Pseudomonas syringae
سیوڈوموناس سرنجی ایک چھڑی کی شکل کا، گرام منفی جراثیم ہے جس میں پولر فلیجیلا ہوتا ہے۔ پودوں کے پیتھوجین کے طور پر، یہ انواع کی ایک وسیع رینج کو متاثر کر سکتا ہے، اور 50 سے زیادہ مختلف پیتھوورز کے طور پر موجود ہے، یہ سب این سی پی پی بی، آئی سی ایم پی، اور دیگر جیسے بین الاقوامی ثقافت کے مجموعوں کے محققین کے لیے دستیاب ہیں۔ سیوڈوموناس سرنجی جینس سیوڈوموناس کا ایک رکن ہے، اور 16 ایس آر آر این اے تجزیہ کی بنیاد پر، اسے پی سرنجی گروپ میں رکھا گیا ہے۔ اس کا نام للاک کے درخت (سرنگا ولگرس) کے نام پر رکھا گیا ہے، جس سے اسے پہلی بار الگ کیا گیا تھا۔ پورے سیوڈوموناس جینس کے 494 مکمل جینوموں کے فائیلوجینیمی تجزیے سے پتہ چلتا ہے کہ پی سرنج سخت معنوں میں مونوفائلیٹک نوع نہیں بناتی، بلکہ ایک وسیع تر ارتقائی گروہ ہے جس میں دیگر انواع بھی شامل ہیں، جیسے پی۔ ایویلانی، پی۔ ساواستانوئی، پی۔ امیگڈالی، اور پی۔ سیراسی۔ سیوڈوموناس سرنج ارجنائن ڈائی ہائیڈرولیز اور آکسیڈیز سرگرمی کے لیے منفی جانچ کرتا ہے، اور سکروس غذائیت اگر پر پولیمر لیون بناتا ہے۔ بہت سے، لیکن تمام نہیں، تناؤ لیپوڈیپسینوپیپٹائڈ پلانٹ ٹاکسن سرنگومیسن کا سراغ لگاتے ہیں، اور جب کنگز بی میڈیم پر وٹرو میں کلچر کیا جاتا ہے تو یہ سائڈروفور پیوورڈن کی پیداوار کا سبب بنتا ہے۔ سیوڈوموناس سرنج آئس نیوکلیئشن ایکٹیو (آئی این اے) پروٹین بھی تیار کرتا ہے جو پانی (پودوں میں) کو کافی زیادہ درجہ حرارت پر منجمد کرنے کا سبب بنتا ہے، جس کے نتیجے میں چوٹ لگتی ہے۔ 1970 کی دہائی سے، پی سرنگے کو ایک ماحولیاتی "حیاتیاتی آئس نیوکلیٹر" کے طور پر شامل کیا گیا ہے، جس میں ہوا سے پیدا ہونے والے بیکٹیریا کلاؤڈ کنڈینسیشن نیوکلئی کے طور پر کام کرتے ہیں۔ حالیہ شواہد سے پتہ چلتا ہے کہ یہ انواع بارش اور برف پیدا کرنے میں پہلے کے خیال سے بڑا کردار ادا کرتی ہیں۔ وہ اولوں کے کور میں بھی پائے گئے ہیں، جو حیاتیاتی بارش میں مدد کرتے ہیں۔ یہ آئی این اے پروٹین مصنوعی برف بنانے میں بھی استعمال ہوتے ہیں۔ سیوڈوموناس سرنج پیتھوجینسیس کا انحصار ایفیکٹر پروٹین پر ہوتا ہے جو بیکٹیریل ٹائپ III سراو کے نظام کے ذریعے پودوں کے خلیے میں خارج ہوتا ہے۔ پی سرنگے میں ہاپ جینز کے ذریعے انکوڈ کیے گئے تقریبا 60 مختلف قسم کے III اثر کنبوں کی نشاندہی کی گئی ہے۔ ٹائپ III ایفیکٹر بنیادی طور پر پودوں کے دفاع کو دبانے میں اپنے کردار کے ذریعے پیتھوجینسیس میں حصہ ڈالتے ہیں۔ تین پی سرنجیوں کے تناؤ کے لیے جینوم کی ترتیب کی ابتدائی دستیابی اور عربی ڈوپسس تھالیانا، نیکوٹیانا بینتھامیانا، اور ٹماٹر سمیت اچھی خصوصیات والے میزبان پودوں پر بیماری کا سبب بننے کے لیے منتخب تناؤ کی صلاحیت کی وجہ سے، پی سرنجیوں نے پودوں اور پیتھوجین کے تعاملات کی سالماتی حرکیات کی تجرباتی خصوصیت کے لیے ایک اہم ماڈل سسٹم کی نمائندگی کی ہے۔ 1961 میں، امریکی محکمہ زراعت کے پال ہوپ نے ہر موسم میں متاثرہ پتوں کو پیس کر مکئی کی پھپھوندی کا مطالعہ کیا، پھر اس بیماری کا پتہ لگانے کے لیے اگلے موسم کے لیے مکئی کی جانچ کے لیے پاؤڈر لگایا۔ اس سال ایک حیرت انگیز ٹھنڈ پڑ گئی، جس کے عجیب نتائج برآمد ہوئے۔ صرف بیمار پاؤڈر سے متاثرہ پودوں کو پالے سے نقصان پہنچا، جس سے صحت مند پودے غیر منجمد رہ گئے۔ اس رجحان نے سائنسدانوں کو حیران کر دیا جب تک کہ ڈی سی آرنی اور سی اپر کے ساتھ وسکونسن-میڈیسن یونیورسٹی کے گریجویٹ طالب علم اسٹیون ای لنڈو نے 1970 کی دہائی کے اوائل میں خشک پتی کے پاؤڈر میں ایک جراثیم پایا۔ سٹیون ای لنڈو، جو اب یونیورسٹی آف کیلیفورنیا، برکلے میں پلانٹ پیتھولوجسٹ ہیں، نے پایا کہ جب اس مخصوص جراثیم کو پودوں میں متعارف کرایا گیا جہاں یہ اصل میں موجود نہیں ہے، تو پودے ٹھنڈ سے ہونے والے نقصان کا بہت زیادہ خطرہ بن گئے۔ انہوں نے بیکٹیریا کی شناخت پی سرنجی کے طور پر کی، آئس نیوکلیئشن میں پی سرنجی کے کردار کی تحقیقات کی اور 1977 میں میوٹینٹ آئس مائنس اسٹرین کو دریافت کیا۔ بعد میں وہ ریکومبیننٹ ڈی این اے ٹیکنالوجی کے ذریعے پی سرنجی کے آئس مائنس اسٹرین کو تیار کرنے میں بھی کامیاب رہے۔ جینومکس پورے سیوڈوموناس جینس کے 494 مکمل جینوموں کے تقابلی جینومک اور فائیلوجینیمک تجزیے کی بنیاد پر، پی سرنگی سخت معنوں میں مونوفائلیٹک نوع نہیں بناتی، بلکہ ایک وسیع تر ارتقائی گروہ (مجموعی طور پر 34 جینوم، 3 ذیلی گروپوں میں منظم) بناتی ہے جس میں دیگر انواع بھی شامل ہیں۔ پی سرنجی گروپ کا بنیادی پروٹیوم 2944 پروٹین پر مشتمل تھا، جبکہ اس گروپ کے تناؤ کی پروٹین گنتی اور جی سی مواد بالترتیب 4973 اور 6026 (اوسط: 5465) اور 58 اور 59.3% (اوسط: 58.6%) کے درمیان تھا۔ بیماری کا چکر سیوڈوموناس سرنج متاثرہ پودوں کے بافتوں جیسے نیکروسس یا گوموسس (درخت پر زخموں سے نکلنے والا رس) پر زیادہ سردی لگاتا ہے لیکن صحت مند نظر آنے والے پودوں کے بافتوں میں بھی زیادہ سردی لگ سکتی ہے۔ موسم بہار میں، بارش یا دیگر ذرائع سے پانی بیکٹیریا کو پتوں/پھولوں پر دھوئے گا جہاں یہ بڑھے گا اور پورے موسم گرما میں زندہ رہے گا۔ یہ پی سرنجی کے لائف سائیکل کا ایپی فائیٹ مرحلہ ہے جہاں یہ بڑھے گا اور پھیل جائے گا لیکن بیماری کا سبب نہیں بنے گا۔ ایک بار جب یہ پتی کے اسٹومٹا یا پتیوں یا لکڑی کے بافتوں پر نیکروٹک دھبوں کے ذریعے پودے میں داخل ہوتا ہے تو بیماری شروع ہو جائے گی۔ اس کے بعد پیتھوجین انٹر سیلولر اسپیس میں استحصال کرے گا اور بڑھے گا جس کی وجہ سے پتی کے دھبے اور کینکر ہوتے ہیں۔ پی سرنج منجمد ہونے سے قدرے نیچے کے درجہ حرارت میں بھی زندہ رہ سکتی ہے۔ یہ منجمد درجہ حرارت سے نیچے کھٹی چیری، خوبانی اور آڑو جیسے درختوں کے اندر انفیکشن کی شدت میں اضافہ کرتے ہیں۔ ایپیڈیمولوجی پی سرنج کی وجہ سے ہونے والی بیماریاں گیلے، ٹھنڈے حالات کی طرف سے پسند کی جاتی ہیں-بیماری کے لیے زیادہ سے زیادہ درجہ حرارت آس پاس ہوتا ہے، حالانکہ یہ اس میں شامل پیتھوور کے مطابق مختلف ہو سکتا ہے۔ بیکٹیریا بیج سے پیدا ہوتے ہیں، اور بارش کے چھڑکنے سے پودوں کے درمیان منتشر ہو جاتے ہیں۔ اگرچہ یہ ایک پودے کا پیتھوجین ہے، لیکن جب حالات بیماری کے لیے سازگار نہیں ہوتے ہیں تو یہ فائیلوسفیئر میں ساپروٹروف کے طور پر بھی زندہ رہ سکتا ہے۔ پی سرنج کے کچھ ساپروٹروفک تناؤ کو فصل کے بعد کے سڑنے کے خلاف بائیو کنٹرول ایجنٹوں کے طور پر استعمال کیا گیا ہے۔ پیتھوجینسیٹی کے میکانزم پی سرنج پیتھوجینسیٹی کے میکانزم کو کئی زمروں میں تقسیم کیا جا سکتا ہے: پودے پر حملہ کرنے کی صلاحیت، میزبان مزاحمت پر قابو پانے کی صلاحیت، بائیو فلم کی تشکیل، اور آئس نیوکلیٹنگ خصوصیات والے پروٹین کی پیداوار۔ پلانکٹونک پی سرنجی پودوں پر حملہ کرنے کی صلاحیت ہدف میزبان کی طرف تیرنے کے لیے اپنے فلیجیلا اور پیلی کا استعمال کرتے ہوئے پودوں میں داخل ہونے کے قابل ہے۔ یہ قدرتی افتتاحی مقامات کے زخموں کے ذریعے پودے میں داخل ہوتا ہے، کیونکہ یہ پودے کی خلیے کی دیوار کو توڑنے کے قابل نہیں ہوتا ہے۔ اس کی ایک مثال پتی کی کان کنی کرنے والی مکھی سکیپٹومیزا فلاوا کے ساتھ شراکت داری ہے، جو اوویپوزیشن کے دوران پتیوں میں سوراخ پیدا کرتی ہے جس سے پیتھوجین فائدہ اٹھا سکتا ہے۔ پی سرنج میں ٹیکسیوں کے کردار کا اچھی طرح سے مطالعہ نہیں کیا گیا ہے، لیکن خیال کیا جاتا ہے کہ بیکٹیریا اپنے میزبان کو تلاش کرنے اور انفیکشن کا سبب بننے کے لیے پودے سے خارج ہونے والے کیمیائی اشاروں کا استعمال کرتے ہیں۔ میزبان مزاحمت پر قابو پانا اثرات سیوڈوموناس سرنج آئسولیٹس وائرس کے عوامل کی ایک رینج رکھتے ہیں جسے ٹائپ III سراو سسٹم (T3SS) ایفیکٹر پروٹین کہتے ہیں۔ یہ پروٹین بنیادی طور پر بیماری کی علامات پیدا کرنے اور انفیکشن کو آسان بنانے کے لیے میزبان کے مدافعتی ردعمل میں ہیرا پھیری کرنے کے لیے کام کرتے ہیں۔ پی سرنج میں ٹی 3 ایس ایس ایفیکٹرز کا بڑا خاندان ایچ آر پی جین کلسٹر ہے، جو ایچ آر پی سراو کے آلات کے لیے کوڈنگ کرتا ہے۔ ہاپ ایفیکٹرز ٹائپ III ایفیکٹرز ہیں جو گلائسین میکس 2-ہائیڈروکسیسوفلاوونون ڈی ہائیڈریٹیس (جی ایم ایچ آئی ڈی 1) میں مداخلت کرتے ہیں۔ ہوپ زیڈ 1 بی پیداوار کے بعد ڈیڈزین کو کم کر دیتا ہے، ارتکاز کو کم کرتا ہے اور اس طرح پودے کو فراہم ہونے والی قوت مدافعت کو کم کرتا ہے۔ فائٹوٹاکسن پیتھوجینز فائٹوٹاکسن بھی پیدا کرتے ہیں جو پودے کو زخمی کرتے ہیں اور میزبان مدافعتی نظام کو دبا سکتے ہیں۔ ایسا ہی ایک فائٹوٹاکسن کوروناٹین ہے، جو پیتھوورز پیٹو اور پی جی ایل میں پایا جاتا ہے۔ ایلیسیٹرز پی ایس ٹی ڈی سی 3000 پی سرنجی میں ایک پی ایس آئی این ایف 1، آئی این ایف 1 تیار کرتا ہے۔ میزبان اس ایلیسیٹر کا پتہ لگانے پر آٹوفیجی کے ساتھ جواب دیتے ہیں۔ لیو اور دیگر۔ 2005 میں اسے بڑے پیمانے پر حساسیت کا واحد متبادل پایا گیا جو بڑے پیمانے پر پروگرام شدہ خلیوں کی موت کا باعث بنتا ہے۔ بائیو فلم کی تشکیل سیوڈوموناس سرنجی پولیسیکرائڈز پیدا کرتی ہے جو اسے پودوں کے خلیوں کی سطح پر چپکنے کی اجازت دیتی ہے۔ یہ کورم سینسنگ مالیکیول بھی جاری کرتا ہے، جس سے اسے قریبی دیگر بیکٹیریل خلیوں کی موجودگی کا احساس ہوتا ہے۔ اگر یہ مالیکیول ایک حد سے گزر جاتے ہیں، تو بیکٹیریا جین کے اظہار کے اپنے نمونے کو بائیو فلم بنانے کے لیے تبدیل کر دیتے ہیں اور وائرس سے متعلق جینوں کا اظہار شروع کر دیتے ہیں۔ بیکٹیریا انتہائی چپچپا مرکبات جیسے پولیسیکرائڈز اور ڈی این اے کا اخراج کرتے ہیں تاکہ ایک حفاظتی ماحول پیدا کیا جا سکے جس میں ترقی کی جا سکے۔ آئس نیوکلیٹنگ خصوصیات سیوڈوموناس سرنجی-کسی بھی معدنیات یا دیگر حیاتیات سے زیادہ-ماحول کے سامنے آنے والے پودوں میں سطح کے پالے سے ہونے والے نقصان کے لیے ذمہ دار ہے۔ اینٹی فریز پروٹین کے بغیر پودوں کے لیے، برف کا نقصان عام طور پر درمیان میں ہوتا ہے کیونکہ پودوں کے بافتوں میں پانی سپر کولڈ مائع حالت میں رہ سکتا ہے۔ پی سرنج پانی کو زیادہ سے زیادہ درجہ حرارت پر منجمد کرنے کا سبب بن سکتا ہے، لیکن کم درجہ حرارت (نیچے) پر برف کے نیوکلیئشن کا سبب بننے والے تناؤ زیادہ عام ہیں۔ منجمد ہونے سے اپیتھیلیا میں چوٹیں آتی ہیں اور پودوں کے بنیادی بافتوں میں موجود غذائی اجزاء بیکٹیریا کے لیے دستیاب ہوتے ہیں۔ سیوڈوموناس سرنج میں انا (آئس نیوکلیئشن ایکٹیو) جین ہوتے ہیں جو آئی این اے پروٹین بناتے ہیں جو بیکٹیریا کی سطح پر بیرونی بیکٹیریل جھلی میں منتقل ہوتے ہیں، جہاں پروٹین برف کی تشکیل کے لیے نیوکلئی کے طور پر کام کرتے ہیں۔ برف سے ہونے والے نقصان کو کم کرنے کے لیے آئس مائنس بیکٹیریا کے نام سے جانے جانے والے پی سرنج کے مصنوعی تناؤ بنائے گئے ہیں۔ سیوڈوموناس سرنج اولے کے مرکز میں پایا گیا ہے، جس سے پتہ چلتا ہے کہ یہ جراثیم زمین کے ہائیڈرولوجیکل سائیکل میں کردار ادا کر سکتا ہے۔ انتظامیہ فی الحال کھیت سے پی سرنج کو ختم کرنے کا کوئی 100% مؤثر طریقہ موجود نہیں ہے۔ اس پیتھوجین پر قابو پانے کا سب سے عام طریقہ یہ ہے کہ تانبے کے مرکبات یا دیگر بھاری دھاتوں کے ساتھ جراثیم کش ادویات کا چھڑکاؤ کیا جائے جنہیں پھپھوندی کش ادویات یا کیڑوں پر قابو پانے والے دیگر کیمیکلز کے ساتھ ملایا جا سکتا ہے۔ فکسڈ تانبے کے ساتھ کیمیائی علاج جیسے بورڈو، کاپر ہائیڈروکسائڈ، اور کپریک سلفیٹ کا استعمال پی سرنجی کے پھیلاؤ کو روکنے کے لیے بیکٹیریا کو مار کر کیا جاتا ہے جب کہ یہ پتوں، یا درختوں کے لکڑی کے حصوں پر ایپیفائٹ مرحلے میں ہوتا ہے-تاہم مزاحم پی سرنجی کے تناؤ موجود ہیں۔ اینٹی بائیوٹکس جیسے سٹریپٹومیسن اور نامیاتی جراثیم کش ادویات کا چھڑکاؤ پی سرنج کو کنٹرول کرنے کا ایک اور طریقہ ہے لیکن اوپر درج کردہ طریقوں سے کم عام ہے۔ نئی تحقیق سے پتہ چلا ہے کہ ٹماٹر کے پودوں میں امونیم (این ایچ 4 +) غذائیت کا اضافہ میٹابولک تبدیلی کا سبب بن سکتا ہے جس کی وجہ سے سیوڈوموناس سرنج کے خلاف مزاحمت ہو سکتی ہے۔ یہ "امونیم سنڈروم" پودے میں غذائیت کے عدم توازن کا سبب بنتا ہے اور اس وجہ سے پیتھوجین کے خلاف دفاعی ردعمل کو متحرک کرتا ہے۔ باغات میں استعمال ہونے والے سخت حفظان صحت کے طریقوں کے ساتھ ساتھ موسم بہار اور موسم گرما کے اوائل میں کٹائی درختوں کو پی سرنجی کے خلاف زیادہ مزاحم بنانے کے لیے ثابت ہوئے۔ باغ کے درختوں پر پائے جانے والے کاٹرائزنگ کینکرز انفیکشن کو پھیلنے سے روک کر درخت کی جان بچا سکتے ہیں۔ مزاحمت کے لیے پودوں کی افزائش کرنا پی سرنج سے بچنے کا ایک اور مؤثر طریقہ ہے۔ یہ سیڈوموناس سرنجی پی وی کے ساتھ چیری کے جڑ اسٹاک میں کامیاب رہا ہے۔ سرنج، لیکن ابھی تک، کوئی دوسری نوع اس پیتھوجین کے خلاف مزاحم نہیں ہے۔ مزاحمتی افزائش نسل ایک سست عمل ہے، خاص طور پر درختوں میں۔ بدقسمتی سے، پی سرنجی بیکٹیریا مزاحم پودوں کو متاثر کرنے کے لیے جینیاتی طور پر ڈھال سکتے ہیں، اور مزاحمتی افزائش کے عمل کو دوبارہ شروع کرنا پڑتا ہے۔ بیکٹیریوفیج اور کارواکرول کا ایک مشترکہ علاج پلانکٹونک اور بائیو فلم دونوں شکلوں کے کنٹرول میں وعدہ ظاہر کرتا ہے۔ ریبوٹائپ تجزیہ کے بعد، پی سرنج کے کئی پیتھووروں کو دیگر انواع میں شامل کرنے کی تجویز پیش کی گئی تھی (دیکھیں پی امیگڈالی، 'پی۔ ٹماٹر '، پی۔ کرونافاسیئنز، پی۔ ایویلانی، پی۔ ہیلیانتھی '، پی۔ ٹریمی، پی۔ کینابینا، اور پی۔ وائریڈیفلاوا)۔ اس اسکیما کے مطابق، بقیہ پیتھوورز یہ ہیں: میپل ایسر پرجاتیوں پر حملہ کرتے ہیں۔ کیوی فروٹ ایکٹینیڈیا ڈیلیسیوسا پر حملہ کرتا ہے۔ ہارس چیسٹ نٹ ایسکولس ہپپوکاسٹینم پر حملہ کرتا ہے، جس سے خون بہنا شروع ہو جاتا ہے۔ چقندر بیٹا ولگرس پر حملہ کرتا ہے۔ گندم ٹریٹیکم ایسٹیوم پر حملہ کرتا ہے۔ کوہیکوے کے درخت ڈائیسوکسیلم سپیکٹیبل پر حملہ کرتا ہے۔ سویابین گلائسین میکس پر حملہ کرتا ہے، جس کی وجہ سے سویابین میں جراثیم پھیل جاتے ہیں۔ جو ہورڈیم ولگیئر پر حملہ کرتا ہے۔ گندم ٹریٹیکم ایسٹیوم پر حملہ کرتا ہے۔ پینکم گھاس کی انواع پر حملہ کرتا ہے۔ کریبیپل مالس سلویسٹرس پرجاتیوں پر حملہ کرتا ہے۔ نیکٹرائن اور آڑو پر حملہ کرتا ہے۔ پھلیوں کے ہیلو بلائٹ کا سبب بنتا ہے۔ مٹر پیسم سٹیوم پر حملہ کرتا ہے۔ سرنگا، پرونس اور فیزولس پرجاتیوں پر حملہ کرتا ہے۔ ٹماٹر پر حملہ کرتا ہے۔ تاہم، بہت سے تناؤ جن کے لیے نئی انواع کی گروہ بندی کی تجویز کی گئی تھی، سائنسی ادب میں پی سرنجی کے پیتھوور کے طور پر حوالہ دیا جاتا ہے، بشمول پیتھوور ٹماٹر، فیزولکولا، اور میکولکولا۔ Pseudomonas Savastanoi کو کبھی پی سرنجی کا ایک پیتھوور یا ذیلی نسل سمجھا جاتا تھا، اور بہت سی جگہوں پر اسے پی ایس پی وی کہا جاتا ہے۔ ساواستانوئی، اگرچہ ڈی این اے سے متعلق مطالعات کے نتیجے میں، اسے ایک نئی نوع کے طور پر نصب کیا گیا ہے۔ اس میں تین میزبان مخصوص پیتھوور ہوتے ہیں: پی ایس فریکسینی (جو ایش کینکر کا سبب بنتا ہے)، پی ایس نیری (جو اولینڈر پر حملہ کرتا ہے)، اور پی ایس اولی (جو زیتون کی گرہ کا سبب بنتا ہے)۔ میزبان کی خاصیت کے تعین کنندگان پیتھوجین کے اثر انگیز جینوں اور پودے کے مزاحمتی جینوں کے امتزاج کے بارے میں سوچا جاتا ہے کہ اس بات کا تعین کرنے کے لیے کہ ایک مخصوص پیتھوور کس نوع کو متاثر کر سکتا ہے۔ پودے پیتھوجین سے وابستہ مالیکیولر پیٹرن (پی اے ایم پی) کو پہچان کر اور مدافعتی ردعمل شروع کر کے پیتھوور کے خلاف مزاحمت پیدا کر سکتے ہیں۔ یہ پی اے ایم پیز مائکروب کے کام کرنے کے لیے ضروری ہیں، اس لیے انہیں ضائع نہیں کیا جا سکتا، لیکن پیتھوجین اس مدافعتی ردعمل کو دبانے کے طریقے تلاش کر سکتا ہے، جس کی وجہ سے پیتھوجین اور میزبان کے درمیان ارتقائی ہتھیاروں کی دوڑ شروع ہو جاتی ہے۔ ایک ماڈل سسٹم کے طور پر سیوڈوموناس سرنجی، پی سرنجی پی وی کے لیے جینوم سیکوینس کی ابتدائی دستیابی کی وجہ سے۔ سرنجائی تناؤ B728a، اور P. سرنجائی pv۔ فیزولکولا تناؤ 1448 اے، عربیڈوپسس تھالیانا، نیکوٹیانا بینتھامیانا، اور ٹماٹر جیسے اچھی طرح سے خصوصیات والے میزبان پودوں پر بیماری کا سبب بننے کے لیے منتخب تناؤ کی صلاحیت کے ساتھ، پی سرنجی پلانٹ-پیتھوجین تعاملات کی سالماتی حرکیات کی تجرباتی خصوصیت کے لیے ایک اہم ماڈل سسٹم کی نمائندگی کرنے کے لیے آیا ہے۔ پی سرنج تجرباتی نظام پودوں کے دفاع کو دبانے میں پیتھوجین جین مصنوعات کے اہم کردار کے لیے اہم ثبوت کا ذریعہ رہا ہے۔ پی سرنج ایفیکٹرز کے لیے تیار کردہ نام کے نظام کو محققین نے دوسرے بیکٹیریا میں ایفیکٹر ریپورٹیئرز کی خصوصیت کے لیے اپنایا ہے، اور بائیو انفارمیٹک ایفیکٹر کی شناخت کے لیے استعمال ہونے والے طریقوں کو دیگر حیاتیات کے لیے ڈھال لیا گیا ہے۔ اس کے علاوہ، پی سرنج کے ساتھ کام کرنے والے محققین نے پلانٹ سے وابستہ مائکروب جین آنٹولوجی ورکنگ گروپ میں ایک لازمی کردار ادا کیا ہے، جس کا مقصد جین آنٹولوجی کی اصطلاحات تیار کرنا ہے جو حیاتیات کے درمیان تعاملات کے دوران ہونے والے حیاتیاتی عمل کو پکڑتی ہیں، اور جین کی مصنوعات کی تشریح کے لیے اصطلاحات کا استعمال کرتی ہیں۔ سیوڈوموناس سرنج پی وی۔ ٹماٹر کا تناؤ ڈی سی 3000 اور عربی ڈوپسس تھالیانا جیسا کہ اوپر بتایا گیا ہے، پی سرنجی پی وی کا جینوم۔ ٹماٹر ڈی سی 3000 کی ترتیب دی گئی ہے، اور تقریبا 40 ہاپ (ایچ آر پی آؤٹر پروٹین) ایفیکٹرز-پیتھوجینک پروٹین جو میزبان خلیے کو کم کرتے ہیں-کی نشاندہی کی گئی ہے۔ ان 40 اثر کاروں کو اے تھیلیانا سے پہچانا نہیں جاتا ہے اس طرح پی سرنجی پی وی بن جاتا ہے۔ ٹماٹر ڈی سی 3000 اس کے خلاف خطرناک ہے-یعنی پی سرنج پی وی۔ ٹماٹر ڈی سی 3000 اے تھیلیانا کو متاثر کرنے کے قابل ہے-اس طرح اے تھیلیانا اس پیتھوجین کے لیے حساس ہے۔ جین کے لیے بہت سے تعلقات کی نشاندہی دو ماڈل حیاتیات، پی سرنجی پی وی کا استعمال کرتے ہوئے کی گئی ہے۔ ٹماٹر کا تناؤ ڈی سی 3000 اور عربی ڈوپسس۔ جین کے لیے جین کا تعلق میزبان مزاحمتی جینز (آر-جینز) کے ذریعے پیتھوجینک ایورولنس (اے وی آر) جینز کی شناخت کو بیان کرتا ہے۔ پی۔ سرنگی پی وی۔ ٹماٹر ڈی سی 3000 اے تھیلیانا میں اے وی آر: آر جین کے تعاملات کا مطالعہ کرنے کے لیے ایک مفید ٹول ہے کیونکہ اسے دوسرے بیکٹیریل پیتھوجینز سے اے وی آر جینز کے ساتھ تبدیل کیا جا سکتا ہے، اور اس کے علاوہ، کیونکہ اینڈوجینس ہاپس جینز میں سے کسی کو بھی اے تھیلیانا کے ذریعے پہچانا نہیں جاتا ہے، اس ماڈل کا استعمال کرتے ہوئے شناخت کی جانے والی کسی بھی مشاہدہ شدہ اے وی آر شناخت کو اے تھیلیانا کے ذریعے متعارف کردہ اے وی آر کی شناخت سے منسوب کیا جا سکتا ہے۔ پی سرنگی پی وی کی تبدیلی۔ ٹماٹر ڈی سی 3000 دوسرے پیتھوجینز کے اثرات کے ساتھ پودوں کے پیتھوجین کے تعاملات کے بارے میں مزید معلومات حاصل کرنے کے لیے عربی ڈوپسس میں بہت سے آر جینز کی شناخت کا باعث بنا ہے۔ اے تھیلیانا میں ڈائنامین سے متعلق پروٹین 2 بی/ڈی آر پی 2 بی جین براہ راست امیونٹی جین نہیں ہے، لیکن بیرونی مواد کو انٹرا سیلولر نیٹ ورک میں منتقل کرنے میں مدد کرنے سے بالواسطہ طور پر متعلق ہے، اور کچھ میوٹینٹس حساسیت میں اضافہ کرتے ہیں۔ سیوڈوموناس سرنج پی وی۔ ٹماٹر کا تناؤ ڈی سی 3000، اس کے مشتقات، اور اس کا ٹماٹر میزبان جیسا کہ اس کے نام سے پتہ چلتا ہے، پی سرنج پی وی۔ ٹماٹر ڈی سی 3000 (پی ایس ٹی ڈی سی 3000) ٹماٹر (سولانم لائکوپرسیکم) کے لیے خطرناک ہے۔ تاہم، ٹماٹر کی کاشت ریو گرانڈے-پی ٹی او آر (آر جی-پی ٹی او آر)، جو مزاحمتی جین پی ٹی او کو پناہ دیتا ہے، پی ایس ٹی ڈی سی 3000 کے ذریعے خارج ہونے والے کلیدی اثرات کو پہچانتا ہے، جو اسے بیکٹیریا کے خلاف مزاحم بناتا ہے۔ پیٹو-ایکسپریسنگ ٹماٹر لائنوں اور پی ایس ٹی ڈی سی 3000 اور اس کے پیتھوورز کے درمیان تعاملات کا مطالعہ پودوں اور مائکروب کے تعاملات کو سمجھنے کے لیے ایک طاقتور نظام ہے۔ دوسرے پودوں کی طرح ٹماٹر میں بھی دو درجے کا پیتھوجین دفاعی نظام ہوتا ہے۔ پودوں کے دفاع کی پہلی اور زیادہ عالمگیر لائن، پیٹرن سے متحرک قوت مدافعت (پی ٹی آئی)، اس وقت فعال ہوتی ہے جب سیل کی سطح پر پلانٹ پیٹرن ریکگنیشن ریسیپٹرز (پی آر آر) پیتھوجین سے وابستہ مالیکیولر پیٹرن (پی اے ایم پی) سے جڑے ہوتے ہیں۔ پودوں کی قوت مدافعت کی دوسری شاخ، ایفیکٹر-ٹرگرڈ امیونٹی (ای ٹی آئی)، اس وقت متحرک ہوتی ہے جب انٹرا سیلولر (نیوکلیوٹائڈ-بائنڈنگ سائٹ، لیوسین سے بھرپور ریپیٹ) این بی-ایل آر آر پروٹین ایک ایفیکٹر سے جڑے ہوتے ہیں، جو ایک خاص پیتھوجین کے لیے مخصوص انو ہوتا ہے۔ ای ٹی آئی عام طور پر پی ٹی آئی سے زیادہ شدید ہوتا ہے، اور جب دفاعی ایکٹیویشن کی حد تک پہنچ جاتا ہے، تو یہ ایک انتہائی حساس ردعمل (ایچ آر) کو متحرک کر سکتا ہے، جو کہ انفیکشن کے پھیلاؤ کو روکنے کے لیے میزبان ٹشو کی بامقصد موت ہے۔ پی ایس ٹی ڈی سی 3000 کے ذریعے خارج ہونے والے دو کلیدی ایفیکٹرز اے وی آر پی ٹو اور اے وی آر پی ٹو بی ہیں، جو آر جی-پی ٹی او آر جیسی ٹو-ایکسپریسنگ ٹماٹر لائنوں میں پی ٹی او/پی آر ایف ریسیپٹر کمپلیکس کو باندھ کر ای ٹی آئی کا آغاز کرتے ہیں۔ پی ایس ٹی ڈی سی 3000 کو اتپریورتن تناؤ پی ایس ٹی ڈی سی 3000 ایور پیٹو ایور پیٹو بی (پی ایس ٹی ڈی سی 3000 ایور پیٹو بی) بنانے کے لیے تبدیل کیا گیا ہے، جو نہ تو ایور پیٹو اور نہ ہی ایور پیٹو بی کا اظہار کرتا ہے۔ آر جی-پی ٹی او آر کو پی ایس ٹی ڈی سی 3000 کے ساتھ متاثر کرنے سے، پی ٹی او/پی آر ایف کمپلیکس کے ذریعہ تسلیم شدہ اہم اثرات کی عدم موجودگی کی وجہ سے پیتھوجین میں ای ٹی آئی متحرک نہیں ہوتا ہے۔ لیب میں یہ انتہائی قیمتی ہے، کیونکہ پی ایس ٹی ڈی سی 3000 کا استعمال محققین کو آر جی-پی ٹی او آر میں پی ٹی آئی-امیدوار جینوں کے کام کا مطالعہ کرنے کی اجازت دیتا ہے، جو بصورت دیگر ای ٹی آئی کے ذریعے چھپایا جاتا۔ ایک اور مفید ڈی۔ سی۔ 3000 مشتق پی۔ ایس۔ ٹی۔ ڈی۔ سی۔ 3000۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔۔ ہے۔ پی ایس ٹی ڈی سی 3000 کی طرح، یہ تناؤ اے وی آر پی ٹو اور اے وی آر پی ٹو بی کا اظہار نہیں کرتا ہے، لیکن اس میں فلائی سی، جین انکوڈنگ فلیگیلن کے لیے ایک اضافی ناک آؤٹ بھی ہے، جس کے ٹکڑے ٹماٹر پی ٹی آئی کے لیے درکار اہم پی اے ایم پیز کے طور پر کام کرتے ہیں۔ اسی لائن کے اندر پودوں کا موازنہ کرکے جو یا تو پی ایس ٹی ڈی سی 3000  वाली یا پی ایس ٹی ڈی سی 3000 والی سے متاثر ہوئے ہیں، محققین اس بات کا تعین کر سکتے ہیں کہ آیا دلچسپی کے جین پی ٹی آئی کے فلیگیلن شناخت کے راستے کے لیے اہم ہیں یا نہیں۔ سی آر آئی ایس پی آر سے چلنے والے ٹماٹر ناک آؤٹ میوٹینٹس (آر جی-پی ٹی او آر پس منظر میں) کا پی ایس ٹی ڈی سی 3000، پی ایس ٹی ڈی سی 3000 آیور پیٹو ایور پیٹو بی، یا پی ایس ٹی ڈی سی 3000 آیور پیٹو ایور پیٹو بی آیو فلائی سی کے ساتھ علاج کرنے سے ٹماٹر کے مدافعتی نظام کے کلیدی اجزاء کی خصوصیت پیدا ہوئی ہے اور ٹماٹر کی بیماری کے شعبے کو آگے بڑھانے کے لیے اس کا استعمال جاری ہے۔ اہمیت سیوڈوموناس سرنج نے اپنے مختلف پیتھوورز سے بہت سی فصل اور باغات کی صنعتوں کو متاثر کیا ہے۔ پی ایس پی وی۔ Mesarich et al. 2017 پی ایس اے کے میوٹینٹس کی ٹرانسپوسن اندراج ترتیب کے لیے کئی کتب خانے فراہم کرتا ہے۔ نیوزی لینڈ میں کیوی فروٹ کی صنعت کو 2007 میں پی سرنگی پی وی سے پہلی بار پھیلنے کے بعد سے تباہ کن نقصان اٹھانا پڑا ہے۔ ایکٹینیڈیا۔ نیوزی لینڈ کیوی فروٹ کی برآمدات کے کل حجم میں اٹلی کے بعد دوسرے نمبر پر ہے جو NZ 1 بلین ڈالر کی سالانہ آمدنی کرتا ہے، جس سے یہ ملک میں سب سے زیادہ اقتصادی طور پر قیمتی برآمد ہوتا ہے۔ 2014 میں صرف برآمدات کا نقصان NZ $93 کروڑ جتنا زیادہ تھا۔ کاشتکاروں کو علاج کے لیے ادائیگی کرنی پڑی، اور متاثرہ انگوروں کو ہٹانے کے ساتھ ساتھ ان کے باغات میں سرمائے کی قیمت کا نقصان اٹھانا پڑا۔ کچھ لوگوں کے لیے، وباء کے بعد باغ کی قیمت NZ $450,000/ہیکٹر سے $70,000/ہیکٹر تک چلی گئی، جو کہ خالی زمین کی قیمت ہے۔ نیوزی لینڈ کے ملک کے لیے ایکویٹی کا کل نقصان NZ $2 بلین جتنا زیادہ تھا۔ 2010 اور 2012 کے درمیان اطالوی کیوی کے باغات کو یا تو پی سرنگے پی وی نے مار ڈالا تھا۔ ایکٹینیڈیا یا بیماری پر قابو پانے کے لیے مارا گیا۔ کاشتکاروں اور ان کے فراہم کنندگان کے لیے مالی نتائج شدید تھے، جیسا کہ معاشی نتائج زیادہ وسیع تھے۔ بائیوپریسیپیٹیشن آئس مائنس بیکٹیریا سیوڈوموناس فیج 6 نیشنل کلیکشن آف پلانٹ پیتھوجینک بیکٹیریا حوالہ جات بیرونی روابط بیک ڈائیو میں سیوڈوموناس سرنج کی قسم کا تناؤ-بیکٹیریل ڈائیورسٹی میٹا ڈیٹا بیس سیوڈوموناڈیلس بیکٹیریل پلانٹ پیتھوجینز اور بیماریاں سویابین کی بیماریاں 1904 میں بیان کردہ بیکٹیریا