C5orf24
C5orf24 (کروموسوم 5 اوپن ریڈنگ فریم 24) انسانوں میں C5orf24 جین (5q31.1) کے ذریعے انکوڈ شدہ ایک پروٹین ہے۔ C5orf24 بنیادی طور پر مرکزے میں مقامی ہے اور ممالیہ جانوروں، پرندوں، رینگنے والے جانوروں، آبی حیات اور مچھلیوں میں آرتھولوگس کے ساتھ انتہائی محفوظ ہے۔ جین ہیومن C5orf24 ایک پروٹین کوڈنگ جین ہے جو 26,133 بیس جوڑے لمبے (chr 5:134,833، 603-134,859، 735) دو ایکسون اور لوکس 5q31.1 پر ایک انٹرن پر مشتمل ہے جو پلس اسٹرینڈ پر مبنی ہے۔ جین کے متبادل نام FLJ37562 اور LOC134553 ہیں۔ C5orf24 کے پڑوسی جینوں میں DDX46، RPL34P13، اور TXNDC15 شامل ہیں۔ ٹرانسکرپشن کے کچھ عوامل جو پروموٹر ریجن (GXP _ 7545710) پر محفوظ سائٹس سے منسلک ہونے کی پیش گوئی کرتے ہیں وہ ہیں NRF1، E2F، ZF5، اور AHR۔ نقل انسانی C5orf24 جین میں تین mRNA نقل کی قسمیں ہیں۔ ٹرانسکرپٹ ورژن 1 اور 2 دونوں پروٹین آئسوفارم 1 کو انکوڈ کرتے ہیں جس کی لمبائی 188 امینو ایسڈ ہوتی ہے۔ ٹرانسکرپٹ ورژن 1 سب سے طویل اور اعلی ترین معیار کا ٹرانسکرپٹ (5083 نیوکلیوٹائڈز) ہے جس میں ٹرانسکرپٹ ورژن 2 (4896 نیوکلیوٹائڈز) چھوٹا 5 'یو ٹی آر خطہ ہے۔ ٹرانسکرپٹ ورژن 3 میں اندرونی حصے کا فقدان ہے جس کے نتیجے میں ایک متبادل ٹرانسلیشنل اسٹاپ کوڈن بنتا ہے جس سے یہ سب سے مختصر ورژن (3054 نیوکلیوٹائڈز) ہوتا ہے جو چھوٹے پروٹین آئسوفارم 2 کو انکوڈنگ کرتا ہے جس کی لمبائی 155 امینو ایسڈ ہوتی ہے۔ یو پی ایف 0461 پروٹین C5orf24 کا پروٹین آئسوفارم 1 188 امینو ایسڈ ہے جو ایکسون 2 کے ذریعے طویل انکوڈ کیا گیا ہے۔ اس میں امینو ایسڈ کی پوزیشنوں 1-20 اور 79-142 پر بالترتیب دو بے ترتیب علاقے ہوتے ہیں۔ دوسرے بے ترتیب علاقے میں اندرونی تکرار کا ایک سلسلہ شامل ہے۔ انسانی پیش رو پروٹین کے تقریبا 10 کے آئسو الیکٹرک پوائنٹ کے ساتھ 20.1 کے ڈی اے ہونے کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ امیونو بلوٹنگ نے تجرباتی سالماتی وزن تقریبا 25 کے ڈی اے ہونے کا مظاہرہ کیا۔ Ser37، Ser121، اور Ser180 میں تین تجرباتی فاسفوریلیشن سائٹس کی اطلاع دی گئی ہے اور ساتھ ہی Lys146 میں ہر جگہ موجود سائٹ کے شواہد بھی ملے ہیں۔ امینو ایسڈ پوزیشن 79-83 (کے کے کے کے) پر ایک محفوظ نیوکلیئر لوکلائزیشن سگنل کی تصدیق اینٹی-سی 5 او آر ایف 24 اینٹی باڈیز کا استعمال کرتے ہوئے امیونو فلوریسنس تجربات کے ذریعے کی گئی تھی جو نیوکلیوپلازم میں لوکلائزیشن کی عکاسی کرتے ہیں۔ افینیٹی کرومیٹوگرافی اور اینٹی ٹیگ کویمیونوپریسیپیٹیشن تجربات سے پتہ چلتا ہے کہ C5orf24 ممکنہ طور پر متعدد دیگر پروٹینوں کے ساتھ تعامل کرتا ہے جن میں STK11، CAB39، LYK5، PPNOX1، اور PBX1 شامل ہیں۔ ارتقاء کی تاریخ آرتھولوگس C5orf24 پروٹین پودوں یا پھپھوندی میں موجود نہیں ہے لیکن آرتھولوگس ممالیہ جانوروں، پرندوں، رینگنے والے جانوروں، آبی حیات کے ساتھ ساتھ ہڈی والی مچھلی (اوسٹیچتھیس) اور کارٹیلاجینس مچھلی (کونڈریچتھیس) میں پائے گئے ہیں۔ جبڑے کے بغیر مچھلیوں (اگناتھا) اور invertebrates میں ایک آرتھولوگس ڈومین کے ثبوت موجود ہیں۔ C5orf24 (NP_001129058.1)، سائٹوکروم c (NP_061820.1) جس میں ارتقاء کی سست شرح ہے، اور فبرینوجن الفا (NP_000499.1) جس میں ارتقاء کی تیز شرح ہے، کے درمیان m اقدار (انحراف کی درست شرح) کا موازنہ ظاہر کرتا ہے کہ یہ پروٹین کافی سست شرح سے تیار ہوا ہے خاص طور پر جب مچھلی کے سلسلے کو خارج کیا جاتا ہے۔ متوازی C5orf24 جین میں کوئی متوازی نہیں ہے۔ تحفظ متعدد ترتیب کی صف بندی سے پتہ چلتا ہے کہ C5orf24 پروٹین انتہائی محفوظ کیا گیا ہے اور ممکنہ طور پر تقریبا 465 ملین سال پہلے کارٹلیجینس مچھلیوں میں پیدا ہوا ہے۔ دوسرے بے ترتیب خطے میں اندرونی تکرار کا ایک سلسلہ اضافی طور پر جبڑے کے بغیر مچھلیوں اور invertebrates کے اندر پائے جانے والے پروٹین میں شناخت کیا گیا، جس سے پتہ چلتا ہے کہ ایک آرتھولوگس ڈومین ارتقائی تاریخ میں اور بھی پہلے شروع ہوا تھا۔ طبی اہمیت ایکسپریشن C5orf24 ہر جگہ محدود ٹشو کی تغیر پذیری کے ساتھ ظاہر ہوتا ہے۔ مائکرو ارے سے تشخیص شدہ ٹشو کے اظہار کے نمونوں سے ظاہر ہوتا ہے کہ سوزش کے ماحول میں C5orf24 کی سطح کم ہو رہی ہے جیسے کہ ٹبیل مسکولر ڈسٹروفی کے مریضوں اور موٹاپے کے شکار بچوں میں۔ جینوٹائپ-فینوٹائپ ارتباط اگرچہ اس جین کو ابھی تک سائنسی برادری نے اچھی طرح سے نہیں سمجھا ہے، لیکن کچھ جینوٹائپ-فینوٹائپ ارتباط قائم کیے گئے ہیں جن میں پی ٹی ایس ڈی والے افراد میں سی 5 او آر ایف 24 کا اپ ریگولیشن اور بہتر علامات والے افراد میں ڈاؤن ریگولیشن، سی 5 او آر ایف 24 جی سی سائٹس کی میتھیلیشن کی سطح کے درمیان ایک لکیری ارتباط منشیات کے عادی افراد میں اسکور کو منفی طور پر متاثر کرتا ہے، نیز جی ڈبلیو اے ایس کے مطالعات جو سی 5 او آر ایف 24 میں ایس این پیز کو چینی ہان آبادی اور کرون کی بیماری میں پارکنسنز کی بیماری سے وابستہ ہونے کا مظاہرہ کرتے ہیں۔ حوالہ جات جانوروں کے پروٹین