Activity-based proteomics
سرگرمی پر مبنی پروٹومکس، یا سرگرمی پر مبنی پروٹین پروفائلنگ (اے بی پی پی) ایک فعال پروٹومک ٹیکنالوجی ہے جو کیمیائی تحقیقات کا استعمال کرتی ہے جو میکانکی طور پر متعلقہ کلاسوں کے انزائموں کے ساتھ رد عمل ظاہر کرتی ہے۔ اے بی پی پی کی بنیادی اکائی تحقیقات ہے، جو عام طور پر دو عناصر پر مشتمل ہوتی ہے: ایک رد عمل گروپ (آر جی، جسے بعض اوقات "وار ہیڈ" کہا جاتا ہے) اور ایک ٹیگ۔ مزید برآں، کچھ تحقیقات میں ایک بائنڈنگ گروپ ہو سکتا ہے جو انتخاب کو بڑھاتا ہے۔ رد عمل والے گروپ میں عام طور پر ایک خاص طور پر ڈیزائن کیا گیا الیکٹروفائل ہوتا ہے جو ایک فعال انزائم کے فعال مقام پر نیوکلیوفیلک باقیات سے ہم آہنگی سے منسلک ہو جاتا ہے۔ ایک ایسا انزائم جو روک دیا گیا ہو یا ترجمہ کے بعد ترمیم شدہ ہو، سرگرمی پر مبنی تحقیقات کے ساتھ رد عمل ظاہر نہیں کرے گا۔ یہ ٹیگ یا تو ایک رپورٹر ہو سکتا ہے جیسے فلورفور یا افینیٹی لیبل جیسے بائیوٹن یا ایک الکین یا ایزائڈ ہو سکتا ہے جو ہیوزجن 1,3-ڈائپولر سائکلوڈڈیشن (جسے کلک کیمسٹری بھی کہا جاتا ہے) کے ساتھ استعمال ہوتا ہے۔ فوائد اے بی پی پی کا ایک بڑا فائدہ پروٹین یا ایم آر این اے کی کثرت تک محدود ہونے کے بجائے براہ راست انزائم فعال سائٹ کی دستیابی کی نگرانی کرنے کی صلاحیت ہے۔ انزائموں کی کلاسوں کے ساتھ جیسے سیرائن ہائیڈرولیز اور میٹالوپروٹیز جو اکثر اینڈوجینس انفیکٹرز کے ساتھ تعامل کرتے ہیں یا جو غیر فعال زیموجینز کے طور پر موجود ہوتے ہیں، یہ تکنیک روایتی تکنیکوں پر ایک قیمتی فائدہ پیش کرتی ہے جو سرگرمی کے بجائے کثرت پر انحصار کرتی ہیں۔ کثیر جہتی پروٹین کی شناخت کی ٹیکنالوجی حالیہ برسوں میں اے بی پی پی کو ٹینڈم ماس سپیکٹرومیٹری کے ساتھ جوڑا گیا ہے جس سے ایک ہی نمونے سے سینکڑوں فعال انزائموں کی شناخت ممکن ہوئی ہے۔ یہ تکنیک، جسے اے بی پی پی-مڈ پی آئی ٹی (کثیر جہتی پروٹین شناختی ٹیکنالوجی) کے نام سے جانا جاتا ہے، خاص طور پر پروفائلنگ انفیکٹر سلیکٹیویٹی کے لیے مفید ہے کیونکہ ایک انفیکٹر کی طاقت کو بیک وقت سینکڑوں اہداف کے خلاف آزمایا جا سکتا ہے۔ اے بی پی پی کو پہلی بار 1990 کی دہائی میں پروٹیسیس کے مطالعہ میں رپورٹ کیا گیا تھا۔ ماس سپیکٹرومیٹری پروٹومکس سے متعلق انفیکٹرس ایم اے ایف پی اور ڈی آئی ایف پی کیموپروٹومکس حوالہ جات پروٹومکس جینومکس پروٹین کے طریقے ماس سپیکٹرومیٹری بھی دیکھیں۔