Microviridae
مائکرو وائریڈی بیکٹیریوفیجز کا ایک خاندان ہے جس میں سنگل اسٹرینڈڈ ڈی این اے جینوم ہوتا ہے۔ اس خاندان کا نام قدیم یونانی لفظ () سے ماخوذ ہے، جس کا مطلب "چھوٹا" ہے۔ یہ ان کے جینوم کے سائز سے مراد ہے، جو ڈی این اے وائرس کے سب سے چھوٹے میں سے ہیں۔ اینٹروبیکٹیریا، انٹرا سیلولر پرجیوی بیکٹیریا، اور اسپائروپلاسما قدرتی میزبان کے طور پر کام کرتے ہیں۔ اس خاندان میں 22 انواع ہیں، جو سات نسلوں اور دو ذیلی خاندانوں میں تقسیم ہیں۔ وائرولوجی وائریون غیر ڈھکے ہوئے ہوتے ہیں، ایک آئکوساہڈرل سمیٹری (T = 1) کے ساتھ گول ہوتے ہیں۔ ان کا قطر 25-27 نینو میٹر کے درمیان ہوتا ہے اور ان کی دم نہیں ہوتی۔ ہر وائریون میں ایف، جی اور جے پروٹین کی 60 کاپیاں اور ایچ پروٹین کی 12 کاپیاں ہوتی ہیں۔ ان میں 12 پینٹاگونل صور کی شکل کے پینٹیمرز ہوتے ہیں (~ 7.1 این ایم چوڑے × 3.8 این ایم اونچے)، جن میں سے ہر ایک جی کی 5 کاپیوں اور ایچ پروٹین میں سے ایک پر مشتمل ہوتا ہے۔ اس خاندان میں وائرس اپنے جینوم کو ایک رولنگ سرکل میکانزم کے ذریعے نقل کرتے ہیں اور وقف شدہ آر سی آر ابتدائی پروٹین کو انکوڈ کرتے ہیں۔ اگرچہ اس خاندان کی اکثریت پرجاتیوں میں لائٹک لائف سائیکل ہوتے ہیں، لیکن کچھ میں معتدل لائف سائیکل ہو سکتے ہیں۔ جینوم کے سائز 4.5-6kb سے ہوتے ہیں اور سرکلر ہوتے ہیں۔ یہ 11 جینوں کو انکوڈ کرتا ہے (ترتیب میں: A، A *، B، C، K، D، E، J، F، G، اور H)، جن میں سے نو ضروری ہیں۔ غیر ضروری جین ای اور کے ہیں۔ کئی جینوں میں اوور لیپنگ ریڈنگ فریم ہوتے ہیں۔ پروٹین اے * کو پروٹین اے کے اندر انکوڈ کیا جاتا ہے۔ اس میں اے پروٹین کے این ٹرمینل سے ~ 1/3 امینو ایسڈ کی کمی ہوتی ہے اور اسی فریم میں انکوڈ کیا جاتا ہے جس میں اے پروٹین ہوتا ہے۔ اس کا ترجمہ میسنجر آر این اے کے اندر اندرونی اسٹارٹ سائٹ سے کیا جاتا ہے۔ جین ای کو + 1 فریم شفٹ کے ساتھ جین ڈی کے ساتھ انکوڈ کیا جاتا ہے۔ جین کے جین اے، بی، اور سی کو اوورلیپ کرتا ہے۔ نقل کی ابتدا 30 بنیادی ترتیب میں ہوتی ہے۔ نقل کے لیے پوری 30 بیس سیکوینس درکار ہوتی ہے۔ سالماتی حیاتیات بڑے کیپسیڈ پروٹین (ایف) میں 426 امینو ایسڈ ہوتے ہیں، بڑے سپائیک پروٹین (جی) میں 175 امینو ایسڈ ہوتے ہیں، چھوٹے ڈی این اے بائنڈنگ پروٹین (جے) میں 25-40 امینو ایسڈ ہوتے ہیں، اور ڈی این اے پائلٹ پروٹین (ایچ) میں 328 امینو ایسڈ ہوتے ہیں۔ پروٹین ایف کا اہم فولڈنگ موٹف بہت سے وائرل کیپسیڈ پروٹینوں کے لیے عام آٹھ پھنسے ہوئے اینٹی پیریلل بیٹا بیرل ہے۔ جی پروٹین ایک تنگ بیٹا بیرل ہے جس کے تار ریڈیئل طور پر باہر کی طرف چلتے ہیں۔ جی پروٹین پانچ کے گروپوں میں پائے جاتے ہیں جو 12 اسپائکس بناتے ہیں جو ایک ہائیڈروفیلک چینل کو گھیرے ہوئے ہیں۔ انتہائی بنیادی جے پروٹین میں کسی ثانوی ساخت کا فقدان ہوتا ہے اور یہ ایف پروٹین کے اندرونی شگاف میں واقع ہوتا ہے۔ اس میں پروٹین میں کوئی تیزابیت والے امینو ایسڈ کے باقیات نہیں ہوتے ہیں اور بارہ بنیادی باقیات این-ٹرمینس میں دو کلسٹرز میں مرتکز ہوتے ہیں جو پرولین سے بھرپور علاقے سے الگ ہوتے ہیں۔ وائیرون کی اسمبلی میں دو اسکیفولڈنگ پروٹین، اندرونی اسکیفولڈنگ پروٹین بی اور بیرونی اسکیفولڈنگ پروٹین ڈی کا استعمال ہوتا ہے۔ ایسا لگتا ہے کہ پروٹین بی کا کام اسمبلی کے لیے وائیرون کے لیے درکار پروٹین ڈی کی مقدار کو کم کرنا ہے۔ پروٹین ایچ ایک ملٹی فنکشنل ساختی پروٹین ہے جو داخلے کے عمل کے دوران وائرل ڈی این اے کو میزبان خلیے کے اندرونی حصے میں چلانے کے لیے درکار ہوتا ہے۔ پروٹین ای ایک 91 امینو ایسڈ جھلی پروٹین ہے جو میزبان ٹرانسلوکیس ایم آر اے وائی کو روک کر میزبان سیل لائسیس کا سبب بنتا ہے۔ یہ روک تھام کی سرگرمی این ٹرمینل 29 امینو ایسڈ کے اندر واقع ہے۔ پروٹین اے ایک واحد اسٹرینڈ اینڈو نیوکلیز ہے اور وائرل ڈی این اے کی نقل کے آغاز کا ذمہ دار ہے۔ یہ فائی ایکس اصل پر جی اور اے نیوکلیوٹائڈ کے بقیہ جوڑے کے درمیان فاسفوڈیسٹر بانڈ کے کلیویج اور لائیگیشن کو متحرک کرتا ہے۔ یہ فیج کی عملداری کے لیے ضروری نہیں ہو سکتا لیکن جب اسے تبدیل کیا جاتا ہے تو برسٹ سائز 50 فیصد تک کم ہو جاتے ہیں۔ پروٹین اے * میزبان ڈی این اے کی نقل کو روکتا ہے۔ پروٹین اے کے برعکس یہ میزبان کے سنگل اسٹرینڈڈ بائنڈنگ پروٹین کی موجودگی میں فائی ایکس وائرل ڈی این اے کو الگ کرنے کی صلاحیت رکھتا ہے۔ پروٹین اے *، جیسے پروٹین اے، فیج کی عملداری کے لیے ضروری نہیں ہو سکتا۔ پروٹین سی اختتامی اور دوبارہ شروع ہونے والے رد عمل کی وفاداری کو بڑھاتا ہے اور وائرل ڈی این اے کو پروٹین کے خول میں پیک کرنے کے لیے ضروری ہے۔ پروٹین کے میں 56 امینو ایسڈ ہوتے ہیں اور یہ میزبان خلیے کی جھلی میں پائے جاتے ہیں۔ ایسا لگتا ہے کہ یہ وائرس کے پھٹنے کے سائز کو بڑھانے کے قابل ہے۔ درجہ بندی اس خاندان کو دو ذیلی خاندانوں میں تقسیم کیا گیا ہے: گوکوشوویرینے اور بلاویرینے (سابقہ جینس مائیکرو وائرس)۔ یہ گروہ اپنے میزبان، جینوم کی ساخت، اور ویرون کی ساخت میں مختلف ہیں۔ نام گوکوشوویرینے جاپانی سے ماخوذ ہے جس کا مطلب بہت چھوٹا ہے۔ گوکوشوائرس فی الحال صرف لازمی انٹرا سیلولر پرجیویوں کو متاثر کرنے کے لیے جانے جاتے ہیں۔ ذیلی خاندان بلاویرینے کے تمام اراکین اینٹروبیکٹیریا کو متاثر کرتے ہیں۔ ایک تخیلاتی تیسری گروہ بندی تجویز کی گئی ہے-الپا وائرینے-جو بیکٹیریوڈیلز آرڈر کو متاثر کرتی ہے۔ یہ وائرسوں کا ایک گروپ ہے جسے صرف پروفیجز کے نام سے جانا جاتا ہے اور ان وائرسوں پر اضافی کام ذیلی خاندان کی حیثیت دینے سے پہلے اشارہ کیا جاتا ہے۔ ایک چوتھا کلاڈ تجویز کیا گیا ہے-پیچوویرینے۔ اس کلاڈ میں ایک جینوم تنظیم ہے جو اس خاندان کے دیگر ارکان سے مختلف ہے۔ یہ نام پیچو سے ماخوذ ہے جس کا مطلب آکسیٹین میں چھوٹا ہے۔ ایک اور وائرس کو ترکی کے آنت سے الگ کر دیا گیا ہے جس کی خصوصیات دیگر مائیکرو وائرس سے ملتی جلتی ہیں لیکن معلوم پرجاتیوں سے بالکل مختلف ہیں۔ نوٹ ذیلی خاندان بلاویرینے (سابقہ جینس مائیکرو وائرس) کے اراکین میں چار ساختی پروٹین ہوتے ہیں: میجر کیپسیڈ پروٹین ایف، میجر اسپائک پروٹین جی، ایک چھوٹا ڈی این اے بائنڈنگ پروٹین جے (لمبائی میں 25-40 امینو ایسڈ) اور ڈی این اے پائلٹ پروٹین ایچ۔ ویرون کی اسمبلی میں دو اسکیفولڈنگ پروٹین، اندرونی اسکیفولڈنگ پروٹین بی اور بیرونی اسکیفولڈنگ پروٹین ڈی استعمال ہوتا ہے۔ پروٹین ایچ ایک کثیر فعال ساختی پروٹین ہے جو وائرل ڈی این اے کو میزبان خلیے کے اندرونی حصے میں داخل کرنے کے لیے درکار ہوتا ہے۔ جینوموں کی لمبائی 5.3 اور 6.2 کلو بیس (کے بی) کے درمیان ہوتی ہے۔ اس ذیلی خاندان کے اراکین کو جینوم کے سائز کے مطابق تین اہم کلڈوں میں تقسیم کیا جا سکتا ہے۔ گروپوں کے اندر سائز کی تغیر پذیری بنیادی طور پر انٹرجینک علاقوں کے اندراج اور حذف کرنے کے نتیجے میں ہوتی ہے۔ وائرس کو معلوم لیب پر مبنی تناؤ سے ان کی مماثلت کے مطابق تفویض کیا جاتا ہے-φX174 جیسے کلاڈ، G4 جیسے کلاڈ اور α3 جیسے کلاڈ۔ مائکرو وائریڈی کے φX174 نما کلاڈ میں سب سے چھوٹے اور کم سے کم متغیر جینوم ہوتے ہیں (5,386-5، 387 bp) ؛ G4 نما کلاڈ سائز میں 5,486-5، 487 bp سے مختلف ہوتا ہے ؛ جبکہ جینوم کے سائز کا سب سے بڑا گروپ α3 جیسا کلاڈ ہے جس میں جینوم 6,061-6259 bp سے ہوتے ہیں۔ ذیلی خاندان گوکوشوویرینے کے اراکین کے پاس صرف دو ساختی پروٹین ہوتے ہیں: کیپسڈ پروٹین ایف (وائرس پروٹین 1) اور ڈی این اے پائلٹ پروٹین ایچ (وائرس پروٹین 2) اور وہ اسکیفولڈنگ پروٹین کا استعمال نہیں کرتے۔ ان کے پاس 'مشروم نما' پروٹریشن بھی ہوتے ہیں جو ان کے آئکوساہیڈرل کیپسیڈز کی ہم آہنگی کے تین گنا محوروں پر واقع ہوتے ہیں۔ یہ گوکوشوائرس کے پروٹین ایف کے اندر بڑے اندراج لوپس سے تشکیل پاتے ہیں اور مائیکرو وائرس میں غیر حاضر ہوتے ہیں۔ ان میں مائیکرو وائرس جینس میں پرجاتیوں کے بیرونی سکیفولڈنگ پروٹین ڈی اور بڑے اسپائیک پروٹین جی دونوں کی کمی ہے۔ اس گروپ کے جینوم چھوٹے ہوتے ہیں-لمبائی میں تقریبا 4.5 کے بی۔ اس ذیلی خاندان میں نسل بیڈیلو مائکرو وائرس، کلیمیڈیا مائکرو وائرس اور اسپائرو مائکرو وائرس شامل ہیں۔ زندگی کا چکر زندگی کے چکر میں کئی مراحل ہوتے ہیں۔ مخصوص رسیپٹر (ز) 2 کے ذریعے میزبان کو جذب کرنا۔ میزبان خلیے 3 میں وائرل ڈی این اے کی حرکت۔ سنگل اسٹرینڈ فارم کو ڈبل اسٹرینڈڈ انٹرمیڈیٹ میں تبدیل کرنا اسے ریپلیکیٹو فارم I کے نام سے جانا جاتا ہے۔ 4. ابتدائی جینوں کی نقل 5. وائرل جینوم وائرل پروٹین اے کی نقل نقل (اوری) کی ابتدا میں نقل I ڈی این اے اسٹرینڈ کو الگ کرتی ہے اور ہم آہنگی سے خود کو ڈی این اے سے منسلک کرتی ہے، جس سے نقل فارم II مالیکیول پیدا ہوتا ہے۔ جینوم کی نقل اب ایک رولنگ سرکل میکانزم کے ذریعے شروع ہوتی ہے۔ میزبان کا ڈی این اے پولیمرس سنگل اسٹرینڈڈ ڈی این اے کو ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے میں تبدیل کرتا ہے۔ 6. دیر سے جین اب میزبان کے آر این اے پولیمریز کے ذریعے نقل کیے جاتے ہیں۔ 7. نئے وائرس کی ترکیب وائرل پروٹین سی نقل کمپلیکس سے منسلک ہوتا ہے، جس سے نئے وائرل مثبت پھنسے ہوئے ڈی این اے کی پیکیجنگ پروکیپسیڈز میں ہوتی ہے۔ ابتدائی کمپلیکس میزبان سیل پروٹین کے نمائندے اور وائرل اے اور سی پروٹین پر مشتمل ہوتا ہے۔ یہ پروکیپسڈ کے ساتھ مل کر 50S کمپلیکس بناتے ہیں۔ 8. میزبان سائٹوپلازم 9 میں ویرون کی پختگی۔ میزبان سیل لائسیس سے اخراج فائی ایکس 174-انکوڈڈ پروٹین ای کے ذریعے ہوتا ہے، جو پیپٹائڈوگلیکن کی ترکیب کو روکتا ہے جس کے نتیجے میں متاثرہ سیل پھٹ جاتا ہے۔ مزید پڑھنے کے لیے حوالہ جات رویکتا، ڈی آر۔ وغیرہ۔، 2006۔ افقی جین کی منتقلی اور مائیکرو وائیرڈ کولیفیج جینومز کا ارتقاء۔ جرنل آف بیکٹیریاولوجی، 118 (3) پی 1134-1142 بیرونی روابط وائرل زون: مائیکرو وائریڈی ترتیب شدہ جینومز کی فہرست آئی سی ٹی وی وائرس خاندان بیکٹیریوفیجز