C3orf38
کروموسوم 3 اوپن ریڈنگ فریم 38 (C3orf38) ایک پروٹین ہے جسے انسانوں میں C3orf38 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ C3orf38 جین آگے کے اسٹرینڈ پر کروموسوم 3 (3p11.1) پر واقع ہے۔ یہ chr 3:88,149، 959-88,168، 729 سے 18,771 اڈوں پر پھیلا ہوا ہے۔ اس میں 3 ایکسون ہوتے ہیں۔ اس جین کے عام عرفی نام ایم جی سی 26717، ایل او سی 285237، اور ایف ایل جے 54270 ہیں۔ C3orf38 کے پڑوسی جینوں میں سے کچھ میں ZNF654، CGGBP1، اور LOC105377202 شامل ہیں۔ نقل پروٹین C3orf38 پروٹین لمبائی میں 329 امینو ایسڈ ہے۔ نامعلوم فنکشن کا ایک بڑا ڈومین، DUF4518، C3orf38 پروٹین کی اکثریت پر مشتمل ہے۔ یہ ڈومین پروٹین فیملی pfam15008 کا ایک حصہ ہے، جس کے بارے میں خیال کیا جاتا ہے کہ وہ اپوپٹوسس ریگولیشن میں شامل ہے۔ یہ پی ایف اے ایم 15008 سی ایل 20886 سپر فیملی کا واحد رکن ہے۔ اگرچہ C3orf38 پروٹین میں مجموعی طور پر کوئی غیر معمولی امینو ایسڈ کی کثرت نہیں ہے، لیکن ساختیاتی تجزیے کے مطابق DUF4518 میں ہسٹائڈائنز کی زیادہ کثرت اور سیرائنز کی کم کثرت ہے۔ پورے C3orf38 پروٹین کا پیش گوئی شدہ سالماتی وزن 37. kD ہے اور آئسو الیکٹرک پوائنٹ 6.51 ہے۔ C3orf38 پروٹین کے اندر موجود DUF4518 کا متوقع سالماتی وزن 31 kD اور آئسو الیکٹرک پوائنٹ 6.49 ہے۔ ریگولیشن جین لیول ریگولیشن C3orf38 جین کے لیے متعدد ممکنہ پروموٹروں کی نشاندہی کی گئی ہے، جو نیچے دیے گئے جدول میں بیان کیے گئے ہیں۔ C3orf38 جین انسانی بافتوں میں ہر جگہ اظہار ظاہر کرتا ہے۔ پروٹین کی سطح کا ضابطہ C3orf38 پروٹین کے سائٹوپلازم میں سب سے زیادہ اعتماد کے ساتھ پائے جانے کی توقع ہے۔ اس دریافت کی تائید C3orf38 آرتھولوگس کی ایک صف کے معائنے سے ہوتی ہے۔ انسانی C3orf38 پروٹین اور اس کے آرتھولوگس کے درمیان کئی اچھی طرح سے محفوظ پوسٹ ٹرانسلیشن ترمیم سائٹس پائی جاتی ہیں، جنہیں نیچے دیے گئے جدول میں دکھایا گیا ہے۔ ان میں سے زیادہ تر پی ٹی ایم پی کے سی فاسفوریلیشن سائٹس ہیں۔ مزید برآں، C3orf38 پروٹین میں دو تصدیق شدہ فعال مقامات واقع ہیں۔ پہلا ایک ایلڈیہائیڈ ڈی ہائیڈروجنیز گلوٹامک ایسڈ فعال سائٹ ہے جو امینو ایسڈ 1-8 سے واقع ہے۔ دوسری سائٹ ایک یوکرائیوٹک تھائول (سسٹین) پروٹیسیس ہسٹائڈائن فعال سائٹ ہے جو امینو ایسڈ 227-237 سے واقع ہے۔ C3orf38 پروٹین کے لیے ہومیولوجی/ارتقاء آرتھولوگس BLAST سرچز کا استعمال کرتے ہوئے ممالیہ جانوروں، رینگنے والے جانوروں، پرندوں، امفیبیئنز، مچھلیوں اور invertebrates میں پائے جا سکتے ہیں۔ ان آرتھولوگس کا انتخاب نیچے آرتھولوگ ٹیبل میں پایا جا سکتا ہے۔ کوئی پیرالاگ نہیں ہیں۔ مزید برآں، سائٹوکروم سی اور فائبرینوجن الفا پروٹین کے ساتھ C3orf38 پروٹین کے سلسلے کا موازنہ کرکے، C3orf38 پروٹین کے لیے ارتقاء کی اعتدال پسند شرح کا تعین کیا گیا۔ فنکشن اگرچہ C3orf38 جین کے فنکشن کی تحقیقات جاری ہے، لیکن چند مطالعات نے اس کے کردار کے بارے میں قیمتی بصیرت فراہم کی ہے۔ ایک مطالعہ نے C3orf38 کو امیدوار پروپوپٹوٹک جین کے طور پر شناخت کیا ہے۔ ایک اور مطالعہ نے C3orf38 کو ٹاپ کینڈیڈیٹ ٹیومر سپریسر جین (TSG) کے طور پر شناخت کیا۔ مختلف پروٹینوں میں سے C3orf38 پروٹین کے ساتھ تعامل، دو خاص طور پر دلچسپ ہیں کیونکہ C3orf38 ایک امیدوار پرواپپٹوٹک اور ٹیومر دبانے والا جین ہے۔ سب سے پہلے، بی اے جی فیملی مالیکیولر چیپرون ریگولیٹر 4 (بی اے جی 4) ایک اینٹی اپوپٹوٹک پروٹین ہے جو متعدد اپوپٹوسس اور نشوونما سے متعلق پروٹین کے ساتھ تعامل کرنے کے لیے جانا جاتا ہے۔ دوسرا، ڈی این اے جے ہیٹ شاک پروٹین فیملی ممبر بی 4 (ڈی این اے جے بی 4) ہیٹ شاک پروٹین-40 فیملی (ایچ ایس پی 40)، ایک مالیکیولر چیپرون، اور ٹیومر سپریسر (خاص طور پر کولوریکٹل کارسنوما کے لیے) کا رکن ہے۔ حوالہ جات