Toxic Small RNA
سالماتی حیاتیات میں، زہریلا چھوٹا آر این اے (ٹی ایس آر این اے، ٹی آر این اے سے ماخوذ چھوٹے آر این اے کے ساتھ الجھن میں نہ پڑنا) ٹرانس انکوڈڈ چھوٹے غیر کوڈنگ آر این اے کا ایک خاندان ہے جو خصوصی طور پر بیٹاپروٹوبیکٹیریا کے بین جنیاتی علاقوں میں پایا جاتا ہے۔ کئی متوازی لوکی ہر کوڈنگ جینوم میں اسی طرح کے (لیکن ایک جیسے نہیں) ٹی ایس آر این اے کو انکوڈ کر سکتے ہیں۔ عام طور پر، برک ہولڈریا کی ہر نوع میں 3 سے 5 یکساں ٹی ایس آر این اے ہوتے ہیں۔ برک ہولڈریا نسب کی چار انواع کے ساتھ تجربات نے لوگرتھمک نمو کے مراحل میں ٹی ایس آر این اے کے محفوظ اور آئینی اظہار کو دکھایا۔ ترتیب اور ساخت برک ہولڈریا سینوسیپاسیا میں 4 ٹی ایس آر این اے کے ثانوی ڈھانچوں کی خصوصیت سے پتہ چلتا ہے کہ وہ ڈبل ہیئر پن ڈھانچے بناتے ہیں۔ بعض اوقات، یہ ڈھانچہ آر این اے پر کارروائی کے بعد ہی نتیجہ اخذ کرتا ہے (جیسا کہ این سی ایس 27 میں)۔ عام طور پر، ثانوی ڈھانچے کے غیر جوڑے والے حصوں میں سی یو سے بھرپور (سائٹوسین اور یوراسل سے بھرپور) خطہ ہوتا ہے۔ یہ سی یو سے مالا مال خطہ ایک فعال خطہ ہونے کا مشورہ دیا جاتا ہے جو ایم آر این اے کے رائبوسوم بائنڈنگ سائٹ (آر بی ایس) کو باندھتا ہے۔ فنکشن اگرچہ عمل کا طریقہ کار ہدف کے لحاظ سے مختلف ہو سکتا ہے، لیکن یہ تجویز کیا گیا ہے کہ ٹی ایس آر این اے متعدد ایم آر این اے کے رائبوسوم بائنڈنگ تسلسل کو باندھ کر جین کے اظہار کو منظم کرتے ہیں۔ ہرباسپیرلم سیروپیڈیکی میں پائے جانے والے ٹی ایس آر این اے کا کم جی سی (گوانائن اور سائٹوسین) مواد اس مفروضے کی تائید کرے گا۔ یہ ممکن ہے کہ اس تعامل کو مستحکم کرنے کے لیے چیپرون پروٹین ایچ ایف کیو کی ضرورت ہو، لیکن اس کا کردار واضح نہیں ہے۔ وسیع پیمانے پر، یہ تجویز کیا جاتا ہے کہ ٹی ایس آر این اے برک ہولڈریا میں کاربوہائیڈریٹ اور امینو ایسڈ میٹابولزم کو منظم کرتے ہیں۔ ان کا زیادہ اظہار اس وقت ہوتا ہے جب بی۔ سینوسیپیشیا کو بھوک کے ماحول کے مقابلے میں گلوکوز سے بھرپور میڈیم میں اگایا جاتا ہے۔ اس کے برعکس، ٹی ایس آر این اے کا حد سے زیادہ اظہار امینو ایسڈ سے بھرپور ماحول میں نشوونما کو متاثر کرتا ہے۔ نشوونما کی یہ تخفیف میڈیم کے مخصوص مواد پر منحصر ہوتی ہے، کیونکہ بہت سے ماحول میں اب بھی معمول کی نشوونما ہوتی ہے۔ اگرچہ زیادہ تر مخصوص ٹی ایس آر این اے بڑی حد تک غیر خصوصیت والے ہیں، لیکن این سی ایس 27 کے فنکشن کا مطالعہ کیا گیا ہے۔ اس میں ایک محفوظ ترتیب ہوتی ہے جو بہت سے نقل و حمل اور میٹابولک ٹرانسکرپٹس کی شائن-ڈالگرنو ترتیب کی الٹی تکمیل ہے۔ ممکنہ اہداف میں بہت سے جین شامل ہیں جو کاربوہائیڈریٹ کی نقل و حمل اور خوشبودار امینو ایسڈ کے انحطاط کو منظم کرتے ہیں۔ مخصوص اہداف میں 4-ہائیڈروکسیفینیلپیروویک ایسڈ ڈائی آکسیجنیز (ایچ پی پی ڈی) اور انڈولیپیروویٹ فیریڈوکسن آکسیڈوریڈیکٹس (آئی او آر) شامل ہیں۔ یہ انزائم فینائلالینائن اور ٹائروسین کیٹابولزم میں شامل ہوتے ہیں۔ دیگر ممکنہ اہداف میں اے ٹی پی بائنڈنگ کیسٹ ٹرانسپورٹرز (اے بی سی ٹرانسپورٹرز) میں گلیسرول کنیز اور سبسٹریٹ بائنڈنگ پروٹین شامل ہیں۔ لہذا، شواہد کے بہت سے ٹکڑے بتاتے ہیں کہ ٹی ایس آر این اے کاربوہائیڈریٹ اور امینو ایسڈ میٹابولزم کو منظم کرتے ہیں، تاہم، اس فنکشن کی تصدیق نہیں ہوئی ہے۔ ایک نسبتا غیر مطالعہ شدہ ٹی ایس آر این اے، این سی ایس 62، کو ٹی این-سیک ڈیٹا کی بنیاد پر ضروری ہونے کا مشورہ دیا گیا ہے۔ اصل میں، ٹی ایس آر این اے کا نام اس لیے رکھا گیا تھا کہ وہ کلوننگ ویکٹر پر ظاہر ہونے پر ای کولی کی نشوونما کو روکتے پائے گئے تھے۔ وہ طریقہ کار جس کے ذریعے ٹی ایس آر این اے زہریلے ہوتے ہیں ابھی تک نامعلوم ہے۔ ٹی ایس آر این اے ای کولی کے لیے زہریلے نہیں ہوتے جب نشوونما کے ذریعے میں ہوتے ہیں، اور نہ ہی جب ای کولی کے ساتھ اگائے جاتے ہیں تو وہ بی سینوسیپیشیا کے ذریعے خفیہ ہوتے ہیں۔ مزید برآں، وہ بیکٹیریا کے لیے زہریلے نہیں ہیں جن میں یہ آر این اے مالیکیول پائے جاتے ہیں (بی۔ سینوسیپیشیا)۔ این سی آر این اے کے اس خاندان کے لیے نام کی تبدیلی تجویز کی گئی ہے۔ ان کی ساخت کی بنیاد پر، بعض ٹی ایس آر این ایز کو 'ڈبل ہیئر پن آر این ایز' کہنے کی تجویز پیش کی گئی ہے۔ اصل میں 2015 (این سی ایس 27) میں شناخت شدہ ایک ٹی ایس آر این اے کو برک ہولڈریا ڈبل ہیئرپین ایس آر این اے ریگولیٹر کے لیے بی ڈی ایچ آر 1 کا نام تجویز کیا گیا ہے۔ ایسچریچیا کولی ایس آر این اے ایکسٹرا سیلولر آر این اے کی فہرست آر این اے کی آر ایف اے ایم آر این اے مداخلت چھوٹی مداخلت کرنے والی آر این اے چھوٹے نیوکلولر آر این اے سے ماخوذ مائیکرو آر این اے بیرونی روابط پین ڈاٹکس-جینوں کا ایک ڈیٹا بیس جو بیکٹیریا کے لیے زہریلا ہے۔ آر ایف اے ایم ڈیٹا بیس-متعلقہ این سی آر این اے کے سینکڑوں خاندانوں کی ایک کیوریٹڈ فہرست حوالہ جات غیر کوڈنگ آر این اے