KH domain
کے ہومیولوجی (کے ایچ) ڈومین ایک پروٹین ڈومین ہے جس کی شناخت سب سے پہلے ہیومن ہیٹرجینیئس نیوکلیئر ربنیوکلیوپروٹین (ایچ این آر این پی) کے میں کی گئی تھی۔ تقریبا 70 امینو ایسڈ کی ایک ارتقائی طور پر محفوظ ترتیب، کے ایچ ڈومین مختلف قسم کے نیوکلک ایسڈ بائنڈنگ پروٹین میں موجود ہے۔ کے ایچ ڈومین آر این اے کو باندھتا ہے، اور آر این اے کی شناخت میں کام کر سکتا ہے۔ یہ کئی پروٹینوں میں متعدد نقلوں میں پایا جاتا ہے، جہاں وہ باہمی تعاون سے یا آزادانہ طور پر کام کر سکتے ہیں۔ مثال کے طور پر، اے یو سے بھرپور عنصر آر این اے بائنڈنگ پروٹین کے ایس آر پی میں، جس میں 4 کے ایچ ڈومینز ہیں، کے ایچ ڈومینز 3 اور 4 اے یو سے بھرپور آر این اے اہداف کے مختلف علاقوں کے ساتھ تعامل کرنے کے لیے آزاد بائنڈنگ ماڈیولز کے طور پر برتاؤ کرتے ہیں۔ ایف ایم آر 1 کے پہلے کے ایچ ڈومین اور ایچ این آر این پی کے کے سی-ٹرمینل کے ایچ ڈومین کے حل کے ڈھانچے کا تعین نیوکلیئر مقناطیسی گونج (این ایم آر) سے ہوتا ہے جس سے بیٹا-الفا-الفا-بیٹا-الفا ڈھانچہ ظاہر ہوتا ہے۔ ایک کے ایچ ڈومین پروٹین، نووا 1 کے آٹو اینٹی باڈیز، پیرانوپلاسٹک اوپسوکلونس اٹیکسیا کا سبب بنتے ہیں۔ کے ایچ ڈومین رائبوسومل پروٹین ایس 3 کے این-ٹرمینس پر پایا جاتا ہے۔ یہ ڈومین اس لحاظ سے غیر معمولی ہے کہ اس میں عام کے ایچ ڈومین کے مقابلے میں مختلف فولڈ ہوتا ہے۔ نیوکلک ایسڈ بائنڈنگ کے ایچ ڈومینز یا تو آر این اے یا سنگل اسٹرینڈڈ ڈی این اے سے جڑے ہوتے ہیں۔ نیوکلک ایسڈ ڈومین کے ایک طرف ایک توسیعی تشکیل میں جڑا ہوا ہے۔ بائنڈنگ الفا ہیلکس 1، الفا ہیلکس 2، جی ایکس ایکس جی لوپ (جس میں انتہائی محفوظ سیکوینس موٹف ہوتا ہے) اور متغیر لوپ کے درمیان بنے شگاف میں ہوتی ہے۔ بائنڈنگ کلیفٹ فطرت میں ہائیڈروفوبک ہے جس میں کمپلیکس کو مستحکم کرنے کے لیے مختلف قسم کے اضافی پروٹین مخصوص تعاملات ہوتے ہیں۔ والورڈے اور ان کے ساتھیوں نے نوٹ کیا کہ، "نیوکلک ایسڈ بیس ٹو پروٹین ارومیٹک سائیڈ چین اسٹیکنگ انٹرایکشنز جو دیگر اقسام کے سنگل اسٹرینڈڈ نیوکلک ایسڈ بائنڈنگ موفٹس میں رائج ہیں، کے ایچ ڈومین نیوکلک ایسڈ کی شناخت میں نمایاں طور پر غیر حاضر ہیں"۔ ساختی گروپ ساختی طور پر کے ایچ ڈومینز کی دو مختلف اقسام ہیں جن کی شناخت گریشین نے کی ہے جنہیں ٹائپ I اور ٹائپ II کہا جاتا ہے۔ ٹائپ I ڈومینز بنیادی طور پر یوکرائیوٹک پروٹینز میں پائے جاتے ہیں، جبکہ ٹائپ II ڈومینز بنیادی طور پر پروکیریوٹس میں پائے جاتے ہیں۔ اگرچہ دونوں اقسام میں کم سے کم اتفاق رائے کی ترتیب کا موٹف مشترک ہے لیکن ان کے مختلف ساختی فولڈ ہوتے ہیں۔ ٹائپ I کے ایچ ڈومینز میں تین پھنسے ہوئے بیٹا شیٹ ہوتے ہیں جہاں تینوں اسٹرینڈز مخالف متوازی ہوتے ہیں۔ ٹائپ II ڈومین میں تین بیٹا اسٹرینڈز میں سے دو متوازی سمت میں ہیں۔ جبکہ ٹائپ I ڈومینز عام طور پر پروٹین کے اندر متعدد کاپیوں میں پائے جاتے ہیں، ٹائپ II عام طور پر فی پروٹین ایک ہی کاپی میں پائے جاتے ہیں۔ اس ڈومین پر مشتمل انسانی پروٹین اے کے اے پی 1 ؛ اے این کے ایچ ڈی 1 ؛ اے این کے آر ڈی 17 ؛ اے ایس سی سی 1 ؛ بی آئی سی سی 1 ؛ ڈی ڈی ایکس 43 ؛ ڈی ڈی ایکس 53 ؛ ڈی پی پی اے 5 ؛ ایف ایم آر 1 ؛ ایف یو بی پی 1 ؛ ایف یو بی پی 3 ؛ ایف ایکس آر 1 ؛ ایف ایکس آر 2 ؛ جی ایل ڈی 1 ؛ ایچ ڈی ایل بی پی ؛ ایچ این آر پی کے ؛ آئی جی ایف 2 بی پی 1 ؛ آئی جی ایف 2 بی پی 2 ؛ آئی جی ایف 2 بی پی 3 ؛ کے ایچ ڈی آر بی ایس 1 ؛ کے ایچ ڈی آر بی ایس 2 ؛ کے ایچ ڈی آر بی ایس 3 ؛ کے ایچ ایس آر پی ؛ کے آر آر 1 ؛ میکس 3 اے ؛ میکس 3 بی ؛ میکس 3 سی ؛ میکس 3 ڈی ؛ نووا 1 ؛ نووا 2 ؛ پی سی بی پی 1 ؛ پی سی بی پی 2 ؛