Candidatus
پروکیریوٹ کے ناموں میں، کینڈیڈیٹس (لاطینی میں رومن عہدے کے امیدوار کے لیے) پروکیریوٹک فائیلا کے نام کے لیے استعمال ہوتا ہے جو اچھی طرح سے نمایاں ہیں لیکن ابھی تک غیر مہذب ہیں۔ عصری ترتیب کے نقطہ نظر، جیسے کہ 16 ایس رائبوسومل آر این اے ترتیب یا میٹاجنومکس، تجزیہ شدہ حیاتیات کے بارے میں بہت زیادہ معلومات فراہم کرتے ہیں اور اس طرح انفرادی انواع کی شناخت اور خصوصیت کی اجازت دیتے ہیں۔ تاہم، پروکیریوٹک پرجاتیوں کی اکثریت ناقابل کاشت رہتی ہے اور اس وجہ سے ان وٹرو اسٹڈی میں مزید خصوصیت کے لیے ناقابل رسائی ہے۔ امیدوار ٹیکسوں کی ایک بڑی تعداد کی حالیہ دریافتوں نے امیدوار فائیلا تابکاری کو بیکٹیریل تنوع میں نئی بصیرت کے ذریعے زندگی کے درخت کو وسعت دی ہے۔ نام کی تاریخ پروکیریوٹس کے ناموں کے ابتدائی بین الاقوامی ضابطے کے ساتھ ساتھ ابتدائی ترمیمات میں پروکیریوٹس کی شناخت کے امکان کا حساب نہیں تھا جو ابھی تک قابل کاشت نہیں تھے۔ لہذا، کوڈ پر نظر ثانی شروع کرنے کے لیے 1994 میں انٹرنیشنل کمیٹی آن سسٹمیٹکس آف پروکیریوٹس (آئی سی ایس پی، سابقہ انٹرنیشنل کمیٹی آن سسٹمیٹک بیکٹیریاولوجی) کی ایک کانفرنس کے تناظر میں کینڈیڈیٹس کی اصطلاح تجویز کی گئی تھی۔ سیکوینسنگ ٹیکنالوجیز کی جاری پیشرفت سے وابستہ کینڈیڈیٹس ٹیکسا کی بڑھتی ہوئی تعداد کی وجہ سے، آئی سی ایس پی نے 1996 میں کینڈیڈیٹس ٹیکسا (تازہ ترین ورژن میں ضمیمہ 11) کے لیے ایک ضمیمہ شامل کرکے پروکیریوٹس کے بین الاقوامی ضابطہ نام کو اپنایا۔ تاہم، کینڈیڈیٹس ٹیکسا کا نام ابھی تک پروکیریوٹک کوڈ کے عمومی قواعد کے تحت نہیں آتا ہے جس کی وجہ سے کینڈیڈیٹس ٹیکسا کو ترجیح دینے کے لیے موجودہ کوڈ کو تبدیل کرنے کے لیے جاری بات چیت اور تجاویز سامنے آتی ہیں۔ فی الحال، عارضی حیثیت "کینڈیڈیٹس" کا استعمال کیا جا سکتا ہے اگر درج ذیل معلومات فراہم کی جائیں: کینڈیڈیٹس کی حیثیت میں کسی جاندار کا انواع کا نام لفظ کینڈیڈیٹس پر مشتمل ہوتا ہے، اس کے بعد یا تو ایک مخصوص لقب کے ساتھ جینس کا نام، یا صرف ایک جینس کا نام، یا صرف ایک مخصوص لقب ہوتا ہے۔ مثالوں میں کینڈیڈیٹس لبروبیکٹر ایشیاٹیکم ؛ کینڈیڈیٹس میگنیٹوبیکٹیریم ؛ کینڈیڈیٹس انٹرا سیلولرس شامل ہیں۔ تمام امیدوار ٹیکسوں (ایک امیدوار فہرست) کی فہرست آئی جے ایس ای ایم کے ادارتی بورڈ کے تعاون سے آئی سی ایس پی کے عدالتی کمیشن کے ذریعے رکھی جاتی ہے اور مناسب وقفوں میں اپ ڈیٹ کی جاتی ہے۔ ایک بار جب کینڈیڈیٹس ٹیکسا کو کامیابی کے ساتھ کاشت کیا جاتا ہے، تو اس نام کو اس فہرست سے ہٹانا پڑتا ہے اور پروکیریوٹس کے بین الاقوامی ضابطہ نام کے مطابق ایک نیا نام تجویز کرنا پڑتا ہے۔ اگرچہ 1994 کی تجویز اور بعد کے کوڈ میں امیدواروں کی فہرست کو برقرار رکھنے کا مطالبہ کیا گیا تھا، لیکن ناموں کو درست کرنے پر کام 2017 تک شروع نہیں ہوا تھا، جب "نہیں" تھا۔ 0 "ٹرائل شائع کیا گیا ہے۔ مصنف نے پایا کہ جمع کیے گئے 400 میں سے 120 نام ضابطے کی خلاف ورزی کریں گے اگر وہ باضابطہ طور پر تجویز کیے جائیں۔ عام وجوہات لاطینی غلطیاں، ڈپلیکیٹ نام، اور غیر لاطینی نام ہیں۔ نتیجے کے طور پر، امیدوار کی فہرستیں اب ایسے ناموں کے لیے اصلاحات بھی پیش کرتی ہیں۔ درست کیے گئے ناموں کو درست کیا جاتا ہے۔ (درست کرنے کے لیے) اتھارٹی کے میدان میں، کچھ ذرائع مزید آگے جا کر اصلاح کا حوالہ دیتے ہیں (مثال کے طور پر۔ "سی۔" کیرلسولسیا "کوریگ۔ موران اور دیگر۔ 2005 میں Ogen et al. 2020)۔ نمبر سے شروع ہونے والی ہر شائع شدہ فہرست۔ 1، ایک مقررہ مدت میں تجویز کردہ تمام معروف امیدوار ناموں کے علاوہ پچھلے ادوار کے لیے کسی بھی ضمیمہ کا احاطہ کرتا ہے۔ تازہ ترین کینڈیڈیٹس لسٹ نمبر ہے۔ 4، جو نومبر 2022 میں شائع ہوا، 2021 میں تجویز کردہ ناموں کا احاطہ کرتا ہے۔ غیر کاشتکاری ماحولیاتی عوامل اس کی کئی وجوہات ہیں کہ بہت سی پروکیریوٹک انواع لیب میں کیوں نہیں اگتی ہیں جن میں سے بہت سی ناقص طور پر سمجھی جاتی ہیں۔ ان وجوہات میں سے ایک وہ ماحول ہے جس سے انواع کو بازیافت کیا جاتا ہے جس سے لیبارٹری کے حالات میں نقل کرنا مشکل ہو سکتا ہے۔ بہت سے پروکیریوٹس میں نشوونما کی انتہائی مخصوص ضروریات ہوتی ہیں جن میں ایک مخصوص غذائیت کی ساخت، مخصوص پی ایچ حالات، درجہ حرارت، ماحولیاتی دباؤ یا آکسیجن کی سطح کی ضرورت شامل ہے۔ زیادہ تر تجارتی طور پر دستیاب گروتھ میڈیا اور انکیوبیشن پروٹوکول نے ان ضروریات کو ناقص طور پر پورا کیا جس سے ماحولیاتی نمونوں سے دلچسپی کے حامل بیکٹیریا کو کامیابی کے ساتھ الگ کرنے کے لیے رہائش گاہ کی ایک جامع تشخیص ضروری ہو گئی۔ پرجاتیوں کا تعامل زیادہ تر پروکیریوٹک انواع اکیلے نہیں بلکہ زندگی کی تمام سلطنتوں سے تعلق رکھنے والی دیگر انواع کے ساتھ پیچیدہ برادریوں میں رہتی ہیں۔ نتیجے کے طور پر، بہت سی انواع اپنے سیل کی نشوونما کے لیے اپنے پڑوسی پرجاتیوں کے میٹابولائٹس یا سگنلنگ مرکبات پر انحصار کرتی ہیں۔ مطلوبہ مادوں کی شناخت مشکل ہو سکتی ہے لیکن ایک بار شناخت ہونے کے بعد مشترکہ کاشت یا مخصوص مرکب کا اضافہ ممکنہ طور پر دلچسپی کی انواع کو کاشت کرنے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ جینوم میں کمی انواع کے تعامل کی بہت سی مثالیں سمبائیوٹک نوعیت کی ہوتی ہیں جن کی تعریف دو یا دو سے زیادہ انواع کے درمیان گہرے، طویل مدتی تعلقات کے طور پر کی جاتی ہے جو یا تو باہمی، غیر جانبدار یا نقصان دہ ہو سکتے ہیں۔ علامت کے مقام پر منحصر ہے، علامت یا تو آکٹوسیمبیونٹس یا اینڈوسیمبیونٹس ہو سکتے ہیں۔ اینڈو سمبائیوٹک بیکٹیریا میں جین کو حذف کرنے کے ذریعے ڈراسٹک جینوم میں کمی کا مشاہدہ کیا گیا ہے جس کے بارے میں خیال کیا جاتا ہے کہ اس حقیقت کی وجہ سے بہت سے جین پناہ گاہ میزبان ماحول میں غیر ضروری ہو جاتے ہیں۔ یہ اکثر ڈی این اے کی مرمت اور نقل کے ضابطے کے لیے جینوں کو متاثر کرتا ہے جس کی وجہ سے ان حیاتیات کو ان کے میزبان سے باہر کاشت کرنا مشکل ہو جاتا ہے۔ مزید دیکھیں کینڈیڈیٹ ڈویژن گلوسری آف سائنٹفک نامی بین الاقوامی کوڈ آف نامی بیکٹیریا کی فہرست کینڈیڈیٹس کی حیثیت کے ساتھ ٹیکسا کی فہرست مزید پڑھنے بیکٹیریل نام کینڈیڈیٹس ٹیکسا