PDBREPORT
پی ڈی بی آر ای پی آر ٹی ڈیٹا بیس پروٹین ڈیٹا بینک میں حیاتیاتی مالیکیولز کے ڈھانچوں میں پائی جانے والی بے ضابطگیوں اور غلطیوں کا ڈیٹا بیس ہے۔ پی ڈی بی آر ای پی آر ٹی ایس ڈیٹا بیس سلیکو پروٹین ڈھانچے کے بائیو انفارمیٹکس منصوبوں میں پروٹین ڈھانچے کے معیار کا اندازہ لگانے کے لیے ایک مفید سہولت ہے، اور سی اے ایس پی ہومیولوجی ماڈلنگ 'مقابلہ' کے شرکاء کے ذریعے کثرت سے استعمال کیا گیا ہے۔ پی ڈی بی آر ای پورٹس واٹ چیک سافٹ ویئر کا استعمال کرتے ہوئے بنائے جاتے ہیں۔ واٹ _ چیک واٹ آئی ایف سافٹ ویئر کا آپشن ہے جو میکرو مالیکیولز (خاص طور پر پروٹین) کی توثیق کرتا ہے۔ بہت سے واٹ چیک آپشن معمول کی اقدار کا تعین کرتے ہیں۔ یعنی معیاری انحراف کی تعداد جو کوئی بھی مشاہدہ اپنے اوسط سے ہٹ جاتا ہے۔ اور زیادہ تر معاملات میں ایسے واقعات کو درج کیا جاتا ہے اگر انحراف 4 سگما سے زیادہ ہو، جس کا مطلب ہے کہ درج شدہ بے ضابطگیوں میں سے دس ہزار میں سے ایک حقیقی ہے اور غلطی نہیں ہے۔ واٹ چیک پیجز کا سیکشن 'توثیق' مزید تفصیل کے ساتھ اس کی وضاحت کرتا ہے۔ مسائل PDBREPORT اندراجات کو PDB میں جمع شدہ میکرو مالیکیولر ڈھانچوں کے لیے ایرر رپورٹس کے طور پر دیکھا جا سکتا ہے۔ ایرر رپورٹ کی اصطلاح کو احتیاط کے ساتھ استعمال کیا جانا چاہیے کیونکہ واٹ چیک سافٹ ویئر جو پی ڈی بی آر ای پی آر ٹی پیدا کرتا ہے، چار معیاری انحراف یا اس سے زیادہ کی ہر بے ضابطگی کو غلطی کے طور پر ظاہر کرتا ہے۔ ان میں سے کچھ رپورٹ شدہ بے ضابطگیاں غلطیوں کے بجائے اوسط سے حقیقی انحراف ہو سکتی ہیں۔ حوالہ جات ساختی بائیو انفارمیٹکس پروٹین ڈھانچہ حیاتیاتی ڈیٹا بیس