Pyrobaculum
پائروبیکولم تھرموپروٹیسی کی ایک جینس ہے۔ تفصیل اور اہمیت جیسا کہ اس کے لاطینی نام پائروبیکولم ("فائر اسٹک") سے پتہ چلتا ہے، آرکیون چھڑی کی شکل کا ہوتا ہے اور زیادہ درجہ حرارت والے مقامات سے الگ ہوتا ہے۔ یہ گرام منفی ہے اور اس کے خلیات پروٹین ذیلی اکائیوں کی ایس پرت سے گھرا ہوا ہے۔ پی ایروفیلم ایک ہائپر تھرموفیلک اور میٹابولک طور پر ورسٹائل جاندار ہے۔ دیگر ہائپر تھرموفائلز سے مختلف، یہ آکسیجن کی موجودگی میں زندہ رہ سکتا ہے اور مائیکرو ایروبک حالات میں مؤثر طریقے سے بڑھ سکتا ہے۔ پائروبیکولم ییلوسٹونینسس تناؤ ڈبلیو پی 30 کو یو ایس اے کے ییلوسٹون نیشنل پارک (وائی این پی) میں ایک عنصر سلفر تلچھٹ (جوزف کا کوٹ ہاٹ اسپرنگ [جے سی ایچ ایس]، 80 ڈگری سیلسیس، پی ایچ 6.1، 135 ایم یو اے ایس) سے حاصل کیا گیا تھا اور یہ ایک کیمورگانوہیٹروٹروف ہے اور اسے الیکٹران قبولیت کے طور پر عنصر سلفر اور/یا آرسنیٹ کی ضرورت ہوتی ہے۔ عنصر سلفر اور آرسنیٹ کی موجودگی میں اضافے کے نتیجے میں تھیوارسینٹس اور پولیسلفائڈز کی تشکیل ہوئی۔ اس جاندار کے مکمل جینوم کی ترتیب (1.99 ایم بی، 58 فیصد جی + سی مواد) کی گئی تھی، جس سے کاربوہائیڈریٹ، امینو ایسڈ اور لپڈ کے انحطاط کے لیے متعدد میٹابولک راستے ظاہر ہوتے ہیں۔ متعدد ڈائیمیتھائل سلفوکسائڈ-مولیبڈوپٹرین (ڈی ایم ایس او-ایم پی ٹی) آکسیڈوریڈیکٹس جینز کی نشاندہی کی گئی، جو سلفر اور آرسینک کی کمی میں ملوث ہیں۔ تقریبا تمام مطلوبہ کوفیکٹرز اور میٹابولائٹس کی ڈی نووو ترکیب کے لیے راستوں کی نشاندہی کی گئی۔ پی۔ ییلوسٹونینسس کی تقابلی جینومکس اور جے سی ایچ ایس سے جمع شدہ میٹاجینوم ترتیب سے پتہ چلتا ہے کہ یہ جاندار سیٹو آبادیوں سے انتہائی متعلق ہے (~95% اوسط نیوکلیوٹائڈ ترتیب شناخت)۔ پی۔ ییلوسٹونینسس کی جسمانی صفات اور میٹابولک صلاحیتیں وائی این پی میں ان آبادیوں کی تقسیم اور افعال کی تفہیم کو فروغ دینے کے لیے ایک اہم بنیاد فراہم کرتی ہیں۔ جینوم ڈھانچہ پائروبیکولم کی پہلی انواع جس کی ترتیب دی گئی وہ پی ایروفیلم تھی۔ اس کی سرکلر جینوم سیکوینس لمبائی میں 2,222,430 Bp ہے اور اس میں 2605 پروٹین-انکوڈنگ سیکوینس (سی ڈی ایس) ہوتے ہیں۔ خلیے کی ساخت اور میٹابولزم اینیروبک حالات کے تحت، آرکیئن نائٹریٹ کو ڈی نائٹریفیکیشن راستے کے ذریعے مالیکیولر نائٹروجن میں کم کر دیتا ہے۔ زیادہ تر انواع یا تو کیمولیتھو آٹوٹروفک طور پر سلفر میں کمی کے ذریعے یا نامیاتی طور پر سلفر کے تنفس کے ذریعے یا خمیر کے ذریعے اگتی ہیں۔ خلیے تقریبا آئتاکار سروں کے ساتھ چھڑی کی شکل کے ہوتے ہیں اور تقریبا 1.5-8 * 0.5-0.6 μm ہوتے ہیں۔ پائروبیکولم پیریٹریچس یا بائی پولر پولیٹریچس فلیگلیشن کی وجہ سے متحرک ہے، اور اس کی کالونیاں گول اور سرمئی سے سبز سیاہ ہوتی ہیں۔ یہ انواع یا تو فیکیولی طور پر ایروبک یا سختی سے اینیروبک ہیں۔ خمیر کے نچوڑ، پیپٹون، گوشت کے نچوڑ پر نمو دیکھی گئی، لیکن گیلیکٹوز، گلوکوز، مالٹوز، اسٹارچ گلائکوجن، ایتھنول، میتھانول، فارمامائڈ، فارمیٹ، میلیٹ، پروپیونیٹ، لیکٹیٹ، ایسیٹیٹ اور کیسامینو ایسڈ پر نہیں۔ جینیاتی طور پر ترتیب دی جانے والی پائروبیکولم پرجاتیوں میں سے پہلی، پی ایروفیلم (چھڑی کی شکل، 3-8 * 0.6 مائیکرو میٹر)، ایک آرکیون کے لیے ایک نایاب خصوصیت رکھتی ہے کیونکہ یہ ایروبک سانس لینے کی صلاحیت رکھتی ہے (ایروفیلم = "ہوا سے محبت کرنے والی")۔ یہ اس حقیقت سے واضح ہوتا ہے کہ آرکیون صرف آکسیجن کی موجودگی میں اس وقت بڑھتا ہے جب نائٹریٹ موجود نہیں ہوتا تھا۔ یہ ایسی کالونیاں پیدا کرتا ہے جو گول اور سرمئی پیلے رنگ کی ہوتی ہیں۔ یہ ایروبک اور اینیروبک تنفس کے دوران نامیاتی (زیادہ سے زیادہ خلیوں کی کثافت کا مشاہدہ پیچیدہ نامیاتی جیسے خمیر کے نچوڑ، گوشت کے نچوڑ، ٹرپٹون، اور پیپٹون کے ساتھ سبسٹریٹ کے طور پر کیا گیا تھا) اور غیر نامیاتی مرکبات دونوں کا استعمال کرتا ہے۔ نیز، نشوونما کے لیے بنیادی سلفر کا استعمال بھی دیکھا گیا۔ مزید برآں، پی ایروفیلم 75 اور 104 ڈگری سیلسیس کے درمیان بڑھتا ہے اور 100 ڈگری سیلسیس پر زیادہ سے زیادہ درجہ حرارت بڑھتا ہے۔ اسٹیشنری فیز کلچرز میں، پائروبیکولم کیلیڈی فونٹس خلیات کو جمع کرنے کے لیے مشاہدہ کیا گیا۔ جمع کرنے کی ثالثی آرکیئل بنڈلنگ پیلی (اے بی پی) کے ذریعے ہونے کا امکان ہے، جو انتہائی ترتیب شدہ دو قطبی بنڈلوں میں جمع ہوتے ہیں۔ ان بنڈلوں کی دو قطبی نوعیت ممکنہ طور پر کم از کم دو یا زیادہ مختلف خلیوں سے تنوں کی ایسوسی ایشن سے پیدا ہوتی ہے۔ جزو پروٹین، اے بی پی اے، بیکٹیریل پروٹین ٹی اے ایس اے کو ترتیب اور ساختی دونوں سطحوں پر ہم آہنگی ظاہر کرتا ہے، جو بیکٹیریل بائیو فلمز میں ایکسٹرا سیلولر میٹرکس کا ایک بڑا جزو ہے، جو بائیو فلم استحکام میں معاون ہے۔ ماحولیات اس تاریخ تک، پائروبیکولم کے تناؤ کو غیر جانبدار سے قدرے الکلین ابلتے ہوئے سالفٹریک پانی اور اتلی سمندری ہائیڈروتھرمل نظام سے الگ کیا گیا ہے۔ پی ایروفیلم کو مارونٹی بیچ، اسچیا، اٹلی میں ایک ابلتے ہوئے سمندری پانی کے سوراخ سے الگ کیا گیا تھا۔ مزید مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ پی ایروفیلم الیکٹران قبول کنندہ کے طور پر نائٹریٹ کے ساتھ سختی سے اینیروبک حالات میں بڑھتا ہے۔ فائیلوجینی فی الحال قبول شدہ درجہ بندی نامیات میں کھڑے ہونے والے پروکیریوٹک ناموں کی فہرست (ایل پی ایس این) اور نیشنل سینٹر فار بائیوٹیکنالوجی انفارمیشن (این سی بی آئی) پر مبنی ہے۔ یہ بھی دیکھیں پائروبیکولم بطور آر 3 آرکیا جنرا کی چھوٹی آر این اے فہرست حوالہ جات مزید پڑھنا سائنسی جریدے سائنسی ڈیٹا بیس بیرونی روابط آرکیا جنرا تھرموفائلز تھرموپروٹوٹا