UBA2
یوبیکیوٹین نما 1-ایکٹیویٹنگ انزائم E1B (UBLE1B) جسے ایس یو ایم او-ایکٹیویٹنگ انزائم سب یونٹ 2 (SAE2) بھی کہا جاتا ہے ایک انزائم ہے جسے انسانوں میں یو بی اے 2 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ چھوٹے پروٹین ایس یو ایم او (دیکھیں ایس یو ایم او 1) کے اضافے سے پروٹین کی پوسٹ ٹرانسلیشنل ترمیم، یا سومولیشن، پروٹین کی ساخت اور انٹرا سیلولر لوکلائزیشن کو منظم کرتی ہے۔ ایس اے ای 1 اور یو بی اے 2 ایک ہیٹروڈائمر بناتے ہیں جو پروٹین کے سمائیلیشن کے لیے ایس یو ایم او کو فعال کرنے والے انزائم کے طور پر کام کرتے ہیں۔ ساخت ڈی این اے یو بی اے 2 سی ڈی این اے ٹکڑا 2683 بی پی لمبا اور 640 امینو ایسڈ کے پیپٹائڈ کو انکوڈ کرتا ہے۔ پیش گوئی شدہ پروٹین کی ترتیب انسانی یو بی اے 3 یا ای 1 (یوبیکیوٹین راستے میں) کے مقابلے میں خمیر یو بی اے 2 (35 ٪ شناخت) سے زیادہ مشابہت رکھتی ہے۔ یو بی اے جین کروموسوم 19 پر واقع ہے۔ پروٹین یوبا 2 ذیلی اکائی 640 اے اے بقیہ ہوتی ہے جس کا سالماتی وزن 72 کے ڈی اے ہوتا ہے۔ یہ تین ڈومینز پر مشتمل ہوتا ہے: ایک اڈینایلیشن ڈومین (جس میں اڈینایلیشن فعال سائٹ ہوتی ہے)، ایک اتپریرک سی آئی ایس ڈومین (جس میں اتپریرک سی آئی ایس 173 کے باقیات ہوتے ہیں جو تھیوسٹر بانڈ کی تشکیل میں حصہ لیتے ہیں)، اور ایک یوبیکیوٹین جیسا ڈومین۔ ایس یو ایم او-1 اتپریرک سی آئی ایس ڈومین اور یو بی ایل ڈومین کے درمیان یو بی اے 2 پر جڑا ہوا ہے۔ میکانزم ایس یو ایم او ایکٹیویٹنگ انزائم (ای 1، ایس اے ای 1 اور یو بی اے 2 کا ہیٹروڈائمر) ایس یو ایم او 1 کو چالو کرنے اور اسے یو بی سی 9 (ایس یو ایم اوایلیشن کے لیے واحد معروف ای 2) میں منتقل کرنے کے رد عمل کو متحرک کرتا ہے۔ رد عمل تین مراحل میں ہوتا ہے: اڈینایلیشن، تھیوسٹر بانڈ کی تشکیل، اور ای 2 میں ایس یو ایم او کی منتقلی۔ سب سے پہلے، ایس یو ایم او سی-ٹرمینل گلائسین کے باقیات کا کاربوکسیل گروپ اے ٹی پی پر حملہ کرتا ہے، جس سے ایس یو ایم او-اے ایم پی اور پائروفاسفیٹ بنتے ہیں۔ اگلا، یو بی اے 2 فعال سائٹ میں ایک اتپریرک سسٹین کا تھائول گروپ ایس یو ایم او-اے ایم پی پر حملہ کرتا ہے، جس سے ایس یو ایم او کے یو بی اے 2 اور سی-ٹرمینل گلائسین کے درمیان ایک اعلی توانائی تھائویسٹر بانڈ بنتا ہے اور اے ایم پی کو جاری کرتا ہے۔ آخر میں، ایس یو ایم او کو ایک ای 2 سسٹین میں منتقل کیا جاتا ہے، جس سے ایک اور تھیوسٹر بانڈ بنتا ہے۔ فنکشن یوبیکیوٹین ٹیگ میں پروٹین کو پروٹیسوم کے ذریعے انحطاط کی طرف لے جانے کا ایک اچھی طرح سے سمجھا ہوا کردار ہے۔ ایس یو ایم او مالیکیولز جو کردار ادا کرتے ہیں وہ زیادہ پیچیدہ ہوتے ہیں اور بہت کم اچھی طرح سے سمجھے جاتے ہیں۔ ایس یو ایم اوائیلیشن کے نتائج میں دوسرے پروٹین کے لیے یا ڈی این اے کے ساتھ سبسٹریٹ کے تعلق کو تبدیل کرنا، سبسٹریٹ لوکلائزیشن کو تبدیل کرنا، اور یوبیکیوٹین بائنڈنگ کو روکنا (جو سبسٹریٹ کے انحطاط کو روکتا ہے) شامل ہیں۔ کچھ پروٹینوں کے لیے، ایسا لگتا ہے کہ سمائیلیشن کا کوئی کام نہیں ہے۔ غیر متحرک خلیوں میں این ایف-کے بی ٹرانسکرپشن فیکٹر این ایف-کے بی کو آئی کے بی اے انفیکٹر پروٹین بائنڈنگ کے ذریعے غیر فعال کیا جاتا ہے۔ این ایف-کے بی کی سرگرمی ہر جگہ اور اس کے بعد آئی کے بی اے کے انحطاط کے ذریعے حاصل کی جاتی ہے۔ آئی کے بی اے کی سمائیلیشن کا این ایف-کے بی پر منحصر نقل پر مضبوط روک تھام کا اثر پڑتا ہے۔ یہ خلیوں کے لیے ٹرانسکرپشنل ایکٹیویشن کے لیے دستیاب این ایف-کے بی کی تعداد کو منظم کرنے کا ایک طریقہ کار ہو سکتا ہے۔ پی 53 ٹرانسکرپشن فیکٹر پی 53 ایک ٹیومر دبانے والا ہے جو سیل سائیکل ریگولیشن اور اپوپٹوسس میں شامل جینوں کو چالو کرکے کام کرتا ہے۔ اس کی سطح کو ایم ڈی ایم 2 پر منحصر ہر جگہ کے ذریعے منظم کیا جاتا ہے۔ پی 53 کا ایس یو ایم اوائیلیشن (یوبیکیوٹین ترمیم سائٹس سے ایک الگ لائسین کے باقیات پر) پروٹیسوم کے انحطاط کو روکتا ہے اور پی 53 ردعمل کے لیے ایک اضافی ریگولیٹر کے طور پر کام کرتا ہے۔ خمیر کے بڈنگ اور فشن کے ایکسپریشن اینڈ ریگولیشن اسٹڈیز سے پتہ چلا ہے کہ سیل سائیکل ریگولیشن میں ایس یو ایم او آئیلیشن اہم ہو سکتا ہے۔ سیل سائیکل کے دوران، یو بی اے 2 کے ارتکاز میں خاطر خواہ تبدیلی نہیں آتی ہے جبکہ ایس اے ای 1 کی سطح میں ڈرامائی اتار چڑھاؤ ظاہر ہوتا ہے، جس سے یہ پتہ چلتا ہے کہ یو بی اے 2 کے بجائے ایس اے ای 1 کے اظہار کا ضابطہ سیل کے لیے ایس یو ایم اوائیلیشن کو منظم کرنے کا ایک طریقہ ہو سکتا ہے۔ تاہم، اس وقت جب SAE1 کی سطح کم ہوتی ہے، SAE1-UBA2 ہیٹروڈائمر کے علاوہ UBA2 پر مشتمل پروٹین کمپلیکس کے بہت کم ثبوت پائے جاتے ہیں۔ ایک ممکنہ وضاحت یہ ہوگی کہ یہ کمپلیکس صرف مختصر مدت کے لیے موجود ہوتے ہیں، اس طرح سیل کے نکات میں واضح نہیں ہوتے ہیں۔ یو بی اے 2 کا اظہار دماغ، پھیپھڑوں اور دل سمیت زیادہ تر اعضاء میں پایا جاتا ہے، جو ان اعضاء میں سمائیلیشن راستے کے ممکنہ وجود کی نشاندہی کرتا ہے۔ خصیوں میں یو بی اے 2 کی ایک بلند سطح (نیز راستے کے دیگر تمام انزائم اجزاء) پائی جاتی ہے، جو مییوسس یا سپرمیٹوجینیسیس میں یو بی اے 2 کے ممکنہ کردار کی تجویز کرتی ہے۔ نیوکلئس کے اندر، یو بی اے 2 پورے نیوکلئی میں تقسیم ہوتا ہے لیکن نیوکلیولی میں نہیں پایا جاتا ہے، جس سے پتہ چلتا ہے کہ ایس یو ایم اوائیلیشن بنیادی طور پر نیوکلئی میں ہو سکتا ہے۔ ایس اے ای 1 اور یو بی اے 2 کا سائٹوپلاسمک وجود بھی ممکن ہے اور یہ سائٹوپلاسمک سبسٹریٹس کے امتزاج کا ذمہ دار ہے۔ ماؤس ماڈل حیاتیات کو یو بی اے 2 فنکشن کے مطالعہ میں استعمال کیا گیا ہے۔ ایک مشروط ناک آؤٹ ماؤس لائن، جسے Uba2TM1a (KOMP) Wtsi کہا جاتا ہے، ویلکم ٹرسٹ سینگر انسٹی ٹیوٹ میں انٹرنیشنل ناک آؤٹ ماؤس کنسورشیم پروگرام کے حصے کے طور پر تیار کیا گیا تھا-دلچسپی رکھنے والے سائنسدانوں کو بیماری کے جانوروں کے ماڈل تیار کرنے اور تقسیم کرنے کے لیے ایک ہائی تھرو پٹ میوٹیجینیسیس پروجیکٹ۔ نر اور مادہ جانوروں کو حذف کرنے کے اثرات کا تعین کرنے کے لیے ایک معیاری فینوٹائپک اسکرین سے گزرنا پڑا۔ اتپریورتن چوہوں پر پچیس ٹیسٹ کیے گئے اور چار اہم غیر معمولی چیزیں مشاہدہ کی گئیں۔ حمل کے دوران کسی بھی ہم جنس پرست متغیر جنین کی نشاندہی نہیں کی گئی تھی، اور اس وجہ سے کوئی بھی دودھ چھڑانے تک زندہ نہیں رہا۔ بقیہ ٹیسٹ ہیٹروزائگس میوٹینٹ بالغ چوہوں پر کیے گئے۔ ڈی ای ایکس اے کے ذریعہ خواتین کے جسم کی لمبائی میں کمی پائی گئی، جبکہ دونوں جنسوں کے جانوروں میں ایکس رے میں کمر اور ساکرل ریڑھ کی ہڈی کی تعداد میں کمی واقع ہوئی۔ ڈروسفیلا ڈروسفیلا یو بی اے 2 ہومولوگ ڈوبا 2 جین کا کوڈنگ ریجن 2.3 کے بی لمبا ہے اور اس میں 2 انٹرن (53 اور 52 بی پی) ہوتے ہیں۔ پیش گوئی شدہ پروٹین میں 766 امینو ایسڈ کے باقیات ہوتے ہیں اور اس کا وزن 84 کے ڈی اے ہوتا ہے۔ پروٹین کی مجموعی شناخت 47 ٪ سے ایچ یو بی اے 2 اور 31 ٪ خمیر یو بی اے 2 ہے۔ تین یکساں پروٹینوں کے درمیان مکمل شناخت کے کئی علاقے بھی ہیں۔ کوڈنگ ترتیب کے سی-ٹرمینل خطے میں ایک تخیلاتی نیوکلیئر لوکلائزیشن ترتیب بھی شامل ہے۔ تعاملات SAE2 کو SAE1، چھوٹے ubiquitin سے متعلق ترمیم کنندہ 1، اور UBE2I کے ساتھ تعامل کرتے ہوئے دکھایا گیا ہے۔ حوالہ جات مزید پڑھنے بیرونی روابط ای سی 6.3.2 چوہوں میں تبدیل شدہ جین