Coliform bacteria
کولیفارم بیکٹیریا کی تعریف یا تو متحرک یا غیر متحرک گرام منفی غیر بیج بنانے والے بیسلی کے طور پر کی جاتی ہے جس میں 35-37 °C کے زیادہ سے زیادہ نمو کے درجہ حرارت کے تحت ایسڈ اور گیسیں پیدا کرنے کے لیے β-galactosidase ہوتا ہے۔ وہ ایروبس یا فیکلٹیٹو ایروبس ہو سکتے ہیں، اور کھانے، دودھ اور پانی کے کم سینیٹری معیار کا عام طور پر استعمال ہونے والا اشارہ ہیں۔ کولیفارم آبی ماحول، مٹی اور پودوں پر پائے جا سکتے ہیں۔ وہ عالمی سطح پر گرم خون والے جانوروں کے پاخانہ میں بڑی تعداد میں موجود ہیں کیونکہ وہ معدے کے نظام میں رہنے کے لیے جانے جاتے ہیں۔ اگرچہ کولیفارم بیکٹیریا عام طور پر سنگین بیماری کی وجوہات نہیں ہوتے ہیں، لیکن ان کو کلچر کرنا آسان ہوتا ہے، اور ان کی موجودگی کا استعمال یہ اندازہ لگانے کے لیے کیا جاتا ہے کہ فضلہ سے پیدا ہونے والے دیگر روگجنک حیاتیات نمونے میں موجود ہو سکتے ہیں، یا یہ کہ نمونہ استعمال کرنا محفوظ نہیں ہے۔ اس طرح کے پیتھوجینز میں بیماری پیدا کرنے والے بیکٹیریا، وائرس، یا پروٹوزوا اور بہت سے ملٹی سیلولر پرجیویوں شامل ہیں۔ عام عام نسلوں میں شامل ہیں: سائٹروبیکٹر لمبائی میں 0.6-6 μm کے درمیان پیریٹریکس فیکلٹیٹو اینیروبک بیسلی ہیں۔ سائٹروبیکٹر پرجاتیوں کو نقصان پہنچائے بغیر آنتوں کے نباتات میں آباد کیا جاتا ہے، لیکن اگر انہیں موقع دیا جائے تو وہ پیشاب کی نالی کے انفیکشن، بیکٹیریمیا، دماغی پھوڑے، نمونیا، پیٹ کے اندر سیپسس، مینینجائٹس اور جوڑوں کے انفیکشن کا باعث بن سکتے ہیں۔ سائٹروبیکٹر پرجاتیوں کے انفیکشن کی شرح اموات 33-48% کے درمیان ہوتی ہے، جس میں نوزائیدہ بچے اور امیونوکمپروائزڈ افراد زیادہ حساس ہوتے ہیں۔ اینٹروبیکٹر متحرک، فلیجیلیٹڈ بیسلی ہیں جو بیکٹیریمیا، سانس کی نالی کے انفیکشن، پیشاب کی نالی کے انفیکشن، ان علاقوں کے انفیکشن جہاں سرجری ہوئی ہے، اور انتہائی معاملات میں مینینجائٹس، سینوسائٹس اور آسٹیومیلائٹس جیسے انفیکشن کا سبب بنتی ہیں۔ نمونے میں اینٹروبیکٹر کی موجودگی کا تعین کرنے کے لیے، انہیں سب سے پہلے میک کونکی اگر پر اگایا جاتا ہے تاکہ اس بات کی تصدیق کی جا سکے کہ وہ لییکٹوز خمیر کر رہے ہیں۔ انڈول ٹیسٹ اینٹروبیکٹر کو ایسچریچیا سے الگ کرے گا، کیونکہ اینٹروبیکٹر انڈول منفی اور ایسچریچیا مثبت ہے۔ اینٹروبیکٹر کو حرکت پذیری میں فرق کی وجہ سے کلیبیلا سے ممتاز کیا جاتا ہے۔ کلیبسیلا غیر متحرک، گرام منفی بیسیلی ہیں جن کی لمبائی 1 سے 2 مائیکرو میٹر تک ہوتی ہے۔ وہ فیکلٹیٹو اینیروبس ہیں جن میں ایک کیپسول ہوتا ہے جو پیچیدہ ایسڈ پولیسیکرائڈز پر مشتمل ہوتا ہے جو انہیں کئی مہینوں تک خشک ہونے کا مقابلہ کرنے کی اجازت دیتا ہے۔ کلبیسیلا نمونیا کلبیسیلا کی سب سے عام نوع ہے جو انسانوں، جانوروں کے معدے کے راستوں، سیوریج اور مٹی میں پائی جاتی ہے۔ کاربوہائیڈریٹ سے بھرپور میڈیا پر، کلبیسیلا کالونیاں میوکوسل بیرونی سطح کے ساتھ سرمئی سفید رنگ کی دکھائی دیتی ہیں۔ مخلوط نمونے میں کلبیسیلا پرجاتیوں کے انتخاب کے لیے استعمال ہونے والا میڈیا ایک اگر ہے جس میں آرنیتھائن، رافینوز اور کوزر سائٹریٹ شامل ہیں، جہاں اس نسل کے ارکان پیلے رنگ کی، گیلی نظر آنے والی کالونیاں بنائیں گے۔ Escherichia پرجاتیوں عام طور پر انسانی آنت اور دیگر گرم خون والے جانوروں میں رہتے ہیں، اور انسانوں میں بیماری پیدا کرنے کے لیے سب سے زیادہ ذمہ دار ہیں۔ ای کولی خاص طور پر انسانی آنت میں دیکھا جانے والا سب سے عام جاندار ہے اور انسانوں میں مختلف قسم کی بیماریوں کا سبب بنتا ہے۔ زیادہ تر ای کولی تناؤ متحرک ہوتے ہیں اور انہوں نے افقی جین کی منتقلی سے اپنی بہت سی وائرل خصوصیات حاصل کی ہیں۔ گیسٹرو انٹیسٹینل سنڈروم کا سبب بننے والی ای کولی کی کئی مختلف اقسام ہیں: ڈائریاجینک ای کولی (ڈی ای سی)، اینٹروٹاکسیجینک ای کولی (ای ٹی ای سی) ؛ ای پی ای سی ؛ شیگا ٹاکسن پیدا کرنے والی ای۔ کولی (ایس ٹی ای سی)، جس میں ای ایچ ای سی ؛ اینٹرو ایگریگیٹو ای کولی (ای اے ای سی) ؛ اور اینٹرو انویسیو ای کولی (ای آئی ای سی) شامل ہیں۔ ای کولی کی شناخت کرنے کے مختلف طریقے ہیں جو ان کے خلیے کی سطح پر او، ایچ اور کے پولیسیکرائڈز کی تغیر کی بنیاد پر یا منتخب میڈیا کا استعمال کرتے ہوئے ہوتے ہیں۔ ایسچریچیا کولی (ای کولی) کو زیادہ تر دیگر کولیفارم سے اس کی فیکل کولیفارم ٹیسٹ میں 44 ڈگری سیلسیس پر لییکٹوز کو خمیر کرنے کی صلاحیت، اور بعض قسم کے کلچر میڈیا پر اس کی نشوونما اور رنگ کے رد عمل سے ممتاز کیا جا سکتا ہے۔ جب ایک ایوسین میتھلین بلیو (ای ایم بی) پلیٹ پر کلچر کیا جاتا ہے، تو ای کولی کے لیے ایک مثبت نتیجہ گہرے جامنی میڈیم پر دھاتی سبز کالونیاں ہوتی ہیں۔ 24 گھنٹے کی انکیوبیشن مدت کے بعد نیلی یا سبز کالونیوں کے طور پر ظاہر ہونے کے لیے ٹرپٹون بائل ایکس-گلوکورونائڈ (ٹی بی ایکس) پر بھی کلچر کیا جا سکتا ہے۔ ایسچریچیا کولی کی انکیوبیشن مدت 12-72 گھنٹے ہوتی ہے جس میں زیادہ سے زیادہ نمو کا درجہ حرارت 37 ڈگری سیلسیس ہوتا ہے۔ عام کولیفارم گروپ کے برعکس، ای کولی تقریبا خصوصی طور پر فضلہ کی اصل کا ہے اور اس طرح ان کی موجودگی فضلہ کی آلودگی کی ایک موثر تصدیق ہے۔ ای کولی کے زیادہ تر تناؤ بے ضرر ہوتے ہیں، لیکن کچھ انسانوں میں سنگین بیماری کا سبب بن سکتے ہیں۔ انفیکشن کی علامات اور علامات میں خون دار اسہال، پیٹ میں درد، الٹی اور کبھی کبھار بخار شامل ہیں۔ یہ بیکٹیریا نمونیا، سانس کی دیگر بیماریوں اور پیشاب کی نالی کے انفیکشن کا سبب بھی بن سکتے ہیں۔ مختلف قسم کے کولیفارم بیکٹیریا کے درمیان فرق کرنے کا ایک آسان طریقہ ایوسین میتھیلین بلیو اگر پلیٹ کا استعمال کرنا ہے۔ یہ پلیٹ گرام (+) بیکٹیریا کو جزوی طور پر روکتی ہے، اور لییکٹوز خمیر کی صلاحیتوں کی بنیاد پر گرام (-) بیکٹیریل کالونیوں میں رنگ کی تبدیلی پیدا کرے گی۔ مضبوط لییکٹوز خمیر گہرے نیلے/جامنی/سیاہ کے طور پر ظاہر ہوں گے، اور E.coli (جو لییکٹوز کو بھی خمیر کرتا ہے) کالونیاں گہرے رنگ کی ہوں گی، لیکن اس میں دھاتی سبز چمک بھی نظر آئے گی۔ دیگر کولیفارم بیکٹیریا موٹی، پتلی کالونیوں کے طور پر ظاہر ہوں گے، جن میں غیر خمیر بے رنگ ہوتے ہیں، اور کمزور خمیر گلابی ہوتے ہیں۔ کولیفارم پھیلنے کے واقعات Escherichia coli O157 15 نومبر 2021 تک، امریکہ کی سات ریاستوں نے ای کولی O157: H7 تناؤ سے ہونے والی بیماریوں کے دس واقعات کا اعلان کیا۔ یہ معاملات 15 اکتوبر 2021 سے 27 اکتوبر 2021 تک رپورٹ ہوئے اور مینیسوٹا ڈیپارٹمنٹ آف ایگریکلچر اور ایف ڈی اے نے تحقیقات کی۔ یہ نتیجہ اخذ کیا گیا کہ متاثرہ لوگوں کے گھروں سے جمع کیے گئے پالک کے پیکٹ ای کولی کے تناؤ سے آلودہ تھے جو بیماری پیدا کرنے والے تناؤ سے ملتے جلتے تھے۔ اس کا تعین پالک سے نکالے گئے تناؤ پر پورے جینوم کی ترتیب انجام دے کر اور اس کا موازنہ متاثرہ افراد سے لیے گئے تناؤ سے کر کے کیا گیا۔ 7 فروری 2022 تک، کینیڈا میں البرٹا اور ساسکچیوان کے صوبوں نے ای کولی او 157 تناؤ کی بیماریوں کے اجتماعی طور پر تصدیق شدہ چودہ کیسوں کی اطلاع دی۔ یہ دسمبر 2021 اور جنوری 2022 کے درمیان رپورٹ کیے گئے تھے، اور پبلک ہیلتھ ایجنسی آف کینیڈا (پی ایچ اے سی)، کینیڈین فوڈ انسپیکشن ایجنسی (سی ایف آئی اے)، اور ہیلتھ کینیڈا اصل کمچی کے ایک مخصوص برانڈ کا تعین کرنے میں کامیاب رہے جو کہ حیاتیات کا منبع ہے۔ 28 جنوری 2022 اور 6 فروری 2022 کو سی ایف آئی اے نے ہینکوک اوریجنل کمچی پر ایک یاد دہانی جاری کی۔ پینے کے پانی میں کولیفارم بیکٹیریا کا پتہ لگانا پی سی آر بیٹا گیلیکٹوسیڈیز جین کو بڑھانا عام طور پر کولیفارم کا پتہ لگانے کے لیے استعمال کیا جاتا ہے، کیونکہ تمام کولیفارم جاندار یہ مرکب تیار کرتے ہیں۔ بیٹا-ڈی گلوکوورونیڈیز کی وسعت کا استعمال ای کولی کا پتہ لگانے کے لیے کیا جاتا ہے، یا ویروٹاکسن پیدا کرنے والے ای کولی کا پتہ لگانے کے لیے ان کے ویروٹاکسن جین (جینز) کی توسیع۔ کیمیلومینسینٹ ان سیٹو ہائبرڈائزیشن اینٹروبیکٹیریاسی جینس میں 16 ایس آر آر این اے کے مخصوص علاقے اولیگونیوکلیوٹائڈ تحقیقات سے جڑے ہوئے ہیں، جو پینے کے پانی کے معیار کی نگرانی میں مدد کرتے ہیں۔ خاص طور پر، ای کولی کو سویابین پیرو آکسیڈیز-لیبلڈ پیپٹائڈ نیوکلک ایسڈ (پی این اے) تحقیقات کے ساتھ لیبل کیا جاتا ہے جو ان کے 16 ایس آر آر این اے میں ایک مخصوص ترتیب سے جڑے ہوتے ہیں۔ جب کیمیلومینسینٹ سبسٹریٹ کے ساتھ مل کر استعمال کیا جاتا ہے، تو روشنی پیدا ہوتی ہے جہاں ای کولی کی ہر کالونی واقع ہوتی ہے، جس سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ وہ نمونے میں موجود ہیں۔ وایلیٹ ریڈ بائل اگر ٹھوس میڈیم لییکٹوز خمیر کرنے والے کولیفارم کو اگانے کے لیے استعمال ہوتا ہے اور غیر جانبدار سرخ پی ایچ اشارے کا استعمال کرتا ہے۔ گلابی کالونیاں اس وقت ظاہر ہوتی ہیں جب لییکٹوز کو خمیر کیا جاتا ہے اور وہ پت سے گھرا ہوا ہوتا ہے جو باہر نکل گیا ہوتا ہے۔ اس بات کی تصدیق کرنے کے لیے کہ آیا یہ کالونیاں کولیفارم ہیں، انہیں شاندار سبز لییکٹوز پت (بی جی ایل بی) میں منتقل کیا جاتا ہے اور انکیوبیٹ کیا جاتا ہے۔ اگر انکیوبیشن کے بعد گیس نظر آتی ہے تو اس بات کی تصدیق کی جا سکتی ہے کہ نمونے میں کولیفارم موجود تھے۔ میمبرین فلٹر طریقہ ٹیسٹ کے نمونوں کو معیاری فلٹر پیپر کے ذریعے فلٹر کیا جاتا ہے اور پھر انہیں ایم-اینڈو یا ایل ای ایس اینڈو اگر میڈیم میں منتقل کیا جاتا ہے۔ کالونیاں انکیوبیشن کے 22-24 گھنٹوں کے بعد سبز دھاتی چمک کے ساتھ گلابی سرخ دکھائی دیتی ہیں۔ ان کالونیوں کی کولیفارم کے طور پر تصدیق کی جا سکتی ہے اگر انہیں لاورل ٹرپٹوز (ایل ایس ٹی) میں ٹیکہ لگایا جائے، گیس پیدا کی جائے، اور پھر بی جی ایل بی میں ٹیکہ لگایا جائے۔ اگر بی جی ایل بی ٹیوبوں میں گیس کی پیداوار ہوتی ہے، تو کولیفارم بیکٹیریا کی موجودگی کے لیے ٹیسٹ مثبت ہے۔ یہ بھی دیکھیں بیکٹیریا سے متعلق پانی کا تجزیہ کولفارم انڈیکس فیکل کولفارم انڈیکیٹر بیکٹیریا پیتھوجینک ایسچریچیا کولی حوالہ جات بیکٹیریا خوراک سے پیدا ہونے والی بیماریاں پانی کے معیار کے اشارے