Caulimoviridae
کالیموویریڈی پودوں کو متاثر کرنے والے وائرس کا ایک خاندان ہے۔ اس خاندان میں 94 انواع ہیں، جو 11 نسلوں کو تفویض کی گئی ہیں۔ کالیموویریڈی خاندان سے تعلق رکھنے والے وائرسوں کو ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے (ڈی ایس ڈی این اے) ریورس ٹرانسکرائبنگ وائرس (یا پیراٹرو وائرس) یعنی کہا جاتا ہے۔ وائرس جو اپنے نقل کے چکر میں الٹا نقل کے مرحلے پر مشتمل ہوتے ہیں۔ اس خاندان میں ڈی ایس ڈی این اے جینوم والے تمام پودوں کے وائرس ہوتے ہیں جن کی زندگی کے چکر میں الٹا نقل کرنے کا مرحلہ ہوتا ہے۔ درجہ بندی مندرجہ ذیل نسلوں کو تسلیم کیا گیا ہے: بدنوائرس کالیمووائرس کیومووائرس ڈیوسکووائرس پیٹووائرس روزاڈنوائرس روفلوڈیوائرس سولینڈو وائرس سویامووائرس ٹونگروائرس ویکسینیوائرس وائرس ذرہ ڈھانچہ اس خاندان کے تمام وائرس غیر ڈھکے ہوئے ہیں۔ وائرس کے ذرات یا تو بیسیلفارم یا آئسومیٹرک ہوتے ہیں۔ وائرس کی ساخت میں شامل نیوکلیوکیپسڈ کی قسم وائرل ذرات کے سائز کا تعین کرتی ہے۔ بیسیلفارم ذرات قطر میں تقریبا 35-50 nm اور لمبائی میں 900 nm تک ہوتے ہیں۔ آئسومیٹرک ذرات اوسط 45-50 nm قطر میں ہوتے ہیں اور آئکوساہیڈرل سمیٹری ظاہر کرتے ہیں۔ جینوم کی ساخت اور نقل اس خاندان کے وائرس کے جینوموں میں مونوپارٹائٹ، غیر ہم آہنگی سے بند سرکلر ڈی ایس ڈی این اے 7.2-9.3 کے بی پی ہوتا ہے جس میں مخصوص مقامات پر دونوں جینوم اسٹرینڈز میں تضادات ہوتے ہیں۔ ان جینوموں میں ایک اوپن ریڈنگ فریم (او آر ایف) ہوتا ہے، جیسا کہ پیٹیوائرس میں دیکھا گیا ہے، آٹھ او آر ایف جیسے کہ سوئیمو وائرس میں۔ وائرل جینوموں کے ذریعے انکوڈ شدہ پروٹینوں میں ریورس ٹرانسکرپٹیس-ربونوکلیز ایچ، ایسپارٹک پروٹیسیس، نیوکلیوکیپسائڈز اور ٹرانس ایکٹیویٹرز شامل ہیں-نقل کے لیے ضروری دیگر پروٹین بھی ہیں جنہیں ابھی تک کوئی مخصوص کام تفویض نہیں کیا گیا ہے۔ نقل میزبان خلیوں کے سائٹوپلازم اور نیوکلئس دونوں میں ہوتی ہے۔ سب سے پہلے، وائرل جینوم سائٹوپلازم میں داخل ہوتا ہے۔ وائرل ڈی این اے میزبان مرکزے میں داخل ہونے پر سپر کوائلڈ منی کروموسوم ڈھانچے بناتا ہے، جہاں اسے پولیڈینائیلیٹڈ آر این اے میں نقل کیا جاتا ہے جو کہ حتمی طور پر بے کار ہوتا ہے (ڈی این اے کے کچھ حصوں کے لیے دو بار نقل ہونے کی وجہ سے)۔ نیا نقل شدہ آر این اے سائٹوپلازم میں داخل ہوتا ہے جہاں اسے یا تو وائرل پروٹین میں ترجمہ کیا جاتا ہے، یا وائرل ریورس ٹرانسکرپٹیس کے ذریعے ڈی ایس ڈی این اے وائرل جینوم کی نئی کاپیوں میں دوبارہ نقل کیا جاتا ہے۔ نئے ڈی ایس ڈی این اے جینوم سائٹوپلازم میں بند کیے جاتے ہیں اور جاری کیے جاتے ہیں۔ نقل کے عمل میں ایک ریٹرو ٹرانسکرپشن مرحلہ اور ایک آر این اے انٹرمیڈیٹ شامل ہوتا ہے، اس لیے کالیموویریڈی خاندان کے وائرس کو حقیقی ڈی ایس ڈی این اے وائرس نہیں سمجھا جاتا ہے-اس کے بجائے انہیں ڈی این اے ریورس ٹرانسکرائبنگ وائرس کہا جاتا ہے۔ وہ اس خصوصیت کو ریٹرو وائرس کے ساتھ بانٹتے ہیں۔ تاہم، ریٹرو وائرس کے برعکس، کالیموویریڈی خاندان کے وائرس کو نقل کرنے کے لیے اپنے میزبانوں کے جینوم میں وائرل جینوم کے انضمام کی ضرورت نہیں ہوتی ہے اور اس وجہ سے ان کا جینوم انزیمیٹک پروٹین انٹیگریز کو انکوڈ نہیں کرتا ہے۔ پودوں کے جینوم میں اینڈوجینس وائرل عناصر (ای وی ای) کی موجودگی وسیع پیمانے پر ہے۔ اور سب سے زیادہ معروف پلانٹ ای وی ای کی ابتدا کالیموویریڈی خاندان میں ڈی این اے جینوم والے وائرس سے ہوتی ہے۔ خیال کیا جاتا ہے کہ انضمام ڈی این اے کی مرمت کے طریقہ کار کے دوران غیر ہم جنس پرست اختتامی جوڑ (ناجائز دوبارہ ملاپ) کے ذریعے ہوتا ہے۔ زیادہ تر پودوں کے ای وی ای غیر متعدی ہوتے ہیں۔ تاہم، پیٹونیا (پیٹونیا رگ کلیئرنگ وائرس)، کیلے (کیلے کی لکیر او ایل وائرس، کیلے کی لکیر جی ایف وائرس، کیلے کی لکیر آئی ایم وائرس) اور نیکوٹیانا ایڈورڈونی (تمباکو رگ کلیئرنگ وائرس) کے جینوم میں متعدی کالیموویریڈی ای وی ای کی اطلاع ملی ہے۔ حوالہ جات بیرونی روابط آئی سی ٹی وی رپورٹ: کالیموویریڈی وائرل پلانٹ پیتھوجینز اور بیماریاں وائرس خاندان اورٹر وائرلز