Rubicon (protein)
روبیکن (رن ڈومین بیکلن-1-انٹرایکٹنگ اور سسٹین سے بھرپور ڈومین پر مشتمل پروٹین) ایک پروٹین ہے جسے انسانوں میں آر یو بی سی این جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ روبیکن آٹوفیجی کے چند معروف منفی ریگولیٹرز میں سے ایک ہے، ایک سیلولر عمل جو غیر ضروری یا خراب سیلولر اجزاء کو خراب کرتا ہے۔ روبیکن کو چھوٹے جی ٹی پیز رب 7 کے ساتھ تعامل کے ذریعے اس کے کام کے مقامات پر بھرتی کیا جاتا ہے، اور پی آئی 3 کے سی 3-سی 2 (کلاس III فاسفیٹائڈیلینوسٹول 3-کینیس کمپلیکس 2) کی روک تھام کے ذریعے آٹوفیگی کے آٹوفیگوسوم-لیسوسوم فیوژن مرحلے کو خراب کرتا ہے۔ روبیکن کا منفی ماڈیولیشن بڑھاپے اور بڑھاپے سے وابستہ بیماریوں میں کمی سے وابستہ ہے: روبیکن کی ناک آؤٹ گول کیڑے اور خواتین پھلوں کی مکھیوں میں عمر میں اضافہ کرتی ہے، اور چوہوں میں گردے کے فائبروسس اور α-سنکیوکلین کے جمع ہونے میں کمی آتی ہے۔ آٹوفیجی کے ضابطے کے علاوہ، ایل سی 3 سے وابستہ فگوسیٹوسس (ایل اے پی) اور ایل سی 3 سے وابستہ اینڈوسیٹوسس (لینڈو) کے لیے روبیکن کی ضرورت دکھائی گئی ہے۔ روبیکن کو متعدد ڈاون اسٹریم ریگولیٹری مالیکیولز کے ساتھ براہ راست تعامل کے ذریعے پیدائشی مدافعتی ردعمل کو منفی طور پر منظم کرنے کے لیے بھی دکھایا گیا ہے۔ ساخت روبیکن 972 امینو ایسڈ پر مشتمل ہے اور اس میں ایک این-ٹرمینل رن ڈومین، ایک مڈل ریجن (ایم آر)، اور ایک سی-ٹرمینل روبیکن ہومیولوجی (آر ایچ) ڈومین ہے۔ روبیکن ہومولوجی ڈومین سسٹین کے باقیات سے مالا مال ہے اور کم از کم 4 ڈیویلینٹ زنک آئنوں کو باندھتا ہے، جس سے زنک فنگر موفٹس بنتے ہیں۔ روبیکن اور جی ٹی پی سے منسلک رب 7 کے درمیان تعامل کی ساختی بنیاد کا تجرباتی طور پر تعین کیا گیا ہے (پی ڈی بی آئی ڈی: 6 ڈبلیو سی ڈبلیو)۔ فنکشن این-ٹرمینل رن ڈومین کا فنکشن نامعلوم ہے، لیکن یہ آٹوفیجی دبانے کے لیے ضروری ہے۔ درمیانی علاقے میں PI3K-بائنڈنگ ڈومین (PIKBD) ہوتا ہے، جو PI3KC3-C2 کی روک تھام میں ثالثی کرتا ہے۔ سی-ٹرمینل روبیکن ہومیولوجی ڈومین راب 7 کے ساتھ تعامل میں ثالثی کرتا ہے، اور اس کا اشتراک دیگر آر ایچ ڈومین پر مشتمل آٹوفیگی ریگولیٹری پروٹینز کے ذریعے کیا جاتا ہے، بشمول پی ایل ای کے ایچ ایم 1 اور پیسر (جسے آر یو بی سی این ایل، روبیکن جیسا آٹوفیگی انہانسر بھی کہا جاتا ہے)۔ آٹوفیجی پر منحصر روبیکن PI3KC3-C2 کے ساتھ وابستگی اور روک تھام کے ذریعے آٹوفیجی کو دبا دیتا ہے۔ خاص طور پر، روبیکن براہ راست PI3KC3-C2 کو باندھتا ہے اور بیکلن-1 ذیلی یونٹ کے کنفارمیشنل ماڈیولیشن کے ذریعے جھلی میں PI3KC3-C2 کی بھرتی کو روکتا ہے۔ یہ سرگرمی آٹوفگوسوم جھلی میں پی آئی 3 کے سی 3 کی طرف سے فاسفیٹائڈیلینوسٹول 3-فاسفیٹ (پی آئی 3 پی) کی پیداوار کو روکتی ہے، اور اس کے نتیجے میں ایسی مشینری کو بھرتی کرنے میں ناکامی ہوتی ہے جو آٹوفگوسوم-لیسوسوم فیوژن کی ہدایت کرتی ہے۔ روبیکن کو رب 7 کے ساتھ براہ راست تعامل کے ذریعے اس کے عمل کی جگہ پر نشانہ بنایا جاتا ہے، جو دیر سے اینڈوسومز اور دیر سے آٹوفگوسومز کو سجاتا ہے۔ آٹوفیجی سے آزاد روبیکن ایل سی 3 سے وابستہ فگوسیٹوسس (ایل اے پی) اور ایل سی 3 سے وابستہ اینڈوسیٹوسس (لینڈو) کے لیے ضروری ہے۔ روبیکن پی آئی 3 کے سی 3 کو فگوسومز میں لوکلائزیشن میں کردار ادا کرتا ہے، جو جھلی میں پی آئی 3 پی کی پیداوار اور این او ایکس 2 سمیت ڈاون اسٹریم ایفیکٹرز کی بھرتی کے لیے اہم ہے۔ روبیکن کو پیدائشی مدافعتی ردعمل کو دبانے اور کچھ معاملات میں وائرل نقل کو بڑھاوا دینے کے لیے دکھایا گیا ہے۔ روبیکن این ایف-κ بی ایسینشیل ماڈیولیٹر (این ای ایم او)، انٹرفیرون ریگولیٹری فیکٹر 3 (آئی آر ایف 3) اور کیسپیس ریکروٹمنٹ ڈومین پر مشتمل پروٹین 9 (کارڈ 9) کے ساتھ تعامل کے ذریعے سائٹوکائن کے ردعمل کو دبا دیتا ہے۔ عمر بڑھنے اور بیماری سے متعلق بیماریوں میں کردار چوہوں اور دیگر ماڈل حیاتیات میں عمر کے ساتھ ساتھ روبیکن کے اظہار کی سطح میں اضافہ ہوتا ہے، جس سے یہ پتہ چلتا ہے کہ روبیکن عمر سے وابستہ آٹوفیجی میں کمی کا سبب بن سکتا ہے۔ چونکہ آٹوفیجی میں کمی کا تعلق بڑھاپے اور عمر سے متعلق بیماریوں سے ہے، اس لیے روبیکن کے ماڈیولیشن کو ایک ممکنہ علاج کے ہدف کے طور پر شناخت کیا گیا ہے۔ چوہوں میں، روبیکن ناک آؤٹ دماغ میں α-سنکیوکلین کے جمع ہونے کو کم کرتا ہے اور گردے میں انٹرسٹیشیل فائبروسس کو کم کرتا ہے۔ عمر رسیدہ روبیکن ناک آؤٹ آٹوفیجی کے ماڈیولیشن کے ذریعے گول کیڑے (سی۔ ایلیگنس) میں عمر میں اضافہ کرتا ہے، اور خواتین پھلوں کی مکھیوں (ڈی۔ میلانوگاسٹر) میں عمر میں بھی اضافہ کرتا ہے۔ غیر الکحل فیٹی جگر کی بیماری (این اے ایف ایل ڈی) غیر الکحل فیٹی جگر کی بیماری (این اے ایف ایل ڈی) کے ماؤس ماڈل میں روبیکن کی سطح میں اضافہ ہوتا ہے۔ ہیپاٹوسائٹس میں روبیکن کا ناک آؤٹ جگر کے اسٹیٹوسس اور آٹوفیجی کو بہتر بناتا ہے، جس سے پتہ چلتا ہے کہ روبیکن این اے ایف ایل ڈی پیتھوجینسیس میں حصہ ڈالتا ہے۔ میٹابولک بیماری ایڈیپوز ٹشوز میں روبیکن کے اظہار کی عمر پر منحصر کمی ضرورت سے زیادہ آٹوفیجک سرگرمی کی وجہ سے میٹابولک عوارض کو بڑھا سکتی ہے۔ صالح اٹیکسیا (ایس سی اے آر 15) روبیکن کے اندر ایک واحد نیوکلیوٹائڈ حذف کرنے کا تغیر صالح اٹیکسیا (او ایم آئی ایم آئی ڈی: 615705) کی وجہ ہے۔ صالح اٹیکسیا (جسے سپینوسیریبلر اٹیکسیا، آٹوسومل ریسیسیو 15 یا ایس سی اے آر 15 بھی کہا جاتا ہے) سپینوسیریبلر اٹیکسیا کی ایک شکل ہے جس کی خصوصیت ہاتھوں، چال، تقریر اور آنکھوں کی حرکت میں ہم آہنگی کے ترقی پسند نقصان سے ہوتی ہے۔ یہ بیماری ان بچوں میں دریافت ہوئی تھی جن میں ایک اتپریورتن (c.2624delC p.Ala875ValfsX146) ہوتا ہے جس کی وجہ سے ایک فریم شفٹ اتپریورتن ہوتا ہے اور الینائن 875 سے شروع ہونے والے روبیکن کوڈنگ جین میں ایک غلط اوپن ریڈنگ فریم ہوتا ہے۔ سی-ٹرمینل ڈومین کے نتیجے میں خلل رب 7 اور دیر سے اینڈوسومز کے ساتھ روبیکن سب سیلولر لوکلائزیشن کو متاثر کرتا ہے۔ پی ایل ای کے ایچ ایم 1 آر یو بی سی این ایل (روبیکن کی طرح) آر اے بی 7 اے بیکلن-1 حوالہ جات بھی دیکھیں۔