XYZ file format
XYZ فائل فارمیٹ ایک کیمیائی فائل فارمیٹ ہے۔ کوئی رسمی معیار موجود نہیں ہے اور کئی تغیرات موجود ہیں، لیکن ایک عام XYZ فارمیٹ مالیکیول جیومیٹری کی وضاحت کرتا ہے جس میں کارٹیشین کوآرڈینیٹس کے ساتھ ایٹموں کی تعداد دی جاتی ہے جو پہلی لائن پر پڑھی جائے گی، دوسری پر تبصرہ، اور مندرجہ ذیل لائنوں میں جوہری کوآرڈینیٹس کی لائنیں۔ فائل فارمیٹ جیومیٹریز درآمد اور برآمد کرنے کے لیے کمپیوٹیشنل کیمسٹری پروگراموں میں استعمال ہوتا ہے۔ اکائیاں عام طور پر انگسٹروم میں ہوتی ہیں۔ کچھ تغیرات میں جوہری علامتوں کے بجائے جوہری اعداد کا استعمال کرنا، یا تبصرہ لائن کو چھوڑنا شامل ہے۔ XYZ فارمیٹ استعمال کرنے والی فائلوں میں روایتی طور پر توسیع ہوتی ہے۔ فارمیٹ. xyz فائل فارمیٹ کی فارمیٹنگ مندرجہ ذیل ہے: <ایٹموں کی تعداد> تبصرہ لائن <عنصر> <X> <Y> <Z>۔ XYZ فائل فارمیٹ میں کنیکٹوٹی کی معلومات واضح ہونے کے بجائے مضمر ہے۔ XYZ (XMol کا حصہ) کے مرکزی صفحہ کے مطابق، نوٹ کریں کہ XYZ فارمیٹ میں کنیکٹوٹی کی معلومات نہیں ہیں۔ یہ جان بوجھ کر چھوٹ زیادہ لچک کی اجازت دیتی ہے: ایک XYZ فائل بنانے کے لیے، آپ کو یہ جاننے کی ضرورت نہیں ہے کہ مالیکیول کے بانڈز کہاں ہیں۔ آپ کو صرف یہ جاننے کی ضرورت ہے کہ اس کے ایٹم کہاں ہیں۔ کنیکٹوٹی کی معلومات XYZ فائلوں کے لیے خود بخود پیدا ہوتی ہیں کیونکہ انہیں XMol سے متعلق ایپلی کیشنز میں پڑھا جاتا ہے۔ مختصر طور پر، اگر دو ایٹموں کے درمیان فاصلہ ان کے کوولینٹ ریڈیائی کے مجموعے سے کم ہے، تو انہیں بند شدہ سمجھا جاتا ہے۔ مثال پائریڈین مالیکیول کو XYZ فارمیٹ میں درج ذیل طریقے سے بیان کیا جا سکتا ہے: 11 C-0.180226841 0.360945118-1.120304970 C-0.180226841 1.559292118-0.407860970 C-0.180226841 1.503191118 0.986935030 N-0.180226841-0.781300882 0.986935030 C-0.180226841-0.837401882-0.407860970 H-0.180226841 0.360945118-2.206546970 H-0.180226841 2.517950118-0.917077970 H-0.180226841 2.421289118 1.572099030 H-0.180226841 m یکے بعد دیگرے سنیپ شاٹ کے لیے ایک مثال xyz فارمیٹ ہے جسے حرکت پذیری کے طور پر پیش کیا جا سکتا ہے: <ایٹموں کی تعداد> تبصرہ لائن ایٹم _ علامت 11 x-کوورڈ 11 y-کوورڈ 11 z-کوورڈ 11 ایٹم _ علامت 12 x-کوورڈ 12 y-کوورڈ 12 z-کوورڈ 12. ایٹم _ علامت 1n x-کوورڈ 1n y-کوورڈ 1n z-کوورڈ 1n <ایٹموں کی تعداد> تبصرہ لائن ایٹم _ علامت 21 x-کوورڈ 21 y-کوورڈ 21 z-کوورڈ 21 ایٹم _ علامت 22 x-کوورڈ 22 y-کوورڈ 22. ایٹم _ علامت 2n x-کوورڈ 2n y-کوورڈ ۔ ۔ <ایٹموں کی تعداد> تبصرہ لائن ایٹم _ سمبلم 1 x-کوورڈم 1 y-کوورڈم 1 z-کوورڈم 1 ایٹم _ سمبلم 2 x-کوورڈم 2 y-کوورڈم 2 z-کوورڈم 2. ایٹم _ سمبلم x-کوورڈم y-کوورڈم z-کوورڈم نوٹ کریں کہ xyz معیار کے لیے یہ ضروری نہیں ہے کہ ایٹموں کی تعداد یا کیمیائی نوعیت بعد کے سنیپ شاٹس پر یکساں ہو، جو حرکت پذیری کے دوران ایٹموں کو غائب ہونے یا فیلڈ آف ویو میں آنے کی اجازت دیتا ہے۔ توسیعی XYZ فارمیٹ توسیعی XYZ فائل فارمیٹ حوالہ جات کیمیائی فائل فارمیٹ بھی دیکھیں۔