Histone fold
ہسٹون فولڈ ایک ساختی طور پر محفوظ موٹف ہے جو سی-ٹرمینس کے قریب ہر بنیادی ہسٹون ترتیب میں ہسٹون آکٹمر میں پایا جاتا ہے جو ہسٹون کو ہیٹروڈائمرز میں باندھنے کا ذمہ دار ہوتا ہے۔ ہسٹون فولڈ اوسطا تقریبا 70 امینو ایسڈ پر مشتمل ہوتا ہے اور تین الفا ہیلیکس پر مشتمل ہوتا ہے جو دو مختصر، غیر ساختہ لوپس سے جڑے ہوتے ہیں۔ جب ڈی این اے کی موجودگی میں نہیں ہوتے ہیں، تو بنیادی ہسٹون سر سے دم کے انٹرمیڈیٹس میں جمع ہوتے ہیں (H3 اور H4 پہلے ہیٹروڈائمرز میں جمع ہوتے ہیں پھر دو ہیٹروڈائمرز کو ٹیٹریمر بنانے کے لیے فیوز کرتے ہیں، جبکہ H2A اور H2B ہیٹروڈائمرز بناتے ہیں) ہر ہسٹون فولڈ ڈومین کے درمیان "ہینڈ شیک موٹف" میں وسیع ہائڈروفوبک تعاملات کے ذریعے۔ نیز ہسٹون فولڈ سب سے پہلے ٹاٹا باکس بائنڈنگ پروٹین سے وابستہ عوامل میں پایا گیا، جو نقل میں ایک اہم جزو ہے۔ ہسٹون فولڈ کا ارتقاء پیپٹائڈز کے آبائی سیٹوں کے مختلف امتزاج سے پایا جا سکتا ہے جو ہیلکس-اسٹرینڈ-ہیلکس موٹف بناتے ہیں جو آبائی ٹکڑوں سے تین تہوں سے آتے ہیں۔ یہ پیپٹائڈ کی زنجیروں کو آرکیئل ہسٹونز میں پایا جا سکتا ہے، جو یوکیریوٹک H3-H4 ٹیٹریمر سے آ سکتے ہیں۔ آرکیئل سنگل چین ہسٹونز بیکٹیریم ایکویفیکس ایولیکس میں بھی پائے جاتے ہیں۔ جو بیکٹیریا تک پہنچنے کے لیے لیٹرل جین کی منتقلی کے ساتھ یوکیریوٹس اور آرکیا کے نسب سے آنے والے متنوع بیکٹیریا فائیلوجینی کی مدد کرتا ہے۔ یہ ڈی این اے کمپکشن کے لیے آکٹمر آرکٹیولیٹڈ پروٹین اینڈوسکیلیٹن کی طرف لے جاتے ہیں۔ اس اینڈوسکیلیٹن سے اس کا ایک مرکزی حصہ ہوتا ہے جو ہسٹون ڈائمرائزیشن کے لیے جوڑتا ہے۔ اس کے بعد یہ ڈائمر-ڈائمر رابطوں کی خصوصیات بنانے کے لیے فولڈ کے آخری حصوں کی طرف جاتا ہے جو آکٹمر پر پروٹین سپر ہیلکس کو بھی ڈھک دیتا ہے۔ ایک انواع جس پر غور کیا گیا وہ ڈروسفیلا ہے، اور ڈروسفیلا ٹرانسکرپشن انیشی ایشن فیکٹر کی ذیلی اکائیوں میں مخصوص امینو ایسڈ کے سلسلے ہوتے ہیں جن میں ہسٹون فولڈز کی مختلف خصوصیات ہوتی ہیں جو دو پروٹین بناتی ہیں جو ذیلی اکائیوں کو تشکیل دیتی ہیں۔ جب صرف ڈروسفیلا میں ہسٹون فولڈ موٹف کو دیکھتے ہیں تو بنیادی ہسٹون پروٹین کے پروٹین-پروٹین اور پروٹین ڈی این اے کے تعامل کو غیر ہسٹون پروٹین کو دیکھ کر پایا جا سکتا ہے۔ اس کے بعد اسے "ڈروسفیلا سے ٹی اے ایف آئی آئی 42/ٹی اے ایف آئی آئی 62 کمپلیکس اور میتھانوکوکس ایوویڈس سے ایچ ایم ایف بی پر ساختی مطالعات میں استعمال کیا جا سکتا ہے، مذکورہ بالا تلاشوں میں ہسٹون فولڈ پر مشتمل پروٹین کی شناخت کی گئی ہے، اس بات کی تصدیق کی گئی ہے کہ ان پروٹینوں میں ہسٹون جیسی ذیلی ساخت موجود ہے، جس میں انفرادی پروٹین کینونکل ہسٹون فولڈ موٹف میں فولڈ ہوتے ہیں"۔ ہسٹون فولڈ پروٹین کے ہسٹون پروٹین-پروٹین اور ڈی این اے-پروٹین تعاملات کی ارتقائی ساخت اور رینج میں ارتقائی خصلتوں کی ایک بہت وسیع رینج ہوتی ہے جو ڈھانچے اور دیگر پروٹین بناتی ہے۔ ہسٹون فولڈز انٹرفیس کی سطحوں کو دیکھتے وقت ہسٹون کے تعاملات کو محفوظ رکھتے ہوئے نیوکلیوسومل کور پارٹیکل میں ایک کردار ادا کرتے ہیں۔ ان میں ایک سے زیادہ ہسٹون فولڈ ہوتے ہیں۔ نیوکلیوسوم کور پارٹیکل کی ساخت میں دو طریقے ہوتے ہیں جن میں سب سے بڑی تعامل کی سطحیں ہوتی ہیں جو گروپ H3-H4 اور H2A-H2B ہیٹروٹائپک ڈائمر تعاملات میں ہوتی ہیں۔ H2A-H2A ڈھانچے کو دیکھتے وقت اس میں انٹرفیس پر لوپ کی ترمیم ہوتی ہے جو اسے دوسرے ڈھانچوں کے اسی انٹرفیس کے ساتھ کلسٹرنگ سے خارج کرتی ہے۔ جس کی وجہ سے یہ ٹرانسکرپشنل ایکٹیویشن میں ایک مختلف فنکشن رکھتا ہے۔ اس کے علاوہ سب سے لمبی ہیلکس زنجیروں کی وجہ سے دونوں طریقے الگ ہیں۔ یہ دو ہسٹون فولڈز کے درمیان ہاتھ ملانے کے تعاملات کا استعمال کرتے ہیں، جبکہ وہ اسے باقی طریقوں کے مقابلے میں خود کو منفرد بنانے کے لیے بھی استعمال کرتے ہیں۔ اسی طرح بنیادی نیوکلیوسوم ذرہ کے 5 اور 7 طریقے دو قسم کے ہسٹون فولڈ ڈائمرز کا استعمال کرتے ہیں جو یہ ظاہر کرتے ہیں کہ تمام ہسٹون ڈومینز ایک دوسرے کے ساتھ تعامل کرنے اور مختلف طریقوں سے تعامل کرنے کے قابل ہونے کے لیے ایک جیسی ساختی شکل کا اشتراک کرتے ہیں۔ یہ دکھانا کہ ہسٹون کی ساخت کتنی لچکدار اور موافقت پذیر ہے۔ H4 اور H2A ایک انٹرنیوکلیوسومل رابطے تشکیل دے سکتے ہیں جنہیں دو پیپٹائڈز کے درمیان آئنک تعاملات انجام دینے کے قابل ہونے کے لیے ایسیٹیلیٹ کیا جا سکتا ہے، جو بدلے میں آس پاس کے انٹرنیوکلیوسومل رابطوں کو تبدیل کر سکتے ہیں جو کرومیٹن کو کھولنے کا راستہ بنا سکتے ہیں۔ حوالہ جات پروٹین فولڈنگ مالیکیولر بائیولوجی