EF-Ts
ای ایف-ٹی ایس (لانگشن فیکٹر تھرمو اسٹیبل) پروکیریوٹک لانگشن فیکٹرز میں سے ایک ہے۔ یہ انسانی مائٹوکونڈریا میں ٹی ایس ایف ایم کے طور پر پایا جاتا ہے۔ یہ یوکرائیوٹک EF-1B سے ملتا جلتا ہے۔ ای ایف-ٹی ایس ای ایف-ٹو (طول و عرض عنصر تھرمو غیر مستحکم) کے لیے گوانائن نیوکلیوٹائڈ ایکسچینج فیکٹر کے طور پر کام کرتا ہے، جو ای ایف-ٹو سے گوانوسین ڈائیفاسفیٹ کی رہائی کو متحرک کرتا ہے۔ یہ ای ایف-ٹو کو ایک نئے گوانوسین ٹرائی فاسفیٹ مالیکیول سے منسلک کرنے، ای ایف-ٹی ایس کو جاری کرنے، اور ایک اور امینو ایسیل ٹی آر این اے کے اضافے کو متحرک کرنے کے قابل بناتا ہے۔ ساخت پروٹین Qβ-Replicase ایک ٹیٹرامیرک پروٹین ہے، جس کا مطلب ہے کہ اس میں چار ذیلی یونٹس ہوتے ہیں۔ یہ ذیلی اکائیاں دو طول و عرض کے عوامل ہیں، ای ایف-ٹو اور ای ایف-ٹی ایس، رائبوسومل پروٹین ذیلی اکائی ایس 1، اور آر این اے پر منحصر آر این اے پولیمرس β-ذیلی اکائی۔ دو طول و عرض کے عوامل ایک ہیٹروڈائمر ڈھانچہ بناتے ہیں جسے دی ایلونگیشن فیکٹر کمپلیکس کہا جاتا ہے، جو کہ آر ڈی آر پی β-سبونٹ کی پولیمرائزیشن سرگرمی کے لیے ضروری ہے۔ اس کے ثانوی ساختی اجزاء α-ہیلسیس، β-شیٹس اور β-بیرل پر مشتمل ہوتے ہیں۔ ای ایف-ٹی ایس پروٹین کے اوپری حصے کی اکثریت پر مشتمل ہوتا ہے، جبکہ ای ایف-ٹو نچلے نصف حصے کو بناتا ہے جہاں بیٹا بیرل نظر آتے ہیں۔ تشکیل کو کھلا سمجھا جاتا ہے، جب کوئی گوانائن نیوکلیوٹائڈ ای ایف-ٹو میں فعال سائٹ سے منسلک نہیں ہوتا ہے۔ ای ایف-ٹی ایس سلسلہ چار اہم ڈومینز پر مشتمل ہے، سی-ٹرمینل ڈومین، این-ٹرمینل ڈومین، ڈائمرائزیشن ڈومین، اور کور ڈومین جو سبھی پروٹین کی ساخت اور فعالیت میں ایک مخصوص کردار ادا کرتے ہیں۔ ڈائمرائزیشن ڈومین میں چار مخالف متوازی α-ہیلیسیس ہوتے ہیں جو ڈائمر ڈھانچہ ڈومین بنانے کے لیے EF-Du اور EF-Ts کے درمیان رابطے کا بنیادی ذریعہ ہے۔ N-ٹرمینل ڈومین کا دائرہ رہائشیوں 1-54 (n1-n54) سے ہے، کور ڈومین n55-n179 سے ہے، ڈائمرائزیشن ڈومین n180-n228 سے ہے، اور آخر میں C-ٹرمینل ڈومین جو n264-n282 سے ہے۔ بنیادی ڈومین دو ذیلی ڈومینز، سی اور این پر مشتمل ہے جو بالترتیب ای ایف-ٹو کے ڈومینز 3 اور 1 کے ساتھ تعامل کرتے ہیں۔ طول و عرض کے عمل کا راستہ ای ایف-ٹی ایس گوانائن نیوکلیوٹائڈ ایکسچینج فیکٹر کے طور پر کام کرتا ہے، یہ ای ایف-ٹو * جی ڈی پی (غیر فعال شکل) کے ای ایف-ٹو * جی ٹی پی (فعال) کے رد عمل کو متحرک کرتا ہے۔ ای ایف-ٹو (فعال) پھر امینو ایسیل-ٹی آر این اے کو رائبوسوم تک پہنچاتا ہے۔ لہذا، ای ایف-ٹی ایس کا بنیادی کردار ای ایف-ٹو کو دوبارہ اپنی فعال حالت میں ری سائیکل کرنا ہے تاکہ ایک اور لمبائی کا چکر مکمل کیا جا سکے۔ اس راستے کی اکثریت ای ایف-ٹو ڈومین 1 کی تشکیلی تبدیلیوں کے ذریعے انجام دی جاتی ہے جس میں فعال سائٹ اور رائبوسوم اور ٹی آر این اے کے ذریعے سوئچ 1 اور 2 کے علاقوں میں ہیرا پھیری ہوتی ہے۔ سب سے پہلے، ای ایف-ٹو کے ڈومین 1 میں جی ٹی پیز سرگرمی سائٹ کو ہائیڈروفوبک باقیات کی ایک سیریز کے ذریعے بلاک کیا جاتا ہے جو ای ایف-ٹی ایس کے ذریعے ایکٹیویشن سے پہلے اتپریرک باقیات اس 84 کو غیر فعال شکل میں بلاک کرتے ہیں۔ ایک بار جب ٹی آر این اے ای ایف-ٹو سے جڑا ہوتا ہے، تو اسے رائبوسوم تک پہنچایا جاتا ہے جو جی ٹی پی کو ہائیڈرولائز کرتا ہے اور ای ایف-ٹو کو ٹی آر این اے کو باندھنے کے لیے کم وابستگی کے ساتھ چھوڑ دیتا ہے۔ رائبوسوم یہ کام سوئچ 1 خطے میں ہیرا پھیری کے ذریعے کرتا ہے، جی ٹی پی ہائیڈرولیسس کے بعد ثانوی ڈھانچہ بنیادی طور پر α-ہیلسیس سے β-ہیئرپین میں بدل جاتا ہے۔ اس کے بعد ای ایف-ٹو کو غیر فعال حالت میں رائبوسوم سے جاری کیا جاتا ہے جو سائیکل کو مکمل کرتا ہے جب تک کہ ای ایف-ٹی ایس کے ذریعہ ایک بار پھر فعال نہ ہو جائے۔ ای ایف-ٹو کے ہیلکس ڈی کو گوانائن نیوکلیوٹائڈ کے تبادلے کے لیے ای ایف-ٹی ایس کے این-ٹرمینل ڈومین کے ساتھ تعامل کرنا چاہیے۔ ایک حالیہ مطالعہ نے راستے میں شامل بنیادی باقیات کو دیکھنے کے لیے ای ایف-ٹو کے ہیلکس ڈی پر کچھ باقیات کو تبدیل کر کے گوانائن نیوکلیوٹائڈ کے تبادلے کے رد عمل کی حرکیات پر تحقیق کی۔ لیو 148 اور گلو 152 کے اتپریورتن نے اس شرح کو کم کر دیا جس پر ای ایف-ٹی ایس این-ٹرمینل ڈومین ہیلکس ڈی سے نمایاں طور پر جڑا ہوا ہے، یہ نتیجہ اخذ کرتے ہوئے کہ یہ دونوں باقیات رد عمل کے راستے میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ حیاتیات کے درمیان امینو ایسڈ کا تحفظ یہ مضمون EF-Ts پر مرکوز ہے کیونکہ یہ Qβ-بیکٹیریوفیج میں موجود ہے، تاہم بہت سے جاندار پروٹین کے ساتھ اسی طرح کے طول و عرض کے عمل کا استعمال کرتے ہیں جن کا کام تقریبا EF-Ts جیسا ہی ہوتا ہے۔ ای ایف-ٹی ایس کا تعلق پروٹین کے گروپ سے ہے جسے گوانائن نیوکلیوٹائڈ ایکسچینج فیکٹرز کے نام سے جانا جاتا ہے اور یہ پروٹین بہت سے مختلف بائیو کیمیکل راستوں میں کام کرتے ہیں، یہ ٹی ایس ایف سپر فیملی سے بھی تعلق رکھتے ہیں۔ دیگر حیاتیات کے درمیان پائے جانے والے امینو ایسڈ کے تحفظ کی اکثریت این-ٹرمینل ڈومین میں واقع ہے جہاں ای ایف-ٹی ایس ای ایف-ٹو سے جڑے ہوتے ہیں اور گوانائن نیوکلیوٹائڈ کا تبادلہ ہوتا ہے۔ ذیل میں EF-Ts کے اہم N-ٹرمینل ڈومین کی صف بندی ہے جیسا کہ یہ دوسرے حیاتیات میں موجود ہے۔ E.Coli: 8-LVKELRETGAGMDCCKALT-20 LACBS: 8-LVAELRKRTEVSITKARIALS-20 باس ٹورس: 8-LLMKLRKTGYSFINCKKALE-20 ڈروسفیلا: 8-ALAALRKKTGYTFANCKKKALE-20 چاروں میں محفوظ امینو ایسڈ لیو 12 اور آرگ 18 ہیں (اوپر بولڈ میں دیکھے گئے حروف)، یہ نتیجہ اخذ کیا جا سکتا ہے کہ یہ دو باقیات گوانائن نیوکلیوٹائڈ کے تبادلے میں اہم کردار ادا کرتے ہیں کیونکہ وہ صرف دو ہی مکمل طور پر محفوظ ہیں۔ یوکرائٹس میں ای ایف-1 ایک ہی کام انجام دیتا ہے، اور گوانائن نیوکلیوٹائڈ کے تبادلے کا طریقہ کار تقریبا ایک جیسا ہے، جیسا کہ ای ایف-ٹی ایس لیکن ساختی طور پر مختلف ہے۔ پروکیریوٹک طول و عرض کے عوامل EF-टु (طول و عرض کا عنصر تھرمو غیر مستحکم) EF-G (طول و عرض کا عنصر G) EF-P (طول و عرض کا عنصر P) پروٹین ترجمہ GTPase حوالہ جات پروٹین حیاتیاتی ترکیب بھی دیکھیں۔