SmY RNA
ایس ایم وائی ربنیوکلک ایسڈ (ایس ایم وائی آر این اے) چھوٹے نیوکلیئر آر این اے کا ایک خاندان ہے جو نیماتوڈ کیڑوں کی کچھ انواع میں پایا جاتا ہے۔ خیال کیا جاتا ہے کہ وہ ایم آر این اے ٹرانس اسپلیسنگ میں ملوث ہیں۔ ایس ایم وائی آر این اے تقریبا 70-90 نیوکلیوٹائڈز لمبے ہوتے ہیں اور ایک مشترکہ ثانوی ڈھانچے کا اشتراک کرتے ہیں، جس میں دو اسٹیم لوپس ایس ایم پروٹین کے لیے متفقہ بائنڈنگ سائٹ کے ساتھ ہوتے ہیں۔ ایس ایم پروٹین اسپلیسیوسومل ایس این آر این پیز کا ایک مشترکہ جزو ہے۔ ایس ایم وائی آر این اے کلاس کروماڈوریا کے نیماتوڈس میں پائے گئے ہیں، جن میں سب سے زیادہ عام طور پر مطالعہ کیے جانے والے نیماتوڈس (جیسے کینورابڈائٹس، پرسٹیونکس، اور ایسکیرس) شامل ہیں، لیکن کلاس ڈوریلیمیا میں زیادہ دور سے متعلق ٹرائچینیلا اسپائریلس میں نہیں۔ ہر نوع میں ایس ایم وائی جینوں کی تعداد مختلف ہوتی ہے، زیادہ تر کینورابڈائٹس اور پرسٹیونکس پرجاتیوں میں 10-26 متعلقہ متوازی کاپیاں ہوتی ہیں، جبکہ دیگر نیماتوڈس میں 1 سے 5 ہوتی ہیں۔ دریافت پہلا ایس ایم وائی آر این اے 1996 میں پیوریفائیڈ ایسکیرس لمبریکوائڈز اسپلیسیوسوم تیاریوں میں دریافت کیا گیا تھا، جیسا کہ ایک اور ایس ایم ایکس آر این اے کہا جاتا تھا جو ایس ایم وائی کے لیے پتہ لگانے کے لیے یکساں نہیں ہے۔ بارہ ایس ایم وائی ہومولوگس کی شناخت سنورابڈائٹس ایلیگنس میں کمپیوٹیشنل طور پر کی گئی تھی، اور دس سنورابڈائٹس بریگسی میں۔ ان ایس ایم وائی جینوں کے کئی نقل کو کلون کیا گیا اور سی ایلیگنس میں چھوٹے غیر کوڈنگ آر این اے نقل کے منظم سروے میں ترتیب دیا گیا۔ اینٹی ٹی ایم جی اینٹی باڈیز کا استعمال کرتے ہوئے C.elegans میں 2,2,7-ٹرائمیتھائل گوانوسین (ٹی ایم جی) 5 'کیپیڈ ٹرانسکرپٹس کے ایک منظم سروے نے دو ٹی ایم جی کیپیڈ ایس ایم وائی ٹرانسکرپٹس کی نشاندہی کی۔ ان نقل میں ممکنہ ایس ایم بائنڈنگ سائٹس کے ترتیب کے تجزیے سے پتہ چلتا ہے کہ ایس ایم وائی، یو 5 ایس این آر این اے، یو 3 ایس این او آر این اے اور اسپلیسڈ لیڈر آر این اے کے نقل (ایس ایل 1 اور ایس ایل 2) سب ایک بہت ہی ملتے جلتے اتفاق رائے ایس ایم بائنڈنگ ترتیب (اے اے یو 4-5 جی جی اے) پر مشتمل ہیں۔ یو 1، یو 2 اور یو 4 ایس این آر این اے نقل میں شناخت شدہ پیش گوئی شدہ ایس ایم بائنڈنگ سائٹس اس اتفاق رائے سے مختلف ہیں۔ فنکشن سی ایلیگنس میں، ایس ایم وائی آر این اے اسپلیسوسوم کے ساتھ اور ایس ایم، ایس ایل 75 پی، اور ایس ایل 26 پی پروٹین کے ساتھ ہم آہنگ ہوتے ہیں، جبکہ بہتر خصوصیات والے سی ایلیگنس ایس ایل 1 ٹرانس اسپلیسنگ ایس این آر این اے ایس ایم، ایس ایل 75 پی، اور ایس ایل 21 پی (ایس ایل 26 پی کا ایک پیرالاگ) کے ساتھ ایک کمپلیکس میں ہم آہنگ ہوتے ہیں۔ SL21p یا SL26p کے فنکشن کا نقصان انفرادی طور پر صرف ایک کمزور سرد حساس فینوٹائپ کا سبب بنتا ہے، جبکہ دونوں کا ناک ڈاؤن مہلک ہے، جیسا کہ SL75p ناک ڈاؤن ہے۔ ان نتائج کی بنیاد پر، خیال کیا جاتا ہے کہ ایس ایم وائی آر این اے ٹرانس اسپلیسنگ میں کام کرتے ہیں۔ حوالہ جات بیرونی روابط غیر کوڈنگ آر این اے چھوٹے جوہری آر این اے اسپلیسنگ نیماٹوڈ نیوکلک ایسڈ