C12orf50
کروموسوم 12 اوپن ریڈنگ فریم 50 (C12orf50) ایک پروٹین انکوڈنگ جین ہے جو انسانوں میں C12orf50 پروٹین کے لیے انکوڈ کرتا ہے۔ اس جین کے لیے الحاق کی شناخت NM _ 152589 ہے۔ C12orf50 کا مقام 12q21.32 ہے۔ یہ ریورس اسٹرینڈ پر 88429231 سے 88373811 (این سی بی آئی 37، اگست 2010) تک 55.42 کے بی کا احاطہ کرتا ہے۔ C12orf50 کے کچھ پڑوسی جین RPS4XP15، LOC107984542، اور C12orf29 ہیں۔ RPS4XP15 اوپر کی طرف C12orf50 ہے اور اسی اسٹرینڈ پر ہے۔ LOC107984542 اور C12orf29 دونوں نیچے کی طرف ہیں۔ LOC107984542 مخالف اسٹرینڈ پر ہے جبکہ C12orf29 اسی اسٹرینڈ پر ہے۔ C12orf50 میں چھ آئسوفارم ہیں۔ یہ صفحہ آئسوفارم X1 پر توجہ مرکوز کر رہا ہے۔ C12orf50 آئسوفارم X1 1711 نیوکلیوٹائڈز لمبا ہے اور اس میں 414 اے اے کی لمبائی والا پروٹین ہے۔ فنکشن آنٹولوجی C12orf50 کے فنکشن کی طرف اشارہ کرتی ہے کہ وہ mRNA اور پروٹین بائنڈنگ کو فعال کرنا ہے۔ یہ نیوکلئس سے پولی (اے) + ایم آر این اے کی برآمد میں بھی شامل ہے۔ آئسوفارم C12orf50 جین میں 6 آئسوفارم ہوتے ہیں۔ جین کا اظہار جینوم کے ذریعے مخصوص اظہار کے ساتھ انسانی بافتوں کے تجزیے میں، 27 مختلف بافتوں کی نمائندگی کرنے والے 95 انسانی افراد کے بافتوں کے نمونوں پر آر این اے-سی کیو کیا گیا تاکہ بافتوں کی مخصوص پروٹین کوڈنگ جینوں کا تعین کیا جا سکے کہ خصیوں کے استثناء کے ساتھ زیادہ تر انسانی بافتوں میں C12orf50 کا اظہار بہت کم ہے۔ C12orf50 کا اظہار خصیوں تک محدود تھا۔ پروٹین غیر خصوصیت والا پروٹین کروموسوم 12 اوپن ریڈنگ فریم 50 انسانوں میں ایک پروٹین ہے، جسے C12orf50 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ پروٹین تک رسائی کی شناخت Q8NA57 ہے۔ پروٹین کی لمبائی 414aa ہے۔ پروٹین کی پیش گوئی شدہ کمیت 47.2 کے ڈی اے ہے۔ پروٹین میں سی سی سی ایچ قسم کا زیڈ این فنگر ڈومین شامل ہے۔ پروٹین میں سی سی سی ایچ قسم کا زیڈ این فنگر ڈومین ہے جس میں سی-ایکس 8-سی-ایکس 5-سی-ایکس 3-ایچ موٹف ہے۔ ڈومین پروٹین کے آغاز سے شروع ہوتا ہے اور 44 ویں امینو ایسڈ میں جاتا ہے۔ پروٹین میں تین بے ترتیب علاقے بھی ہوتے ہیں جن کی لمبائی 136 ویں امینو ایسڈ سے لے کر 168 ویں تک ہوتی ہے جس کی لمبائی 33 اے اے ہوتی ہے، 297 ویں سے 333 ویں تک 37 اے اے کی لمبائی ہوتی ہے، اور 346 ویں سے 414 ویں تک 69 اے اے کی لمبائی ہوتی ہے۔ پیش گوئی شدہ سالماتی وزن 47.3 کے ڈی اے ہے اور پیش گوئی شدہ آئسو الیکٹرک پوائنٹ 8.79 ہے۔ ساخت C12orf50 کے لیے پیش گوئی شدہ ترتیری ڈھانچے میں زنک فنگر ڈومین میں پروٹین کے آغاز کی طرف دو بیٹا شیٹ اور 106-124 aa سے ایک ہیلکس ہے۔ یہ پورے ممالیہ آرتھولوگس میں محفوظ ہیں۔ کنڈلی والے علاقوں کی بھی ایک بڑی تعداد ہے۔ پروموٹر، 3 'یو ٹی آر ریجن، اور 5' یو ٹی آر بہت اچھی طرح سے محفوظ ہیں۔ امینو ایسڈ 87 سے 111 تک ہیلکس سے پہلے اور شروع میں ایک منفی کلسٹر (تیزابیت والا ڈومین) ہوتا ہے۔ لوکلائزیشن نیوکلئس میں ہونے کا امکان 47.8% اور سائٹوپلازم میں ہونے کا امکان 30.4% ہے۔ اس کی تصدیق سگما-ایلڈرچ کے ذریعے امیونو ہسٹو کیمسٹری اور امیونو فلوریسنس کے ذریعے نیوکلئس اور سائٹوپلازم دونوں میں مثبتیت ظاہر کرتے ہوئے کی گئی۔ ایک نیوکلیئر لوکیشن سگنل اور ایسڈک ڈومین ہے۔ آرتھولوگس اس بات کی بھی تصدیق کرتے ہیں کہ C12orf50 نیوکلئس اور سائٹوپلازم میں مقامی ہے۔ پروٹین کے تعاملات دو پروٹین (جی اے پی ڈی ایچ ایس اور جی او ایل جی اے 2) ہیں جو C12orf50 کے ساتھ تعامل کرتے ہیں۔ گلائسرالڈیہائیڈ-3-فاسفیٹ ڈی ہائیڈروجنیز، سپرمیٹوجینک (جی اے پی ڈی ایچ ایس) انزائم توانائی پیدا کرنے والے مختلف راستوں کے درمیان تبدیلی کو منظم کرنے میں اہم کردار ادا کر سکتا ہے، اور یہ سپرم کی حرکت پذیری اور مردانہ زرخیزی کے لیے ضروری ہے۔ ترجمہ کے بعد کی تبدیلیاں C12orf50 کی پیش گوئی کی گئی ہے کہ وہ مختلف فاسفوریلیشن، C-مینوسیلیشن، اور O-گلائکوسیلیشن سے گزرے گی۔ فاسفوریلیشن سائٹس امینو ایسڈ 262، 349 اور 370 پر ہیں۔ او-گلائکوسیلیشن سائٹس امینو ایسڈ 139، 238، اور 374 ہیں۔ سی-مینوسیلیشن سائٹس امینو ایسڈ 13، 102، 292، اور 388 ہیں۔ ارتقاء C12orf50 کی ارتقائی شرح فائبرینوجن الفا کے قریب ہے، جو اسے نسبتا تیز بناتی ہے۔ C12orf50 کے آرتھولوج ممالیہ جانوروں، رینگنے والے جانوروں، پرندوں اور امفیبیئن سیسلین میں پائے گئے ہیں۔ مینڈکوں، مچھلیوں، invertebrates، یا فنگی کے لیے کوئی آرتھولوگ نہیں پائے گئے۔ ممالیہ آرتھولوگس انسانوں کے ساتھ سب سے زیادہ مماثلت رکھتے تھے سوائے پلاٹیپس کے۔ ستنداریوں سے انسانوں کے انحراف کی حد 6.4-180 ملین سال تھی۔ رینگنے والے آرتھولوج اگلے اسی طرح کے تھے اور تقریبا 318 ملین سال پہلے الگ ہوگئے تھے۔ پھر پرندے اسی وقت انسانوں سے الگ ہو گئے جب رینگنے والے جانور تھے۔ سب سے کم مماثل امفیبیئن سیسلین تھے اور وہ تقریبا 351.7 ملین سال پہلے الگ ہوگئے تھے۔ ہومیولوجی آرتھولوگس C12orf50 میں ممالیہ جانوروں، پرندوں، رینگنے والے جانوروں اور سیسلین امفیبیئنز میں آرتھولوگس ہیں۔ امفیبیئن مینڈکوں، invertebrates، پودوں، فنگی، یا خمیر میں کوئی آرتھولوج نہیں پائے گئے۔ نیچے دیے گئے جدول میں کچھ آرتھولوگس دکھائے گئے ہیں جو BLAST پر پائے جا سکتے ہیں۔ پیرالاگس C12orf50 کے دو پیرالاگس ہیں: ZC3H11A اور ZC3H11B۔ انگلی کے ڈومین زنک کو دونوں پیرالاگس میں سمجھا جاتا ہے۔ حوالہ جات