Hydrophilicity plot
ہائیڈروفیلسیٹی پلاٹ پروٹین کے امینو ایسڈ کی ہائیڈروفوبسیٹی یا ہائیڈروفیلسیٹی کی ڈگری کا مقداری تجزیہ ہے۔ یہ پروٹین کی ممکنہ ساخت یا ڈومینز کی خصوصیت یا شناخت کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ پلاٹ میں اس کے ایکس محور پر پروٹین کی امینو ایسڈ کی ترتیب ہوتی ہے، اور اس کے وائی محور پر ہائیڈروفوبیسیٹی اور ہائیڈروفیلسیٹی کی ڈگری ہوتی ہے۔ قطبی سالوینٹس جیسے پانی کے مخصوص امینو ایسڈ کے ساتھ تعامل کی ڈگری کی پیمائش کرنے کے کئی طریقے ہیں۔ مثال کے طور پر، کائٹ-ڈولٹل پیمانہ ہائیڈروفوبک امینو ایسڈ کی نشاندہی کرتا ہے، جبکہ ہوپ-ووڈس پیمانہ ہائیڈروفیلک باقیات کی پیمائش کرتا ہے۔ پلاٹ کی شکل کا تجزیہ کرنے سے پروٹین کی جزوی ساخت کے بارے میں معلومات ملتی ہیں۔ مثال کے طور پر، اگر تقریبا 20 امینو ایسڈ کا ایک حصہ ہائیڈروفوبیسیٹی کے لیے مثبت ظاہر ہوتا ہے، تو یہ امینو ایسڈ لپڈ بائی لیئر میں پھیلے ہوئے الفا ہیلکس کا حصہ ہو سکتے ہیں، جو ہائیڈروفوبک فیٹی ایسڈ پر مشتمل ہوتا ہے۔ اس کے برعکس، ہائیڈروفیلسیٹی والے امینو ایسڈ اس بات کی نشاندہی کرتے ہیں کہ یہ باقیات سالوینٹ، یا پانی کے ساتھ رابطے میں ہیں، اور اس وجہ سے ان کے پروٹین کی بیرونی سطح پر رہنے کا امکان ہے۔ مندرجہ بالا جدول میں موجود ڈیٹا ایک کمپیوٹر پروگرام کا استعمال کرتے ہوئے تیار کیا گیا تھا جو پروٹین کے اندر حصوں کی اوسط ہائیڈروفوبیسیٹی کا اندازہ کرتا ہے اور ادب سے جمع کردہ ڈیٹا کا استعمال کرتا ہے۔ حوالہ جات بیرونی روابط ExPASy پروٹسکل پروٹین ہائیڈروفوبیسیٹی پلاٹس کولوراڈو اسٹیٹ ہائیڈروپیتھیسیٹی پلاٹس سے دی ورلڈ آف بائیو انفارمیٹکس پلاٹس (گرافکس) پروٹین ڈھانچہ