Ribophorin
ربوفورن گنبد کی شکل کے ٹرانس میمبرین گلائکوپروٹین ہوتے ہیں جو کھردرے اینڈوپلاسمک ریٹیکولم کی جھلی میں واقع ہوتے ہیں، لیکن ہموار اینڈوپلاسمک ریٹیکولم کی جھلی میں غیر حاضر ہوتے ہیں۔ رائبوفورائنز کی دو قسمیں ہیں: رائبوفورائن I اور II۔ یہ پروٹین کمپلیکس اولیگوساکری ٹرانسفرس (او ایس ٹی) میں نامی کمپلیکس کی دو مختلف ذیلی اکائیوں کے طور پر کام کرتے ہیں۔ ربوفورن I اور II صرف یوکیریوٹ خلیوں میں موجود ہوتے ہیں۔ دونوں قسم کے رائبوفورنس کسی نہ کسی اینڈوپلاسمک ریٹیکولم کے ساتھ رائبوسومز کے پابند ہونے کے ساتھ ساتھ اس تعامل پر منحصر شریک ترجمے کے عمل میں بھی کلیدی کردار ادا کرتے ہیں۔ کھردرے اینڈوپلاسمک ریٹیکولم کے رائبوفورائن کا مواد رائبوسومل اکائیوں کی سٹوچیومیٹرک تعداد کے برابر ہوتا ہے۔ لہذا، یہ ریٹیکولم میں ان پروٹینوں کی بڑی اہمیت، کثرت اور اچھے تحفظ کی نشاندہی کرتا ہے۔ نتیجتا، ان پروٹینوں کو انکوڈ کرنے والے جینوں میں نقائص پیدائشی عوارض اور تباہ کن نتائج کا سبب بن سکتے ہیں۔ رائبوفورن I اور II بالترتیب RPN1 اور RPN2 جینوں کے ذریعے انکوڈ کیے جاتے ہیں۔ رائبوفورنس غیر آئنک ڈٹرجنٹس جیسے ٹریٹن ایکس-100 میں گھلنشیل ہوتے ہیں۔ ربوفورن کی دو قسمیں ہیں: ربوفورن I اور ربوفورن II ؛ اس کی وجہ سے، ہر ایک کی اپنی خصوصیات ہیں، اس حقیقت کے باوجود کہ دونوں ربوفورن کی کچھ مشترکہ خصوصیات ہیں۔ اس طرح، ربوفورن II کے مقابلے میں ربوفورن I کی ساخت مختلف ہے۔ ربوفورن I اولیگوساکری ٹرانسفرس (او ایس ٹی) کی یہ ذیلی اکائی 1821 جوڑوں کے اڈوں سے بنتی ہے، جو تقریبا 607 امینو ایسڈ ہیں۔ اس کا سالماتی وزن 68550,8 ڈالٹن ہے۔ جب جھلی میں لنگر انداز ہوتا ہے، تو اس کے امینو ایسڈ کا 75 ٪ اینڈوپلاسمک ریٹیکولم کے لومین یا اس میں ہوتا ہے۔ اس کا سگنل تسلسل، جو پروٹین کے پختہ ہونے پر ختم ہو جاتا ہے، 23 امینو ایسڈ سے بنتا ہے اور اس میں منفی چارج ہوتا ہے، جو کہ بہت غیر معمولی ہے۔ بالغ پروٹین (584 اے اے) کے باقی امینو ایسڈ اس طرح تقسیم کیے جاتے ہیں: اے اے 1 سے 415 تک وہ ای آر کے لومین پر واقع ہوتے ہیں، 416 سے 434 تک آرگنیل کی جھلی پر لنگر انداز ہوتے ہیں، اور دیگر سائٹوپلازم میں ہوتے ہیں۔ ربوفورن II او ایس ٹی کی دوسری ذیلی اکائی 1896 کے جوڑوں سے بنتی ہے، جو 632 امینو ایسڈ کے برابر ہے۔ اس کا سالماتی وزن تقریبا 69283'4 ڈالٹن ہے۔ ربوفورن II میں، 90 ٪ امینو ایسڈ جھلی میں یا اینڈوپلاسمک ریٹیکولم کے لومین میں واقع ہوتے ہیں۔ رائبوفورائن I کے طور پر، یہ ایک سگنل کی ترتیب بھی دکھاتا ہے، لیکن یہ 22 اے اے سے بنتا ہے، منفی چارج کے ساتھ بھی۔ باقی کی تقسیم مندرجہ ذیل ہے: اے اے 1 سے 516 تک لومین پر، 517 سے 539 تک جھلی پر (لنگر کے طور پر) اور آخری 70 سائٹوپلازم پر ہیں۔ اس صورت میں اسپرگین جو گلائکوسیلیٹڈ ہے نمبر 84 اے اے ہے۔ ربوفورن II مختلف قسم کے پروٹیسیس کے لیے مکمل طور پر مزاحم ہے۔ لوکیشن ربوفورنس صرف ممالیہ خلیوں میں پائے جاتے ہیں، جہاں وہ کھردرے اینڈوپلاسمک ریٹیکولم کی جھلی میں واقع ہوتے ہیں۔ وہ ای آر میں پروٹین کی منتقلی کے دوران رائبوسوم کے ساتھ تعامل کرتے ہیں۔ رائبوفورائن I اور II دونوں میں ٹائپ I جھلی ٹوپولوجی ہوتی ہے جس میں ان کی پولی پیپٹائڈ زنجیروں کا بڑا حصہ ای آر-لومین کی طرف ہوتا ہے اور وہ ممالیہ پروٹین کمپلیکس او ایس ٹی کا حصہ ہیں۔ یہ کمپلیکس نئے ترکیب شدہ پولی پیپٹائڈز کے کوٹرانسلیشنل این-گلائکوسیلیشن کو متاثر کرتا ہے، اور چار آر ای آر مخصوص جھلی پروٹینوں پر مشتمل ہوتا ہے، جو رائبوفورائنز (I اور II)، او ایس ٹی 48 اور ڈیڈل ہیں۔ او ایس ٹی کمپلیکس کی تشکیل کے لیے، پروٹین کے درمیان مخصوص تعاملات ہوتے ہیں ؛ اس کی وجہ سے، ربوفورن I اور II کے لومین ڈومینز او ایس ٹی 48 کے لومین ڈومین کے ساتھ تعامل کرتے ہیں۔ اس کے باوجود، دونوں ربوفورائنز کے درمیان براہ راست تعامل نہیں ہوتا ہے۔ چونکہ وہ ٹرانس میمبرین پروٹین ہوتے ہیں، رائبوفورنس ای آر جھلی کو عبور کرتے ہیں اور اس طرح، پروٹین میں ایک سائٹوپلاسمک، ایک ٹرانس میمبرین اور ایک لومین ڈومین ہوتا ہے۔ ربوفورن II کے معاملے میں، ٹرانس میمبرین اور سائٹوپلاسمک ڈومینز وہ ہیں جن میں ای آر پر برقرار رکھنے کا فنکشن ہوتا ہے۔ لیکن دوسری طرف، لومین ڈومین وہ ہے جس میں ربوفورن I کے لیے برقرار رکھنے کا فنکشن ہوتا ہے۔ ربوفورن I ای آر جھلی میں رہتا ہے جس میں امینو ایسڈ 416 سے 434 تک کی واحد پھیلاؤ کی ترتیب ہوتی ہے، جس میں 150 امینو ایسڈ کا سائٹوپلاسمک سی ٹرمینس اور 415 باقیات پر مشتمل ایک لومینل این-ٹرمینل ڈومین ہوتا ہے۔ رائبوفوٹن II کو ای آر جھلی میں اسی طرح ٹھکانے لگایا جاتا ہے، لیکن اب جھلی میں پھیلا ہوا ڈومین بقیہ 517-539 پر واقع ہے اور اسپرگین کے بقیہ 544 اور 547 کو سائٹوپلازم پر ٹھکانے لگایا جائے گا جس سے اولیگوساکرائڈ کے اضافے کے لیے صرف اسن 84 کو پوٹیٹو سائٹ کے طور پر چھوڑا جائے گا۔ سائٹوپلاسمک ڈومین کی زیادہ سے زیادہ لمبائی 70 بقیہ ہوگی۔ رائبوفورنس میں سگنل کے سلسلے ہوتے ہیں جو انہیں ترجیحی طور پر ای آر جھلی میں مقامی بناتے ہیں۔ فنکشن ربوفورنس I اور II، کھردرے اینڈوپلاسمک ریٹیکولم کا ٹرانس میمبرین گلائکوپروٹین، ربوسومز کے اتحاد میں مداخلت کرتا ہے (وہ ربوسوم کی بڑی ذیلی اکائی، 60S، کو ٹھیک کرتے ہیں) RE جھلی میں، اور وہ شریک ترجمے کے منتقلی کے عمل میں اہم کردار ادا کرتے ہیں جو اس اتحاد پر منحصر ہوتا ہے، جیسے کہ نوزائیدہ پولی پیپٹائڈ کو جھلی میں داخل کرنا یا تالاب کے لومین میں ان کی منتقلی ؛ یہ پولی ریبوسومز سے پیدا ہونے والے پروٹین کی منتقلی ہے۔ ربوفورن I عام طور پر ان پروٹینوں کے ساتھ تعامل کرتا ہے جن کی فولڈنگ غلط ہوتی ہے ؛ بصورت دیگر، یہ پروٹین مقامی ریاستی پروٹینوں کے ساتھ تعامل نہیں کرتا ہے۔ اس سے پتہ چلتا ہے کہ ربوفورن I ایک چیپرون کے طور پر کام کر سکتا ہے جو غلط فولڈنگ والے پروٹین کو پہچانتا ہے۔ مزید برآں، یہ ربوفورن سبسٹریٹس کو پکڑ کر اور انہیں اتپریرک مرکز تک لے جانے کے ذریعے اولیگوساکری ٹرانسفرس (پروٹین کے لیے این-گلائکوسیلیشن کا مرکزی انزائم) میں پیشگی پروٹین کی فراہمی کو منظم کر سکتا ہے۔ تاکہ، ربوفورن I ان ممکنہ سبسٹریٹس کو انزائم کی اتپریرک ذیلی اکائی کے قریب رکھ سکے۔ اس طرح، ای آر میں ان کے بائیوجینیسیس کے دوران این-گلائکوسیلیشن رد عمل کی کارکردگی بہتر ہوگی۔ لیکن ربوفورن I صرف طے شدہ سبسٹریٹس کے N-گلائکوسیلیشن کو تیزی سے تبدیل کرتا ہے، کیونکہ یہ بظاہر دوسرے سبسٹریٹس کے ساتھ اسی عمل میں قابل تقسیم ہے۔ جب ربوفورن ضروری نہیں ہوتا ہے، تو ان پیشروؤں کے پاس اولیگوساکیریل ٹرانسفرس کے اتپریرک مرکز کا شارٹ کٹ ہوتا ہے یا ان کی موجودگی کمپلیکس میں باقی غیر اتپریرک ذیلی اکائیوں پر منحصر ہوتی ہے۔ یہ طے شدہ سبسٹریٹس کے لیے رائبوفورن I کی خاصیت کو ظاہر کرتا ہے ؛ تاکہ، یہ پروٹین اولیگوساکیریل ٹرانسفرس کمپلیکس کے اتپریرک مرکز میں سبسٹریٹس کی ترسیل کو منتخب طور پر منظم کرے۔ اگرچہ ربوفورن II اب بھی ایک پروٹین بالکل نامعلوم ہے، لیکن یہ دریافت کیا گیا ہے کہ یہ ربوفورن ایک این-اولیگوساکری ٹرانسفرس کمپلیکس کا حصہ ہے جو اعلی مینوز اولیگوساکرائڈز کو اسپرگین کے باقیات سے جوڑتا ہے جو نوزائیدہ پولی پیپٹائڈ زنجیروں کے اسن-ایکس-سیر/تھر اتفاق رائے کے نقش میں پائے جاتے ہیں۔ مزید برآں، یہ پروٹین دوسرے پروٹین کے برقرار رکھنے کے اشاروں کی شناخت میں حصہ لیتا ہے۔ رائبوفورائن II کے بارے میں زیادہ معلومات نہیں ہیں کیونکہ کمپلیکس کی اس ذیلی اکائی کی تحقیق رائبوفورائن I کی طرح نہیں کی گئی ہے۔ رائبوفورائن کی پروٹین کی ترکیب سائٹوپلازم میں کی جاتی ہے۔ ربوفورن I کو آر پی این 1 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے، جبکہ ربوفورن II کو آر پی این 2 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ مزید برآں، ہر جین رائبوفورائن سیلولر لوکلائزیشن کی نشاندہی کرنے کے لیے ایک سگنل سیکوینس کو انکوڈ کرتا ہے۔ انسانوں میں، یہ ترتیب ربوفورن I میں 23 امینو ایسڈ اور ربوفورن II میں 22 امینو ایسڈ سے بنتی ہے۔ کروموسوم میں، جین ایک مخصوص لوکس میں پائے جاتے ہیں۔ انسانوں میں، RPN1 3q21.3 (کروموسوم 3 میں) پر واقع ہے اور RPN2 لوکس 20q12-q13.1 (کروموسوم 20 میں) پر پایا جاتا ہے۔ مجموعی طور پر، ربوفورن I اور II بالترتیب 607 اور 632 امینو ایسڈ پر مشتمل ہیں۔ یہ بھی دیکھیں اینڈوپلاسمٹک ریٹیکولم حوالہ جات مزید پڑھنا گلائکوپروٹین ساختی پروٹین رائبوسوم