C11orf98
C11orf98 نامعلوم فعل کے انسانوں میں کروموسوم 11 پر ایک پروٹین انکوڈنگ جین ہے۔ یہ دوسری صورت میں c11orf48 کے نام سے جانا جاتا ہے۔ جین کروموسومل لوکس کو 62,662,817-62,665,210 سے پھیلاتا ہے۔ 4 ایکسون ہیں۔ یہ ڈی این اے کے 2,394 بیس جوڑوں میں پھیلا ہوا ہے اور ایک ایم آر این اے تیار کرتا ہے جو 646 بیس جوڑے لمبا ہوتا ہے۔ جین کا اظہار یہ جین بہت اعلی سطح پر ظاہر ہوتا ہے، جو اوسط جین سے 4.4 گنا زیادہ ہے۔ c11orf98 پروٹین کا اظہار بافتوں کی ایک وسیع صف میں کیا جاتا ہے۔ آر این اے-سی کیو ڈیٹ سے پتہ چلتا ہے کہ یہ جین اپینڈکس، لمف نوڈ اور تھائمس میں سب سے زیادہ ظاہر ہوتا ہے۔ پی ایس او آر ٹی II کے ذریعے کیے گئے ایک تجزیے نے یہ نتیجہ اخذ کیا کہ C11orf98 جین پروڈکٹ نیوکلئس 82.6% وشوسنییتا کے لیے مقامی ہے۔ اس نیوکلیئر لوکلائزیشن سے پتہ چلتا ہے کہ C11orf98 پروٹین کا نیوکلئس میں جین کے اظہار اور ضابطے سے متعلق ایک فنکشن ہو سکتا ہے۔ ضابطہ نقل کے کئی مختلف عوامل کی پیش گوئی کی گئی ہے جو c11orf98 جین کے اظہار کو منظم کرتے ہیں۔ نقل کے ان عوامل کی پیش گوئی جینومیٹکس کا استعمال کرتے ہوئے جین میں پائے جانے والے ڈی این اے کے سلسلے کی بنیاد پر کی گئی تھی جس نے نام اور تفصیل بھی فراہم کی تھی۔ پروٹین c11orf98 جین ایک پروٹین کو انکوڈ کرتا ہے جو 123 امینو ایسڈ لمبا ہوتا ہے۔ پروٹین کا متوقع سالماتی وزن 14.2 کے ڈی اے ہے۔ بیسال آئسو الیکٹرک پوائنٹ کا تعین 11.53 کیا گیا تھا۔ پروٹین کی سب سیلولر لوکلائزیشن نیوکلئس میں ہونے کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ ڈومین c11orf98 پروٹین نامعلوم فنکشن (DUF5564) کے علاقے پر مشتمل ہے جو امینو ایسڈ 1-98 سے پھیلا ہوا ہے۔ پروٹین کے اندر 2 بے ترتیب علاقے بھی ہیں جو امینو ایسڈ 1-21 اور 32-123 سے پھیلتے ہیں۔ C11orf98 میں 4 دو طرفہ نیوکلیئر لوکلائزیشن سگنلز (NLS _ BP) ہوتے ہیں جو اس بات کی نشاندہی کرتے ہیں کہ پروٹین کو نیوکلیئر ٹرانسپورٹ کے ذریعے سیل نیوکلئس میں درآمد کرنے کے لیے 'ٹیگ' کیا جائے گا۔ این ایل ایس _ بی پی ترتیب عام طور پر مثبت طور پر چارج شدہ ارجنائنز پر مشتمل ہوتی ہے، جو ارجنائن سے بھرپور خطے (اے آر جی _ آر آئی سی ایچ) کی بھی وضاحت کرے گی۔ ساخت c11orf98 پروٹین کے ثانوی ڈھانچوں میں متعدد الفا ہیلیکس کے ساتھ ساتھ بیٹا شیٹس ہونے کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ ترتیری ڈھانچے کی پیش گوئی الفا فولڈ پوسٹ ٹرانسلیشنل ترمیم C11orf98 پروٹین کا استعمال کرتے ہوئے کی گئی تھی جس میں ترجمہ کے بعد ترمیم کی جاتی ہے۔ سی 11 او آر ایف 98 پروٹین میں امیڈیشن سائٹ ہونے کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ یہ ایک فعال پیپٹائڈ پریکسر کلیویج سائٹ کے طور پر کام کرتا ہے۔ اس کے بعد، ایک سی اے ایم پی-اور سی جی ایم پی پر منحصر پروٹین کینیز فاسفوریلیشن سائٹ کے ساتھ ساتھ دیگر فاسفوریلیشن سائٹس جیسے کیسین کینیز II فاسفوریلیشن سائٹ اور ایک پروٹین کینیز سی فاسفوریلیشن سائٹ کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ ایک این-میرسٹائیلیشن سائٹ کی بھی پیش گوئی کی گئی تھی۔ فاسفوریلیشن اہم ہے کیونکہ سائٹ میں ایک فاسفوریل گروپ شامل کیا جاتا ہے، جو صرف نیوکلئس یا سائٹوسول میں ہو سکتا ہے۔ مائیرسٹائیلیشن اہم ہے کیونکہ ایک مائیرسٹائل گروپ (فیٹی ایسڈ گروپ) کو سائٹ میں شامل کیا جاتا ہے جو ٹرانس میمبرین پروٹین یا سائٹوسولک پروٹین کو جھلی میں لنگر انداز کرنے میں مدد کرتا ہے۔ بارہ پیش گوئی شدہ او-بیٹا-جی ایل سی این اے سی گلائکوسیلیشن سائٹس تھیں۔ یہ اہم ہے کیونکہ یہ ترمیم خصوصی طور پر جھلی پروٹین اور خفیہ پروٹین کے بجائے جوہری اور سائٹوپلاسمک پروٹین پر پائی جاتی ہے۔ ایک سمویلیشن سائٹ کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ سومایلیشن ایک ترجمہ کے بعد کی ترمیم ہے جو نیوکلیئر-سائٹوسولک ٹرانسپورٹ، ٹرانسکرپشنل ریگولیشن، اپوپٹوسس، پروٹین استحکام، تناؤ کا جواب، اور سیل سائیکل کے ذریعے ترقی میں شامل ہے۔ تعاملات ہومیولوجی اور ارتقاء آرتھولوگس c11orf98 جین میں 148 آرتھولوگس ہوتے ہیں۔ سب سے قدیم آرتھولوج invertebrates میں ظاہر ہوا۔ دیگر آرتھولوگ پرندوں، رینگنے والے جانوروں، امفیبیئنز، مچھلیوں اور invertebrates میں پائے گئے۔ ارتقاء کی شرح c11orf98 کے لیے نسبتا ارتقاء کی شرح فائبرینوجن الفا کی شرح سے سست ہے، لیکن سائٹوکروم c سے تیز ہے۔ یہ دائیں فائیلوجنیٹک درخت پر گراف پر دکھایا گیا ہے۔ دائیں طرف ایک فائیلوجنیٹک درخت ہے جو جین کی ارتقائی تاریخ کو ظاہر کرتا ہے۔ طبی اہمیت فی الحال، c11orf98 جین کا تعلق کسی بیماری یا طبی حالت سے نہیں ہے۔ حوالہ جات