Incomplete lineage sorting
نامکمل نسب کی چھانٹ، جسے ہیمپلیسی، گہری ہم آہنگی، آبائی پولیمورفزم کو برقرار رکھنا، یا ٹرانس اسپیسیس پولیمورفزم بھی کہا جاتا ہے، آبادی کی جینیات میں ایک رجحان کو بیان کرتا ہے جب آبائی جین کی کاپیاں (وقت میں پیچھے کی طرف دیکھنا) ایک عام آبائی کاپی میں جمع ہونے میں ناکام رہتی ہیں جب تک کہ پچھلے قیاس آرائی کے واقعات سے زیادہ گہرا نہ ہو۔ یہ جینیاتی پولیمرفزم کی نسب کی ترتیب کی وجہ سے ہوتا ہے جو پرجاتیوں کے درخت میں مسلسل نوڈس میں برقرار رکھے گئے تھے۔ دوسرے لفظوں میں، ایک ہی جین سے پیدا ہونے والا درخت آبادی یا نوع کی سطح کے درخت سے مختلف ہوتا ہے، جس سے ایک متضاد درخت پیدا ہوتا ہے۔ طریقہ کار جو بھی ہو، نتیجہ یہ ہے کہ پیدا شدہ انواع کی سطح کا درخت تشخیص کے لیے استعمال ہونے والے منتخب جینوں کے لحاظ سے مختلف ہو سکتا ہے۔ یہ مکمل نسب کی چھانٹ کے برعکس ہے، جہاں جین سے پیدا ہونے والا درخت آبادی یا پرجاتیوں کی سطح کے درخت کے برابر ہوتا ہے۔ دونوں فائیلوجنیٹک تجزیہ میں عام نتائج ہیں، حالانکہ یہ جین، حیاتیات اور نمونے لینے کی تکنیک پر منحصر ہے۔ تصور نامکمل نسب کی چھانٹ کے تصور کے فائیلوجنیٹک تکنیکوں کے لیے کچھ اہم مضمرات ہیں۔ مختلف انواع کے واقعات میں پولیمرفزم کی استقامت نامکمل نسب کی چھانٹ کا سبب بن سکتی ہے۔ فرض کریں کہ اس کے بعد کے دو قیاس آرائی کے واقعات واقع ہوتے ہیں جہاں ایک آباؤ اجداد کی نوع پہلے پرجاتیوں اے کو جنم دیتی ہے، اور دوسرا پرجاتیوں بی اور سی کو۔ ایک ہی جین کا مطالعہ کرتے وقت، اس کے متعدد ورژن (ایللیز) ہو سکتے ہیں جس کی وجہ سے مختلف کردار ظاہر ہوتے ہیں (پولیمرفزم)۔ شکل 1 میں دکھائی گئی مثال میں، جین G کے دو ورژن (ایلیلز) ہیں، G0 اور G1۔ A، B اور C کے آباؤ اجداد میں اصل میں جین G، G0 کا صرف ایک ورژن تھا۔ کسی وقت، ایک تغیر واقع ہوا اور آبائی آبادی پولیمرفک ہو گئی، کچھ افراد میں G0 اور دیگر میں G1 تھا۔ جب انواع اے تقسیم ہوئی تو اس نے صرف جی 1 کو برقرار رکھا، جبکہ بی اور سی کا آباؤ اجداد پولیمرفک رہا۔ جب B اور C الگ ہوئے تو B نے صرف G1 اور C صرف G0 کو برقرار رکھا۔ نہ ہی اب G میں پولیمرفک تھے۔ جین G کا درخت A اور B کو بہنوں کے طور پر دکھاتا ہے، جبکہ پرجاتیوں کا درخت B اور C کو بہنوں کے طور پر دکھاتا ہے۔ اگر ان انواع کی فائیلوجینی جین جی پر مبنی ہے، تو یہ انواع کے درمیان حقیقی تعلقات کی نمائندگی نہیں کرے گی۔ دوسرے لفظوں میں، سب سے زیادہ متعلقہ انواع لازمی طور پر سب سے زیادہ متعلقہ جین کے وارث نہیں ہوں گے۔ یہ یقینا نامکمل نسب کی چھانٹ کی ایک آسان مثال ہے، اور حقیقی تحقیق میں یہ عام طور پر زیادہ پیچیدہ ہوتا ہے جس میں زیادہ جین اور انواع ہوتے ہیں۔ تاہم، دیگر میکانزم اسی واضح تضاد کا باعث بن سکتے ہیں، مثال کے طور پر، ایلیلز ہائبرڈائزیشن کے ذریعے انواع کی حدود میں منتقل ہو سکتے ہیں، اور ڈی این اے کو وائرس کے ذریعے انواع کے درمیان منتقل کیا جا سکتا ہے۔ اس کی وضاحت شکل 2 میں کی گئی ہے۔ یہاں اے، بی اور سی کے آباؤ اجداد اور بی اور سی کے آباؤ اجداد کے پاس جین جی کا صرف جی 0 ورژن تھا۔ بی اور سی کے انحراف پر اے میوٹیشن ہوا، اور بی نے ایک میوٹیٹڈ ورژن، جی 1 حاصل کیا۔ کچھ وقت بعد، تیر سے پتہ چلتا ہے کہ G1 کو کسی طرح سے B سے A میں منتقل کیا گیا تھا (جیسے۔ ہائبرڈائزیشن یا افقی جین کی منتقلی)۔ تین انواع میں G کی صرف حتمی حالتوں کا مطالعہ کرنے سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ A اور B B اور C کے بجائے بہنیں ہیں، جیسا کہ شکل 1 میں ہے، لیکن شکل 2 میں یہ نامکمل نسب کی چھانٹ کی وجہ سے نہیں ہے۔ اثرات نامکمل نسب کی چھانٹ کے فائیلوجنیٹک تحقیق کے لیے اہم مضمرات ہیں۔ اس بات کا امکان ہے کہ ایک فائیلوجنیٹک درخت بناتے وقت اس نامکمل نسب کی چھانٹ کی وجہ سے یہ حقیقی تعلقات سے مشابہت نہیں رکھتا ہے۔ تاہم، ہائبرڈائزیشن یا افقی جین کی منتقلی کے ذریعے نسلوں کے درمیان جین کا بہاؤ ایک ہی متضاد فائیلوجنیٹک درخت پیدا کر سکتا ہے۔ ان مختلف عملوں میں فرق کرنا مشکل لگ سکتا ہے، لیکن ان ارتقائی حرکیات میں زیادہ بصیرت حاصل کرنے کے لیے بہت زیادہ تحقیق اور مختلف شماریاتی نقطہ نظر تیار کیے جا رہے ہیں۔ نامکمل نسب کی چھانٹ کے مضمرات کو کم کرنے کی قراردادوں میں سے ایک یہ ہے کہ انواع یا آبادی کے فائیلوجینیز بنانے کے لیے متعدد جینوں کا استعمال کیا جائے۔ جتنے زیادہ جین استعمال ہوتے ہیں، فائیلوجینی اتنی ہی زیادہ قابل اعتماد ہوتی ہے۔ ڈپلوئڈ حیاتیات میں نامکمل نسب کی چھانٹ عام طور پر جنسی تولیدی عمل کے ساتھ ہوتی ہے کیونکہ اس نوع کا سراغ کسی ایک شخص یا افزائش نسل کے جوڑے سے نہیں لگایا جا سکتا۔ جب جاندار قبائل کی آبادی بڑی ہوتی ہے (یعنی۔ ہزاروں) ہر جین میں کچھ تنوع ہوتا ہے اور جین کا درخت پہلے سے موجود دیگر نسلوں پر مشتمل ہوتا ہے۔ اگر آبادی زیادہ ہے تو یہ آبائی نسب طویل عرصے تک برقرار رہیں گے۔ جب آپ قریب سے وقت پر قیاس آرائی کے واقعات کے ساتھ بڑی آبائی آبادی کو اکٹھا کرتے ہیں تو ڈی این اے کے یہ مختلف ٹکڑے متضاد وابستگی کو برقرار رکھتے ہیں۔ اس سے مشترکہ آباؤ اجداد یا شاخوں کے نکات کا تعین کرنا مشکل ہو جاتا ہے۔ پرائمیٹ ارتقاء میں پرائمیٹس کا مطالعہ کرتے وقت، چمپینزی اور بونوبوس کسی بھی دوسرے ٹیکسا کے مقابلے میں ایک دوسرے سے زیادہ متعلق ہوتے ہیں اور اس طرح بہن ٹیکسا ہوتے ہیں۔ پھر بھی، بونوبو جینوم کے 1.6 ٪ کے لیے، ترتیبات چمپینزی کے مقابلے میں انسانوں کے ہم جنس پرستوں سے زیادہ قریب سے متعلق ہیں، جو شاید نامکمل نسب کی چھانٹ کا نتیجہ ہے۔ ہومینیڈی خاندان (انسانوں سمیت عظیم بندر) میں 23,000 سے زیادہ ڈی این اے ترتیب کی صف بندی کے مطالعے سے پتہ چلا ہے کہ تقریبا 23 فیصد نے چمپینزی اور انسانوں کے معروف بہن تعلقات کی حمایت نہیں کی۔ انسانی ارتقاء میں، نامکمل نسب کی چھانٹ کا استعمال ہومینین نسلوں کے خاکے کے لیے کیا جاتا ہے جو شاید اسی وقت ترتیب دینے میں ناکام رہے ہوں گے جب قبل از تاریخ میں قیاس آرائی ہوئی تھی۔ جینیاتی جانچ اور جینوم کی ترتیب کی آمد کی وجہ سے، محققین نے پایا کہ ہومینن نسلوں کے درمیان جینیاتی تعلقات جسمانی خصوصیات کی بنیاد پر ان کے تعلق کی سابقہ تفہیم سے متفق نہیں ہو سکتے ہیں۔ مزید برآں، آخری مشترکہ آباؤ اجداد (ایل سی اے) کا انحراف لازمی طور پر اسی وقت نہیں ہو سکتا جب قیاس آرائی ہو۔ نسب کی چھانٹ ایک ایسا طریقہ ہے جو ماہرین آثار قدیمہ کو جینیاتی تعلقات اور تغیرات کو تلاش کرنے کی اجازت دیتا ہے جو صرف فائیلوجینی پر مبنی ان کے پچھلے سپیسیشن ماڈلز کے ساتھ فٹ نہیں ہو سکتے ہیں۔ انسانی خاندانی درخت کی نامکمل نسب کی چھانٹ بہت دلچسپی کا علاقہ ہے۔ قدیم انسانوں سے جدید انسانوں میں منتقلی اور ہومینین نسب سے دوسرے عظیم بندروں کے انحراف دونوں پر غور کرتے وقت متعدد نامعلوم ہیں۔ بندر اور ہومینن/انسانی انحراف نامکمل نسب کی چھانٹ کا مطلب ہے کہ جینوں کے درمیان اوسط انحراف کا وقت انواع کے درمیان انحراف کے وقت سے مختلف ہو سکتا ہے۔ نمونوں سے پتہ چلتا ہے کہ انسان اور چمپینزی کے جینوم میں جینوں کے درمیان اوسط انحراف کا وقت انسانوں اور گوریلوں کے درمیان تقسیم سے پرانا ہے۔ اس کا مطلب یہ ہے کہ انسانوں اور چمپینزی کے مشترکہ آباؤ اجداد نے جینیاتی مواد کے نشانات چھوڑے ہیں جو انسانوں، چمپینزی اور گوریلوں کے مشترکہ آباؤ اجداد میں موجود تھے۔ تاہم، جینیاتی درخت انواع یا فائیلوجینی درخت سے قدرے مختلف ہے۔ فائیلوجینی ٹری میں جب ہم انسان، بونوبو چمپینزی اور گوریلوں کے درمیان ارتقائی تعلقات کو دیکھتے ہیں، تو نتائج سے پتہ چلتا ہے کہ بونوبو اور چمپینزی کی علیحدگی وقت کے قریب بونوبو-چمپینزی آباؤ اجداد اور انسانوں کے مشترکہ آباؤ اجداد کے قریب واقع ہوئی، جس سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ گوریلوں سے علیحدگی کے بعد انسانوں اور چمپینزی نے کئی ملین سالوں تک ایک مشترکہ آباؤ اجداد کا اشتراک کیا۔ اس سے وہ رجحان پیدا ہوتا ہے جو نامکمل نسب کی چھانٹ ہے۔ آج محققین انسانوں اور ان کے ہم منصبوں کے درمیان ارتقائی تعلقات کا مطالعہ کرنے کے لیے ڈی این اے کے ٹکڑوں پر انحصار کر رہے ہیں اس امید پر کہ یہ مختلف قسم کے انسانوں کے جینوموں سے نسل پرستی اور آبائی عمل کے بارے میں معلومات فراہم کرے گا۔ وائرسوں میں نامکمل نسب کی چھانٹ وائرل فائیلوڈینامکس میں ایک عام خصوصیت ہے، جہاں فائیلوجینی کی نمائندگی ایک شخص سے دوسرے شخص میں بیماری کی منتقلی سے ہوتی ہے، جسے آبادی کی سطح کا درخت کہا جاتا ہے، اکثر آبادی کی رکاوٹوں کی وجہ سے جینیاتی تجزیہ سے پیدا ہونے والے درخت سے مطابقت نہیں رکھتا ہے جو بیماری کی وائرل منتقلی کی ایک موروثی خصوصیت ہے۔ شکل 3 سے پتہ چلتا ہے کہ یہ کیسے ہو سکتا ہے۔ اس کا تعلق ایچ آئی وی کی مجرمانہ منتقلی سے ہے جہاں کچھ مجرمانہ معاملات میں، ملزم اور متاثرہ کے تناؤ سے ایک یا دو جینوں کا فائیلوجنیٹک تجزیہ ٹرانسمیشن کا اندازہ لگانے کے لیے استعمال کیا گیا ہے ؛ تاہم، نامکمل نسب کی چھانٹ کی مشترکیت کا مطلب یہ ہے کہ ٹرانسمیشن کا اندازہ صرف اس طرح کے بنیادی تجزیے کی بنیاد پر نہیں لگایا جا سکتا۔ لسانیات میں جیکس اینڈ لسٹ (2019) سے پتہ چلتا ہے کہ نامکمل نسب کی چھانٹ کے تصور کا اطلاق زبان کے ارتقاء میں غیر روایتی مظاہر کے لیے کیا جا سکتا ہے۔ کلیان اور فرانکوئس (2019)، تاریخی گلوٹومیٹری کے طریقہ کار کے حامی، جو تاریخی لسانیات میں درخت کے ماڈل کے اطلاق کو چیلنج کرنے والا ایک ماڈل ہے، اس بات سے اتفاق کرتے ہیں کہ "تاریخی گلوٹومیٹری خاندانی درخت کے ماڈل کو چیلنج نہیں کرتا ہے جب نامکمل نسب کی چھانٹ کو مدنظر رکھا جاتا ہے"۔ گبن-انسان کے آخری مشترکہ آباؤ اجداد لگگر فالکن کولیسینٹ تھیوری ملٹی اسپیشیز کولیسینٹ عمل نسب (ارتقاء) حوالہ جات بیرونی روابط فائیلوجنیٹکس آبادی جینیات