Domain of unknown function
ڈومین آف نامعلوم فنکشن (DUF) ایک پروٹین ڈومین ہے جس کی کوئی خصوصیت نہیں ہے۔ ان خاندانوں کو فام ڈیٹا بیس میں سابقہ DUF کے بعد ایک نمبر کا استعمال کرتے ہوئے اکٹھا کیا گیا ہے، جس کی مثالیں DUF2992 اور DUF1220 ہیں۔ 2019 تک، فام ڈیٹا بیس کے اندر تقریبا 4,000 ڈی یو ایف خاندان ہیں جو 22 فیصد سے زیادہ معروف خاندانوں کی نمائندگی کرتے ہیں۔ کچھ DUFs کو مقبول استعمال کی وجہ سے نام کا استعمال کرتے ہوئے نام نہیں دیا گیا ہے لیکن اس کے باوجود DUFs ہیں۔ DUF عہدہ عارضی ہے، اور اس طرح کے خاندانوں کو کسی فنکشن کی شناخت کے بعد زیادہ مخصوص نام (یا موجودہ ڈومین میں ضم) کا نام دیا جاتا ہے۔ ڈی یو ایف نامی اسکیم کرس پونٹنگ نے اسمارٹ ڈیٹا بیس میں ڈی یو ایف 1 اور ڈی یو ایف 2 کے اضافے کے ذریعے متعارف کرائی تھی۔ یہ دونوں ڈومینز بیکٹیریل سگنلنگ پروٹین میں بڑے پیمانے پر تقسیم پائے گئے۔ اس کے بعد، ان ڈومینز کے افعال کی نشاندہی کی گئی اور اس کے بعد ان کا نام بالترتیب جی جی ڈی ای ایف ڈومین اور ای اے ایل ڈومین رکھ دیا گیا۔ ساختی جینومکس پروگراموں نے ساخت کے تعین کے ذریعے ڈی یو ایف کے افعال کو سمجھنے کی کوشش کی ہے۔ 250 سے زیادہ ڈی یو ایف خاندانوں کے ڈھانچے کو حل کیا گیا ہے۔ اس (2009) کے کام سے پتہ چلتا ہے کہ تقریبا دو تہائی DUF خاندانوں کا ڈھانچہ پہلے حل شدہ خاندان سے ملتا جلتا تھا اور اس وجہ سے موجودہ پروٹین سپر فیملی کے مختلف اراکین ہونے کا امکان ہے، جبکہ تقریبا ایک تہائی میں ایک نیا پروٹین فولڈ تھا۔ کچھ DUF خاندان ان ڈومینز کے ساتھ ریموٹ سیکوینس ہومیولوجی کا اشتراک کرتے ہیں جن کی خصوصیت فنکشن ہوتی ہے۔ ان رشتوں کو جوڑنے کے لیے کمپیوٹیشنل کام کا استعمال کیا جا سکتا ہے۔ 2015 کا ایک کام 20 ٪ DUFs کو نمایاں ساختی سپر فیملی کو تفویض کرنے میں کامیاب رہا۔ فام مسلسل "کلان" سپر فیملی اندراجات میں (دستی طور پر تصدیق شدہ) تفویض بھی انجام دیتا ہے۔ تعدد اور تحفظ 2013 میں تمام پروٹین ڈومینز میں سے 20 فیصد سے زیادہ کو ڈی یو ایف کے طور پر بیان کیا گیا تھا۔ بیکٹیریا میں تقریبا 2,700 ڈی یو ایف پائے جاتے ہیں جبکہ یوکرائٹس میں صرف 1,500 سے زیادہ پائے جاتے ہیں۔ بیکٹیریا اور یوکرائٹس کے درمیان 800 سے زیادہ ڈی یو ایف مشترک ہیں، اور ان میں سے تقریبا 300 آرکیا میں بھی موجود ہیں۔ کل 2,786 بیکٹیریل پی ایف اے ایم ڈومینز جانوروں میں بھی پائے جاتے ہیں، جن میں 320 ڈی یو ایف شامل ہیں۔ حیاتیات میں کردار بہت سے ڈی یو ایف انتہائی محفوظ ہیں، جو حیاتیات میں ایک اہم کردار کی نشاندہی کرتے ہیں۔ تاہم، اس طرح کے بہت سے ڈی یو ایف ضروری نہیں ہیں، اس لیے ان کا حیاتیاتی کردار اکثر نامعلوم رہتا ہے۔ مثال کے طور پر، DUF143 زیادہ تر بیکٹیریا اور یوکرائیوٹک جینوم میں موجود ہوتا ہے۔ تاہم، جب اسے ایسچریچیا کولی میں حذف کیا گیا تو کوئی واضح فینوٹائپ کا پتہ نہیں چلا۔ بعد میں یہ دکھایا گیا کہ DUF143 پر مشتمل پروٹین رائبوسومل خاموش کرنے والے عوامل ہیں جو دو رائبوسومل ذیلی اکائیوں کی اسمبلی کو روکتے ہیں۔ اگرچہ یہ فنکشن ضروری نہیں ہے، لیکن یہ پروٹین کی حیاتیاتی ترکیب کو بند کر کے خلیوں کو کم غذائیت کے حالات کے مطابق ڈھالنے میں مدد کرتا ہے۔ نتیجے کے طور پر، یہ پروٹین اور ڈی یو ایف صرف اس وقت متعلقہ ہو جاتے ہیں جب خلیات بھوکے ہو جاتے ہیں۔ اس طرح یہ خیال کیا جاتا ہے کہ بہت سے ڈی یو ایف (یا نامعلوم فنکشن کے پروٹین، پی یو ایف) صرف کچھ شرائط کے تحت درکار ہوتے ہیں۔ ضروری DUFs Goodacre et al. 355 ضروری پروٹینوں (16 ماڈل بیکٹیریل پرجاتیوں میں) میں 238 ڈی یو ایف کی نشاندہی کی گئی، جن میں سے زیادہ تر سنگل ڈومین پروٹین کی نمائندگی کرتے ہیں، جو واضح طور پر ڈی یو ایف کی حیاتیاتی ضروریات کو قائم کرتے ہیں۔ ان DUFs کو "ضروری DUFs" یا eDUFs کہا جاتا ہے۔ بیرونی روابط حرف D سے شروع ہونے والے فام خاندانوں کی فہرست، بشمول DUF خاندان حوالہ جات پروٹین ڈومینز