Epigenome
ایک ایپیجینوم کسی جاندار کے ڈی این اے اور ہسٹون پروٹین میں ہونے والی کیمیائی تبدیلیوں کے ریکارڈ پر مشتمل ہوتا ہے۔ یہ تبدیلیاں ٹرانس جنریشنل اسٹرینڈڈ ایپیجینٹک وراثت کے ذریعے کسی جاندار کی اولاد میں منتقل کی جا سکتی ہیں۔ ایپیجینوم میں تبدیلیوں کے نتیجے میں کرومیٹن کی ساخت میں تبدیلیاں اور جینوم کے کام میں تبدیلیاں آسکتی ہیں۔ ایپیجینوم جین کے اظہار، نشوونما، ٹشو کی تفریق، اور قابل منتقلی عناصر کو دبانے کو منظم کرنے میں شامل ہے۔ بنیادی جینوم کے برعکس، جو کسی فرد کے اندر بڑی حد تک جامد رہتا ہے، ماحولیاتی حالات کے ذریعہ ایپیجینوم کو متحرک طور پر تبدیل کیا جا سکتا ہے۔ کینسر ایپیجینٹکس کینسر کی تحقیق میں فی الحال ایک فعال موضوع ہے۔ انسانی ٹیومر ڈی این اے میتھیلیشن اور ہسٹون ترمیم کے نمونوں کی ایک بڑی رکاوٹ سے گزرتے ہیں۔ کینسر سیل کی غیر معمولی ایپیجینیٹک زمین کی تزئین کی خصوصیت عالمی جینومک ہائپومیتھیلیشن، سی پی جی جزیرے کے پروموٹر ٹیومر سپریسر جینز کی ہائپر میتھیلیشن، اہم جینز کے لیے ایک تبدیل شدہ ہسٹون کوڈ اور مونواسیٹیلیٹڈ اور ٹرائی میتھیلیٹڈ ہسٹون ایچ 4 کا عالمی نقصان ہے۔ ایپیجینوم تحقیقی منصوبے ایک ممکنہ انسانی ایپیجینوم پروجیکٹ کی پیش کش کے طور پر، ہیومن ایپیجینوم پائلٹ پروجیکٹ کا مقصد انسانی جینوم میں میتھیلیشن متغیر پوزیشنوں (ایم وی پیز) کی شناخت اور فہرست بنانا ہے۔ سیکوینسنگ ٹیکنالوجی میں پیش رفت اب متعدد سالماتی طریقوں کے ذریعے جینوم وسیع ایپیجینومک حالتوں کی جانچ کرنے کی اجازت دیتی ہے۔ ایپیجینوم کی تحقیقات کے لیے مائیکرو اور نینو اسکیل آلات بنائے گئے ہیں یا تجویز کیے گئے ہیں۔ حوالہ ایپیجینومز کی جانچ کرنے کی ایک بین الاقوامی کوشش 2010 میں انٹرنیشنل ہیومن ایپیجینوم کنسورشیم (آئی ایچ ای سی) کی شکل میں شروع ہوئی۔ آئی ایچ ای سی ممبران کا مقصد مختلف قسم کے عام اور بیماری سے متعلق انسانی خلیوں کی اقسام سے کم از کم 1,000 حوالہ (بیس لائن) انسانی ایپیجینوم تیار کرنا ہے۔ روڈ میپ ایپیجینومکس پروجیکٹ این آئی ایچ روڈ میپ ایپیجینومکس پروجیکٹ کا ایک مقصد عام، صحت مند افراد سے انسانی حوالہ ایپیجینومز کو سیل لائنوں، بنیادی خلیوں اور بنیادی بافتوں کی ایک بڑی قسم میں پیدا کرنا ہے۔ پروجیکٹ کے ذریعہ تیار کردہ ڈیٹا، جسے ہیومن ایپیجینوم اٹلس سے براؤز اور ڈاؤن لوڈ کیا جا سکتا ہے، پانچ اقسام میں آتا ہے جو ایپیجینوم کے مختلف پہلوؤں اور ایپیجینومک ریاستوں کے نتائج (جیسے جین کا اظہار) کی جانچ کرتا ہے: ہسٹون ترمیم-کرومیٹن امیونوپریسیپیٹیشن سیکوینسنگ (CHIP-Seq) ترمیم کے خلاف اینٹی باڈیز کا استعمال کرتے ہوئے ہسٹون ترمیم کے جینوم وسیع نمونوں کی نشاندہی کرتا ہے۔ ڈی این اے میتھیلیشن-مکمل جینوم بیسلفائٹ-سیک، کم نمائندگی بیسلفائٹ-سیک (آر آر بی ایس)، میتھیلیٹیڈ ڈی این اے امیونوپریسیپیٹیشن سیکوینسنگ (ایم ای ڈی آئی پی-سیک)، اور میتھیلیشن حساس پابندی انزیم سیکوینسنگ (ایم آر ای-سیک) بیس پیئر سطح تک ریزولوشن کی مختلف سطحوں پر جینوم کے حصوں میں ڈی این اے میتھیلیشن کی شناخت کرتے ہیں۔ کرومیٹن تک رسائی-ڈی این ایز I انتہائی حساس سائٹس سیکوینسنگ (ڈی این ایز-سیک) جینوم میں کھلے یا قابل رسائی علاقوں کو تلاش کرنے کے لیے ڈی این ایز I انزائم کا استعمال کرتا ہے۔ جین ایکسپریشن-آر این اے-سیق اور ایکسپریشن ایرے اظہار کی سطح یا پروٹین کوڈنگ جین کی شناخت کرتے ہیں۔ چھوٹے آر این اے ایکسپریشن-ایس ایم آر این اے-سیک چھوٹے نان کوڈنگ آر این اے، بنیادی طور پر ایم آئی آر این اے کے اظہار کی شناخت کرتا ہے۔ صحت مند افراد کے لیے حوالہ ایپیجینومز روڈ میپ ایپیجینومکس پروجیکٹ کے دوسرے مقصد کو قابل بنائیں گے، جو الزائمر کی بیماری جیسی بیماری کی حالتوں میں پائے جانے والے ایپیجینومک اختلافات کی جانچ کرنا ہے۔ ایپیجینٹکس ایپیجینوم ایڈیٹنگ ہیومن ایپیجینوم این سی بی آئی ایپیجینومکس حوالہ جات بیرونی لنکس حوالہ ایپیجینوم میپنگ کنسورشیم ہوم پیج این سی بی آئی ایپیجینومکس ہب این سی بی آئی جین ایکسپریشن اونیبس ایپیجینومکس ہیومن ایپیجینوم اٹلس روڈ میپ ایپیجینومکس ویژوئلائزیشن ہب روڈ میپ ایپیجینومکس ویژوئلائزیشن ہب (لوڈ ٹریک ہب) ہیومن ایپیجینوم براؤزر واشنگٹن یونیورسٹی ایپیجینوم براؤزر یو سی ایس سی آئینے ہیومن ایپیجینوم پروجیکٹ کینسر ریسرچ ایپیجینٹکس