Tetratricopeptide repeat 39A
ٹیٹراٹریکوپیپٹائڈ ریپیٹ 39 اے ایک انسانی پروٹین ہے جو ٹی ٹی سی 39 اے جین کے ذریعے انکوڈ کیا گیا ہے۔ ٹی ٹی سی 39 اے کو ڈی ای ایم ای-6 (ایم سی ایف 7 میں ایسٹراڈیول پروٹین 6 کے ساتھ مختلف طور پر ظاہر کیا گیا ہے)، کے آئی اے اے 0452، اور سی 1 او آر ایف 34 کے نام سے بھی جانا جاتا ہے۔ ٹی ٹی سی 39 اے کا فنکشن فی الحال اچھی طرح سے سمجھا نہیں گیا ہے۔ ٹیٹراٹریکوپیپٹائڈ ریپیٹ 39 اے کے اندر اہم خصوصیت نامعلوم فنکشن 3808 (DUF3808) کا ڈومین ہے، جو تقریبا پورے پروٹین پر پھیلا ہوا ہے۔ کے آئی اے اے 0452 کو جینوم کی ترتیب میں فرق کی وجہ سے ٹی ٹی سی 39 اے کی آئسوفارم کے طور پر بھی دیکھا جا سکتا ہے، لیکن ڈی یو ایف ڈومین میں اوورلیپ ہوتا ہے۔ جین TTC39A کے لیے جین 1p32.3 پر پہلے کروموسوم پر واقع ہے۔ جینومک ڈی این اے 57,859 بیسز لمبا ہوتا ہے، جو 19 ایکسون پر مشتمل ہوتا ہے اور مائنس اسٹرینڈ پر واقع ہوتا ہے۔ ایم آر این اے کی لمبائی 2759 اڈوں کی ہوتی ہے۔ ٹی ٹی سی 39 اے آر این ایف 11 اور ای پی ایس 15 کے جینوں سے گھرا ہوا ہے۔ ان میں سے کسی بھی جین کا کوئی معروف تعامل یا TTC39A جیسا کام نہیں ہے۔ ٹی ٹی سی 39 اے کے حذف ہونے کے نتیجے میں کوئی معلوم طبی عوارض نہیں ہیں۔ کے آئی اے اے 0452 کا جین بھی پہلے کروموسوم پر 1p32.3 پر واقع ہے۔ جینومک ڈی این اے 34,096 بیسز لمبا ہوتا ہے، جو 11 ایکسون پر مشتمل ہوتا ہے اور مائنس اسٹرینڈ پر واقع ہوتا ہے۔ ایم آر این اے کی لمبائی 6256 اڈوں کی ہوتی ہے۔ ہومیولوجی ٹی ٹی سی 39 اے میں کئی آرتھولوگس ہیں جو یوکرائٹس، آرکیا اور بیکٹیریا میں پائے گئے ہیں۔ دو متوازی، ٹی ٹی سی 39 بی اور ٹی ٹی سی 39 سی کی بھی نشاندہی کی گئی ہے۔ TTC39B اور TTC39C کے افعال معلوم نہیں ہیں۔ کے آئی اے اے 0452 میں یوکرائٹس، اچیا اور بیکٹیریا سے ٹی ٹی سی 39 اے جیسے کئی اسی طرح کے آرتھولوگ ہیں لیکن پروٹین کی شناخت اور مماثلت مختلف ہیں۔ ایم آر این اے میں پروموٹر کی خصوصیات ہیں۔ ٹی ٹی سی 39 اے جین کے پیش گوئی شدہ پروموٹر 713 بی پی پر محیط ہے جو کہ 51,796,048 سے 51,796,760 تک ہے۔ KIAA0452 جین کے لیے ایک پیش گوئی شدہ پروموٹر 51,796,517 سے 51,797,117 تک 600 بی پی تک پھیلا ہوا ہے۔ نقل کے عوامل ذیل میں نقل کے کچھ عوامل ہیں جو پیش گوئی شدہ پروموٹر ترتیب کے لیے موجود ہیں۔ ذیل میں نقل کے کچھ عوامل ہیں، جن میں 1 کی مماثلت ہے، جو پیش گوئی شدہ پروموٹر ترتیب کے لیے موجود ہیں۔ پروٹین سب سے طویل پروٹین کی ترتیب 613 امینو ایسڈ پر مشتمل ہے۔ TTC39A کے اندر، نامعلوم فنکشن کا ایک ڈومین ہے، DUF 3808۔ DUF 3808 کو عام طور پر ایک بیرونی مائٹوکونڈریل جھلی پروٹین سمجھا جاتا ہے اور اسے پھپھوندی سے انسانوں میں محفوظ کیا گیا ہے۔ DUF 3808 میں ایک ٹیٹراٹریکوپیپٹائڈ، TPR _ 16 اور ایک پیش گوئی شدہ ٹرانس میمبرین ڈومین بھی شامل ہے۔ ٹی ٹی سی 39 اے کے ڈھانچے میں 12 الفا ہیلیکس اور ایک واحد بیٹا شیٹ ہونے کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ کے آئی اے اے 0452 میں 453 امینو ایسڈ کے ساتھ پروٹین کی ترتیب ہے۔ کے آئی اے اے 0452 کے ڈھانچے میں 11 الفا ہیلیکس اور 9 بیٹا شیٹس ہونے کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ KIAA0452 نامعلوم فنکشن کے ڈومین، DUF 3808 کے ذریعے TTC39A کو اوورلیپ کرتا ہے۔ KIAA0452 کا پیش گوئی شدہ سالماتی وزن 49.4 kdal اور ایک آئسو الیکٹرک پوائنٹ 6.766000 ہے۔ اظہار ٹی ٹی سی 39 اے کے لیے 17 اسپلیس اقسام ہیں۔ ٹی ٹی سی 39 اے انسانی جسم میں ایک انتہائی اظہار شدہ پروٹین ہے۔ اظہار کی سب سے زیادہ سطح مماری غدود اور خصیوں میں واقع ہوتی ہے۔ اظہار کی سب سے کم سطح مدافعتی نظام میں پائی جاتی ہے۔ کے آئی اے اے 0452 کا اظہار دماغ میں سب سے زیادہ پایا جاتا ہے، جس میں ٹرائیجیمینل گینگلیئن اور آکسیپیٹل لوب ٹی ٹی سی 39 اے میں سب سے زیادہ سطح ہارمون کے ذمہ دار چھاتی کے کارسنوما خلیوں میں ٹی ایف اے پی 2 سی کے ذریعہ متاثر ہوتی ہے اور ٹی ٹی سی 39 اے کا اظہار ایسٹروجن ریسیپٹر مثبت کارسنوما سیل لائنوں میں ہوتا ہے۔ ترجمہ کے بعد کی تبدیلیاں فاسفوریلیشن کے کئی پیش گوئی شدہ مقامات ہیں لیکن کسی کی بھی تجرباتی طور پر تصدیق نہیں ہوئی ہے۔ پوزیشن 175 پر ایک واحد سلفینیشن سائٹ کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ کے آئی اے اے 0452 میں 274 کی پوزیشن پر ایک واحد این-ایسیٹلیشن سائٹ ہے۔ تعاملات ٹی ٹی سی 39 اے کو بی ٹی این ایل 2 اور ایم اے پی کے 3 کے ساتھ تعامل کرتے ہوئے پایا گیا ہے۔ حوالہ جات