Palindromic sequence
پیلینڈرومک ترتیب ایک ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے یا آر این اے مالیکیول میں نیوکلک ایسڈ کی ترتیب ہے جس کے ذریعے ایک خاص سمت میں پڑھنا (جیسے۔ 5 'سے 3') ایک اسٹرینڈ پر اسی سمت میں ترتیب سے ملتا جلتا ہے (جیسے۔ 5 'سے 3') تکمیلی اسٹرینڈ پر۔ پالینڈروم کی یہ تعریف اس طرح ایک دوسرے کے تکمیلی تاروں کے پالینڈرومک ہونے پر منحصر ہے۔ جینیات کے تناظر میں پیلینڈروم کے معنی الفاظ اور جملوں کے لیے استعمال ہونے والی تعریف سے قدرے مختلف ہیں۔ چونکہ ایک ڈبل ہیلکس نیوکلیوٹائڈز کے دو جوڑے دار مخالف متوازی تاروں سے بنتا ہے جو مخالف سمتوں میں چلتے ہیں، اور نیوکلیوٹائڈز ہمیشہ اسی طرح سے جوڑتے ہیں (ڈی این اے میں تھامین (ٹی) کے ساتھ اڈینائن (اے) یا آر این اے میں یوراسل (یو) ؛ گوانائن (جی) کے ساتھ سائٹوسین (سی)، ایک (سنگل اسٹرینڈڈ) نیوکلیوٹائڈ ترتیب کو پیلینڈروم کہا جاتا ہے اگر یہ اس کی الٹی تکمیل کے برابر ہو۔ مثال کے طور پر، ڈی این اے کی ترتیب ACCTAGT اس کے نیوکلیوٹائڈ بائی نیوکلیوٹائڈ تکمیل TGGATCCA کے ساتھ پیلینڈرومک ہے کیونکہ تکمیل میں نیوکلیوٹائڈز کی ترتیب کو الٹنا اصل ترتیب دیتا ہے۔ پیلینڈرومک نیوکلیوٹائڈ کی ترتیب ہیئر پن بنانے کی صلاحیت رکھتی ہے۔ ہیئر پن کا تنے کا حصہ ایک فرضی ڈبل پھنسا ہوا حصہ ہوتا ہے کیونکہ پورا ہیئر پن نیوکلک ایسڈ کے ایک ہی (واحد) اسٹرینڈ کا حصہ ہوتا ہے۔ پیلینڈرومک موفٹس زیادہ تر جینومز یا جینیاتی ہدایات کے سیٹوں میں پائے جاتے ہیں۔ ان پر خاص طور پر بیکٹیریل کروموسوم اور ان پر بکھرے ہوئے نام نہاد بیکٹیریل انٹرسپرسڈ موزیک عناصر (بی آئی ایم ای) میں تحقیق کی گئی ہے۔ 2008 میں، ایک جینوم سیکوینسنگ پروجیکٹ نے دریافت کیا کہ انسانی ایکس اور وائی کروموسوم کے بڑے حصے پیلینڈروم کے طور پر ترتیب دیے گئے ہیں۔ پیلینڈرومک ڈھانچہ Y کروموسوم کو وسط میں جھک کر خود کو ٹھیک کرنے کی اجازت دیتا ہے اگر ایک طرف کو نقصان پہنچا ہو۔ پیلینڈروم بھی اکثر پیپٹائڈ کے سلسلے میں پائے جاتے ہیں جو پروٹین بناتے ہیں، لیکن پروٹین فنکشن میں ان کا کردار واضح طور پر معلوم نہیں ہے۔ یہ تجویز کیا گیا ہے کہ پیپٹائڈز میں پیلینڈروم کے وجود کا تعلق پروٹین میں کم پیچیدگی والے علاقوں کے پھیلاؤ سے ہو سکتا ہے، کیونکہ پیلینڈروم اکثر کم پیچیدگی والے ترتیبات سے وابستہ ہوتے ہیں۔ ان کے پھیلاؤ کا تعلق الفا ہیلیکس یا پروٹین/پروٹین کمپلیکس بنانے کے اس طرح کے سلسلے کے رجحان سے بھی ہو سکتا ہے۔ مثال کے طور پر ریسٹریکشن انزائم سائٹس پیلینڈرومک سیکوینس سالماتی حیاتیات میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ چونکہ ڈی این اے کی ترتیب ڈبل اسٹرینڈڈ ہوتی ہے، اس لیے پیلینڈروم کا تعین کرنے کے لیے بیس جوڑوں کو پڑھا جاتا ہے، (نہ کہ صرف ایک اسٹرینڈ پر بیس)۔ بہت سے پابندی والے اینڈو نیوکلیز (پابندی والے انزائم) مخصوص پیلینڈرومک ترتیب کو پہچانتے ہیں اور انہیں کاٹ دیتے ہیں۔ پابندی والے انزائم ایکو آر 1 مندرجہ ذیل پیلینڈرومک ترتیب کو تسلیم کرتا ہے: 5 '-جی اے اے ٹی ٹی سی-3' 3 '-سی ٹی ٹی اے جی-5' اوپر کا اسٹرینڈ 5 '-جی اے اے ٹی ٹی سی-3' پڑھتا ہے، جبکہ نیچے کا اسٹرینڈ 3 '-سی ٹی ٹی اے اے جی-5' پڑھتا ہے۔ اگر ڈی این اے اسٹرینڈ کو پلٹ دیا جاتا ہے، تو ترتیب بالکل ایک جیسی ہوتی ہے (5 'جی اے اے ٹی ٹی سی-3' اور 3 '-سی ٹی ٹی اے اے جی-5')۔ یہاں مزید پابندی والے انزائم اور پیلینڈرومک ترتیبات ہیں جنہیں وہ پہچانتے ہیں: میتھیلیشن سائٹس پیلینڈرومک ترتیبات میں میتھیلیشن سائٹس بھی ہو سکتی ہیں۔ یہ وہ جگہیں ہیں جہاں میتھائل گروپ کو پیلینڈرومک ترتیب سے منسلک کیا جا سکتا ہے۔ میتھیلیشن مزاحم جین کو غیر فعال بنا دیتا ہے ؛ اسے انسرشنل ان ایکٹیویشن یا انسرشنل میوٹیجینیسیس کہا جاتا ہے۔ مثال کے طور پر، ٹیٹراسیکلین مزاحم جین میں پی بی آر 322 میتھیلیشن پلازمیڈ کو ٹیٹراسیکلین کے لیے ذمہ دار بناتا ہے ؛ ٹیٹراسیکلین مزاحم جین میں میتھیلیشن کے بعد اگر پلازمیڈ اینٹی بائیوٹک ٹیٹراسیکلین کے سامنے آتا ہے، تو یہ زندہ نہیں رہتا ہے۔ ٹی سیل ریسیپٹرز میں پیلینڈرومک نیوکلیوٹائڈز ٹی سیل ریسیپٹر (ٹی سی آر) جینوں کی تنوع ان کے جرم لائن انکوڈڈ وی، ڈی اور جے حصوں سے وی (ڈی) جے کے دوبارہ امتزاج پر نیوکلیوٹائڈ کے اندراج سے پیدا ہوتی ہے۔ وی-ڈی اور ڈی-جے جنکشنوں پر نیوکلیوٹائڈ کے اندراج بے ترتیب ہوتے ہیں، لیکن ان اندراجات کے کچھ چھوٹے ذیلی سیٹ غیر معمولی ہوتے ہیں، اس میں ایک سے تین بیس جوڑے جرم لائن ڈی این اے کی ترتیب کو الٹا دہراتے ہیں۔ ان مختصر تکمیلی پیلینڈرومک ترتیبات کو پی نیوکلیوٹائڈز کہا جاتا ہے۔ حوالہ جات ڈی این اے پیلینڈرومز