Murine coronavirus
میورین کورونا وائرس (M-CoV) بیٹا کورونویرس جینس کا ایک وائرس ہے جو چوہوں کو متاثر کرتا ہے۔ ذیلی نسل ایمبیکو وائرس سے تعلق رکھنے والے، میورین کورونا وائرس کے تناؤ اینٹروٹروپک یا پولیٹروپک ہوتے ہیں۔ اینٹروٹروپک تناؤ میں ماؤس ہیپاٹائٹس وائرس (ایم ایچ وی) تناؤ ڈی، وائی، آر آئی، اور ڈی وی آئی ایم شامل ہیں، جبکہ پولیٹروپک تناؤ، جیسے جے ایچ ایم اور اے 59، بنیادی طور پر ہیپاٹائٹس، اینٹرائٹس اور انسیفلائٹس کا سبب بنتے ہیں۔ میورین کورونا وائرس لیبارٹری کے چوہے اور لیبارٹری کے چوہے میں ایک اہم پیتھوجین ہے۔ یہ انسانوں کے علاوہ جانوروں میں سب سے زیادہ مطالعہ شدہ کورونا وائرس ہے، اور بہت سے وائرولوجیکل اور کلینیکل مطالعات کے لیے جانوروں کی بیماری کے ماڈل کے طور پر استعمال کیا گیا ہے۔ مرائن ہیپاٹائٹس وائرس مرائن کورونا وائرس پہلی بار 1949 میں دریافت ہوا تھا۔ محققین نے وائرس کو دماغ، ریڑھ کی ہڈی، جگر، پھیپھڑوں، تلی اور چوہے کے گردے سے انسیفلائٹس اور شدید مائیلن چوٹ کی علامات کے ساتھ الگ کیا، اور اسے تناؤ کا نام ماؤس ہیپاٹائٹس وائرس (ایم ایچ وی)-جے ایچ ایم دیا۔ ایم ایچ وی اب انسانوں کے علاوہ جانوروں میں سب سے زیادہ مطالعہ شدہ کورونا وائرس ہے، جو کورونا وائرس کے لیے ایک ماڈل حیاتیات کے طور پر کام کرتا ہے۔ میورین کورونا وائرس کی 25 سے زیادہ مختلف اقسام ہیں۔ فضلہ-زبانی یا سانس کے راستے سے منتقل ہونے والے یہ وائرس چوہوں کے جگر کو متاثر کرتے ہیں اور انہیں ہیپاٹائٹس کے لیے جانوروں کی بیماری کے ماڈل کے طور پر استعمال کیا گیا ہے۔ فضلہ کے مادے میں منتقل ہونے والے تناؤ ایم ایچ وی-ڈی، ایم ایچ وی-ڈی وی آئی ایم، ایم ایچ وی-وائی اور ایم ایچ وی-آر آئی بنیادی طور پر ہاضمے کی نالی کو متاثر کرتے ہیں، بعض اوقات تلی، جگر اور لمفیٹک ٹشو کو متاثر کرتے ہیں۔ MHV-1، MHV-2، MHV-3، MHV-A59، MHV-S، MHV-JHM اور دیگر وائرس کے تناؤ سانس کی نالی میں نقل کرتے ہیں اور پھر دوسرے اعضاء جیسے جگر، پھیپھڑوں اور دماغ میں پھیل جاتے ہیں۔ ایم ایچ وی-جے ایچ ایم بنیادی طور پر مرکزی اعصابی نظام کو متاثر کرتا ہے اور 1949 سے اس کا وسیع پیمانے پر مطالعہ کیا گیا ہے۔ چوہوں میں، یہ اعصاب کو متاثر کرنے والے ہیپاٹائٹس وائرس شدید یا دائمی اعصابی علامات کا سبب بن سکتے ہیں اور انفیکشن پر چوہوں کی قوت مدافعت کو متحرک کر سکتے ہیں۔ انفیکشن ڈیمیلینیشن کا باعث بنتا ہے، جو ایک سے زیادہ سکلیروسیس کے جانوروں کی بیماری کے ماڈل کے طور پر کام کرتا ہے۔ MHV-2، MHV-3 اور MHV-A59 بھی جگر کو متاثر کر سکتے ہیں ؛ ان میں سے پہلے دو زیادہ خطرناک ہیں۔ MHV-3 وائرس کا بنیادی تناؤ ہے جو ہیپاٹائٹس کا مطالعہ کرنے کے لیے استعمال ہوتا ہے ؛ MHV-1 بنیادی طور پر پھیپھڑوں کو متاثر کرتا ہے۔ میورین ہیپاٹائٹس وائرس انتہائی متعدی ہے اور لیبارٹری چوہوں میں سب سے عام پیتھوجینز میں سے ایک ہے۔ انفیکشن کی علامات چوہے کی قسم، انفیکشن کا راستہ، جینوٹائپ اور عمر کے مطابق مختلف ہوتی ہیں۔ MHV-1، MHV-S اور MHV-Y کمزور وائرل تناؤ ہیں۔ MHV-2، MHV-3، MHV-A5 9 اور MHV-JHM زیادہ خطرناک ہیں، جو بالغ چوہوں میں نسبتا ہلکے ہوتے ہیں لیکن نوزائیدہ بچوں میں زیادہ اموات ہوتے ہیں۔ انفیکشن، یہاں تک کہ اگر یہ واضح علامات کا سبب نہیں بنتا ہے، لیبارٹری کے مضامین کے مدافعتی نظام کو متاثر کر سکتا ہے اور تجرباتی نتائج کی تشریح میں غلطیوں کا سبب بن سکتا ہے۔ مثال کے طور پر، وائرس میکروفیجز میں نقل تیار کر سکتا ہے اور ان کے کام کو متاثر کر سکتا ہے، ساتھ ہی تلی میں بھی، جہاں انفیکشن قدرتی قاتل خلیوں کو متحرک کرتا ہے اور ٹی سیل اور بی خلیوں کو متاثر کرتا ہے۔ چوہوں میں ہیپاٹائٹس وائرس کے انفیکشن کی روک تھام اور علاج کے لیے کوئی ویکسین موجود نہیں ہے، بنیادی طور پر اس کی وجہ اعلی تغیر کی شرح اور وائرس کے مختلف قسم کے تناؤ کے ساتھ ساتھ یہ خدشات بھی ہیں کہ ویکسینیشن خود تجرباتی تحقیقی نتائج کی تشریح میں مداخلت کر سکتی ہے، لیکن اس وائرس کو دیگر کورونا وائرس ویکسینوں کی ترقی کے لیے ایک تجرباتی ماڈل کے طور پر استعمال کیا جا سکتا ہے۔ 1991 میں مائیکل ایم سی لائی کی لیبارٹری نے میورین ہیپاٹائٹس وائرس کی پوری جینوم سیکوینسنگ مکمل کی۔ 31, 000 نیوکلیوٹائڈز کی کل لمبائی کے ساتھ، یہ اس وقت معلوم سب سے بڑا آر این اے وائرس جینوم تھا۔ 2002 میں، امریکی وائرولوجسٹ رالف ایس بیرک نے ماؤس ہیپاٹائٹس وائرس کے لیے ایک ریورس جینیاتی نظام تیار کیا جس میں چھوٹے ٹکڑوں سے ایک مکمل ایم ایچ وی سی ڈی این اے جمع کیا گیا۔ فینسی چوہوں میں، چوہے کا کورونا وائرس (آر سی او وی یا آر سی وی) بنیادی طور پر دو وائرس کے تناؤ پر مشتمل ہوتا ہے، سائالوڈاکریوڈینائٹس وائرس (ایس ڈی اے وی) اور پارکر کا آر سی او وی (آر سی او وی-پی)، یہ دونوں سانس کی نالی کے انفیکشن کا سبب بنتے ہیں، جن میں سے پہلا آنکھوں، ہارڈیرین گلینڈ اور تھوک غدود کو بھی متاثر کرتا ہے۔ ماضی میں، یہ خیال کیا جاتا تھا کہ دونوں انفیکشن کی وجہ سے ہونے والی علامات مختلف تھیں، لیکن حالیہ برسوں میں، یہ استدلال کیا گیا ہے کہ دونوں کی علامات میں آنکھ اور ناک سے خارج ہونے والا مادہ، بڑی تھوک غدود میں اضافہ، سیالڈینائٹس، فوٹوسنسیٹیویٹی، کیراٹائٹس، سانس کی قلت، اور نمونیا شامل ہیں۔ اس میں بہت کم یا کوئی واضح فرق نہیں ہے، اور یہ تجویز کیا گیا ہے کہ پارکر کا چوہا کورونا وائرس صرف چوہے کے تھوک والے اڈینو وائرس کی ایک قسم ہے۔ یہ انتہائی متعدی ہے۔ عام طور پر، چھوٹے چوہوں میں علامات زیادہ سنگین ہوتی ہیں، اور کچھ افراد کو آنکھوں کو مستقل نقصان پہنچتا ہے۔ دوسرے 1982 میں، محققین نے پفنوسس کورونویرس (پی سی او وی) کو الگ تھلگ کرنے کے بعد چوہوں کے دماغ میں ایک کورونویرس پایا، جو مینکس شیر واٹرس میں جلد اور آنکھوں کی بیماری کا سبب بنتا ہے۔ پایا جانے والا وائرس چوہے کے ہیپاٹائٹس وائرس سے بہت ملتا جلتا تھا، لیکن تنہائی کے عمل میں لیبارٹری کے چوہوں کے استعمال کی وجہ سے اس امکان کو خارج نہیں کیا جا سکتا کہ یہ پرندوں سے نہیں بلکہ چوہے سے ماخوذ تھا۔ اس کے بعد کے مطالعات سے پتہ چلا ہے کہ وائرس میں ہیماگگلوٹینن ایسٹیرس (ایچ ای) ہے۔ اگر کورونویرس واقعی شیر واٹر سے شروع ہوا تھا، تو یہ ان چند پرندوں کے کورونویرس میں سے ایک ہے جو گاما کورونویرس یا ڈیلٹا کورونویرس نہیں ہے۔ 2009 میں، انٹرنیشنل کمیٹی آن ٹیکسونومی آف وائرسز (آئی سی ٹی وی) نے اس پرندے کے کورونا وائرس کو مورائن کورونا وائرس کلیڈ سے تعلق رکھنے والے کے طور پر درجہ بند کیا۔ 2011 سے 2013 تک، محققین نے چین کے شہر ژی جیانگ میں کئی مقامات پر چوہوں کے نمونے اکٹھے کیے اور لانگکوان لیس رائس فیلڈ چوہے میں تین نئے وائرس کے تناؤ دریافت کیے، جنہیں اجتماعی طور پر 2015 میں لانگکوان آر ایل چوہا کورونا وائرس (ایل آر ایل وی) کے طور پر بیان کیا گیا تھا۔ جینوم چوہا کورونا وائرس ایک مثبت پھنسے ہوئے سنگل اسٹرینڈ آر این اے وائرس ہے جس کی بیرونی جھلی ہے۔ اس کا جینوم سائز تقریبا 31,000 نیوکلیوٹائڈز کا ہوتا ہے۔ کورونا وائرس کے چار ساختی پروٹینوں کے علاوہ-اسپائیک پروٹین (ایس)، جھلی پروٹین (ایم)، لفافہ پروٹین (ای) اور نیوکلیوکیپسڈ پروٹین (این)-کچھ ماؤس کورونا وائرس کی سطحوں پر ہیماگگلوٹینن ایسٹیریس (ایچ ای) بھی ہوتا ہے۔ ایچ ای میزبان خلیے کی سطح پر سیالک ایسڈ سے جڑا رہ سکتا ہے اور وائرل انفیکشن کو فروغ دے سکتا ہے، اور اس میں ایسیٹیل ایسٹیریس سرگرمی ہوتی ہے، جو پابند وائرس کو چھوڑنے کے لیے ریسیپٹرز کو خراب کر سکتی ہے۔ وائرس میں چار معاون پروٹین بھی ہوتے ہیں-2a، 4، 5a اور I (یا N2) (چوہے کے تھوک والے اڈینوفرائٹس وائرس میں NS2، 15k، 12.6k اور 7b کے نام سے جانا جاتا ہے یا لانگکوان لووسائی ماؤس کورونا وائرس میں 2a، 5a، 5b اور N2 کے نام سے جانا جاتا ہے)۔ یہ معاون پروٹین میزبان کے مدافعتی ردعمل کا مقابلہ کر سکتے ہیں۔ معاون پروٹین این ایس 2 (2 اے جین کے ذریعے انکوڈ شدہ) میں 2′، 5′-فاسفوڈیسٹیریس سرگرمی ہوتی ہے۔ یہ خلیے میں 2′، 5′-اولیگواڈینیلیٹ کو خراب کر سکتا ہے اور اس کی سرگرمی سے بچ سکتا ہے۔ خلیوں میں ربن نیوکلیز ایل وائرل آر این اے کو خراب کرنے کے لیے دفاعی طریقہ کار کو چالو کرتا ہے اور معاون پروٹین 5 اے میزبان انٹرفیرون کو روکتا ہے۔ مختلف وائرس کے تناؤ میں معاون پروٹین کی اقسام مختلف ہو سکتی ہیں۔ مثال کے طور پر، ایم ایچ وی-ایس میں معاون پروٹین 5 اے کی کمی ہے، اس لیے یہ انٹرفیرون کے لیے کم مزاحم ہے۔ تمام چار معاون پروٹین وائرل نقل کے لیے قابل تقسیم ہیں۔ ای پروٹین کو ای 1 اور ای 2 گلائکوپروٹین میں تقسیم کیا گیا ہے، جن کے بارے میں خیال کیا جاتا ہے کہ وہ مختلف مقاصد کی تکمیل کرتے ہیں۔ جینوم کو 1ab-2a-HE-S-4-5a-E-M-N-I کا حکم دیا جاتا ہے، جہاں 5a اور 5b پروٹین ایک ہی mRNA کے ذریعے انکوڈ کیے جاتے ہیں اور I کا اوپن ریڈنگ فریم کیپسڈ پروٹین N کے اوپن ریڈنگ فریم کے اندر واقع ہوتا ہے۔ انفیکشن جب کورونا وائرس میزبان خلیے کو متاثر کرتا ہے، تو اس کا اسپائیک پروٹین (S) میزبان خلیے کی سطح پر موجود رسیپٹر سے جڑا رہتا ہے، جو وائرس کو خلیے میں داخل ہونے کے قابل بناتا ہے۔ سپائیک پروٹین کو میزبان کے پروٹیز کے ذریعے نئے خلیے کی تشکیل، نقل و حمل اور انفیکشن کے تمام مراحل میں کاٹا جاتا ہے۔ وہ ڈومین جو وائرس کی بیرونی جھلی کو سیل جھلی کے ساتھ فیوز کرنے میں مدد کرتا ہے، انفیکشن کو آسان بنانے کے لیے بے نقاب ہوتا ہے۔ چوہے کے کورونا وائرس کے ذریعہ استعمال ہونے والا میزبان سیل ریسیپٹر عام طور پر سی ای اے سی اے ایم 1 (ایم سی ای اے سی اے ایم 1) ہوتا ہے۔ متاثرہ ٹشو کی قسم اور جس وقت سپائیک پروٹین کاٹا جاتا ہے وہ وائرس کے تناؤ کے مطابق مختلف ہوتا ہے۔ ان میں سے ایس 1 ایم ایچ وی-اے 59 کے اسپائیک پروٹین میں ہے۔ ایس 2 کی کلیویج سائٹ کو میزبان خلیے میں فورن جیسے پروٹیسیس کے ذریعے کاٹا جاتا ہے جب وائرس پیدا ہوتا ہے اور جمع ہوتا ہے، اور جب وائرس کسی نئے خلیے کو متاثر کرتا ہے، تو کامیاب انفیکشن کے لیے لائسوسومل راستے میں مزید کلیویج کی بھی ضرورت ہوتی ہے۔ ایم ایچ وی-2 کے آکیروسن میں ایس 1/ایس 2 کلیویج سائٹ نہیں ہے اور اسمبلی کے عمل کے دوران اسے نہیں کاٹا جاتا ہے۔ اس کا انفیکشن اینڈوسومل انزائمز کے ذریعے سپائیک پروٹین کے پھٹنے پر منحصر ہوتا ہے۔ ایم ایچ وی-جے ایچ ایم (خاص طور پر زیادہ خطرناک JHM.SD اور جے ایچ ایم-سی ایل 2)، جو اعصابی بافتوں کو متاثر کرتا ہے، کو سطح کی نمائش کی ضرورت نہیں ہوسکتی ہے۔ جسم خلیے کو متاثر کر سکتا ہے، یعنی یہ خلیے کے رسیپٹر سے جڑے بغیر جھلی فیوژن حاصل کر سکتا ہے، اس لیے یہ اعصابی نظام میں ڈھانچوں کو ایم سی ای اے سی اے ایم 1 کے بہت کم اظہار سے متاثر کر سکتا ہے، اور اس کا انفیکشن بنیادی طور پر خلیے کی سطح کے پروٹیز کے ذریعے اس کے اسپائیک پروٹین کو کاٹنے پر منحصر ہو سکتا ہے۔ جب مختلف تناؤ کے چوہے کے ہیپاٹائٹس وائرس ایک ہی وقت میں خلیوں کو متاثر کرتے ہیں، تو جینیاتی نقل کے دوران ٹیمپلیٹ سوئچنگ ہو سکتی ہے، جس کے نتیجے میں جین کا دوبارہ ملاپ ہوتا ہے، جو وائرل تنوع کے ارتقا کے لیے اہم ہو سکتا ہے۔ مانا جاتا ہے کہ درجہ بندی اور ارتقاء میورین کورونویرس کا انسانی کورونویرس HKU1 سے سب سے زیادہ گہرا تعلق ہے۔ یہ دو انواع، بیٹا کورونویرس 1، خرگوش کورونویرس HKU14، اور چائنا ریٹس کورونویرس HKU24 کے ساتھ، بین الاقوامی کمیٹی برائے ٹیکسونومی آف وائرسز کی درجہ بندی کے مطابق، جینس بیٹا کورونویرس کے اندر ذیلی نسل ایمبیکوائرس بناتی ہیں۔ اس ذیلی نسل کو جین انکوڈنگ ہیماگلوٹینن ایسٹیرس (ایچ ای) کی موجودگی سے ممتاز کیا جاتا ہے، حالانکہ بہت سے لیبارٹری میورین ہیپاٹائٹس وائرس کے تناؤ (جیسے ایم ایچ وی-اے 59 اور ایم ایچ وی-1) میں، یہ جین اتپریورتن کی وجہ سے ختم ہو گیا ہے اور صرف ایک سڈوجین کے طور پر برقرار رہتا ہے۔ ایچ ای چوہے کے ہیپاٹائٹس وائرس کے انفیکشن اور نقل کے لیے قابل علاج ہے، اور درحقیقت، ایچ ای کی کمی والے ہیپاٹائٹس کے تناؤ وٹرو میں مسابقتی فائدہ رکھتے دکھائی دیتے ہیں۔ کورونا وائرس کے اسپائیک پروٹین کا این-ٹرمینل ڈومین (این ٹی ڈی) جانوروں کے خلیوں میں گیلیکٹن سے ملتا جلتا ہے۔ لہذا، یہ تجویز کیا گیا ہے کہ یہ ڈومین اصل میں ایک میزبان جانور کے خلیے سے ماخوذ تھا۔ خلیہ ایک لیکٹن کے لیے جین حاصل کرتا ہے، جو میزبان خلیے کی سطح پر چینی کو ایک متاثرہ خلیے کے طور پر باندھ سکتا ہے۔ اس کے بعد، وائرس کے اس کلڈ میں وائرس ایچ ای کو حاصل کرتا ہے تاکہ وائرس کو متاثرہ خلیوں سے چھٹکارا مل سکے، لیکن بعد میں ماؤس کورونا وائرس کا این ٹی ڈی ایک نئی ساخت میں تیار ہوا جسے پروٹین ریسیپٹر ایم سی ای اے سی اے ایم 1 سے جوڑا جا سکتا ہے۔ امتزاج وائرس اور میورین خلیوں کی بائنڈنگ کی صلاحیت کو بہت بڑھاتا ہے۔ چونکہ اب شکر سے جڑا ہونا ضروری نہیں ہے، اس لیے یہ آہستہ آہستہ لیکٹن فنکشن کھو دیتا ہے، اور مزید HE کھو دیتا ہے۔ اس کے برعکس، مویشیوں کا کورونا وائرس، انسانی کورونا وائرس او سی 43، اور دیگر اب بھی شوگر ریسیپٹر ہیں، اس لیے سپائیک این ٹی ڈی گلوٹین کے کام کو برقرار رکھتا ہے۔ الفا کورونویرس اور بیٹا کورونویرس سبھی چمگادڑ کے وائرس سے پیدا ہو سکتے ہیں، لیکن ذیلی نسل ایمبیکو وائرس میں چوہوں کو متاثر کرنے والے بہت سے وائرس ہوتے ہیں (ماؤس کورونویرس کے علاوہ، لوچینگ آر این چوہا کورونویرس، چائنا ریٹس کورونویرس ایچ کے یو 24 اور میوڈس کورونویرس 2 جے ایل 14 بھی ہیں، جن میں 2015 سے بڑی تعداد میں متعلقہ وائرس کے تناؤ پائے گئے ہیں)، اور چمگادڑ کا کوئی وائرس نہیں ملا ہے۔ کچھ اسکالرز تجویز کرتے ہیں کہ اس کلاڈ کا مشترکہ آباؤ اجداد ماؤس وائرس ہو سکتا ہے، جو پھر چوہوں کے ذریعے انسانوں اور مویشیوں میں منتقل ہوا۔ آر این اے-آر این اے ریکومبینیشن جینیاتی ریکومبینیشن اس وقت ہو سکتی ہے جب ایک ہی متاثرہ میزبان خلیے میں کم از کم دو آر این اے وائرل جینوم موجود ہوں۔ میورین کورونا وائرس کے مختلف تناؤ کے درمیان آر این اے-آر این اے کا دوبارہ امتزاج ٹشو کلچر اور ماؤس کے مرکزی اعصابی نظام دونوں میں اعلی تعدد پر پایا گیا۔ ان نتائج سے پتہ چلتا ہے کہ آر این اے-آر این اے کا دوبارہ امتزاج کورونا وائرس کے قدرتی ارتقاء اور نیورو پیتھوجینسیس میں اہم کردار ادا کر سکتا ہے۔ ریکومبینیشن کے طریقہ کار میں وائرل جینوم ریپلیکیشن کے دوران ٹیمپلیٹ سوئچنگ شامل ہوتی دکھائی دیتی ہے، ایک ایسا عمل جسے کاپی چوائس ریکومبینیشن کہا جاتا ہے۔ سٹرینز سائالوڈاکریوڈینائٹس وائرس لیبارٹری چوہوں کا ایک انتہائی متعدی کورونا وائرس ہے جو افراد کے درمیان براہ راست رابطے اور بالواسطہ طور پر ایروسول کے ذریعے منتقل ہو سکتا ہے۔ شدید انفیکشن میں تھوک، لیکریمل اور ہارڈیرین غدود کے لیے زیادہ بیماری اور ٹراپزم ہوتا ہے۔ خرگوش کے اندرونی کورونا وائرس نوجوان یورپی خرگوش میں شدید معدے کی بیماری اور اسہال کا سبب بنتا ہے۔ اموات کی شرح زیادہ ہے۔ ماؤس ہیپاٹائٹس وائرس کے ساتھ چوہوں کے تحقیقی انفیکشن کو کورونویرس کے علاج کے طور پر آئورمیکٹن کی جانچ کرنے کے لیے ایک ماڈل سسٹم کے طور پر استعمال کیا گیا ہے۔ حوالہ جات بیٹا کورونویرس چوہوں کی بیماریاں جانوروں کی وائرولوجی