Twisted intercalating nucleic acid
ٹوسٹڈ انٹرکالیٹنگ نیوکلک ایسڈ (ٹی آئی این اے) ایک نیوکلک ایسڈ انو ہے جو، جب ٹرپلکس بنانے والے اولیگونیوکلیوٹائڈز (ٹی ایف اوز) میں شامل کیا جاتا ہے، تو ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے (ڈی ایس ڈی این اے) اور ٹی ایف اوز سے ہوگسٹین ٹرپلکس ڈی این اے کی تشکیل کو مستحکم کرتا ہے۔ ٹرپل بانڈ کے گرد موڑنے کی اس کی صلاحیت ٹرپلکس ڈی این اے بنانے کے لیے ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے کے اندر باہمی تعامل میں آسانی کو بڑھاتا ہے۔ واٹسن-کرک اینٹی پیریلل ڈوپلیکس ڈی این اے کو مستحکم کرنے کے لیے کچھ ترتیبات دکھائی گئی ہیں۔ ٹیینا-ڈی این اے پرائمرز کو پی سی آر میں بائنڈنگ کی خاصیت میں اضافہ کرنے کے لیے دکھایا گیا ہے۔ جی-کواڈروپلیکس میں ٹینا کے اندراج کا استعمال بھی اینٹی ایچ آئی وی-1 سرگرمی کو بڑھانے کے لیے دکھایا گیا ہے۔ ٹینا مستحکم پی ٹی ڈی این اے پر مبنی طبی تشخیصی جانچ کی بہتر حساسیت اور خاصیت کا مظاہرہ کرتا ہے۔ ٹرپل ایکس ڈی این اے ٹرپل ہیلکس اس وقت تشکیل پاتے ہیں جب ایک سنگل اسٹرینڈڈ ٹرپل ایکس بنانے والا اولیگونیوکلیوٹائڈ (ٹی ایف او) مخصوص بڑے نالی تعاملات کے ذریعے ڈی ایس ڈی این اے کے پیورین پر مشتمل اسٹرینڈ سے جڑا ہوتا ہے۔ عام طور پر، متوازی (پائریمائڈائن) بائنڈنگ موٹف میں جسمانی حالات کے تحت پی ایچ حساس سی +-جی-سی ہوگسٹین بیس ٹرپلکس کی تشکیل کی ضرورت کی وجہ سے، ٹی ایف او کا تیسرا رخ کم ہوتا ہے۔ ٹی ایف اوز میں ترمیم کی کوشش کی گئی ہے تاکہ ان کے اہداف کے ساتھ ان کے پابند وابستگی کو بہتر بنایا جا سکے اور نئے ٹرپلکس نیوکلیو بیسز کے ڈیزائن کے ساتھ ڈی ایس ڈی این اے ترتیب میں پابندیوں کو کم کیا جا سکے۔ حال ہی میں، یہ پایا گیا ہے کہ ہوموپائریمیڈائن اولیگوڈیوکسینوکلیوٹائڈز کے وسط میں (R)-1-O-[4-(1-پائرینائلتھائنائل) فینائلمیتھائل] گلسرول (ٹی آئی این اے) کا بلج اندراج ہوگسٹین قسم کے ٹرپلکس اور ڈوپلیکس میں تھرمل استحکام کو جنم دے سکتا ہے، جبکہ اسی نیوکلیوٹائڈ مواد کے واٹسن-کرک قسم کے ڈوپلیکس غیر مستحکم تھے۔ ٹی ایم کو بڑھانے کے لیے، بیس کے فرق کو ٹی ایف او کے مرکز میں رکھا جانا چاہیے اور جب ممکن ہو تو، اے، سی یا ٹی سے جی بیس کے فرق سے گریز کیا جانا چاہیے۔ بیس مماثلتوں کو بیس مماثلت کے ہر طرف ٹینا کے باہمی تعامل کے ذریعے بے اثر کیا جا سکتا ہے اور ٹینا کے براہ راست 3 'یا 5' کے ذریعے نقاب کیا جا سکتا ہے۔ ڈی این اے ہائبرڈائزیشن کا استعمال کرتے ہوئے تشخیصی تجزیے اینٹی پیریلل ڈوپلیکس ہیلیسیس کی علیحدگی سے محدود ہوتے ہیں۔ اسے ڈی این اے کو مستحکم کرنے والے مالیکیولز جیسے کہ آرتھو-ٹی آئی این اے جیسے انٹرکیلیٹرز کا استعمال کرکے بہتر بنایا جا سکتا ہے، جو ڈوپلیکس کی تشکیل کو مستحکم کریں گے۔ مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ استحکام میں سب سے زیادہ اضافہ اس وقت ہوا جب 3 'اور 5' سروں پر انٹرکالیٹنگ پرائمر استعمال کیے گئے۔ اولیگونیوکلیوٹائڈ میں ٹینا مالیکیول کی تعیناتی پروب ہائبرڈائزیشن کی تجزیاتی حساسیت کو بہتر بنانے کی صلاحیت رکھتی ہے۔ پیرا-ٹی آئی این اے مالیکیول تمام پوزیشنوں میں ٹی ایم کو کم کرتے ہیں خاص طور پر جب اولیگونیوکلیوٹائڈ کے مرکز میں ہوتے ہیں، جبکہ آرتھو-ٹی آئی این اے مالیکیولز میں، مرکز میں غیر جانبدار ہونے کے ساتھ کہیں بھی بہتری دیکھی گئی۔ اندرونی ٹینا مالیکیول کے ساتھ ٹرمینل پیرا-یا آرتھو-مالیکیول کے امتزاج نے ٹی ایم میں سب سے زیادہ اضافہ ظاہر کیا۔ ٹی این اے مالیکیولز کو ٹی ایم میں زیادہ سے زیادہ اضافے کے لیے ٹرمینل طور پر رکھا جانا چاہیے۔ ٹی ایم میں اضافہ جانچ کی خاصیت میں اضافہ کرتا ہے، جیسے پی سی آر۔ اینٹی ایچ آئی وی-1 سرگرمی حالیہ مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ جی-کواڈروپلیکس میں ٹینا کے اندراج کا استعمال بھی اینٹی ایچ آئی وی-1 سرگرمی کو بڑھانے کے لیے دکھایا گیا ہے۔ اس طرح کے مطالعات میں، دو جی کواڈروپلیکسس جو سیل لائنوں پر اینٹی ایچ آئی وی-1 سرگرمی کو ظاہر کرتے ہیں، ان میں لاکڈ نیوکلک ایسڈ (ایل این اے) یا ٹینا کے اندراج کا استعمال کرتے ہوئے ترمیم کی گئی۔ اس کا شامل ہونا اینٹی ایچ آئی وی-1 سرگرمی میں 8 گنا بہتری فراہم کرتا ہے اور 5 'فاسفیٹ کا تعارف جی-کواڈروپلیکس کی ڈائمرائزیشن کو روکنے کے لیے دکھایا گیا تھا۔ اولیگونیوکلیوٹائڈز بنانے والے بہت سے اینٹی وائرل کواڈروپلیکسز نے زیادہ تھرمل طور پر مستحکم جی-کواڈروپلیکسز اور ہائی آرڈر جی کواڈروپلیکس ڈھانچے بھی بنائے، جو مشاہدہ کردہ اینٹی وائرل سرگرمی کے لیے ذمہ دار ہو سکتے ہیں۔ علاج کی ایپلی کیشنز ٹی ایف او اینٹی جین تھراپی میں وعدہ رکھتے ہیں، ان کی اعلی ترتیب کی خاصیت کی وجہ سے۔ تاہم، ویو میں پوٹاشیم کی سطح TFOs کو واحد طور پر G-کوآرٹیٹ ڈھانچے بنانے کے لیے فروغ دیتی ہے، TFOS کو ٹرپلکس تشکیل میں تعامل کرنے سے روکتی ہے اور TFO سیل تھراپی کی تاثیر کو کم کرتی ہے۔ تاہم، جیسا کہ پیراماسیوم اور دیگر کی طرف سے دکھایا گیا ہے، زیادہ گوانائن کے ارتکاز والے ٹی ایف اوز میں (آر)-1-او-[4-(1-پیرینیلیتھائنائل) فینائلمیتھائل] گلسرول (ٹی آئی این اے) کا بلج اندراج پوٹاشیم کے ذریعے سیلف ایسوسی ایشن کی موجودگی کو بہت کم کر دیتا ہے۔ اس کے بعد، ٹینا-ٹی ایف اوز کو مستقبل میں ویو میں جینوم کو نشانہ بنانے اور علاج کے مقصد کی طرف جینوم میں ہیرا پھیری کرنے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ پیورین ٹینا-ٹی ایف او کا استعمال کے آر اے ایس پروٹو-اونکوجین کی طرف اینٹی جین مالیکیول کے طور پر مخصوص وعدہ رکھتا ہے۔ حوالہ جات نیوکلک ایسڈ