Photolyase
فوٹولیسیس () ڈی این اے مرمت کے انزائم ہیں جو بالائے بنفشی روشنی کی نمائش سے ہونے والے نقصان کی مرمت کرتے ہیں۔ ان انزائموں کو اپنی فعالیت اور اصل ڈی این اے کی مرمت دونوں کے لیے مرئی روشنی (سپیکٹرم کے بنفشی/نیلے سرے سے) کی ضرورت ہوتی ہے۔ فوٹولیسیس پر مشتمل ڈی این اے کی مرمت کے طریقہ کار کو فوٹو ری ایکٹیویشن کہا جاتا ہے۔ وہ بنیادی طور پر پائریمائڈائن ڈائمرز کو پائریمائڈائن بیسز کی ایک عام جوڑی میں تبدیل کرتے ہیں۔ فنکشن فوٹولیسیس تکمیلی ڈی این اے اسٹرینڈز کو باندھتے ہیں اور بعض قسم کے پیریمیڈائن ڈائمرز کو توڑ دیتے ہیں جو اس وقت پیدا ہوتے ہیں جب ڈی این اے کے ایک ہی اسٹرینڈ پر تھامین یا سائٹوسین بیسز کا ایک جوڑا باہمی طور پر جڑا ہوتا ہے۔ اس ڈائمرائزیشن کی بانڈ لمبائی عام بی-ڈی این اے ڈھانچے کی بانڈ لمبائی سے کم ہوتی ہے جو نقل اور نقل کے لیے غلط ٹیمپلیٹ تیار کرتی ہے۔ زیادہ عام کوولینٹ لنکج میں سائکلوبوٹین پل کی تشکیل شامل ہے۔ فوٹوولائسز کا ان زخموں کے لیے بہت زیادہ لگاؤ ہوتا ہے اور وہ پلٹ کر باندھتے ہیں اور انہیں اصل اڈوں میں تبدیل کر دیتے ہیں۔ ارتقاء فوٹولیز ایک فائیلوجنیٹک طور پر پرانا انزائم ہے جو بیکٹیریا سے لے کر فنگی سے لے کر پودوں اور جانوروں تک بہت سی انواع میں موجود اور فعال ہے۔ پودوں میں یووی سے ہونے والے نقصان کی مرمت میں فوٹوولائز خاص طور پر اہم ہے۔ فوٹوولائز میکانزم اب انسانوں اور دیگر پلسینٹل ممالیہ جانوروں میں کام نہیں کر رہا ہے جو اس کے بجائے کم موثر نیوکلیوٹائڈ اخراج کی مرمت کے طریقہ کار پر انحصار کرتے ہیں، حالانکہ وہ بہت سے کرپٹوکروم کو برقرار رکھتے ہیں۔ فوٹوولائسز فلاوپروٹین ہوتے ہیں اور ان میں دو ہلکی کٹائی کرنے والے کوفیکٹر ہوتے ہیں۔ بہت سے فوٹولیسیس میں ایک این-ٹرمینل ڈومین ہوتا ہے جو دوسرے کوفیکٹر کو باندھتا ہے۔ تمام فوٹوولائسز میں دو الیکٹران سے کم ہونے والے ایف اے ڈی ایچ ہوتے ہیں۔ انہیں دوسرے کوفیکٹر کی بنیاد پر دو اہم کلاسوں میں تقسیم کیا گیا ہے، جو یا تو فولیٹ فوٹوولائسز میں پیٹرین میتھینائل ٹیٹرا ہائیڈروفولیٹ (ایم ٹی ایچ ایف) ہو سکتا ہے یا ڈیزافلاوین فوٹوولائسز میں ڈیزافلاوین 8-ہائیڈروکسی-7,8-ڈائیڈیمیتھائل-5-ڈیزاریبوفلاوین (8-ایچ ڈی ایف) ہو سکتا ہے۔ اگرچہ اتپریرک سرگرمی کے لیے صرف ایف اے ڈی کی ضرورت ہوتی ہے، لیکن دوسرا کوفیکٹر کم روشنی کے حالات میں رد عمل کی شرح کو نمایاں طور پر تیز کرتا ہے۔ انزائم الیکٹران کی منتقلی کے ذریعے کام کرتا ہے جس میں کم شدہ فلاوین FADH-روشنی کی توانائی کے ذریعے چالو ہوتا ہے اور پائریمائڈائن ڈائمر کو توڑنے کے لیے الیکٹران ڈونر کے طور پر کام کرتا ہے۔ ترتیب کی مماثلتوں کی بنیاد پر ڈی این اے فوٹولیسیس کو چند کلاسوں میں تقسیم کیا جا سکتا ہے: کلاس 1 سی پی ڈی فوٹولیسیس انزائم ہیں جو گرام منفی اور گرام مثبت بیکٹیریا، ہیلوفیلک آرکیا ہیلوبیکٹیریم ہیلوبیئم سے سائکلوبوٹین پائریمائڈائن ڈائمر (سی پی ڈی) کے زخموں پر کارروائی کرتے ہیں۔ کلاس 2 سی پی ڈی فوٹولیسیس سی پی ڈی کے زخموں پر بھی کارروائی کرتے ہیں۔ یہ تھیل کریس عربیڈوپسس تھیلیانا اور چاول جیسے پودوں میں پائے جاتے ہیں۔ پلانٹ اور فنگی کرپٹوکروم کلاس 1 سی پی ڈی سے ملتے جلتے ہیں۔ وہ نیلی روشنی کے فوٹو ریسیپٹر ہیں جو نیلی روشنی سے پیدا ہونے والے جین کے اظہار اور سرکیڈین تالوں کے ماڈیولیشن میں ثالثی کرتے ہیں۔ کلاس 3 سی پی ڈی لائسیس پلانٹ کرپٹوکرومز کے لیے ایک بہن گروپ بناتے ہیں، جو بدلے میں کلاس 1 سی پی ڈیز کے لیے ایک بہن گروپ ہیں۔ کری-ڈی اے ایس ایچ گروپ سی پی ڈی لائسیس ہیں جو سنگل اسٹرینڈڈ ڈی این اے کے لیے انتہائی مخصوص ہیں۔ اراکین میں ویبریو ہیضہ، زینوپس لیوس سے X1Cry، اور عربی ڈوپسس تھالیانا سے AtCry3 شامل ہیں۔ ڈی اے ایس ایچ کا نام ابتدائی طور پر ڈروسفیلا، عربیڈوپسس، سینکوسسٹس، اور ہیومن کے نام پر رکھا گیا تھا، ابتدائی طور پر خیال کیا جاتا تھا کہ چار ٹیکسوں میں لائسیس کے اس خاندان کو شامل کیا گیا ہے۔ اس کے بعد سے درجہ بندی بدل گئی ہے۔ ان کے نام کا "کری" حصہ ابتدائی مفروضوں کی وجہ سے تھا کہ وہ کرپٹوکروم تھے۔ یوکرائیوٹک (6-4) ڈی این اے فوٹولیسیس جانوروں کے کرپٹوکروم کے ساتھ ایک گروپ بناتے ہیں جو سرکیڈین تال کو کنٹرول کرتے ہیں۔ وہ ڈروسفیلا اور انسانوں سمیت متنوع انواع میں پائے جاتے ہیں۔ کرپٹوکروموں کی اپنی تفصیلی گروہ بندی ہوتی ہے۔ بیکٹیریل 6-4 لائسیس ()، جسے ایف ای ایس-بی سی پی گروپ بھی کہا جاتا ہے، تمام فوٹولیسیس کے مقابلے میں اپنا آؤٹ گروپ بناتے ہیں۔ سی پی ڈی کی غیر کلاس 2 شاخ کو کچھ نظاموں جیسے پرنٹس (PR00147) میں کلاس 1 میں گروپ کیا جاتا ہے۔ اگرچہ چھوٹے گروپوں کے اراکین پر اتفاق کیا گیا ہے، طریقہ کار میں فرق کی وجہ سے مصنفین کے درمیان فائیلوجینی بہت مختلف ہو سکتی ہے، جس کی وجہ سے مصنفین کے ساتھ کچھ الجھن پیدا ہوتی ہے جو ہر چیز کو فٹ کرنے کی کوشش کرتے ہیں (فی ایس-بی سی پی کو چھوڑ کر) دو درجے کی درجہ بندی میں۔ کرپٹوکرومز ایک پولی فائیلیٹک گروپ بناتے ہیں جن میں فوٹولیسیس بھی شامل ہیں جو اپنی ڈی این اے کی مرمت کی سرگرمی کھو چکے ہیں اور اس کے بجائے سرکیڈین تال کو کنٹرول کرتے ہیں۔ ہیلا خلیوں میں نیلے سبز طحالب سے فوٹوولائز شامل کرنے سے یو وی بی کی نمائش سے ڈی این اے کو ہونے والے نقصان کو جزوی طور پر کم کیا گیا۔ اس ڈومین پر مشتمل انسانی پروٹین: کریپٹوکرومز: سی آر وائی 1 ؛ سی آر وائی 2 نام بندی اس انزائم کلاس کا منظم نام ڈی آکسی رائبوسائیکلوبوٹاڈیپائریمائڈائن پائریمائڈائن-لیسیس ہے۔ عام استعمال میں دیگر ناموں میں فوٹو ری ایکٹیویٹنگ انزائم، ڈی این اے فوٹولیز، ڈی این اے فوٹوریز ایکٹیویٹنگ انزائم، ڈی این اے سائکلوبوٹین ڈپائریمیڈائن فوٹولیز، ڈی این اے فوٹولیز، ڈی آکسی ریبونوکلک فوٹولیز، ڈی آکسی ریبوڈیپائریمیڈائن فوٹولیز، فوٹولیز، پی آر ای، پی ایچ آر بی فوٹولیز، ڈی آکسی ریبونوکلک سائکلوبوٹین ڈپائریمیڈائن فوٹولیز، فقرہ اے فوٹولیز، ڈائپائریمیڈائن فوٹولیز (فوٹو حساس)، اور ڈی آکسی ریبونوکلائٹ پائریمائڈائن ڈائمر لائز (فوٹو حساس) شامل ہیں۔ یہ انزائم لائسیس کے خاندان سے تعلق رکھتا ہے، خاص طور پر کاربن کاربن لائسیس کی "کیچ آل" کلاس میں۔ حوالہ جات مزید پڑھنے بیرونی روابط ای سی 4.1.99 ڈی این اے مرمت معلوم ساخت فلاووپروٹینز کے انزائم