Pseudomonas citronellolis
Pseudomonas citronellolis ایک گرام منفی، بیسیلس بیکٹیریم ہے جو پائروویٹ کاربوکسیلیز کے طریقہ کار کا مطالعہ کرنے کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ یہ سب سے پہلے شمالی ورجینیا، ریاستہائے متحدہ میں چیڑ کے درختوں کے نیچے جنگل کی مٹی سے الگ کیا گیا تھا۔ خصوصیات Pseudomonas citronellolis ایک گرام منفی، بیسیلس جراثیم۔ یہ سب سے پہلے شمالی ورجینیا، ریاستہائے متحدہ میں چیڑ کے درختوں کے نیچے جنگل کی مٹی سے الگ کیا گیا تھا۔ اس میں ایک قطبی فلیگیلم ہوتا ہے جو اسے متحرک ہونے کی اجازت دیتا ہے۔ پودوں کے ساتھ تعلق اگر پر، پی۔ سائٹرونیلولس گول سفید کالونیاں بناتا ہے جو فلوروسینٹ سبز روغن پیدا کرتے ہیں۔ یہ ایک بائیو فلم بھی تیار کرتا ہے اور زیادہ تر اینٹی بائیوٹکس کے خلاف مزاحم ہے۔ بیکٹیریا کا اپنے پودوں کے میزبان (یا تو چیڑ کے درختوں یا تلسی کے ساتھ) کے ساتھ حیاتیاتی تعلق ہوتا ہے۔ یہ ایک قسم کا ہارمون پیدا کرتا ہے جو پودوں کے خلیوں کی لمبائی اور تقسیم کو جنم دیتا ہے، جس سے مقامی دستیاب غذائی اجزاء میں اضافہ ہوتا ہے۔ میٹابولک صلاحیت پی۔ سائٹرونیلولس کا مطالعہ اہم ہے کیونکہ اسے گلوکوز سے متعلق میٹابولزم اور انزائم کی سرگرمی کی تحقیق کے لیے ایک ماڈل کے طور پر استعمال کیا جا سکتا ہے۔ اس میں پولی تھیلین کے حیاتیاتی انحطاط میں استعمال کی صلاحیت بھی ہے۔ جینوم کا سائز 6,951,444 bp ہے جس میں DNA کوڈنگ 6,028,113 bp ہے۔ اوسط جی سی مواد 67.11% اور 4,665,300 bp ہے۔ 6169 پیشین گوئی شدہ جینوں میں سے 6071 (98.41 ٪) پروٹین سی ڈی ایس تھے جن میں سے 4762 جینوں کی فنکشن پیشن گوئی تھی۔ 15 آر آر این اے سمیت کل 96 آر این اے جینوں کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ ایک ٹیمپلیٹ کی 16 ایس آر سیکوینسنگ کے لیے سیوڈوموناس سائٹرونیلولس کے ڈی این اے آئسولیشن سے 25 ایم یو ایل ڈائلیوٹڈ جینومک ڈی این اے کا انکشاف ہوا۔ ڈی این اے کو بڑھانے کے لیے پرائمر کے طور پر بوکسائر، ریپیٹیٹیو ایکسٹراجینک پیلینڈرومک سیکوینس بیسڈ پی سی آر اینالیسس (آر ای پی-پی سی آر)، اور اینٹروبیکٹیریل ریپیٹیٹیو انٹرجینک اتفاق رائے (ای آر آئی سی) کا استعمال کیا گیا۔ پی۔ سائٹرونیلولس کے 29 تناؤ کے لیے پی سی آر نے 8 سے 12 امپلیفائیڈ بینڈ حاصل کیے۔ یہ 9,000 بی پی سے لے کر 100 بی پی تک کے سائز کے ساتھ بہت ممتاز تھے۔ آر ای پی-پی سی آر سب سے زیادہ پیچیدہ امپلیفائیڈ بینڈنگ پیٹرن تیار کرتا ہے، جو مختلف تیل کی کیچڑ سے آلودہ مٹی کے نمونوں سے الگ تھلگ پی سائٹرونیلولس تناؤ کے درمیان تنوع کی عکاسی کرتا ہے۔ پی۔ سائٹرونیلولس تناؤ کے رائبوٹائپ نمونوں نے متعدد امپلیکنز دکھائے جو آر آر این اے سپیسر خطے کی پولیمرفزم کی مضبوطی سے نشاندہی کرتے ہیں۔ جینوم پر اس تجربے میں کوئی پلازمیڈز نہیں تھے اور اس نے اس کے وجود کا کوئی ثبوت فراہم نہیں کیا۔ 16 ایس آر آر این اے تجزیے کی بنیاد پر، پی۔ سائٹرونیلولس کو پی۔ ایروگینوسا گروپ میں رکھا گیا ہے۔ پی۔ سائٹرونیلولس کو "لکیری مونو-اور ڈائیکاربکسیلک ایسڈ" سے پولی ہائیڈروکسیال-کانوایٹس کی حیاتیاتی ترکیب کے قابل بھی پایا گیا ہے، جو بیکٹیریل سے ترکیب شدہ پالئیےسٹر کی ایک قسم ہے۔ P. citronellolis P3B5 جینوم میں ایسے جین ہوتے ہیں جو چھ پیش گوئی شدہ لیکٹامیس کے لیے انکوڈ کرتے ہیں جو لیکٹم اینٹی بائیوٹکس کے خلاف مزاحمت کرتے ہیں۔ مزید برآں، جینوم میں افلوکس پمپوں کے لیے انکوڈنگ کرنے والے جین ہوتے ہیں جو دیگر اینٹی بائیوٹکس جیسے ٹرائمیتھوپریم کو مزاحمت فراہم کرتے ہیں۔ P3B5 جینوم ان جینوں کو انکوڈ کرتا ہے جو اسے الکین کو خراب کرنے کے قابل بناتے ہیں۔ اس کے تناؤ کے لچکدار اور پودوں پر انحصار کرنے والے طرز زندگی کے ساتھ مل کر، اس جاندار کو پودوں کے تدارک کے طریقوں کے لیے ایک دلچسپ امیدوار بناتا ہے۔ کئی اے بی کے خلاف مزاحمت کا مشاہدہ کیا گیا اور کئی اے بی آر جینوں کا پتہ چلا، لیکن اے بی آر جین کو متحرک کرنے کی صلاحیت کا کوئی ثبوت نہیں مل سکا۔ حوالہ جات بیرونی روابط بیک ڈائیو میں سیوڈوموناس سائٹرونیلولس کی قسم کا تناؤ-1960 میں بیان کردہ بیکٹیریل تنوع میٹا ڈیٹا بیس سیوڈوموناڈیلس بیکٹیریا