Atromentin
ایٹرومینٹن ایک قدرتی کیمیائی مرکب ہے جو اگاریکومیسیٹس فنگس میں اگاریکلس اور تھیلیفوریلز کے ترتیب میں پایا جاتا ہے۔ اسے لیبارٹری کی ترکیب سے بھی تیار کیا جا سکتا ہے۔ کیمیائی طور پر، یہ ایک پولیفینول اور ایک بینزوکوئنون ہے۔ آٹرومینٹن کلائٹوسیب سبیلوڈنز کی ثقافتوں اور ہائیڈنیلم پیکی کے نکات میں پایا گیا ہے۔ اس کی حیاتیاتی ترکیب میں پہلے انزائموں کو ٹیپینیلا پینوائڈز میں نمایاں کیا گیا ہے۔ ان میں سے ایک کو ایٹرومینٹن سنتھٹیس کہا جاتا ہے۔ حیاتیاتی سرگرمیاں ایٹرومینٹن کی متعدد ممکنہ حیاتیاتی سرگرمیوں کا وٹرو میں مطالعہ کیا گیا ہے۔ ایٹرومینٹن میں وٹرو اینٹی بیکٹیریل سرگرمی ہوتی ہے، جو بیکٹیریا سٹریپٹوکوکس نمونیا میں انزائم اینویل-ایسیل کیریئر پروٹین ریڈکٹیس (فیٹی ایسڈ کی حیاتیاتی ترکیب کے لیے ضروری) کو روکتی ہے۔ ایٹرومینٹن ایک ہموار پٹھوں کے محرک کے طور پر دکھایا گیا ہے۔ یہ الگ تھلگ انسانی لیوکیمیا U937 خلیوں میں اپوپٹوسس کو بھی جنم دیتا ہے۔ یہ ایک اینٹی کوگولنٹ بھی ہے۔ ایٹرومینٹن کی جینیاتی اور انزیمیٹک بنیاد کو 4-ہائیڈروکسیفینیل پائروویک ایسڈ (4-ایچ پی پی) کی دو اکائیوں سے غیر ریبوسومل پیپٹائڈ سنتھٹیس جیسے انزائم (ایٹرومینٹن سنتھٹیس) کے ذریعے بائیو سنتھیسائز کیا جاتا ہے، جس میں ڈومین فن تعمیر اڈینایلیشن-تھیولیشن-تھیوسٹرس (اے-ٹی-ٹی ای) ہوتا ہے۔ 4-ایچ پی پی ایک امینو ٹرانسفرس کے ذریعے ڈیمینیشن سے تیار کیا جاتا ہے۔ ان دونوں جینوں کی جینیاتی بنیاد کلسٹرڈ ہے (یعنی ایک دوسرے سے متصل)۔ ان انزائموں کی خصوصیت سب سے پہلے ٹیپینیلا پینوائڈز میں ای کولی میں متعلقہ جینز (اے ٹی آر اے اور اے ٹی آر ڈی) کو زیادہ سے زیادہ ظاہر کرکے اور ایٹرومینٹن کی تشکیل کا مشاہدہ کرنے کے لیے 4-ایچ پی پی کے ساتھ ہولو انزائم کو انکیوبیٹ کرکے کی گئی تھی۔ اس کے بعد سویلس گریویلی میں گری اے انزائم کی خصوصیت، پیکسلس انولوٹس میں چھ (انو اے 1-6، جن میں سے انو اے 1، 2 اور 5 فعال تھے)، اور سرپولا لیکریمینز سے این پی ایس 3۔ اس کے علاوہ، الکحل ڈی ہائیڈروجنیز/آکسیڈوریڈیکٹس کے لیے ایک اور ملحقہ اور محفوظ جین انکوڈنگ ہے جس کا کام واضح نہیں ہے۔ زیادہ تر معاملات میں کلسٹرڈ بائیوسینتھیٹک جین بیسڈیومیسیٹس میں آرتھولوگس پائے جاتے ہیں۔ 23 مختلف ایٹرومینٹن پیدا کرنے والے بیسڈیومیسیٹس کے ایٹرومینٹن سنتھٹیس اور امینو ٹرانسفرس کے درمیان ایک مشترکہ پروموٹر موٹف پایا گیا جو تقریبا تمام معاملات میں الکحل ڈی ہائیڈروجنیز سے غیر حاضر تھا، جو دو ضروری جینوں کے مشترکہ ضابطے کی نشاندہی کرتا ہے جو ایک مشترکہ نقل کے عنصر کے ذریعہ ایٹرومینٹن کی پیداوار کو یقینی بناتے ہیں۔ اضافی پروموٹر موفٹس کی شناخت آٹرومینٹن جینز سے پہلے کی گئی تھی جو آٹرومینٹن کے مختلف جینیاتی ضابطوں کی نشاندہی کرتے ہوئے آکٹومائکوریہزی کے لیے بھوری رنگ کے سڑنے سے غیر حاضر تھے۔ ایس لیکریمینز سے ایٹرومینٹن سنتھٹیس اور امینو ٹرانسفرس کے جینز کو بیکٹیریا کے ساتھ شریک انکیوبیشن کے دوران اپ ریگولیٹ کیا گیا تھا۔ بائیو سنتھیسز کے لیے امینو ایسڈ نان رائبوسومل کوڈ نان رائبوسومل پیپٹائڈ سنتھٹیس جیسا انزائم (ایٹرومینٹن سنتھٹیس) جو 4-ایچ پی پی کے دو مونومرز کو متناسب طور پر گاڑھا کرتا ہے اس میں ایک ایڈینیلیشن ڈومین ہوتا ہے جو اتپریرک سے پہلے سبسٹریٹس کو قبول کرتا ہے۔ قبولیت ڈومین 10 امینو ایسڈ کوڈ پر مشتمل ہوتا ہے جسے نان ریبوسومل کوڈ (این آر پی ایس کوڈ) کہا جاتا ہے۔ یہاں، سوئلز گریویلی، گری اے سے ایٹرومینٹن سنتھٹیس کی مثال استعمال کی گئی ہے۔ کوڈ امینو ایسڈ پوزیشنز 235 (V)، 236 (A)، 239 (E)، 278 (F)، 299 (S)، 301 (G)، 322 (G)، 320 (A)، 331 (C)، 517 (K) پر پایا جاتا ہے۔ کوڈ ایس لیکریمینز (این پی ایس 3)، ٹیپینیلا پینوائڈز (اے ٹی آر اے)، اور پیکسلس انولوٹس (آئی این وی اے) سے ایٹرومینٹن سنتھٹیسیس کے ساتھ صف بندی کرتا ہے۔ اسی طرح، ایٹرومینٹن کی پیداوار کے لیے این آر پی ایس کوڈ دیگر خوشبودار الفا-کیٹو ایسڈ سے ماخوذ مرکبات کے لیے عالمگیر کوڈ کی حمایت کرتا ہے، جیسے کہ ایل-فینیلالانائن جیسے رالفورانون بی سے فینائل پائروویک ایسڈ کے ذریعے، اور ایل-ٹرپٹوفین جیسے ڈیڈیمیتھائل ایسٹریکوئنون ڈی سے انڈول-3-پائروویک ایسڈ کے ذریعے (نوٹ ایٹرومینٹن خوشبودار الفا-کیٹو ایسڈ ایل-ٹائروسین سے 4-ہائیڈروکسی فینائل پائروویک ایسڈ کے ذریعے حاصل کیا جاتا ہے)۔ پیکسیلس انولوٹس کے انوا کے لیے، تھیو ایسٹیریز ڈومین (آخری ڈومین) میں ایک عام امینو ایسڈ موٹف بھی پایا گیا جس نے بائیو کیمیکل ڈیٹا کی حمایت کی کہ یا تو انزائم ایٹرومینٹن کی تشکیل کو مکمل کرنے کے لیے فعال ہے یا نہیں۔ ایٹرومینٹن کی حیاتیاتی ترکیب خوشبودار امینو ایسڈ ایل-ٹائروسین 4-ہائیڈروکسیفینیلپیروویک ایسڈ کا پیش خیمہ ہے، اور 4-ایچ پی پی کی 2 اکائیوں کو ایٹرومینٹن بنانے کے لیے گاڑھا کیا جاتا ہے۔ ابتدائی مرحلہ امینو ٹرانسفرس کے ذریعے ڈیمینیشن ہے۔ دوسرا مرحلہ غیر ریبوسومل پیپٹائڈ سنتھٹیس جیسے انزائم (این آر پی ایس کی طرح، کیونکہ اس میں کینونکل کنڈینسیشن ڈومین نہیں ہے، جسے ایٹرومینٹن/کوئنون سنتھٹیس کہا جاتا ہے) کے ذریعے اتپریرک ہوتا ہے۔ اس این آر پی ایس جیسے انزائم کا ایڈینیلیشن ڈومین 4-ایچ پی پی کو قبول کرتا ہے جیسا کہ اے ٹی پی-پی پی آئی-ایکسچینج اسیسے کے ذریعے طے کیا جاتا ہے۔ انزائم، جب ای کولی میں تیار ہوتا ہے، تو اسے فاسفوپینٹینیئل ٹرانسفرس (پیپینٹ) کے ذریعے اس کی ہولو شکل میں تیار کرنے کی ضرورت ہوتی ہے، حالانکہ ای کولی ویو میں اپو انزائم کو پرائم کر سکتا ہے (جیسے۔ این ٹی ڈی کے ذریعے)۔ پینٹ کو کامیابی کے ساتھ سی ڈی این اے سے استعمال کیا گیا ہے جو اے نیڈولانس سے ماخوذ ہے (مثال کے طور پر۔ این پی جی اے)، سٹریپٹومیسیس ورٹیسیلس (ایس وی پی)، اور پیکسلس انولوٹس (پی پی ٹی اے)۔ کچھ مطالعات، خاص طور پر بگنس اور دیگر کی طرف سے بیکٹیریم برک ہولڈریا تھائی لینڈینسس سے، یہ ظاہر ہوا ہے کہ امینو ٹرانسفرس جین غیر حاضر ہو سکتا ہے، اور یہ سرگرمی اس کے بنیادی میٹابولزم کے ذریعے فراہم کی جا سکتی ہے۔ کنجینر روغن ایٹرومینٹن مختلف دیگر روغنوں کا پیش خیمہ ہے، بشمول پلونک ایسڈ جیسے ویریگیٹک ایسڈ، زیروکومک ایسڈ، ہوموکسیروکومک ایسڈ، آئسوکسیروکومک ایسڈ، ایٹرومینٹک ایسڈ، ویریگیٹوروبن، زیروکوموروبن، اور دیگر ترمیم شدہ مشتقات۔ اہم پلونک ایسڈ قسم کے روغن بیکٹیریا کے ساتھ شریک انکیوبیشن یا اعلی نامیاتی نائٹروجن مواد کے تعارف کے دوران خفیہ پائے گئے (غیر نامیاتی نائٹروجن پر مشتمل غیر محرک میڈیم پر نمو کے مقابلے میں)۔ ڈائریل سائکلوپینٹینونز میں انولوٹن، انولوٹن، گائروسیکینن، گائروپورین (گائروسیانن کی آکسیڈائزڈ قسم)، اینہائڈروئنولوٹن، اور کیمونکسن شامل ہیں۔ اگرچہ ساختی طور پر ایک جیسے، گریولین (اے-ڈی) 4-ایچ پی پی سے اخذ کیے گئے ہیں، جو ایٹرومینٹن کا پیش خیمہ ہے۔ گریویلن سویلس جینس کے لیے کیموٹیکسونومک مارکر ہیں۔ ایٹرومینٹن کی تبدیلیوں میں لیوکوآٹرومینٹن، لیوکومینٹن-3، لیوکومینٹن-4، اور سلنکولیوکومیلون شامل ہیں۔ مزید برآں، تھیلفورک ایسڈ ایک مشتق ہے جو تھیلفورائڈ کلاڈ سے ہے۔ اس کے پیش رو ایٹرومینٹن کی پیداوار کے لیے جینیاتی اور انزیمیٹک بنیاد کے علاوہ ان روغنوں کی تشکیل میں شامل مختلف انزائم نامعلوم ہیں۔ پیکسلس انولوٹس میں، جے جی آئی مائیکوکوسم پورٹل کے ذریعے دستیاب اینوٹیٹڈ جینوم میں چھ نان رائبوسومل پیپٹائڈ سنتھٹیس جیسے انزائموں کی نشاندہی کی گئی۔ یہ جین، جنہیں انوا 1,2,3، 4,5 اور 6 کہا جاتا ہے، ای کولی میں حد سے زیادہ ظاہر ہوئے تھے اور جینوں کی خصوصیت 4-ایچ پی پی کے ساتھ اپو انزیم کو شریک انکیوبیٹ کرنا تھا تاکہ ایٹرومینٹن کی تشکیل کا تعین کیا جا سکے جیسا کہ اس کی خصوصیت یو وی-ویس سپیکٹرم اور مونو آئسوٹوپک ماس کے ذریعہ نوٹ کیا گیا ہے۔ چھ میں سے تین انزائم فعال پائے گئے۔ اس سے بیسڈیومائیسیٹ میں ایٹرومینٹن کی پیداوار میں بے مثال بے کار پن ظاہر ہوا۔ حوالہ جات اینٹیکوگولنٹس اینٹی مائکروبیلز آکسیڈوریڈیکٹس انفیکٹرز ہائیڈروکسی بینزوکوئنونز پولیفینولز