Ranpirnase
رنپرنیز ایک ربن نیوکلیز انزائم ہے جو شمالی چیتے کے میڑک (رانا پائپینز) کے آکائٹس میں پایا جاتا ہے۔ رنپرنیز پینکریٹک ربونوکلیز (آر نیس اے) پروٹین سپر فیملی کا ایک رکن ہے اور یوراسل اور گوانائن نیوکلیوٹائڈز کے لیے ترتیب کی ترجیح کے ساتھ آر این اے سبسٹریٹس کو خراب کرتا ہے۔ ایمفینیز کے ساتھ ساتھ، ایک اور چیتے کے مینڈک ربونوکلیز، رنپرنیز کا مطالعہ ایک ممکنہ کینسر اور اینٹی وائرل علاج کے طور پر کیا گیا ہے جس کی وجہ تبدیل شدہ خلیوں اور اینٹی وائرل سرگرمی کے خلاف جانچ کی جانے والی سائٹوٹوکسائٹی کا غیر معمولی طریقہ کار ہے۔ رنپرنیز کو اصل میں بائیوٹیکنالوجی کمپنی (سابقہ الفاسل کارپوریشن)، تمیر بائیو کے سائنس دانوں نے دریافت کیا تھا، جہاں اس کا تجربہ پری کلینیکل اسیسز اور کلینکل ٹرائلز میں پینن یا اونکونیز، اور ٹی ایم آر 004 کے نام سے کیا گیا تھا۔ رنپرنیز کے عمل کے طریقہ کار کو آر این اے مداخلت کے راستے سے منسوب کیا گیا ہے، ممکنہ طور پر ایس آئی آر این اے مالیکیولز کو صاف کرنے کے ذریعے ؛ ٹرانسفر آر این اے کے پھٹنے کے لیے ؛ اور این ایف-κB راستے میں مداخلت کے لیے۔ فی الحال (مارچ 2020 تک) رنپیرناز ایک ممکنہ اینٹی وائرل کے طور پر کلینیکل ٹرائلز میں ہے۔ ای سی نمبر ای سی سسٹم، یا انزائم کی درجہ بندی کا نظام انزائم کے ناموں کو معیاری بنانے کے ساتھ ساتھ انزائم کے رد عمل کی قسم اور فنکشن کی ایسوسی ایشن کی اجازت دینے کے لیے بنایا گیا تھا۔ رنپرنیز کے لیے ای سی نمبر ای سی 4.6.1.18 ہے، لیکن پہلے ای سی 3.1.27.5 تھا۔ اس کا مطلب یہ ہے کہ رنپرنیز کلاس 4، سب کلاس 6، سب سب کلاس 1، اور سیریل #18 میں ہے۔ کلاس 4 کو لائسیس سمجھا جاتا ہے، جبکہ ذیلی کلاس 4.6.1 انزائم کو مزید فاسفورس آکسیجن لائسیس کے طور پر درجہ بندی کرتا ہے۔ بالآخر، رنپرنیز کو پینکریٹک ربنیوکلیز کے طور پر درجہ بند کیا جا سکتا ہے۔ رد عمل کا راستہ رنپرنیز کا رد عمل کا راستہ ہدف شدہ خلیے کی سطح پر قائم انزائم کے ذریعے شروع کیا جاتا ہے۔ رنپرنیز پھر داخل ہوتا ہے اور توانائی پر منحصر اینڈوسیٹوسس کے ذریعے خلیے میں داخل ہوتا ہے۔ خلیے میں داخل ہونے کے بعد، رنپرنیز کو گولگی اپریٹس کے ذریعے سائٹوسول کی طرف بھیج دیا جاتا ہے، جہاں انزائم پھر منتخب طور پر ٹی آر این اے کو توڑ سکتا ہے، جبکہ آر آر این اے اور ایم آر این اے کو نظر انداز کر سکتا ہے۔ رنپرنیز آر این اے میں پائے جانے والے پی-او 5 بانڈ کے پھٹنے کو آسان بنا کر ٹی آر این اے کو خراب کرتا ہے، خاص طور پر پیریمیڈائن نیوکلیوسائڈز کے 3 'سائیڈ پر۔ آر این اے کے انحطاط کے اس عمل کے نتیجے میں پروٹین کی ترکیب میں رکاوٹ پیدا ہوتی ہے۔ پروٹین کی ترکیب کی یہ روک تھام رنپرنیز کے سائٹوسٹیٹک اور سائٹوٹوکسک اثرات میں معاون ہے۔ ساخت رنپرنیز رانا پائپینز کے اووسائٹس میں پایا جاتا ہے، جسے شمالی چیتے کا مینڈک بھی کہا جاتا ہے۔ ان اووسائٹس میں پینکریٹک ربونوکلیز اے کی دو ایک جیسی تغیرات ہیں، جو دونوں سائٹوسٹیٹک اور سائٹوٹوکسک خصوصیات کی نمائش کرتے ہیں۔ رنپرنیز میں 104 امینو ایسڈ کے باقیات ہوتے ہیں، جو اسے آر نیس اے سپر فیملی کا سب سے چھوٹا شناخت شدہ رکن بناتے ہیں۔ مجموعی طور پر، رنپرنیز کو چھوٹا سنگل چین پروٹین سمجھا جاتا ہے جس کا سالماتی وزن تقریبا 12,000 ڈی اے ہوتا ہے۔ ایک بار رنپرنیز کو اووسائٹس سے الگ کرنے کے بعد، یہ دریافت کیا گیا کہ رنپرنیز امینو ایسڈ پوزیشن 25 پر پولیمرفک ہے۔ خاص طور پر، اس پوزیشن پر تاریخی طور پر تھری امینو ایسڈ کا قبضہ رہا ہے، لیکن سیر امینو ایسڈ کی بھی نشاندہی کی گئی ہے۔ تاہم، یہ تبدیلی انزائم کے کام کو تبدیل کرتی دکھائی نہیں دیتی۔ مزید برآں، رنپرنیز میں 4 ڈائیسلفائیڈ بانڈز ہوتے ہیں جو انزائم کو اعلی حرارت کا استحکام دیتے ہیں۔ فنکشن ایک بار خلیے میں داخل ہونے کے بعد، رنپرنیز سائٹوسٹیٹک اور سائٹوٹوکسک دونوں کردار ادا کرتا ہے۔ سائٹوسٹیٹک طور پر، رنپرنیز جی 1 میں سیل سائیکل کو روکتا ہے، لیکن بیک وقت سائٹوٹاکسن کے طور پر کام کرتا ہے۔ اس بات کے شواہد موجود ہیں کہ ٹی آر این اے کو ہونے والا نقصان ناقابل واپسی ہے اور یہ پرو-اپوپٹوٹک سگنل کے طور پر کام کر سکتا ہے، تاہم ایسا لگتا ہے کہ یہ اضافی انزائموں پر منحصر ہے جو پروگرام شدہ سیل کی موت میں مدد کرتے ہیں۔ رنپرنیز عام خلیوں کے مقابلے ٹیومر کے خلیوں کے خلاف سب سے زیادہ فعال اور موثر معلوم ہوتا ہے۔ ان ٹیومر خلیوں کے اندر، رنپرنیز ایک سگنل ٹرانسڈکشن راستے کو چالو کرتا ہے جسے اسٹریس ایکٹیویٹڈ پروٹین کینیز یا ایس اے پی کے کہا جاتا ہے۔ ایس اے پی کے 1 میں جے این کے-1 اور-2 ایلیلز ہوتے ہیں جو رنپرنیز سے نشانہ بنائے جاتے ہیں اور پریشان ہوتے ہیں۔ یہ جے این کے رنپرنیز سے پیدا ہونے والے سائٹوٹوکسک اثرات کے منتظمین کے طور پر اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ بالآخر، متعدد پرو-اپوپٹوٹک راستوں کے شامل ہونے کی وجہ سے رنپرنیز کینسر کے خلیوں میں زیادہ اپوپٹوٹک معلوم ہوتا ہے۔ معروف کرسٹل ڈھانچے رنپرنیز کا کرسٹل ڈھانچہ ایک حصے پر مشتمل ہوتا ہے جو ہیلکس کے آغاز کو گھیرے ہوئے ہوتا ہے۔ یہ وہ جگہ ہے جہاں مرکزی سلسلہ ایک تناؤ کی تشکیل کو فرض کرتا ہے جس کی وجہ سے اس انزائم کے پیپٹائڈ بانڈز کے اندر طیاروں سے نمایاں انحراف ہوتا ہے۔ خاص طور پر، Ser39، Arg40، اور Pro41 کے پیپٹائڈ بانڈز بالترتیب 160.0، 192.1، اور 193.5 ° کے ω ڈائیڈرل زاویوں کا تجربہ کرتے ہیں۔ Arg40 اور Glu42 کی سائیڈ چینز کی سمت واضح طور پر بیان کی گئی ہے، اور Arg40 کا گوانیڈینو گروپ خود کو سلفیٹ آئن کے ساتھ صف بندی کرتا ہے۔ معروف فعال سائٹس رنپرنیز کی فعال سائٹ ایک اتپریرک تثلیث پر مشتمل ہے جو عام طور پر آر نیس اے سپر فیملی میں پائی جاتی ہے۔ یہ اتپریرک تثلیث اس کے 10، لیس 31، اور اس کے 97 پر مشتمل ہے۔ عام اتپریرک تثلیث کے علاوہ، رنپرنیز میں دو اضافی فعال سائٹ کے باقیات ہوتے ہیں: Lys9 اور ایک N-ٹرمینل پائروگلوٹامیٹ کے باقیات۔ یہ اضافی فعال سائٹیں اینڈوپلاسمک ریٹیکولم کے اندر اس کے انکوڈڈ گلوٹامین کے شریک ترجمہاتی سائیکلائزیشن کے ذریعے بنائی جاتی ہیں۔ فنکشن سے جڑی ساخت رنپرنیز کی ساخت اس کے فنکشن پر اثر انداز ہوتی دکھائی دیتی ہے۔ خاص طور پر، مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ رنپرنیز سبسٹریٹ کی خاصیت کو ایڈجسٹ کرنے کے لیے کولمبک تعاملات کے ساتھ ساتھ ہائیڈروجن بانڈنگ سسٹم کا استعمال کرتا ہے۔ مزید برآں، یہ دیکھا گیا ہے کہ امینو ایسڈ کی تبدیلی میں جان بوجھ کر ہونے والی تبدیلیاں بھی سبسٹریٹ کی خاصیت میں ترمیم کر سکتی ہیں۔ مطالعات نے ان ساختی خصوصیات کی بھی تحقیقات کی ہیں جو رنپرنیز کی کم اتپریرک سرگرمی کی بنیاد رکھتی ہیں۔ اتپریرک سرگرمی میں یہ کمی سبسٹریٹ کے لیے کم وابستگی سے وابستہ ہے۔ ایسا لگتا ہے کہ اس کا ایک حل T5R متبادل سے گزر رہا ہے۔ ایک T5R متبادل کو آر این اے میں رنپرنیز اور فاسفوریل گروپ کے درمیان ایک کامیاب کولومبی تعامل قائم کرنے کے لیے تیار کیا جاتا ہے۔ اس کے نتیجے میں ربن نیوکلیولیٹک سرگرمی میں دوگنا اضافہ ہوا۔ ربنوکلیز تجرباتی دوائیں