Biomolecular Object Network Databank
بائیو مالیکیولر آبجیکٹ نیٹ ورک ڈیٹا بینک ایک بائیو انفارمیٹکس ڈیٹا بینک ہے جس میں چھوٹے مالیکیول ڈھانچوں اور تعاملات کے بارے میں معلومات ہوتی ہیں۔ ڈیٹا بینک متعدد موجودہ ڈیٹا بیس کو مربوط کرتا ہے تاکہ کسی مخصوص مالیکیول کے لیے فی الحال دستیاب معلومات کا جامع جائزہ فراہم کیا جا سکے۔ پس منظر بلیو پرنٹ انیشی ایٹو ٹورنٹو کے ماؤنٹ سینا ہسپتال میں سیموئل لونن فیلڈ ریسرچ انسٹی ٹیوٹ میں ڈاکٹر کرسٹوفر ہوگ کی لیب میں ایک تحقیقی پروگرام کے طور پر شروع ہوا۔ 14 دسمبر 2005 کو انلیشڈ انفارمیٹکس لمیٹڈ نے دی بلیو پرنٹ انیشی ایٹو انٹلیکچوئل پراپرٹی کے تجارتی حقوق حاصل کر لیے۔ اس میں پروٹین انٹرایکشن ڈیٹا بیس بائنڈ، چھوٹے مالیکیول انٹرایکشن ڈیٹا بیس ایس ایم آئی ڈی کے ساتھ ساتھ ڈیٹا گودام سیک ہاؤنڈ کے حقوق شامل تھے۔ انلیشڈ انفارمیٹکس ایک ڈیٹا مینجمنٹ سروس فراہم کنندہ ہے اور ڈاکٹر ہوگ کی رہنمائی میں دی بلیو پرنٹ انیشی ایٹو کے انتظام اور علاج کی نگرانی کر رہا ہے۔ کنسٹرکشن بانڈ اصل بلیو پرنٹ انیشی ایٹو ڈیٹا بیس کے ساتھ ساتھ دیگر ڈیٹا بیس، جیسے جین بینک، کو ان ڈیٹا کا تجزیہ کرنے کے لیے درکار بہت سے ٹولز کے ساتھ جوڑتا ہے۔ ترتیبات کے لیے اینوٹیشن لنک، بشمول ٹیکسون شناخت کنندگان، بے کار ترتیبات، جین آنٹولوجی کی وضاحتیں، مین شناخت کنندگان میں آن لائن مینڈیلین وراثت، محفوظ ڈومینز، ڈیٹا بیس کراس حوالہ جات، لوکس لنک شناخت کنندگان اور مکمل جینوم بھی دستیاب ہیں۔ بانڈ کراس ڈیٹا بیس سوالات کی سہولت فراہم کرتا ہے اور ایک کھلا رسائی کا وسیلہ ہے جو تعامل اور ترتیب کے ڈیٹا کو مربوط کرتا ہے۔ چھوٹے مالیکیول انٹرایکشن ڈیٹا بیس (ایس ایم آئی ڈی) چھوٹے مالیکیول انٹرایکشن ڈیٹا بیس ایک ڈیٹا بیس ہے جس میں پروٹین ڈومین چھوٹے مالیکیول انٹرایکشن ہوتے ہیں۔ یہ محفوظ ڈومین ڈیٹا بیس (سی ڈی ڈی) میں پائے جانے والے ڈومین خاندانوں کی شناخت کے لیے ڈومین پر مبنی نقطہ نظر کا استعمال کرتا ہے، جو استفسار کے چھوٹے مالیکیول کے ساتھ تعامل کرتے ہیں۔ این سی بی آئی کا سی ڈی ڈی کئی مختلف ذرائع سے ڈیٹا کو یکجا کرتا ہے ؛ پروٹین فیملیز (پی ایف اے ایم)، سمپل ماڈیولر آرکیٹیکچر ریسرچ ٹول (ایس ایم اے آر ٹی)، کلسٹر آف آرتھولوگس جینز (سی او جیز)، اور این سی بی آئی کے اپنے کیوریٹڈ سیکوینس۔ ایس ایم آئی ڈی میں ڈیٹا پروٹین ڈیٹا بینک (پی ڈی بی) سے حاصل کیا جاتا ہے، جو معروف پروٹین کرسٹل ڈھانچوں کا ایک ڈیٹا بیس ہے۔ ایس ایم آئی ڈی سے پروٹین جی آئی، ڈومین شناخت کنندہ، پی ڈی بی آئی ڈی یا ایس ایم آئی ڈی آئی ڈی درج کر کے پوچھ گچھ کی جا سکتی ہے۔ تلاش کے نتائج ڈیٹا بیس میں شناخت شدہ ہر تعامل کے لیے چھوٹے مالیکیول، پروٹین اور ڈومین کی معلومات فراہم کرتے ہیں۔ غیر حیاتیاتی رابطوں کے ساتھ تعاملات کو عام طور پر پہلے سے طے شدہ طور پر اسکرین کیا جاتا ہے۔ ایس ایم آئی ڈی-بلاسٹ ایک ایسا ٹول ہے جو چھوٹے مالیکیول بائنڈنگ سائٹس کی تشریح کرنے کے ساتھ ساتھ پروٹین میں بائنڈنگ سائٹس کی پیش گوئی کرنے کے لیے تیار کیا گیا ہے جن کے کرسٹل ڈھانچے کا ابھی تعین نہیں کیا گیا ہے۔ پیشن گوئی پی ڈی بی میں پائے جانے والے معروف تعاملات کے اخراج پر مبنی ہے، جو دلچسپی کے ایک چھوٹے سے مالیکیول کے ساتھ غیر کرسٹلائزڈ پروٹین کے درمیان تعاملات پر مبنی ہے۔ پی ڈی بی سے معلوم چھوٹے مالیکیول تعاملات کے ٹیسٹ سیٹ کے خلاف ایس ایم آئی ڈی-بلاسٹ کی توثیق کی گئی تھی۔ اسے پروٹین-چھوٹے مالیکیول کے تعاملات کا درست پیش گوئی کرنے والا دکھایا گیا تھا۔ پیش گوئی شدہ تعاملات کا 60 فیصد یکساں طور پر پی ڈی بی اینوٹیٹڈ بائنڈنگ سائٹ سے ملتا جلتا ہے، اور ان میں سے 73 فیصد میں پروٹین کے بائنڈنگ باقیات کا 80 فیصد سے زیادہ صحیح طریقے سے شناخت کیا گیا تھا۔ ہوگ، سی اور دیگر۔ اندازہ لگایا گیا ہے کہ 45 فیصد پیش گوئیاں جو پی ڈی بی کے اعداد و شمار میں نہیں دیکھی گئیں وہ حقیقت میں حقیقی مثبت کی نمائندگی کرتی ہیں۔ بائیو مالیکیولر انٹرایکشن نیٹ ورک ڈیٹا بیس (بائنڈ) تعارف تمام معروف سالماتی تعاملات کو دستاویز کرنے کے لیے ڈیٹا بیس کا خیال اصل میں ٹونی پاوسن نے 1990 کی دہائی میں پیش کیا تھا اور بعد میں اسے یونیورسٹی آف ٹورنٹو کے سائنسدانوں نے برٹش کولمبیا یونیورسٹی کے تعاون سے تیار کیا تھا۔ بائیو مالیکیولر انٹرایکشن نیٹ ورک ڈیٹا بیس (بی آئی این ڈی) کی ترقی کو کینیڈین انسٹی ٹیوٹ آف ہیلتھ ریسرچ (سی آئی ایچ آر)، جینوم کینیڈا، کینیڈین فاؤنڈیشن فار انوویشن اور اونٹاریو ریسرچ اینڈ ڈویلپمنٹ فنڈ کی گرانٹ سے تعاون حاصل ہے۔ بائنڈ کو اصل میں حیاتیاتی سالماتی تعاملات، سالماتی کمپلیکس اور راستوں سے متعلق معلومات کے لیے مسلسل بڑھتے ہوئے ذخیرے کے طور پر ڈیزائن کیا گیا تھا۔ چونکہ پروٹومکس ایک تیزی سے ترقی کرنے والا شعبہ ہے، اس لیے محققین کے لیے سائنسی جرائد سے معلومات آسانی سے دستیاب ہونے کی ضرورت ہے۔ بائنڈ سیلولر عمل میں شامل سالماتی تعاملات اور راستوں کو سمجھنے میں سہولت فراہم کرتا ہے اور بالآخر سائنس دانوں کو ترقیاتی عمل اور بیماری کے پیتھوجینسیس کے بارے میں بہتر تفہیم فراہم کرے گا۔ بائنڈ پروجیکٹ کے بڑے اہداف یہ ہیں: ایک عوامی پروٹومکس وسائل بنانا جو سب کے لیے دستیاب ہو ؛ دوسرے ذرائع سے ڈیٹا مائننگ کو فعال کرنے کے لیے ایک پلیٹ فارم بنانا (پری بائنڈ) ؛ پیچیدہ سالماتی تعاملات کے تصورات پیش کرنے کے قابل پلیٹ فارم بنانا۔ شروع سے ہی، بائنڈ کھلی رسائی رہا ہے اور سافٹ ویئر کو آزادانہ طور پر تقسیم اور ترمیم کیا جا سکتا ہے۔ فی الحال، بائنڈ میں ڈیٹا کی تفصیلات، ڈیٹا بیس اور متعلقہ ڈیٹا مائننگ اور ویژوئلائزیشن ٹولز شامل ہیں۔ آخر کار، یہ امید کی جاتی ہے کہ بائنڈ ہر بڑے ماڈل حیاتیات میں ہونے والے تمام تعاملات کا مجموعہ ہوگا۔ ڈیٹا بیس ڈھانچہ بائنڈ تین قسم کے ڈیٹا پر مشتمل ہے: تعاملات، سالماتی کمپلیکس اور راستے۔ تعاملات بائنڈ کا بنیادی جزو ہیں اور یہ بیان کرتے ہیں کہ کس طرح 2 یا اس سے زیادہ اشیاء (A اور B) ایک دوسرے کے ساتھ تعامل کرتے ہیں۔ اشیاء مختلف قسم کی چیزیں ہو سکتی ہیں: ڈی این اے، آر این اے، جین، پروٹین، لگینڈ، یا فوٹون۔ تعامل اندراج میں کسی مالیکیول کے بارے میں سب سے زیادہ معلومات ہوتی ہیں۔ یہ اس کے نام اور مترادفات کے بارے میں معلومات فراہم کرتا ہے، جہاں یہ پایا جاتا ہے (مثال کے طور پر۔ خلیے میں کہاں، کون سی نوع، کب فعال ہے، وغیرہ۔ )، اور اس کی ترتیب یا جہاں اس کی ترتیب مل سکتی ہے۔ تعامل اندراج ان وٹرو، کیمیائی حرکیات (بشمول تھرموڈینامکس اور حرکیات) میں بائنڈنگ کا مشاہدہ کرنے کے لیے درکار تجرباتی حالات کا بھی خاکہ پیش کرتا ہے۔ بائنڈ اندراجات کی دوسری قسم سالماتی کمپلیکس ہیں۔ سالماتی کمپلیکس کی تعریف ان مالیکیولز کے مجموعے کے طور پر کی جاتی ہے جو مستحکم ہوتے ہیں اور ایک دوسرے سے جڑے ہونے پر ایک فنکشن رکھتے ہیں۔ ریکارڈ میں مختلف تعاملات میں کمپلیکس کے کردار کے بارے میں کچھ معلومات بھی ہو سکتی ہیں اور سالماتی کمپلیکس اندراج 2 یا اس سے زیادہ تعاملات کے ریکارڈ سے ڈیٹا کو جوڑتا ہے۔ بائنڈ کا تیسرا جزو پاتھ وے ریکارڈ سیکشن ہے۔ ایک راستہ تعاملات کے ایک نیٹ ورک پر مشتمل ہوتا ہے جو سیلولر عمل کے ضابطے میں شامل ہوتا ہے۔ اس حصے میں فینوٹائپز اور راستے سے متعلق بیماریوں کے بارے میں بھی معلومات ہو سکتی ہیں۔ بائنڈ میں اندراج بنانے کے لیے درکار معلومات کی کم از کم رقم پب میڈ اشاعت کا حوالہ اور دوسرے ڈیٹا بیس میں اندراج ہے (جیسے۔ جین بینک)۔ ڈیٹا بیس کے اندر ہر اندراج ڈیٹا کے لیے حوالہ جات/مصنفین فراہم کرتا ہے۔ چونکہ بائنڈ ایک مسلسل بڑھتا ہوا ڈیٹا بیس ہے، اس لیے بائنڈ کے تمام اجزاء اپ ڈیٹس اور تبدیلیوں کو ٹریک کرتے ہیں۔ بائنڈ خلاصہ نحو نوٹیشن 1 (ASN.1) زبان کا استعمال کرتے ہوئے لکھی گئی ڈیٹا کی تفصیلات پر مبنی ہے۔ ASN.1 کا استعمال این سی بی آئی اپنے اینٹریز سسٹم کے لیے ڈیٹا اسٹور کرتے وقت بھی کرتا ہے اور اس وجہ سے بی آئی این ڈی ڈیٹا کی نمائندگی کے لیے این سی بی آئی جیسے ہی معیارات کا استعمال کرتا ہے۔ ASN.1 زبان کو ترجیح دی جاتی ہے کیونکہ اس کا آسانی سے ڈیٹا کی تفصیلات کی دوسری زبانوں میں ترجمہ کیا جا سکتا ہے (مثال کے طور پر۔ ایکس ایم ایل)، پیچیدہ ڈیٹا کو آسانی سے سنبھال سکتا ہے اور تمام حیاتیاتی تعاملات پر لاگو کیا جا سکتا ہے-نہ کہ صرف پروٹین۔ بیڈر اور ہوگ (2000) نے بائنڈ کے ذریعہ استعمال کردہ ASN.1 ڈیٹا کی تفصیلات پر ایک تفصیلی مخطوطہ تیار کیا ہے۔ ڈیٹا بیس میں ڈیٹا جمع کرنے اور کیوریشن صارف کے جمع کرنے کی حوصلہ افزائی کی جاتی ہے۔ ڈیٹا بیس میں حصہ ڈالنے کے لیے، کسی کو لازمی طور پر جمع کرنا چاہیے: رابطہ کی معلومات، پب میڈ شناخت کنندہ اور دو مالیکیول جو تعامل کرتے ہیں۔ جو شخص ریکارڈ جمع کراتا ہے وہ اس کا مالک ہوتا ہے۔ تمام ریکارڈوں کو عام کرنے سے پہلے تصدیق شدہ کیا جاتا ہے اور معیار کی یقین دہانی کے لیے بائنڈ تیار کیا جاتا ہے۔ بائنڈ کیوریشن میں دو ٹریک ہوتے ہیں: ہائی تھرو پٹ (ایچ ٹی پی) اور لو تھرو پٹ (ایل ٹی پی)۔ ایچ ٹی پی ریکارڈ ان کاغذات سے ہوتے ہیں جنہوں نے ایک تجرباتی طریقہ کار سے 40 سے زیادہ تعامل کے نتائج کی اطلاع دی ہے۔ ایچ ٹی پی کیوریٹرز عام طور پر بائیو انفارمیٹکس پس منظر رکھتے ہیں۔ ایچ ٹی پی کیوریٹر تجرباتی ڈیٹا کو جمع کرنے کے ذمہ دار ہیں اور وہ نئی اشاعتوں کی بنیاد پر بائنڈ کو اپ ڈیٹ کرنے کے لیے اسکرپٹ بھی بناتے ہیں۔ ایل ٹی پی ریکارڈ ان افراد کے ذریعے تیار کیے جاتے ہیں جن کے پاس ایم ایس سی یا پی ایچ ڈی اور انٹرایکشن ریسرچ میں لیبارٹری کا تجربہ ہوتا ہے۔ ایل ٹی پی کیوریٹرز کو کینیڈین بائیو انفارمیٹکس ورکشاپس کے ذریعے مزید تربیت دی جاتی ہے۔ چھوٹے مالیکیول کیمسٹری کے بارے میں معلومات کیمسٹوں کے ذریعے الگ سے تیار کی جاتی ہیں تاکہ یہ یقینی بنایا جا سکے کہ کیوریٹر اس موضوع کے بارے میں جانکاری رکھتا ہے۔ بائنڈ کیوریشن کی ترجیح ایل ٹی پی پر توجہ مرکوز کرنا ہے تاکہ معلومات اکٹھا کی جا سکیں جیسا کہ اسے شائع کیا جاتا ہے۔ اگرچہ، ایچ ٹی پی مطالعات ایک ہی وقت میں مزید معلومات فراہم کرتے ہیں، لیکن ایل ٹی پی کے مزید مطالعات رپورٹ کیے جا رہے ہیں اور دونوں ٹریکس کے ذریعے یکساں تعداد میں تعاملات کی اطلاع دی جا رہی ہے۔ 2004 میں، بائنڈ نے 110 جرائد سے ڈیٹا اکٹھا کیا۔ ڈیٹا بیس گروتھ بائنڈ میں اس کے تصور کے بعد سے نمایاں اضافہ ہوا ہے ؛ درحقیقت، ڈیٹا بیس میں 2003 اور 2004 کے درمیان اندراجات میں 10 گنا اضافہ دیکھا گیا۔ ستمبر 2004 تک، 2004 تک 100,000 سے زیادہ تعامل کے ریکارڈ موجود تھے (بشمول 58,266 پروٹین-پروٹین، 4,225 جینیاتی، 874 پروٹین-چھوٹے مالیکیول، 25,857 پروٹین-ڈی این اے، اور 19,348 بائیو پولیمر تعاملات)۔ ڈیٹا بیس میں 31,972 پروٹین، 4560 ڈی این اے نمونے اور 759 آر این اے نمونوں کی ترتیب کی معلومات بھی شامل ہیں۔ یہ اندراجات 11,649 اشاعتوں سے جمع کیے گئے ہیں ؛ اس لیے ڈیٹا بیس ڈیٹا کے ایک اہم امتزاج کی نمائندگی کرتا ہے۔ ڈیٹا بیس میں اندراجات والے حیاتیات میں شامل ہیں: Saccharomyces cerevisiae، Drosophila melanogaster، Homo sapiens، Mus musculus، Caenorhabditis elegans، Helicobacter pylori، Bos taurus، HIV-1، Gallus gallus، Arabidopsis thaliana، نیز دیگر۔ ستمبر 2004 تک مجموعی طور پر 901 ٹیکسوں کو شامل کیا گیا اور بائنڈ کو بائنڈ-میٹازوا، بائنڈ-فنگی اور بائنڈ-ٹیکسروٹ میں تقسیم کیا گیا ہے۔ نہ صرف ڈیٹا بیس میں موجود معلومات کو مسلسل اپ ڈیٹ کیا جاتا ہے، بلکہ سافٹ ویئر خود بھی کئی ترامیم سے گزرا ہے۔ بائنڈ کا ورژن 1 1999 میں جاری کیا گیا تھا اور صارف کے تاثرات کی بنیاد پر اس میں ترمیم کی گئی تھی تاکہ بائنڈنگ کے لیے درکار تجرباتی حالات پر اضافی تفصیل اور تعامل کے سیلولر لوکیشن کی درجہ بندی کی تفصیل شامل کی جا سکے۔ ورژن 2.0 2001 میں جاری کیا گیا تھا اور اس میں دوسرے ڈیٹا بیس میں دستیاب معلومات سے لنک کرنے کی صلاحیت شامل تھی۔ ورژن 3 (2002) نے جینیاتی تعاملات کو بھی شامل کرنے کے لیے ڈیٹا بیس کو فزیکل/بائیو کیمیکل تعاملات سے بڑھایا۔ ورژن 3.5 (2004) میں ایک بہتر صارف انٹرفیس شامل تھا جس کا مقصد معلومات کی بازیافت کو آسان بنانا تھا۔ 