Geminiviridae
Geminiviridae پودوں کے وائرس کا ایک خاندان ہے جو اپنی جینیاتی معلومات کو سنگل اسٹرینڈڈ (ایس ایس) ڈی این اے کے سرکلر جینوم پر انکوڈ کرتا ہے۔ اس خاندان میں 520 انواع ہیں، جو 14 نسلوں کو تفویض کی گئی ہیں۔ اس خاندان سے وابستہ بیماریوں میں شامل ہیں: روشن پیلے رنگ کی موزیک، پیلے رنگ کی موزیک، پیلے رنگ کی موٹل، پتی کا گھومنا، اسٹنٹنگ، سٹریکس، کم پیداوار۔ ان کے پاس سنگل اسٹرینڈڈ سرکلر ڈی این اے جینوم انکوڈنگ جین ہوتے ہیں جو نقل کے وائرین اسٹرینڈ ماخذ سے دونوں سمتوں میں مختلف ہوتے ہیں (یعنی۔ جیمنی وائرس جینوم ایمبیسینس ہیں)۔ بالٹیمور کی درجہ بندی کے مطابق انہیں کلاس II وائرس سمجھا جاتا ہے۔ یہ سنگل اسٹرینڈڈ ڈی این اے وائرس کا سب سے بڑا معلوم خاندان ہے۔ ماسٹری وائرس اور کرٹو وائرس کی منتقلی مختلف لیف ہاپر پرجاتیوں کے ذریعے ہوتی ہے (جیسے۔ مکئ کے اسٹریک وائرس اور دیگر افریقی اسٹریک وائرس سیکاڈولینا ایمبیلا کے ذریعے منتقل ہوتے ہیں)، واحد معروف ٹوپوکو وائرس پرجاتیوں، ٹماٹر سیوڈو-کورلی ٹاپ وائرس، ٹری ہاپر مائکروٹیلس میلیفیرا کے ذریعے منتقل ہوتا ہے، اور بیگومو وائرس وائٹ فلائی پرجاتیوں، بیمیشیا ٹابیسی کے ذریعے منتقل ہوتے ہیں۔ یہ وائرس دنیا بھر میں فصلوں کو کافی حد تک نقصان پہنچانے کے ذمہ دار ہیں۔ جیمنی وائرس کی بیماریوں کی وبا کئی عوامل کی وجہ سے پیدا ہوئی ہے، بشمول مختلف جیمنی وائرس کا دوبارہ ملاپ جس سے پودے کو دوبارہ متاثر کیا جاتا ہے، جو نئے، ممکنہ طور پر وائرل وائرس کو تیار کرنے کے قابل بناتا ہے۔ دیگر معاون عوامل میں متاثرہ پودوں کے مواد کی نئے مقامات پر نقل و حمل، نئے بڑھتے ہوئے علاقوں میں زراعت کی توسیع، اور ویکٹرز کی توسیع اور نقل مکانی شامل ہیں جو وائرس کو ایک پودے سے دوسرے پودے میں پھیلا سکتے ہیں۔ وائرولوجی ایس ایس ڈی این اے کا جینوم یا تو 2500-3100 نیوکلیوٹائڈز کے درمیان ایک جزو ہو سکتا ہے، یا، کچھ بیگومو وائرس کے معاملے میں، 2600 اور 2800 نیوکلیوٹائڈز کے درمیان دو ایک جیسے سائز کے اجزاء ہو سکتے ہیں۔ ان میں لمبا، جیمینیٹ کیپسڈ ہوتے ہیں جن میں دو نامکمل T = 1 آئکوساہیڈرا گمشدہ سرے پر جڑے ہوتے ہیں۔ کیپسڈ سائز میں 18-20 nm قطر میں تقریبا 30 nm کی لمبائی کے ساتھ ہوتے ہیں۔ بیگومو وائرس دو اجزاء کے ساتھ (یعنی۔ دو طرفہ) جینوم میں یہ اجزاء دو مختلف ذرات میں الگ ہوتے ہیں جن میں سے دونوں کو عام طور پر ایک مناسب میزبان خلیے کے اندر ایک نیا انفیکشن شروع کرنے کے لیے ایک ساتھ منتقل ہونا ضروری ہے۔ درجہ بندی درج ذیل نسلوں کو تسلیم کیا گیا ہے: بیکورٹووائرس بیگومووائرس کیپولا وائرس سیٹلوڈاوائرس کرٹووائرس ایرگرووائرس گریبلووائرس مالڈووائرس ماسٹریوائرس ملکریلی وائرس اوپون وائرس ٹوپوکو وائرس ٹرنکورٹوائرس متعدد اضافی نسلیں تجویز کی گئی ہیں: بامینی وائرس، نیمیوائرس اور نمینی وائرس۔ ریپلیکیشن جیمنی وائرس جینوم صرف چند پروٹین کو انکوڈ کرتے ہیں۔ اس طرح، وہ نقل کے لیے میزبان سیل عوامل پر منحصر ہوتے ہیں: ان میں ڈی این اے پولیمریز جیسے عوامل شامل ہیں-اور شاید پولیمریز کی مرمت-تاکہ ان کے جینوم کو بڑھایا جا سکے، نیز نقل کے عوامل بھی۔ جیمنی وائرس ایک رولنگ سرکل میکانزم کے ذریعے نقل کرتے ہیں جیسے بیکٹیریوفیجز جیسے ایم 13، اور بہت سے پلازمیڈز۔ نقل ایک متاثرہ پودے کے خلیے کے مرکزے کے اندر ہوتی ہے۔ سب سے پہلے سنگل اسٹرینڈڈ سرکلر ڈی این اے کو ڈبل اسٹرینڈڈ سرکلر انٹرمیڈیٹ میں تبدیل کیا جاتا ہے۔ اس مرحلے میں وائرل جینومک یا پلس سینس ڈی این اے اسٹرینڈ کو ٹیمپلیٹ کے طور پر استعمال کرتے ہوئے ایک تکمیلی منفی احساس اسٹرینڈ تیار کرنے کے لیے سیلولر ڈی این اے کی مرمت کے انزائموں کا استعمال شامل ہے۔ اگلا مرحلہ رولنگ سرکل مرحلہ ہے، جہاں وائرل ریپ پروٹین کے ذریعے نقل کی ابتدا کے اندر واقع ایک مخصوص جگہ پر وائرل اسٹرینڈ کو الگ کیا جاتا ہے تاکہ نقل شروع کی جا سکے۔ یوکرائیوٹک نیوکلئس میں یہ عمل ریپلیکیٹو انٹرمیڈیٹ جینومز کی کونکیٹیمیرک ڈبل اسٹرینڈڈ شکلوں کو جنم دے سکتا ہے، حالانکہ ڈبل اسٹرینڈڈ یونٹ حلقوں کو متاثرہ پودوں اور خلیوں سے الگ کیا جا سکتا ہے۔ وائرس جینوم (پلس سینس) کی نئی سنگل اسٹرینڈڈ ڈی این اے شکلیں ممکنہ طور پر کوٹ پروٹین کے ڈی این اے انٹرمیڈیٹس کی نقل کے ساتھ تعامل سے بنتی ہیں، کیونکہ سی پی جین کی کمی والے جینوم ایس ایس ڈی این اے نہیں بناتے ہیں۔ ایس ایس ڈی این اے کو مرکزے میں اگنے والے ذرات میں پیک کیا جاتا ہے۔ یہ واضح نہیں ہے کہ آیا یہ ذرات پھر مرکزے کو چھوڑ سکتے ہیں اور آس پاس کے خلیوں میں وائریون کے طور پر منتقل ہو سکتے ہیں، یا آیا کوٹ پروٹین اور حرکت پروٹین سے وابستہ ایس ایس ڈی این اے جینوم کی شکل ہے جو پلازموڈسماتا کے ذریعے سیل سے سیل میں اسمگل ہو جاتا ہے۔ یہ وائرس ویکٹر کیڑے کے چھیدنے والے منہ کے حصوں کے ذریعے مختلف پودوں کے خلیوں میں داخل ہوتے ہیں اور ابتدائی طور پر انہیں متاثر کرتے ہیں: تاہم، ان خلیوں میں عام طور پر ڈی این اے کی نقل کے لیے ضروری میزبان انزائم کی کمی ہوتی ہے، جس کی وجہ سے وائرس کے لیے نقل تیار کرنا مشکل ہو جاتا ہے۔ اس بلاک پر قابو پانے کے لیے جیمنی وائرس پودوں کے خلیوں کو ایک پرسکون حالت سے سیل سائیکل میں دوبارہ داخل ہونے پر آمادہ کر سکتے ہیں تاکہ وائرل نقل پیدا ہو سکے۔ وائرس ریپ پروٹین وائرل جینوم میں انکوڈ شدہ واحد پروٹین جو جیمینوائرل ڈی این اے کی نقل کے لیے ضروری ہے وہ جیمینوائرل ریپلیکیشن پروٹین ریپ ہے۔ ریپ وائرل ڈی این اے کی رولنگ سرکل ریپلیکیشن شروع کرتا ہے اور دوسرے میزبان پروٹین کے ساتھ تعامل کرتا ہے جو ریپلیکیشن مشینری کے اجزاء ہیں۔ میزبان RAD54 اور DNA پولیمریز میزبان پروٹین RAD54 جیمینوائرل DNA نقل کو ماڈیول کرتا ہے۔ آر اے ڈی 54 پروٹین ڈی این اے کے دوبارہ امتزاج اور مرمت میں کام کرتا ہے اور وائرل ڈی این اے کے دائرے کی نقل کے لیے ضروری معلوم ہوتا ہے۔ نیز، جیمنی وائرس ڈی این اے کی نقل میزبان پلانٹ ڈی این اے پولیمریز الفا اور ڈیلٹا کے ذریعے ثالثی کی جاتی ہے۔ ارتقاء یہ وائرس فائٹوپلاسما پلازمیڈ سے تیار ہوئے ہوں گے۔ جیمنی وائرس پودوں کے میزبان کو جینیاتی معلومات کی افقی جین منتقلی کی صلاحیت رکھتے ہیں۔ حوالہ جات بیرونی روابط آئی سی ٹی وی آن لائن (10 واں) رپورٹ ؛ جیمینی وائریڈی پلانٹ وائرس کی تفصیل مائکروبیولوجی بائٹس: پلانٹ وائرس وائرل زون: جیمینی وائریڈی وائرل پلانٹ پیتھوجینز اور بیماریاں وائرس خاندان