Miniature Inverted-repeat Transposable Elements
چھوٹے الٹا دہرائے جانے والے ٹرانسپوزیبل عناصر (مائیٹس) غیر خود مختار کلاس II ٹرانسپوزیبل عناصر (ڈی این اے سیکوینس) کا ایک گروپ ہیں۔ غیر خود مختار ہونے کی وجہ سے، مائیٹس اپنے ٹرانسپوز کے لیے کوڈ نہیں کر سکتے۔ وہ جانوروں، پودوں، پھپھوندی، بیکٹیریا اور یہاں تک کہ وائرس کے جینوم کے اندر موجود ہیں۔ مائیٹ عام طور پر مختصر (50 سے 500 بی پی) عناصر ہوتے ہیں جن میں ٹرمینل الٹا تکرار (ٹی آئی آر ؛ 10-15 بی پی) اور دو فلینکنگ ٹارگٹ سائٹ ڈپلیکیشن (ٹی ایس ڈی) ہوتے ہیں۔ دوسرے ٹرانسپوسن کی طرح، مائیٹس بنیادی طور پر جین سے بھرپور علاقوں میں داخل کیے جاتے ہیں اور یہ ایک وجہ ہو سکتی ہے کہ وہ جین کے اظہار کو متاثر کرتے ہیں اور یوکرائیوٹک ارتقاء کو تیز کرنے میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ چھوٹے سائز کے باوجود ان کا اعلی کاپی نمبر دلچسپی کا موضوع رہا ہے۔ مائیٹس کی ابتدا مائیٹس کے ایک تفصیلی مطالعے سے پتہ چلتا ہے کہ مائیٹ ذیلی خاندان ایک ہی جینوم سے متعلقہ خود مختار عناصر سے پیدا ہوئے ہیں اور یہ ذیلی خاندان مائیٹ خاندانوں کی تشکیل کرتے ہیں۔ ایک قسم کا خود مختار عنصر ایک یا زیادہ مائیٹ خاندانوں کو جنم دے سکتا ہے۔ معروف ٹی ای سپر فیملی کے ساتھ ٹی آئی آر کے سلسلے میں ان کے تعلقات کی بنیاد پر درجہ بندی، مائیٹس کو بعض خاندانوں میں درجہ بند کیا گیا ہے۔ مثال کے طور پر، ڈبلیو ٹورسٹ، ایکروبیٹ، ہارٹ ہیلر مائیٹ خاندان ہیں جن میں پودوں کی کچھ انواع ٹی ای سپر فیملی پی آئی ایف/ہاربنجر کے تحت ہیں۔ سٹووے پیسم سٹیوم ایل میں ایک مائیٹ خاندان ہے جو ٹی سی 1/میرینر ٹی ای سپر فیملی کے سلسلے میں ٹی ایس ڈی ٹی اے کے ساتھ ہے۔ مائیٹس کا ایک گروپ جسے CMITES کے نام سے جانا جاتا ہے جو پگگی بیک سپر فیملی سے متعلق ہے، بعض مرجان پرجاتیوں میں پایا گیا۔ اگرچہ زیادہ تر مائیٹس کو گروپ کیا گیا ہے، لیکن ان میں سے کچھ کو ابھی تک ان کے ٹی ای سپر فیملی الاٹ نہیں کیے گئے ہیں۔ ایسے خاندانوں میں عربڈوپسس تھالیانا میں ایٹاٹ اور ایڈس ایجپٹی میں پائے جانے والے اےٹون خاندان شامل ہیں۔ اس کے علاوہ، کئی اور مائیٹ خاندانوں کے دریافت ہونے کا امکان ہے۔ پلانٹ جینوم مائیٹس میں مائیٹس سب سے پہلے پودوں میں دریافت کیے گئے تھے۔ سی اے سی ٹی اے، ایچ اے ٹی، میوٹیٹر، پی آئی ایف، اور ٹی سی 1/مرینر سپر فیملی سے تعلق رکھنے والے عناصر بیان کیے گئے ہیں۔ ان کے ٹرمینل الٹی ہوئی تکرار اور ٹارگٹ سائٹ کی نقلوں کی مماثلت پر منحصر ہے، پودوں کے جینوم میں زیادہ تر مائیٹس کو دو بڑے گروپوں میں تقسیم کیا گیا ہے: ٹورسٹ نما مائیٹس (پی آئی ایف سے ماخوذ) اور اسٹاوے نما مائیٹس (ٹی سی 1/مرینر سے ماخوذ)۔ اسٹاوے اور ٹورسٹ عناصر اپنے ترتیب میں نمایاں طور پر مختلف ہیں۔ پھر بھی، ان میں اہم ساختی مماثلت پائی گئی ہے۔ اسٹاو وے عناصر ہدف سائٹ کی خاصیت رکھتے ہیں، ان کا سائز چھوٹا ہوتا ہے اور محفوظ ٹرمینل الٹا دہرایا جاتا ہے۔ مائیٹس جیسے سیاحوں میں بھی اس معاملے کا تعین کیا جاتا ہے۔ وہ مستحکم ڈی این اے ثانوی ڈھانچے تشکیل دے سکتے ہیں جو ان کی شناخت میں بہت مفید ثابت ہو سکتے ہیں۔ کچھ سٹووے عناصر میں سی آئی ایس-ایکٹنگ ریگولیٹری ڈومینز بھی ہوتے ہیں۔ دیگر مائیٹ سپر فیملی کو بھی پودوں میں بیان کیا گیا ہے، جیسے کیلے میں ایچ اے ٹی قسم کے مائیٹ اور نائٹ شیڈز۔ مکئی کے جینوم میں مائیٹ فیملی ہارٹ بریکر (ایچ بی آر) کی موجودگی یا عدم موجودگی کی بنیاد پر، ایک مالیکیولر مارکر تیار کیا گیا۔ یہ ایچ بی آر مارکر مستحکم ثابت ہوئے ہیں، جو مکئی کے جینوم میں یکساں طور پر تقسیم ہوتے ہیں۔ کاسا اور دیگر کا مطالعہ۔ اس سے پتہ چلتا ہے کہ ایچ بی آر مارکر کو دیگر سالماتی مارکر کے ساتھ مل کر مکئی کی جڑی نسلوں کے جینو ٹائپ کا مطالعہ کرنے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ فائنڈمیٹ جیسے کمپیوٹیشنل اسسٹنس سافٹ ویئر مائیٹ خاندانوں کی شناخت کے لیے کچھ اوسط سائز کے بی پی کی ترتیب اندراجات کا استعمال کرتے ہیں۔ ڈیٹیکٹمیٹ نامی ایک میٹ لیب پر مبنی پروگرام وسیع پیمانے پر جینوم پر مائیٹس کا پتہ لگا سکتا ہے اور چاول کے جینوم پر اس کا تجربہ کیا گیا۔ دیگر ٹولز جیسے مسٹ اور مائیٹ ہنٹر بھی اسی طرح کے مقاصد کے لیے استعمال ہوتے ہیں۔ مائیٹ خاندانوں کی خصوصیت کے لیے ایک ٹول کٹ تیار کیا گیا ہے جسے مائیٹ تجزیہ کٹ میک کہا جاتا ہے جسے یانگ اور ہال نے تیار کیا ہے۔ حوالہ جات جینیاتی نقشہ سازی جینومکس