Saccharibacteria
ساکریبیکٹیریا، جسے پہلے ٹی ایم 7 کے نام سے جانا جاتا تھا، بیکٹیریا کا ایک بڑا نسب ہے۔ اسے 16 ایس آر آر این اے ترتیب کے ذریعے دریافت کیا گیا تھا۔ انسانی زبانی گہا سے TM7x کاشت کیا گیا اور انکشاف کیا گیا کہ TM7x ایک انتہائی چھوٹا کوکس (200-300 nm) ہے اور اس کا ایک مخصوص طرز زندگی ہے جو پہلے انسان سے وابستہ جرثوموں میں نہیں دیکھا گیا تھا۔ یہ مختلف میزبانوں کا ایک واجب ایپیبیونٹ ہے، بشمول ایکٹینومیسیس اوڈونٹولیٹیکس تناؤ (XH001) پھر بھی اس کا ایک پرجیوی مرحلہ بھی ہوتا ہے جس سے اس کے میزبان کی موت ہو جاتی ہے۔ مکمل جینوم ترتیب سے ایک انتہائی کم شدہ جینوم (705kB) اور امینو ایسڈ بائیوسینتھیٹک صلاحیت کی مکمل کمی کا پتہ چلا۔ 2014 میں زبانی گہا سے ٹی ایم 7 کا ایک ایکسینک کلچر رپورٹ کیا گیا تھا لیکن کوئی ترتیب یا کلچر دستیاب نہیں کیا گیا تھا۔ کینڈیڈیٹ فائیلم ٹی ایم 6 کے ساتھ، اس کا نام 1994 میں جرمنی میں پیٹ بوگ کے مٹی کے نمونے کے ماحولیاتی مطالعے میں حاصل کردہ ترتیبات کے نام پر رکھا گیا تھا جہاں 262 پی سی آر امپلیفائیڈ 16 ایس آر ڈی این اے کے ٹکڑوں کو پلازمیڈ ویکٹر میں کلون کیا گیا تھا، جسے ٹی ایم کلونز (لیٹ۔ پیٹ، درمیانی پرت)۔ اس کے بعد سے یہ کئی ماحول میں پایا گیا ہے جیسے کہ فعال کیچڑ، واٹر ٹریٹمنٹ پلانٹ کی کیچڑ، برساتی جنگل کی مٹی، انسانی تھوک، سپنج، کاکروچ، سونے کی کانوں، ایسیٹیٹ سے ترمیم شدہ آبی تلچھٹ، اور دیگر ماحول (بار تھرموفیلک) کے ساتھ مل کر، جو اسے ایک وافر اور وسیع پیمانے پر پھیلا ہوا فیلم بناتا ہے۔ حال ہی میں، TM7 rDNA اور پورے خلیوں کا پتہ انسانی جلد TM7 کی> 99.7% شناخت اور انسانی زبانی TM7a کی 98.6% شناخت کے ساتھ فعال کیچڑ میں لگایا گیا، جس سے پتہ چلتا ہے کہ ماحولیاتی مقامات پر میٹابولک طور پر فعال TM7 آئسولیٹ انسانی صحت میں TM7 پرجاتیوں کے کردار کی تحقیقات کے لیے ماڈل حیاتیات کے طور پر کام کر سکتے ہیں۔ خصوصیات TM7 مخصوص FISH تحقیقات نے بائیو ری ایکٹر کی کیچڑ سے شناخت شدہ انواع میں گرام مثبت خلیے کے لفافوں اور کئی مورفٹائپز کی موجودگی کا انکشاف کیا: ایک شیٹڈ تنت (وافر مقدار میں)، مختصر زنجیروں میں پائے جانے والی چھڑی، ایک موٹا تنت اور کوکی ؛ سابقہ ایکیل بوم قسم 0041 (فعال کیچڑ کے بلکنگ کے مسائل) کی وجہ ہو سکتا ہے۔ بیکٹیریل فائیلا کی اکثریت گرام نیگیٹیو ڈیڈرمز ہیں، جبکہ صرف بیسیلوٹا، ایکٹینومیسیٹوٹا اور کلوروفلیکسٹا مونوڈرمز ہیں۔ پولی کاربونیٹ جھلی کو گروتھ سپورٹ کے طور پر اور مٹی کے نچوڑ کو سبسٹریٹ کے طور پر استعمال کرتے ہوئے، اس کلاڈ کے مائکرو کالونیوں کو 10 دن کے انکیوبیشن کے بعد، 50 سے کم خلیوں کے ساتھ 15 مائیکرو میٹر تک لمبی فلیمینٹس سلاخوں یا ہر کالونی میں کئی سو خلیوں کے ساتھ مختصر سلاخوں پر مشتمل کیا گیا تھا۔ ایک مائیکرو فلوڈک چپ کی بدولت جو ایک ہی خلیے کے جینوم کو الگ تھلگ کرنے اور وسعت دینے کی اجازت دیتی ہے، یکساں 16 ایس آر آر این اے والے 3 لمبے فلامینٹ مورفولوجی خلیوں کے جینوم کو جینوم کا ایک مسودہ ترتیب بنانے کے لیے ترتیب دیا گیا جو کچھ پہلے سے طے شدہ خصوصیات کی تصدیق کرتا ہے، اس کی کچھ میٹابولک صلاحیتوں کو واضح کرتا ہے، نئے جینوں کو ظاہر کرتا ہے اور ممکنہ پیتھوجینک صلاحیتوں کی طرف اشارہ کرتا ہے۔ 50 سے زیادہ مختلف فائیلوٹائپز کی نشاندہی کی گئی ہے اور اس میں 17 فیصد کا نسبتا معمولی انٹراڈیوژن 16 ایس آر ڈی این اے ترتیب کا انحراف ہے، جو 13 سے 33 فیصد تک ہے۔ جے ایس فائیلو ایس وی جی کا استعمال کرتے ہوئے بنایا گیا ٹی ایم 7 کا ایک انٹرایکٹو فائیلوجنیٹک ٹری، جین بینک کے ترتیبات اور درخت کی شاخوں کے درمیان فاصلے کے میٹرکس کے حسابات تک فوری رسائی کی اجازت دیتا ہے۔ مستحکم آاسوٹوپ کی تحقیقات کرنے والے مطالعات سے پتہ چلا ہے کہ اس فایلم کے کچھ اراکین ٹولوین کو خراب کر سکتے ہیں۔ ٹیکسونومی فی الحال قبول شدہ ٹیکسونومی نامیات (ایل پی ایس این) اور نیشنل سینٹر فار بائیوٹیکنالوجی انفارمیشن (این سی بی آئی) کلاس "سچاریمونڈیا" کوریگ کے ساتھ پروکیریوٹک ناموں کی فہرست پر مبنی ہے۔ میک لین اور دیگر۔ 2020 ["نینوپیریوڈونٹوموربیا" کوریگ۔ میک لین اور دیگر۔ 2020 ؛ "نانوسائنکوکیا" کوریگ۔ میک لین اور دیگر۔ 2020] آرڈر کریں "ساکریموناڈیلس" میک لین اور دیگر۔ 2020 ["نانوگینگیولالس" کوریگ۔ میک لین اور دیگر۔ 2020 ؛ "نینوپیریوڈونٹوموربلز" کوریگ۔ میک لین اور دیگر۔ 2020 ؛ "نانوسینبیکٹیریلز" میک لین اور دیگر۔ 2020 ؛ "نانوسائنکوکلز" میک لین اور دیگر۔ 2020] "سی اے۔ چیرا کورگ۔ لیموس اور دیگر۔ 2019 "سی اے۔ سی۔ رینی کوریگ۔ لیموس اور دیگر۔ 2019 "سی اے۔ منی مائکروبیا "ابراہیم اور دیگر۔ 2021 "سی اے۔ ایم نوڈس ابراہیم اور دیگر۔ 2021 "سی اے۔ ایم۔ ویلسی ابراہیم اور دیگر۔ 