TEDDM1
ٹرانس میمبرین ایپیڈیڈائمل پروٹین 1 ایک ٹرانس میمبرین پروٹین ہے جو ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 جین کے ذریعے انکوڈ کیا گیا ہے۔ ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کو عام طور پر ٹی ایم ای ایم 45 سی کے نام سے بھی جانا جاتا ہے اور یہ 273 امینو ایسڈ کو انکوڈ کرتا ہے جس میں چھ الفا ہیلکس ٹرانس میمبرین ریجنز ہوتے ہیں۔ پروٹین میں نامعلوم فنکشن کا 118 امینو ایسڈ لمبائی کا خاندان ہوتا ہے۔ اگرچہ ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کا صحیح کام سمجھ میں نہیں آیا ہے، لیکن اس کے پلازما جھلی کا ایک لازمی جزو ہونے کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ جین لوکس ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کروموسوم 1 پر واقع ہے جو مائنس سرے پر 1q25.3 پر پایا جاتا ہے۔ ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 ایک واحد ایکسون پر مشتمل ہے۔ ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کے جین پڑوس میں گلوٹامیٹ-امونیا لیگیز (جی ایل یو ایل)، لانگ انٹرجینک نان پروٹین کوڈنگ آر این اے 272 (ایل آئی این سی 00272)، اور شارپر-ایم پی آر اے ریگولیٹری ریجن 13543 (ایل او سی 122149321) شامل ہیں۔ اظہار TEDDM1 زیادہ تر بڑے بافتوں میں ظاہر ہوتا ہے۔ جین کا اظہار خصیوں میں اعلی سطح پر اور ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کے اظہار کے ساتھ دیگر تمام بافتوں کے مقابلے دل میں کم سطح پر ہوتا ہے۔ دماغ میں، ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کا اظہار امیگدالا، ہپپوکیمپس اور سٹریٹم میں ہوتا ہے۔ ماؤس کے دماغ میں، ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کو آر این اے تحقیقات کا استعمال کرتے ہوئے عمومی اظہار کے ساتھ دریافت کیا گیا۔ خلیے کے اندر، ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 بنیادی طور پر پلازما جھلی میں ظاہر ہوتا ہے۔ دیگر جھلی سے جڑے پروٹینوں کی طرح، ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 پروٹین میں پیش گوئی شدہ سگنل پیپٹائڈ ہوتا ہے، حالانکہ سگنل پیپٹائڈ کی قسم معلوم نہیں ہے۔ چونکہ ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 دیگر ٹرانس میمبرین پروٹینوں کے ساتھ بہت سی خصوصیات کا اشتراک کرتا ہے، اس سے پتہ چلتا ہے کہ پروٹین کا مختلف خلیوں کے عمل جیسے سگنل ٹرانسڈکشن اور پروٹین کی اسمگلنگ میں کردار ہو سکتا ہے۔ جین لیول ریگولیشن ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کا اظہار نمونہ ہر جگہ تھا۔ انسانوں میں ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 ایم آر این اے کی کثرت معتدل سے کم تھی۔ پروٹین ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 پروٹین کا سالماتی وزن تقریبا 31.3 کے ڈی اے ہے اور ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کا نظریاتی آئسو الیکٹرک پوائنٹ (پی آئی) 8.02 ہے۔ خاص طور پر، یہ دیگر پروٹینوں کے اوسط پی آئی سے مختلف ہے کیونکہ ان کا پی آئی 4-7 کی پی ایچ رینج میں آتا ہے۔ اس سے پتہ چلتا ہے کہ ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 پروٹین میں زیادہ تر پروٹین کے مقابلے میں بنیادی امینو ایسڈ کی زیادتی ہوتی ہے۔ ڈومینز ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 میں نامعلوم فنکشن کا ایک واحد بڑا ڈومین ہے جس کا عنوان DUF716 ہے۔ یہ ڈومین امینو ایسڈ پوزیشن 95 سے 219 پروٹین تک پھیلا ہوا ہے۔ DUF716 میں لیوسین زپر کی اکثریت ہوتی ہے جو عام طور پر پروٹین کی ڈائمرائزیشن سے وابستہ ہوتی ہے۔ DUF716 پروٹین میں چھ ٹرانس میمبرین علاقوں میں سے تین پر مشتمل ہوتا ہے، اور اس میں اعلی تحفظ کے امینو ایسڈ کے حصے ہوتے ہیں، جس سے پتہ چلتا ہے کہ DUF716 ممکنہ طور پر TEDDM1 پروٹین فنکشن میں اہم کردار ادا کرتا ہے۔ ترجمے کے بعد کی تبدیلیاں ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 ترجمے کے بعد کی کئی تبدیلیوں سے مشروط ہے۔ اٹھارہ پیش گوئی شدہ فاسفوریلیشن سائٹس ہیں۔ دیگر مخصوص مقامات میں ایک این-گلائکوسیلیشن سائٹ، ایک کیسین کینیز II فاسفوریلیشن سائٹ، ایک لیوسین زپر پیٹرن، دو این-مائرسٹیلیشن سائٹس، اور تین پروٹین کینیز سی فاسفوریلیشن سائٹس شامل ہیں۔ این-گلائکوسیلیشن جھلی پروٹین کی ایک اور عام خصوصیت ہے اور یہ سراو اور سائٹوسکیلیٹل تنظیم میں شامل ہے۔ کیسین کینیز II پروٹین کے استحکام اور سیل سگنلنگ ردعمل کے ساتھ شامل ہے۔ لیوسین زیپرز سیکوینس موفٹس ہیں جو پروٹین-پروٹین کے تعاملات کو آسان بناتے ہیں۔ این-میریسٹیلیشن سائٹس لگینڈ بائنڈنگ اور پروٹین ڈائنامکس میں شامل ہیں۔ پروٹین کینیز سی فاسفوریلیشن کا تعلق خلیوں کے پھیلاؤ اور جین کے اظہار کے ضابطے سے ہے۔ ساخت ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کی ثانوی ساخت این-ٹرمینس پر آزاد بے ترتیب کنڈلی اور ایک واحد الفا ہیلکس سے شروع ہوتی ہے۔ ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 میں چھ ٹرانس میمبرین پروٹین ساختی طور پر ایک جیسے الفا ہیلیسیس کے طور پر نمایاں ہیں۔ پروٹین کا یہ علاقہ این-ٹرمینس کے مقابلے میں کافی گاڑھا ہوتا ہے۔ الفا ہیلیکس میں عام طور پر بنیادی طور پر ہائیڈروفوبک باقیات ہوتے ہیں، جو پلازما جھلی کے اندر واقع ان علاقوں کے ساتھ ہم آہنگ ہوتے ہیں۔ الفا ہیلیکس عام طور پر ڈی این اے بائنڈنگ موفٹس سے بھی وابستہ ہوتے ہیں۔ ہومیولوجی/ایوولوشن پیرالاگ ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کے دو معروف پیرالاگ ہیں، ٹی ایم ای ایم 45 اے اور ٹی ایم ای ایم 45 بی۔ آرتھولوگس انسانی جین TEDDM1 کے لیے 100 سے زیادہ آرتھولوگس موجود ہیں۔ ان معروف آرتھولوگس میں سے وہ صرف ممالیہ جانوروں، امفیبیئنز میں موجود پائے گئے، اور پائے جانے والے تمام آرتھولوگس کی انحراف کی تاریخ کا موازنہ ہومو سیپینز سے کیا گیا۔ مچھلی ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 انسانی ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 سے سب سے زیادہ دور سے متعلق آرتھولوگس ہیں، جن میں انحراف کی سب سے دور میڈین تاریخ 46.4 کروڑ سال پہلے ہے۔ اگرچہ ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کے لیے آرتھولوگس ہڈی والی مچھلیوں میں موجود ہیں، جیسا کہ پروٹوپٹرس انیکٹنس میں اس کے وجود سے ظاہر ہوتا ہے، جین کے آرتھولوگس کارٹلیجینس مچھلیوں میں کہیں زیادہ کثرت سے پائے گئے تھے۔ ارتقاء ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کے سالماتی ارتقاء کی نسبت کی شرح فائبرینوجن الفا سے کافی ملتی جلتی تھی اور سائٹوکروم سی کے ارتقاء کی شرح سے بہت زیادہ تیز تھی۔ انٹرایکٹنگ پروٹینز نے اسٹرینگ کے ذریعے پائے جانے والے ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 پروٹین کے فعال شراکت داروں کی پیش گوئی کی۔ کلینیکل اہمیت کینسر کے پچھلے تحقیقی مطالعات کے مطابق، جین پر مبنی ایسوسی ایشن کے تجزیے سے پتہ چلا ہے کہ جی ایل یو ایل کے ساتھ ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 وہ دو جین ہیں جن کا ہیپاٹائٹس بی وائرس سے متعلق ہیپاٹو سیلولر کارسنوما سے سب سے زیادہ تعلق ہے، جو جگر کے کینسر کی سب سے عام شکل ہے۔ ٹی ای ڈی ڈی ایم 1 کی کیریٹنوسائٹس کے ساتھ اس کی شمولیت اور مائیکرو آر این اے-31 کی روک تھام کی وجہ سے بھی اہم طبی اہمیت ہے، جو جنین امپلانٹیشن اور نشوونما کا ایک اہم ریگولیٹر ہے۔ حوالہ جات