OSER1
کروموسوم 20 اوپن ریڈنگ فریم 111، یا C20orf111، ایک فرضی پروٹین ہے جسے انسانوں میں C20orf111 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ C20orf111 کو پیریٹ 1 (پیرو آکسائیڈ انڈسیبل ٹرانسکرپٹ 1)، ایچ ایس پی سی 207، اور dJ1183I21.1 کے نام سے بھی جانا جاتا ہے۔ یہ اصل میں کروموسوم 20 کی جینومک ترتیب کا استعمال کرتے ہوئے پایا گیا تھا۔ نیشنل سینٹر فار بائیوٹیکنالوجی انفارمیشن، یا این سی بی آئی سے پتہ چلتا ہے کہ یہ کروموسوم 20 پر q13.11 پر واقع ہے، تاہم یونیورسٹی آف کیلیفورنیا-سانتا کروز (یو سی ایس سی) کی ویب سائٹ پر موجود جینوم براؤزر سے پتہ چلتا ہے کہ یہ مقام q13.12 پر ہے، اور اڈینوسین ڈیمینیز لوکس کے دس لاکھ بیس جوڑوں کے اندر ہے۔ یہ بھی پایا گیا کہ ہائیڈروجن پیرو آکسائیڈ ()-انڈیوسڈ اپوپٹوسس سے گزرنے والے خلیوں میں اظہار میں اضافہ ہوا ہے۔ C20orf111 کے امینو ایسڈ کے مواد کا تجزیہ کرنے کے بعد، یہ سیرائن کے باقیات سے بھرپور پایا گیا۔ جین C20orf111 ایک درست، پروٹین کوڈنگ جین ہے جو UCSC جینوم براؤزر کو تلاش کرکے q13.12 پر کروموسوم 20 کے مائنس اسٹرینڈ پر پایا جاتا ہے، لیکن NCBI پر ریفسیک کے مطابق q13.11۔ C20orf111 کے قریب کچھ معروف جین ان کے معروف فنکشن کے ساتھ نیچے دیے گئے خانے میں دیے گئے ہیں۔ ٹرانسکرپٹ عمومی خصوصیات جینومک ڈی این اے لمبائی: 14,968 بیس جوڑے (بی پی) سب سے عام ایم آر این اے لمبائی: 4 ایکسون کے ساتھ 2,260 بی پی۔ اس میں 10 اسپلیس آئسوفارم ہوتے ہیں۔ 5 'غیر ترجمہ شدہ خطہ 252 بی پی لمبا۔ 3 'غیر ترجمہ شدہ خطہ 1,129 بی پی لمبا۔ ٹرانسکرپٹ متغیرات 10 اسپلیس آئسوفارم جو اچھے پروٹین کو انکوڈ کرتے ہیں، مجموعی طور پر 8 مختلف آئسوفارم، جن میں سے 2 مکمل آئسوفارم ہیں۔ نیچے دی گئی تصویر میں 10 آئسوفارم دکھائے گئے ہیں جن کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ ان 10 اسپلیس آئسوفارم میں سے 8 کی پیپٹائڈ کی لمبائی مختلف ہوتی ہے، تاہم یہ تمام پروٹین صرف فرضی ہیں جن پر کوئی وسیع تحقیق نہیں کی گئی ہے۔ ٹرانسکرپشن ریگولیشن پیش گوئی شدہ پروموٹر کی ترتیب کو دیکھتے وقت، کوئی آر این اے پولیمیرس II بائنڈنگ سائٹس نہیں ہیں، تاہم ٹاٹا سے کم پروموٹروں کے لیے بنیادی پروموٹر عنصر کے لیے ایک بائنڈنگ سائٹ ہے۔ پروموٹر کے اسی علاقے میں، ایک ٹاٹا بائنڈنگ فیکٹر سیکوینس بھی ہے، جو ٹرانسکرپشن کے لیے آر این اے پولیمرس II کی پوزیشننگ میں مدد کرتا ہے۔ پروٹین کی عمومی خصوصیات نامعلوم فنکشن 776 (DUF776) کا ایک انتہائی محفوظ ڈومین پر مشتمل ہے، جو پورے پروٹین کا 62 فیصد بنتا ہے۔ سالماتی وزن 31.8 کلو ڈالٹن آئسو الیکٹرک پوائنٹ 8.57 جوہری پروٹین فنکشن ہونے کی پیش گوئی C20orf111 کے فنکشن کو سائنسی برادری اچھی طرح سے نہیں سمجھتی ہے۔ اس میں نامعلوم فنکشن کا ایک ڈومین، DUF776 ہوتا ہے، جس کا ایک بڑا حصہ ہے جو زینوپس ٹراپیکلس کے ذریعے اچھی طرح سے محفوظ ہے۔ یہ بھی دکھایا گیا ہے کہ چوہے کے کارڈیومیوسائٹس میں اظہار میں اضافہ ہوا ہے جو ہائیڈروجن پیرو آکسائیڈ پر مبنی اپوپٹوسس سے گزر رہے ہیں۔ اظہار انسانوں میں ای ایس ٹی پروفائلز کو دیکھتے وقت، عام ٹشو (غیر کینسر)، فی ملین 82 نقل کی سطح پر ظاہر ہوتا ہے۔ C20orf111 کو چوہے کے کارڈیک مایوسائٹس میں اظہار میں اضافے کے لیے دکھایا گیا ہے جو |H |2 |O |2 |-انڈیوسڈ اپوپٹوسس سے گزر رہے ہیں، جو سیل کی موت میں کردار کا مشورہ دیتے ہیں۔ مثانے، سروائیکل، سر اور گردن، نان نیوپلاسیا، پینکریٹک، اور پروسٹیٹ کینسر کے خلیوں میں اظہار کی سطح معمول سے کم ہوتی ہے۔ ہومیولوجی C20orf111 جین کے انسانی جینوم میں کوئی واضح متوازی نہیں ہیں۔ تاہم، دوسرے حیاتیات میں اس کے بہت سے آرتھولوج ہیں، اور یہ زینوپس ٹراپیکلس جیسے حیاتیات میں انتہائی محفوظ ہے اور سی-ٹرمینس پر پروٹو اینیمل ٹرائکوپلاکس کے پیروکاروں میں نیم محفوظ ہے۔ درج ذیل جدول پائے جانے والے آرتھولوگس کی ایک منتخب تعداد پیش کرتا ہے۔ تحفظ نیچے دی گئی تصویر دیگر حیاتیات کے درمیان C20orf111 پروٹین کے تحفظ کا موازنہ کرنے والی ایک سے زیادہ ترتیب کی صف بندی ہے۔ پروٹین ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں کے درمیان DUF776 کے علاقے میں اور یوکرائٹس میں C-ٹرمینس پر بھی انتہائی محفوظ ہے۔ ExPASy میں ٹولز کا استعمال کرتے ہوئے C20orf111 کے لیے ترجمے کے بعد کی تبدیلیوں کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ پوزیشن R81 اور S82 کے درمیان پروٹین میں پیش گوئی شدہ پروپپٹائڈ کلیویج سائٹ۔ 30 پیشین گوئی شدہ سیرائن فاسفوریلیشن سائٹس 5 پیشین گوئی شدہ تھریونین فاسفوریلیشن سائٹس 3 پیشین گوئی شدہ ٹائروسائن فاسفوریلیشن سائٹس پیشین گوئی شدہ ثانوی ڈھانچہ PELE (پروٹین ثانوی ساخت کی پیشین گوئی) C20orf111 کی ثانوی ساخت کی پیشین گوئی کے لیے استعمال کیا گیا تھا۔ β-اسٹرینڈ یا α-ہیلکس ثانوی ساخت کی راہ میں بہت کم ہے، لیکن پروٹین کا ایک بڑا حصہ بے ترتیب کنڈلی کے طور پر موجود معلوم ہوتا ہے۔ یہ دائیں طرف C20orf111 تصاویر کی تصویر پر دکھایا گیا ہے۔ حوالہ جات بیرونی روابط انسانی پروٹین کروموسوم انسانی جینوم پروجیکٹس