FET protein family
ایف ای ٹی پروٹین خاندان (جسے ٹی ای ٹی پروٹین خاندان بھی کہا جاتا ہے) تین اسی طرح کے ساخت اور کام کرنے والے پروٹین پر مشتمل ہوتا ہے۔ وہ اور ایف ای ٹی جین خاندان کے جین جو انہیں انکوڈ کرتے ہیں (یعنی۔ پری میسنجر آر این اے تشکیل دیتے ہیں جو ان کی پیداوار کے لیے ذمہ دار میسنجر آر این اے میں تبدیل ہوتے ہیں) یہ ہیں: 1) ای ڈبلیو ایس آر 1 جین کے ذریعے انکوڈ کردہ ای ڈبلیو ایس آر 1 پروٹین (جسے ایونگ سارکوما آر این اے بائنڈنگ پروٹین، ای ڈبلیو ایس آر این اے بائنڈنگ پروٹین 1، یا bK984G1.4 جین بھی کہا جاتا ہے) جو بینڈ 12.2 پر واقع ہے (یعنی۔ "ق") کروموسوم کا بازو 22 ؛ 2) ایف یو ایس (یعنی۔ کروموسوم 16 کے چھوٹے بازو پر بینڈ 16 پر واقع ایف یو ایس جین کے ذریعے انکوڈ شدہ پروٹین (جسے ایف یو ایس آر این اے بائنڈنگ پروٹین، ٹی ایل ایس، اے ایس ٹی ایل ایس، اے ایل ایس 6، ای ٹی ایم 4، ایف یو ایس 1، پی او ایم پی 75، اے ایل ٹی ایف یو ایس، یا ایچ این آر این پی پی 2 جین بھی کہا جاتا ہے) ؛ اور 3) ٹی اے ایف 15 جین کے ذریعے انکوڈ شدہ ٹی اے ایف 15 پروٹین (جسے ٹی اے ٹی اے باکس بائنڈنگ پروٹین سے وابستہ عنصر 15، این پی ایل 3، آر بی پی 56، ٹی اے ایف 2 این، یا ٹی اے ایف آئی آئی 68 جین بھی کہا جاتا ہے) جو کروموسوم 7 کے لمبے بازو پر بینڈ 12 پر واقع ہے۔ اس پروٹین خاندان کا نام ایف ای ٹی ایف یو ایس، ای ڈبلیو کے پہلے حروف سے ماخوذ ہے۔ جانچ شدہ تقریبا تمام بافتوں میں ایف ای ٹی پروٹین کا بھرپور اظہار ہوتا ہے۔ وہ آر این اے بائنڈنگ پروٹین ہیں۔ اپنے آر این اے کے اہداف کے پابند ہونے سے، وہ ان کے ضابطے میں حصہ ڈالتے ہیں: a) پری میسنجر آر این اے میں جینوں کی نقل، پری میسنجر آر این اے کو بالغ میسنجر آر این اے میں تقسیم کرنا، اور ان کے بنیادی خلیوں کے مختلف علاقوں کے درمیان ان آر این اے کی نقل و حمل ؛ b) مائیکرو آر این اے کی پروسیسنگ جو آر این اے کو خاموش کرنے اور جین کے اظہار کے نقل و حمل کے بعد کے ضابطے میں شامل ہیں ؛ اور 3) خراب ڈی این اے کا پتہ لگانے اور مرمت۔ ان متعدد، پیچیدہ، اور اکثر نامکمل طور پر سمجھے جانے والے اعمال کے ذریعے، ایف ای ٹی فیملی پروٹین متنوع جینوں کے سیلولر اظہار کو منظم کرتے ہیں۔ تاہم، ایف ای ٹی پروٹین کے جین اکثر مختلف قسم کے تغیرات سے گزرتے ہیں۔ اگرچہ یہ تغیرات اور وہ بیماریاں جن سے وہ وابستہ ہیں ان بیماریوں سے متعلق ویکیپیڈیا کے صفحات میں پایا جا سکتا ہے، یہ مضمون ایک قسم کی تغیرات، فیوژن جین اتپریورتن پر مرکوز ہے۔ فیوژن جین دو پہلے سے آزاد جینوں سے تشکیل پاتے ہیں جو کروموسوم کی منتقلی، کروموسوم میں کچھ جینیاتی مواد کے حذف ہونے، یا کروموسومل الٹ کی وجہ سے متحد ہو جاتے ہیں۔ مثال کے طور پر، ای ڈبلیو ایس آر 1-ایف ایل 1 فیوژن جین کروموسومل ٹرانسلوکیشن کے ذریعے بنایا جاتا ہے جو عام طور پر کروموسوم 22 کے لمبے (یا "کیو") بازو کے بینڈ 12 پر واقع ای ڈبلیو ایس آر 1 جین کے حصے کو ایف ایل آئی 1 ای ٹی ایس ٹرانسکرپشن فیکٹر فیملی جین کے حصے کے ساتھ ضم کرتا ہے جو عام طور پر کروموسوم 11 کے لمبے بازو کے بینڈ 24 پر واقع ہوتا ہے۔ ای ڈبلیو ایس آر 1-ایف ایل آئی 1 فیوژن جین ایک ای ڈبلیو ایس-ایف ایل آئی 1 چیمیرک پروٹین کو انکوڈ کرتا ہے جس میں غیر منظم اور ضرورت سے زیادہ ایف ایل آئی 1 ٹرانسکرپشن فیکٹر سرگرمی ہوتی ہے جو بظاہر ایونگ سارکوما کی نشوونما میں معاون ثابت ہوتی ہے۔ ایف ای ٹی فیوژن جینوں نے حالیہ دلچسپی کو اپنی طرف متوجہ کیا ہے کیونکہ ان کا تعلق میسنشیمل ٹشو خلیوں سے حاصل ہونے والے نرم ٹشو نیوپلاسم کی ایک وسیع رینج سے پایا گیا ہے، اور وہ اس کی نشوونما کو فروغ دینے کے لیے کام کر سکتے ہیں۔ ایف ای ٹی جین پر مشتمل فیوژن جین کا پتہ لگانا ٹیومر کی اقسام کی تشخیص میں انتہائی مددگار ہے، ان پیتھوجینک میکانزم کی وضاحت کرتا ہے جس کے ذریعے یہ فیوژن پروٹین عوارض کو فروغ دیتے ہیں، اور اس طرح ان عوارض کے علاج کے لیے ممکنہ اہداف کی نشاندہی کرتے ہیں۔ مہلک اور غیر معمولی نیوپلاسٹک ٹیومر کے ساتھ ان فیوژن جینز کی وابستگی کی درج ذیل مثالیں ہیں۔ مہلک نوپلاسم ایوینگ سارکوما: ایوینگ سارکوما کی کلاسیکی شکل کے تقریبا تمام معاملات میں ٹیومر کے خلیات ہوتے ہیں جو ایک فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں جو ایف ای ٹی فیملی جین کے حصے کو ای ٹی ایس ٹرانسکرپشن فیکٹر فیملی جین (یعنی۔ ایک FLI1، ERG، ETV1، ETV4، یا FEV جین)۔ یہ فیوژن جین 80-85% معاملات میں EWSR1-FLI1 فیوژن جین یا 5 سے 10 فیصد معاملات میں EWSR1-ERG فیوژن جین ہیں۔ کلاسیکی ایونگ سارکوما ٹیومر خلیوں کے نایاب معاملات ای ٹی وی 1، ای ٹی وی 4، یا ایف ای وی جین سے جڑے ہوئے ای ڈبلیو ایس آر 1 یا ایف یو ایس جین کا اظہار کرتے ہیں۔ ایوینگ سارکوما کے گول سیل سارکوما قسم میں نیوپلاسٹک خلیات (جسے بعض اوقات این ایف اے ٹی سی 2-دوبارہ ترتیب شدہ سارکوما کہا جاتا ہے) ایک ایف ای ٹی فیملی جین پر مشتمل فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں جو ایک ایسے جین سے جڑا ہوتا ہے جو ای ٹی ایس ٹرانسکرپشن فیملی جین نہیں ہے۔ یہ فیوژن جین ای ڈبلیو ایس آر 1-این ایف اے ٹی سی 2، ایف یو ایس-این ایف اے ٹی سی 2، اور ای ڈبلیو ایس آر 1-پی اے ٹی زیڈ 1 ہیں۔ مائیکسوئڈ لیپوسرکوما: ان ٹیومر کے نیوپلاسٹک خلیات بیماری کے غیر معمولی معاملات میں 90 فیصد میں ایف یو ایس-ڈی ڈی آئی ٹی 3 فیوژن جین یا ای ڈبلیو ایس آر 1-ڈی ڈی آئی ٹی 3 فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں۔ انجیومیٹائڈ فائبرس ہسٹیوسیٹوما: ان ٹیومرز میں نیوپلاسٹک خلیات زیادہ تر معاملات میں ای ڈبلیو ایس آر 1-سی آر ای بی 1 فیوژن جین یا ای ڈبلیو ایس آر 1-سی آر ای بی، ایف یو ایس-سی آر ای بی، ای ڈبلیو ایس آر 1-اے ٹی ایف 1، ایف یو ایس-اے ٹی ایف 1، ڈبلیو ایس آر 1-سی آر ای ایم، یا بیماری کے غیر معمولی معاملات میں ایف یو ایس-سی آر ای ایم فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں۔ FET-CREB فیوژن کے ساتھ انٹراکرینیئل میسینکائمل ٹیومر: یہ ٹیومر انجیومیٹائڈ فائبرس ہسٹیوسیٹوما ٹیومر کی ایک قسم ہونے کا مشورہ دیا جاتا ہے۔ تعریف کے مطابق، ان تمام ٹیومرز میں نیوپلاسٹک خلیات ایف ای ٹی-سی آر ای بی فیوژن جینز کا اظہار کرتے ہیں۔ 20 رپورٹ شدہ کیسوں میں سے، ان ٹیومر کے نیوپلاسٹک خلیوں میں فیوژن جین ای ڈبلیو ایس آر 1-اے ٹی ایف 1 (8 کیس)، ای ڈبلیو ایس آر 1-سی آر ای بی 1 (7 کیس)، ای ڈبلیو ایس آر 1-سی آر ای ایم (4 کیس)، اور ایف یو ایس-سی آر ای ایم (1 کیس) تھے۔ پرائمری پلمونری میکسوئڈ سارکوما: ان انتہائی نایاب ٹیومرز کے 27 رپورٹ شدہ کیسوں میں سے 17 نے ای ڈبلیو ایس آر 1-سی آر ای بی 1 کا اظہار کیا اور 1 نے اپنے نیوپلاسٹک خلیوں میں مزید وضاحت شدہ ای ڈبلیو ایس آر 1 جین کی تشکیل نو کا اظہار کیا۔ کلیئر سیل سارکوما: اس ٹیومر کے نیوپلاسٹک خلیوں نے زیادہ تر معاملات میں ای ڈبلیو ایس آر 1-اے ٹی ایف 1 فیوژن جین یا ای ڈبلیو ایس آر 1-سی آر ای بی 1، ای ڈبلیو ایس آر 1-سی آر ای ایم، یا ای ڈبلیو ایس آر 1-ڈی ڈی آئی ٹی 3 فیوژن جین کا اظہار کیا۔ کلیئر سیل سارکوما جیسا معدے کا ٹیومر (جسے معدے کا نیورویکٹوڈرمل ٹیومر بھی کہا جاتا ہے): ان ٹیومر میں نیوپلاسٹک خلیات بالترتیب> 50 ٪ یا ~25% معاملات میں EWSR1: ATF1 یا EWSR1: CREB1 فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں۔ میسوتھیلوما: ان ٹیومرز کے ایک چھوٹے سے ذیلی سیٹ میں نیوپلاسٹک خلیات ہوتے ہیں جو ای ڈبلیو ایس آر 1-سی آر ای بی فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں یا، کم صورتوں میں، ایف یو ایس-سی آر ای بی فیوژن جین۔ میوپیٹیلیوما: ان ٹیومرز میں سے تقریبا 50 فیصد میں نیوپلاسٹک خلیات ہوتے ہیں جو ایک فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں جو ای ڈبلیو ایس آر 1 جین پر مشتمل ہوتا ہے جو پی بی ایکس 1، پی بی ایکس 3، زیڈ این ایف 444، پی او یو 5 ایف 1، اے ٹی ایف 1، یا کے ایل ایف 17 جین سے جڑا ہوتا ہے یا کم عام صورتوں میں ایف یو ایس جین مؤخر الذکر جینوں میں سے کسی ایک سے جڑا ہوتا ہے۔ سکلیروزنگ ایپیٹیلائڈ فائبروسرکوما: ان ٹیومرز میں نیوپلاسٹک خلیات ~30% میں EWSR1-CREB3L1 فیوژن جین، 12 فیصد میں FUS-CREB3L2 فیوژن جین، اور بیماری کے نایاب معاملات میں EWSR1-CREB3L2، EWSR1-CREB3L3، یا EWSR1-CREM فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں، اور دیگر ابھی تک EWSR1 جین میں مکمل طور پر طے شدہ ترتیب نہیں ہیں۔ کم درجے کا فائبرومیکسائڈ سارکوما: ان ٹیومرز میں موجود نیوپلاسٹک خلیات اکثریت میں ایف یو ایس-سی آر ای بی 3 ایل 2 فیوژن جین یا اقلیتی معاملات میں ایف یو ایس-سی آر ای بی 3 ایل 1، ای ڈبلیو ایس آر 1-سی آر ای بی 3 ایل 2، یا ای ڈبلیو ایس آر 2-سی آر ای بی ایل 1 فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں۔ ایکسٹراسکیلیٹل میکسوئڈ کونڈروسرکوما: یہ ٹیومر کے نیوپلاسٹک خلیات زیادہ تر معاملات میں ای ڈبلیو ایس آر 1-این آر 4 اے 3 فیوژن جین یا بیماری کے کبھی کبھار معاملات میں ٹی اے ایف 15-این آر 4 اے 3 کا اظہار کرتے ہیں۔ ای ڈبلیو ایس آر 1-ایس ایم اے ڈی 3 مثبت فائبربلاسٹک ٹیومر: یہ ٹیومر، جو حال ہی میں مخصوص کلینیکوپیتھولوجیکل خصوصیات کے ساتھ نیوپلازم کی خصوصیت رکھتے ہیں، فی الحال ان کے نیوپلاسٹک خلیوں میں ای ڈبلیو ایس آر 1-ایس ایم اے ڈی 3 فیوژن جین کے اظہار سے بیان کیے جاتے ہیں۔ ایپی تھیلائڈ اور اسپنڈل سیل رابڈومیوسرکوما ای ڈبلیو ایس آر 1/ایف یو ایس-ٹی ایف سی پی 2 فیوژن کے ساتھ: ان نئے بیان کردہ ٹیومرز کو رابڈومیوسرکوما کا ایک چھوٹا سا ذیلی سیٹ سمجھا جاتا ہے جس میں تعریف کے مطابق نیوپلاسٹک خلیات ہوتے ہیں جو ای ڈبلیو ایس آر 1-ٹی ایف سی پی 2 یا ایف یو ایس-ٹی ایف سی پی 2 فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں۔ سادہ ہڈی کا سسٹ (جسے یونیکیمرل ہڈی کا سسٹ بھی کہا جاتا ہے): ان ٹیومرز کے ایک ذیلی سیٹ میں نیوپلاسٹک خلیات ہوتے ہیں جو ایف یو ایس-این ایف اے ٹی سی 2 یا ای ڈبلیو ایس آر 1-این ایف اے ٹی سی 2 فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں۔ ایک حالیہ تحقیق میں بتایا گیا ہے کہ ان سسٹوں میں موجود نیوپلاسٹک خلیوں نے چار میں ایف یو ایس-این ایف اے ٹی سی 2 فیوژن جین اور نو ٹیسٹ کے معاملات میں سے دو میں ای ڈبلیو ایس آر 1-این ایف اے ٹی سی 2 فیوژن جین کا اظہار کیا۔ ای ڈبلیو ایس آر 1-این ایف اے ٹی سی 1 فیوژن کے ساتھ ہڈی کا ہیمانجیوما: یہ نایاب ٹیومر ہیمانجیوما کا ایک ذیلی مجموعہ ہیں جو تعریف کے مطابق ہڈی کے بافتوں میں ہوتے ہیں اور نیوپلاسٹک خلیوں پر مشتمل ہوتے ہیں جو ای ڈبلیو ایس آر 1-این ایف اے ٹی سی 1 فیوژن جین کا اظہار کرتے ہیں۔ حوالہ جات کینسر آر این اے بائنڈنگ پروٹین سے وابستہ اتپریورتن جین کینسر بینین نیوپلاسم