Podospora anserina
پوڈوسپورا اینسرینا سورڈاریالس آرڈر سے ایک فلیمینٹس ایسکومیسیٹ فنگس ہے۔ اسے سنسینس (بڑھاپا)، پرائنز، جنسی تولید، اور مییوٹک ڈرائیو کی سالماتی حیاتیات کے مطالعہ کے لیے ایک نمونہ جاندار سمجھا جاتا ہے۔ اس کا ایک لازمی جنسی اور سڈوہوموتھالک لائف سائیکل ہوتا ہے۔ یہ ایک غیر پیتھوجینک کوپروفیلس فنگس ہے جو گھڑ، خرگوش، گائے اور بھیڑ جیسے سبزی خور جانوروں کے گوبر کو آباد کرتی ہے۔ ٹیکسونومی پوڈوسپورا اینسرینا کا اصل نام مالینورنیہ اینسرینا رابن ہارسٹ (1857) تھا۔ پوڈوسپورا اینسرینا بعد میں نیسل (1883) میں شائع ہوا، جو آج کل اس سے عام لیبارٹری تناؤ، 'نیسل' کا حوالہ دینے کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ اسے پلیوریج اینسرینا (سیز) کے نام سے بھی جانا جاتا ہے۔ ٹھیک ہے۔ پی۔ اینسرینا کی جینیات کو رزیٹ اور اینگلمین (1949) میں نمایاں کیا گیا تھا اور ایسسر (1974) نے اس کا جائزہ لیا تھا۔ 18S rRNA اور پروٹین آرتھولوگس شیئر 60-70% ہومیولوجی کی بنیاد پر پی۔ اینسرینا کا تخمینہ 75 ملین سال پہلے نیوروسپورا کراسا سے الگ ہوا ہے۔ ایسپرگیلس نیڈولنس اور پوڈوسپورا اینسرینا کے درمیان جین کلسٹر آرتھولوگس میں 63 فیصد ایک جیسی بنیادی امینو ایسڈ کی ترتیب ہوتی ہے (حالانکہ یہ انواع مختلف طبقات سے ہیں) اور موازنہ شدہ پروٹیوموں کا اوسط امینو ایسڈ 10 فیصد کم ہوتا ہے، جس سے الگ الگ انواع کے مفروضوں کو جنم ملتا ہے لیکن پھر بھی مشترکہ جین ہوتے ہیں۔ ریسرچ پوڈوسپورا جینیات، بڑھاپے (سینسینس، سیل ڈیجنریشن)، ایسکومیسیٹ کی نشوونما، ہیٹروکیریئن مطابقت پذیری، فنگی، پریونز، اور مائٹوکونڈریل اور پیروکسسومل فزیولوجی میں ملاپ کا مطالعہ کرنے کے لیے ایک نمونہ جاندار ہے۔ پوڈوسپورا پیچیدہ (مکمل) آلو ڈیکسٹروز، کارن میل اگر/شوربے، یا یہاں تک کہ مصنوعی میڈیم پر آسانی سے کاشت کیا جا سکتا ہے، اور جدید سالماتی آلات کا استعمال کرتے ہوئے، اس میں ہیرا پھیری کرنا آسان ہے۔ اس کی زیادہ سے زیادہ نشوونما کا درجہ حرارت لیبارٹری کے حالات میں 7 سے 11 دنوں میں اپنا لائف سائیکل مکمل کر سکتا ہے۔ تناؤ زیادہ تر تحقیق 1920 کی دہائی میں نمونے لیے گئے فرانسیسی تناؤ کے ایک چھوٹے سے مجموعے میں کی گئی ہے، خاص طور پر ایس اینڈ ایس نامی تناؤ۔ یہ دونوں تناؤ ہیٹ-ایس لوکس کے علاوہ بہت ملتے جلتے ہونے کے لیے جانے جاتے ہیں۔ 2008 میں شائع ہونے والا حوالہ جینوم S + سے مطابقت رکھتا ہے، جو + ملاپ کی قسم کے ساتھ S تناؤ کا ایک ہیپلوئڈ مشتق ہے۔ اس کے علاوہ، دو دیگر آبادیوں کے نمونے لیے گئے ہیں، ایک یوزنگن، جرمنی میں، اور دوسرا ویگننگن، نیدرلینڈز میں، جن دونوں کو بیج کے مارنے کا مطالعہ کرنے کے لیے استعمال کیا گیا ہے، فنگی میں مییوٹک ڈرائیو کا فینوٹائپک اظہار۔ اس کے علاوہ لیب سے ماخوذ متعدد تناؤ ہیں: αPaKu70 کا استعمال تبدیلیوں کے دوران پروٹوپلاسٹ میں یکساں دوبارہ ملاپ کو بڑھانے کے لیے کیا جاتا ہے تاکہ مطلوبہ جین حذف کرنے یا ایللیک میوٹیشنز پیدا کیے جا سکیں۔ پروٹوپلاسٹ کو لکیری ڈی این اے کے ساتھ تبدیل کرکے، جو پی اے کے یو 70 جین کو اینٹی بائیوٹک کیسٹ کے ساتھ جوڑتا ہے، اور پھر تناؤ کا انتخاب کرکے اور پی سی آر کے ذریعے تصدیق کرکے، ایک پی اے کے یو 70 تناؤ حاصل کیا جا سکتا ہے۔ ایس تناؤ سے ماخوذ۔ Mn19 ایک طویل عرصے تک رہنے والا تناؤ ہے جو سنسینس کا مطالعہ کرنے کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ یہ مینگنیز (Mn) پر اگائے جانے والے تناؤ A +-84-11 سے ماخوذ ہے۔ بتایا گیا ہے کہ یہ مخصوص تناؤ ایک ریس ٹیوب میں 2 سال سے زیادہ زندہ رہا ہے جو نباتاتی نشوونما کو ڈھانپتا ہے۔ ۔ ہے نہیں علامت کی بوڑھاپن جو ہے تناؤ لافانی ایک δiδviv یہ پیلے رنگ کا روغن پیدا کرتا ہے۔ ویو کی کمی نے جنگلی قسم اور آئی کی کمی کے مقابلے میں دنوں میں زندگی کی مدت میں 2.3 فیکٹر کا اضافہ کیا۔ تاہم، تناؤ αiδviv نے پورے مطالعے کے دوران کوئی سنسینس نہیں دکھایا اور ایک سال سے زیادہ عرصے تک نباتاتی تھا۔ یہ جین ہم آہنگ ہوتے ہیں اور جسمانی طور پر قریب سے جڑے ہوتے ہیں۔ AL2 ایک طویل مدتی تناؤ ہے۔ ال-2 پر مشتمل لکیری مائٹوکونڈریل پلازمیڈ کا اندراج عمر میں اضافے کو ظاہر کرتا ہے۔ تاہم، قدرتی آئسولیٹس جن میں ال-2 کی ہم آہنگی ہوتی ہے ان کی عمر میں اضافہ نہیں ہوتا ہے۔ Δgrisea ایک طویل عرصے تک رہنے والا تناؤ اور تانبے کو لینے والا میوٹینٹ ہے۔ اس تناؤ کا تانبے سے تعلق کم ہوتا ہے اور اس طرح انٹرا سیلولر تانبے کی سطح کم ہوتی ہے، جس کی وجہ سے سائنائڈ مزاحم متبادل آکسیڈیز، پی اے او ایکس، راستہ (تانبے پر منحصر مائٹوکونڈریل سائٹوکروم سی آکسیڈیز (سی او ایکس) کمپلیکس کے بجائے) کا استعمال ہوتا ہے۔ یہ تناؤ زیادہ مستحکم ایم ٹی ڈی این اے بھی ظاہر کرتا ہے۔ تانبے کا استعمال αx1 تناؤ سے ملتا جلتا ہے۔ δex1 ایک 'لافانی تناؤ' ہے جو 12 سال سے زیادہ عرصے سے بڑھ رہا ہے اور اب بھی بڑھاپے کی کوئی علامت ظاہر نہیں کرتا ہے۔ یہ تناؤ سائانیڈ مزاحم، سیلیسیل ہائیڈروکسامک ایسڈ (SHAM) حساس راستے کے ذریعے سانس لیتا ہے۔ یہ حذف کرنا COX کمپلیکس میں خلل ڈالتا ہے۔ ایجنگ پوڈوسپورا اینسرینا کی ایک مقررہ عمر ہوتی ہے اور یہ سینسینس کو فینوٹائپک طور پر ظاہر کرتی ہے (سست نمو، کم فضائی ہائفی، اور ڈسٹل ہائفی میں روغن کی پیداوار میں اضافے سے)۔ تاہم، الگ تھلگ افراد یا تو عمر میں اضافہ یا لافانی کو ظاہر کرتے ہیں، کیونکہ عمر بڑھنے کے عمل کا مطالعہ کرنے کے لیے لافانی تناؤ پیدا کرنے یا عمر میں اضافہ کرنے کے لیے بہت سی جینیاتی ہیرا پھیری کی گئی ہے۔ عام طور پر، مائٹوکونڈرین اور مائٹوکونڈریل کروموسوم کی جانچ کی جاتی ہے۔ سنسینس اس لیے ہوتا ہے کیونکہ تنفس کے دوران رد عمل والی آکسیجن کی انواع پیدا ہوتی ہیں جو عمر کو محدود کرتی ہیں اور وقت کے ساتھ عیب دار مائٹوکونڈریل ڈی این اے جمع ہو سکتا ہے۔ اس علم کے ساتھ، غذائیت کی دستیابی، تنفس (اے ٹی پی کی ترکیب) اور آکسیڈیز، جیسے سائٹوکروم سی آکسیڈیز پر توجہ مرکوز کی گئی۔ کیروٹینائڈز، وہ روغن جو پودوں میں بھی پائے جاتے ہیں اور انسانوں کو صحت سے متعلق فوائد فراہم کرتے ہیں، پوڈوسپورا کے مختلف آباؤ اجداد نیوروسپورا کراسا جیسے فنگی میں پائے جاتے ہیں۔ این کراسا (اور دیگر فنگی) کارٹینائڈز میں تمام جین یعنی یووی تابکاری سے تحفظ فراہم کرتے ہیں۔ ال-2 پوڈوسپورا اینسرینا کے زیادہ اظہار سے عمر میں 31 فیصد اضافہ ہوا۔ کیلوری کی پابندی کے مطالعے سے پتہ چلتا ہے کہ غذائی اجزاء میں کمی، جیسے چینی، عمر میں اضافہ، ممکنہ طور پر سست میٹابولزم کی وجہ سے اور اس طرح رد عمل والے آکسیجن پرجاتیوں کی پیداوار میں کمی یا بقا کے جینوں کو متاثر کیا۔ نیز، انٹرا سیلولر تانبے کی سطح ترقی کے ساتھ منسلک پائی گئی۔ اس کا مطالعہ گریزیا-ڈیلیٹڈ اور ایکس 1-ڈیلیٹڈ تناؤ کے ساتھ ساتھ جنگلی قسم کے ایس تناؤ میں بھی کیا گیا۔ گریشیا کے بغیر پوڈوسپورا، ایک تانبے کی نقل کے عنصر، نے انٹرا سیلولر تانبے کی سطح کو کم کر دیا تھا جو ایک متبادل سانس کے راستے کے استعمال کا باعث بنتا ہے جس کے نتیجے میں کم آکسیڈیٹیو تناؤ پیدا ہوتا ہے۔ ہیٹروکیریئن مطابقت پذیری درج ذیل جینز، ایللیک اور غیر متوازی دونوں، نباتاتی مطابقت پذیری میں ملوث پائے جاتے ہیں (صرف وہ کلون اور خصوصیات درج ہیں): ہیٹ-سی، ہیٹ-سی، ہیٹ-ایس، آئی ڈی آئی-2، آئی ڈی آئی-1، آئی ڈی آئی-3، موڈ-اے، موڈ-ڈی، موڈ-ای، پی ایس پی-اے۔ پوڈوسپورا اینسرینا میں کم از کم 9 ہیٹ لوکی ہوتے ہیں۔ انزائمز پوڈوسپورا اینسرینا لیکسیس تیار کرنے کے لیے جانا جاتا ہے، جو کہ فینولوکسائڈیز کی ایک قسم ہے۔ جینیات جیل الیکٹروفورسس کے ذریعہ اصل جینیاتی مطالعات 7 کروموسوم اور 1 مائٹوکونڈریل کروموسوم کے ساتھ جینوم سائز، میگا بیس کی تلاش کا باعث بنے۔ 1980 کی دہائی میں مائٹوکونڈریل کروموسوم کی ترتیب دی گئی تھی۔ پھر، 2003 میں، بی اے سی کلون اور براہ راست ترتیب کا استعمال کرتے ہوئے کروموسوم V کے سینٹرومیر سے متصل علاقوں کی ترتیب کے لیے ایک پائلٹ مطالعہ شروع کیا گیا۔ 