Rubicon homology domain
روبیکن ہومولوجی ڈومین (جسے آر ایچ ڈومین بھی کہا جاتا ہے) تقریبا 250 امینو ایسڈ کا ایک ارتقائی طور پر محفوظ پروٹین ڈومین ہے جو پروٹین-پروٹین کے تعامل میں ثالثی کرتا ہے۔ آر ایچ ڈومین کئی انسانی پروٹینوں میں موجود ہیں جو آٹوفیجی اور اینڈوسومل اسمگلنگ کے ضابطے میں شامل ہیں۔ اگرچہ تمام آر ایچ ڈومینز کی خصوصیت نہیں کی گئی ہے، انسانی روبیکن اور پی ایل ای کے ایچ ایم 1 چھوٹے جی ٹی پیز رب 7 کے ساتھ تعامل میں ثالثی کرتے ہیں، جو دیر سے اینڈوسومز اور آٹوفگوسومز پر پایا جاتا ہے۔ آر ایچ ڈومینز میں 16 محفوظ سسٹین اور ہسٹائڈائن کے باقیات ہوتے ہیں جو زنک کے ایٹموں کو باندھتے ہیں اور کم از کم 4 زنک انگلی کے نقش بناتے ہیں۔ روبیکن کے آر ایچ ڈومین کے سی-ٹرمینس کی طرف امینو ایسڈ کے باقیات کو رب 7 کے ساتھ تعامل کے لیے ضروری دکھایا گیا ہے۔ ساخت رب 7 کے ساتھ کمپلیکس میں روبیکن آر ایچ ڈومین کی 3 ڈی جوہری ساخت کا تعین ایکس رے کرسٹلگرافی کے ذریعے کیا گیا ہے۔ آر ایچ ڈومین کی ساخت "ایل" شکل کی ہوتی ہے، جس میں "ایل" کی بنیاد رب 7 کے سوئچ علاقوں سے رابطہ رکھتی ہے۔ یہ ڈھانچہ بنیادی طور پر الفا ہیلیکل ہے، جس میں زنک فنگر موفٹس کے آس پاس چھوٹے بیٹا اسٹرینڈ کے علاقے موجود ہیں۔ روبیکن آر ایچ ڈومین کا این-ٹرمینل علاقہ ایف وائی وی ای ڈومین سے ملتا جلتا ہے، تاہم پی آئی 3 پی کے کینونکل ایف وائی وی ای ڈومین بائنڈنگ کے لیے درکار بنیادی باقیات موجود نہیں ہیں۔ آر ایچ ڈومین آر ایچ ڈومینز پر مشتمل پروٹین متعدد پروٹینز میں پائے جاتے ہیں، بشمول (انسانوں میں): روبیکن، پروٹین کے آر ایچ ڈومین پر مشتمل خاندان کا متعین رکن اور آٹوفیگی پی ایل ای کے ایچ ایم 1 کا منفی ریگولیٹر، آسٹیوپیٹروسیس پیسر میں ملوث ایک پروٹین، آٹوفیگی ڈی ای ایف 8 کا ایک مثبت ریگولیٹر، لائسوسوم پردیی تقسیم پی ایل ای کے ایچ ایم 3 کا ریگولیٹر، جو کنکال کے پٹھوں کی تفریق میں شامل ہے۔