Multiple loci VNTR analysis
ایک سے زیادہ لوکی وی این ٹی آر تجزیہ (ایم ایل وی اے) ایک ایسا طریقہ ہے جو مخصوص مائکروجنزموں کے جینیاتی تجزیے کے لیے استعمال کیا جاتا ہے، جیسے کہ پیتھوجینک بیکٹیریا، جو بیک وقت دہرائے جانے والے ڈی این اے ترتیبات کی پولیمورفزم سے فائدہ اٹھاتا ہے۔ "وی این ٹی آر" ایک "متغیر نمبر ٹینڈم ریپیٹ" ہے۔ یہ طریقہ فارنسک سائنس میں اچھی طرح سے جانا جاتا ہے کیونکہ یہ انسانوں میں ڈی این اے فنگر پرنٹنگ کی بنیاد ہے۔ جب بیکٹیریا پر لاگو کیا جاتا ہے، تو یہ فارنسک مائکروبیولوجی میں معاون ہوتا ہے جس کے ذریعے کسی خاص تناؤ کے منبع کا پتہ لگایا جا سکتا ہے، جس سے یہ وباء کی نگرانی کے لیے ایک مفید تکنیک بن جاتی ہے۔ ایک عام ایم ایل وی اے میں، متعدد اچھی طرح سے منتخب اور خصوصیت والے (تغیر کی شرح اور تنوع کے لحاظ سے) لوکی کو پولیمریز چین ری ایکشن (پی سی آر) کے ذریعے بڑھایا جاتا ہے، تاکہ ہر لوکس کے سائز کی پیمائش کی جا سکے، عام طور پر حوالہ ڈی این اے کے ٹکڑوں (ایک نام نہاد ڈی این اے سائز مارکر) کے ساتھ مل کر امپلیفیکیشن مصنوعات کے الیکٹروفورسس کے ذریعے۔ مختلف الیکٹروفورسس آلات کا استعمال مطلوبہ سائز کے تخمینے کی درستگی اور مقامی لیبارٹری سیٹ اپ کے لحاظ سے کیا جا سکتا ہے، بنیادی ایگروز جیل الیکٹروفورسس سے لے کر زیادہ نفیس اور ہائی تھرو پٹ کیپلری الیکٹروفورسس ڈیوائسز تک۔ اس سائز کے تخمینے سے، ہر لوکس پر ریپیٹ یونٹس کی تعداد کا اندازہ لگایا جا سکتا ہے۔ نتیجے میں حاصل ہونے والی معلومات ایک کوڈ ہے جس کا موازنہ ایک بار جانچ کو ہم آہنگ اور معیاری بنانے کے بعد حوالہ ڈیٹا بیس سے آسانی سے کیا جا سکتا ہے۔ ایم ایل وی اے متعدد پیتھوجینز میں پہلی لائن ٹائپنگ کا ایک بڑا ذریعہ بن گیا ہے جہاں اس طرح کی ہم آہنگی حاصل کی جا سکتی ہے، بشمول مائیکوبیکٹیریم ٹیوبرکلوسس، بیسیلس اینتھریسس، بروسیلا۔ کچھ ایم ایل وی اے سے وابستہ ویب سائٹس https://web.archive.org/web/20141225151444/http:// tendemrepeat. u-psud.fr HTTP:// mlva. u-psud.fr http://www.mlva.eu http://www.umcutrecht.nl/subsite/MLVA http://miru-vntrplus.org http://www.pasteur.fr/recherche/genopole/PF8/mlva http://mlva.net https://web.archive.org/web/20130927082141/http:// microgeno. org/سافٹ ویئر ایم ایل وی اے ڈیٹا کے تجزیے کے لیے جین میپر کیپلیری الیکٹروفورسس مشینوں کے ایک مخصوص برانڈ سے چوٹیوں کو معمول پر لانے اور سائز کال کرنے کے لیے ایک تجارتی سافٹ ویئر ہے۔ بائیو عددی حیاتیاتی اعداد و شمار کے ایک بڑے پینل کو ذخیرہ کرنے اور تجزیہ کرنے کے لیے ایک تجارتی بائیو انفارمیٹکس حل، بشمول ایم ایل وی اے، اور زیادہ عام طور پر کریکٹر ڈیٹا سیٹس۔ نارملائزیشن، سائز کالنگ، سائز کی اصلاح، دہرانے کی تعداد کی تفویض اور ایم ایل وی اے ڈیٹا پر کلسٹر تجزیہ کیا جا سکتا ہے۔ حوالہ جات جینیاتی تکنیک تکراری ڈی این اے ترتیبات