2008 میں، ایک 10x مکمل جینوم ڈرافٹ سیکوینس شائع کیا گیا تھا۔ جینوم کا سائز اب 35-36 میگا بیس ہونے کا تخمینہ لگایا گیا ہے۔ فنگس میں جینیاتی ہیرا پھیری کم ہومولوگس ریکومبینیشن کی کارکردگی کی وجہ سے مشکل ہے اور جو ایلیل متبادل کا استعمال کرتے ہوئے جینیاتی مطالعات میں رکاوٹ بنتی ہے۔ 2005 میں، جین کو حذف کرنے کا ایک طریقہ ایسپرگیلس نیڈولانس کے ماڈل کی بنیاد پر تیار کیا گیا تھا جس میں کاسمڈ پلازمیڈ کی تبدیلی شامل تھی۔ پوڈوسپورا کے لیے ایک بہتر نظام 2008 میں ایک ایسے تناؤ کا استعمال کرتے ہوئے تیار کیا گیا تھا جس میں نان ہومولوگس اینڈ جوائننگ پروٹین (کے یو (پروٹین) کی کمی تھی، جسے پوڈوسپورا میں پاکیو 70 کے نام سے جانا جاتا ہے۔ اس طریقہ کار کے بارے میں دعوی کیا جاتا ہے کہ ٹرانسفارمینٹس کے 100% مطلوبہ ہومولوگس ریکومبینیشن سے گزرتے ہیں جس کے نتیجے میں ایللیک متبادل ہوتا ہے، اور تبدیلی کے بعد، پی اے کے یو 70 حذف کرنے کو جنگلی قسم کے تناؤ کے ساتھ عبور کر کے بحال کیا جا سکتا ہے تاکہ صرف ٹارگٹڈ جین حذف کرنے یا ایللیک ایکسچینج (مثال کے طور پر۔ پوائنٹ میوٹیشن)۔ ثانوی میٹابولائٹس یہ اچھی طرح سے جانا جاتا ہے کہ تمام ڈومینز میں بہت سے جاندار ثانوی میٹابولائٹس پیدا کرتے ہیں، اور فنگی اس سلسلے میں بہت زیادہ ہیں۔ 1990 کی دہائی میں پوڈوسپورا جینس کے لیے مصنوعات کی کان کنی اچھی طرح سے جاری تھی۔ پوڈوسپورا اینسرینا سے پینٹاکیٹائڈز کے طور پر درجہ بند دو نئی قدرتی مصنوعات، خاص طور پر بینزوکوئنونز کے مشتق، دریافت کی گئیں۔ ان میں اینٹی فنگل، اینٹی بیکٹیریل اور سائٹوٹوکسک سرگرمیاں ظاہر ہوئیں۔ افقی جین کی منتقلی بیکٹیریا میں اور پروکیریوٹس اور یوکیریوٹس کے درمیان عام ہے پھر بھی یوکیریوٹک حیاتیات کے درمیان زیادہ نایاب ہے۔ فنگی کے درمیان، ثانوی میٹابولائٹ کلسٹرز افقی جین کی منتقلی کے لیے اچھے امیدوار ہیں، مثال کے طور پر، ایک فعال ایس ٹی جین کلسٹر جو سٹیرگمیٹو سسٹین پیدا کرتا ہے، پوڈوسپورا اینسرینا میں پایا گیا تھا اور اصل میں ایسپرگلس سے ماخوذ تھا۔ یہ کلسٹر اچھی طرح سے محفوظ ہے، بشمول، خاص طور پر، ٹرانسکرپشن فیکٹر بائنڈنگ سائٹس۔ سٹیریگمیٹو سسٹین خود زہریلا ہے اور ایک اور زہریلے میٹابولائٹ، افلاٹاکسن کا پیش خیمہ ہے۔ یہ بھی دیکھیں کہ فنگل پرائنز PXMP3 وائرس کی درجہ بندی OLIGO پرائمر تجزیہ سافٹ ویئر پوائنٹ اتپریورتن امیلوئڈ حوالہ جات بیرونی لنکس لاسیوسفیریاسی ٹیکسا جس کا نام گوٹلوب لڈوگ رابن ہورسٹ فنگی نے 1857 ماڈل حیاتیات میں بیان کیا ہے۔