FAM166C
فیملی ود سیکوینس مماثلت 166، ممبر سی (ایف اے ایم166 سی)، ایک پروٹین ہے جو ایف اے ایم166 سی جین کے ذریعے انکوڈ کیا گیا ہے۔ پروٹین FAM166C (عرفیت c2orf70، LOC339778) مرکزے میں مقامی ہے۔ اس کا حساب شدہ سالماتی وزن 23.29 kDa ہے۔ اس میں DUF2475 بھی ہوتا ہے، جو امینو ایسڈ 19-85 سے نامعلوم فنکشن کا پروٹین ہے۔ ایف اے ایم166 سی پروٹین برائے نام خصیوں، معدے اور تائیرائڈ میں ظاہر ہوتا ہے۔ جین FAM166C جین، جسے C2orf70 بھی کہا جاتا ہے، لوکس 2p23.3 کے مثبت احساس والے اسٹرینڈ پر واقع ہے۔ اس میں 9 ایکسون ہوتے ہیں، تاہم اوورلیپ کی وجہ سے انسانی جینوم میں صرف 4 میں فرق کیا جا سکتا ہے۔ FAM166C 18.6 kpb کی کل لمبائی کے لیے 26,562,565 سے 26,581,166 تک پھیلا ہوا ہے۔ جین پڑوس ایف اے ایم166 سی کے لیے جین پڑوس ڈی آر سی 1، ایل او سی 112840921، او ٹی او ایف، سی آئی بی 4 اور ایل او سی 122756675 پر مشتمل ہے۔ ایل او سی 112840921 اور ایل او سی 122756675 دونوں پیش گوئی شدہ ٹرانسکرپشنل ریگولیٹری علاقے ہیں۔ ڈی آر سی 1 (ڈائنین ریگولیٹری کمپلیکس سب یونٹ 1) نیکسن-ڈائنین کمپلیکس کے مرکزی جزو کو انکوڈ کرتا ہے، جو سلیری ڈائن کا ریگولیٹر ہے۔ اس جین میں تغیرات سلیری ڈسکینیشیا کا باعث بن سکتے ہیں۔ او ٹی او ایف پروٹین اوٹوفرلن کو انکوڈ کرتا ہے جسے ویسیکل جھلی فیوژن میں شامل ہونے کا مشورہ دیا گیا ہے۔ تغیرات نیوروسینسری نونسینڈرومک ریسیسیو بہرا پن، ڈی ایف این بی 9 کا باعث بن سکتے ہیں۔ سی آئی بی 4 (ہومو سیپینز کیلشیم اور انٹیگرن بائنڈنگ فیملی ممبر 4) سی آئی بی 4 پروٹین کو انکوڈ کرتا ہے جو انٹیگرن الفا آئی آئی بی سب یونٹ ایکٹیویشن کو منظم کرتا ہے۔ نقل FAM166C میں 2 مختلف نقل کی قسمیں ہیں۔ سب سے زیادہ وافر قسم FAM166C ٹرانسکرپٹ ویرینٹ 1 ہے، جس کی لمبائی 718 نیوکلیوٹائڈز ہے۔ پروٹین ایف اے ایم166 سی پروٹین لمبائی میں 201 امینو ایسڈ ہے جس کا متوقع سالماتی وزن 23 کے ڈی اے اور 10 کا آئسو الیکٹرک پوائنٹ ہے۔ اس میں ٹائروسین اور پرولین کی سطح معمول سے زیادہ اور آئسولیسین کی سطح معمول سے کم ہوتی ہے۔ ڈومینز اور ساخت FAM166C پروٹین میں نامعلوم فنکشن کا ایک ڈومین ہوتا ہے جسے امینو ایسڈ 19-85 سے DUF2475 کہا جاتا ہے۔ ایف اے ایم166 سی آئسوفارم 1 ثانوی ڈھانچہ بنیادی طور پر الفا ہیلیکل نوعیت کا معلوم ہوتا ہے جس میں صرف مختصر حصے بیٹا شیٹس ہونے کی پیش گوئی کی جاتی ہے۔ ترتیری ساخت کی پیش گوئیاں اعلی اعتماد کے ساتھ 5 الگ الگ الفا ہیلیسیس دکھاتی ہیں۔ آئسوفارمز ایف اے ایم166 سی میں 2 مختلف اسپلیس آئسوفارمز ہیں۔ سب سے زیادہ وافر آئسوفارم ایف اے ایم166 سی پروٹین آئسوفارم 1 ہے جس کی لمبائی 201 امینو ایسڈ ہے۔ ریگولیشن جین لیول ریگولیشن پروموٹر ایف اے ایم166 سی کے 3 ممکنہ پروموٹر ہیں جو مکمل پروٹین آئسوفارم تیار کرتے ہیں، تاہم آئسوفارم 1 صرف جی ایکس پی _ 1493451 کے ذریعے انکوڈ کیا گیا ہے۔ آئسوفارم 2 کو بھی GXP _ 1493451 کے ذریعے انکوڈ کیا گیا ہے۔ ٹرانسکرپشن فیکٹر بائنڈنگ سائٹس GXP _ 1493451 میں 250 سے زیادہ ٹرانسکرپشن فیکٹر بائنڈنگ سائٹس شامل ہیں۔ سب سے زیادہ محفوظ اور پابند ہونے کے امکانات میں ایک فورک ہیڈ باکس پروٹین فیکٹر (V $FOXP2.01)، ایک کولیجن کروکس ڈومین فیکٹر (V $CKROX.01) اور ایک E2F ٹرانسکرپشن فیکٹر (V $E2F3.01) شامل ہیں۔ ایکسپریشن پیٹرن ایف اے ایم166 سی میں دیگر پروٹینوں کے مقابلے میں مجموعی طور پر اظہار کی سطح کم ہوتی ہے لیکن جس بافت میں اس کا اظہار ہوتا ہے، وہ خصیوں، معدے اور تائیرائڈ میں سب سے زیادہ نمایاں طور پر ظاہر ہوتا ہے۔ خلیے کے اندر، ایف اے ایم166 سی نیوکلئس میں مقامی ہوتا ہے اور اس میں 2 نیوکلیئر لوکلائزیشن سگنلز ہوتے ہیں۔ پروٹین اینٹی باڈی کا داغ خاص طور پر نیوکلیئر جھلی کی لوکلائزیشن کا انتہائی اشارہ ہے۔ ٹرانسکرپٹ لیول ریگولیشن ایف اے ایم166 سی ٹرانسکرپٹ ورژن 1 کا 5 'یو ٹی آر لمبائی میں 29 بی پی ہے۔ ممکنہ 3 ڈی ڈھانچوں کا تجزیہ ایک ہیئر پن ڈھانچے کی نشاندہی کرتا ہے، تاہم، 5 'یو ٹی آر آرتھولوگس کے درمیان بہت زیادہ مختلف ہے جس سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ یہ نقل کے ضابطے کے لیے ایک اہم خطہ ہونے کا امکان نہیں ہے۔ 3 'یو ٹی آر کی لمبائی 89 بی پی ہے اور اس میں 699 بی پی پر ایک پولیڈینایلیشن سگنل ہوتا ہے۔ یہ انسانی نقل کی مختلف اقسام کے درمیان محفوظ ہے، لیکن آرتھولوگس کے درمیان صرف چھوٹے حصے اچھی طرح سے محفوظ ہیں۔ اس میں 631 بی پی (ہے-ایم آئی آر-3184-3 پی) اور 641 بی پی (ہے-ایم آئی آر-4539، ہے-ایم آئی آر-12113) پر اعتدال پسند تحفظ کے علاقوں میں 2 پیش گوئی شدہ ایم آئی-آر این اے بائنڈنگ سائٹس شامل ہیں۔ تھری ڈی پیشن گوئی دو اسٹیم لوپ ڈھانچوں کی نشاندہی کرتی ہے۔ پروٹین کی سطح کے ضابطے ایف اے ایم166 سی میں 7 فاسفوریلیشن سائٹس، 2 ایسیٹیلیشن سائٹس اور ایک او-جی ایل سی این اے سی سائٹ ہونے کی پیش گوئی کی گئی ہے، جو آرتھولوگس کے درمیان اچھی طرح سے محفوظ ہیں۔ مندرجہ بالا تصویر ایف اے ایم166 سی ٹرانسکرپٹ ورژن 1/پروٹین آئسوفارم 1 کا تصوراتی ترجمہ ہے۔ فاسفوریلیشن سائٹس کو سبز رنگ میں نمایاں کیا جاتا ہے، این سے منسلک ایسیٹیلیشن سائٹس کو نیلے رنگ میں نمایاں کیا جاتا ہے، اندرونی ایسیٹیلیشن سائٹس کو گلابی رنگ میں نمایاں کیا جاتا ہے، او-بی-جی ایل سی این اے سی سائٹس کو پیلے رنگ میں نمایاں کیا جاتا ہے، نیوکلیئر لوکلائزیشن سگنلز کو ہلکے نیلے رنگ میں نمایاں کیا جاتا ہے اور پولی اے سگنل کو سرخ رنگ میں نمایاں کیا جاتا ہے۔ نقل کے آغاز اور اختتام کو بالترتیب رنگین سبز اور سرخ متن کے ساتھ نشان زد کیا گیا ہے۔ DUF275 کو بریکٹ کے ساتھ نشان زد کیا جاتا ہے اور تمام معروف آرتھولوگس کے درمیان محفوظ امینو ایسڈ کو بولڈ کیا جاتا ہے۔ ہومیولوجی اور ارتقاء کے پیرالاگ انسانی ایف اے ایم166 سی جین میں دو پیرالاگ ہوتے ہیں جنہیں ایف اے ایم166 اے اور ایف اے ایم166 بی کہا جاتا ہے۔ وہ بالترتیب 9q34.3 اور 9p13.3 پر واقع ہیں۔ دونوں پروٹینوں کا کام فی الحال اچھی طرح سے سمجھ میں نہیں آیا ہے۔ آرتھولوگس FAM166C میں پرجاتیوں میں آرتھولوگس کیڑے مکوڑوں کی طرح دور ہیں۔ ممالیہ آرتھولوگس معتدل طور پر انسانی ایف اے ایم166 سی سے ملتے جلتے ہیں، جن کی فیصد شناخت 70 فیصد سے زیادہ ہے۔ رینگنے والے جانوروں، پرندوں اور آبی حیات میں آرتھولوج 65 ٪ سے 40 ٪ تک ہوتے ہیں۔ مچھلی اور invertebrates میں، شناخت 40 ٪ سے 20 ٪ تک ہوتی ہے۔ فنگی، بیکٹیریا یا پودوں میں کوئی آرتھولوج نہیں پائے گئے۔ ارتقاء ایف اے ایم166 سی جین ان کیڑوں میں سب سے زیادہ دور ظاہر ہوتا ہے جو تقریبا 79.7 ملین سال پہلے انسانوں سے الگ ہو گئے تھے۔ ایف اے ایم166 اے اور ایف اے ایم166 بی کے آرتھولوگ بھی کیڑوں میں پائے جاتے ہیں۔ ایف اے ایم166 سی اعتدال پسند شرح سے تیار ہوتا ہے۔ امینو ایسڈ کی ترتیب میں 1 فیصد تبدیلی کے لیے تقریبا 1 کروڑ سال درکار ہوتے ہیں۔ آرتھولوگس کی ترتیب کی مماثلت کی بنیاد پر، ایف اے ایم166 سی سائٹوکروم سی اور فائبرینوجن الفا کے وسط میں ایک شرح سے تیار ہوتا ہے۔ کلینیکل اہمیت ڈیزیز ایسوسی ایشن کولوریکٹل کینسر متعدد مطالعات نے کولوریکٹل کینسر کے علاج کے ممکنہ ہدف کے طور پر ایف اے ایم166 سی کا جائزہ لیا ہے۔ ایک مطالعہ میں، محققین نے G12A کولوریکٹل کینسر کے لیے منشیات کے علاج کی عملداری کے لیے FAM166C کا جائزہ لیا۔ ایف اے ایم166 سی ان 11 جینوں میں سے ایک تھا جن میں کے آر اے ایس جی 12 (میوٹیٹڈ اونکوجین سپریسر) کولوریکٹل کینسر کے مریضوں اور جنگلی قسم کے کولوریکٹل کینسر کے مریضوں کے درمیان نمایاں طور پر دو گنا تبدیلی تھی۔ ایک اور مطالعہ نے ایف اے ایم166 سی کی شناخت سی وی بی-ڈی کے چار ممکنہ اہداف میں سے ایک کے طور پر کی، جو بڑی آنت کے ایڈینوکارسنوما میں اس کے زیادہ اظہار کی بنیاد پر کولوریکٹل کینسر کے خلیوں کا ایک آٹوفیگی سیل ڈیتھ انڈسر ہے۔ تغیرات (دلچسپی کے ایس این پیز) جی ڈبلیو اے ایس کا استعمال کرتے ہوئے، ایک ایف اے ایم166 سی ایس این پی کی شناخت بیکٹیریل نوآبادیات کی اعلی سطح کے ساتھ منسلک ہونے کے طور پر کی گئی تھی، یہ ایک خاصیت ہے جو پیریڈونٹائٹس سے وابستہ ہو سکتی ہے۔ موازنہ کے طور پر پورے ایکسوم کی ترتیب اور انسانی حوالہ جینوم کا استعمال کرتے ہوئے، ایک ناول ایف اے ایم166 سی ایس این پی کی شناخت واحد جین اتپریورتن کے طور پر کی گئی جس کا پولیفین اسکور 0.954 تھا جس سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ یہ ممکنہ طور پر نقصان دہ تھا اور مریض کے دو طرفہ پھٹے ہونٹ اور تالو میں سے کسی ایک میں شامل ہو سکتا ہے۔ حوالہ جات