Chemical space
کیمیائی جگہ کیمینفارمیٹکس میں ایک تصور ہے جو تمام ممکنہ مالیکیولز اور کیمیائی مرکبات کے ذریعہ پھیلی ہوئی پراپرٹی کی جگہ کا حوالہ دیتا ہے جو تعمیراتی اصولوں اور حدود کے حالات کے دیئے گئے سیٹ پر عمل پیرا ہے۔ اس میں لاکھوں مرکبات ہوتے ہیں جو محققین کے لیے آسانی سے قابل رسائی اور دستیاب ہوتے ہیں۔ یہ ایک لائبریری ہے جو مالیکیولر ڈاکنگ کے طریقہ کار میں استعمال ہوتی ہے۔ نظریاتی خالی جگہیں ایک کیمیائی خالی جگہ جس کا اکثر کیمینفارمیٹکس میں حوالہ دیا جاتا ہے وہ ممکنہ فارماکولوجیکل طور پر فعال مالیکیولز کی ہوتی ہے۔ اس کے سائز کا تخمینہ 1060 مالیکیول کی ترتیب میں لگایا گیا ہے۔ اس جگہ کے عین مطابق سائز کا تعین کرنے کے لیے کوئی سخت طریقے نہیں ہیں۔ ممکنہ فارماکولوجیکل طور پر فعال مالیکیولز کی تعداد کا اندازہ لگانے کے لیے استعمال ہونے والے مفروضے، تاہم، لیپنسکی قوانین کا استعمال کرتے ہیں، خاص طور پر 500 کی سالماتی وزن کی حد۔ تخمینہ کاربن، ہائیڈروجن، آکسیجن، نائٹروجن اور سلفر کے لیے استعمال ہونے والے کیمیائی عناصر کو بھی محدود کرتا ہے۔ یہ مزید 500 ڈالٹن سے نیچے رہنے کے لیے زیادہ سے زیادہ 30 ایٹموں کا مفروضہ بناتا ہے، شاخوں اور زیادہ سے زیادہ 4 رنگوں کی اجازت دیتا ہے اور 1063 کے تخمینے پر پہنچتا ہے۔ اس تعداد کو اکثر بعد کی اشاعتوں میں پوری نامیاتی کیمسٹری کی جگہ کے تخمینہ شدہ سائز کے طور پر غلط حوالہ دیا جاتا ہے، جو کہ ہیلوجینز اور دیگر عناصر کو شامل کرنے پر بہت بڑا ہوگا۔ منشیات جیسی جگہ اور لیڈ جیسی جگہ کے علاوہ، جو جزوی طور پر، لیپنسکی کے پانچ کے اصول کے ذریعہ بیان کی گئی ہے، معروف منشیات کی جگہ (کے ڈی ایس) کا تصور، جس کی وضاحت مارکیٹنگ کے منشیات کے سالماتی وضاحتیں کرتی ہیں، کو بھی متعارف کرایا گیا ہے۔ کے ڈی ایس کا استعمال منشیات کی نشوونما کے لیے کیمیائی خالی جگہوں کی حدود کی پیش گوئی میں مدد کے لیے ان مالیکیولز کی ساخت کا موازنہ کر کے کیا جا سکتا ہے جو ڈیزائن اور ترکیب سے گزر رہے ہیں اور مالیکیولر ڈسکرپٹر پیرامیٹرز سے جو کے ڈی ایس کے ذریعے بیان کیے گئے ہیں۔ تجرباتی جگہیں جولائی 2009 تک، کیمیائی تجریدی خدمات کے ساتھ 49,037,297 نامیاتی اور غیر نامیاتی مادے رجسٹرڈ تھے، جس سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ ان کی اطلاع سائنسی ادب میں دی گئی ہے۔ مطلوبہ خصوصیات والے مرکبات کے لیے لیبارٹری پر مبنی اسکریننگ کے لیے استعمال ہونے والی کیمیائی لائبریریاں چھوٹے سائز (چند سو سے سیکڑوں ہزاروں مالیکیولز) کی حقیقی دنیا کی کیمیائی لائبریریوں کی مثالیں ہیں۔ ورچوئل مالیکیولز کے سلیکو ڈیٹا بیس بنا کر کیمیائی جگہ کی نسل کی منظم تلاش ممکن ہے، جسے کم جہتوں میں مالیکیولز کی کثیر جہتی پراپرٹی کی جگہ پیش کر کے دیکھا جا سکتا ہے۔ کیمیائی خالی جگہوں کی تخلیق میں الیکٹرانوں اور جوہری مرکزوں کے سٹوچیومیٹرک امتزاج پیدا کرنا شامل ہو سکتا ہے تاکہ دی گئی تعمیراتی اصولوں کے لیے تمام ممکنہ ٹوپولوجی آئسومرز حاصل کیے جا سکیں۔ کیمینفارمیٹکس میں، اسٹرکچر جنریٹرز نامی سافٹ ویئر پروگراموں کا استعمال تمام کیمیائی ڈھانچے کا سیٹ تیار کرنے کے لیے کیا جاتا ہے جو دی گئی حدود کے حالات پر عمل پیرا ہوتے ہیں۔ آئینی آئسومر جنریٹر، مثال کے طور پر، کسی دیئے گئے سالماتی مجموعی فارمولے کے تمام ممکنہ آئینی آئسومر تیار کر سکتے ہیں۔ حقیقی دنیا میں، کیمیائی تعاملات ہمیں کیمیائی جگہ میں حرکت کرنے کی اجازت دیتے ہیں۔ کیمیائی خلا اور سالماتی خصوصیات کے درمیان نقشہ سازی اکثر منفرد نہیں ہوتی، جس کا مطلب ہے کہ بہت ہی مختلف مالیکیول ہو سکتے ہیں جو بہت ہی مماثل خصوصیات کی نمائش کرتے ہیں۔ مواد کے ڈیزائن اور منشیات کی دریافت دونوں میں کیمیائی خلا کی تلاش شامل ہے۔ کیمینفارمیٹکس ڈرگ ڈیزائن سیکوینس اسپیس (ارتقاء) مالیکیول مائننگ حوالہ جات کیمینفارمیٹکس کمپیوٹیشنل کیمسٹری بھی دیکھیں۔