RNA polymerase III
یوکیریوٹ خلیوں میں، آر این اے پولیمریز III (جسے پول III بھی کہا جاتا ہے) ایک پروٹین ہے جو ڈی این اے کو 5 ایس رائبوسومل آر این اے، ٹی آر این اے اور دیگر چھوٹے آر این اے کی ترکیب کے لیے نقل کرتا ہے۔ آر این اے پول III کے ذریعے نقل شدہ جین "ہاؤس کیپنگ" جین کے زمرے میں آتے ہیں جن کا اظہار تمام خلیوں کی اقسام اور زیادہ تر ماحولیاتی حالات میں ضروری ہے۔ لہذا، پول III نقل کا ضابطہ بنیادی طور پر خلیوں کی نشوونما اور خلیوں کے چکر کے ضابطے سے منسلک ہے، اور اس طرح آر این اے پولیمریز II کے مقابلے میں کم ریگولیٹری پروٹین کی ضرورت ہوتی ہے۔ تاہم تناؤ کے حالات میں، پروٹین ایم اے ایف 1 پول III کی سرگرمی کو روکتا ہے۔ ریپامائسن اپنے براہ راست ہدف TOR کے ذریعے ایک اور پول III انفیکٹر ہے۔ ٹرانسکرپشن کے عمل میں (کسی بھی پولیمرس کے ذریعے) تین اہم مراحل شامل ہوتے ہیں: ابتدا، جس میں جین کے پروموٹر ایلونگیشن پر آر این اے پولیمرس کمپلیکس کی تعمیر کی ضرورت ہوتی ہے، آر این اے ٹرانسکرپٹ کی ترکیب، آر این اے ٹرانسکرپشن کی تکمیل اور آر این اے پولیمرس کمپلیکس کو الگ کرنا۔ شروعات: پروموٹر پر پولیمرس کمپلیکس کی تعمیر۔ پول III غیر معمولی ہے (پول II کے مقابلے میں) جس میں جین کے اوپر کی طرف کسی کنٹرول سیکوینس کی ضرورت نہیں ہوتی ہے، اس کے بجائے عام طور پر اندرونی کنٹرول سیکوینس پر انحصار کرتے ہیں-جین کے نقل شدہ حصے کے اندر سیکوینس (حالانکہ اوپر کی طرف سیکوینس کبھی کبھار دیکھے جاتے ہیں، جیسے۔ یو 6 ایس این آر این اے جین میں ایک اپ اسٹریم ٹاٹا باکس ہوتا ہے جیسا کہ پول II پروموٹرز میں دیکھا گیا ہے)۔ پول III آغاز کی تین کلاسیں ہیں، جو 5 ایس آر آر این اے، ٹی آر آر این اے، اور یو 6 ایس این آر این اے آغاز سے مطابقت رکھتی ہیں۔ تمام صورتوں میں، یہ عمل ٹرانسکرپشن عوامل کے ساتھ شروع ہوتا ہے جو کنٹرول سیکوینس کو پابند کرتے ہیں، اور TFIIIB (پولیمرس III B کے لیے ٹرانسکرپشن فیکٹر) کے ساتھ ختم ہوتا ہے جسے کمپلیکس میں بھرتی کیا جاتا ہے اور پول III کو جمع کیا جاتا ہے۔ ٹی ایف آئی آئی بی تین ذیلی اکائیوں پر مشتمل ہے: ٹی اے ٹی اے بائنڈنگ پروٹین (ٹی بی پی)، ایک ٹی ایف آئی آئی بی سے متعلق عنصر (بی آر ایف 1، یا ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں پول III سے نقل شدہ جینوں کے ذیلی سیٹ کی نقل کے لیے بی آر ایف 2)، اور ایک بی-ڈبل-پرائم (بی ڈی پی 1) یونٹ۔ مجموعی طور پر فن تعمیر پول دوم سے مماثلت رکھتا ہے۔ کلاس I 5S rRNA میں عام مراحل (جسے کلاس I بھی کہا جاتا ہے) جین کی شروعات: TFIIIA (پولیمرس III A کے لیے ٹرانسکرپشن فیکٹر) انٹراجینک (نقل شدہ DNA ترتیب کے اندر واقع) 5S rRNA کنٹرول ترتیب، C بلاک (جسے باکس C بھی کہا جاتا ہے) سے منسلک ہوتا ہے۔ ٹی ایف آئی آئی آئی اے ایک پلیٹ فارم کے طور پر کام کرتا ہے جو اے اور بی بلاکس کی جگہ لے لیتا ہے تاکہ ٹی ایف آئی آئی آئی سی کو ٹرانسکرپشن کے اسٹارٹ سائٹ کے حوالے سے ایک سمت میں رکھا جا سکے جو ٹی آر این اے جینز کے لیے مشاہدہ کیے جانے کے مساوی ہے۔ ایک بار جب TFIIIC TFIIIA-DNA کمپلیکس سے منسلک ہو جاتا ہے، تو TFIIIB کی اسمبلی آگے بڑھتی ہے جیسا کہ tRNA ٹرانسکرپشن کے لیے بیان کیا گیا ہے۔ ٹی آر این اے میں کلاس II عام مراحل (جسے کلاس II بھی کہا جاتا ہے) جین کی شروعات: ٹی ایف آئی آئی آئی سی (پولیمرس III سی کے لیے ٹرانسکرپشن فیکٹر) دو انٹراجینک (نقل شدہ ڈی این اے ترتیب کے اندر واقع) کنٹرول سیکوینس، اے اور بی بلاکس (جسے باکس اے اور باکس بی بھی کہا جاتا ہے) سے جڑا ہوتا ہے۔ ٹی ایف آئی آئی آئی سی ایک اسمبلی عنصر کے طور پر کام کرتا ہے جو ٹی ایف آئی آئی بی کو ٹرانسکرپشن کے آغاز کی جگہ کے اوپر کی طرف تقریبا 26 بیس جوڑوں پر مرکوز سائٹ پر ڈی این اے سے منسلک کرنے کے لیے پوزیشن کرتا ہے۔ TFIIIB نقل کا عنصر ہے جو نقل کے ابتدائی مقام پر پول III کو جمع کرتا ہے۔ ایک بار جب TFIIIB ڈی این اے سے منسلک ہو جاتا ہے، تو TFIIIC کی ضرورت نہیں رہتی ہے۔ ٹی ایف آئی آئی بی پروموٹر اوپننگ میں بھی اہم کردار ادا کرتا ہے۔ کلاس III یو 6 ایس این آر این اے میں عام مراحل (جسے کلاس III بھی کہا جاتا ہے) جین کی شروعات (صرف ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں دستاویزی): ایس این اے پی سی (ایس این آر این اے ایکٹیویٹنگ پروٹین کمپلیکس ؛ ذیلی اکائیاں: 1، 2، 3، 4، 5) (جسے پی بی پی اور پی ٹی ایف بھی کہا جاتا ہے) پی ایس ای (پراکسیمل سیکوینس عنصر) سے جڑے ہوتے ہیں جو نقل کے آغاز کی جگہ کے اوپر کی طرف تقریبا 55 بیس جوڑوں پر مرکوز ہوتے ہیں۔ اس اسمبلی کو پول II ٹرانسکرپشن عوامل اکتوبر 1 اور ایس ٹی اے ایف کی طرف سے بہت زیادہ حوصلہ افزائی کی جاتی ہے جو ٹرانسکرپشن کے اسٹارٹ سائٹ کے اوپر کی طرف کم از کم 200 بیس جوڑوں جیسے ڈی ایس ای (ڈسٹل سیکوینس عنصر) سے منسلک ہوتے ہیں۔ یہ عوامل اور پروموٹر عناصر ایس این آر این اے جینوں کے پول II اور پول III ٹرانسکرپشن کے درمیان مشترک ہیں۔ ایس این اے پی سی ٹرانسکرپشن کی اسٹارٹ سائٹ کے اوپر کی طرف 26 بیس جوڑوں پر مرکوز ٹاٹا باکس پر ٹی ایف آئی آئی بی کو جمع کرنے کا کام کرتا ہے۔ یہ ایک ٹاٹا باکس کی موجودگی ہے جو اس بات کی وضاحت کرتی ہے کہ ایس این آر این اے جین پول II کے بجائے پول III کے ذریعے نقل کیا گیا ہے۔ یو 6 ایس این آر این اے نقل کے لیے ٹی ایف آئی آئی آئی بی میں ایک چھوٹا بی آر ایف 1 پیرالاگ، بی آر ایف 2 ہوتا ہے۔ TFIIIB نقل کا عنصر ہے جو نقل کے ابتدائی مقام پر پول III کو جمع کرتا ہے۔ سیکوینس کنزرویشن پیش گوئی کرتا ہے کہ بی آر ایف 2 پر مشتمل ٹی ایف آئی آئی بی بھی پروموٹر اوپننگ میں کردار ادا کرتا ہے۔ پول III کے ذریعے نقل کے آغاز کے بعد طول و عرض TFIIIB ڈی این اے سے جڑا رہتا ہے (بیکٹیریل σ عوامل اور پول II نقل کے لیے زیادہ تر بنیادی نقل کے عوامل کے برعکس)۔ یہ پول III-نقل شدہ جینوں کی نقل کی بحالی کی اعلی شرح کی طرف لے جاتا ہے۔ Saccharomyces cerevisiae پر کی گئی ایک تحقیق میں، زنجیر کی لمبائی کی شرح اوسطا 21 سے 22 نیوکلیوٹائڈز فی سیکنڈ پائی گئی، اور سب سے تیز رفتار 29 نیوکلیوٹائڈز فی سیکنڈ تھی۔ یہ شرحیں ڈروسفیلا پر کیے گئے ان ویو مطالعہ کے ذریعے پائے جانے والے آر این اے پولیمریز II کی لمبائی کی شرحوں سے موازنہ تھیں۔ آر این اے سلسلہ کی لمبائی کے انفرادی مراحل کے تجزیے سے پتہ چلتا ہے کہ یو-ختم شدہ آر این اے زنجیروں میں یو اور اے کا اضافہ سست تھا۔ ٹرمینیشن پولی میریز III چھوٹے پولی یو اسٹریچ (5-6) پر ٹرانسکرپشن کو ختم کرتا ہے۔ یوکرائٹس میں، ہیئر پن لوپ کی ضرورت نہیں ہے، لیکن انسانوں میں اختتامی کارکردگی کو بڑھا سکتا ہے۔ Saccharomyces cerevisiae میں، یہ پایا گیا کہ نقل کا خاتمہ ترتیب T7GT6 میں ہوا اور ترقی پسند تھا۔ پانچ، چھ، اور سات یو باقیات کے ساتھ نقل کی موجودگی اور ٹی 7 اسٹریچ کے سست پڑھنے سے پتہ چلتا ہے کہ آر این اے چین میں ایک واحد جی کو شامل کرنے سے لمبائی کی شرحوں کو مکمل طور پر یا کافی حد تک دوبارہ ترتیب دینے میں مدد ملی۔ نقل شدہ آر این اے آر این اے پولیمریز III سے نقل شدہ آر این اے کی اقسام میں شامل ہیں: ٹرانسفر آر این اے 5 ایس رائبوسومل آر این اے یو 6 اسپلیسوسومل آر این اے آر این اے آر این اے ایس پی اور آر این اے ایم آر پی آر این اے 7 ایس ایل آر این اے (سگنل ریکگنیشن پارٹیکل کا آر این اے جزو) والٹ آر این اے وائی آر این اے ایس آئی این ای (مختصر بکھرے ہوئے تکراری عناصر) 7 ایس کے آر این اے کئی مائیکرو آر این اے کئی چھوٹے نیوکلولر آر این اے ڈی این اے مرمت آر این اے پولیمریز III میں متعدد جین ریگولیٹری اینٹی سینس آر این اے کا کردار ڈی این اے ڈبل اسٹرینڈ بریکس کی ہومولوگس ریکومبنیشنل مرمت کے لیے ضروری معلوم ہوتا ہے۔ آر این اے پولیمریز III ڈبل اسٹرینڈ بریکس پر ایک عارضی آر این اے-ڈی این اے ہائبرڈ کی تشکیل کو متحرک کرتا ہے، جو ہومولوگس ریکومبینیشن میڈیٹڈ ڈبل اسٹرینڈ بریک مرمت میں ایک ضروری انٹرمیڈیٹ مرحلہ ہے۔ یہ مرحلہ 3 'زیادہ لٹکنے والے ڈی این اے اسٹرینڈ کو انحطاط سے بچاتا ہے۔ عارضی آر این اے-ڈی این اے ہائبرڈ انٹرمیڈیٹ کی تشکیل کے بعد آر این اے اسٹرینڈ کو آر اے ڈی 51 پروٹین سے تبدیل کیا جاتا ہے جو اس کے بعد ہومولوگس ریکومبینیشن کے ایس ایس ڈی این اے حملے کے مرحلے کو متحرک کرتا ہے۔ یہ بھی دیکھیں RNA پولیمریز حوالہ جات جین اظہار پروٹین