Systematic Protein Investigative Research Environment
سسٹمیٹک پروٹین انویسٹی گیٹو ریسرچ انوائرمنٹ (ایس پی آئی آر ای) پروٹین اور پیپٹائڈز کی شناخت کے لیے ویب پر مبنی تجربے سے متعلق ماس سپیکٹرومیٹری (ایم ایس) پروٹومکس تجزیہ فراہم کرتا ہے، اور لیبل سے پاک اظہار اور رشتہ دار اظہار کا تجزیہ کرتا ہے۔ اسپائر ایک ویب انٹرفیس فراہم کرتا ہے اور انٹرایکٹو اور سادہ ڈیٹا فارمیٹس دونوں میں نتائج پیدا کرتا ہے۔ میتھوڈولوجی اسپائر کے تجزیے ایک تجرباتی ڈیزائن پر مبنی ہوتے ہیں جو غلط دریافت کی شرح اور مقامی غلط دریافت کی شرح (ایف ڈی آر، ایل ایف ڈی آر) پیدا کرتا ہے اور اوپن سورس سرچ اور ڈیٹا تجزیہ کے طریقوں کو مربوط کرتا ہے۔ ایکس کو یکجا کرکے! ٹنڈم، او ایم ایس ایس اے اور سپیکٹراسٹ اسپائر اسکورنگ اور سنگل سرچ انجنوں کے موجودہ امتزاج کے مقابلے پروٹین آئی ڈیز (50-90%) میں اضافہ کر سکتے ہیں جبکہ درست کثیر جہتی غلطی کا تخمینہ بھی فراہم کر سکتے ہیں۔ اسپائر اپنے تجزیے کے نتائج کو پروٹین فنکشن، راستوں اور ماڈل حیاتیات سے پروٹین کے اظہار کے اعداد و شمار کے ساتھ جوڑتا ہے۔ دیگر معلومات کے ساتھ انضمام اسپائر اپنے ملٹی اومیکس پروفائلنگ ایکسپریشن ڈیٹا بیس (ایم او پی ای ڈی) کے ذریعے نتائج کو عوامی طور پر دستیاب پروٹومکس ڈیٹا سے بھی جوڑتا ہے۔ اسپائر صارف کے فراہم کردہ پروٹین آئی ڈی اور اظہار کے اعداد و شمار کے لیے تجزیہ اور تشریح فراہم کر سکتا ہے۔ صارفین ڈیٹا (مناسب طریقے سے معیاری) اپ لوڈ کر سکتے ہیں یا ڈیٹا فائلوں میں میل کر سکتے ہیں۔ مزید پڑھنے کے لیے حوالہ جات ماس سپیکٹرومیٹری سافٹ ویئر پروٹومکس حیاتیاتی ڈیٹا بیس