SHIFTCOR
شفٹکور (شفٹ کریکشن) ایک آزادانہ طور پر دستیاب ویب سرور کے ساتھ ساتھ پروٹین کیمیائی شفٹ ری ریفرنسنگ کے لیے ایک اسٹینڈ الون کمپیوٹر پروگرام ہے۔ کیمیائی شفٹ ریفرنسنگ بائیو مالیکیولر این ایم آر میں ایک خاص طور پر وسیع مسئلہ ہے جس میں موجودہ این ایم آر کیمیائی شفٹ اسائنمنٹس میں سے 25 فیصد تک کا غلط حوالہ دیا جاتا ہے۔ حوالہ دینے کے ان مسائل میں سے کچھ 1 سے 2.5 پی پی ایم (خاص طور پر 13 سی اور 15 این کیمیائی شفٹوں میں) کے درمیان منظم غلطیوں کا باعث بن سکتے ہیں۔ اس شدت کی غلطیاں پروٹین کے درمیان تفویض کا موازنہ کرنے یا ساختی طور پر کیمیائی تبدیلیوں کی تشریح کرنے کی کسی بھی کوشش کے ساتھ تباہی مچا سکتی ہیں۔ یہ شناخت کرنا کہ کون سے پروٹین کو غلط طریقے سے تفویض کیا گیا ہے یا غلط طریقے سے حوالہ دیا گیا ہے مشکل ہو سکتا ہے، جیسا کہ غلطیوں کے پائے جانے کے بعد انہیں درست کیا جا سکتا ہے۔ شفٹ کور پروگرام ان کیمیائی شفٹ حوالہ جات کے مسائل کی شناخت اور ان کو ٹھیک کرنے میں مدد کے لیے ڈیزائن کیا گیا تھا۔ خاص طور پر یہ پیپٹائڈز اور پروٹین کی 1H، 13C اور 15N ریڑھ کی ہڈی کی کیمیائی شفٹوں کا موازنہ، شناخت، اصلاح اور دوبارہ حوالہ دیتا ہے جس میں مشاہدہ شدہ کیمیائی شفٹوں کا موازنہ دلچسپی کے پروٹین (پروٹینز) کے 3D ڈھانچے (PDB کوآرڈینیٹس کا استعمال کرتے ہوئے) سے حاصل ہونے والی پیش گوئی شدہ کیمیائی شفٹوں سے کیا جاتا ہے۔ پیش گوئی شدہ کیمیائی تبدیلیوں کا حساب شفٹ ایکس پروگرام کا استعمال کرتے ہوئے لگایا جاتا ہے۔ شفٹکور پروگرام اصل میں ریف ڈی بی نامی مناسب طریقے سے دوبارہ حوالہ شدہ پروٹین کیمیائی شفٹ اسائنمنٹس کا ڈیٹا بیس بنانے کے لیے استعمال کیا گیا تھا۔ ریف ڈی بی 2000 سے زیادہ صحیح حوالہ شدہ پروٹین کیمیائی شفٹ اسائنمنٹس کا ایک ویب قابل رسائی ڈیٹا بیس ہے۔ اگرچہ اصل میں صرف ایک اسٹینڈ ایلون پروگرام کے طور پر دستیاب ہے، اس کے بعد سے شفٹکور کو ویب سرور کے طور پر عام استعمال کے لیے جاری کیا گیا ہے۔ کیمیائی شفٹ این ایم آر پروٹین ڈھانچہ ڈیٹا بیس پروٹین کیمیائی شفٹ پروٹین ثانوی ڈھانچہ پروٹین کیمیائی شفٹ پیشن گوئی کیمیائی شفٹ انڈیکس پروٹین این ایم آر حوالہ جات بیرونی روابط شفٹ ایکس آر ایف ڈی بی نیوکلیئر مقناطیسی گونج سافٹ ویئر پروٹین طریقے پروٹین ڈھانچہ بائیو فزکس کیمسٹری سافٹ ویئر حیاتیاتی ڈیٹا بیس