Medical microbiology
میڈیکل مائکروبیولوجی، مائکروبیولوجی کا بڑا ذیلی مجموعہ جو طب پر لاگو ہوتا ہے، طبی سائنس کی ایک شاخ ہے جس کا تعلق متعدی بیماریوں کی روک تھام، تشخیص اور علاج سے ہے۔ اس کے علاوہ، سائنس کا یہ شعبہ صحت کی بہتری کے لیے جرثوموں کے مختلف طبی استعمال کا مطالعہ کرتا ہے۔ چار قسم کے مائکروجنزم ہیں جو متعدی بیماری کا سبب بنتے ہیں: بیکٹیریا، فنگی، پرجیویوں اور وائرس، اور ایک قسم کا متعدی پروٹین جسے پریئن کہا جاتا ہے۔ ایک طبی مائکروبیولوجسٹ پیتھوجینز کی خصوصیات، ان کی منتقلی کے طریقوں، انفیکشن کے طریقہ کار اور نشوونما کا مطالعہ کرتا ہے۔ ہسپتال یا میڈیکل ریسرچ سینٹر میں کلینیکل/میڈیکل مائیکرو بائیولوجسٹ کے طور پر تعلیمی قابلیت کے لیے عام طور پر بیچلر ڈگری کی ضرورت ہوتی ہے جبکہ کچھ ممالک میں مائیکرو بائیولوجی میں ماسٹرز کے ساتھ پی ایچ ڈی۔ کسی بھی لائف سائنسز (بائیو کیم، مائیکرو، بائیوٹیک، جینیٹکس وغیرہ) میں۔ طبی مائکروبیولوجسٹ اکثر معالجین کے لیے مشیر کے طور پر کام کرتے ہیں، جو پیتھوجینز کی شناخت فراہم کرتے ہیں اور علاج کے اختیارات تجویز کرتے ہیں۔ اس معلومات کا استعمال کرتے ہوئے، ایک علاج وضع کیا جا سکتا ہے۔ دیگر کاموں میں کمیونٹی کے لیے ممکنہ صحت کے خطرات کی شناخت یا جرثوموں کے ممکنہ طور پر خطرناک یا مزاحم تناؤ کے ارتقا کی نگرانی، کمیونٹی کو تعلیم دینا اور صحت کے طریقوں کے ڈیزائن میں مدد کرنا شامل ہو سکتا ہے۔ وہ وبائی امراض اور بیماری کے پھیلنے کو روکنے یا ان پر قابو پانے میں بھی مدد کر سکتے ہیں۔ تمام طبی مائکروبیولوجسٹ مائکروبیل پیتھولوجی کا مطالعہ نہیں کرتے ہیں۔ کچھ عام، غیر پیتھوجینک پرجاتیوں کا مطالعہ کرتے ہیں تاکہ اس بات کا تعین کیا جا سکے کہ آیا ان کی خصوصیات کو اینٹی بائیوٹکس یا علاج کے دیگر طریقوں کو تیار کرنے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ ایپیڈیمولوجی، آبادی میں صحت اور بیماری کے حالات کے نمونوں، وجوہات اور اثرات کا مطالعہ، طبی مائکروبیولوجی کا ایک اہم حصہ ہے، حالانکہ اس شعبے کا طبی پہلو بنیادی طور پر افراد میں مائکروبیل انفیکشن کی موجودگی اور نشوونما، انسانی جسم پر ان کے اثرات، اور ان انفیکشن کے علاج کے طریقوں پر مرکوز ہے۔ اس سلسلے میں پورے شعبے کو، ایک اطلاقی سائنس کے طور پر، تصوراتی طور پر تعلیمی اور طبی ذیلی خصوصیات میں تقسیم کیا جا سکتا ہے، حالانکہ حقیقت میں صحت عامہ کے مائکروبیولوجی اور طبی مائکروبیولوجی کے درمیان ایک سیال تسلسل موجود ہے، جس طرح طبی لیبارٹریوں میں جدید ترین حالت کا انحصار تعلیمی طب اور تحقیقی لیبارٹریوں میں مسلسل بہتری پر ہوتا ہے۔ 