ORF6
او آر ایف 6 ایک ایسا جین ہے جو سارس-کوو اور سارس-کوو-2 سمیت ذیلی نسل سربیکو وائرس کے کورونویرس میں وائرل آلات پروٹین کو انکوڈ کرتا ہے۔ یہ MERS-CoV میں موجود نہیں ہے۔ خیال کیا جاتا ہے کہ یہ انٹرفیرون دشمنی کے ذریعے وائرل انفیکشن کے خلاف مدافعتی نظام کے ردعمل کو کم کرتا ہے۔ ساخت او آر ایف 6 پروٹین سارس-کوو میں 63 امینو ایسڈ کے باقیات اور سارس-کوو-2 میں 61 پر کافی چھوٹا ہے۔ او آر ایف 6 کی ترتیب اچھی طرح سے محفوظ نہیں ہے اور دونوں وائرسوں کے درمیان اس کی نسبتا کم ترتیب کی شناخت تقریبا 66 فیصد ہے۔ اس میں ایک ایمفیپیتھک این-ٹرمینل الفا ہیلکس ہوتا ہے جو جھلی کے ساتھ منسلک ہوتا ہے، لیکن یہ ٹرانس میمبرین پروٹین نہیں ہے۔ اس کی تقریبا 20 باقیات والی سی-ٹرمینل دم قطبی ہے اور سائٹوسول تک پھیلی ہوئی ہے، اور اس میں پروٹین کی اسمگلنگ کے لیے سگنل کے سلسلے ہوتے ہیں۔ اظہار اور لوکلائزیشن دیگر آلات پروٹینوں کے جینوں کی طرح، او آر ایف 6 جین ان کے قریب واقع ہے جو ساختی پروٹین کو انکوڈنگ کرتے ہیں، کورونا وائرس آر این اے جینوم کے 5 'سرے پر۔ او آر ایف 7 اے، او آر ایف 7 بی، اور او آر ایف 8 کے ساتھ، او آر ایف 6 جھلی (ایم) اور نیوکلیوکیپسڈ (این) جین کے درمیان واقع ہے۔ یہ اینڈوپلاسمک ریٹیکولم اور گولگی اپریٹس میں مقامی ہے، سارس-کوو-2 میں ہونے والے مطالعات سے بھی آٹوفگوسومز اور لائسوسومز جیسے پھپھوندی کے ساتھ تعلق کی نشاندہی ہوتی ہے۔ فنکشن او آر ایف 6 پروٹین کا بنیادی کام امیونو ماڈیولیشن اور انٹرفیرون دشمنی سمجھا جاتا ہے۔ یہ وائرل ریپلیکیشن کے لیے ضروری نہیں ہے، حالانکہ اس کی عدم موجودگی سے ریپلیکیشن کی کارکردگی کم ہوتی دکھائی دیتی ہے۔ سارس-کوو میں وائرل پروٹین کے تعاملات کے مطالعے سے پتہ چلتا ہے کہ او آر ایف 6 پروٹین ایک اور وائرل آلات پروٹین، او آر ایف 9 بی پروٹین کے ساتھ پروٹین-پروٹین کے تعاملات کو ظاہر کرتا ہے۔ سارس-کوو میں، لیکن ریکومبیننٹ میورین ہیپاٹائٹس وائرس میں نہیں، او آر ایف 6 پروٹین کا پتہ وائرس جیسے ذرات اور بالغ وائرینز میں لگایا گیا ہے، جس سے پتہ چلتا ہے کہ یہ ایک معمولی وائرل ساختی پروٹین ہو سکتا ہے۔ مدافعتی اثرات سارس-کوو اور سارس-کوو-2 دونوں کا او آر ایف 6 پروٹین ایک انٹرفیرون مخالف ہے اور خیال کیا جاتا ہے کہ یہ مدافعتی فرار میں ملوث ہے۔ میزبان سیل پروٹین کے ساتھ کئی پروٹین-پروٹین تعاملات کو اس اثر میں ثالثی کے لیے بیان کیا گیا ہے۔ یہ اطلاع دی گئی ہے کہ یہ ایس ٹی اے ٹی ٹرانسکرپشن فیکٹر کی جوہری درآمد کو روکتا ہے، جو انٹرفیرون ایکٹیویشن کو روکتا ہے۔ سارس-کوو رپورٹ کے مطالعے میں اس کی ثالثی او آر ایف 6 پروٹین کو کیریوفینز سے باندھ کر کی جا سکتی ہے۔ سارس-کوو-2 میں، او آر ایف 6 پروٹین مبینہ طور پر آر اے ای 1 اور این یو پی 98 کے ساتھ تعامل کرتا ہے، جو کیریوفین کے تعاملات کو روکتا ہے۔ حوالہ جات کورونویرس پروٹین