TATA box
سالماتی حیاتیات میں، ٹاٹا باکس (جسے گولڈ برگ-ہوگنیس باکس بھی کہا جاتا ہے) ڈی این اے کا ایک سلسلہ ہے جو آرکیا اور یوکیریوٹس میں جین کے بنیادی پروموٹر علاقے میں پایا جاتا ہے۔ ٹاٹا باکس کے بیکٹیریل ہومولوگ کو پربنو باکس کہا جاتا ہے جس کی اتفاق رائے کی ترتیب مختصر ہوتی ہے۔ ٹاٹا باکس کو غیر کوڈنگ ڈی این اے ترتیب سمجھا جاتا ہے (جسے سی آئی ایس-ریگولیٹری عنصر بھی کہا جاتا ہے)۔ اسے "ٹاٹا باکس" کہا جاتا تھا کیونکہ اس میں ایک متفقہ ترتیب ہوتی ہے جس کی خصوصیت ٹی اور اے بیس جوڑوں کو دہرانا ہے۔ "باکس" کی اصطلاح کی ابتدا کیسے ہوئی یہ واضح نہیں ہے۔ 1980 کی دہائی میں، ماؤس جینوم لوکی میں نیوکلیوٹائڈ کے سلسلے کی تحقیقات کرتے ہوئے، ہوگنیس باکس کا تسلسل پایا گیا اور-31 پوزیشن پر "باکسڈ ان" کیا گیا۔ جب متفقہ نیوکلیوٹائڈز اور متبادل کا موازنہ کیا گیا تو محققین نے ہم جنس پرست علاقوں کو "باکسڈ" کیا۔ ترتیب میں باکسنگ "باکس" کی اصطلاح کی ابتدا پر روشنی ڈالتی ہے۔ ٹاٹا باکس کی شناخت پہلی بار 1978 میں یوکرائیوٹک پروموٹروں کے ایک جزو کے طور پر کی گئی تھی۔ ٹرانسکرپشن ٹاٹا پر مشتمل جین میں ٹاٹا باکس پر شروع کی جاتی ہے۔ ٹاٹا باکس کچھ یوکرائیوٹک جینوں میں ٹاٹا بائنڈنگ پروٹین (ٹی بی پی) اور ٹرانسکرپشن کے دیگر عوامل کا بائنڈنگ سائٹ ہے۔ آر این اے پولیمریز II کے ذریعہ جین ٹرانسکرپشن کا انحصار طویل فاصلے تک ریگولیٹری عناصر جیسے بڑھانے والے اور سائلنسر کے ذریعہ بنیادی پروموٹر کے ضابطے پر ہوتا ہے۔ نقل کے مناسب ضابطے کے بغیر، یوکرائیوٹک جاندار اپنے ماحول کا مناسب جواب نہیں دے پائیں گے۔ ٹاٹا باکس کے آغاز کی ترتیب اور طریقہ کار کی بنیاد پر، اس اتفاق رائے کی ترتیب میں اندراج، حذف، اور پوائنٹ میوٹیشن جیسی تغیرات کے نتیجے میں فینوٹائپک تبدیلیاں آسکتی ہیں۔ یہ فینوٹائپک تبدیلیاں پھر ایک بیماری کے فینوٹائپ میں تبدیل ہو سکتی ہیں۔ ٹی اے ٹی اے باکس میں تغیرات سے وابستہ کچھ بیماریوں میں معدے کا کینسر، سپینوسیریبلر اٹیکسیا، ہنٹنگٹن کی بیماری، اندھا پن، β-تھیلیسیمیا، امیونوسوپریشن، گلبرٹ سنڈروم، اور ایچ آئی وی-1 شامل ہیں۔ ٹاٹا بائنڈنگ پروٹین (ٹی بی پی) کو وائرل ٹرانسکرپشن کے ذریعہ وائرس کے ذریعے بھی نشانہ بنایا جا سکتا ہے۔ ٹاٹا باکس پہلا یوکرائیوٹک کور پروموٹر موٹف تھا جس کی شناخت 1978 میں امریکی بائیو کیمسٹ ڈیوڈ ہوگنیس نے کی تھی جب وہ اور ان کے گریجویٹ طالب علم مائیکل گولڈ برگ سوئٹزرلینڈ کی یونیورسٹی آف باسل میں چھٹی پر تھے۔ انہوں نے سب سے پہلے ڈروسفیلا، ممالیہ اور وائرل جینوں میں 5 'ڈی این اے پروموٹر سیکوینسز کا تجزیہ کرتے ہوئے ٹاٹا سیکوینس دریافت کیا۔ ٹاٹا باکس آر این اے پولیمریز II کے ذریعے نقل شدہ پروٹین کوڈنگ جینوں میں پایا گیا تھا۔ ارتقاء کی تاریخ ٹاٹا باکس پر زیادہ تر تحقیق خمیر، انسان اور ڈروسفیلا جینومز پر کی گئی ہے، تاہم، اسی طرح کے عناصر آرکیا اور قدیم یوکرائٹس میں پائے گئے ہیں۔ آرکیا پرجاتیوں میں، پروموٹر 8 بی پی اے ٹی سے بھرپور ترتیب پر مشتمل ہوتا ہے جو ٹرانسکرپشن اسٹارٹ سائٹ کے اوپر 24 بی پی پر واقع ہوتا ہے۔ اس ترتیب کو اصل میں باکس اے کہا جاتا تھا، جو اب اس ترتیب کے طور پر جانا جاتا ہے جو آرکیئل ٹاٹا بائنڈنگ پروٹین (ٹی بی پی) کے ہومولوگ کے ساتھ تعامل کرتا ہے۔ اس کے علاوہ، اگرچہ کچھ مطالعات نے کئی مماثلتوں کو بے نقاب کیا ہے، لیکن کچھ ایسے بھی ہیں جنہوں نے آرکیئل اور یوکرائیوٹک ٹی بی پی کے درمیان قابل ذکر اختلافات کا پتہ لگایا ہے۔ آرکیا پروٹین اپنی بنیادی ترتیب میں اور الیکٹروسٹیٹک چارج کی تقسیم میں زیادہ ہم آہنگی ظاہر کرتا ہے، جو اہم ہے کیونکہ زیادہ ہم آہنگی پروٹین کی قطبی انداز میں ٹاٹا باکس کو باندھنے کی صلاحیت کو کم کرتی ہے۔ اگرچہ ٹاٹا باکس بہت سے یوکرائیوٹک پروموٹروں میں موجود ہے، لیکن یہ زیادہ تر پروموٹروں میں موجود نہیں ہے۔ ایک مطالعہ سے پتہ چلا ہے کہ 1031 ممکنہ پروموٹر علاقوں میں سے 30 فیصد سے بھی کم انسانوں میں ایک تخیلاتی ٹاٹا باکس موٹف پر مشتمل ہے۔ ڈروسفیلا میں 205 بنیادی پروموٹروں میں سے 40 فیصد سے بھی کم پر ٹاٹا باکس موجود ہے۔ جب ٹاٹا باکس کی عدم موجودگی ہوتی ہے اور ٹی بی پی موجود نہیں ہوتا ہے، تو ڈاون اسٹریم پروموٹر عنصر (ڈی پی ای) ابتدائی عنصر (انر) کے تعاون سے ٹرانسکرپشن فیکٹر II ڈی (ٹی ایف آئی آئی ڈی) سے منسلک ہوتا ہے، جو ٹاٹا کے بغیر پروموٹروں میں ٹرانسکرپشن شروع کرتا ہے۔ ڈی پی ای کی شناخت تین ڈروسفیلا ٹاٹا کے بغیر پروموٹروں اور ٹاٹا کے بغیر انسانی آئی آر ایف-1 پروموٹر میں کی گئی ہے۔ خصوصیات لوکیشن پروموٹر کے سلسلے بیکٹیریا اور یوکرائٹس کے درمیان مختلف ہوتے ہیں۔ یوکرائٹس میں، ٹاٹا باکس اسٹارٹ سائٹ کے اوپر 25 بیس جوڑوں پر واقع ہے جسے آر پی بی 4/آر بی پی 7 نقل شروع کرنے کے لیے استعمال کرتا ہے۔ میٹا زونس میں، ٹاٹا باکس ٹرانسکرپشن اسٹارٹ سائٹ کے اوپر کی طرف 30 بیس جوڑوں میں واقع ہے۔ جب کہ خمیر، ایس سیریوسی میں، ٹاٹا باکس کی متغیر پوزیشن ہوتی ہے جو اسٹارٹ سائٹ کے اوپر کی طرف 40 سے 100 بی پی تک ہو سکتی ہے۔ ٹی اے ٹی اے باکس جین کے 40 فیصد بنیادی پروموٹروں میں بھی پایا جاتا ہے جو خلیوں میں ایکٹین سائٹوسکیلیٹن اور سکڑنے والے آلات کے لیے کوڈ کرتے ہیں۔ بنیادی پروموٹر کی قسم ٹرانسکرپشن اور جین کے اظہار کی سطح کو متاثر کرتی ہے۔ ٹاٹا بائنڈنگ پروٹین (ٹی بی پی) کو دو طریقوں سے بھرتی کیا جا سکتا ہے، ایس اے جی اے کے ذریعے، جو آر این اے پولیمریز II کے لیے ایک کوفیکٹر ہے، یا ٹی ایف آئی آئی ڈی کے ذریعے۔ جب پروموٹر آر این اے پولیمریز II کو بھرتی کرنے کے لیے ایس اے جی اے/ٹی اے ٹی اے باکس کمپلیکس کا استعمال کرتے ہیں، تو وہ زیادہ منظم ہوتے ہیں اور بھرتی کے ٹی ایف آئی آئی ڈی/ٹی بی پی موڈ کا استعمال کرنے والے پروموٹروں کے مقابلے میں اظہار کی اعلی سطح کو ظاہر کرتے ہیں۔ بیکٹیریا میں، پروموٹر کے علاقوں میں ایک پربنو باکس ہو سکتا ہے، جو یوکرائیوٹک ٹاٹا باکس کے مترادف کام کرتا ہے۔ پربنو باکس میں 6 بی پی کا علاقہ ہے جو-10 پوزیشن کے ارد گرد مرکوز ہے اور-35 کے علاقے کے ارد گرد ایک 8-12 بی پی ترتیب ہے جو دونوں محفوظ ہیں۔ سی اے اے ٹی باکس (سی اے ٹی باکس بھی) نیوکلیوٹائڈز کا ایک خطہ ہے جس میں مندرجہ ذیل اتفاق رائے کی ترتیب ہوتی ہے: 5 'جی جی سی سی اے اے ٹی سی ٹی 3'۔ سی اے اے ٹی باکس ٹرانسکرپشن شروع کرنے والی جگہ کے اوپر کی طرف 75-80 اڈوں اور ٹاٹا باکس کے اوپر کی طرف تقریبا 150 اڈوں پر واقع ہے۔ یہ نقل کے عوامل (سی اے اے ٹی ٹی ایف یا سی ٹی ایف) کو باندھتا ہے اور اس طرح آر این اے پولیمریز کے آسان بائنڈنگ کے لیے قریبی ابتدائی کمپلیکس کو مستحکم کرتا ہے۔ سی اے اے ٹی بکس شاذ و نادر ہی ان جینوں میں پائے جاتے ہیں جو تمام خلیوں کی اقسام میں ہر جگہ موجود پروٹین کا اظہار کرتے ہیں۔ ساخت کی ترتیب اور پھیلاؤ ٹاٹا باکس یوکرائیوٹک کور پروموٹر کا ایک جزو ہے اور عام طور پر اتفاق رائے کی ترتیب 5 '-ٹاٹا (اے/ٹی) اے (اے/ٹی)-3' پر مشتمل ہوتا ہے۔ خمیر میں، مثال کے طور پر، ایک تحقیق سے پتہ چلا ہے کہ مختلف Saccharomyces جینومز میں اتفاق رائے کی ترتیب 5 '-TATA (A/T) A (A/T) (A/G)-3' تھی، پھر بھی خمیر کے جینوں میں سے صرف 20 فیصد میں ہی TATA ترتیب موجود تھی۔ اسی طرح، انسانوں میں صرف 24 فیصد جینوں میں پروموٹر ریجن ہوتے ہیں جن میں ٹاٹا باکس ہوتا ہے۔ ٹاٹا باکس پر مشتمل جین تناؤ کے ردعمل اور بعض قسم کے میٹابولزم میں شامل ہوتے ہیں اور ٹاٹا سے کم جینوں کے مقابلے میں زیادہ منظم ہوتے ہیں۔ عام طور پر، ٹی اے ٹی اے پر مشتمل جین سیل کی نشوونما، ڈی این اے کی نقل، نقل، اور ترجمہ جیسے ضروری سیلولر افعال میں شامل نہیں ہوتے ہیں کیونکہ ان کی انتہائی منظم نوعیت ہوتی ہے۔ ٹاٹا باکس عام طور پر ٹرانسکرپشن اسٹارٹ سائٹ کے اوپر کی طرف 25-35 بیس جوڑوں پر واقع ہوتا ہے۔ ٹاٹا باکس پر مشتمل جینوں کو عام طور پر اضافی پروموٹر عناصر کی ضرورت ہوتی ہے، بشمول ایک ابتدائی سائٹ جو ٹرانسکرپشن اسٹارٹ سائٹ کے بالکل اوپر کی طرف واقع ہے اور ایک ڈاون اسٹریم کور عنصر (ڈی سی ای)۔ یہ اضافی پروموٹر علاقے یوکرائٹس میں نقل کے آغاز کو منظم کرنے کے لیے ٹاٹا باکس کے ساتھ مل کر کام کرتے ہیں۔ نقل کے آغاز میں فنکشن کا کردار ٹاٹا باکس ابتدائی پیچیدہ تشکیل کا مقام ہے، جو یوکرائٹس میں نقل کے آغاز کا پہلا قدم ہے۔ ابتدائی کمپلیکس کی تشکیل اس وقت شروع ہوتی ہے جب ملٹی سب یونٹ ٹرانسکرپشن فیکٹر II D (TFID) اپنے ٹاٹا بائنڈنگ پروٹین (TBP) سب یونٹ پر ٹاٹا باکس سے جڑا ہوتا ہے۔ ٹی بی پی پروٹین میں مخالف متوازی β شیٹس کے علاقے کے ذریعے ٹاٹا باکس کی معمولی نالی سے جڑا ہوتا ہے۔ تین قسم کے سالماتی تعاملات ٹی بی پی کو ٹی اے ٹی اے باکس سے جڑے رہنے میں معاون ہوتے ہیں: ٹی بی پی پر موجود چار فینائلالینائن کے باقیات (پی ای 57، پی ای 74، پی ای 148، پی ای 165) ڈی این اے سے جڑے ہوتے ہیں اور ڈی این اے میں کنک بناتے ہیں، جس سے ڈی این اے کی معمولی نالی کھل جاتی ہے۔ ٹی بی پی امینو ایسڈ (اسن 27، اسن 117، تھر 82، تھر 173) (اور معمولی نالی میں اڈوں) پر قطبی سائیڈ چینز کے درمیان چار ہائیڈروجن بانڈ بنتے ہیں۔ ٹی بی پی کے باقیات (خاص طور پر الی 152 اور لیو 163) اور ڈی این اے اڈوں کے درمیان متعدد ہائیڈروفوبک تعاملات (~ 15) تشکیل پاتے ہیں، بشمول وین ڈیر والز قوتیں۔ مزید برآں، ٹی بی پی کے بائنڈنگ کو ٹاٹا باکس کے ساتھ ڈی این اے کے ساتھ تعاملات کو مستحکم کرکے سہولت فراہم کی جاتی ہے، جو جی-سی بھرپور ترتیبات پر مشتمل ہوتا ہے۔ یہ ثانوی تعاملات ڈی این اے کے موڑنے اور ہیلیکل ان وائنڈنگ کو جنم دیتے ہیں۔ ڈی این اے موڑنے کی ڈگری انواع اور ترتیب پر منحصر ہے۔ مثال کے طور پر، ایک تحقیق میں اڈینو وائرس ٹاٹا پروموٹر سیکوینس (5 '-سی جی سی ٹی اے اے اے اے جی جی سی-3') کو ایک ماڈل بائنڈنگ سیکوینس کے طور پر استعمال کیا گیا اور پتہ چلا کہ ٹاٹا باکس سے جڑے انسانی ٹی بی پی نے بڑی نالی کی طرف 97 ڈگری موڑ کو جنم دیا جبکہ خمیر ٹی بی پی پروٹین نے صرف 82 ڈگری موڑ کو جنم دیا۔ ٹی بی پی/ٹاٹا باکس کمپلیکس کے ایکس رے کرسٹلگرافی کے مطالعے عام طور پر اس بات پر متفق ہیں کہ ٹی بی پی بائنڈنگ کے عمل کے دوران ڈی این اے ~ 80° موڑ سے گزرتا ہے۔ ٹی بی پی کی طرف سے ٹاٹا باکس پر پابند ہونے سے پیدا ہونے والی تشخیصی تبدیلیاں اضافی نقل کے عوامل اور آر این اے پولیمریز II کو پروموٹر کے علاقے سے منسلک کرنے کی اجازت دیتی ہیں۔ ٹی ایف آئی آئی ڈی پہلے ٹاٹا باکس سے جڑا ہوتا ہے، جسے ٹی ایف آئی آئی اے کے ذریعے ٹی ایف آئی آئی ڈی کمپلیکس کے اوپری حصے سے جڑا جاتا ہے۔ اس کے بعد ٹی ایف آئی آئی بی ٹی ٹی اے ٹی اے باکس کے اوپر اور نیچے دونوں طرف تعاملات کے ذریعے ٹی ایف آئی آئی ڈی-ٹی ایف آئی آئی اے-ڈی این اے کمپلیکس سے منسلک ہوتا ہے۔ اس کے بعد آر این اے پولیمریز II کو ٹی ایف آئی آئی ایف کی مدد سے اس ملٹی پروٹین کمپلیکس میں بھرتی کیا جاتا ہے۔ اضافی نقل و حمل کے عوامل پھر پابند ہوتے ہیں، پہلے TFIIE اور پھر TFIIH۔ یہ یوکرائیوٹک ٹرانسکرپشن کے لیے ابتدائی کمپلیکس کی اسمبلی کو مکمل کرتا ہے۔ عام طور پر، ٹاٹا باکس آر این اے پولیمریز II پروموٹر علاقوں میں پایا جاتا ہے، حالانکہ کچھ ان وٹرو مطالعات سے یہ ظاہر ہوا ہے کہ آر این اے پولیمریز III ٹاٹا کے سلسلے کو پہچان سکتا ہے۔ آر این اے پولیمریز II اور ٹرانسکرپشن کے مختلف عوامل کا یہ مجموعہ بیسال ٹرانسکرپشنل کمپلیکس (بی ٹی سی) کے نام سے جانا جاتا ہے۔ اس حالت میں، یہ صرف ٹرانسکرپشن کی نچلی سطح دیتا ہے۔ نقل کی سطح کو بڑھانے کے لیے دیگر عوامل کو بی ٹی سی کی حوصلہ افزائی کرنی چاہیے۔ ڈی این اے کے بی ٹی سی محرک علاقے کی ایسی ہی ایک مثال سی اے اے ٹی باکس ہے۔ اضافی عوامل، بشمول میڈی ایٹر کمپلیکس، ٹرانسکرپشنل ریگولیٹری پروٹین، اور نیوکلیوسوم میں ترمیم کرنے والے انزائم بھی ویو میں ٹرانسکرپشن کو بڑھاتے ہیں۔ مخصوص خلیوں کی اقسام میں یا مخصوص پروموٹروں پر تعاملات ٹی بی پی کو کئی ٹی بی پی سے متعلق عوامل میں سے ایک سے تبدیل کیا جا سکتا ہے (ڈروسفیلا میں ٹی آر ایف 1، میٹازون میں ٹی بی پی ایل 1/ٹی آر ایف 2، ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں ٹی بی پی ایل 2/ٹی آر ایف 3)، جن میں سے کچھ ٹی بی پی کی طرح ٹی اے ٹی اے باکس کے ساتھ تعامل کرتے ہیں۔ مختلف قسم کے ایکٹیویٹرز یا ریپریسرز کے ساتھ ٹاٹا باکسز کا تعامل جینوں کی نقل و حمل کو کئی طریقوں سے متاثر کر سکتا ہے۔ افزودہ کرنے والے طویل فاصلے تک ریگولیٹری عناصر ہیں جو پروموٹر کی سرگرمی میں اضافہ کرتے ہیں جبکہ سائلنسر پروموٹر کی سرگرمی کو دباتے ہیں۔ تغیرات ٹاٹا باکس میں تغیرات حذف کرنے یا داخل کرنے سے لے کر نقطہ تغیر تک ہو سکتے ہیں جس کے مختلف اثرات اس جین کی بنیاد پر ہوتے ہیں جسے تبدیل کیا گیا ہے۔ تغیرات ٹرانسکرپشن کی شروعات کے لیے ٹاٹا بائنڈنگ پروٹین (ٹی بی پی) کے بائنڈنگ کو تبدیل کرتے ہیں۔ اس طرح، جین کی بنیاد پر فینوٹائپ میں نتیجے میں تبدیلی آتی ہے جس کا اظہار نہیں کیا جا رہا ہے (شکل 3)۔ اندراج یا حذف کرنا ٹاٹا باکس اتپریورتن کے ابتدائی مطالعات میں سے ایک نے آکٹوپین قسم کے سائٹوکینن جین کے لیے ایگروبیکٹیریم ٹیومیفیشینز سے ڈی این اے کی ترتیب کو دیکھا۔ اس مخصوص جین میں تین ٹاٹا بکس ہوتے ہیں۔ ایک فینوٹائپ تبدیلی صرف اس وقت دیکھی گئی جب تینوں ٹاٹا بکس کو حذف کر دیا گیا۔ آخری ٹاٹا باکس اور ٹرانسکرپشن اسٹارٹ سائٹ کے درمیان اضافی بیس جوڑوں کے داخل ہونے کے نتیجے میں اسٹارٹ سائٹ میں تبدیلی آئی ؛ اس طرح، ایک فینوٹائپک تبدیلی کا نتیجہ ہے۔ اس اصل اتپریورتن مطالعہ سے، نقل میں تبدیلی تب دیکھی جا سکتی ہے جب نقل کو فروغ دینے کے لیے کوئی ٹاٹا باکس نہ ہو، لیکن جین کی نقل تب ہوگی جب ترتیب میں کوئی اندراج ہو۔ داخل ہونے کی وجہ سے نتیجے میں فینوٹائپ کی نوعیت متاثر ہو سکتی ہے۔ مکئ کے فروغ دینے والوں میں تغیرات پودوں کے اعضاء کے مخصوص انداز میں فروغ دینے والے جینوں کے اظہار کو متاثر کرتے ہیں۔ ٹاٹا باکس کی نقل سکیوٹلم اور جڑوں میں انزیمیٹک سرگرمی میں نمایاں کمی کا باعث بنتی ہے، جس سے جرگ کی انزیمیٹک سطح متاثر نہیں ہوتی ہے۔ ٹاٹا باکس کو حذف کرنے سے سکیوٹیلم اور جڑوں میں انزیمیٹک سرگرمی میں تھوڑی کمی واقع ہوتی ہے، لیکن جرگ میں انزیمیٹک کی سطح میں بڑی کمی واقع ہوتی ہے۔ پوائنٹ میوٹیشنز ٹاٹا باکس میں پوائنٹ میوٹیشنز میں اسی طرح کی مختلف فینوٹائپک تبدیلیاں ہوتی ہیں جو اس جین پر منحصر ہوتی ہیں جو متاثر ہو رہا ہے۔ مطالعات سے یہ بھی پتہ چلتا ہے کہ ٹاٹا باکس کی ترتیب میں اتپریورتن کی جگہ ٹی بی پی کے پابند ہونے میں رکاوٹ بنتی ہے۔ مثال کے طور پر، ٹاٹا اے اے اے سے سی اے ٹی اے اے اے اے میں تغیر نقل کو تبدیل کرنے کے لیے بائنڈنگ میں مکمل طور پر رکاوٹ ڈالتا ہے، پڑوسی ترتیبات متاثر کر سکتے ہیں اگر کوئی تبدیلی ہو یا نہ ہو۔ تاہم، ٹاٹا اے اے اے سے ٹاٹا سی اے اے والے ہیلا خلیوں میں تبدیلی دیکھی جا سکتی ہے جس کی وجہ سے نقل میں 20 گنا کمی واقع ہوتی ہے۔ کچھ بیماریاں جو مخصوص جین ٹرانسکرپشن کی وجہ سے اس کی کمی کی وجہ سے ہو سکتی ہیں وہ ہیں: تھیلیسیمیا، پھیپھڑوں کا کینسر، دائمی ہیمولیٹک انیمیا، امیونوسوپریشن، ہیموفیلیا بی لیڈن، اور تھرومبوفلیبیٹس اور مایوکارڈیل انفکشن۔ ساوینکووا اور دیگر۔ ایک منتخب ٹاٹا باکس سیکوینس اور ٹی بی پی کے لیے کے ڈی ویلیو کی پیش گوئی کرنے کے لیے ایک تخروپن لکھا ہے۔ اس کا استعمال منتخب اتپریورتن کے نتیجے میں فینوٹائپک خصلتوں کی براہ راست پیش گوئی کے لیے کیا جا سکتا ہے جس کی بنیاد پر ٹی بی پی ٹی اے ٹی اے باکس سے کتنی مضبوطی سے جڑا ہوا ہے۔ بیماریاں ٹاٹا باکس کے علاقے میں تغیرات ٹرانسکرپشن کی شروعات کے لیے ٹاٹا بائنڈنگ پروٹین (ٹی بی پی) کے پابند ہونے کو متاثر کرتے ہیں، جس کی وجہ سے کیریئرز میں بیماری کا فینوٹائپ ہو سکتا ہے۔ معدے کے سرطان کا تعلق ٹاٹا باکس پولیمرفزم سے ہے۔ ٹاٹا باکس میں پی جی 2 جین کے ٹرانسکرپشن فیکٹر کے لیے ایک بائنڈنگ سائٹ ہے۔ یہ جین پی جی 2 سیرم تیار کرتا ہے، جو معدے کے کینسر میں ٹیومر کے لیے بائیو مارکر کے طور پر استعمال ہوتا ہے۔ ٹاٹا باکس کے لمبے سلسلے پی جی 2 سیرم کی اعلی سطح کے ساتھ منسلک ہوتے ہیں جو معدے کے کینسر کے حالات کی نشاندہی کرتے ہیں۔ چھوٹے ٹاٹا باکس سیکوینس والے کیریئر پی جی 2 سیرم کی نچلی سطح پیدا کر سکتے ہیں۔ کئی نیوروڈیجینریٹو عوارض ٹاٹا باکس میوٹیشن سے وابستہ ہیں۔ دو عوارض کو اجاگر کیا گیا ہے، سپینوسیریبلر اٹیکسیا اور ہنٹنگٹن کی بیماری۔ سپینوسیریبلر اٹیکسیا میں، یہ بیماری فینوٹائپ ٹاٹا بائنڈنگ پروٹین (ٹی بی پی) میں پولیگلوٹامین ریپیٹ کی توسیع کی وجہ سے ہوتی ہے۔ ان پولیگلوٹامین-ٹی بی پی خلیوں کا جمع ہونا واقع ہوگا، جیسا کہ مریضوں کے دماغ کے حصوں میں پروٹین کے مجموعے سے ظاہر ہوتا ہے، جس کے نتیجے میں نیورونل خلیوں کا نقصان ہوتا ہے۔ زیادہ موتیابند بننے کی وجہ سے اندھا پن ہو سکتا ہے جب آکسیڈیٹیو اسٹریس جین کی سطح کو بڑھانے کے لیے مائیکرو آر این اے کے ذریعے ٹاٹا باکس کو نشانہ بنایا جاتا ہے۔ مائیکرو آر این اے 3 '-غیر ترجمہ شدہ علاقے کو نشانہ بنا سکتے ہیں اور آکسیڈیٹیو تناؤ سے متعلق جینوں کی نقل کو چالو کرنے کے لیے ٹاٹا باکس سے منسلک ہو سکتے ہیں۔ ٹی اے ٹی اے بکسوں میں ایس این پیز بی-تھیلیسیمیا، امیونوسوپریشن، اور دیگر اعصابی عوارض سے وابستہ ہیں۔ ایس این پیز ٹی بی پی/ٹی اے ٹی اے کمپلیکس کو غیر مستحکم کرتے ہیں جس سے ٹی اے ٹی اے بائنڈنگ پروٹین (ٹی بی پی) ٹی اے ٹی اے باکس سے جڑے رہنے کی شرح میں نمایاں کمی واقع ہوتی ہے۔ اس سے ٹرانسکرپشن کی سطح کم ہوتی ہے جو بیماری کی شدت کو متاثر کرتی ہے۔ مطالعات کے نتائج نے اب تک وٹرو میں تعامل کو دکھایا ہے، لیکن نتائج ویو میں اس سے موازنہ ہوسکتے ہیں۔ گلبرٹ سنڈروم کا تعلق یو ٹی جی 1 اے 1 ٹاٹا باکس پولیمرفزم سے ہے۔ اس سے نوزائیدہ بچوں میں پیلیا ہونے کا خطرہ لاحق ہوتا ہے۔ مائیکرو آر این اے ایچ آئی وی-1 جیسے وائرس کی نقل تیار کرنے میں بھی کردار ادا کرتے ہیں۔ نوول ایچ آئی وی-1-انکوڈڈ مائیکرو آر این اے کو وائرس کی پیداوار کو بڑھانے کے ساتھ ساتھ ٹاٹا باکس کے علاقے کو نشانہ بنا کر ایچ آئی وی-1 تاخیر کو چالو کرنے کے لیے پایا گیا ہے۔ طبی اہمیت ٹیکنالوجی اب تک بہت سے مطالعات وٹرو میں کیے گئے ہیں، جو خلیوں میں کیا ہو رہا ہے اس کی حقیقی وقت کی نمائندگی نہیں بلکہ صرف اس کی پیش گوئی فراہم کرتے ہیں کہ کیا ہو سکتا ہے۔ ویو میں ٹاٹا بائنڈنگ سرگرمی کو ظاہر کرنے کے لیے 2016 میں حالیہ مطالعات کیے گئے ہیں۔ کینونکل ٹی بی پی/ٹی ایف آئی آئی ڈی پر منحصر بیسال ٹرانسکرپشن مشینری کے ذریعے ٹرانسکرپشن شروع کرنے کے لیے بنیادی پروموٹر مخصوص میکانزم کو حال ہی میں ویو میں دستاویزی شکل دی گئی ہے جس میں ٹی اے ٹی اے بائنڈنگ میں شامل انسانی اے سی ٹی بی جین کے ایس آر ایف پر منحصر اپ اسٹریم ایکٹیویٹنگ سیکوینس (یو اے ایس) کے ذریعے ایکٹیویشن کو دکھایا گیا ہے۔ کینسر تھراپی فارماسیوٹیکل کمپنیاں کئی سالوں سے روایتی طریقوں سے ڈی این اے کو نشانہ بنانے کے لیے کینسر تھراپی کی دوائیں ڈیزائن کر رہی ہیں، اور کامیاب ثابت ہوئی ہیں۔ تاہم، ان ادویات کی زہریلا پن نے سائنسدانوں کو ڈی این اے سے متعلق دیگر عمل تلاش کرنے پر مجبور کیا ہے جنہیں اس کے بجائے نشانہ بنایا جا سکتا ہے۔ حالیہ برسوں میں، کینسر کے مخصوص سالماتی اہداف کو تلاش کرنے کے لیے ایک اجتماعی کوشش کی گئی ہے، جیسے کہ پروٹین-ڈی این اے کمپلیکس، جس میں ٹی اے ٹی اے بائنڈنگ موٹف شامل ہے۔ وہ مرکبات جو پروٹین-ڈی این اے انٹرمیڈیٹ کو پھنساتے ہیں اس کے نتیجے میں ڈی این اے پروسیسنگ ایونٹ کا سامنا کرنے کے بعد یہ سیل کے لیے زہریلا ہو سکتا ہے۔ ایسے مرکبات پر مشتمل منشیات کی مثالوں میں ٹوپوٹیکن، ایس این-38 (ٹوپوآئسومیرس I)، ڈاکسوروبیسن، اور مائٹوکسینٹرون (ٹوپوآئسومیرس II) شامل ہیں۔ سسپلٹین ایک ایسا مرکب ہے جو ڈی این اے کی بڑی نالی میں ملحقہ گوانائنز سے ہم آہنگی سے جڑا ہوتا ہے، جو معمولی نالی میں ڈی این اے بائنڈنگ پروٹین تک رسائی کی اجازت دینے کے لیے ڈی این اے کو مسخ کرتا ہے۔ یہ ٹاٹا بائنڈنگ پروٹین (ٹی بی پی) اور ٹاٹا باکس کے درمیان تعامل کو غیر مستحکم کر دے گا۔ نتیجہ یہ ہے کہ ٹرانسکرپشن کی شروعات کو کم کرنے کے لیے ڈی این اے پر ٹاٹا بائنڈنگ پروٹین (ٹی بی پی) کو متحرک کرنا ہے۔ جینیاتی انجینئرنگ ٹاٹا باکس ترمیم ارتقاء کی تبدیلیوں نے پودوں کو بدلتے ہوئے ماحولیاتی حالات کے مطابق ڈھالنے پر مجبور کیا ہے۔ زمین کی تاریخ میں، زمین کے ایروبک ماحول کی نشوونما کے نتیجے میں پودوں میں آئرن کی کمی واقع ہوئی۔ اسی نوع کے دیگر ارکان کے مقابلے میں، مالوس باکاٹا ور۔ شیاجینینسس میں ایک ٹاٹا باکس ہوتا ہے جو آئرن ریگولیٹڈ ٹرانسپورٹر 1 (آئی آر ٹی 1) پروموٹر کے پروموٹر کے اوپر کی طرف ڈالا جاتا ہے۔ نتیجے کے طور پر، پروموٹر سرگرمی کی سطحوں میں اضافہ ہوتا ہے، جس سے ٹی ایف آئی آئی ڈی سرگرمی میں اضافہ ہوتا ہے اور اس کے نتیجے میں نقل و حمل کا آغاز ہوتا ہے، جس کے نتیجے میں زیادہ آئرن ایفیشنٹائپ ہوتا ہے۔ یہ بھی دیکھیں کہ پربنو باکس انیشی ایٹر عنصر کوزک اتفاق رائے ترتیب حوالہ جات ریگولیٹری ترتیبات 1978 حیاتیات میں