1676 میں، انٹون وین لیوینہوک نے اپنے ڈیزائن کے سنگل لینس خوردبین کا استعمال کرتے ہوئے بیکٹیریا اور دیگر مائکروجنزموں کا مشاہدہ کیا۔ 1796 میں، ایڈورڈ جینر نے ایک بچے کو چیچک کے خلاف کامیابی سے حفاظتی ٹیکے لگانے کے لیے کاؤپاکس کا استعمال کرتے ہوئے ایک طریقہ تیار کیا۔ وہی اصول آج ویکسین تیار کرنے کے لیے استعمال ہوتے ہیں۔ اس کے بعد، 1857 میں لوئس پاسچر نے کئی بیماریوں جیسے اینتھراکس، مرغی ہیضے اور ریبیز کے ساتھ ساتھ خوراک کے تحفظ کے لیے پیسٹورائزیشن کے خلاف ویکسین بھی تیار کیں۔ 1867 میں جوزف لیسٹر کو جراثیم کش جراحی کا باپ سمجھا جاتا ہے۔ پتلے کاربولک ایسڈ سے آلات کو جراثیم سے پاک کرکے اور زخموں کو صاف کرنے کے لیے اس کا استعمال کرکے، آپریشن کے بعد کے انفیکشن کو کم کیا گیا، جس سے مریضوں کے لیے سرجری زیادہ محفوظ ہو گئی۔ 1876 اور 1884 کے درمیان کے سالوں میں رابرٹ کوچ نے متعدی بیماریوں کے بارے میں بہت زیادہ بصیرت فراہم کی۔ وہ خالص کلچر میں بیکٹیریا کی علیحدگی پر توجہ مرکوز کرنے والے پہلے سائنسدانوں میں سے ایک تھے۔ اس نے جراثیمی نظریہ کو جنم دیا، ایک مخصوص خرد حیاتیات جو کسی خاص بیماری کا ذمہ دار ہے۔ انہوں نے اس کے ارد گرد معیارات کا ایک سلسلہ تیار کیا جو کوچ کے مفروضوں کے نام سے مشہور ہو گئے ہیں۔ طبی مائکروبیولوجی میں ایک اہم سنگ میل گرام سٹین ہے۔ 1884 میں ہنس کرسچن گرام نے بیکٹیریا کو داغدار کرنے کا طریقہ تیار کیا تاکہ انہیں خوردبین کے تحت زیادہ دکھائی دے اور مختلف کیا جا سکے۔ یہ تکنیک آج کل بڑے پیمانے پر استعمال ہوتی ہے۔ 1910 میں پال ایرلچ نے آتشک کے ساتھ متاثرہ خرگوش پر آرسینک پر مبنی کیمیکلز کے متعدد امتزاج کا تجربہ کیا۔ ایرلچ نے پھر پایا کہ آرسفینامائن سفلس اسپائروکیٹس کے خلاف موثر پایا گیا تھا۔ اس کے بعد آرسفینامائنز کو 1910 میں دستیاب کرایا گیا، جسے سالورسن کے نام سے جانا جاتا ہے۔ 1929 میں الیگزینڈر فلیمنگ نے اس وقت اور اب دونوں میں سب سے زیادہ استعمال ہونے والا اینٹی بائیوٹک مادہ تیار کیا: پینسلن۔ 1939 میں گیرہارڈ ڈوماک نے بغیر کسی زہریلے پن کے پروٹوسل سرخ محفوظ چوہوں کو پیتھوجینک سٹریپٹوکوکی اور سٹیفیلوکوکی سے پایا۔ ڈوماک کو سلفا دوا کی دریافت کے لیے فزیولوجی یا میڈیسن کا نوبل انعام ملا۔ ڈی این اے سیکوینسنگ، 1977 میں والٹر گلبرٹ اور فریڈرک سینگر کے ذریعہ تیار کردہ ایک طریقہ، ویکسین، طبی علاج اور تشخیصی طریقوں کی ترقی میں تیزی سے تبدیلی کا سبب بنا۔ ان میں سے کچھ میں مصنوعی انسولین شامل ہے جو 1979 میں ریکومبیننٹ ڈی این اے کا استعمال کرتے ہوئے تیار کی گئی تھی اور ہیپاٹائٹس بی کے لیے پہلی جینیاتی طور پر تیار کردہ ویکسین 1986 میں بنائی گئی تھی۔ 