DIMPL
ڈی آئی ایم پی ایل (ڈسکوری آف انٹرجینک موٹفز پائپ لائن) ایک بائیو انفارمیٹک پائپ لائن ہے جو بیکٹیریل جی سی سے بھرپور انٹرجینک ریجنز (آئی جی آر) کو نکالنے اور منتخب کرنے کے قابل بناتی ہے جو اسٹرکچرڈ نان کوڈنگ آر این اے (این سی آر این اے) کے لیے افزودہ ہیں۔ این سی آر این اے موٹف کی دریافت کے لیے بیکٹیریل آئی جی آر کو افزودہ کرنے کا طریقہ سب سے پہلے "بیکٹیریا میں منظم نان کوڈنگ آر این اے کی جینوم وسیع دریافت" میں ایک مطالعہ کے لیے رپورٹ کیا گیا تھا۔ ڈی آئی ایم پی ایل پائپ لائن آئی جی آر نکال کر، انہیں لمبائی اور نیوکلک ایسڈ کی ساخت سے فلٹر کرکے، اور امیدوار کے نقشوں کی شناخت اور ان کے ممکنہ افعال کو تفویض کرنے کے لیے ضروری ڈیٹا اکٹھا کرکے کل جینوم تجزیہ کے عمل کو خودکار بناتی ہے۔ ڈی آئی ایم پی ایل پائپ لائن سپورٹ ویکٹر مشین (ایس وی ایم) کلاسیفائرز کے ذریعے این سی آر این اے کے لیے افزودہ جینومک علاقوں کی شناخت کے لیے تولیدی تکنیک فراہم کرتی ہے۔ اس کا استعمال نیوکلک ایسڈ اور پروٹین موفٹس کو تلاش کرنے کے لیے کیا جا سکتا ہے، بشمول رائبوسوچ جیسے عناصر، اپ اسٹریم اوپن ریڈنگ فریم (یو او آر ایف)، شارٹ اوپن ریڈنگ فریم (ایس او آر ایف)، رائبوسومل پروٹین لیڈر سیکوینس، خود غرض جینیاتی عناصر اور نامعلوم فنکشن کے دیگر منظم آر این اے موفٹس۔ ڈی آئی ایم پی ایل ترتیب تجزیہ کے مختلف وسائل کا استعمال کرتا ہے، بشمول: Rfam ڈیٹا بیس، معروف آر این اے خاندانوں کے حوالہ کے طور پر BLASTX سرچ ٹول، غیر متناسب پروٹین کوڈنگ کے علاقوں کو ختم کرنے کے لیے INFERNAL پیکیج، آئی جی ایس کے ترتیبات سی ایم فائنڈر کو تلاش کرنے کے لیے، ممکنہ آر این اے ثانوی ڈھانچے کی خصوصیات R-سکیپ سافٹ ویئر اور R2R ڈرائنگ الگورتھم کو تلاش کرنے کے لیے، اتفاق رائے ماڈل RNA کوڈ تیار کرنے کے لیے، کوڈنگ کے علاقوں کی موجودگی کو دیکھنے کے لیے جینوم ویو، ڈی آئی ایم پی ایل کا استعمال کرتے ہوئے دریافت ہونے والے RNA موٹف کے جینیاتی سیاق و سباق کو دیکھنے کے لیے HMP-PP رائبوسویچ، ICD-II ncRNA موٹف، کار اے این سی آر این اے موٹف، ایل ڈی ایچ 2 این سی آر این اے موٹف، دوسروں کے درمیان۔ حوالہ جات بائیو انفارمیٹکس کمپیوٹیشنل بائیولوجی