2021 "سی اے۔ مائیکوسینبیکٹر "باتینوویچ اور دیگر۔ 2021 (جے آر 1) "سی اے۔ ایم۔ امیلیٹیکس "باتینوویچ اور دیگر۔ 2021 "سی اے۔ نانوسائنساکریبیکٹیریم "کوریگ۔ میک لین اور دیگر۔ 2020 خاندان "نانوگینجیویلاسی" میک لین اور دیگر۔ 2020 "سی اے۔ نینوگنگیوالس "میک لین اور دیگر۔ 2020 (CMJM _ G6 _ 1 _ HOT _ 870 ؛ UMGS1907) "Ca. این۔ جنجیوٹکس "میک لین اور دیگر۔ 2020 خاندان "نینوپیریوڈونٹوموربیسی" کوریگ۔ میک لین اور دیگر۔ 2020 "سی اے۔ نینوپیریوڈونٹوموربس "کوریگ۔ میک لین اور دیگر۔ 2020 (EAM _ G5 _ 1 _ HOT _ 356 ؛ UBA1103) "Ca. این۔ پیریڈونٹیکس کوریگ۔ میک لین اور دیگر۔ 2020 خاندان "نانوسینبیکٹیریسی" میک لین اور دیگر۔ 2020 "سی اے۔ نانوسینبیکٹر "میک لین اور دیگر۔ 2020 (TM7x) "Ca. این۔ لائٹیکس "میک لین اور دیگر۔ 2020 خاندان "نانوسائنکوکیسی" میک لین اور دیگر۔ 2020 "سی اے۔ نانوسائنکوکس میک لین اور دیگر۔ 2020 (G3 _ 2 _ Rum _ HOT _ 351B ؛ UBA2866) "Ca. N. اس کے علاوہ میک لین اور دیگر۔ 2020 "سی اے۔ این۔ نینورالیکس "میک لین اور دیگر۔ 2020 خاندان "Saccharimonadacea" میک لین اور دیگر۔ 2020 "سی اے۔ Saccharimonas "Albertsen et al. 2013 "سی اے۔ ایس۔ البرٹسن اور دیگر۔ 2013 فیملی UBA1547 "Ca. مائکروسیکریموناس کوریگ۔ لیموس اور دیگر۔ 2019 (AMD02 ؛ UBA6175) "Ca. ایم۔ سوسیگونینسس "کوریگ۔ لیموس اور دیگر۔ 2019 فائیلوجینی بیکٹیریل آرڈرز کی فہرست بھی دیکھیں بیکٹیریا جنرا کی فہرست حوالہ جات بیرونی روابط زیر زمین پانی میں پائے جانے والے الٹرا چھوٹے، پرجیوی بیکٹیریا، کتے، بلیاں-اور آپ ؛ پر: سائنس ٹیک ڈیلی ؛ 21 جولائی، 2020 ؛ ماخذ: فورسیتھ انسٹی ٹیوٹ جیفری ایس میک لین، بیٹبیلیگ بور، کرسٹوفر اے کیرنز، کیلی رائٹن، وینیوان شی، زوسانگ ہی، اور دیگر۔ : ممالیہ میزبانوں کے لیے انتہائی چھوٹے پرجیوی کم شدہ جینوم بیکٹیریا کا حصول اور موافقت ؛ میں: سیل ریپ 32، 107939 ؛ 21 جولائی، 2020 ؛ ڈوئی: 10.1016/j.celrep.2020.107939 جیفری ایس میک لین، بیٹبیلگ بور، تھاؤ ٹی۔ ٹو، کوانہوئی لیو، کرسٹوفر اے کیرنز، لنڈسے سولڈن، کیلی رائٹن، زویسونگ ہی، وینیوان شی: فائیلم ساکریبیکٹیریا کے انتہائی متنوع لیکن کم شدہ جینومز میں انسانی میزبانوں کے لیے انتہائی چھوٹے بیکٹیریا کے آزاد حصول اور موافقت کا ثبوت ؛ پر: بائیو آرکسیو ؛ فروری 02، 2018 ؛ ڈوئی: 10.1101/258137