسیع کی گئی اور 1999 میں 977 سرکاری طور پر تسلیم شدہ تھے، اور کچھ عارضی، پودوں کے وائرس کی انواع تھیں۔ ٹی ایم وی کی صفائی (کرسٹلائزیشن) سب سے پہلے وینڈل اسٹینلے نے کی تھی، جس نے 1935 میں اپنے نتائج شائع کیے، حالانکہ اس نے اس بات کا تعین نہیں کیا کہ آر این اے متعدی مواد تھا۔ تاہم، انہیں 1946 میں کیمسٹری کا نوبل انعام ملا۔ 1950 کی دہائی میں دو لیبارٹریوں کی ایک دریافت نے بیک وقت ثابت کیا کہ ٹی ایم وی کا صاف شدہ آر این اے متعدی تھا جس نے اس دلیل کو تقویت دی۔ آر این اے جینیاتی معلومات کو نئے متعدی ذرات کی پیداوار کے لیے کوڈ تک لے جاتا ہے۔ حال ہی میں وائرس کی تحقیق پلانٹ وائرس جینوم کی جینیات اور سالماتی حیاتیات کو سمجھنے پر مرکوز رہی ہے، اس بات کا تعین کرنے میں خاص دلچسپی کے ساتھ کہ وائرس کس طرح پودوں کی نقل، حرکت اور انفیکشن کر سکتا ہے۔ وائرس کی جینیات اور پروٹین کے افعال کو سمجھنے کا استعمال بائیوٹیکنالوجی کمپنیوں کے ذریعہ تجارتی استعمال کی صلاحیت کو تلاش کرنے کے لیے کیا گیا ہے۔ خاص طور پر، وائرل سے ماخوذ ترتیبات کا استعمال مزاحمت کی نئی شکلوں کی تفہیم فراہم کرنے کے لیے کیا گیا ہے۔ ٹیکنالوجی میں حالیہ تیزی انسانوں کو پودوں کے وائرس میں ہیرا پھیری کرنے کی اجازت دیتی ہے جو پودوں میں ویلیو ایڈڈ پروٹین کی پیداوار کے لیے نئی حکمت عملی فراہم کر سکتی ہے۔ ساخت کے وائرس انتہائی چھوٹے ہوتے ہیں اور صرف الیکٹران خوردبین کے تحت مشاہدہ کیے جا سکتے ہیں۔ وائرس کی ساخت اس کے پروٹین کے کوٹ سے ملتی ہے، جو وائرل جینوم کو گھیرے ہوئے ہوتے ہیں۔ وائرل ذرات کی اسمبلی بے ساختہ ہوتی ہے۔ پودوں کے 50 فیصد سے زیادہ معلوم وائرس چھڑی کی شکل کے (لچکدار یا سخت) ہوتے ہیں۔ ذرہ کی لمبائی عام طور پر جینوم پر منحصر ہوتی ہے لیکن یہ عام طور پر 300 اور 500 این ایم کے درمیان ہوتی ہے جس کا قطر 15-20 این ایم ہوتا ہے۔ پروٹین کی ذیلی اکائیوں کو ڈسک بنانے کے لیے دائرے کے دائرے کے ارد گرد رکھا جا سکتا ہے۔ وائرل جینوم کی موجودگی میں، ڈسکس کو اسٹیک کیا جاتا ہے، پھر درمیان میں نیوکلک ایسڈ جینوم کے لیے جگہ کے ساتھ ایک ٹیوب بنائی جاتی ہے۔ پودوں کے وائرسوں میں دوسری سب سے عام ساخت آئسومیٹرک ذرات ہیں۔ وہ قطر میں 25-50 nm ہیں۔ ایسے معاملات میں جب صرف ایک کوٹ پروٹین ہوتا ہے، بنیادی ڈھانچہ 60 ٹی ذیلی اکائیوں پر مشتمل ہوتا ہے، جہاں ٹی ایک عدد ہوتا ہے۔ کچھ وائرس میں 2 کوٹ پروٹین ہو سکتے ہیں جو ایک آئکوساہڈرل کی شکل کا ذرہ بنانے کے لیے منسلک ہوتے ہیں۔ Geminiviridae کی تین نسلیں ہیں جو ایسے ذرات پر مشتمل ہوتی ہیں جو دو آئسومیٹرک ذرات کی طرح ایک دوسرے سے جڑے ہوتے ہیں۔ پودوں کے وائرس کی بہت کم تعداد میں، ان کے کوٹ پروٹین کے علاوہ، ایک لپڈ لفافہ ہوتا ہے۔ یہ پودوں کے خلیے کی جھلی سے حاصل ہوتا ہے کیونکہ وائرس کا ذرہ خلیے سے نکل جاتا ہے۔ پودوں کے وائرس کی منتقلی سیپ وائرس کے ذریعے کسی زخمی پودے کے ساتھ صحت مند پودے کے رابطے سے سیپ کی براہ راست منتقلی سے پھیل سکتی ہے۔ اس طرح کا رابطہ زرعی طریقوں کے دوران ہو سکتا ہے، جیسے اوزار یا ہاتھوں سے ہونے والے نقصان سے، یا قدرتی طور پر، جیسے پودے کو جانور کھانا کھلانے سے۔ عام طور پر ٹی ایم وی، آلو کے وائرس اور کھیرے کے موزیک وائرس سیپ کے ذریعے منتقل ہوتے ہیں۔ کیڑے پودوں کے وائرس کو ایک ویکٹر کے ذریعے منتقل کرنے کی ضرورت ہوتی ہے، زیادہ تر کیڑے جیسے لیف شاپر۔ وائرس کی ایک کلاس، رابڈوویریڈی، اصل میں کیڑے کے وائرس ہونے کی تجویز کی گئی ہے جو پودوں میں نقل کرنے کے لیے تیار ہوئے ہیں۔ پودے کے وائرس کا منتخب کردہ کیڑا ویکٹر اکثر اس وائرس کی میزبان رینج میں تعین کرنے والا عنصر ہوگا: یہ صرف ان پودوں کو متاثر کر سکتا ہے جن پر کیڑا ویکٹر کھانا کھاتا ہے۔ یہ جزوی طور پر اس وقت دکھایا گیا جب پرانی دنیا کی سفید مکھی نے اسے ریاستہائے متحدہ میں بنایا، جہاں اس نے پودوں کے بہت سے وائرس کو نئے میزبانوں میں منتقل کیا۔ ان کے منتقل ہونے کے طریقے پر منحصر ہے، پودوں کے وائرس کو غیر مستقل، نیم مستقل اور مستقل کے طور پر درجہ بند کیا جاتا ہے۔ غیر مستقل ترسیل میں، وائرس کیڑے کے اسٹائلٹ کے دور دراز سرے سے منسلک ہو جاتے ہیں اور اگلے پودے پر یہ کھانا کھاتا ہے، یہ اسے وائرس سے ٹیکہ لگاتا ہے۔ نیم مستقل وائرل ٹرانسمیشن میں وائرس کیڑے کی اگلی آنت میں داخل ہوتا ہے۔ وہ وائرس جو آنت کے ذریعے ہیمولیمف میں اور پھر تھوک غدود میں منتقل ہونے کا انتظام کرتے ہیں انہیں مستقل کہا جاتا ہے۔ مستقل وائرس کی دو ذیلی کلاسیں ہیں: پھیلاؤ اور گردش۔ متعدی وائرس پودے اور کیڑے دونوں میں نقل کرنے کے قابل ہوتے ہیں (اور اصل میں کیڑے کے وائرس ہو سکتے ہیں)، جبکہ گردش نہیں کر سکتے۔ گردش کرنے والے وائرس ایفیڈز کے اندر چیپرون پروٹین سمبیوئن کے ذریعے محفوظ ہوتے ہیں، جو بیکٹیریل سمبیوئنٹس کے ذریعے پیدا ہوتے ہیں۔ بہت سے پودوں کے وائرس اپنے جینوم پولی پیپٹائڈز کے اندر کیڑوں کے ذریعے منتقلی کے لیے ضروری ڈومینز کے ساتھ انکوڈ کرتے ہیں۔ غیر مستقل اور نیم مستقل وائرس میں، یہ ڈومین کوٹ پروٹین میں ہوتے ہیں اور دوسرا پروٹین مددگار جزو کے نام سے جانا جاتا ہے۔ یہ بتانے کے لیے کہ یہ پروٹین کیڑوں کی ثالثی سے وائرل ٹرانسمیشن میں کس طرح مدد کرتے ہیں، ایک برجنگ مفروضہ تجویز کیا گیا ہے۔ مددگار جزو کوٹ پروٹین کے مخصوص ڈومین سے منسلک ہوگا، اور پھر کیڑے کے منہ کے حصے-ایک پل بنائیں گے۔ مستقل پھیلاؤ والے وائرس، جیسے ٹماٹر اسپاٹڈ ولٹ وائرس (ٹی ایس ڈبلیو وی) میں، اکثر پروٹین کے ارد گرد ایک لپڈ کوٹ ہوتا ہے جو پودوں کے وائرس کی دوسری کلاسوں میں نہیں دیکھا جاتا ہے۔ ٹی ایس ڈبلیو وی کے معاملے میں، اس لپڈ لفافے میں 2 وائرل پروٹین ظاہر ہوتے ہیں۔ یہ تجویز کیا گیا ہے کہ وائرس ان پروٹینوں کے ذریعے باندھتے ہیں اور پھر ریسیپٹر-میڈیٹڈ اینڈوسیٹوسس کے ذریعے کیڑے کے خلیے میں لے جاتے ہیں۔ نیماٹوڈس مٹی سے پیدا ہونے والے نیماٹوڈس کو بھی وائرس منتقل کرنے کے لیے دکھایا گیا ہے۔ وہ متاثرہ جڑوں کو کھا کر انہیں حاصل کرتے ہیں اور منتقل کرتے ہیں۔ وائرس غیر مستقل اور مستقل طور پر منتقل ہو سکتے ہیں، لیکن وائرس کے نیماتوڈس میں نقل کرنے کے قابل ہونے کا کوئی ثبوت نہیں ہے۔ وائرس اسٹائلٹ (کھانا کھلانے والے اعضاء) یا آنت سے منسلک ہوتے ہیں جب وہ کسی متاثرہ پودے کو کھاتے ہیں اور پھر دوسرے پودوں کو متاثر کرنے کے لیے بعد میں کھانا کھلانے کے دوران الگ ہو سکتے ہیں۔ وائرس کی مثالیں جو نیماتوڈس کے ذریعے منتقل ہو سکتے ہیں ان میں تمباکو رنگ اسپاٹ وائرس اور تمباکو ریٹل وائرس شامل ہیں۔ پلازموڈیوفورائڈز وائرس کی متعدد نسلیں مٹی سے پیدا ہونے والے زواسپورک پروٹوزوا کے ذریعے مسلسل اور غیر مستقل طور پر منتقل ہوتی ہیں۔ یہ پروٹوزوا خود فائٹوپاتھوجینک نہیں ہیں، بلکہ پرجیوی ہیں۔ وائرس کی منتقلی اس وقت ہوتی ہے جب وہ پودوں کی جڑوں سے منسلک ہو جاتے ہیں۔ مثالوں میں پولیمیکسا گرامینس شامل ہیں، جو اناج کی فصلوں میں پودوں کی وائرل بیماریوں کو منتقل کرنے کے لیے دکھایا گیا ہے اور پولیمیکسا بیٹا جو چقندر کی نیکروٹک زرد رگ وائرس کو منتقل کرتا ہے۔ پلازموڈیوفورائڈز پودے کی جڑ میں بھی زخم پیدا کرتے ہیں جس کے ذریعے دوسرے وائرس داخل ہو سکتے ہیں۔ بیج اور جرگ سے پیدا ہونے والے وائرس پودوں کے وائرس کی نسل در نسل منتقلی تقریبا 20 فیصد پودوں کے وائرس میں ہوتی ہے۔ جب وائرس بیجوں کے ذریعے منتقل ہوتے ہیں، تو بیج پیداواری خلیوں میں متاثر ہوتا ہے اور وائرس جراثیم کے خلیوں میں اور بعض اوقات، لیکن کم کثرت سے، بیج کے کوٹ میں برقرار رہتا ہے۔ جب خراب موسم جیسے حالات کی وجہ سے پودوں کی نشوونما اور نشوونما میں تاخیر ہوتی ہے تو بیجوں میں وائرس کے انفیکشن کی مقدار میں اضافہ ہوتا ہے۔ ایسا لگتا ہے کہ پودے پر بیج کے مقام اور اس کے متاثر ہونے کے امکانات کے درمیان کوئی تعلق نہیں ہے۔ [5] بیجوں کے ذریعے پودوں کے وائرس کی منتقلی میں شامل میکانزم کے بارے میں بہت کم معلومات ہیں، حالانکہ یہ معلوم ہے کہ یہ ماحولیاتی طور پر متاثر ہے اور یہ کہ بیج کی منتقلی جنین کے براہ راست حملے کی وجہ سے ہوتی ہے جو کہ بیضہ دانی کے ذریعے یا متاثرہ گیمیٹس کی ثالثی میں جنین پر حملے کے ساتھ بالواسطہ راستے سے ہوتی ہے۔ [5] [6] یہ عمل میزبان پودے کے لحاظ سے بیک وقت یا الگ سے ہو سکتے ہیں۔ یہ معلوم نہیں ہے کہ یہ وائرس کس طرح بیضہ دانی میں والدین اور اولاد کی نسلوں کے درمیان جنین اور حدود پر براہ راست حملہ کرنے اور اسے عبور کرنے کے قابل ہے۔ [6] پودوں کی بہت سی انواع بیجوں کے ذریعے متاثر ہو سکتی ہیں جن میں لیگیومینوسی، سولانیسی، کمپوزیٹی، روزیسی، ککربیٹیسی، گرامینی خاندان شامل ہیں لیکن ان تک محدود نہیں ہیں۔ [5] بین عام موزیک وائرس بیجوں کے ذریعے منتقل ہوتا ہے۔ فرانس کے شہر مارسیل میں بحیرہ روم کی یونیورسٹی کے محققین کو پودوں سے انسانوں میں براہ راست منتقلی کے ایسے کمزور شواہد ملے ہیں جو تجویز کرتے ہیں کہ مرچوں میں عام وائرس، مرچ ہلکا موٹل وائرس (پی ایم ایم او وی) انسانوں کو متاثر کرنے کے لیے آگے بڑھا ہو گا۔ یہ ایک بہت ہی نایاب اور انتہائی غیر متوقع واقعہ ہے کیونکہ، کسی خلیے میں داخل ہونے اور اس کی نقل تیار کرنے کے لیے، ایک وائرس کو "اس کی سطح پر موجود رسیپٹر سے جڑا ہونا چاہیے، اور پودوں کا وائرس انسانی خلیے پر موجود رسیپٹر کو پہچاننے کا انتہائی امکان نہیں رکھتا ہے۔ ایک امکان یہ ہے کہ یہ وائرس انسانی خلیوں کو براہ راست متاثر نہیں کرتا ہے۔ اس کے بجائے، ننگی وائرل آر این اے آر این اے مداخلت سے ملتے جلتے طریقہ کار کے ذریعے خلیوں کے کام کو تبدیل کر سکتا ہے، جس میں کچھ آر این اے کے سلسلے کی موجودگی جین کو آن اور آف کر سکتی ہے، "نیو اورلینز، لوزیانا میں ٹولن یونیورسٹی کے وائرولوجسٹ رابرٹ گیری کے مطابق۔ میزبانوں پر اثرات میزبانوں میں پودوں کے وائرس کی انٹرا سیلولر زندگی کا اب بھی خاص طور پر انفیکشن کے ابتدائی مراحل کا مطالعہ کیا جاتا ہے۔ بہت سے جھلی ڈھانچے جو وائرس پودوں کے خلیوں کو پیدا کرنے پر آمادہ کرتے ہیں وہ متحرک ہوتے ہیں، جو اکثر پیدا کرنے والے خلیے کے اندر اور ان کے پڑوسیوں میں نئے وائرس کو منتقل کرنے کے لیے استعمال ہوتے ہیں۔ وائرس پودوں کی اپنی انٹرا سیلولر جھلی میں بھی مختلف تبدیلیاں لاتے ہیں۔ پیریرا اور دیگر کا کام۔ 2012 میں مچھر وائرس کے انفیکشن اور پودوں کے وائرس کے خمیر کے ماڈلز کا مطالعہ کرنے والے مختلف دیگر افراد میں یہ پایا گیا کہ یہ لپڈ کے ہومیوسٹاسس میں ہونے والی تبدیلیوں کی وجہ سے ہے جو ان کی انٹرا سیلولر جھلیوں کو تشکیل دیتے ہیں، بشمول ترکیب میں اضافہ۔ یہ تقابلی لپڈ تبدیلیاں پودوں کے وائرس کے کم سمجھے جانے والے علاقے کے لیے ہماری توقعات اور تحقیقی ہدایات کو مطلع کرتی ہیں۔ پودوں کے وائرل پروٹین کا ترجمہ پودوں کے 75 فیصد وائرس میں جینوم ہوتے ہیں جو سنگل اسٹرینڈڈ آر این اے (ایس ایس آر این اے) پر مشتمل ہوتے ہیں۔ پودوں کے 65 فیصد وائرسوں میں + ایس ایس آر این اے ہوتا ہے، جس کا مطلب ہے کہ وہ میسنجر آر این اے کی طرح ایک ہی معنوں میں ہوتے ہیں لیکن 10 فیصد میں-ایس ایس آر این اے ہوتا ہے، جس کا مطلب ہے کہ ان کا ترجمہ کرنے سے پہلے انہیں + ایس ایس آر این اے میں تبدیل کیا جانا چاہیے۔ 5 فیصد ڈبل اسٹرینڈڈ آر این اے ہیں اور اس لیے فوری طور پر + ایس ایس آر این اے وائرس کے طور پر ترجمہ کیا جا سکتا ہے۔ 3 فیصد کو آر این اے اور ڈی این اے کے درمیان تبدیل کرنے کے لیے ریورس ٹرانسکرپٹیس انزائم کی ضرورت ہوتی ہے۔ پودوں کے 17 فیصد وائرس ایس ایس ڈی این اے ہیں اور بہت کم ڈی ایس ڈی این اے ہیں، اس کے برعکس جانوروں کے وائرس کا ایک چوتھائی حصہ ڈی ایس ڈی این اے ہے اور تین چوتھائی بیکٹیریوفیج ڈی ایس ڈی این اے ہیں۔ وائرس اپنے جینوم کے ذریعے انکوڈ کردہ 4-10 پروٹین تیار کرنے کے لیے پودوں کے رائبوسومز کا استعمال کرتے ہیں۔ تاہم، چونکہ بہت سے پروٹین ایک ہی اسٹرینڈ پر انکوڈ ہوتے ہیں (یعنی، وہ پولی سسٹونک ہوتے ہیں) اس کا مطلب یہ ہوگا کہ رائبوسوم یا تو صرف ایک پروٹین تیار کرے گا، کیونکہ یہ پہلے اسٹاپ کوڈن پر ترجمہ ختم کر دے گا، یا یہ کہ ایک پولی پروٹین تیار کیا جائے گا۔ پودوں کے وائرسوں کو پودوں کے خلیوں کے ذریعے وائرل پروٹین کی پیداوار کی اجازت دینے کے لیے خصوصی تکنیکیں تیار کرنی پڑتی ہیں۔ ترجمہ ہونے کے لیے، یوکرائیوٹک ایم آر این اے کو 5 'کیپ ڈھانچے کی ضرورت ہوتی ہے۔ اس کا مطلب یہ ہے کہ وائرس میں بھی ایک ہونا ضروری ہے۔ یہ عام طور پر 7MeGpppN پر مشتمل ہوتا ہے جہاں N عام طور پر اڈینائن یا گوانائن ہوتا ہے۔ وائرس ایک پروٹین کو انکوڈ کرتے ہیں، عام طور پر ایک نقل، میتھائل ٹرانسفرس سرگرمی کے ساتھ اس کی اجازت دیتے ہیں۔ کچھ وائرس ٹوپی چھیننے والے ہوتے ہیں۔ اس عمل کے دوران، وائرل ٹرانسکرپٹیس کمپلیکس کے ذریعے 7 ایم جی کیپڈ میزبان ایم آر این اے کو بھرتی کیا جاتا ہے اور اس کے بعد وائرل انکوڈڈ اینڈو نیوکلیز کے ذریعے الگ کیا جاتا ہے۔ نتیجے میں کیپڈ لیڈر آر این اے وائرل جینوم پر پرائم ٹرانسکرپشن کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ تاہم کچھ پودوں کے وائرس کیپ کا استعمال نہیں کرتے، پھر بھی وائرل ایم آر این اے کے 5 'اور 3' غیر ترجمہ شدہ علاقوں میں موجود کیپ-آزاد ترجمہ بڑھانے والوں کی وجہ سے مؤثر طریقے سے ترجمہ کرتے ہیں۔ کچھ وائرس پڑھیں (جیسے۔ تمباکو موزیک وائرس (ٹی ایم وی) میں آر این اے کے سلسلے ہوتے ہیں جن میں "لیک" اسٹاپ کوڈن ہوتا ہے۔ ٹی ایم وی میں 95 ٪ وقت میزبان رائبوسوم اس کوڈن پر پولی پیپٹائڈ کی ترکیب کو ختم کر دے گا لیکن باقی وقت یہ اس سے آگے جاری رہتا ہے۔ اس کا مطلب یہ ہے کہ پیدا ہونے والے 5 فیصد پروٹین عام طور پر پیدا ہونے والے دیگر پروٹینوں سے بڑے اور مختلف ہوتے ہیں، جو کہ ٹرانسلیشنل ریگولیشن کی ایک شکل ہے۔ ٹی ایم وی میں، پولی پیپٹائڈ کی یہ اضافی ترتیب ایک آر این اے پولیمریز ہے جو اس کے جینوم کی نقل بناتی ہے۔ ذیلی جینومک آر این اے کی پیداوار کچھ وائرس اپنے جینوم کے اندر تمام پروٹین کے ترجمہ کو یقینی بنانے کے لیے ذیلی جینومک آر این اے کی پیداوار کا استعمال کرتے ہیں۔ اس عمل میں جینوم پر انکوڈ کیا گیا پہلا پروٹین، اور ترجمہ کیا جانے والا پہلا پروٹین، ایک نقل ہے۔ یہ پروٹین باقی جینوم پر کام کرے گا جو منفی اسٹرینڈ ذیلی جینومک آر این اے تیار کرتا ہے پھر ان پر مثبت اسٹرینڈ ذیلی جینومک آر این اے بنانے کے لیے کام کرے گا جو بنیادی طور پر ترجمہ کے لیے تیار ایم آر این اے ہیں۔ بکھرے ہوئے جینوم کچھ وائرل خاندان، جیسے کہ برومووائریڈی اس کے بجائے ملٹی پارٹیٹ جینوم کا انتخاب کرتے ہیں، جینوم متعدد وائرل ذرات کے درمیان تقسیم ہوتے ہیں۔ انفیکشن ہونے کے لیے، پودے کو جینوم کے تمام ذرات سے متاثر ہونا چاہیے۔ مثال کے طور پر بروم موزیک وائرس میں 3 وائرل ذرات کے درمیان جینوم تقسیم ہوتا ہے، اور انفیکشن ہونے کے لیے مختلف آر این اے والے تمام 3 ذرات درکار ہوتے ہیں۔ پولی پروٹین پروسیسنگ کو پودوں کے 45 ٪ وائرس، جیسے پوٹیویریڈی اور ٹائموویریڈی نے اپنایا ہے۔ رائبوسوم وائرل جینوم سے ایک واحد پروٹین کا ترجمہ کرتا ہے۔ پولی پروٹین کے اندر ایک انزائم (یا انزائم) ہوتا ہے جس میں پروٹینز فنکشن ہوتا ہے جو پولی پروٹین کو مختلف واحد پروٹینوں میں الگ کرنے یا صرف پروٹیز کو الگ کرنے کے قابل ہوتا ہے، جو اس کے بعد بالغ پروٹین تیار کرنے والے دوسرے پولی پیپٹائڈز کو الگ کر سکتا ہے۔ جینوم پیکیجنگ انفیکشن کے عمل میں ملوث ہونے کے علاوہ، وائرل نقل آر این اے وائرس کے جینیاتی مواد کی پیکیجنگ کا براہ راست ضروری حصہ ہے۔ مختلف دوسرے وائرسوں میں پہلے سے ہی نقل کی شمولیت کی تصدیق ہونے کی وجہ سے اس کی توقع کی جا رہی تھی۔ پودوں کے وائرس کی ایپلی کیشنز پودوں کے وائرس کو وائرل ویکٹروں کو انجینئر کرنے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے، وہ اوزار جو عام طور پر سالماتی ماہر حیاتیات پودوں کے خلیوں میں جینیاتی مواد پہنچانے کے لیے استعمال کرتے ہیں۔ وہ بائیو میٹریل اور نینو ٹیکنالوجی آلات کے ذرائع بھی ہیں۔ پودوں کے وائرس اور ان کے اجزاء کا علم جدید پلانٹ بائیوٹیکنالوجی کی ترقی میں اہم کردار ادا کرتا ہے۔ آرائشی پودوں کی خوبصورتی کو بڑھانے کے لیے پودوں کے وائرس کے استعمال کو پودوں کے وائرس کا پہلا ریکارڈ شدہ استعمال سمجھا جا سکتا ہے۔ ٹولپ توڑنے والا وائرس ٹولپ پیریانتھ کے رنگ پر اپنے ڈرامائی اثرات کے لیے مشہور ہے، یہ اثر 17 ویں صدی کے ڈچ "ٹولپ انماد" کے دوران انتہائی مطلوب تھا۔ تمباکو موزیک وائرس (ٹی ایم وی) اور گوبھی موزیک وائرس (سی اے ایم وی) اکثر پودوں کی سالماتی حیاتیات میں استعمال ہوتے ہیں۔ سی اے ایم وی 35 ایس پروموٹر خاص دلچسپی کا حامل ہے، جو ایک بہت مضبوط پروموٹر ہے جو پودوں کی تبدیلیوں میں اکثر استعمال ہوتا ہے۔ تمباکو موزیک وائرس پر مبنی وائرل ویکٹرز میں میگنیکون® اور ٹی آر بی او پلانٹ ایکسپریشن ٹیکنالوجیز شامل ہیں۔ پودوں کے وائرس کی نمائندہ ایپلی کیشنز ذیل میں درج ہیں۔ مزید پڑھنے کے لیے حوالہ جات زیٹلن، ملٹن (1998)، ڈسکوریز ان پلانٹ بائیولوجی، نیویارک 14853، یو ایس اے۔ پی پی۔ 105-110۔ ایس ڈی کنگ اور ایس ایف یانگ (ایڈز)۔ ڈکنسن، ایم۔ (2003)، مالیکیولر پلانٹ پیتھولوجی۔ بائیوس سائنٹیفک پبلشرز۔ https://web.archive.org/web/20080529082637/http:// stinet. dtic. mil/oai/oai? & verb = प्राप्ति ریکارڈ & میٹا ڈیٹا پریفیکس = ایچ ٹی ایم ایل & شناخت کنندہ = پلانٹ http://www.plantcell.org/cgi/reprint/6/6/777 بیرونی لنکس پلانٹ وائرس آن لائن، پلانٹ وائرس کی مکمل فہرست ڈی پی وی ویب، آن لائن پلانٹ وائرس ڈیٹا بیس پلانٹ وائرس علامات ڈینش انسٹی ٹیوٹ آف ایگریکلچرل سائنسز وائرولوجی مالیکیولر بائیولوجی بائیوٹیکنالوجی 1890s سائنس 1890s میں نیدرلینڈز میں نیدرلینڈز بائیولوجی میں