1995 میں انسٹی ٹیوٹ فار جینومک ریسرچ کی ایک ٹیم نے پہلا بیکٹیریل جینوم ہیموفیلس انفلوئنزا ترتیب دیا۔ چند ماہ بعد، پہلا یوکرائیوٹک جینوم مکمل ہوا۔ یہ تشخیصی تکنیکوں کے لیے انمول ثابت ہوگا۔ 2007 میں، ڈینش فوڈ کمپنی ڈینسکو کی ایک ٹیم، سی آر آئی پی آر-سی اے ایس سسٹم کے مقصد کو فیجز کے لیے انکولی قوت مدافعت کے طور پر شناخت کرنے میں کامیاب رہی۔ اس کے بعد یہ نظام تیزی سے ڈبل اسٹرینڈ بریک پیدا کرنے کی صلاحیت کے ذریعے جینوم ایڈیٹنگ میں مدد کرنے کے قابل پایا گیا۔ سکل سیل بیماری کا مریض پہلا شخص تھا جس کا علاج جولائی 2019 میں سی آر آئی ایس پی آر کے ساتھ جینیاتی عارضے کے لیے کیا گیا تھا۔ عام طور پر علاج شدہ متعدی بیماریاں بیکٹیریل اسٹریپٹوکوکل فرینگائٹس کلیمیڈیا ٹائیفائیڈ بخار تپ دق وائرل روٹا وائرس ہیپاٹائٹس سی ہیومن پیپیلوما وائرس (ایچ پی وی) پیراسائٹک ملیریا جیارڈیا لیمبلیا ٹاکسوپلاسما گونڈی فنگل کینڈیڈا 'ہسٹوپلاسموسس خشکی کی وجوہات اور متعدی بیماریوں کی منتقلی انفیکشن بیکٹیریا، وائرس، فنگی اور پرجیویوں کی وجہ سے ہو سکتی ہیں۔ بیماری کا سبب بننے والا پیتھوجین بیرونی ہو سکتا ہے (بیرونی ماخذ سے حاصل کیا گیا ؛ ماحولیاتی، جانور یا دوسرے لوگ، مثال کے طور پر۔ انفلوئنزا) یا اینڈوجینس (عام نباتات سے مثلا۔ کینڈیڈیسیسس)۔ جس جگہ پر ایک جرثوم جسم میں داخل ہوتا ہے اسے پورٹل آف انٹری کہا جاتا ہے۔ ان میں سانس کی نالی، معدے کی نالی، جینیٹورینری ٹریکٹ، جلد اور میوکس میمبرین شامل ہیں۔ کسی مخصوص جرثومے کے داخلے کا پورٹل عام طور پر اس بات پر منحصر ہوتا ہے کہ وہ اپنے قدرتی مسکن سے میزبان تک کیسے سفر کرتا ہے۔ مختلف طریقے ہیں جن سے افراد کے درمیان بیماری پھیل سکتی ہے۔ ان میں شامل ہیں: براہ راست رابطہ-کسی متاثرہ میزبان کو چھونا، بشمول جنسی رابطہ بالواسطہ رابطہ-آلودہ سطح کے بوندوں کے رابطے کو چھونا-کھانسی یا چھینکنا فضلے کے راستے سے-آلودہ کھانے یا پانی کے ذرائع کو کھانا ہوا سے پھیلنا-بیجوں کو لے جانے والا پیتھوجین ویکٹر ٹرانسمیشن-ایک ایسا جاندار جو خود بیماری کا سبب نہیں بنتا ہے لیکن پیتھوجینز کو ایک میزبان سے دوسرے میزبان میں منتقل کرکے انفیکشن منتقل کرتا ہے فومائٹ ٹرانسمیشن-ایک بے جان شے یا مادہ جو متعدی جراثیم یا پرجیویوں کو لے جانے کے قابل ہے ماحولیاتی-ہسپتال سے حاصل شدہ انفیکشن (نوسوکومیل انفیکشن) دوسرے پیتھوجینز کی طرح، وائرس جسم میں داخل ہونے کے لیے ٹرانسمیشن کے ان طریقوں کا استعمال کرتے ہیں، لیکن وائرس اس میں مختلف ہوتے ہیں کہ انہیں میزبان کے اصل خلیوں میں بھی داخل ہونا پڑتا ہے۔ ایک بار جب وائرس میزبان کے خلیوں تک رسائی حاصل کر لیتا ہے، تو وائرس کے جینیاتی مواد (آر این اے یا ڈی این اے) کو سیل میں متعارف کرایا جانا چاہیے۔ وائرس کے درمیان نقل بہت مختلف ہوتی ہے اور اس کا انحصار ان میں شامل جین کی قسم پر ہوتا ہے۔ زیادہ تر ڈی این اے وائرس نیوکلئس میں جمع ہوتے ہیں جبکہ زیادہ تر آر این اے وائرس صرف سائٹوپلازم میں تیار ہوتے ہیں۔ میزبان کے خلیوں میں وائرس کے انفیکشن، پھیلاؤ اور استقامت کے طریقہ کار اس کی بقا کے لیے اہم ہیں۔ مثال کے طور پر، خسرہ جیسی کچھ بیماریاں ایک حکمت عملی استعمال کرتی ہیں جس کے تحت یہ میزبانوں کی ایک سیریز میں پھیلنا ضروری ہے۔ وائرل انفیکشن کی ان شکلوں میں، بیماری کا علاج اکثر جسم کے اپنے مدافعتی ردعمل کے ذریعے کیا جاتا ہے، اور اس لیے وائرس کو امیونولوجیکل مزاحمت یا میزبان کی موت سے تباہ ہونے سے پہلے نئے میزبانوں میں منتشر ہونا ضروری ہے۔ اس کے برعکس، کچھ متعدی ایجنٹ جیسے فیلائن لیوکیمیا وائرس، مدافعتی ردعمل کا مقابلہ کرنے کے قابل ہوتے ہیں اور انفرادی میزبان کے اندر طویل مدتی رہائش حاصل کرنے کے قابل ہوتے ہیں، جبکہ مسلسل میزبانوں میں پھیلنے کی صلاحیت کو بھی برقرار رکھتے ہیں۔ تشخیصی ٹیسٹ معمولی بیماری کے لیے متعدی ایجنٹ کی شناخت اتنی ہی آسان ہو سکتی ہے جتنی کہ طبی پیشکش ؛ جیسے معدے کی بیماری اور جلد کے انفیکشن۔ ایک تعلیم یافتہ تخمینہ لگانے کے لیے کہ کون سا مائکروب اس بیماری کا سبب بن سکتا ہے، وبائی امراض کے عوامل پر غور کرنے کی ضرورت ہے ؛ جیسے کہ مریض کے مشتبہ جاندار کے سامنے آنے کا امکان اور کسی کمیونٹی میں مائکروبیل تناؤ کی موجودگی اور پھیلاؤ۔ متعدی بیماری کی تشخیص تقریبا ہمیشہ مریض کی طبی تاریخ سے مشورہ کرکے اور جسمانی معائنہ کرکے شروع کی جاتی ہے۔ شناخت کی مزید تفصیلی تکنیکوں میں مائکروبیل کلچر، مائکروسکوپی، بائیو کیمیکل ٹیسٹ اور جینو ٹائپنگ شامل ہیں۔ دیگر کم عام تکنیکیں (جیسے ایکس رے، سی اے ٹی اسکین، پی ای ٹی اسکین یا این ایم آر) ایک متعدی ایجنٹ کی نشوونما کے نتیجے میں اندرونی غیر معمولی چیزوں کی تصاویر تیار کرنے کے لیے استعمال کی جاتی ہیں۔ مائکروبیل کلچر مائکروبیولوجیکل کلچر بنیادی طریقہ ہے جو لیبارٹری میں مطالعہ کے لیے متعدی بیماری کو الگ کرنے کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ ٹشو یا سیال کے نمونوں کی جانچ ایک مخصوص پیتھوجین کی موجودگی کے لیے کی جاتی ہے، جس کا تعین انتخابی یا تفریقی میڈیم میں نشوونما سے ہوتا ہے۔ جانچ کے لیے استعمال ہونے والے ذرائع ابلاغ کی 3 اہم اقسام یہ ہیں: سالڈ کلچر: غذائی اجزاء، نمکیات اور اگر کے مرکب کا استعمال کرتے ہوئے ایک ٹھوس سطح بنائی جاتی ہے۔ اگر پلیٹ پر ایک مائکروب پھر کالونیوں (کلون جہاں خلیات ایک دوسرے سے ملتے جلتے ہیں) میں بڑھ سکتا ہے جس میں ہزاروں خلیات ہوتے ہیں۔ یہ بنیادی طور پر بیکٹیریا اور فنگس کو کلچر کرنے کے لیے استعمال ہوتے ہیں۔ مائع کلچر: خلیات مائع میڈیا کے اندر اگائے جاتے ہیں۔ مائکروبیل نمو کا تعین مائع کو کولائڈل معطلی بنانے میں لگنے والے وقت سے ہوتا ہے۔ یہ تکنیک پرجیویوں کی تشخیص اور مائیکوبیکٹیریا کا پتہ لگانے کے لیے استعمال ہوتی ہے۔ سیل کلچر: انسانی یا جانوروں کے سیل کلچر دلچسپی کے مائکروب سے متاثر ہوتے ہیں۔ ان ثقافتوں کا مشاہدہ اس بات کا تعین کرنے کے لیے کیا جاتا ہے کہ مائکروب کے خلیوں پر کیا اثر پڑتا ہے۔ یہ تکنیک وائرس کی شناخت کے لیے استعمال ہوتی ہے۔ مائکروسکوپی کلچر تکنیک اکثر مائکروسکوپک معائنہ کا استعمال کرتی ہیں تاکہ مائکروب کی شناخت میں مدد مل سکے۔ مرکب روشنی خوردبین جیسے آلات کو حیاتیات کے اہم پہلوؤں کا اندازہ لگانے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ یہ مریض سے نمونہ لینے کے فورا بعد کیا جا سکتا ہے اور بائیو کیمیکل سٹیننگ تکنیک کے ساتھ مل کر استعمال کیا جاتا ہے، جس سے سیلولر خصوصیات کے حل کی اجازت ملتی ہے۔ تحقیق کے لیے جرثوموں کا زیادہ تفصیل سے مشاہدہ کرنے کے لیے الیکٹران خوردبین اور فلوروسینس خوردبین بھی استعمال کیے جاتے ہیں۔ الیکٹران خوردبین کی دو اہم اقسام اسکیننگ الیکٹران خوردبین اور ٹرانسمیشن الیکٹران خوردبین ہیں۔ ٹرانسمیشن الیکٹران مائکروسکوپی الیکٹرانوں کو دلچسپی کے سیل کے ایک پتلی کراس سیکشن سے گزرتی ہے، اور پھر یہ الیکٹرانوں کو فلوروسینٹ اسکرین پر ری ڈائریکٹ کرتی ہے۔ یہ طریقہ خلیوں کے اندر اور اندر کے ڈھانچوں، خاص طور پر خلیوں کی دیواروں اور جھلیوں کو دیکھنے کے لیے مفید ہے۔ اسکیننگ الیکٹران مائکروسکوپی ان الیکٹرانوں کو پڑھتی ہے جو خلیوں کی سطح سے جھلکتے ہیں۔ اس کے بعد ایک سہ جہتی تصویر بنائی جاتی ہے جو خلیوں کے سائز اور بیرونی ساخت کو ظاہر کرتی ہے۔ دونوں تکنیکیں جرثوموں کی ساخت کے بارے میں مزید تفصیلی معلومات فراہم کرنے میں مدد کرتی ہیں۔ یہ اسے بہت سے طبی شعبوں میں مفید بناتا ہے، جیسے جسم کے بہت سے حصوں کی تشخیص اور بائیوپسیز، حفظان صحت، اور وائرولوجی۔ وہ پیتھوجینز کی ساخت کے بارے میں اہم معلومات فراہم کرتے ہیں، جو ڈاکٹروں کو زیادہ علم کے ساتھ ان کا علاج کرنے کی اجازت دیتے ہیں۔ بائیو کیمیکل ٹیسٹ متعدی ایجنٹوں کی شناخت کے لیے تیز اور نسبتا سادہ بائیو کیمیکل ٹیسٹ استعمال کیے جا سکتے ہیں۔ بیکٹیریا کی شناخت کے لیے، میٹابولک یا انزیمیٹک خصوصیات کا استعمال عام ہے کیونکہ ان کی جینس اور پرجاتیوں کی خصوصیت کے نمونوں میں کاربوہائیڈریٹ کو خمیر کرنے کی صلاحیت ہے۔ ایسڈ، الکحل اور گیسوں کا عام طور پر ان ٹیسٹوں میں پتہ چلتا ہے جب بیکٹیریا کو منتخب مائع یا ٹھوس میڈیا میں اگایا جاتا ہے، جیسا کہ اوپر بتایا گیا ہے۔ ان ٹیسٹوں کو بڑے پیمانے پر انجام دینے کے لیے خودکار مشینیں استعمال کی جاتی ہیں۔ یہ مشینیں بیک وقت متعدد بائیو کیمیکل ٹیسٹ انجام دیتی ہیں، جن میں مختلف کنویں والے کارڈز کا استعمال کیا جاتا ہے جن میں مختلف پانی کی کمی والے کیمیکل ہوتے ہیں۔ دلچسپی کا مائکروب ہر کیمیکل کے ساتھ ایک مخصوص انداز میں رد عمل ظاہر کرے گا، جس سے اس کی شناخت میں مدد ملے گی۔ سیرولوجیکل طریقے انتہائی حساس، مخصوص اور اکثر انتہائی تیز لیبارٹری ٹیسٹ ہوتے ہیں جو مختلف قسم کے مائکروجنزموں کی شناخت کے لیے استعمال ہوتے ہیں۔ ٹیسٹ اینٹی باڈی کی خاص طور پر اینٹیجن سے جڑے رہنے کی صلاحیت پر مبنی ہوتے ہیں۔ اینٹیجن (عام طور پر ایک متعدی ایجنٹ کے ذریعہ بنایا گیا پروٹین یا کاربوہائیڈریٹ) اینٹی باڈی سے جڑا ہوتا ہے، جس سے اس قسم کے ٹیسٹ کو بیکٹیریا کے علاوہ دیگر حیاتیات کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ یہ بائنڈنگ پھر واقعات کا ایک سلسلہ شروع کرتی ہے جس کا ٹیسٹ کے لحاظ سے آسانی سے اور قطعی طور پر مشاہدہ کیا جا سکتا ہے۔ زیادہ پیچیدہ سیرولوجیکل تکنیکوں کو امیونواسس کے نام سے جانا جاتا ہے۔ جیسا کہ اوپر بیان کیا گیا ہے اسی طرح کی بنیاد کا استعمال کرتے ہوئے، امیونواسے انفیکشن کے جواب میں متعدی ایجنٹوں یا متاثرہ میزبان کے ذریعہ تیار کردہ پروٹین سے اینٹیجنز کا پتہ لگا سکتے ہیں یا ان کی پیمائش کر سکتے ہیں۔ پولیمیرس چین ری ایکشن (پی سی آر) تشخیص جرثوموں کا پتہ لگانے اور ان کا مطالعہ کرنے کے لیے سب سے زیادہ استعمال ہونے والی سالماتی تکنیک ہے۔ دوسرے طریقوں کے مقابلے میں ترتیب اور تجزیہ قطعی، قابل اعتماد، درست اور تیز ہے۔ آج، مقداری پی سی آر استعمال کی جانے والی بنیادی تکنیک ہے، کیونکہ یہ طریقہ معیاری پی سی آر جانچ کے مقابلے میں تیز ڈیٹا فراہم کرتا ہے۔ مثال کے طور پر، روایتی پی سی آر تکنیکوں میں رد عمل ختم ہونے کے بعد امپلیفائیڈ ڈی این اے مالیکیولز کو دیکھنے کے لیے جیل الیکٹروفورسس کے استعمال کی ضرورت ہوتی ہے۔ مقداری پی سی آر کو اس کی ضرورت نہیں ہے، کیونکہ پتہ لگانے کا نظام ڈی این اے مالیکیولز کا پتہ لگانے کے لیے فلوروسینس اور تحقیقات کا استعمال کرتا ہے کیونکہ انہیں بڑھایا جا رہا ہے۔ اس کے علاوہ، مقداری پی سی آر آلودگی کے خطرے کو بھی دور کرتا ہے جو معیاری پی سی آر طریقہ کار (پی سی آر پروڈکٹ کو بعد کے پی سی آر میں لے جانے) کے دوران ہو سکتا ہے۔ جرثوموں کا پتہ لگانے اور ان کا مطالعہ کرنے کے لیے پی سی آر کا استعمال کرنے کا ایک اور فائدہ یہ ہے کہ نئے دریافت شدہ متعدی جرثوموں یا تناؤ کے ڈی این اے کے سلسلے کا موازنہ ڈیٹا بیس میں پہلے سے درج کردہ سے کیا جا سکتا ہے، جس کے نتیجے میں یہ سمجھنے میں مدد ملتی ہے کہ کون سا جاندار متعدی بیماری کا سبب بن رہا ہے اور اس طرح علاج کے کون سے ممکنہ طریقے استعمال کیے جا سکتے ہیں۔ یہ تکنیک وائرل انفیکشن جیسے ایڈز اور ہیپاٹائٹس کا پتہ لگانے کے لیے موجودہ معیار ہے۔ علاج ایک بار جب کسی انفیکشن کی تشخیص اور شناخت ہو جاتی ہے، تو معالج اور طبی مائکروبیولوجسٹ سے مشورہ کرکے مناسب علاج کے اختیارات کا جائزہ لینا ضروری ہے۔ کچھ انفیکشن کا علاج جسم کے اپنے مدافعتی نظام سے کیا جا سکتا ہے، لیکن زیادہ سنگین انفیکشن کا علاج اینٹی مائکروبیل دوائیوں سے کیا جاتا ہے۔ بیکٹیریل انفیکشن کا علاج اینٹی بیکٹیریلز (اکثر اینٹی بائیوٹکس کہا جاتا ہے) سے کیا جاتا ہے جبکہ فنگل اور وائرل انفیکشن کا علاج بالترتیب اینٹی فنگلز اور اینٹی وائرل سے کیا جاتا ہے۔ پرجیوی بیماریوں کے علاج کے لیے اینٹی پیراسائٹس کے نام سے جانے جانے والی دوائیوں کا ایک وسیع طبقہ استعمال کیا جاتا ہے۔ طبی مائکروبیولوجسٹ اکثر مریض کے معالج کو مائکروب کے تناؤ اور اس کی اینٹی بائیوٹک مزاحمت، انفیکشن کی جگہ، اینٹی مائکروبیل دوائیوں کی ممکنہ زہریلا پن اور مریض کو ہونے والی کسی بھی منشیات کی الرجی کی بنیاد پر علاج کی سفارشات دیتے ہیں۔ منشیات کے علاوہ کسی خاص قسم کے جاندار (بیکٹیریا، فنگس وغیرہ) کے لیے مخصوص ہونا۔ )، کچھ دوائیں کسی خاص جینس یا حیاتیات کی انواع کے لیے مخصوص ہوتی ہیں، اور دوسرے حیاتیات پر کام نہیں کریں گی۔ اس خاصیت کی وجہ سے، طبی مائکروبیولوجسٹوں کو سفارشات کرتے وقت بعض اینٹی مائکروبیل ادویات کی تاثیر پر غور کرنا چاہیے۔ مزید برآں، کسی جاندار کے تناؤ کسی خاص دوا یا منشیات کی کلاس کے خلاف مزاحم ہو سکتے ہیں، یہاں تک کہ جب یہ عام طور پر انواع کے خلاف موثر ہو۔ یہ تناؤ، جنہیں مزاحم تناؤ کہا جاتا ہے، طبی صنعت کے لیے بڑھتی ہوئی اہمیت کا ایک سنگین صحت عامہ کا خدشہ پیش کرتے ہیں کیونکہ اینٹی بائیوٹک مزاحمت کا پھیلاؤ خراب ہوتا ہے۔ اینٹی مائکروبیل مزاحمت ایک تیزی سے پریشانی کا مسئلہ ہے جو ہر سال لاکھوں اموات کا باعث بنتا ہے۔ اگرچہ منشیات کے خلاف مزاحمت میں عام طور پر جرثومے شامل ہوتے ہیں جو کیمیائی طور پر کسی اینٹی مائکروبیل دوا کو غیر فعال کرتے ہیں یا ایک خلیہ میکانکی طور پر کسی دوا کے استعمال کو روکتا ہے، بائیو فلمز کی تشکیل سے منشیات کے خلاف مزاحمت کی ایک اور شکل پیدا ہو سکتی ہے۔ کچھ بیکٹیریا لگائے گئے آلات جیسے کیتھیٹر اور پروستھیسز پر سطحوں پر چپکے رہ کر اور دوسرے خلیوں کے لیے ایک ایکسٹرا سیلولر میٹرکس بنا کر بائیو فلم بنانے کے قابل ہوتے ہیں۔ یہ انہیں ایک مستحکم ماحول فراہم کرتا ہے جہاں سے بیکٹیریا منتشر ہو سکتے ہیں اور میزبان کے دوسرے حصوں کو متاثر کر سکتے ہیں۔ مزید برآں، بیکٹیریل خلیوں کی ایکسٹرا سیلولر میٹرکس اور گھنے بیرونی پرت اندرونی بیکٹیریا کے خلیوں کو اینٹی مائکروبیل دوائیوں سے بچا سکتی ہے۔ فیج تھراپی ایک ایسی تکنیک ہے جو اینٹی بائیوٹکس سے پہلے دریافت کی گئی تھی، لیکن اینٹی بائیوٹکس کے غالب ہونے کے ساتھ ہی یہ راستے میں گر گئی۔ اسے اب اینٹی مائکروبیل مزاحمت کو بڑھانے کے ممکنہ حل کے طور پر سمجھا جا رہا ہے۔ بیکٹیریوفیجز، وائرس جو صرف بیکٹیریا کو متاثر کرتے ہیں، خاص طور پر دلچسپی کے بیکٹیریا کو نشانہ بنا سکتے ہیں اور ان کے جینوم کو انجیکشن دے سکتے ہیں۔ یہ عمل بیکٹیریا کو مزید فیجز بنانے کے لیے اپنی پیداوار کو روکنے پر مجبور کرتا ہے، اور یہ اس وقت تک جاری رہتا ہے جب تک کہ بیکٹیریا خود کو بند نہیں کر لیتے اور فیجز کو آس پاس کے ماحول میں چھوڑ نہیں دیتے۔ فیج تھراپی مائکرو بائیوٹا کو نہیں مارتی کیونکہ یہ مخصوص ہے، اور یہ اینٹی بائیوٹک الرجی والے لوگوں کی مدد کر سکتی ہے۔ کچھ خرابیاں یہ ہیں کہ یہ ایک وقت طلب عمل ہے کیونکہ مخصوص جراثیم کی شناخت کرنے کی ضرورت ہے۔ اس کے پاس فی الحال اس کے اثرات اور حفاظت کی حمایت کرنے والی تحقیق کا ادارہ بھی نہیں ہے جو اینٹی بائیوٹکس کرتے ہیں۔ بیکٹیریا بالآخر سی آر آئی ایس پی آر/سی اے ایس 9 سسٹم جیسے نظاموں کے ذریعے بھی مزاحم بن سکتے ہیں۔ اگرچہ بہت سے کلینیکل ٹرائلز امید افزا رہے ہیں، یہ ظاہر کرتے ہوئے کہ یہ ممکنہ طور پر اینٹی مائکروبیل مزاحمت کے مسئلے میں مدد کر سکتا ہے۔ یہ ایک مجموعی اثر کے لیے اینٹی بائیوٹکس کے ساتھ مل کر بھی استعمال کیا جا سکتا ہے۔ میڈیکل مائکروبیولوجی صرف بیماری کی تشخیص اور علاج کے بارے میں نہیں ہے، اس میں فائدہ مند جرثوموں کا مطالعہ بھی شامل ہے۔ جراثیم متعدی بیماری کا مقابلہ کرنے اور صحت کو فروغ دینے میں مددگار ثابت ہوئے ہیں۔ علاج جرثوموں سے تیار کیے جا سکتے ہیں، جیسا کہ الیگزینڈر فلیمنگ کی پینسلن کی دریافت کے ساتھ ساتھ بیکٹیریل جینس سٹریپٹومیسیس سے نئی اینٹی بائیوٹکس کی ترقی سے ظاہر ہوتا ہے۔ مائکروجنزم نہ صرف اینٹی بائیوٹکس کا ذریعہ ہیں بلکہ کچھ میزبان کو صحت سے متعلق فوائد فراہم کرنے کے لیے پروبائیوٹکس کے طور پر بھی کام کر سکتے ہیں، جیسے کہ معدے کی بہتر صحت فراہم کرنا یا پیتھوجینز کو روکنا۔ حوالہ جات بیرونی روابط میڈیکل مائکروبیولوجی مائکروبیولوجی کلینیکل پیتھولوجی پیتھولوجی اپلائیڈ مائکروبیولوجی