RK2 plasmid
آر کے 2 پلاسمڈ ایک وسیع میزبان رینج کا پلاسمڈ ہے جس کا تعلق آئی این سی پی مطابقت پذیری گروپ سے ہے۔ یہ ایک خلیے والے حیاتیات کی وسیع اقسام میں نقل کرنے کی صلاحیت کے لیے قابل ذکر ہے، جو اسے جینیاتی انجینئرنگ کے آلے کے طور پر موزوں بناتا ہے۔ یہ گرام نیگیٹیو بیکٹیریا کی زیادہ تر نسلوں میں منتقلی، نقل اور دیکھ بھال کی صلاحیت رکھتا ہے۔ آر کے 2 کو بعض اوقات پی آر کے 2 کہا جا سکتا ہے، جو کہ ایک اور غیر متعلقہ پلازمیڈ کا نام بھی ہے۔ آر کے 2 کے دیگر ناموں میں آر 18، آر 68، آر پی 1، اور آر پی 4 شامل ہیں۔ یہ سب الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ الگ آئی این سی پی-1 پلاسمڈ گروپ (ایسچریچیا کولی میں آئی این سی پی پلاسمڈز) جس کا آر کے 2 ایک حصہ ہے، کو "انتہائی طاقتور، خود سے منتقل ہونے والے، ایک پیچیدہ ریگولیٹری سرکٹ کے ساتھ خود غرض ڈی این اے مالیکیول" کے طور پر بیان کیا گیا ہے۔ ڈسکوری آر کے 2 کو سب سے پہلے 1969 میں برمنگھم میں اینٹی بائیوٹک مزاحم سیوڈوموناس ایروگینوسا اور کلبیسیلا ایروجینز کے پھیلنے کے سلسلے میں الگ کیا گیا تھا، جیسا کہ پلازمیڈز کے ایک خاندان میں سے ایک ہے جو بیکٹیریل تناؤ کے درمیان ایمپیسلن مزاحمت کی منتقلی میں ملوث ہے۔ آئی این سی پی-1 ذیلی گروپ میں پلازمیڈز کو گندے پانی، زرعی مٹی اور ہسپتالوں سے الگ کیا گیا ہے۔ ساخت آر کے 2 تقریبا 60 کے بی پی لمبی ہے اور اس میں نقل، دیکھ بھال، کنجگیشن اور اینٹی بائیوٹک مزاحمت کے لیے جین ہوتے ہیں۔ مزاحمتی جین اینٹی بائیوٹکس کانامائسن، ایمپیسلن اور ٹیٹراسیکلائن کے خلاف مزاحمت فراہم کرتے ہیں۔ اس کے علاوہ، آر کے 2 میں ممکنہ طور پر مہلک (خلیے کے لیے) جینز کا ایک مجموعہ ہوتا ہے، جسے کلو جینز کہا جاتا ہے، اور تکمیلی ٹرانسکرپشنل ریپریسر جینز کا ایک مجموعہ، جسے کور (کلو اوور رائیڈ کے لیے مختصر) جینز کہا جاتا ہے، جو کلو جینز کو غیر فعال کر دیتے ہیں۔ کلو اور کور جینوں کے مل کر آر کے 2 کی وسیع میزبان رینج میں کردار ادا کرنے کا شبہ ہے۔ نقل آر کے 2 میں ضروری نقل کا نظام نقل، اوری وی، اور ایک جین، ٹی آر ایف اے پر مشتمل ہوتا ہے، جس کا جین پروڈکٹ، ٹی آر ایف اے پروٹین، oriV.CHRISTOPHER ایم۔ تھامس، رچرڈ میئر، * اور ڈونلڈ آر۔ ہیلنسکی: "براڈ-ہوسٹ-رینج پلاسمڈ آر کے 2 کے علاقے جو نقل اور دیکھ بھال کے لیے ضروری ہیں"، جرنل آف بیکٹیریاولوجی، جلد۔ 172، نمبر۔ 7 جولائی 1990، پی۔ 3859-3867 ایسچریچیا کولی میں، ٹی آر ایف اے کے ذریعے فعال ہونے کے بعد نقل اوری وی سے یک طرفہ طور پر آگے بڑھتی ہے۔ ای کولی میں، متعدد پلازمیڈ کاپیاں ایک ساتھ جمع ہوتی دکھائی دیتی ہیں، جس سے ہر ایک cell.Kolatka K، وٹوسنسکا M، پیریچوڈ M، کونیکزنی I میں چند ملٹی پلازمیڈ کلسٹر بنتے ہیں۔