Acidithiobacillus
ایسڈیتھوبیسلس "سیوڈوموناڈوٹا" فایلم میں ایسڈیتھوبیسلیا کی ایک جینس ہے۔ اس جینس میں ایسڈفوفیلک مائکروجنزموں کی دس اقسام شامل ہیں جو سلفر اور/یا آئرن آکسیڈیشن کے قابل ہیں: ایسڈیتیوبیسلس البرٹینسس، ایسڈیتیوبیسلس کالڈس، ایسڈیتیوبیسلس کپریتھرمیکس، ایسڈیتیوبیسلس فیریئنس، ایسڈیتیوبیسلس فیریڈورانس، ایسڈیتیوبیسلس فیریفیلس، ایسڈیتیوبیسلس فیریورانس، ایسڈیتیوبیسلس فیریورانس، ایسڈیتیوبیسلس فیری آکسائڈانس، ایسڈیتیوبیسلس سلفورفیلس، اور ایسڈیتیوبیسلس تھیو آکسائڈانس۔ اے فیرو آکسیڈن اس نسل کا سب سے زیادہ وسیع پیمانے پر مطالعہ کیا گیا ہے، لیکن اے کالڈس اور اے تھیو آکسیڈن بھی تحقیق میں اہم ہیں۔ تمام "سیوڈوموناڈوٹا" کی طرح، ایسڈیتھیوبیسلس ایس پی پی۔ گرام نیگیٹیو اور نان سپور بنانے والے ہوتے ہیں۔ وہ ایسڈ مائن ڈرینیج کی پیداوار میں بھی اہم کردار ادا کرتے ہیں جو کان کنی کی صنعت کے اندر ایک بڑا عالمی ماحولیاتی چیلنج ہے۔ ایسڈیتھیوبیسلس کی کچھ انواع بائیولیچنگ اور بائیومیننگ میں استعمال ہوتی ہیں۔ تیزابیت والے ماحول میں ان بیکٹیریا کی بقا میں مدد کرنے والے جینوں کا ایک حصہ افقی جین کی منتقلی کے ذریعے حاصل کیا گیا ہے۔ جینس ایسڈیتھوبیسلس ایسڈیتھوبیسلس کیمولیتھو آٹوٹروفس ہیں جو ایسڈوفیلک، میسوفیلک، یا میسوتھرموفیلک کے طور پر پائے جا سکتے ہیں۔ ایسڈیتیوبیسلس کالڈس بھی مکسٹروفک طور پر بڑھ سکتا ہے۔ فی الحال، جینس دس انواع پر مشتمل ہے جو سلفر مرکبات کو آکسائڈائز کرکے توانائی حاصل کرنے کی صلاحیت رکھتی ہیں، بعض انواع بھی فیرس اور فیرک آئرن دونوں کا استعمال کرتی ہیں۔ کچھ انواع ماحول سے ہائیڈروجن اور نائٹروجن استعمال کرنے کے لیے بھی تیار ہوئی ہیں۔ وہ کیلون-بینسن-باسھم سائیکل کے ٹرانسالڈولیز قسم کا استعمال کرتے ہوئے کاربن ڈائی آکسائیڈ سے کاربن کو جذب کرتے ہیں۔ جینس متحرک، چھڑی کی شکل کے خلیوں پر مشتمل ہے جنہیں کم پی ایچ ماحول سے الگ کیا جا سکتا ہے جس میں بصورت دیگر غیر جانبدار معدنی اناج پر کم پی ایچ مائکرو ماحولیات بھی شامل ہیں۔ فائیلوجینی ایسڈیتھوبیسیلیلز آرڈر (یعنی۔ تھرمتھیوبیسلس) پہلے گاماپروٹوبیکٹیریا کے ممبر تھے، ان کی پوزیشن کے بارے میں کافی بحث کے ساتھ اور یہ کہ وہ بیٹاپروٹوبیکٹیریا کے اندر بھی آسکتے ہیں، لیکن صورتحال کو پورے جینوم کی صف بندی کے مطالعے سے حل کیا گیا اور دونوں نسلوں کو نئی کلاس ایسڈیتیوبیسلیا میں دوبارہ درجہ بندی کیا گیا ہے۔ اس نسل کے کچھ ارکان کو تھیوبیسلس ایس پی پی کے طور پر درجہ بند کیا گیا تھا، اس سے پہلے کہ انہیں 2000 میں دوبارہ درجہ بند کیا گیا۔ ایسڈیتیوبیسلس فیرو آکسائڈنس (باسونیم تھیوبیسلس فیرو آکسائڈنس) کو آئرن سلفر معدنیات جیسے پائیرائٹ کے ذخائر، آکسائڈائزنگ آئرن اور سلفر سے توانائی کے ذرائع کے طور پر الگ کیا جا سکتا ہے تاکہ آٹوٹروفک نمو میں مدد مل سکے اور فیرک آئرن اور سلفورک ایسڈ تیار کیا جا سکے۔ ایسڈیتیوبیسلس تھیو آکسائڈنس (باسونیم تھیوبیسلس تھیو آکسائڈنس، تھیوبیسلس کنکریٹیوورس) سلفر کو آکسائڈائز کرتا ہے اور سلفورک ایسڈ پیدا کرتا ہے۔ سب سے پہلے مٹی سے الگ تھلگ، یہ بھی مشاہدہ کیا گیا ہے کہ سیوریج گیس میں ہائیڈروجن سلفایڈ کو سلفورک ایسڈ میں تبدیل کرکے کنکریٹ سیوریج پائپوں کے بائیوجینک سلفایڈ کے کٹاؤ کا سبب بنتا ہے۔ ایسڈوتھیوبیسلس کے اندر بائیولیچنگ پرجاتیوں کو بائیو ہائیڈرو میٹالرجی انڈسٹری میں بائیولیچنگ اور بائیو مائننگ نامی طریقوں میں استعمال کیا جاتا ہے، جس کے ذریعے دھاتوں کو بیکٹیریل آکسیکرن کے ذریعے ان کی کچ دھاتوں سے نکالا جاتا ہے۔ بائیو مائننگ تابکار فضلہ کو بیکٹیریا کے ساتھ دھات کے طور پر استعمال کرتی ہے تاکہ سونا، پلاٹینم، پولونیم، ریڈون، ریڈیم، یورینیم، نیپٹونیم، امریکیم، نکل، مینگنیج، برومین، مرکری اور ان کے آاسوٹوپس حاصل کیے جا سکیں۔ 1950 میں کولمر، ٹیمپل اور ہنکل کے ذریعہ اس کی دریافت کے بعد سے ایسڈیتیوبیسلس فیرو آکسیڈن بائیو ہائیڈرو میٹالرجی کے میدان میں سلفایڈ کچ دھاتوں کے اخراج میں معاشی طور پر ایک اہم جراثیم کے طور پر ابھرا ہے۔ اے فیرو آکسیڈنز کی دریافت "بائیو ہائیڈرو میٹالرجی" کی ترقی کا باعث بنی، جو معدنیات یا ٹھوس فضلہ اور تیزاب کی کان کی نکاسی سے دھاتوں کے مائکروبیل ثالثی نکالنے کے تمام پہلوؤں سے متعلق ہے۔ A. کم درجے کی سلفایٔڈ کچ دھاتوں کو تحلیل کرنے کے لیے فیرو آکسیڈانس کو ایک طاقتور لیچنگ جاندار کے طور پر ثابت کیا گیا ہے۔ حال ہی میں، معدنی ارتکاز کے علاج کے ساتھ ساتھ بیچ یا مسلسل بہاؤ والے ری ایکٹروں کا استعمال کرتے ہوئے پیچیدہ سلفایٔڈ کچ دھاتوں پر توجہ مرکوز کی گئی ہے۔ Acidithiobacillus ferrooxidans عام طور پر تیزاب کی کان کی نکاسی اور کان کی دم میں پایا جاتا ہے۔ فیرس آئرن کی آکسیکرن اور سلفر آکسیانیئنز، دھاتی سلفایڈ اور ابتدائی سلفر میں کمی کے نتیجے میں سلفورک ایسڈ میں فیرک سلفیٹ کی پیداوار ہوتی ہے، اس کے نتیجے میں دھاتوں اور دیگر مرکبات میں گھلنشیلتا پیدا ہوتی ہے۔ نتیجے کے طور پر، اے فیرو آکسیڈن بائیو ریمیڈیشن کے عمل کے لیے دلچسپی کا باعث ہو سکتے ہیں۔ ایسڈیتھوبیسلس عام طور پر زنگ کی نمائش کرنے والے علاقوں میں نالوں کی اندرونی سطحوں پر بھی وافر مقدار میں پایا جاتا ہے۔ جینیاتی ترتیب عام پرجاتیوں کی طرح ایسڈوتھیوبیسلس تھیو آکسائڈنس کی شناخت کرتی ہے، حالانکہ یہ کبھی کبھار ایسے مقامات سے غائب ہوتا ہے۔ مورفولوجی ایسڈیتھیوبیسلس ایس پی پی۔ نشوونما کے حالات کے لحاظ سے یہ ایک خلیے کے طور پر یا کبھی کبھار جوڑوں یا زنجیروں میں پائے جاتے ہیں۔ انتہائی متحرک انواع کے ساتھ ساتھ غیر متحرک انواع بھی بیان کی گئی ہیں۔ موٹائل تناؤ میں اے البرٹینسیس کے استثناء کے ساتھ ایک ہی فلیگیلم ہوتا ہے، جس میں پولر فلاجیلا اور گلائکوکلیکس کا ٹفٹ ہوتا ہے۔ نائٹروجن فکسشن بھی ایک اہم ماحولیاتی فعل ہے جو اس نسل کی کچھ انواع کے ذریعہ انجام دیا جاتا ہے، جیسا کہ سالماتی ہائیڈروجن کو توانائی کے ذریعہ کے طور پر استعمال کرتے ہوئے نشوونما ہوتی ہے-نہ ہی ہر نوع میں کوئی خاصیت پائی جاتی ہے۔ فیرک آئرن کو کچھ انواع ٹرمینل الیکٹران قبولیت کے طور پر استعمال کر سکتی ہیں۔ ارتقاء ایسڈیٹیوبیسلس ایس پی پی۔ وہ متنوع ماحول میں رہنے کے لیے جانے جاتے ہیں جیسے گرم چشمے، تیزاب کی کان کی نکاسی (کان کی نکاسی چھوڑ دی گئی) یا کان کی دم، تیزابیت والی مٹی، اور سلفیڈک غار۔ زمینی گرم چشمے فی الحال ایک اہم تحقیقی مرکز ہیں کیونکہ وہ جینس کے لیے معروف محدود حالات فراہم کر سکتے ہیں، لیکن مائکروبیل کمیونٹیز کی میزبانی کرتے ہیں جن میں بعض اوقات ایسڈیتھوبیسلس موجود ہوتے ہیں۔ ان بیکٹیریا کے لیے زیادہ سے زیادہ پی ایچ کے حالات انواع کے لحاظ سے مختلف ہوتے ہیں، لیکن کچھ پی ایچ کے حالات میں جینس کی سطح پر 8.94 تک اور درجہ حرارت 97.6 ڈگری سیلسیس تک دیکھا گیا ہے۔ ایسڈیتھیوبیسلس کی تمام انواع پی ایچ اور درجہ حرارت کے حالات کے تحت 0.5 سے 6.6 اور 5 ڈگری سیلسیس سے 52 ڈگری سیلسیس کے درمیان بڑھ سکتی ہیں۔ وہ بھاری دھاتوں کے لیے انتہائی روادار ہیں اور ایسے ماحول میں پھل سکتے ہیں جہاں ان دھاتوں کی زیادہ مقدار موجود ہو۔ توانائی حاصل کرنے کے لیے، وہ سلفر کے آکسیکرن کو سالماتی آکسیجن میں جوڑنے کے لیے تیار ہوئے ہیں لیکن اپنے ارد گرد کے دیگر وسائل کو الیکٹران ڈونرز یا قبولیت کے طور پر بھی استعمال کر سکتے ہیں۔ انہوں نے افقی جین کی منتقلی کے ذریعے ان ماحول میں رہنے کے لیے موافقت اختیار کی ہے، لیکن جس بنیاد کے ذریعے وہ کم پی ایچ ماحول میں زندہ رہ سکتے ہیں وہ ممکنہ طور پر عمودی جین کی منتقلی کے ذریعے تیار ہوا ہے۔ یہ ممکن ہے کہ ایسڈیتھوبیسلس میں تیزاب مزاحمت کے بنیادی جین سب سے پہلے نیوٹروفائل، ممکنہ طور پر تھرموفیلک سے وراثت میں ملے تھے، اور ان کی پوری ارتقائی تاریخ میں مزید تیزاب مزاحمت جین پڑوسی ایسڈوفائلز سے حاصل کیے گئے تھے۔ اگرچہ سلفر آکسیکرن کی خاصیت جینس میں ہر جگہ موجود ہے، لیکن آئرن آکسیکرن اے فیرو آکسیڈنز، اے فیریڈورانس، اے فیریفیلس، اے فیریوورانس، اور اے فیریئنس کے لیے مخصوص ہے۔ جدید دور کے ایسڈیتھوبیسلس ایس پی پی میں منتقلی۔ یہ سینکڑوں لاکھوں سالوں میں ہوا ہے جس میں جین کے حصول اور جین کے نقصان کے واقعات شامل ہیں۔ کچھ شواہد ایسڈیتھوبیسلس کے حالیہ مشترکہ آباؤ اجداد کی طرف اشارہ کرتے ہیں جو تقریبا اسی وقت نمودار ہوئے جب 800 ملین سال پہلے اے کالڈس ظاہر ہوا تھا۔ Acidithiobacillus ایک نمایاں طور پر متنوع جینس ہے، انواع نے مختلف حدود جیسے تیزابیت، درجہ حرارت، اور غذائیت کی دستیابی کے تحت مختلف ماحول میں زندہ رہنے کے لیے ڈھال لیا ہے۔ مثال کے طور پر اے۔ کالڈس، جو کہ جینس کا واحد معلوم تھرمواسیڈوفائل ہے، انتہائی درجہ حرارت میں 52 ڈگری سیلسیس تک زندہ رہنے میں ماہر ہے، جبکہ اے۔ فیرو آکسیڈن پی ایچ <1 کے ساتھ انتہائی تیزابی حالات میں زندہ رہ سکتے ہیں۔ ایسڈیتھوبیسلیا کلاس کی میٹابولک خصوصیات میں انزائموں کی موجودگی شامل ہے جو سلفر میٹابولزم میں ہائیڈروجن سلفایڈ، ایلیمینٹل سلفر، تھیوسلفیٹ، اور ٹیٹرا تھیونیٹ کے استعمال میں مدد کرتی ہیں۔ آئرن آکسیڈیشن کی صلاحیت رکھنے والی انواع میں ایسے جین بھی ہوتے ہیں جو نائٹروجن فکسشن اور ہائیڈروجن کے استعمال کے لیے کوڈ کیے جاتے ہیں۔ جینومک ساخت میں تنوع ان ہی پرجاتیوں کو ایروبک اور اینیروبک دونوں ماحول میں رہنے کی اجازت دیتا ہے۔ تلیوارا مائن تھیوبیسلس تھرمیتھیوبیسلس ایسڈوفائلز ان ایسڈ مائن ڈرینیج حوالہ جات بیرونی روابط ایسڈیتھیوبیسلس فیرو آکسائڈنس اے ٹی سی سی 23270 جینوم پیج تھیوبیسلس ایس پی بھی دیکھیں۔ بیک ڈائیو میں ایسڈیتھوبیسلس فیرو آکسیڈنز کی قسم کا تناؤ-بیکٹیریل تنوع میٹاڈیٹابیس ایسڈیتھوبیسلیا بیکٹیریا جنرا