Pseudoproline
سیوڈوپرولین (سیوڈو-پرولین، si-Pro بھی) مشتقات مصنوعی طور پر بنائے گئے ڈائپپٹائڈز ہیں جو پیپٹائڈز کی ایف ایم او سی ٹھوس مرحلے کی ترکیب کے دوران جمع کو کم کرنے کے لیے بنائے جاتے ہیں۔ بڑے پیپٹائڈز کی کیمیائی ترکیب اب بھی ٹھوس مرحلے پیپٹائڈ کی ترکیب (ایس پی پی ایس) کے دوران کم حل کے مسائل یا مکمل طور پر محفوظ پیپٹائڈ کے ٹکڑوں کی محدود گھلنشیلتا کی وجہ سے محدود ہے: یہاں تک کہ کیموسیلیکٹو لائیگیشن کے طریقے غیر محفوظ پیپٹائڈ بلاکس کی خود ایسوسی ایشن کی وجہ سے بھی متاثر ہوتے ہیں۔ بڑھتی ہوئی پیپٹائڈ زنجیر کی ترجیحی تشکیل اور اس کی فزیکو کیمیکل خصوصیات کے درمیان تعلق کی وضاحت سے پتہ چلتا ہے کہ β-شیٹ (بیٹا شیٹ) کی تشکیل اکثر حل اور گھلنشیلتا میں نمایاں کمی کے ساتھ متوازی ہوتی ہے۔ بیرونی عوامل کے ذریعہ پیپٹائڈز کے حل کو بڑھانے کی کوششوں کے علاوہ، چند کوششیں، یعنی۔ این-متبادل ایچ ایم بی امینو ایسڈ مشتقات اور سیڈوپرولینز (اوپر دائیں طرف کی شکل دیکھیں) کو جمع اور ثانوی ساخت کی تشکیل کے لیے ذمہ دار پیپٹائڈز کی اندرونی خصوصیات میں ترمیم کرنے کی اطلاع دی گئی ہے۔ سیوڈوپرولینز سیرائن-(آکسا) یا تھریونین سے ماخوذ آکسازولیڈائنز [آکسا (5-می)] اور سسٹین سے ماخوذ تھیازولیڈائنز (ٹی ایچ زیڈ) پر مشتمل ہوتے ہیں جن میں پرولین جیسی رنگ کی ساخت ہوتی ہے (اوپر دائیں دیکھیں)۔ مٹر اور ساتھی کارکنوں نے سیرائن، تھریونائن، اور سسٹین کے آکسا-اور تھیاپرولین مشتقات کو سیر (siPro) کے ساتھ بیان کیا ہے۔ Thr (siPro)، اور Cys (siPro)، بالترتیب، جہاں مخفف siPro پرولین سے تعلق کی نشاندہی کرتا ہے (پوزیشن 4 میں ہیٹروآٹومک رنگ کے متبادل کے ساتھ)۔ پرولین رنگ کی پوزیشن 2 میں متبادل کے ساتھ سیوڈوپرولینز کو سیر/تھر/سیس-(پرو) کا نام دیا گیا ہے۔ C2-متبادل سڈوپرولینز کے سابقہ باقیات کے ساتھ سیس-امیڈ بانڈ کی ترجیح کی وجہ سے، ان کی شمولیت کے نتیجے میں پیپٹائڈ ریڑھ کی ہڈی کی کنک تشکیل ہوتی ہے، اس طرح پیپٹائڈ جمع، خود ایسوسی ایشن، یا β-ساخت کی تشکیل کو روکا جاتا ہے۔ لہذا، سڈوپرولینز بیک وقت دو افعال کو پورا کرتے ہیں: وہ (1) سیر، تھر، اور سیس کے لیے عارضی سائیڈ چین تحفظ کے طور پر اور (2) پیپٹائڈ کی ترکیب کے دوران اور اس کے بعد کی زنجیر اسمبلی میں حل اور جوڑے کی شرحوں کو بڑھانے کے لیے گھلنشیل بلڈنگ بلاکس کے طور پر کام کرتے ہیں۔ سیوڈوپرولینز آزاد امینو ایسڈ کو ایلڈیہائڈز یا کیٹون کے ساتھ تعامل کرکے حاصل کیے جاتے ہیں۔ این-ٹرمینل سیوڈوپرولین پر مشتمل بڑھتی ہوئی پیپٹائڈ زنجیر میں امینو ایسڈ مشتقات کا جوڑا عام طور پر آکسازولیڈائن (تھیازولیڈائن) رنگ سسٹم کی مستحکم طور پر رکاوٹ کی نوعیت اور نائٹروجن ایٹم کی نیوکلیوفلیسیٹی میں کمی کی وجہ سے کم پیداوار کا باعث بنتا ہے۔ نتیجتا، پیپٹائڈ کی ترکیب میں استعمال کے لیے ایف ایم او سی-ایکس اے اے 1-اوکسا/ٹی ایچ زیڈ-او ایچ قسم کے مناسب طور پر محفوظ ڈائپپٹائڈ مشتقات کی تشکیل بہتر ہے۔ آکسازولیڈائن-اور تھیازولیڈائن-رنگ پر مشتمل ڈائپپٹائڈ مشتقات کی تیاری کے لیے دو تصوراتی طور پر مختلف نقطہ نظر ممکن ہیں: (1) ایسڈ فلورائڈز یا این-کاربوکسین ہائیڈرائڈز (این سی اے) کا استعمال کرتے ہوئے سیر-یا تھر سے ماخوذ آکسازولیڈائنز یا سیس سے ماخوذ تھیازولیڈائنز کا ان سیٹو ایسائلیشن ؛ اور (2) سی-ٹرمینل سر یا تھر پر مشتمل ڈائپپٹائڈز (پوسٹ-انسرشن) میں آکسازولیڈائن سسٹم کا براہ راست اندراج۔ انتخاب کا طریقہ سختی سے ویل آئی کے طور پر سیڈوپرولین کی نوعیت پر منحصر ہوتا ہے جیسا کہ چکور نظام کے سی 2 میں متبادلات پر ہوتا ہے۔ فوائد سیوڈوپرولینز مصنوعی پیپٹائڈز کے معیار کو بہتر بنانے کے لیے ایک طاقتور ذریعہ ہیں۔ سیوڈوپرولین ڈپپٹائڈز نے طویل اور مشکل دونوں پیپٹائڈز کی ترکیب کے لیے کامیابی کی شرح میں بہت اضافہ کیا ہے۔ سیوڈوپرولین ڈپپٹائڈز کو دوسرے امینو ایسڈ مشتقات کی طرح متعارف کرایا جا سکتا ہے۔ سیرین اور تھریونین پر مشتمل پیپٹائڈز کے ایف ایم او سی سالڈ فیز پیپٹائڈ سنتھسیس (ایس پی پی ایس) میں سیوڈوپرولین (آکسازولیڈائن) ڈپپٹائڈز کا معمول کا استعمال خام مصنوعات کے معیار اور پیداوار میں قابل ذکر بہتری کا باعث بنتا ہے اور ناکام ترتیبات کی غیر ضروری تکراری ترکیب سے بچنے میں مدد کرتا ہے۔ سیوڈوپرولین ڈائپپٹائڈز ناقابل تلافی پیپٹائڈز، لمبے پیپٹائڈز/چھوٹے پروٹینز، اور سائیکلک پیپٹائڈز کی ترکیب میں خاص طور پر موثر ثابت ہوئے ہیں، جو بہت سے معاملات میں پیپٹائڈز کی پیداوار کو قابل بناتے ہیں جو بصورت دیگر نہیں بنائے جا سکتے تھے۔ یہ ڈائپپٹائڈز استعمال کرنے میں انتہائی آسان ہیں: صرف ایک سیرائن یا تھریونائن کے باقیات کو پیپٹائڈ کی ترتیب میں پچھلے امینو ایسڈ کے باقیات کے ساتھ مل کر مناسب سیوڈوپرولین ڈائپپٹائڈ کے ساتھ تبدیل کریں (اپنی دائیں طرف کی شکل دیکھیں)۔ مقامی ترتیب کلیویج اور ڈیپروٹیکشن پر دوبارہ پیدا ہوتی ہے۔ ایپلی کیشنز حالیہ برسوں میں، کئی پیپٹائڈز، جیسے T-20 (جسے DP178 بھی کہا جاتا ہے)، Eptifibatide، Ziconotide، Pramlintide، Exenatide، اور Bivalirudin، کو امریکی فوڈ اینڈ ڈرگ ایڈمنسٹریشن نے منظور کیا ہے اور یہ مختلف بیماریوں کے علاج میں استعمال کے لیے مارکیٹ میں موجود ہیں۔ اس سے بھی اہم بات یہ ہے کہ 2004 کے آخر میں 600 سے زیادہ پیپٹائڈز یا تو ترقی کے مراحل میں تھے یا پری کلینیکل مراحل میں تھے۔ بہتری روایتی طور پر، ٹھوس مرحلے کی ترکیب نے ہر قسم کے پیپٹائڈز کی ترکیب کے لیے پولی سٹیرائن پر مبنی رال پر انحصار کیا ہے۔ تاہم، ان کی اعلی ہائیڈروفوبیسیٹی کی وجہ سے، ان رالوں کی کچھ حدود ہوتی ہیں، خاص طور پر پیچیدہ پیپٹائڈز کی ترکیب میں، اور ایسے معاملات میں، پولی تھیلین گلائکول (پی ای جی) پر مبنی رال اکثر اعلی نتائج دیتے پائے جاتے ہیں۔ پیچیدہ پیپٹائڈز کی اسمبلی کو تیز کرنے کے لیے ایک اور طاقتور حکمت عملی سیوڈوپرولین ڈپپٹائڈز کو استعمال کرنا ہے۔ یہ مشتقات زنجیروں کے درمیان تعاملات میں خلل ڈالتے ہیں جو عام طور پر مجموعی ترتیب میں ناقص جوڑی کی پیداوار کی وجہ ہوتے ہیں۔ کیمیائی آلات کا ایک بڑا اسلحہ خانہ اب 40 امینو ایسڈ کے باقیات تک تقریبا تمام پیپٹائڈز کی ترکیب کے لیے دستیاب ہے۔ تاہم، کئی چھوٹے سائز کے پیپٹائڈز اور بہت سے بڑے پیپٹائڈز اور/یا پروٹین اب بھی کلاسیکی طریقوں سے دستیاب نہیں ہیں۔ حال ہی میں، RANTES (24-91) کی ایک موثر مرحلہ وار ٹھوس مرحلے کی ترکیب شائع کی گئی تھی۔ رینٹس سی ڈی 8 + ٹی خلیوں کے ذریعہ تیار کردہ ایچ آئی وی کو دبانے والا ایک بڑا عنصر ہے۔ سیرین پروٹیز CD26/ڈائپپٹیڈائل-پیپٹیڈیز IV (CD26/DPP IV) RANTES (1-91) سے RANTES (24-91) تک NH2-ٹرمینل کٹوتی کو جنم دیتا ہے، جو M-ٹراپک ایچ آئی وی-1 تناؤ کے ذریعے مونوسیٹس کے انفیکشن کو روکتا ہے۔ RANTES (24-91) کے 68 امینو ایسڈ میں مجموعی ہونے کا زیادہ رجحان ہوتا ہے۔ یہ طریقہ پی ای جی پر مبنی کیم میٹریکس رال اور سیوڈوپرولین ڈپپٹائڈز کے فوائد کو یکجا کرتا ہے۔ سیوڈوپرولین مونومر سے براہ راست جوڑنا۔ سینکو اور ان کے ساتھیوں نے سب سے پہلے پولی پیپٹائڈ کی ترکیب میں انفرادی، واحد باقیات کے سیوڈوپرولین مشتقات کی تاثیر کی تصدیق کی۔ ادب کے مطابق، سر (म्बाپرو) کی تبدیلی بہترین تھی، تاہم تھر (باپرو) ایک وسیع رینج میں مختلف تھی۔ سیوڈوپرولین مونومر کی ایسیلیشن کا انحصار ایسیلیٹنگ باقیات کی کیمیائی نوعیت پر بھی تھا۔ مانے اور ان کے ساتھیوں نے کامیابی کے ساتھ ہیومن گروتھ ہارمون (ایچ جی ایچ) سے ماخوذ پولی پیپٹائڈ کی ترکیب کی جس تک رسائی پہلے سر (म्बाپ) کا استعمال کرتے ہوئے مشکل تھی، جبکہ جے آر 10 نے تھر (باپ) کا استعمال کیا۔ سینکو اور دیگر پر تعمیر کرنا۔ Szaniszló کے کام، Szaniszló اور ساتھی کارکنوں نے حال ہی میں Thr کی ایسیلیٹنگ کارکردگی کو بہتر بنایا ہے اور اسے اپنے مسلسل بہاؤ پیپٹائڈ سنتھسائزر میں شامل کیا ہے۔ پرولین پیپٹیڈومیمیٹکس (جیسے پیپٹائڈز اور β-پیپٹائڈز) پیپٹائڈز سے متعلق مالیکیول ہیں، لیکن مختلف خصوصیات کے ساتھ۔ پیپٹائڈ کی ترکیب ترجمہ ربوسوم حوالہ جات سائیکلک امینو ایسڈ پیپٹائڈز