: "بیکٹیریل پارٹیشننگ پروٹین براڈ-ہوسٹ رینج پلازمیڈ RK2 کے سب سیلولر لوکیشن کو متاثر کرتے ہیں"، پلازمیڈ، 2010 نومبر ؛ 64 (3): 119-34 RK2 کی کاپی نمبر E. کولی میں تقریبا 4-7 فی سیل اور P. ایروگینوسا میں 3 ہے۔ کم از کم مشتقات آر کے 2 کے کئی کم از کم مشتقات تیار کیے گئے ہیں۔ ان پلازمیڈز میں زیادہ تر جینوں کو ہٹا دیا گیا ہے، جس سے صرف نقل کے لیے ضروری جین اور ایک یا زیادہ قابل انتخاب مارکر رہ گئے ہیں۔ ایسی ہی ایک "منی ریپلیکن" پلاسمڈ پی ایف ایف 1 ہے، جو 5873 بیس پیئرز لمبی ہے۔ پی ایف ایف 1 نقل کی ابتدا، اوری وی، منتقلی کی ابتدا، اوری ٹی، پلاسمڈ نقل پروٹین کے لیے جین کوڈنگ، ٹی آر ایف اے، اور دو اینٹی بائیوٹک مزاحمتی جین، بی ایل اے اور کیٹ پر مشتمل ہے، جو بالترتیب ایمپیسلن اور کلورامفینکول کو مزاحمت فراہم کرتے ہیں۔ پی ایف ایف 1 جیسے کم از کم پلازمیڈز پلازمیڈ ریپلیکیشن اور کاپی نمبر ریگولیشن کے بنیادی طریقہ کار کا مطالعہ کرنے کے لیے مفید ہیں، کیونکہ کم غیر ضروری جینیاتی عناصر ہیں جو مطالعہ کیے جانے والے عمل کو متاثر کر سکتے ہیں۔ پی ایف ایف 1 کے کئی متغیرات کی نشاندہی کی گئی ہے جو پلازمیڈ کے کاپی نمبر کو متاثر کرتے ہیں۔ ایسے دو متغیرات، پی ایف ایف 1 کاپو 254 ڈی اور پی ایف ایف 1 کاپو 271 سی، ای کولی میں پی ایف ایف 1 کی کاپی نمبر کو تقریبا 39-40 سے بڑھا کر بالترتیب تقریبا 501 اور 113 پلازمیڈز فی سیل کر دیتے ہیں۔ کاپی نمبر میں اضافہ جینیاتی انجینئرنگ ایپلی کیشنز کے لیے مفید ہے تاکہ ریکومبیننٹ پروٹین کی پیداوار میں اضافہ کیا جا سکے۔ مزید پڑھنے کے نوٹ ویکٹرون بائیو سولیوشنز: "دی آر کے 2 ریپلیکن"، http://vectronbiosolutions.com/info.php?id=14 میئر وغیرہ۔ : "وسیع میزبان رینج پلازمیڈ آر کے 2 کی سالماتی گاڑی کی خصوصیات"، سائنس، دسمبر 1975: پی پی۔ 1226-1228۔ https://www.science.org/doi/abs/10.1126/science.1060178 سٹینفورڈ یونیورسٹی سے جینوم ڈیٹا: http://genome-www.stanford.edu/vectordb/vector_descrip/NOTCOMPL/RK2.SEQ.html سی ایم تھامس (ایڈیٹر): "پرومسکیوس پلازمیڈز آف گرام نیگیٹیو بیکٹیریا"، اکیڈمک پریس، لندن، 1989۔ سی ایم تھامس، اور سی اے اسمتھ: "مطابقت نہ رکھنے والا گروپ پی پلازمیڈز: جینیات، ارتقا، اور جینیاتی ہیرا پھیری میں استعمال"، مائکروبیولوجی کا سالانہ جائزہ، جلد۔ 41: 77-101، اکتوبر 1987 "پینسیگرو اور دیگر۔ : "مکمل نیوکلیوٹائڈ سیکوینس آف برمنگھم انکارپوریٹڈ پلازمیڈز: تالیف اور تقابلی تجزیہ"، جرنل آف مالیکیولر بائیولوجی، جلد 239، شمارہ 5، 23 جون 1994، صفحات 623-663 سیکوینس ڈیٹا این سی بی آئی میں جمع کیا گیا: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/508311?report=genbank&log $= نیوکل ٹاپ اور بلاسٹ _ رینک = 18 اور RID = CD93RUA001S موبائل جینیاتی عناصر مالیکیولر بائیولوجی پلازمیڈز