Formate dehydrogenase
فارمیٹ ڈی ہائیڈروجنیز انزائموں کا ایک مجموعہ ہے جو فارمیٹ کی کاربن ڈائی آکسائیڈ میں آکسیکرن کو متحرک کرتا ہے، الیکٹرانوں کو دوسرے سبسٹریٹ میں عطیہ کرتا ہے، جیسے کہ فارمیٹ میں NAD +: NAD + آکسیڈوریڈیکٹس () یا فارمیٹ میں سائٹوکروم: فیرسیٹوکروم-b1 آکسیڈوریڈیکٹس ()۔ انزائموں کے اس خاندان نے گلوبل وارمنگ سے متعلق کاربن ڈائی آکسائیڈ فکسشن کے طریقوں پر پریرتا یا رہنمائی کے طور پر توجہ مبذول کرائی ہے۔ فنکشن این اے ڈی پر منحصر فارمیٹ ڈی ہائیڈروجنیز میتھیلوٹروفک خمیر اور بیکٹیریا میں اہم ہیں، جو میتھانول جیسے سی 1 مرکبات کے کیٹابولزم میں اہم ہیں۔ سائٹوکروم پر منحصر انزائم پروکیریوٹس میں اینیروبک میٹابولزم میں زیادہ اہم ہوتے ہیں۔ مثال کے طور پر، ای کولی میں، فارمیٹ: فیرسیٹوکروم-بی 1 آکسیڈوریڈیکٹس ایک اندرونی جھلی پروٹین ہے جس میں دو ذیلی یونٹس ہوتے ہیں اور یہ اینیروبک نائٹریٹ ریسپریشن میں شامل ہوتا ہے۔ این اے ڈی پر منحصر رد عمل تشکیل + این اے ڈی + سی او 2 + این اے ڈی ایچ + ایچ + سائٹوکروم پر منحصر رد عمل تشکیل + 2 فیرسیٹوکروم بی 1 سی او 2 + 2 فیروسیٹوکروم بی 1 + 2 ایچ + مولیبڈوپٹرن، مولیبڈینم اور سیلینیم انحصار دھات پر منحصر ایف ڈی ایچ کی خصوصیت ایم او یا ڈبلیو ان کے فعال مقامات پر۔ یہ فعال مقامات ڈی ایم ایس او ریڈکٹیس میں نظر آنے والے نقش سے ملتے جلتے ہیں، جس میں دو مولیبڈوپٹرین کوفیکٹر مو/ڈبلیو سے جڑے ہوئے ہیں۔ پانچویں اور چھٹے لگینڈس سلفایڈ ہوتے ہیں اور یا تو سسٹینیٹ یا سیلینو سسٹینیٹ ہوتے ہیں۔ عمل کے طریقہ کار میں دھات کے مراکز کے 2e ریڈوکس شامل ہوتے دکھائی دیتے ہیں، جو فارمیٹ سے ہائیڈرائڈ کی منتقلی اور کاربن ڈائی آکسائیڈ کے اخراج سے متاثر ہوتے ہیں: اس اسکیم میں، دو ڈیتھیولین کوفیکٹرز، مولیبڈوپٹرینز کے ذریعہ فراہم کردہ چار تھیولیٹ جیسے لگینڈز کی نمائندگی کرتا ہے۔ ڈیتھیولین اور سسٹینائل/سیلینو سسٹینائل لگینڈ ریڈوکس-انوسینٹ ہوتے ہیں۔ سالماتی تفصیلات کے لحاظ سے، متعدد تحقیقات کے باوجود طریقہ کار غیر یقینی ہے۔ زیادہ تر میکانزم یہ فرض کرتے ہیں کہ فارمیٹ مو/ڈبلیو کے ساتھ ہم آہنگ نہیں ہوتا ہے، اس کے برعکس عام مو/ڈبلیو آکسو-ٹرانسفرز (مثال کے طور پر، ڈی ایم ایس او ریڈکٹیس)۔ ایک مقبول میکانکی تجویز میں ایچ-کو فارمیٹ سے ایم او/ڈبلیو وی آئی = ایس گروپ میں منتقل کرنا شامل ہے۔ ٹرانس میمبرین ڈومین فارمیٹ ڈی ہائیڈروجنیز دو ٹرانس میمبرین ڈومینز پر مشتمل ہے۔ β-ذیلی یونٹ کے تین α-ہیلیسیس اور گاما-ذیلی یونٹ سے چار ٹرانس میمبرین ہیلیسیس۔ فارمیٹ ڈی ہائیڈروجنیز کا β-ذیلی یونٹ پیریپلازم میں موجود ہوتا ہے جس میں ایک واحد ٹرانس میمبرین α-ہیلکس ہوتا ہے جو β-ذیلی یونٹ کو اندرونی میمبرین کی سطح پر لنگر انداز کرکے جھلی کو پھیلاتا ہے۔ β-ذیلی اکائی میں دو ذیلی ڈومین ہوتے ہیں، جہاں ہر ذیلی ڈومین میں دو [4Fe-4S] فیریڈوکسن کلسٹر ہوتے ہیں۔ ذیلی اکائی کے ذریعے ایک سلسلہ میں [4Fe-4S] کلسٹرز کی منصفانہ صف بندی میں علیحدگی کے فاصلے کم ہوتے ہیں، جو [4Fe-4S]-1، [4Fe-4S]-4، [4Fe-4S]-2، اور [4Fe-4S]-3 سے γ-ذیلی اکائی میں پیریپلاسمک ہیمی b تک تیزی سے الیکٹران کے بہاؤ کی اجازت دیتے ہیں۔ اس کے بعد الیکٹران کا بہاؤ جھلی کے پار γ-ذیلی اکائی میں سائٹوپلاسمک ہیم b کی طرف جاتا ہے۔ فارمیٹ ڈی ہائیڈروجنیز کا γ-ذیلی یونٹ ایک جھلی سے جڑا ہوا سائٹوکروم بی ہے جو چار ٹرانس میمبرین ہیلیکس اور دو ہیمی بی گروپوں پر مشتمل ہوتا ہے جو چار ہیلکس بنڈل تیار کرتا ہے جو ہیمی بائنڈنگ میں مدد کرتا ہے۔ گاما ذیلی اکائی سے منسلک ہیم بی کوفیکٹر ذیلی اکائی کے ذریعے الیکٹرانوں کو اچھالنے کی اجازت دیتے ہیں۔ ٹرانس میمبرین ہیلیکس دونوں ہیمی بی گروپوں کو برقرار رکھتے ہیں، جبکہ صرف تین ہیمی لگینڈ فراہم کرتے ہیں اور اس طرح فی-ہیمی کو لنگر انداز کرتے ہیں۔ پیریپلاسمک ہیم بی گروپ β-ذیلی یونٹ کے پیریپلاسمک ڈومین کے [4Fe-4S]-3 کلسٹرز سے الیکٹرانوں کو قبول کرتا ہے۔ سائٹوپلاسمک ہیم بی گروپ پیریپلاسمک ہیم بی گروپ سے الیکٹرانوں کو قبول کرتا ہے، جہاں الیکٹران کا بہاؤ پھر گاما ذیلی یونٹ کے ٹرانس میمبرین ڈومین میں موجود میناکوینون (وٹامن کے) کی کمی کی جگہ کی طرف جاتا ہے۔ γ-ذیلی اکائی میں میناکوینون کی کمی کی جگہ، سائٹوپلاسمک ہیم بی کے ہسٹائڈائن لگینڈ کے پابند ہونے کے ذریعے الیکٹرانوں کو قبول کرتی ہے۔ مزید دیکھیں فارمیٹ ڈی ہائیڈروجنیز (سائٹوکروم) فارمیٹ ڈی ہائیڈروجنیز (سائٹوکروم-سی-553) فارمیٹ ڈی ہائیڈروجنیز (این اے ڈی پی +) مائکروبیل میٹابولزم اضافی پڑھنے کے حوالہ جات بیرونی لنکس ای سی 1.2.2.1 ای این زی وائی ایم ای لنک کے لیے ای سی 1.2.1.2 سیلولر ریسپریشن میٹابولزم ای سی 1.2.2 ای سی 1.2.1