Shigella flexneri
شگیلا فلیکسنیری شگیلا جینس میں گرام نیگیٹیو بیکٹیریا کی ایک قسم ہے جو انسانوں میں اسہال کا سبب بن سکتی ہے۔ شگیلا کے کئی مختلف سیروگروپ بیان کیے گئے ہیں۔ ایس فلیکسنری کا تعلق گروپ بی ایس سے ہے۔ فلیکسنری انفیکشن کا علاج عام طور پر اینٹی بائیوٹکس سے کیا جا سکتا ہے، حالانکہ کچھ تناؤ مزاحم ہو چکے ہیں۔ کم شدید صورتوں کا عام طور پر علاج نہیں کیا جاتا کیونکہ وہ مستقبل میں زیادہ مزاحم ہو جاتے ہیں۔ شگیلا کا ایسچریچیا کولی سے گہرا تعلق ہے، لیکن اسے پیتھوجینسیٹی، فزیولوجی (لییکٹوز یا ڈیکاربوکسیلیٹ لائسین کو خمیر کرنے میں ناکامی) اور سیرولوجی کی بنیاد پر E.coli سے الگ کیا جا سکتا ہے۔ دریافت اس پرجاتیوں کا نام امریکی معالج سائمن فلیکسنر کے نام پر رکھا گیا تھا۔ شگیلا جینس کا نام جاپانی معالج کیوشی شیگا کے نام پر رکھا گیا ہے، جس نے پیچش کی وجہ پر تحقیق کی تھی۔ شیگا نے 1892 میں ٹوکیو امپیریل یونیورسٹی اسکول آف میڈیسن میں داخلہ لیا، جس کے دوران انہوں نے ڈاکٹر شیباسابورو کٹاساتو کے ایک لیکچر میں شرکت کی۔ شیگا ڈاکٹر کٹاساتو کی ذہانت اور اعتماد سے متاثر ہوئے، اس لیے گریجویشن کے بعد وہ ان کے لیے انسٹی ٹیوٹ فار انفیکٹو ڈیزیز میں ریسرچ اسسٹنٹ کے طور پر کام کرنے چلے گئے۔ 1897 میں، شیگا نے اپنی کوششوں پر توجہ مرکوز کی جسے جاپانیوں نے "سیکری" (پیچش) کی وبا کہا۔ یہ وبائیں جاپانی عوام کے لیے نقصان دہ تھیں اور اکثر 19 ویں صدی کے آخر میں پیش آئیں۔ 1897 کی سیکری وبا نے 91,000 سے زیادہ کو متاثر کیا، جس میں اموات کی شرح 20 فیصد سے زیادہ تھی۔ شیگا نے پیچش کے 32 مریضوں کا مطالعہ کیا اور بیماری کا سبب بننے والے جراثیم کو کامیابی کے ساتھ الگ کرنے اور اس کی شناخت کرنے کے لیے کوچز پوسٹولیٹس کا استعمال کیا۔ انہوں نے جراثیم کا مطالعہ اور خصوصیت جاری رکھی، اور اس کے زہریلے مادے کی پیداوار کے طریقوں کی نشاندہی کی۔ شیگا ٹاکسن، اور اس بیماری کے لیے ویکسین بنانے کے لیے انتھک محنت کی۔ خصوصیت مورفولوجی شگیلا فلیکسنیری ایک چھڑی کی شکل کا، غیر فلیجیلر جراثیم ہے جو ایکٹین پر مبنی حرکت پذیری پر انحصار کرتا ہے۔ یہ میزبان کے خلیوں کے اندر اور ان کے درمیان خود کو آگے بڑھانے کے لیے تیز اور مسلسل انداز میں پروٹین ایکٹین تیار کرتا ہے۔ یہ جراثیم گرام منفی، غیر بیج دار ہے جو سیرو گروپ بی سے شگیلا بناتا ہے۔ اس سیرو گروپ کے اندر 6 سیروٹائپ ہیں۔ سیرٹائپ شگیلا فلیکسنیری کا تعلق گروپ بی سے ہے (یعنی۔ بی اینٹی سیرا کے ساتھ جمع کریں) جو مزید چھ قسم کے مخصوص اور چار گروپ کے مخصوص اینٹی سیرا کے ذریعہ ذیلی درجہ بندی کرتا ہے۔ اب تک کم از کم 23 مختلف ذیلی اقسام کی نشاندہی اور اطلاع دی گئی ہے۔ پی سی آر پر مبنی مالیکیولر سیروٹائپنگ تکنیک اب ڈبلیو زیڈ ایکس 1-5 (سیروٹائپ 6 کے علاوہ سبھی) اور جی ٹی آر جینز یا ڈبلیو زیڈ ایکس 6 (صرف سیروٹائپ 6) کو نشانہ بنانے کے لیے دستیاب ہے۔ حملہ شگیلا فلیکسنیری ایک انٹرا سیلولر بیکٹیریا ہے جو ممالیہ آنتوں کی نالی کے ایپیٹیلیل لائننگ کو متاثر کرتا ہے۔ یہ جراثیم تیزاب روادار ہے اور پی ایچ 2 کے حالات سے بچ سکتا ہے۔ اس طرح، یہ اپنے میزبان کے منہ میں داخل ہونے کے قابل ہوتا ہے اور پیٹ کے ذریعے بڑی آنت تک گزرنے سے بچ جاتا ہے۔ ایک بار بڑی آنت کے اندر داخل ہونے کے بعد، ایس فلیکسنری تین طریقوں سے اپیتھیلیم میں داخل ہو سکتا ہے: 1) بیکٹیریا اپیتھیلیل خلیوں کے درمیان تنگ جنکشن کو تبدیل کر سکتا ہے، جس سے وہ ذیلی میوکوسا میں داخل ہو سکتا ہے۔ 2) یہ انتہائی اینڈوسیٹک ایم خلیوں میں گھس سکتا ہے جو اپیتھیلیل پرت میں منتشر ہوتے ہیں اور ذیلی میوکوسا میں داخل ہوتے ہیں۔ 3) ذیلی میوکوسا تک پہنچنے کے بعد، بیکٹیریا کو میکروفیجز کے ذریعے پھگوسیٹوز کیا جا سکتا ہے اور وہ اپوپٹوسس، خلیوں کی موت کو جنم دے سکتا ہے۔ یہ سائٹوکائنز کو جاری کرتا ہے جو ذیلی میوکوسا میں پولیمورفونیوکلیئر خلیات (پی ایم این) کو بھرتی کرتے ہیں۔ ایس فلیکسنری اب بھی بڑی آنت کے لومین میں ایپیٹیلیل لائننگ سے گزرتا ہے جب پی ایم این متاثرہ علاقے میں داخل ہوتے ہیں۔ شگیلا کے جواب میں ایپیٹیلیل پرت کے پار پی ایم این خلیوں کی آمد ایپیٹیلیم کی سالمیت میں خلل ڈالتی ہے جس سے لومینل بیکٹیریا ایم سیل کے آزاد میکانزم میں ذیلی میوکوسا میں داخل ہوتے ہیں۔ ایس فلیکسنری ان تینوں طریقوں کا استعمال ذیلی میوکوسا تک پہنچنے کے لیے کرتا ہے تاکہ بیسولٹرل سائیڈ سے ایپیلیٹیلیل خلیوں میں گھس سکے۔ اس جراثیم میں چار معروف حملہ آور پلازمیڈ اینٹیجن ہیں: آئی پی اے اے، آئی پی اے بی، آئی پی اے سی، اور آئی پی اے ڈی۔ جب ایس فلیکسنری کسی ایپیٹیلیل سیل کے بیسلیٹرل سائیڈ سے رابطہ کرتا ہے، تو آئی پی اے سی اور آئی پی اے بی کو ایک ساتھ جوڑ کر ایپیٹیلیل سیل جھلی میں ایک سوراخ بنایا جاتا ہے۔ اس کے بعد یہ ایپیٹیلیل سیل کے سائٹوپلازم میں دوسرے آئی پی اے پروٹین داخل کرنے کے لیے ٹائپ-III سراو کے نظام (ٹی 3 ایس ایس) کا استعمال کرتا ہے۔ ایس فلیکسنری میزبان کی ایکٹین اسمبلی مشینری کو چالو کرنے کے لیے اپنے بیرونی جھلی پروٹین، آئی سی ایس اے کا استعمال کرکے پڑوسی ایپیٹیلیل خلیوں میں منتقل ہو سکتا ہے۔ آئی سی ایس اے پروٹین کو پہلے جراثیم کے ایک قطب پر مقامی بنایا جاتا ہے جہاں یہ میزبان کے پروٹین، نیورل وسکوٹ-ایلڈرچ سنڈروم پروٹین (این-ڈبلیو اے ایس پی) کے ساتھ جڑا رہے گا۔ یہ آئی سی ایس اے/این-ڈبلیو اے ایس پی کمپلیکس پھر ایکٹین سے متعلق پروٹین (آرپ) 2/3 کمپلیکس کو چالو کرتا ہے۔ آرپ 2/3 کمپلیکس وہ پروٹین ہے جو تیزی سے ایکٹین پولیمرائزیشن شروع کرنے اور بیکٹیریا کو آگے بڑھانے کا ذمہ دار ہے۔ جب ایس فلیکسنری ملحقہ جھلی تک پہنچتا ہے، تو یہ پڑوسی خلیے کے سائٹوپلازم میں ایک پھیلاؤ پیدا کرتا ہے۔ بیکٹیریا سیلولر جھلی کی دو تہوں سے گھرا ہوا ہے۔ اس کے بعد یہ ایک سوراخ بنانے اور اگلے خلیے میں داخل ہونے کے لیے ایک اور آئی پی اے بی سی کمپلیکس کا استعمال کرتا ہے۔ ویک جے ایک پروٹین ہے جس کی ضرورت ایس۔ فلیکسنری کو بھی پھسلن سے باہر نکلنے کے لیے ہوتی ہے۔ اس کے عین مطابق کام کا اب بھی مطالعہ کیا جا رہا ہے لیکن یہ معلوم ہے کہ خلیوں کے درمیان پھیلاؤ اس کے بغیر بہت زیادہ خراب ہو جاتا ہے۔ ایپیٹیلیل سیل کے اندر بیکٹیریل ریپلیکیشن سیل کے لیے نقصان دہ ہے لیکن یہ تجویز کیا جاتا ہے کہ ایپیٹیلیل سیل کی موت بڑی حد تک میزبان کے اپنے سوزش کے ردعمل کی وجہ سے ہوتی ہے۔ جینیات ایس فلیکسنری اور ایسچریچیا کولی کا جینوم انواع کی سطح پر تقریبا ناقابل شناخت ہے۔ ایس فلیکسنری میں ایک سرکلر کروموسوم ہوتا ہے جس میں 4,599,354 بیس جوڑے ہوتے ہیں۔ یہ ای کولی سے چھوٹا ہے لیکن جین ایک جیسے ہیں۔ ایس فلیکسنری کے جینوم میں تقریبا 4,084 معروف جین ہیں۔ ای کولی اور ایس فلیکسنری کے درمیان وسیع مماثلت افقی منتقلی کی وجہ سے تجویز کی گئی ہے۔ ایس فلیکسنری کے لیے بڑی آنت کے اپیتھیلیل لائننگ پر حملہ کرنے کے لیے درکار تمام جین ایک وائرولنس پلازمیڈ پر پائے جاتے ہیں جسے پن وی کہا جاتا ہے۔ پن وی کا جینوم ایس فلیکسنری کی ذیلی اقسام کے درمیان انتہائی محفوظ ہے۔ ایس فلیکسنری میں دو دیگر چھوٹے ملٹی کاپی پلازمیڈز بھی ہوتے ہیں، لیکن ایس فلیکسنری کے کچھ تناؤ میں زیادہ پلازمیڈز ہوتے ہیں جن کے بارے میں شبہ ہے کہ وہ اینٹی بائیوٹک مزاحمت فراہم کرتے ہیں۔ ایس فلیکسنری کے کچھ تناؤ میں اینٹی بائیوٹکس سٹریپٹومیسن، ایمپیسلن، یا ٹرائمیتھوپریم کے خلاف مزاحمت ہوتی ہے۔ یہ پایا گیا ہے کہ کلورامفینکول، نیلیڈیکسک ایسڈ، اور جینٹامائسن اب بھی کچھ تناؤ کے لیے موثر اینٹی بائیوٹکس ہیں۔ میٹابولزم شگیلا فلیکسنیری ایک ہیٹروٹروف ہے۔ یہ شکر کو میٹابولائز کرنے کے لیے ایمبڈن-میئرہوف-پرناس (ای ایم پی)، اینٹنر-ڈوڈوروف (ای ڈی)، یا پینٹوز فاسفیٹ پاتھ وے (پی پی پی) کا استعمال کرتا ہے۔ ان راستوں کی مصنوعات پھر سائٹرک ایسڈ سائیکل (ٹی سی اے) میں داخل ہوتی ہیں۔ ایس فلیکسنری گلوکوز اور پائروویٹ کو میٹابولائز کر سکتا ہے۔ اضافی پائروویٹ سب سے زیادہ ترقی کی اجازت دیتا ہے اور خیال کیا جاتا ہے کہ یہ کاربن کا ترجیحی ذریعہ ہے۔ پائروویٹ کو سیل کے اپنے میٹابولزم کے ذریعے فراہم کیا جا سکتا ہے یا میزبان سیل سے لیا جا سکتا ہے۔ ایس فلیکسنری ایک فیکلٹیٹو اینیروب ہے جو پائروویٹ کی مخلوط ایسڈ خمیر انجام دینے کے قابل ہے۔ ایس فلیکسنری لییکٹوز کو خمیر کرنے سے قاصر ہے۔ یہ جراثیم 37 ڈگری سیلسیس پر بہتر طریقے سے بڑھتا ہے لیکن 30 ڈگری سیلسیس تک کم درجہ حرارت میں بڑھ سکتا ہے۔ چھوٹے آر این اے بیکٹیریل چھوٹے آر این اے بہت سے سیلولر عمل میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ آر این اے جی اور آر وائی ایچ بی ایس آر این اے کا ایس فلیکسنری میں اچھی طرح سے مطالعہ کیا گیا ہے۔ ایس ایس آر 1 ایس آر این اے، جو تیزابیت کے تناؤ کے خلاف مزاحمت اور وائرس کے ضابطے میں کردار ادا کر سکتا ہے، صرف شگیلا میں موجود دکھایا گیا تھا۔ ماحولیاتی متعدی سائیکل شگیلا فلیکسنیری میں ایک وائرل پلازمیڈ ہوتا ہے جو تین وائرل عوامل کے لیے کوڈ کرتا ہے: ایک ٹائپ-3 سراو کا نظام (ٹی 3 ایس ایس)، حملہ پلازمیڈ اینٹیجن پروٹین (آئی پی اے پروٹین)، اور آئی سی ایس اے (سیل سے سیل کے پھیلاؤ کے لیے استعمال ہوتا ہے)۔ انفیکشن کے بعد، ایس فلیکسنری میزبان سیل سائٹوپلازم کو آئی پی اے پروٹین کے ساتھ ٹی 3 ایس ایس کا استعمال کرتے ہوئے انجکشن کرتا ہے-ایک سوئی اور سرنج جیسا سامان جو بہت سے گرام منفی پیتھوجینز کے لیے عام ہے۔ یہ آئی پی اے پروٹین میزبان خلیے کے ذریعے "جھلی کے پھسلنے" کو جنم دیتے ہیں۔ میمبرین رفلنگ جھلی کی جیبیں بناتی ہیں جو بیکٹیریا کو پکڑ کر گھیر لیتی ہیں۔ ایک بار اندر داخل ہونے کے بعد، ایس فلیکسنری میزبان سیل ایکٹین کا استعمال کرتا ہے تاکہ سیلولر میکانزم کا استعمال کرتے ہوئے براہ راست سیل سے سیل میں منتقل ہو سکے جسے پیراسیٹوفیجی کہا جاتا ہے، بیکٹیریل پیتھوجین لسٹریا مونوسیٹوجینز کی طرح۔ شگیلا فلیکسنری ایک ایفیکٹر پروٹین، او ایس پی آئی کا استعمال کرکے انفیکشن کے ابتدائی مرحلے میں شدید سوزش کے ردعمل کو روکنے کے قابل ہے، جسے او آر ایف 169 بی کے ذریعے شگیلا لارج پلازمیڈ پر انکوڈ کیا جاتا ہے اور ٹائپ III سراو کے نظام کے ذریعے خفیہ کیا جاتا ہے۔ یہ ٹی این ایف-α-رسیپٹر سے وابستہ عنصر 6 (ٹی آر اے ایف 6)-ثالثی سگنلنگ راستے کو دبا کر بیکٹیریل حملے کے دوران سوزش کے ردعمل کو کم کرتا ہے۔ او ایس پی آئی میں گلوٹامین ڈیمیڈیز سرگرمی ہے، اور یہ یو بی سی 13 میں پوزیشن 100 پر گلوٹامین کو گلوٹامیٹ کرنے کے لیے منتخب طور پر ڈیمینیٹ کرنے کے قابل ہے، اور اس کے نتیجے میں ای 2 یوبیکیوٹین-کنجگٹنگ سرگرمی کی ناکامی ہوتی ہے جو ٹی آر اے ایف 6 ایکٹیویشن کے لیے ضروری ہے۔ حوالہ جات نورا https://microbenotes.com/biochemical-test-of-shigella-flexneri بیرونی روابط بیک ڈائیو میں شگیلا فلیکسنری کی قسم کا تناؤ-1919 میں بیان کردہ بیکٹیریل تنوع میٹا ڈیٹا بیس اینٹروبیکٹیریاسی بیکٹیریا