Scaffold/matrix attachment region
ایس/ایم اے آر (سکیفولڈ/میٹرکس اٹیچمنٹ ریجن) کی اصطلاح، جسے دوسری صورت میں ایس اے آر (اسکیفولڈ اٹیچمنٹ ریجن)، یا ایم اے آر (میٹرکس سے وابستہ علاقہ) کہا جاتا ہے، یوکرائیوٹک کروموسوم کے ڈی این اے میں ترتیبات ہیں جہاں نیوکلیئر میٹرکس منسلک ہوتا ہے۔ آرکیٹیکچرل ڈی این اے اجزاء کے طور پر جو یوکرائٹس کے جینوم کو سیل نیوکلئس کے اندر فعال اکائیوں میں منظم کرتے ہیں، ایس/ایم اے آرس نیوکلئس کے اندر کرومیٹن کی ساختی تنظیم میں ثالثی کرتے ہیں۔ یہ عناصر کرومیٹن سکافولڈ کے لیے ڈی این اے کے اینکر پوائنٹس تشکیل دیتے ہیں اور کرومیٹن کو ساختی ڈومینز میں منظم کرنے کا کام کرتے ہیں۔ انفرادی جینوں کے مطالعے سے یہ نتیجہ اخذ کیا گیا کہ ایس/ایم اے آر عناصر کی ثالثی میں کرومیٹن کی متحرک اور پیچیدہ تنظیم جین کے اظہار کے ضابطے میں اہم کردار ادا کرتی ہے۔ جائزہ یہ کئی سالوں سے جانا جاتا رہا ہے کہ پولیمر میش ورک، ایک نام نہاد "نیوکلیئر میٹرکس" یا "نیوکلیئر اسکیفولڈ" یوکرائیوٹک نیوکلئی کا ایک لازمی جزو ہے۔ یہ جوہری کنکال جینیاتی معلومات کے پھیلاؤ سے متعلق بہت سے خصوصی واقعات کے لیے ایک متحرک معاون کے طور پر کام کرتا ہے (نیچے دیکھیں)۔ ایس/ایم اے آر جینوم میں غیر بے ترتیب مقامات کا نقشہ بناتے ہیں۔ وہ نقل شدہ علاقوں کے پہلوؤں پر، 5 '-انٹرن میں، اور جین بریک پوائنٹ کلسٹر ریجنز (بی سی آر) میں بھی پائے جاتے ہیں۔ عام نیوکلیئر ساختی پروٹینوں کے لیے ایسوسی ایشن پوائنٹس ہونے کے ناطے ایس/ایم اے آرز مستند اور موثر کروموسومل نقل اور نقل کے لیے، ریکومبینیشن اور کروموسوم کنڈینسیشن کے لیے ضروری ہیں۔ ایس/ایم اے آر میں واضح اتفاق رائے کی ترتیب نہیں ہوتی ہے۔ اگرچہ پروٹو ٹائپ عناصر اے ٹی سے بھرپور علاقوں پر مشتمل ہوتے ہیں جن کی لمبائی کئی سو بیس جوڑوں پر مشتمل ہوتی ہے، لیکن مجموعی طور پر بیس کمپوزیشن یقینی طور پر ان کی سرگرمی کا بنیادی تعین نہیں کرتی ہے۔ اس کے بجائے، ان کے فنکشن کے لیے "اے ٹی-پیچز" کے ایک نمونے کی ضرورت ہوتی ہے جو ٹورسنل تناؤ کے تحت مقامی اسٹرینڈ کو غیر جوڑنے کا رجحان فراہم کرتا ہے۔ بائیو انفارمیٹکس کے نقطہ نظر اس خیال کی حمایت کرتے ہیں کہ، ان خصوصیات کے ذریعہ، ایس/ایم اے آر نہ صرف ایک دی گئی نقل شدہ اکائی (کرومیٹن ڈومین) کو اس کے پڑوسیوں سے الگ کرتے ہیں، بلکہ کسی دیئے گئے ڈومین کے اندر نقل شدہ واقعات کو فعال کرنے والے عوامل کی اسمبلی کے لیے پلیٹ فارم بھی فراہم کرتے ہیں۔ ڈی این اے اسٹرینڈز کو الگ کرنے کا بڑھتا ہوا رجحان (نام نہاد 'اسٹریس انڈیوسڈ ڈوپلیکس غیر مستحکم کرنے کی صلاحیت، ایس آئی ڈی ڈی) ثانوی ڈھانچوں جیسے صلیب یا پھسلن کے ڈھانچوں کی تشکیل کی خدمت کر سکتا ہے، جو متعدد انزائموں (ڈی این اے، ٹوپو آئسومیرس، پولی (اے ڈی پی-رائبوسیل) پولیمرس اور ہسٹون-ایسیٹیلیشن اور ڈی این اے-میتھیلیشن اپریٹس کے انزائم) کے لیے قابل شناخت خصوصیات ہیں۔ ایس/ایم اے آر کو ان کی متحرک خصوصیات کے لحاظ سے یا تو آئینی (تمام خلیوں کی اقسام میں مستقل ڈومین حدود کے طور پر کام کرنے والے) یا فیکلٹیٹو (خلیوں کی قسم اور سرگرمی سے متعلق) کے طور پر درجہ بند کیا گیا ہے۔ اگرچہ انسانی جینوم میں ایس/ایم اے آر کی تعداد کا تخمینہ 64,000 (کرومیٹن ڈومینز) کے علاوہ اضافی 10,000 (ریپلیکیشن فوکیز) تک پہنچنے کا لگایا گیا ہے، لیکن 2007 میں اب بھی صرف ایک معمولی حصہ (تمام یوکیریوٹس کے لیے 559) ایس/مارٹ ڈیٹا بیس میں تشریح کے لیے معیاری معیار پر پورا اترا تھا۔ سیاق و سباق پر منحصر خصوصیات نیوکلیئر میٹرکس کے موجودہ نظریات اسے ایک متحرک وجود کے طور پر تصور کرتے ہیں، جو سیل نیوکلئس کی ضروریات کے ساتھ اپنی خصوصیات کو تبدیل کرتا ہے-بالکل اسی طرح جیسے سائٹوسکیلیٹن اپنی ساخت اور فنکشن کو بیرونی اشاروں کے مطابق ڈھالتا ہے۔ پس منظر میں یہ بات قابل ذکر ہے کہ ایس/ایم اے آر کی دریافت کے دو بڑے راستے ہیں: لیملی اور ساتھی کارکنوں کے ذریعہ اسکیفولڈ اٹیچمنٹ عناصر (ایس اے آر) کی تفصیل، جن کے بارے میں سوچا گیا تھا کہ وہ کسی دیئے گئے کرومیٹن ڈومین کی سرحدوں کی حد بندی کریں گے۔ میٹرکس سے وابستہ علاقوں (ایم اے آر) کی خصوصیت۔ جن کی پہلی مثالوں نے امیونوگلوبلین کیپ چین بڑھانے والے کو نقل کے عوامل کے ساتھ اس کے قبضے کے مطابق سپورٹ کیا۔ اس کے بعد کے کام نے سیاق و سباق پر منحصر عناصر کے آئینی (ایس اے آر جیسے) اور فیکلٹیٹو (ایم اے آر جیسے) فنکشن دونوں کا مظاہرہ کیا۔ جبکہ آئینی S/MARs کو 'تمام' خلیوں کی اقسام میں DNase I انتہائی حساس سائٹ سے منسلک پایا گیا (چاہے منسلک ڈومین نقل کیا گیا ہو یا نہیں)، فیکلٹیٹو قسم کی DNAse I انتہائی حساسیت کا انحصار نقل کی حیثیت پر ہوتا ہے۔ ایس/ایم اے آر کی ان دو فعال اقسام کے درمیان بڑا فرق ان کا سائز ہے: آئینی عناصر کئی کلو بیس جوڑوں پر پھیل سکتے ہیں جبکہ فیکلٹیٹو عناصر کم سائز کی حد پر تقریبا 300 بیس جوڑوں پر ہوتے ہیں۔ یہ اعداد و شمار ان خصوصیات کے بارے میں ہماری موجودہ تفہیم کو ظاہر کرتا ہے اور اس میں درج ذیل نتائج شامل ہیں: ایس/ایم اے آر-سکافولڈ رابطوں کی متحرک خصوصیات جیسا کہ ہیلو فش تحقیقات سے اخذ کیا گیا ہے کہ نقل کے دوران ڈی این اے کو آر این اے-پولی میریز کے ذریعے رییل کیا جاتا ہے جو خود نیوکلیئر میٹرکس کا ایک مقررہ جزو ہے یہ حقیقت کہ بعض ڈومین-اندرونی ایس/ایم اے آر کو فعال ہونے کے لیے ملحقہ نقل کے عنصر کی حمایت کی ضرورت ہوتی ہے۔ جین تھراپی میں استعمال وائرل ویکٹروں کے متبادل کے طور پر، جو مریض کے جسم پر ناپسندیدہ اثرات مرتب کر سکتے ہیں، جین تھراپی کے غیر وائرل طریقوں کا مطالعہ کیا جا رہا ہے۔ اس طرح کے طریقوں میں سے ایک خاص خصوصیات کے ساتھ پلازمیڈز کا استعمال کرتا ہے-نام نہاد ایپیسومز۔ ایپیسومز میں مائٹوسس کے دوران باقی یوکرائیوٹک جینوم کے ساتھ مل کر تقسیم کرنے کی صلاحیت ہوتی ہے۔ معیاری پلازمیڈز کے مقابلے میں وہ نیوکلئس کے اندر ایپیجینٹک طور پر خاموش نہیں ہوتے ہیں اور انزائیمی طور پر تباہ نہیں ہوتے ہیں۔ اقساط یہ صلاحیت اپنی تعمیر کے اندر ایس/ایم اے آر ترتیب کی موجودگی کے ذریعے حاصل کرتے ہیں۔ اضافی معلومات حال ہی میں، ٹیٹکو نے عربیڈوپسس تھالیانا میں جینوں کے اسپاٹیوٹیمپورل اظہار کے ساتھ انٹراجینک ایس/ایم اے آر کا ایک مضبوط ارتباط پایا ہے۔ جینوم پیمانے پر، ایس/ایم اے آر پر مشتمل جینوں کے واضح ٹشو اور اعضاء سے متعلق اور ترقیاتی اظہار کے نمونوں کا پتہ چلا ہے۔ خاص طور پر، ٹرانسکرپشن فیکٹر جینز میں ایس/ایم اے آر کا ایک نمایاں اعلی حصہ ہوتا ہے۔ ایس/ایم اے آر پر مشتمل جینوں کی اظہار کی خصوصیات میں واضح فرق ان کی فعال اہمیت اور پودوں کے ساتھ ساتھ دیگر یوکرائٹس کے اندر جین کے ضابطے کے لیے ساختی کروموسومل خصوصیات کی اہمیت پر زور دیتا ہے۔ حوالہ جات سالماتی جینیات