ORF9c
او آر ایف 9 سی (جسے پہلے او آر ایف 14 بھی کہا جاتا تھا) ذیلی نسل سربیکو وائرس کے کورونا وائرس جینوم میں ایک اوپن ریڈنگ فریم (او آر ایف) ہے۔ یہ سارس-کوو-2 جینوم میں 73 کوڈن طویل ہے۔ اگرچہ یہ اکثر سربیکو وائرس وائرل لوازمات پروٹین جینوں کی فہرستوں میں شامل ہوتا ہے، تجرباتی اور بائیو انفارمیٹکس شواہد سے پتہ چلتا ہے کہ ORF9c ایک فعال پروٹین کوڈنگ جین نہیں ہو سکتا ہے۔ نامیات سائنسی ادب میں اس جین کے لیے استعمال ہونے والے نامیات میں تضاد پایا گیا ہے۔ سارس-کوو پر کچھ کام میں، اسے او آر ایف 14 کہا گیا ہے۔ اسے بعض اوقات او آر ایف 9 بی کہا جاتا ہے، جبکہ اس کے طویل اوپری پڑوسی او آر ایف 9 بی کو او آر ایف 9 اے کا نام دیا گیا تھا۔ موجودہ تجویز کردہ نام اس جین کو او آر ایف 9 سی اور اپ اسٹریم جین کو او آر ایف 9 بی کے طور پر حوالہ دیتے ہیں۔ اظہار اور تعاملات او آر ایف 9 سی دو اوور لیپنگ جینوں میں سے ایک ہے جو مکمل طور پر این جین انکوڈنگ کورونویرس نیوکلیوکیپسڈ پروٹین کے اوپن ریڈنگ فریم کے اندر موجود ہے، دوسرا او آر ایف 9 بی ہے۔ یہ واضح نہیں ہے کہ آیا سارس-کوو-2 انفیکشن کے دوران او آر ایف 9 سی فعال طور پر ظاہر ہوتا ہے۔ مبینہ طور پر تجرباتی حالات میں اس کا ترجمہ نہیں کیا جاتا ہے۔ جب تجرباتی طور پر حد سے زیادہ اظہار کیا جاتا ہے، تو پروٹین سگما ریسیپٹرز اور این ایف-کے بی راستے کے ساتھ تعامل کرتا ہے۔ سارس-کوو پروٹین خود تعاملات کی تشکیل کرتا ہے جو پروٹین ڈائمر یا اعلی درجے کے اولیگومر کی تشکیل کا مشورہ دیتا ہے۔ ارتقاء او آر ایف 9 سی میں سارس-کوو اور سارس-کوو-2 کے درمیان تقریبا 74 فیصد ترتیب کی شناخت ہے۔ سارس-کوو-2 متغیرات کی نشاندہی کی گئی ہے جس میں قبل از وقت اسٹاپ کوڈن متعارف کروائے جاتے ہیں یا جہاں اس کا اسٹارٹ کوڈن کھو گیا تھا، اور امینو ایسڈ کی ترتیب ناقص طور پر محفوظ ہے، اس مفروضے کی حمایت کرتے ہوئے کہ یہ ایک فعال پروٹین کو انکوڈ نہیں کرتا ہے۔ حوالہ جات کورونویرس پروٹین