Hp53int1
انسانی پروٹین 53 انٹرن 1 (Hp53int1) انسانوں میں Hp53int1 جین کے ذریعے انکوڈ شدہ ایک پروٹین ہے۔ جین Hp53int1 جین کروموسوم 17p.13 پر واقع ہے، جو لمبائی میں ڈی این اے کی ترتیب 1125 بیس جوڑوں کے ذریعہ انکوڈ کیا گیا ہے، جو خطے 7,685,260 bp-7,686,371 bp کا احاطہ کرتا ہے۔ Hp53int1 جین کے دو عرفی نام ہیں، WRAP53int1 اور TP53int1، کروموسوم 17 پر WRAP53 اور TP53int1 جینوں کے ساتھ اس کے اوورلیپ کے مطابق۔ Hp53int1 p53p2 اسٹارٹ سائٹ کے نیچے کی طرف واقع ہے۔ Hp53int1 میں متعدد ایکسون نہیں ہوتے ہیں، اور اس لیے اس میں کوئی آئسوفارم نہیں ہوتے ہیں۔ TP53 سے اہم تعلق Hp53int1 جین TP53 کی طرح اسی سمت میں نقل کیا گیا ہے اور TP53 پروٹین سے بھرپور مائیلوئڈ لیوکیمیا خلیوں HL-60 اور U937 میں موجود ہے۔ اس سے TP53 جین اور اس کے بعد کے پروٹین کے ساتھ ایک مضبوط تعلق کا پتہ چلتا ہے، جس میں نقل کے عوامل، پروموٹر سگنلز، ٹشو کے اظہار، اور سب سیلولر لوکلائزیشن کا حصہ شامل ہے۔ اگرچہ یہ جین ایک جیسے نہیں ہیں، لیکن یہ تعلق فنکشن، ساخت اور اظہار کا اشارہ دے سکتا ہے۔ mRNA ٹرانسکرپٹ Hp53int1 کو لمبائی میں 1125 بیس جوڑوں کے پولیڈینائیلیٹڈ ٹرانسکرپٹ کے ذریعے انکوڈ کیا گیا ہے۔ بیس جوڑوں 633.926 اور بیس جوڑوں 496.1000 کے درمیان ایک ریگولیٹری پولی اے ٹیل سیکوینس کے درمیان ایک دہرایا ہوا تسلسل ہوتا ہے۔ بنیادی جوڑوں 633 اور 926 کے درمیان تکرار کی ترتیب الو ایس سی ذیلی خاندان کے تکرار سے ملتی جلتی ہے، یہ ایک ایسی ترتیب ہے جو انسانوں اور پرائمیٹس میں سب سے زیادہ کثرت سے تکرار کی ترتیب کی خصوصیت رکھتی ہے، اور جو ممکنہ طور پر تقریبا 32 ملین سال پہلے دیگر الو ذیلی خاندان کے کمپلیکس سے الگ ہو گئی تھی۔ پروموٹر سیکوینس Hp53int1 جین کی پروموٹر سیکوینس کو لمبائی میں 540 بیس جوڑے دکھایا گیا تھا۔ نقل کے عوامل ایس ایم اے ڈی 2، ایس آر وائی، اور ای ٹی وی 7 میں بنیادی طور پر تحفظ کے اسکور بالترتیب 2.99، 2.73، اور 3.03 تھے، جس میں 4 کی قدر سب سے زیادہ تحفظ اور-0.5 سب سے کم کی نشاندہی کرتی ہے۔ کے ایل ایف 2 اور کے ایل ایف 5 میں سے ہر ایک کے اسکور 3.73 تھے۔ جن انواع کا موازنہ کیا جا رہا ہے ان میں ہاتھی، کتا، ریسس مکاک اور مرغی شامل ہیں۔ پروٹین Hp53int1 پروٹین کا سالماتی وزن 13.3 kdal ہے اور اس کی لمبائی 118 امینو ایسڈ ہے۔ یہ ایک بنیادی پروٹین ہے۔ 102-110 کے درمیان ایک انتہائی محفوظ امینو ایسڈ کی ترتیب ہے۔ سیرائن سائٹ کی تقسیم ارجنائن اور ٹائروسین سائٹس سے نمایاں طور پر زیادہ ہے۔ امینو ایسڈ 22-25 کے درمیان ایک ممکنہ کیسین کنیز II فاسفوریلیشن سائٹ ہے۔ کیسین کینیس II فاسفوریلیشن خلیوں کے پھیلاؤ میں شامل ہے۔ Hp53int1 پروٹین کے لیے عارضے کے تین علاقوں کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ ترجمہ کے بعد کی تبدیلیاں امینو ایسڈ 14-20 کے درمیان ایک ممکنہ O-β-GlcNAc سائٹ موجود ہے۔ کوئی ٹرانس میمبرین ڈومین نہیں ہیں اور نہ ہی سگنل پیپٹائڈز ہیں۔ S5، S15، اور S20 پر ایک محفوظ فاسفوریلیشن سائٹ ہے۔ اسٹرکچر سیکنڈری Hp53int1 پروٹین میں ایک الفا ہیلکس اور پانچ بیٹا شیٹس ہونے کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ آٹھ ممکنہ پروٹین بائنڈنگ سائٹس ہیں۔ ترتیری سب سیلولر لوکلائزیشن ایک 56.5% امکان ہے کہ Hp53int1 پروٹین سائٹوپلازم کے اندر مقامی ہے۔ ٹشو کا اظہار Hp53int1 جین کے لیے ٹشو کی مخصوصیت کم ہے۔ بالغ انسانی بافتوں کے مختلف نمونوں کا موازنہ کرتے وقت تھائمس، بیضہ دانی، لمف نوڈس اور سفید خون کے خلیوں میں زیادہ اظہار ہوتا ہے۔ پراکسیمل ہاضمہ کی نالی، معدے کی نالی، اور مرد/عورت کے بافتوں میں آر این اے کے اظہار اور پروٹین کے اظہار دونوں کے لیے ایک اعلی اظہار اسکور تھا۔ 10 اور 16 ہفتوں کے درمیان جنین کی نشوونما کے دوران، پھیپھڑوں اور دل کے بافتوں میں اظہار بلند ہوتا ہے۔ Hp53int1 مختلف طور پر ان حالات میں ظاہر کیا جاتا ہے جن میں خلیوں کے پھیلاؤ یا apoptosis کی ضرورت ہوتی ہے، TP53 ٹیومر سپریسر جین ہومیولوجی اور ارتقاء پیرالاگ کے ساتھ اس کی ہم آہنگی کے مطابق Hp53int1 جین میں کوئی پیرالاگ نہیں پایا گیا۔ آرتھولوگس این سی بی آئی BLAST ترتیب تجزیہ اور کلسٹل ڈبلیو کا استعمال کرتے ہوئے Hp53int1 اور بیس ٹاپ BLAST ہٹ کے لیے ایک سے زیادہ ترتیب کی صف بندی تیار کی گئی تھی۔ اگرچہ اس تحقیق کا مقصد مختلف قسم کے ممالیہ جانوروں، ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں اور غیر ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں متعدد آرتھولوگس تلاش کرنا تھا، لیکن صرف دو کلاسوں میں نتائج برآمد ہوئے: پرائمیٹس اور بیکٹیریا۔ مزید برآں، Hp53int1 کے اندر صرف ایک امینو ایسڈ کی ترتیب تھی اور اس کی لمبائی میں عام 20 امینو ایسڈ کے آرتھولوگس تھے جو براہ راست منسلک تھے)۔ پرائمیٹ جین کروموسوم 13 پر واقع ہوتے ہیں جبکہ Hp53int1 کروموسوم 17 پر واقع ہوتا ہے۔ نیوکلیئر لفافے کے اندر پرائمیٹ پروٹین کی سب سیلولر لوکلائزیشن کے ثبوت بھی موجود ہیں، جبکہ Hp53int1 کے شواہد سے پتہ چلتا ہے کہ یہ سائٹوپلازم میں ہے۔ اس طرح، یہ فرض کرنا مناسب ہے کہ پرائمیٹس سخت آرتھولوگ نہیں ہیں۔ سخت Hp53int1 صف بندی صرف بیکٹیریا میں کیوں پائی جاتی ہے اس کی ایک ممکنہ وضاحت بیکٹیریا اور پرائمیٹس کے مشترکہ آباؤ اجداد کے درمیان مشترکہ طور پر ایک ممکنہ کراسنگ اوور ایونٹ ہے۔ فنکشن Hp53int1 پروٹین ممکنہ طور پر سیلولر پھیلاؤ اور apoptosis کے ضابطے میں شامل ہے۔ اس کی نشاندہی اپوپٹوسس-ریگولیٹر اور ہر جگہ موجود ریگولیٹر کے تعامل کرنے والے پروٹین کے استعمال، TP53 کے ساتھ نقل کے عوامل کا اس کا حصہ (خاص طور پر SMAD2، SRY، اور ETV7 نقل کے عوامل)، p53p2 اسٹارٹ سائٹ کے نیچے کی طرف اس کا مقام، اس کی کیسین کینیس II فاسفوریلیشن سائٹ، اور بافتوں میں اس کے ہر جگہ موجود اظہار سے ہوتی ہے۔ Hp53int1 جین کا اظہار ماحول میں اس وقت بڑھتا ہے جب خلیوں کے پھیلاؤ کو کم کرنے والے پروٹین کو حد سے زیادہ ظاہر کیا جاتا ہے، جس سے سیلولر ماحول میں اس کی ضرورت کا پتہ چلتا ہے جو خلیوں کی نشوونما کو روکنے کی ضرورت ہے۔ نیز، مقداری تجزیہ سے پتہ چلتا ہے کہ عام ایچ پی 53 پروٹین ڈی این اے کے نقصان کے لیے سیلولر ردعمل کو چالو کرنے کے لیے بالکل ضروری ہے۔ تعاملی پروٹین TP53 کے لیے درج ذیل تعاملی پروٹین پائے گئے، لیکن ان کے کروموسومل تعلقات کی وجہ سے Hp53int1 پر لاگو کیا جا سکتا ہے۔ نوٹ کرنا ضروری ہے: ان تعامل کرنے والے پروٹین کے افعال سیل ریگولیشن (ہر جگہ، ٹرانسکرپشنل ریگولیٹر، اپوپٹوسس، اور پروٹین-ٹائروسین کینیز) میں براہ راست شامل ہوتے ہیں۔ SNPs Hp53int1 کے لیے دو شناخت شدہ SNPS ہیں۔ ایس این پی 15 ٹی پی 53 پروموٹر کے سب سے بڑے او آر ایف کے اوپر کی طرف واقع 43 باقیات کی ترتیب میں 32 ویں مقام پر آتا ہے۔ اس کے بعد ایس این پی 20 1125 بی پی سی ڈی این اے (ایچ پی 53 انٹ 1) کے 3 'سرے سے 45 بی پی نیچے کی طرف واقع ہے۔ طبی اہمیت اس بات کا ثبوت موجود ہے کہ Hp53int1 جین ٹیومر کو دبانے میں ملوث ہے۔ Hp53int1 TP53 ایکسون 1 (TAD1) کے ساتھ اوورلیپ ہوتا ہے۔ اس خطے کے اندر تغیرات کے نتیجے میں متبادل ایکسن اظہار یا نامکمل اسپلیسنگ اور ٹیومر سپریسر فنکشن کا نقصان ہوسکتا ہے۔ آسٹیوسرکوما کے حوالے سے، TP53 کی نامکمل اسپلیسنگ سے متعلق معاملات میں ~20% میں TAD1 کے اندر ان ترتیبات کا پتہ چلا ہے۔ یہ ریارنگمنٹ TP53 انٹرن 1 کی مکمل ترتیب میں واقع ہیں، لیکن ان میں سے اکثریت Hp53int1 ٹرانسکرپٹ کے ڈومین میں کلسٹر ہوگی، جس سے یہ پتہ چلتا ہے کہ ان ریارنگمنٹ کو اس لوکس کے اندر کرومیٹن تشکیل کے ذریعے سہولت فراہم کی جا سکتی ہے۔