Rhodococcus fascians
روڈوکوکس فاشینس (1984 تک کورینبیکٹیریم فاشینس کے نام سے جانا جاتا ہے) ایک گرام مثبت بیکٹیریل فائٹوپاتھوجن ہے جو پتوں والی گال کی بیماری کا سبب بنتا ہے۔ آر فاشینس روڈوکوکس جینس کا واحد فائٹوپاتھوجینک رکن ہے۔ اس کی میزبان رینج میں ڈائکوٹائلڈونس اور مونوکوٹائلڈونس میزبان دونوں شامل ہیں۔ چونکہ یہ عام طور پر تمباکو (نیکوٹیانا) کے پودوں کو متاثر کرتا ہے، اس لیے یہ زرعی لحاظ سے ایک اہم پیتھوجین ہے۔ فزیولوجی اور مورفولوجی آر۔ فاشینس ایکٹینومائسیٹس کا ایک ایروبک، پلیومورفک بیکٹیریا ہے جو غیر متحرک ہے اور بیج نہیں بناتا ہے۔ اگر پلیٹ کی سطح پر اگائی جاتی ہے تو کالونیاں نارنجی رنگ کی ہوتی ہیں اور ہموار یا کھردری دونوں نظر آتی ہیں۔ وائرولنس آر فاشین پودوں کا ایک روگجن ہو سکتا ہے، دونوں انجیوسپرم یا جمناسپرم۔ متاثرہ پودے عام علامات ظاہر کرتے ہیں، جیسے پتی کی اخترتی، جادوئی جھاڑو اور پتی کا گال، جس کی نشوونما پودے کی کاشت، پودے کی عمر اور بیکٹیریا کے تناؤ پر منحصر ہوتی ہے۔ پتی کی اخترتی پیرنکیما کے چوڑے ہونے اور شریانوں کے نظام کی نشوونما پر مشتمل ہوتی ہے، جس کے نتیجے میں لامینے کی جھریاں پڑ جاتی ہیں اور رگوں کا چوڑا ہونا ہوتا ہے۔ پت دار گال ایک پاخانہ ہے جو ایک کلی سے پیدا ہوتا ہے جو عام حالات میں تیار نہیں ہوتا ہے۔ آر۔ فاشینس کے انفیکشن سے آنے والے تمام اثرات پودوں کے خلیوں کی تبدیلی پر منحصر نہیں ہوتے ہیں (جیسا کہ وہ ایگروبیکٹیریم ٹیومیفیشینز یا ایگروبیکٹیریم رائیزوجینز میں ہوتے ہیں)، بلکہ بیکٹیریم کے وائرولنس سے متعلق جینوں کے اظہار اور ان مرکبات کی پیداوار پر جو پودوں کی معمول کی نشوونما اور نشوونما میں مداخلت کر سکتے ہیں۔ انفیکشن کے دوران، آر فاسیئن عام طور پر پودے کی خلیے کی دیواروں کے جنکشن یا گہا کے قریب، نباتاتی بافتوں سے باہر رہتے ہیں، شاید ماحولیاتی تناؤ سے بچنے کے لیے۔ آر فاشینوں کی موجودگی بافتوں کے اندر (پتی یا گالوں میں) اور یہاں تک کہ خلیوں کی دیواروں کے اندر بھی بین سیلولر خالی جگہوں میں دیکھی گئی۔ متاثرہ پودے پر آر فاشین کی موجودگی ضروری ہے، نہ صرف انفیکشن کے آغاز کے لیے بلکہ اس کی دیکھ بھال کے لیے بھی۔ آر۔ فاسیئنز میں وائرل جینز کو پلازمیڈ پر موجود جینز کے ذریعے کنٹرول کیا جاتا ہے (جس میں پلازمیڈ کی کمی ہوتی ہے وہ وائرل نہیں ہوتے ہیں) اور کروموسوم پر۔ حذف کرنے والی تغیرات کا استعمال کرتے ہوئے، پلازمیڈ پر تین لوکی کی شناخت کرنا ممکن تھا: فاس، ایٹ، اور ہائپ، اور کروموسوم پر ایک لوکس، وک۔ ایف اے ایس چھ جینوں (او آر ایف 1-6) اور ایک ریگولیٹری جین، ایف اے ایس آر سے بنا ایک اوپیرون ہے۔ کیونکہ کچھ فاس جینوں کے حذف ہونے سے ایک غیر وائرل فینوٹائپ ملتا ہے، کیونکہ فاس کے لیے وائرس میں ایک اہم کردار تجویز کیا گیا تھا۔ جین ایف اے ایس آر ایک اے آر اے سی جیسا ٹرانسکرپشنل ریگولیٹر ہے۔ اس کی نقل و حمل بعض کاربن ذرائع (جیسے گلوکوز، سکروز، اربینوز، گلیسرول، پائروویٹ، مینٹول، مینوز) یا نائٹروجن کے ذرائع (جیسے ہسٹائڈائن) پر مشتمل ثقافتوں میں وٹرو میں پیدا کی جا سکتی ہے، اور کلچر پی ایچ اور نظری کثافت سے متاثر ہوتی ہے۔ اس کے علاوہ، ایف اے ایس آر کو وائرل تناؤ سے پیدا ہونے والے گال کے نچوڑ سے متاثر کیا جا سکتا ہے۔ آپریون سائٹوکینن کی ترکیب اور انحطاط (او آر ایف 4,5,6) میں شامل جینوں کے لیے ضابطہ بندی کرتا ہے، خاص طور پر آئسوپینٹینائل ٹرانسفرس، سائٹوکینن آکسیڈیز اور گلوٹیشن-ایس ٹرانسفرس کے لیے۔ او آر ایف 1,2,3 سائٹوکروم 450 کے لیے نقل کرتا ہے، ایک فیریڈوکسین جس میں ایک پائروویٹ ڈی ہائیڈروجنیز الفا نما ڈومین اور ایک پائروویٹ ڈی ہائیڈروجنیز بیٹا ذیلی یونٹ بھی ہوتا ہے۔ یہ خیال کیا جاتا تھا کہ پہلے تین جین سائٹوکینن کی ترکیب اور انحطاط کے لیے توانائی فراہم کرتے ہیں، جو اوپیرون کے آخری تین جینوں کے ذریعے انجام دیا جاتا ہے: آر۔ فاشیئن دراصل زیٹین اور آئسوپینٹینیل اڈینائن تیار اور خراب کر سکتے ہیں۔ مرکب سائٹوکن آکسیڈیز (او آر ایف 4) پوزیشن 6 میں رد عمل والے نائٹروجن کے ساتھ اڈینائن بھی بنا سکتا ہے، جو دیگر پس منظر کی زنجیروں کے ساتھ رد عمل ظاہر کر سکتا ہے، سائٹوکینن جیسے مرکبات تشکیل دے سکتا ہے، جو پودوں کے بافتوں کی نشوونما کو فروغ دینے میں زیادہ موثر ہے۔ اے ٹی ایک اوپیرون ہے جو نو جینوں پر مشتمل ہے:، ایک ٹرانسکرپشنل ریگولیٹر، ایک جین جس میں ٹرانس میمبرین لوکلائزیشن کے لیے ڈومینز شامل ہیں (شاید دوسرے اے ٹی جینز کے ذریعے بنائے گئے مرکبات کی برآمد کے لیے درکار)، اور کئی جین اے ٹی اے -۔ بہت سے پوائنٹ اور Δatt اتپریورتن ایک تخفیف شدہ وائرولنس ظاہر کرتے ہیں۔ جین ایک نقل پذیر عنصر ہے جس میں ہیلکس-ٹرن-ہیلکس موٹف بھی شامل ہے۔ اس کی نقل کو انہی عوامل کے ذریعے منظم کیا جاتا ہے جو ایف اے ایس آر نقل کو منظم کرتے ہیں، لیکن زیادہ شدت کے ساتھ، یہ تجویز کرتے ہیں کہ اے ٹی میوٹینٹس میں وائرس کی شدت میں کمی کے ساتھ، اے ٹی ایف اے ایس نقل کو منظم کر سکتا ہے۔ اے ٹی اوپیرون کی نقل کو کورم سینسنگ میکانزم کے ساتھ منظم کیا جاتا ہے: درحقیقت، ثقافتوں کی کثافت اس کی نقل کو متاثر کر سکتی ہے، اور اے ٹی میوٹینٹ تناؤ کے ذریعہ بنائے گئے گالوں سے آنے والے پتوں والے گال کے نچوڑ اس کی نقل پر کم موثر ہوتے ہیں۔ جین اے ٹی اے-اور کی نقل کے لیے درکار مرکبات کی ترکیب میں شامل ہو سکتے ہیں۔ در حقیقت، اے ٹی اے، اے ٹی ڈی اور بیٹالیکٹامیز کی ترکیب میں شامل ہیں، لیکن کلچر سپرنٹینٹس میں ان مرکبات کا کوئی سراغ نہیں ملا۔ ہائپ آر این اے-ہیلیکیس کے لیے کوڈیفائی کرتا ہے ؛ اس جین کے لیے میوٹینٹ ہائپر وائرل ہوتے ہیں۔ نیز، ہائپ وائرس سے متعلق جینوں کے پوسٹ ٹرانسکرپشنل کنٹرول میں شامل ہے، شاید ایف اے ایس مصنوعات پر۔ آپریون وک ایک آپریون ہے جو پانچ جینوں سے بنا ہے، جو بیکٹیریل کروموسوم پر واقع ہے۔ واحد معلوم جین ویکا ہے، جو اوپیرون میں چوتھا جین ہے، جس کی پیداوار ماس ہومولوگ ہے، جو کہ میٹابولک وجوہات اور گلائی آکسیلیٹ کے جمع ہونے سے بچنے کے لیے، سائٹرک ایسڈ سائیکل سے گلائی آکسیلیٹ سائیکل میں تبدیل ہونے کے لیے درکار پروٹین ہے، جو بیکٹیریا کے لیے زہریلا ہے۔ وی سی اے میں تغیرات آر فاشیوں کی گلائی آکسیلیٹ کے جمع ہونے کے خلاف مزاحمت کرنے کی نااہلی کی وجہ سے وائرس کو کم کرتے ہیں۔ تمباکو میں متاثرہ پودے میں ٹرانسکرپشن کا انڈکشن، آر فاسیئنز کا انفیکشن سائٹوکروم پی 450 کے ہائپر ایکسپریشن کا باعث بنتا ہے، عربیڈوپسس تھالیانا میں ابسیسک ایسڈ کو غیر فعال کرنے میں شامل جین کے لیے ہومولوگ، گبریلک ایسڈ آکسیڈیز کا، جو اس ہارمون اور اس کے پیشروؤں کو غیر فعال کرتا ہے، ایک پرولین ڈی ہائیڈروجنیز، جس کی نقل سائٹوکینن سے متاثر ہوتی ہے اور پرولین کو گلوٹامک ایسڈ میں بدل دیتی ہے، اور مولیبڈینم کوفیکٹر میں شامل ایک عنصر، جو سلفر، کاربن اور نائٹروجن میٹابولزم کنٹرول اور ابسیسک ایسڈ کی ترکیب کے لیے درکار ہوتا ہے۔ انفیکشن کے دوران فائٹو ہارمونز کا کردار آر فاشین انفیکشن کے تمام اثرات کو ہارمون ہائپر ڈوج سے منسوب کیا جا سکتا ہے۔ خاص طور پر، زیادہ تر اثرات آکسین اور سائٹوکینن سے جڑے ہوتے ہیں، جیسے: پتیوں پر سبز جزائر کی تشکیل، لامینے کی جھریاں پڑنا، کلی کا پھیلاؤ، بڑھاپے میں تاخیر، اور پس منظر کی جڑوں کی روک تھام۔ در حقیقت، آر فاسیئن خود سائٹوکینن، یا سائٹوکینن جیسے مرکبات تیار کر سکتے ہیں: فاس اوپیرون میں او آر ایف 4 اور او آر ایف 5 کا استعمال کرتے ہوئے، یہ متاثرہ پودوں کو سائٹوکینن پیدا کرنے کے لیے متحرک کر سکتا ہے، اور یہ ٹرپٹوفین سے شروع ہونے والے راستے کا استعمال کرتے ہوئے اور 3-انڈول-پیروویک ایسڈ اور 3-انڈول-ایسیٹالڈیڈ کی پیداوار سے گزرتے ہوئے خود انڈول-3-ایسیٹک ایسڈ تیار کر سکتا ہے۔ R.fascians سائٹوکینن/آکسین تناسب کو متاثر کرنے کے لیے سائٹوکینن کو بھی خراب کر سکتا ہے۔ سائٹوکینن اور آکسین کے علاوہ، آر فاشین دوسرے ہارمونز پر بھی کام کرتے ہیں: خاص طور پر، یہ متاثرہ پودوں میں ایبسسیک ایسڈ اور گیبریلک ایسڈ کی ترکیب کو روک سکتا ہے۔ ابسیسیک ایسڈ نشوونما کو روکتا ہے، اس لیے پتوں والے گالوں میں خلیوں کے پھیلاؤ کی اجازت دینے کے لیے پیداوار کے ایک بلاک کی ضرورت ہوتی ہے۔ گبریلک ایسڈ سیلولر تفریق کو کنٹرول کرتا ہے، اس لیے اس کے بلاک کی ضرورت میریسٹیمیٹک خلیوں کی دیکھ بھال اور ان کے پھیلاؤ کے لیے ہوتی ہے۔ پودوں کی بیماریاں آر۔ فاسیئن کئی میزبان پودوں میں بیماریوں کا سبب بنتے ہیں جن میں تمباکو، چھوٹے پھل (کین بیری، اسٹرابیری) اور آرائشی پودے (تیتلی کے پھول، پرائمولا، کالانچوز، امپیٹینز، جیرینیم، کارنیشن) حوالہ جات بیرونی روابط بیک ڈائیو میں روڈوکوکس فاسیئنز کی قسم کا تناؤ-بیکٹیریل تنوع میٹاڈیٹابیس مائیکوبیکٹیریلز بیکٹیریل پلانٹ کے پیتھوجینز اور بیماریاں تمباکو کی بیماریاں چھوٹے پھلوں کی بیماریاں بیکٹیریل اسٹرابیری کی بیماریاں آرائشی پلانٹ کے پیتھوجینز اور بیماریاں شامل ہیں۔