C5orf49
کروموسوم 5 اوپن ریڈنگ فریم 49، جسے C5orf49 بھی کہا جاتا ہے، ایک پروٹین ہے جسے انسانوں میں C5orf49 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ C5orf49 کے عرفیت میں کروموسوم 5 اوپن ریڈنگ فریم 49، غیر خصوصیات پروٹین C5orf49 اور LOC134121 شامل ہیں۔ C5orf49 کے سیلیا میں مقامی ہونے اور سلیری افعال کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ جین C5orf49 کروموسوم 5، سائٹو بینڈ p15 پر بیس جوڑوں 7,830,378 اور 7,851,151 کے درمیان پایا جاتا ہے، یعنی اس کی لمبائی 20,774 بیس جوڑوں کی ہوتی ہے۔ اس جین کی دو اسپلیس شکلیں ہیں، ایک جس کی لمبائی 147 امینو ایسڈ ہے اور دوسرا جس کی لمبائی 145 امینو ایسڈ ہے۔ C5orf49 مائنس اسٹرینڈ پر مبنی ہے۔ C5orf49 کے پڑوسی جینوں میں فاسٹ کے ڈی 3، ایم ٹی آر آر، اور اے ڈی سی وائی 2 شامل ہیں۔ جین لیول ریگولیشن پروموٹر C5orf49 میں ایک اپ اسٹریم پروموٹر، GXP _ 1271072 ہے، جو دونوں بنیادی نقل کو منظم کرتا ہے۔ GXP _ 1271072 لمبائی میں 1,396 بیس جوڑے ہیں، جو کروموسوم 5 پر بیس جوڑے 7,851,094 سے لے کر بیس جوڑے 7,852,489 تک پھیلے ہوئے ہیں۔ 147 امینو ایسڈ کی طویل ترین نقل کے لیے ٹرانسکرپشن اسٹارٹ ریجن کروموسوم 5 پر بیس جوڑی 7,851,148 سے بیس جوڑی 7,851,164 تک پھیلا ہوا ہے۔ پروٹین ڈھانچہ C5orf49 پروٹین ڈومین DUF4541 کی موجودگی کی خصوصیت رکھتا ہے۔ اس پروٹین ڈومین کے اندر، ایک محفوظ کے ایل ایچ آر ڈی ڈی آر سیکوینس موٹف اور ایک مکمل طور پر محفوظ باقیات Y ہے جو فعال طور پر اہم ہو سکتا ہے۔ ڈومین کو تشریح شدہ تصوراتی ترجمہ پر دکھایا گیا ہے۔ پیشین گوئی شدہ خصوصیات C5orf49 کی درج ذیل خصوصیات کی پیشین گوئی بائیو انفارمیٹک تجزیہ کا استعمال کرتے ہوئے کی گئی تھی: سالماتی وزن: 17 kDa آئسو الیکٹرک پوائنٹ: 7.0 پوسٹ ٹرانسلیشنل ترمیم: چودہ پوسٹ ٹرانسلیشنل تبدیلیوں کی پیشین گوئی کی گئی ہے: پروٹین کی ترتیب پر 8، 9، 11، 80، 100، 135، اور 147 پوزیشنوں پر سات فاسفوریلیشن سائٹس 16، 39، 69، 104، 137 پر چھ ہر جگہ موجود سائٹس۔ 39 اور 104 پر دو ایسیٹیلیشن سائٹس۔ ٹشو کی تقسیم ایکسپریشن ڈیٹا پھیپھڑوں، دماغ اور ریڑھ کی ہڈی کے بافتوں میں سب سے زیادہ نمایاں طور پر اظہار کی نشاندہی کرتا ہے۔ بائنڈنگ پارٹنر سی ڈی کے این 2 ڈی، ایچ ایس ایف 2 بی پی، کے آر ٹی 31 اور کے آر ٹی 34 کو دو ہائبرڈ پری پولنگ اپروچ اور دو ہائبرڈ صفوں کے ذریعے سی 5 آر ایف 49 کے بائنڈنگ پارٹنر پائے گئے۔ پرجاتیوں کی تقسیم C5orf49 ممالیہ جانوروں کے ذریعے تحفظ کو ظاہر کرتا ہے اور آرتھولوگ فلیٹ کیڑے اور سمندری انیمون میں پائے جا سکتے ہیں۔ دائیں طرف کی میز BLAST کا استعمال کرتے ہوئے پائے جانے والے کچھ آرتھولوگس کا پھیلاؤ دکھاتی ہے۔ C5orf49 سپنجوں میں نہیں پایا جاتا ہے، جو 77.7 ملین سال پہلے (ایم وائی اے) کی درمیانی تاریخ پر جدا ہوا تھا، اور یہ اس کے سب سے دور آرتھولوگ 736 ایم وائی اے میں پایا جاتا ہے۔ لہذا، C5orf49 777 ایم وائی اے اور 736 ایم وائی اے کے درمیان جین کے طور پر الگ ہو گیا۔ ارتقاء C5orf49 سائٹوکروم C اور فائبرینوجن الفا کے مقابلے میں وقت کے ساتھ تیز یا سست ارتقاء کی شرح نہیں دکھاتا ہے۔ یہ دائیں طرف پروٹین ڈائیورجنس گراف کے ذریعے دکھایا گیا ہے۔ انسانی کروموسوم 5 پر حوالہ جات جین