TMEM271
ٹرانس میمبرین پروٹین 271، یا ٹی ایم ای ایم 271 ہومو سیپینز میں ایک پروٹین ہے جو ٹی ایم ای ایم 271 جین کے ذریعے انکوڈ کیا گیا ہے، جو مائنس اسٹرینڈ پر 4p16.3 پر واقع ہے۔ پروٹین خلیوں کی پلازما جھلی پر واقع ہوتا ہے اور دماغ کے کئی علاقوں میں اس کا بہت زیادہ اظہار ہوتا ہے۔ جین لوکس TMEM271 کروموسوم 4 پر مائنس اسٹرینڈ پر 4p16.3 پر، ہنٹنگن کی بیماری سے وابستہ جین کے قریب واقع ہے۔ سائز TMEM271 کو انکوڈ کرنے والا جین 2,416 نیوکلیوٹائڈز لمبا ہوتا ہے۔ کوڈنگ کی ترتیب نیوکلیوٹائڈز 234 سے 1391 تک پھیلی ہوئی ہے۔ ایم آر این اے آئسوفارم جین میں ایک ایکسون ہوتا ہے، اور ایک واحد پروٹین ٹرانسکرپٹ تیار ہوتا ہے، کوئی آئسوفارم نہیں ہوتا ہے۔ پروٹین کی خصوصیات TMEM271 لمبائی میں 385 امینو ایسڈ ہے، اور اس کا سالماتی وزن 39.1 kD ہے۔ یہ ایک بنیادی پروٹین ہے جس کا تخمینہ شدہ آئسو الیکٹرک پوائنٹ 9.55 ہے۔ یہ ایلانائن، گلائسین، اور ارجنائن کے باقیات سے بھرپور ہوتا ہے، اور میتھیونائن، اسپرگین، تھریونائن، آئسولیسین، لائسین، اور گلوٹامین کے باقیات کی کمی ہوتی ہے۔ ڈومینز اور موٹف TMEM271 میں بقیہ 50 سے 70، 121 سے 141، اور 219 سے 239 پر تین ٹرانس میمبرین ڈومینز ہیں، اور ان میں سے پہلے دو ہائیڈروفوبک ہیں۔ آرجنائن سے بھرپور ایک علاقہ جس میں باقیات 248 سے لے کر 295 تک ہوتے ہیں، پروٹین کی مثبت چارج شدہ ترتیب کے ساتھ ارتباط کرتا ہے۔ ثانوی ساخت الفا فولڈ پیشن گوئی ماڈلنگ بقیہ 5 سے 37، 45 سے 71، 117 سے 151، اور 199 سے 257 تک واقع چار الفا ہیلیسیس کو دکھاتی ہے۔ یہ ترتیبات عام طور پر ٹرانس میمبرین علاقوں کے ساتھ صف بندی کرتے ہیں۔ ترتیری اور کواٹرنیری اسٹرکچر TMEM271 میں ٹائپ 3a ٹوپولوجی ہے، جس کا مطلب ہے کہ N-ٹرمینس ایکسٹرا سیلولر اسپیس میں ہے۔ پروٹین کے اندر کوئی ڈائیسلفائیڈ پل نہیں ہوتے ہیں۔ الفا فولڈ ڈیٹا بیس پیش گوئی کرتا ہے کہ انسانی TMEM271 پروٹین میں چار الفا ہیلیسیس ہیں۔ جین لیول ریگولیشن ایکسپریشن پیٹرن TMEM271 mRNA دماغ میں بہت زیادہ، اور ایڈرینل گلینڈ اور جلد میں کم سے کم ظاہر ہوتا ہے۔ دماغ کے اندر، سب سے زیادہ اظہار دماغی پرانتستا میں ہوتا ہے، اس کے بعد ہپپوکیمپس، امیگدالا، اور بیسال گینگلیا ہوتا ہے۔ ٹی ایم ای ایم 271 کو سی اے ڈی او-ای ایس 1 سیل لائن میں بھی شامل کیا گیا ہے، ایک انسانی ایونگ کی سارکوما سیل لائن جو گلوٹامیٹ سگنلنگ، پوسٹسیناپٹک نیورو ٹرانسمیٹر ریسیپٹرز کے ضابطے، اور سیکھنے کے حیاتیاتی عمل میں کام کرتی ہے۔ پروٹین لیول ریگولیشن سب سیلولر لوکیشن ٹی ایم ای ایم 271 کے سب سیلولر لوکیشن کی پیش گوئی پلازما جھلی، یا کسی اور جھلی والے آرگنیل جیسے اینڈوپلاسمک ریٹیکولم سے کی جاتی ہے۔ ایک محفوظ پیٹرن 7 نیوکلیئر لوکلائزیشن سیکوینس ہے، جس میں پی اے ایس آر اے آر آر کی امینو ایسڈ سیکوینس 275 پوزیشن پر ہے۔ سگنل پیپٹائڈ پروٹین کے این-ٹرمینس پر بقیہ 1 سے 28 تک ایک سگنل پیپٹائڈ ہوتا ہے جس کے ساتھ کلیویج سائٹ 28/29 پر ہوتی ہے، جس سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ TMEM271 ایک خفیہ پروٹین ہے اور اسے ترجمہ کے بعد کی ترمیم کے دوران اینڈوپلاسمک ریٹیکولم میں منتقل کیا جائے گا۔ ترجمہ کے بعد کی تبدیلیاں بقیہ 151 پر ایک سی اے ایم پی/سی جی ایم پی پر منحصر کینیس (پروٹین کینیس اے) فاسفوریلیشن سائٹ، بقیہ 147 پر ایک کیسین کینیس II (سی کے 2) فاسفوریلیشن سائٹ، اور بقیہ 4 پر ایک پروٹین کینیس سی (پی کے سی) سائٹ ہے۔ بقیہ 249 سے 252 تک ایک درمیانی جگہ ہے۔ آخر میں، بقیہ 7 سے 12 اور 131 سے 136 پر دو مائرسٹائیلیشن سائٹس ہیں۔ باہمی تعامل کرنے والے پروٹین TMEM271 میں براہ راست تعامل کرنے والے پروٹین نہیں ہوتے ہیں۔ تاہم، یہ سی اے ڈی او-ای ایس 1 سیل لائن میں شامل ہے، ایک ایونگ کی سارکوما سیل لائن، جو گلوٹامیٹ سگنلنگ، پوسٹسیناپٹک ریسیپٹر ریگولیشن، اور سیکھنے کے عمل میں کام کرتی ہے۔ پڑوسی جینوں میں سے ایک دوسرے ٹرانس میمبرین پروٹین، ٹی ایم ای ایم 114 کو انکوڈ کرتا ہے، جو آنکھوں کی نشوونما میں کردار ادا کرتا ہے، اور ہائپوتھلمس میں اس کا بہت زیادہ اظہار ہوتا ہے۔ ہومیولوجی اور ارتقاء آرتھولوگس ممالیہ جانوروں، رینگنے والے جانوروں، پرندوں، اور ہڈی اور کارٹلیجینس مچھلیوں دونوں میں ہومو سیپینز TMEM271 کے لیے کئی آرتھولوگس ہیں۔ ممالیہ آرتھولوگس کے ایچ سیپینز کے ساتھ اعلی شناخت کے میچ ہوتے ہیں، اور اس لیے انہیں سخت آرتھولوگس سمجھا جاتا ہے۔ رینگنے والے جانوروں، پرندوں اور مچھلیوں کے اندر زیادہ دور کے آرتھولوگس، یا ہومولوگس ہیں۔ سب سے زیادہ دور آرتھولوگ کالورہنچس ملی ہے، جو 46 کروڑ 40 لاکھ سال پہلے کا ہے۔ طبی اہمیت ٹی ایم ای ایم 271 پروٹین کینسر کی تشخیص نہیں ہے، لیکن گلیوما میں اس کا پتہ چلا ہے۔ جون 2022 میں کی گئی ایک تحقیق میں آسٹیوسرکوما کا شکار ایک 17 سالہ مریض شامل تھا جس کا ٹی ایم ای ایم 271 کے ساتھ بی آر سی اے 1 جین فیوژن تھا۔ ایک اور تحقیق میں ٹی ایم ای ایم 271 جین کا حوالہ دیتے ہوئے کہا گیا ہے کہ اس میں ایس پی کے خلاف مزاحمت کے ساتھ ٹشو میں اظہار میں اضافہ ہوا ہے، جو ایونگ کے سارکوما کے علاج کے لیے استعمال ہونے والی ایک لائسین مخصوص ڈیمیتھیلیز-1 انفیکٹر دوا ہے۔ حوالہ جات انسانی پروٹین