CTXφ bacteriophage
سی ٹی ایکس ایف آئی بیکٹیریوفیج ایک فلیمینٹس بیکٹیریوفیج ہے۔ یہ ایک مثبت اسٹرینڈ ڈی این اے وائرس ہے جس میں سنگل اسٹرینڈ ڈی این اے (ایس ایس ڈی این اے) ہے۔ سی ٹی ایکس ایف آئی ویبریو ہیضے کے کچھ تناؤ کو متاثر کرتا ہے، وہ جراثیم جو ہیضے کا سبب بنتا ہے۔ یہ ہیضے کے زہر (سی ٹی ایکس) کے لیے جین رکھتا ہے، جو ہیضے کو خاص طور پر خطرناک بناتا ہے۔ یہ جین کو ایک وی ہیضے کے تناؤ سے دوسرے میں لے جا سکتا ہے۔ جینیاتی مواد سی ٹی ایکس ایف عام طور پر وی ہیضے کے جراثیم کے جینوم میں موجود اور مربوط ہوتا ہے، اور شاذ و نادر ہی جراثیم کے باہر سے آنے والے وائرین میں ہوتا ہے۔ بیکٹیریل جینوم میں ضم ہونے کے دوران، سی ٹی ایکس پروفیجز دو کروموسوم میں سے ہر ایک پر پائے جاتے ہیں (وی ہیضے کے او 1 سیرو گروپ میں) یا بڑے کروموسوم پر مل کر ترتیب دیے جاتے ہیں (وی ہیضے کے ایل ٹور بائیوٹائپ میں)۔ سی ٹی ایکس ایف آئی کا جینوم 6.9 کے بی لمبا ہے اور دو خطوں پر مشتمل ہے۔ بنیادی علاقے میں ایسے جین ہوتے ہیں جو خود سی ٹی ایکس کے لیے کوڈ کرتے ہیں اور کچھ پروٹین جن کے بارے میں خیال کیا جاتا ہے کہ وہ وائرس کا بیرونی کوٹ بناتے ہیں۔ آر ایس 2 خطے میں ایسے جین ہوتے ہیں جو سی ٹی ایکس ایف آئی کی نقل، ضابطے اور انضمام کو کنٹرول کرتے ہیں۔ میزبان خلیے سے اندراج، نقل اور اخراج وی۔ ہیضے کے جراثیم میں سی ٹی ایکس ایف جینیاتی مواد کا اندراج دو رسیپٹرز کے ذریعے کیا جاتا ہے۔ پہلا ٹاکسن کورگولیٹڈ پائلس (ٹی سی پی) ہے، جو جراثیم کو آنتوں کی خلیے کی دیوار سے چپکنے میں بھی مدد کرتا ہے۔ خیال کیا جاتا ہے کہ ٹی سی پی معمولی سی ٹی ایکس ایف کوٹ پروٹین اور ایف یو سے منسلک ہوتا ہے۔ دوسرا ٹول کیو آر اے جھلی پروٹین کا ڈھانچہ ہے۔ فیج میمبرین بائنڈنگ کے لیے یہ ضروریات ایف ایف فیجز سے کافی ملتی جلتی ہیں، جو بیکٹیریم ایسچریچیا کولی کو متاثر کرتی ہیں اور ٹول کیو آر اے ڈھانچے کے ساتھ ایف پائلس کی ضرورت ہوتی ہے۔ ای کولی میں، ٹول کیو آر اے ایف ایف فیج کو پیریپلاسمک اسپیس میں منتقل کرنے کا کام کرتا ہے، جہاں ایک ممکنہ جھلی فیوژن واقعہ ایف ایف جینوم کو ای کولی سائٹوپلازم میں داخل کرنے کا باعث بنتا ہے۔ وی ہیضے کے خلیے میں سی ٹی ایکس ایف جینیاتی مواد کے انجیکشن میں بھی اسی طرح کے طریقہ کار کا شبہ ہے، حالانکہ اس کی تصدیق کے لیے مزید تحقیق کی ضرورت ہے۔ وی۔ ہیضے کے سائٹوپلازم میں ایس ایس ڈی این اے کے داخل ہونے کے بعد، وائرل جینوم، پی سی ٹی ایکس کی پلاسمڈ شکل بنانے کے لیے ڈی این اے کا ایک تکمیلی اسٹرینڈ بنتا ہے۔ پی سی ٹی ایکس نئے ایس ایس ڈی این اے جینوم بنانے کے لیے ڈی این اے کی نقل سے گزر سکتا ہے اور/یا بیکٹیریل جینوم میں بطور پروفیسر شامل کیا جا سکتا ہے۔ چونکہ یہ پروفیج وی۔ ہیضے کے کچھ حیاتیاتی اقسام میں مل کر موجود ہو سکتا ہے، اس لیے افقی جین کی منتقلی اور اضافی سی ٹی ایکس ایف جینس کی عمودی منتقلی باہمی طور پر خصوصی نہیں ہیں۔ بیکٹیریوفیج کی نئی وائریون شکلیں بنانے کے لیے ضروری پروٹین اور جینومک مواد کی پیداوار کے بعد، پروٹین ایک جھلی پروٹین کمپلیکس، ای پی ایس ڈی سیکرٹین میں جمع ہوتے ہیں۔ ایک بار جب نیا ایس ایس ڈی این اے جینوم جمع شدہ پروٹین کے اندر ہوتا ہے، تو سی ٹی ایکس ایف وائیرین ای پی ایس ڈی سے الگ ہو جاتا ہے اور دوسرے بیکٹیریا کو متاثر کرنے کے لیے آزاد ہوتا ہے۔ فیج کے ذرات بیکٹیریا کے خلیوں سے بغیر لیسس کے خارج ہوتے ہیں۔ غیر سی ٹی ٹاکسن حالیہ تحقیق سے پتہ چلتا ہے کہ سی ٹی کے علاوہ کم از کم دو ٹاکسن سی ٹی ایکس ایف جینوم کے جینوں سے پیدا ہوتے ہیں۔ ان میں سے پہلا آلات ہیضے کا اینٹروٹاکسن (ایس) ہے۔ ایس کے بارے میں فی الحال خیال کیا جاتا ہے کہ یہ وائرین اسٹیج سی ٹی ایکس ایف آئی کا ایک معمولی کوٹ پروٹین ہے، حالانکہ اس عمل کی ابھی تک نشاندہی نہیں کی گئی ہے جس کے ذریعے پروٹین کوٹ سے زہریلا خارج کیا جا سکتا ہے۔ سی ٹی ایکس ایف جینوم کے اندر انکوڈ کیا گیا دوسرا غیر سی ٹی ٹاکسن زونولا آکلوڈینز ٹاکسن (زوٹ) ہے۔ زوٹ، اگرچہ سی ٹی ایکس ایف وائیریون کی پیداوار کے لیے بالکل ضروری ہے، لیکن فیج ذرہ میں موجود نہیں ہے۔ ہیضے کی شدت میں ایس اور زوٹ کا کردار اب بھی بالکل واضح نہیں ہے۔ حوالہ جات بیکٹیریوفیجز انوویریڈی