Poxviridae
پوکس وائریڈی ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے وائرس کا ایک خاندان ہے۔ ورٹیبریٹس اور آرتھروپوڈز قدرتی میزبان کے طور پر کام کرتے ہیں۔ اس خاندان میں فی الحال 83 انواع ہیں، جو 22 نسلوں میں منقسم ہیں، جو دو ذیلی خاندانوں میں منقسم ہیں۔ اس خاندان سے وابستہ بیماریوں میں چیچک شامل ہے۔ پوکس وائرس کی چار نسلیں انسانوں کو متاثر کر سکتی ہیں: آرتھوپوکس وائرس، پیراپوکس وائرس، یاٹاپوکس وائرس، مولسکیپوکس وائرس۔ آرتھوپوکس وائرس: چیچک وائرس (ویریولا)، ویکسینیا وائرس، کاؤ پوکس وائرس، منکی پوکس وائرس ؛ پیراپوکس وائرس: او آر ایف وائرس، سیوڈوکوپوکس، بووائن پیپلر اسٹومائٹس وائرس ؛ یاٹاپوکس وائرس: ٹیناپوکس وائرس، یابا منکی ٹیومر وائرس ؛ مولسکیپوکس وائرس: مولسکم کانٹیگیوسم وائرس (ایم سی وی)۔ سب سے زیادہ عام ویکسینیا (برصغیر پاک و ہند میں دیکھا گیا) اور مولسکم کانٹیگیوسم ہیں، لیکن منکی پوکس کے انفیکشن بڑھ رہے ہیں (مغربی اور وسطی افریقی برساتی جنگلاتی ممالک میں دیکھا گیا)۔ اسی طرح سے نامزد بیماری چکن پوکس ایک حقیقی پوکس وائرس نہیں ہے اور یہ ہرپس وائرس ویریلا زسٹر کی وجہ سے ہوتی ہے۔ اس خاندان کا نام، پوکس وائریڈی، جلد پر پوکس پیدا کرنے والی بیماریوں سے وابستہ وائرس کی اصل گروہ بندی کی میراث ہے۔ وائرل کی جدید درجہ بندی فینوٹائپک خصوصیات پر مبنی ہے۔ مورفولوجی، نیوکلک ایسڈ کی قسم، نقل کا طریقہ، میزبان حیاتیات، اور ان کی وجہ سے ہونے والی بیماری کی قسم۔ چیچک کا وائرس خاندان کا سب سے قابل ذکر رکن ہے۔ پوکس وائرس، خاص طور پر چیچک کی وجہ سے ہونے والی بیماریاں صدیوں سے جانی جاتی ہیں۔ ابتدائی مشتبہ کیسوں میں سے ایک مصری فرعون رمسیس پنجم کا ہے جس کے بارے میں خیال کیا جاتا ہے کہ وہ تقریبا 1150 سال قبل مسیح میں چیچک سے مر گیا تھا۔ خیال کیا جاتا تھا کہ چیچک 8 ویں صدی کے اوائل میں یورپ اور پھر 16 ویں صدی کے اوائل میں امریکہ منتقل ہوئی تھی، جس کے نتیجے میں تعارف کے دو سالوں کے اندر 32 لاکھ ایزٹیک کی اموات ہوئیں۔ مرنے والوں کی اس تعداد کی وجہ مقامی آبادی میں ہزاروں سالوں سے وائرس کی مکمل کمی کو قرار دیا جا سکتا ہے۔ ایڈورڈ جینر کے یہ ظاہر کرنے کے ایک صدی بعد کہ کم طاقتور کاؤ پوکس کو زیادہ مہلک چیچک کے خلاف مؤثر طریقے سے ٹیکہ لگانے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے، دنیا بھر میں چیچک کے خلاف ہر ایک کو ٹیکہ لگانے کی کوشش دنیا کو طاعون جیسی وبا سے نجات دلانے کے حتمی مقصد کے ساتھ شروع ہوئی۔ مقامی چیچک کا آخری کیس 1977 میں صومالیہ میں پیش آیا تھا۔ دو سالوں میں کی گئی وسیع تلاشی میں مزید کوئی کیس نہیں ملا، اور 1979 میں عالمی ادارہ صحت (ڈبلیو ایچ او) نے اس بیماری کو باضابطہ طور پر ختم کرنے کا اعلان کیا۔ 1986 میں، وائرس کے تمام نمونوں کو تباہ کر دیا گیا یا ڈبلیو ایچ او کی دو منظور شدہ حوالہ لیبز میں منتقل کر دیا گیا: فیڈرل سینٹرز فار ڈیزیز کنٹرول اینڈ پریوینشن (سی ڈی سی) کے صدر دفاتر میں۔ اٹلانٹا، جارجیا (ریاستہائے متحدہ) اور ماسکو میں انسٹی ٹیوٹ آف وائرس پریپریشنز میں۔ 11 ستمبر 2001 کے بعد امریکی اور برطانیہ کی حکومتوں نے حیاتیاتی دہشت گردی میں چیچک، یا چیچک جیسی بیماری کے استعمال پر تشویش میں اضافہ کر دیا ہے۔ تاہم، ویکسینیا وائرس، میکسوما وائرس، ٹیناپوکس وائرس اور ریکون پوکس وائرس سمیت کئی پوکس وائرس کی فی الحال پری کلینیکل اور کلینیکل مطالعات میں مختلف انسانی کینسروں میں ان کی علاج کی صلاحیت کے لیے تحقیقات کی جا رہی ہیں۔ مائکروبیولوجی ساخت پوکسویریڈی وائرل ذرات (وائریون) عام طور پر ڈھکے ہوتے ہیں (بیرونی ڈھکے ہوئے وائریون)، حالانکہ وائرس کی انٹرا سیلولر بالغ وائریون شکل، جس میں مختلف لفافے ہوتے ہیں، بھی متعدی ہے۔ وہ انواع کے لحاظ سے اپنی شکل میں مختلف ہوتے ہیں لیکن عام طور پر اینٹوں کی طرح یا گول اینٹوں کی طرح انڈاکار شکل کے طور پر ہوتے ہیں کیونکہ وہ اینڈوپلاسمک ریٹیکولم سے لپٹے ہوتے ہیں۔ وائریون غیر معمولی طور پر بڑا ہوتا ہے، اس کا سائز تقریبا 200 این ایم قطر اور 300 این ایم لمبائی کا ہوتا ہے اور اس کا جینوم ڈی این اے کے ایک واحد، لکیری، ڈبل اسٹرینڈڈ حصے میں ہوتا ہے۔ اس کے مقابلے میں، رائنوائرس 1/10 اتنے بڑے ہوتے ہیں جتنے کہ ایک عام پوکس وائریڈی وائرین ہوتے ہیں۔ 26 مختلف کورڈوپوکس وائرس جینوموں کے جینوم فائیلوجنیٹک تجزیے سے پتہ چلا ہے کہ جینوم کا مرکزی علاقہ محفوظ ہے اور اس میں 90 جین ہوتے ہیں۔ اس کے برعکس ٹرمینی پرجاتیوں کے درمیان محفوظ نہیں ہیں۔ اس گروپ میں ایویپوکس وائرس سب سے زیادہ مختلف ہے۔ اگلا سب سے زیادہ متفرق مولسکیپوکس وائرس ہے۔ کیپرپوکس وائرس، لیپوریپوکس وائرس، سویپوکس وائرس اور یاٹاپوکس وائرس جنرا کلسٹر ایک ساتھ: کیپرپوکس وائرس اور سویپوکس وائرس ایک مشترکہ آباؤ اجداد کا اشتراک کرتے ہیں اور آرتھوپوکس وائرس جینس سے الگ ہیں۔ اوتھوپوکس وائرس جینس کے اندر کاؤپوکس وائرس کا تناؤ برائٹن ریڈ، ایکٹرومیلیا وائرس اور منکی پوکس وائرس کسی دوسرے رکن کے ساتھ قریب سے گروہ بند نہیں ہوتے ہیں۔ ویریولا وائرس اور کیمل پوکس وائرس ایک ذیلی گروہ بناتے ہیں۔ ویکسینیا وائرس کا سب سے زیادہ تعلق سی پی وی-جی آر آئی-90 سے ہے۔ خاندان کے رکن کے جینوم کا جی سی مواد کافی مختلف ہوتا ہے۔ ایویپوکس وائرس، کیپریپوکس وائرس، سروائڈپوکس وائرس، آرتھوپوکس وائرس، سویپوکس وائرس، یاٹاپوکس وائرس اور ایک اینٹوموپوکس جینس (بیٹا اینٹوموپوکس وائرس) کے ساتھ ساتھ کئی دیگر غیر درجہ بند اینٹوموپوکس وائرس میں جی + سی کا مواد کم ہوتا ہے جبکہ دیگر-مولوسیپوکس وائرس، آرتھوپوکس وائرس، پیراپوکس وائرس اور کچھ غیر درجہ بند کورڈوپوکس وائرس-میں نسبتا زیادہ جی + سی مواد ہوتا ہے۔ ان اختلافات کی وجوہات معلوم نہیں ہیں۔ پوکس وائرس کی نقل میں کئی مراحل شامل ہوتے ہیں۔ وائرس سب سے پہلے میزبان خلیے کی سطح پر ایک رسیپٹر سے جڑا ہوتا ہے۔ پوکس وائرس کے رسیپٹرز کے بارے میں خیال کیا جاتا ہے کہ وہ گلائکوسامینوگلیکنز ہیں۔ رسیپٹر سے جڑے رہنے کے بعد، وائرس اس خلیے میں داخل ہوتا ہے جہاں یہ کھولا جاتا ہے۔ وائرس کا کھوج لگانا دو مراحل پر مشتمل عمل ہے۔ سب سے پہلے جب ذرہ خلیے میں داخل ہوتا ہے تو بیرونی جھلی کو ہٹا دیا جاتا ہے ؛ دوسرا وائرس کا ذرہ (بیرونی جھلی کے بغیر) خلیے کی جھلی کے ساتھ فیوز ہو کر کور کو سائٹوپلازم میں چھوڑ دیتا ہے۔ پوکس وائرل جین کا اظہار دو مراحل میں کیا جاتا ہے۔ ابتدائی جین غیر ساختی پروٹین کو انکوڈ کرتے ہیں، بشمول وائرل جینوم کی نقل کے لیے ضروری پروٹین، اور جینوم کی نقل سے پہلے ظاہر کیے جاتے ہیں۔ دیر سے جین کا اظہار جینوم کی نقل کے بعد کیا جاتا ہے اور وائرس کا ذرہ بنانے کے لیے ساختی پروٹین کو انکوڈ کیا جاتا ہے۔ وائرس کے ذرہ کی اسمبلی پختگی کے پانچ مراحل میں ہوتی ہے جو نئے ڈھکے ہوئے وائرین کے حتمی ایکسوائٹوسس کا باعث بنتی ہے۔ جینوم کی نقل تیار ہونے کے بعد، نامکمل وائرین A5 پروٹین کو جمع کر کے انٹرا سیلولر بالغ وائرین بناتا ہے۔ پروٹین سیدھا ہوتا ہے اور انٹرا سیلولر ڈھکے ہوئے وائرین کا اینٹوں کی شکل کا لفافہ ہوتا ہے۔ اس کے بعد ان ذرات کو سیل پلازما میں جوڑ کر سیل سے وابستہ ڈھکے ہوئے وائرین کی تشکیل کی جاتی ہے، جو مائیکرو ٹیوبلز کا سامنا کرتا ہے اور ایک ماورائے سیلولر ڈھکے ہوئے وائرین کے طور پر سیل سے باہر نکلنے کے لیے تیار ہوتا ہے۔ وائرس کے ذرہ کی اسمبلی خلیے کے سائٹوپلازم میں ہوتی ہے اور یہ ایک پیچیدہ عمل ہے جس پر فی الحال تحقیق کی جا رہی ہے تاکہ ہر مرحلے کو مزید گہرائی میں سمجھا جا سکے۔ اس حقیقت کو مدنظر رکھتے ہوئے کہ یہ وائرس بڑا اور پیچیدہ ہے، نقل نسبتا تیز ہوتی ہے جس میں تقریبا 12 گھنٹے لگتے ہیں جب تک کہ میزبان خلیہ وائرس کی رہائی سے مر نہ جائے۔ ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے جینوم والے وائرس کے لیے پوکس وائرس کی نقل غیر معمولی ہے کیونکہ یہ سائٹوپلازم میں ہوتا ہے، حالانکہ یہ دوسرے بڑے ڈی این اے وائرس کی خصوصیت ہے۔ پوکس وائرس جینوم ٹرانسکرپشن کے لیے اپنی مشینری کو انکوڈ کرتا ہے، ایک ڈی این اے پر منحصر آر این اے پولیمریز، جو سائٹوپلازم میں نقل کو ممکن بناتا ہے۔ زیادہ تر ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے وائرس کو ٹرانسکرپشن انجام دینے کے لیے میزبان خلیے کے ڈی این اے پر منحصر آر این اے پولیمریز کی ضرورت ہوتی ہے۔ یہ میزبان پولیمریزس نیوکلئس میں پائے جاتے ہیں، اور اس لیے زیادہ تر ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے وائرس میزبان خلیے کے نیوکلئس کے اندر اپنے انفیکشن سائیکل کا ایک حصہ انجام دیتے ہیں۔ ارتقاء پوکس وائرس کے آباؤ اجداد کا پتہ نہیں ہے لیکن ساختی مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ یہ ایک اڈینو وائرس یا پوکس وائرس اور اڈینو وائرس دونوں سے متعلق ایک نوع ہو سکتی ہے۔ جینوم تنظیم اور ڈی این اے کی نقل کے طریقہ کار کی بنیاد پر روڈیوائرس (روڈیوریڈی) اور بڑے یوکیریل ڈی این اے وائرس کے درمیان ایک فائیلوجنیٹک تعلقات موجود ہو سکتے ہیں: افریقی سوائن بخار وائرس (اسفارویریڈی)، کلوریلا وائرس (فائیکوڈنوائریڈی) اور پوکس وائرس (پوکسویریڈی)۔ پوکس وائرس جینوم میں تغیر کی شرح کا تخمینہ 0.9-1.2 x 10−6 فی سائٹ فی سال لگایا گیا ہے۔ دوسرا تخمینہ اس شرح کو 0.5-7 × 10−6 نیوکلیوٹائڈ متبادل فی سائٹ فی سال پر رکھتا ہے۔ تیسرا تخمینہ شرح کو 4-6 × 10−6 پر رکھتا ہے۔ موجودہ پوکس وائرس کا آخری عام آباؤ اجداد جو ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں کو متاثر کرتا ہے موجود تھا۔ جینس ایویپوکس وائرس 249 ± 69 ہزار سال پہلے آباؤ اجداد سے الگ ہوا۔ آرتھوپوکس وائرس کی نسل کا آباؤ اجداد دوسرے کلڈس سے الگ ہونے کے قریب تھا۔ اس انحراف کے وقت کا دوسرا تخمینہ اس واقعے کو 166,000 ± 43,000 سال پہلے کا بتاتا ہے۔ آرتھوپوکس وائرس کی موجودہ نسل میں تقسیم 14,000 سال پہلے ہوئی تھی۔ جینس لیپوریپوکس وائرس ~ 137,000 ± 35,000 سال پہلے الگ ہو گیا۔ اس کے بعد یاٹاپوکس وائرس جینس کا آباؤ اجداد آیا۔ کیپرپوکس وائرس اور سویپوکس وائرس کا آخری مشترکہ آباؤ اجداد 111,000 ± 29,000 سال پہلے الگ ہو گیا۔ مچھلی سے الگ تھلگ-سالمن گل پوکس وائرس-کورڈوپوکس وائرینے کی ابتدائی شاخ معلوم ہوتی ہے۔ برلن، جرمنی میں ایک نئے گلہری پوکس وائرس کے نتائج کے بعد حال ہی میں ایک نیا نظام تجویز کیا گیا ہے۔ چیچک چیچک کے ظہور کی تاریخ طے نہیں کی گئی ہے۔ یہ ممکنہ طور پر 68,000 اور 16,000 سال پہلے کے درمیان چوہے کے وائرس سے تیار ہوا تھا۔ تاریخوں کی وسیع رینج سالماتی گھڑی کو انشانکن کرنے کے لیے استعمال ہونے والے مختلف ریکارڈوں کی وجہ سے ہے۔ ایک کلاڈ ویریولا میجر اسٹرین (چیچک کی طبی لحاظ سے زیادہ شدید شکل) تھی جو 400 سے 1,600 سال پہلے ایشیا سے پھیل گئی تھی۔ دوسرے کلاڈ میں امریکی براعظموں سے بیان کردہ الاسٹرم مائنر (ایک فینوٹائپک طور پر ہلکا چیچک) اور مغربی افریقہ سے الگ تھلگ دونوں شامل تھے جو موجودہ سے 1,400 اور 6,300 سال پہلے کے آبائی تناؤ سے الگ ہو گئے تھے۔ یہ کلاڈ کم از کم 800 سال پہلے دو ذیلی کلاڈوں میں مزید الگ ہو گیا۔ دوسرے تخمینے میں ٹیٹراپوکس سے ویریولا کی علیحدگی کو 3000-4000 سال پہلے رکھا گیا ہے۔ یہ انسانی بیماری کے طور پر چیچک کی ظاہری شکل کے حوالے سے آثار قدیمہ اور تاریخی شواہد سے مطابقت رکھتا ہے جو نسبتا حالیہ اصل کی نشاندہی کرتا ہے۔ تاہم، اگر اتپریورتن کی شرح ہرپیسوائرس سے ملتی جلتی سمجھی جائے تو ٹیٹراپوکس سے ویریولا کے درمیان انحراف کی تاریخ کا تخمینہ 50,000 سال پہلے لگایا گیا ہے۔ اگرچہ یہ دیگر شائع شدہ تخمینوں سے مطابقت رکھتا ہے لیکن اس سے پتہ چلتا ہے کہ آثار قدیمہ اور تاریخی ثبوت بہت نامکمل ہیں۔ ان وائرسوں میں تغیر کی شرح کے بہتر تخمینے کی ضرورت ہے۔ درجہ بندی ذیلی خاندان کورڈوپوکس وائرینے کی انواع ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں کو متاثر کرتی ہیں اور ذیلی خاندان اینٹوموپوکس وائرینے کی انواع کیڑوں کو متاثر کرتی ہیں۔ کورڈوپوکس وائرینے میں دس تسلیم شدہ نسلیں ہیں اور تین اینٹوموپوکس وائرینے میں ہیں۔ مندرجہ ذیل ذیلی خاندانوں اور نسلوں کو پہچانا جاتا ہے (-وائرینا ذیلی خاندان کی نشاندہی کرتا ہے اور-وائرس جینس کی نشاندہی کرتا ہے): کورڈوپوکس وائرینا ایویپوکس وائرس کیپریپوکس وائرس سینٹپوکس وائرس سروئڈپوکس وائرس میکروپوکس وائرس مولسکیپوکس وائرس مسٹلپوکس وائرس آرتھوپوکس وائرس اوریزوپوکس وائرس پیراپوکس وائرس ٹیروپوکس وائرس سالمونپوکس وائرس سکوریپوکس وائرس سویپوکس وائرس ویسپیرٹیلینپوکس وائرس یاٹاپوکس وائرس اینٹوموپوکس وائرینا الفاپوکس وائرس بیٹا 2012 کا کوٹیا وائرس ایک غیر معمولی کورڈوپوکس وائرس ہے جس کا تعلق کسی نئی نسل سے ہو سکتا ہے۔ کوٹیا وائرس کو 2019 میں نئی جینس اوریزوپوکس وائرس تفویض کیا گیا تھا۔ 2019 میں دریافت ہونے والا برازیل کا پورکیوپینپاکس وائرس کا اس وائرس سے گہرا تعلق ہے۔ دو مزید کورڈوپوکس وائرس NY _ 044 اور مرمینسک پاکسوائرس ہیں۔ ان کا "یوکا پوکس وائرس" سے گہرا تعلق سمجھا جاتا ہے۔ آئی سی ٹی وی انہیں 2016 میں بنائے گئے سینٹاپوکس وائرس کی نسل کے تحت درجہ بندی کرتا ہے۔ ویکسینیا وائرس پروٹو ٹائپکل پوکس وائرس ویکسینیا وائرس ہے، جو چیچک کے خاتمے میں اپنے کردار کے لیے جانا جاتا ہے۔ ویکسینیا وائرس غیر ملکی پروٹین کے اظہار کے لیے ایک موثر ذریعہ ہے، کیونکہ یہ ایک مضبوط میزبان مدافعتی ردعمل ظاہر کرتا ہے۔ ویکسینیا وائرس بنیادی طور پر سیل فیوژن کے ذریعے خلیوں میں داخل ہوتا ہے، حالانکہ فی الحال ذمہ دار رسیپٹر نامعلوم ہے۔ ویکسینیا جین کی تین کلاسوں پر مشتمل ہے: ابتدائی، درمیانی اور دیر سے۔ یہ جین وائرل آر این اے پولیمریز اور متعلقہ نقل کے عوامل کے ذریعے نقل کیے جاتے ہیں۔ ویکسینیا متاثرہ خلیوں کے سائٹوپلازم میں اپنے جینوم کی نقل تیار کرتا ہے، اور آخری مرحلے کے جین کے اظہار کے بعد وائریون مورفوجینیسیس سے گزرتا ہے، جو ایک لفافے کی جھلی میں موجود انٹرا سیلولر بالغ وائریون تیار کرتا ہے۔ لفافے کی جھلی کی اصل ابھی تک معلوم نہیں ہے۔ انٹرا سیلولر بالغ وائرینز کو پھر گولگی اپریٹس میں منتقل کیا جاتا ہے جہاں اسے اضافی دو جھلیوں سے لپیٹا جاتا ہے، جو انٹرا سیلولر لفافے والا وائرس بن جاتا ہے۔ یہ خلیے کے دائرے تک پہنچنے کے لیے سائٹوسکیلیٹل مائکرو ٹیوبلز کے ساتھ منتقل کیا جاتا ہے، جہاں یہ پلازما جھلی کے ساتھ مل کر خلیے سے وابستہ ڈھکا ہوا وائرس بن جاتا ہے۔ یہ خلیے کی سطحوں پر ایکٹین دم کو متحرک کرتا ہے یا بیرونی ڈھکے ہوئے وائرین کے طور پر جاری کیا جاتا ہے۔ کوکاپوکس وائرس واٹر وارٹس حوالہ جات بیرونی روابط آرتھوپوکس وائرس اور پیراپوکس وائرس جنرا کے الیکٹران مائیکرو گراف، بشمول چیچک وائرس، کو انٹرنیشنل کمیٹی آن ٹیکسونومی آف وائرسز نے اپنی پوکسویریڈی پکچر گیلری میں جمع کیا ہے۔ این سی بی آئی ٹیکسونومی پیج۔ وائرل بائیو انفارمیٹکس ریسورس سینٹر میں پوکسویریڈی۔ وائرل زون: پوکس وائریڈی آئی سی ٹی وی وائرس پیتھوجین ڈیٹا بیس اینڈ اینالیسس ریسورس (وی آئی پی آر): پوکس وائریڈی وائرس خاندان