Iodoacetamide
2-آئیوڈواسیٹامائڈ (آئی اے اے) ایک الکیلیٹنگ ایجنٹ ہے جو پیپٹائڈ میپنگ کے مقاصد کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ اس کے اعمال آئیوڈواسیٹیٹ سے ملتے جلتے ہیں۔ یہ عام طور پر سسٹین کے تھائول گروپ کے ساتھ ہم آہنگی سے جڑے رہنے کے لیے استعمال ہوتا ہے تاکہ پروٹین ڈائیسلفائیڈ بانڈ نہ بنا سکے۔ یہ یوبیکیوٹین کے مطالعے میں ڈیوبیکیوٹینیز انزائمز (DUBs) کے روک تھام کے طور پر بھی استعمال ہوتا ہے کیونکہ یہ DUB فعال سائٹ پر سسٹین کے باقیات کو الکیلیٹ کرتا ہے۔ پیپٹائڈیز انفیکٹر آئیوڈواسیٹامائڈ تمام سسٹین پیپٹائڈیز کا ایک ناقابل واپسی انفیکٹر ہے، جس میں اتپریرک سسٹین کے باقیات کے الکیلیشن سے ہونے والی روک تھام کا طریقہ کار ہے (اسکیمیٹک دیکھیں)۔ اس کے تیزاب سے ماخوذ آئیوڈواسیٹیٹ کے مقابلے میں، آئیوڈواسیٹامائڈ کافی تیزی سے رد عمل ظاہر کرتا ہے۔ یہ مشاہدہ معیاری کیمیائی رد عمل سے متصادم معلوم ہوتا ہے، تاہم اتپریرک ہسٹائڈائن کے مثبت امیڈازولیم آئن اور آئیوڈواسیٹیٹ کے منفی طور پر چارج شدہ کاربوکسیل گروپ کے درمیان سازگار تعامل کی موجودگی آئیوڈواسیٹامائڈ کی بڑھتی ہوئی رشتہ دار سرگرمی کی وجہ ہے۔ پروٹین ماس سپیکٹرومیٹری یہ عام طور پر پروٹین ماس سپیکٹرومیٹری کے ساتھ ڈی نووو (پیپٹائڈ) ترتیب کے لیے نمونے کی تیاری کے دوران استعمال ہوتا ہے، لیکن حالیہ ناقدین اس کے استعمال سے بچنے کا مشورہ دیتے ہیں۔