Gene isoform
جین آئسوفارم ایم آر این اے ہوتے ہیں جو ایک ہی لوکس سے تیار ہوتے ہیں لیکن ان کی ٹرانسکرپشن اسٹارٹ سائٹس (ٹی ایس ایس)، پروٹین کوڈنگ ڈی این اے سیکوینس (سی ڈی ایس) اور/یا غیر ترجمہ شدہ علاقوں (یو ٹی آر) میں مختلف ہوتے ہیں، جو ممکنہ طور پر جین فنکشن کو تبدیل کرتے ہیں۔ پروموٹر میں سی آئی ایس-ریگولیٹری عناصر میں ٹرانسکرپشن عوامل اور بیسال ٹرانسکرپشن مشینری کے ذریعے پہچانے جانے والے سلسلے ہوتے ہیں۔ لہذا ٹی ایس ایس کا مقام مخصوص آئسوفارم کے بائیوجینیسیس کو سمجھنے کے لیے اہم ہے۔ یہ خیال کہ مختلف بائنڈنگ پارٹنرز مختلف فعال خصوصیات فراہم کرتے ہیں ٹشو مخصوص جین ریگولیشن میں اچھی طرح سے مطالعہ کیا گیا ہے۔ مثال کے طور پر، ایک ہی ٹرانسکرپشن فیکٹر (ٹی ایف) ہر ٹشو میں مختلف ٹی ایس ایس کے ساتھ باندھ کر مختلف ٹشوز میں جین کے اظہار کو براہ راست کر سکتا ہے۔ سی ڈی ایس میں تبدیلیوں کو پناہ دینے والے آئسوفارم سب سے زیادہ اچھی طرح سے نمایاں کیے گئے ہیں کیونکہ وہ عام طور پر مختلف فعال خصوصیات والے پروٹین کو جنم دیتے ہیں۔ یو ٹی آر بنیادی نقل کی سطح کو متعدد طریقوں سے منظم کرتے ہیں: نقل کا استحکام، فولڈنگ اور کاروبار کے ساتھ ساتھ ترجمہ کی کارکردگی۔ یو ٹی آر اکثر ایم آئی آر این اے کا ہدف ہوتے ہیں، جو عام طور پر انحطاط کو متحرک کرکے یا ترجمہ کو روک کر نقل کے اظہار کو کم کرتے ہیں۔ جین آئسوفارم کو ہول ٹرانسکرپٹم شاٹگن سیکوینسنگ (آر این اے-سیق) کے ذریعے ترتیب دیا جا سکتا ہے۔ حال ہی میں آر این اے-سیق کا استعمال کرتے ہوئے تخلیق نو سے وابستہ جینوں (آر اے جی) کی معروف آئسوفارم کی خصوصیت کے لیے کچھ پیش رفت ہوئی ہے، جو سی این ایس میں آئسوفارم تنوع کو سمجھنے میں اہم ہے۔ مثال اے ٹی ایف 3 ایکٹیویٹنگ ٹرانسکرپشن فیکٹر 3 (اے ٹی ایف 3) متعدد پروموٹروں کے ساتھ ایک معروف آر اے جی ہے۔ اعصاب کی چوٹ کے بعد اے ٹی ایف 3 کا اظہار بڑھتا ہے اور اے ٹی ایف 3 کی آئینی طور پر فعال شکل کے حد سے زیادہ اظہار سے پردیی اعصاب کی تخلیق نو کی شرح میں اضافہ ہوتا ہے۔ ڈورسل روٹ گینگلیا (ڈی آر جی) میں اب تک چار اے ٹی ایف 3 آئسوفارم کی نشاندہی کی گئی ہے۔ یہ چار آئسوفارم ٹی ایس ایس میں مختلف ہیں، اور ایک سی ڈی ایس میں مختلف ہے۔ تاہم یہ واضح نہیں ہے کہ ڈی آر جی نیوران کو دوبارہ پیدا کرنے میں کون سے پروموٹر استعمال میں ہیں۔ پی ٹی ای این فاسفیٹیس اور ٹینسن ہومولوگ (پی ٹی ای این) کی شناخت اصل میں ٹیومر سپریسر جین کے طور پر کی جاتی ہے۔ حالیہ مطالعات سے پتہ چلا ہے کہ پیٹن نے ریٹنا گینگلیئن خلیوں، کورٹیکوسپینل ٹریکٹ، اور ڈی آر جی نیوران میں محور کی تخلیق نو کو بھی دبا دیا۔ اب تک 3 پیٹین آئسوفارم (پیٹین، پیٹین جے 1، اور پیٹین جے 2) کی شناخت اور تجزیہ کیا جا چکا ہے۔ ٹی ایس ایس میں فرق اور سی ڈی ایس میں ایک چھوٹی سی تبدیلی کے علاوہ پی ٹی این جے 1 روایتی پی ٹی این آئسوفارم کی ترتیب میں یکساں ہے۔ پیٹین جے 2 میں ایک کٹا ہوا سی ڈی ایس ہے، جو ایک متبادل ٹرانسکرپشن اسٹارٹ سائٹ ہے اور نیوران کے اندر ظاہر ہونے والے روایتی پیٹین آئسوفارم کے مقابلے میں لمبا 3 'یو ٹی آر ہے۔ کٹا ہوا سی ڈی ایس ایک پروٹین کو انکوڈ کرتا ہے جس میں فاسفیٹ ڈومین کا فقدان ہوتا ہے۔ اس کے علاوہ، پرائمری کورٹیکل نیوران میں پیٹین جے 2 اور پیٹین کا حد سے زیادہ اظہار محور کی تخلیق نو پر اثر انداز نہیں ہوتا ہے۔ لہذا یہ قیاس کیا جاتا ہے کہ پیٹین جے 2 پیٹین کی سرگرمی کو روکنے کے لیے ریگولیٹری آر این اے کے طور پر کام کرتا ہے۔ پروٹین آئسوفارم حوالہ جات آر این اے بھی دیکھیں