MFSD6L
6 لائک (ایم ایف ایس ڈی 6 ایل) پر مشتمل میجر فیسیلیٹیٹر سپر فیملی ڈومین انسانوں میں ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین کے ذریعے انکوڈ شدہ ایک پروٹین ہے۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین ایک ٹرانس میمبرین پروٹین ہے جو بڑے سہولت کار سپر فیملی (ایم ایف ایس) کا حصہ ہے جو سیل میمبرینز میں چھوٹے سالیوٹس کی نقل و حمل کو آسان بنانے کے لیے کیمیوسموٹک گریڈینٹس کا استعمال کرتا ہے۔ انسانی جینوم میں، ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین کروموسوم 17 (17p13.1) پر واقع ہے۔ پولی پیپٹائڈ کو انکوڈنگ کرنے والی ڈی این اے ترتیب 2,256 اڈوں پر مشتمل ہے، جو 8,797,110 bp سے 8,799,365 bp تک شروع ہوتی ہے۔ مزید برآں، جین کی ترتیب مائنس اسٹرینڈ پر رہتی ہے۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین کا ایک عرفی نام ہے جسے ایف ایل جے 35773 کہا جاتا ہے۔ انکوڈنگ ڈی این اے ترتیب کے نتیجے میں ترجمہ شدہ ایم آر این اے ترتیب میں صرف ایک ایکسون ہوتا ہے۔ ٹیومر دبانے والا جین TP53 بھی 17p13.1 پر MFSD6L کے جین پڑوس میں پایا گیا تھا۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل انکوڈنگ ترتیب میں صرف ایک ایکسون کی موجودگی کی وجہ سے ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین میں دیگر آئسوفارم نہیں پائے گئے۔ پروٹین ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کا پیشگی سالماتی وزن تقریبا 64 کے ڈی اے ہوتا ہے، جو 586 امینو ایسڈ پر مشتمل ہوتا ہے۔ ترجمہ کے بعد کی تبدیلیوں کے بعد، جیسے کہ گلائکوسیلیشن، بالغ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کا سالماتی وزن بڑھ کر 72 کے ڈی اے ہو جاتا ہے۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین پر مشتمل امینو ایسڈ میں سے، لیوسین کی سطح زیادہ تر دیگر انسانی پروٹین کے مقابلے میں بڑھ گئی تھی۔ لیوسین میں یہ اضافہ گھریلو چوہے اور چمپینزی کے ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین میں بھی موجود ہے۔ پروٹین میں 8.87 پی آئی کا آئسو الیکٹرک پوائنٹ بھی ہوتا ہے۔ پیپٹائڈ کی ترتیب 11 ٹرانس میمبرین علاقوں پر مشتمل ہے جو پلازما جھلی کو عبور کرتے ہیں۔ مزید برآں، 28 ویں اور 368 ویں انکوڈنگ امینو ایسڈ سے شروع ہونے والے دو ایم ایف ایس خطے بھی ہیں۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کی ثانوی ساخت کے لیے، 16 پیشین گوئی شدہ الفا ہیلیسیس اور 3 پیشین گوئی شدہ بیٹا شیٹس ہیں۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل کی ساخت کے اندر الفا ہیلیکس کی بڑی مقدار کو پروٹین کے ٹرانس میمبرین سولیوٹ ٹرانسپورٹر ہونے سے منسوب کیا جا سکتا ہے کیونکہ الفا ہیلیکس عام طور پر پروٹین کی ساخت کا وہ حصہ ہوتے ہیں جو سیل جھلی کے اندر واقع ہوتے ہیں۔ ترتیری ڈھانچے کے اندر، 29 ویں اور 311 ویں امینو ایسڈ پر دو سسٹین کے درمیان ڈائیسلفائیڈ بانڈ کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ اظہار اور ضابطہ جین کی سطح صرف ایک پروموٹر ریجن تھا، جو 1,107 بی پی پر پھیلا ہوا تھا، جو جینومیٹکس جین 2 پروموٹر ڈیٹا بیس کا استعمال کرتے ہوئے ایم ایف ایس ڈی 6 ایل کے لیے پایا گیا۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین کے 5 'یو ٹی آر کے آغاز کے قریب پروموٹر ریجن کے حصے کے لیے، ٹرانسکرپشن فیکٹر بائنڈنگ سائٹس پائی گئیں۔ نوٹ کا ایک ٹرانسکرپشن فیکٹر بائنڈنگ سائٹ پی 53 ٹیومر سپریسر پروٹین کا مقام تھا۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین پینکریاز، تھوک غدود اور تائیرائڈ میں بہت زیادہ ظاہر ہوا۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین کے ان سیٹو ہائبرڈائزیشن اظہار کے معائنے سے پتہ چلتا ہے کہ جین خاص طور پر ان کے متعلقہ بافتوں کے اندر غدود کے خلیوں کے اندر ظاہر ہوتا ہے۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل کا اظہار گلوکوز کی فاقہ کشی کے نتیجے میں ریگولیٹڈ پایا گیا۔ ٹرانسکرپٹ لیول چونکہ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین کے اندر صرف ایک ایکسون ہوتا ہے اور کوئی انٹرن نہیں ہوتا ہے، اس لیے ایم ایف ایس ڈی 6 ایل ایم آر این اے پر کوئی اسپلیسنگ نہیں کی جاتی ہے۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کا ترجمہ 5 'یو ٹی آر کے اختتام پر شروع ہوتا ہے، جو ایم ایف ایس ڈی 6 ایل ایم آر این اے کا پہلا 245 نیوکلیوٹائڈز ہے۔ ممالیہ آرتھولوگس میں محفوظ اسٹیم لوپ کے علاقے ہیں، جو ممکنہ می آر این اے بائنڈنگ سائٹس کا اندازہ لگاتے ہیں۔ پروٹین کی سطح ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کی ذیلی سیلولر لوکلائزیشن ڈیپ لاک ٹول کے ذریعے سیل جھلی کے اندر ہونے کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ یہ ایم ایف ایس پروٹین کی طرح ایک سالیوٹ سمپورٹر ہونے کی وجہ سے معاون ہے۔ ترجمہ شدہ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کے پہلے 28 امینو ایسڈ میں سگنل پیپٹائڈ ہوتا ہے۔ مزید برآں، پروٹین کی ترتیب کے 110 ویں، 129 ویں اور 224 ویں امینو ایسڈ پر این-گلائکوسیلیشن سائٹس کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ 429 ویں امینو ایسڈ پر ایک سیرائن فاسفوریلیشن سائٹ کی بھی پیش گوئی کی گئی تھی اور اس کی تصدیق دیگر ممالیہ آرتھولوگس کے اندر موجودگی سے کی گئی تھی۔ ارتقاء کے پیرالاگ ایم ایف ایس ڈی 6 پروٹین انسانی ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کا واحد پیرالاگ پایا گیا۔ آرتھولوگس BLAST ترتیب کے تجزیے کے ذریعے، MFSD6L پروٹین میں بہت سے ممالیہ پرجاتیوں میں آرتھولوگس پائے گئے، خاص طور پر پرائمیٹس اور اڑنے والے لومڑیوں میں۔ ریپٹیلیا اور ایمفیبیا کلاسوں میں کچھ آرتھولوگس پائے گئے، حالانکہ ان کی تعداد اتنی زیادہ نہیں تھی جتنی ممالیہ میں تھی۔ مچھلیوں میں، کارٹلیجینس مچھلیوں کے مقابلے رے فائنڈ مچھلیوں میں نمایاں طور پر زیادہ آرتھولوگس پائے گئے۔ مزید برآں، جبڑے سے خالی مچھلی، سی لیمپری، بھی ایک آرتھولوگ پائی گئی۔ invertebrates کے درمیان متعدد orthologs بھی پائے گئے، جیسے echinoderms اور mollusks۔ کیڑوں میں ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کے کوئی اہم آرتھولوگ نہیں پائے گئے ؛ تاہم بیکٹیریا میں آرتھولوگ پائے گئے۔ خاص طور پر، اینیرولینا جینس، جس میں تھرموفیلک بیکٹیریا ہوتے ہیں، انسانی پروٹین کے ساتھ آرتھولوگس پائے گئے کیونکہ اس کے ایم ایف ایس کے علاقے انسانی پروٹین میں پائے جانے والے ایم ایف ایس کے علاقوں سے ملتے جلتے ہیں۔ درج ذیل جدول انسانی ایم ایف ایس ڈی 6 ایل کے آرتھولوگس کی کچھ مثالیں دکھاتا ہے۔ ہومولوگس گومینز ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کے اندر پائے جانے والے اہم ہومولوگس ڈومینز ایم ایف ایس ریجنز ہیں۔ چونکہ ایم ایف ایس میں اس کے سپر فیملی کے اندر سالیوٹ ٹرانسپورٹر پروٹین کی ایک بڑی مقدار شامل ہوتی ہے، اس لیے بہت سے ایم ایف ایس پروٹین ایسے ہوتے ہیں جن کے یکساں ایم ایف ایس ڈومین ہوتے ہیں۔ سب سے زیادہ دور کے ہم جنس پرست BLAST ترتیب کے تجزیے کے ذریعے، سب سے زیادہ دور کے ہم جنس پرست سنڈیریا فیلم کے اندر موجود جاندار تھے، جو بنیادی طور پر جیلی فش، سمندری انیمون اور مرجان پر مشتمل ہوتے ہیں۔ ایک پرانے جداگانہ فیلم، پوریفیرا میں ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین کے لیے BLAST کے ساتھ تلاش کرتے ہوئے، کوئی یکساں ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین ظاہر نہیں ہوا۔ متوقع ظہور کی تاریخ سنیڈریا میں ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کی موجودگی اور پوریفیرا میں عدم موجودگی کے نتیجے میں، ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین کے ظہور کی تخمینہ شدہ تاریخ 687 اور 777 ایم وائی اے کے درمیان ہے، جو ٹائم ٹری سے ملنے والی انحراف کی تاریخیں ہیں۔ درست شدہ ٪ ڈائیورجنس چارٹ اور ہومو سیپینز ایم ایف ایس ڈی 6 پیرالاگ کے درست شدہ ٪ ڈائیورجنس کے حساب سے، ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کے ابھرنے کی تخمینہ شدہ تاریخ تقریبا 736 ایم وائی اے پائی گئی۔ باہمی تعامل کرنے والے پروٹین ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین میں تجرباتی طور پر تصدیق شدہ پروٹین-پروٹین تعاملات نہیں پائے گئے۔ فنکشن پولی پیپٹائڈ کی ترتیب میں بہت سے ٹرانس میمبرین ریجنز ہوتے ہیں، جو سیل کی پلازما جھلی میں سالیوٹس کی نقل و حمل کے لیے ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کو ٹرانس میمبرین پروٹین کے طور پر شناخت کرتے ہیں۔ ترتیری ساخت کی پیشن گوئی کے ٹولز سے پتہ چلتا ہے کہ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کی ساخت 1 پی وی 6 اے سے ملتی جلتی ہے، جو ایک β-گیلیکٹوسائڈز سمپورٹر ہے جو سالیوٹس کو منتقل کرنے کے لیے پروٹون گریڈینٹس کا استعمال کرتا ہے۔ نتیجے کے طور پر، ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کا فنکشن ممکنہ طور پر شوگر سمپورٹر ہو سکتا ہے۔ اس کی تائید اس حقیقت سے بھی ہوتی ہے کہ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل کے اظہار کو گلوکوز کی فاقہ کشی کی وجہ سے ریگولیٹ کیا گیا تھا۔ کلینیکل اہمیت بیماری ایسوسی ایشن ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین سے وابستہ ایک بیماری ٹیٹرولوجی آف فالٹ ہے، جو دل کے چار پیدائشی نقائص کا ایک سلسلہ ہے جو خون کی کم آکسیجنشن کا سبب بن سکتا ہے۔ یہ ایک وینٹریکلر سیپٹل عیب کی وجہ سے ہوتا ہے جو دل کے بائیں وینٹریکل میں آکسیجن والے اور ڈی آکسیجنیٹڈ خون کے اختلاط کا سبب بنتا ہے۔ ایم ایف ایس ڈی 6 ایل جین بھی پیڈیاٹرک موتیابند کی بیماری میں حصہ لینے والا امیدوار جین پایا گیا۔ متغیرات مختلف ایس این پیز ایم ایف ایس ڈی 6 ایل پروٹین کی ترتیب کی انکوڈنگ ترتیب کے اندر پائے گئے جیسا کہ ذیل میں دکھایا گیا ہے۔ حوالہ جات