2006 میں، بائنڈ کو بائیو مالیکیولر آبجیکٹ نیٹ ورک ڈیٹا بیس (بائنڈ) میں شامل کیا گیا جہاں اسے اپ ڈیٹ اور بہتر بنایا جا رہا ہے۔ خصوصی خصوصیات بائنڈ اپنی نوعیت کا پہلا ڈیٹا بیس تھا جس میں ایک اسکیما میں حیاتیاتی سالماتی تعاملات، رد عمل اور راستوں کے بارے میں معلومات شامل تھیں۔ یہ کیمسٹری پر اپنی آنٹولوجی کی بنیاد رکھنے والا پہلا ادارہ بھی ہے جو سالماتی تعاملات کی 3D نمائندگی کی اجازت دیتا ہے۔ بنیادی کیمسٹری سالماتی تعاملات کو ریزولوشن کی جوہری سطح تک بیان کرنے کی اجازت دیتی ہے۔ سائنسی ادب میں حیاتیاتی سالماتی تعامل کی معلومات کا پتہ لگانے کے لیے ڈیٹا مائننگ کے لیے ایک متعلقہ نظام کو پہلے سے ترتیب دیں۔ پروٹین کا نام یا الحاق نمبر درج کیا جا سکتا ہے اور پری بی آئی این ڈی ادب کو اسکین کرے گا اور ممکنہ طور پر تعامل کرنے والے پروٹین کی فہرست واپس کرے گا۔ بائنڈ بلاسٹ پروٹین کے ساتھ تعاملات تلاش کرنے کے لیے بھی دستیاب ہے جو استفسار میں بیان کردہ پروٹین سے ملتے جلتے ہیں۔ بائنڈ کئی "خصوصیات" پیش کرتا ہے جو بہت سے دوسرے پروٹومکس ڈیٹا بیس میں شامل نہیں ہیں۔ اس پروگرام کے مصنفین نے امینو ایسڈ میں ہونے والی ترجمے کے بعد کی تبدیلیوں کو بیان کرنے میں مدد کے لیے روایتی آئی یو پی اے سی نام کی توسیع کی ہے۔ ان ترامیم میں شامل ہیں: ایسیٹیلیشن، فارمیلیشن، میتھیلیشن، پالمیٹولیشن وغیرہ۔ روایتی آئی یو پی اے سی کوڈز کی توسیع ان امینو ایسڈ کو ترتیب کی شکل میں بھی پیش کرنے کی اجازت دیتی ہے۔ بائنڈ ایک منفرد ویژولائزیشن ٹول کا بھی استعمال کرتا ہے جسے آنٹوگلیفس کہا جاتا ہے۔ آنٹوگلیفس جین آنٹولوجی (جی او) کی بنیاد پر تیار کیے گئے تھے اور اصل جی او معلومات کا لنک فراہم کرتے ہیں۔ کئی جی او اصطلاحات کو زمروں میں تقسیم کیا گیا ہے، ہر ایک سیل میں ایک مخصوص فنکشن، بائنڈنگ سپیسیفیٹی، یا لوکلائزیشن کی نمائندگی کرتا ہے۔ مجموعی طور پر 83 آنٹوگلیف حروف ہیں۔ 34 فعال آنٹوگلیفس ہیں جن میں سالمے کے کردار کے بارے میں معلومات ہوتی ہیں (مثال کے طور پر۔ سیل فزیولوجی، آئن ٹرانسپورٹ، سگنلنگ)۔ 25 بائنڈنگ آنٹوگلیفس ہیں جو بیان کرتے ہیں کہ انو کیا باندھتا ہے (مثال کے طور پر۔ لگینڈ، ڈی این اے، آئن)۔ دیگر 24 آنٹوگلیفس سیل کے اندر مالیکیول کے مقام کے بارے میں معلومات فراہم کرتے ہیں (مثال کے طور پر۔ نیوکلئس، سائٹوسکیلیٹن)۔ آنٹوگلیفس کو منتخب کیا جا سکتا ہے اور تلاش کے نتائج سے کچھ خصوصیات کو شامل یا خارج کرنے کے لیے ہیرا پھیری کی جا سکتی ہے۔ آنٹوگلیفس کی بصری نوعیت تلاش کے نتائج کو دیکھتے وقت پیٹرن کی شناخت میں بھی سہولت فراہم کرتی ہے۔ پروٹیوگلیفس محفوظ ڈومینز کی سطح پر پروٹین کی ساختی اور بائنڈنگ خصوصیات کی گرافیکل نمائندگی ہیں۔ پروٹین کو سیدھی افقی لکیر کے طور پر خاکہ بنایا جاتا ہے اور محفوظ ڈومینز کی نمائندگی کے لیے گلیفس داخل کیے جاتے ہیں۔ ہر گلیف کو پروٹین کی ترتیب میں اس کی صف بندی کی متعلقہ پوزیشن اور لمبائی کی نمائندگی کرنے کے لیے دکھایا جاتا ہے۔ ڈیٹا بیس تک رسائی ڈیٹا بیس یوزر انٹرفیس ویب پر مبنی ہے اور متن یا رسائی نمبر/شناخت کاروں کا استعمال کرتے ہوئے اس سے پوچھ گچھ کی جا سکتی ہے۔ بانڈ کے دیگر اجزاء کے ساتھ اس کے انضمام کے بعد سے، نتائج میں تعاملات، سالماتی کمپلیکس اور راستوں میں ترتیبات شامل کیے گئے ہیں۔ ریکارڈز میں معلومات شامل ہیں: بائنڈ آئی ڈی، تعامل/پیچیدہ/راستے کی تفصیل، اشاعتیں، اپ ڈیٹ ریکارڈ، حیاتیات، آنٹوگلیفس، پروٹیوگلیفس، اور دیگر ڈیٹا بیس کے لنکس جہاں اضافی معلومات مل سکتی ہیں۔ بائنڈ ریکارڈز میں دیکھنے کے مختلف فارمیٹس شامل ہیں (مثال کے طور پر۔ ایچ ٹی ایم ایل، ASN.1، ایکس ایم ایل، ایف اے ایس ٹی اے)، نتائج برآمد کرنے کے لیے مختلف فارمیٹس (جیسے۔ ASN.1، XML، GI فہرست، PDF)، اور تصورات (مثال کے طور پر۔ سائٹوسکیپ)۔ دیکھنے اور برآمد کرنے کے درست اختیارات اس بات پر منحصر ہوتے ہیں کہ کس قسم کا ڈیٹا بازیافت کیا گیا ہے۔ صارف کے اعداد و شمار بائنڈ کے انضمام کے بعد سے انلیشڈ رجسٹرڈ افراد کی تعداد میں 10 گنا اضافہ ہوا ہے۔ دسمبر 2006 تک رجسٹریشن 10,000 سے کم رہ گئی۔ بانڈ کے تجارتی ورژن کے سبسکرائبرز چھ عام زمروں میں آتے ہیں ؛ زراعت اور خوراک، بائیوٹیکنالوجی، دواسازی، انفارمیٹکس، مواد اور دیگر۔ بائیوٹیکنالوجی کا شعبہ ان گروپوں میں سب سے بڑا ہے، جس میں 28 فیصد سبسکرپشنز ہیں۔ فارماسیوٹیکل اور انفارمیٹکس بالترتیب 22 فیصد اور 18 فیصد کے ساتھ اس کے بعد ہیں۔ ان سبسکرپشنز کا بڑا حصہ، 69 فیصد، امریکہ کے پاس ہے۔ بانڈ کے تجارتی ورژن تک رسائی رکھنے والے دیگر ممالک میں کینیڈا، برطانیہ، جاپان، چین، کوریا، جرمنی، فرانس، ہندوستان اور آسٹریلیا شامل ہیں۔ یہ تمام ممالک صارف کے حصے میں 6 فیصد سے نیچے آتے ہیں۔ حوالہ جات حیاتیاتی ڈیٹا بیس