Mycobacterium africanum
مائیکوبیکٹیریم افریکینم مائیکوبیکٹیریم کی ایک قسم ہے جو عام طور پر مغربی افریقی ممالک میں پائی جاتی ہے، جہاں اندازہ لگایا جاتا ہے کہ یہ پھیپھڑوں کی تپ دق کا 40 فیصد تک سبب بنتی ہے۔ انفیکشن کی علامات ایم ٹی بی سے ملتی جلتی ہیں۔ یہ مائیکوبیکٹیریم ٹیوبرکلوسس کمپلیکس کا ایک رکن ہے۔ درجہ بندی مائیکوبیکٹیریم ٹیوبرکلوسس کمپلیکس (ایم ٹی بی سی) میں سات بڑے نسب ہیں، جن میں نسب 5 اور 6 کو مائیکوبیکٹیریم افریکینم کے طور پر درجہ بند کیا گیا ہے۔ ایم ٹی بی سی نسب 5 ایم۔ افریکینم ٹائپ 1، مغربی افریقی 1 (ایم اے ایف 1) ہے، اور اس کی درجہ بندی ریجن آف ڈفریٚنسیشن (آر ڈی) 711 کی خصوصیت کو حذف کرنے کی بنیاد پر کی گئی ہے۔ ایم اے ایف 1 عام طور پر خلیج گنی کے آس پاس پایا جاتا ہے۔ ایم ٹی بی سی نسب 6 کو ایم افریکینم ٹائپ 1، ویسٹ افریکن 2 (ایم اے ایف 2) کے نام سے بھی جانا جاتا ہے، اور اس کی درجہ بندی آر ڈی 702 کے حذف ہونے کی بنیاد پر کی گئی ہے۔ ایم اے ایف 2 مغربی افریقہ میں رائج ہے۔ ایم۔ افریکینم ٹائپ 2، مشرقی افریقی، کو پہلے مائیکوبیکٹیریم افریکینم کے ایک تناؤ کے طور پر تسلیم کیا گیا تھا۔ اسے حال ہی میں ایم ٹی بی سی نسب 4 کے ذیلی نسب میں مائیکوبیکٹیریم ٹیوبرکلوسس جینوٹائپ "یوگنڈا" کے طور پر دوبارہ درجہ بند کیا گیا تھا۔ تاریخ ایم افریکینم کو سب سے پہلے ایم ٹی بی سی کے اندر ایک ذیلی نسل کے طور پر بیان کیا گیا تھا، جس میں 1968 میں کاسٹیٹس کے ذریعہ بائیو کیمیکل ٹیسٹنگ کی بنیاد پر ایم تپ دق اور ایم بووس کے درمیان انٹرمیڈیٹ فینوٹائپک خصوصیات تھیں۔ ابتدائی جینیاتی تجزیے سے پتہ چلتا ہے کہ یہ جینومک آر ڈی 9 کے حذف ہونے اور گائر بی نیوکلیوٹائڈ کی الگ ترتیب کی وجہ سے ایم ٹی بی سے الگ تھا، اور برقرار آر ڈی 12 اور آر ڈی 4 کی وجہ سے ایم بووس سے الگ تھا۔ مائکروبیولوجی ایم۔ افریکینم کم آکسیجن کے حالات میں پائروویٹ پر مشتمل میڈیا میں اگایا جاتا ہے، اور خصوصیت والی "ڈیسگونک" کالونیاں بناتا ہے۔ ایم۔ تپ دق کے برعکس، ایم۔ افریکینم کیٹالیز سرگرمی ظاہر کرتا ہے، نائٹریٹ منفی ہے، اور تھیوپین-2-کاربوکسلک ایسڈ ہائیڈرازائڈ (ٹی سی ایچ) اور پیرازینامائڈ (پی زیڈ اے) کے لیے حساس ہے۔ ایم۔ افریکینم بھی ایم۔ تپ دق کے مقابلے میں آہستہ بڑھ رہا ہے، عام طور پر ایم۔ تپ دق کے لیے 3 سے 4 کے بجائے کالونیاں تیار کرنے میں 10 ہفتے لگتے ہیں۔ ایپیڈیمیولوجی ایم۔ افریکینم عام طور پر مغربی افریقی ممالک میں پایا جاتا ہے۔ یہ صرف انسانوں کا انفیکشن ہے اور بیماری کے کھلے معاملات والے افراد سے ہوا کے راستے سے پھیلتا ہے۔ یہ پوری طرح سے سمجھ میں نہیں آیا ہے کہ ایم۔ افریکینم کی تقسیم مغربی افریقہ تک محدود کیوں ہے، دوسرے خطوں میں صرف چھٹپٹ معاملات پائے جاتے ہیں۔ فائیلوجنیٹک شواہد سے پتہ چلتا ہے کہ ایم۔ افریکینم ابتدائی مرحلے میں امریکہ، یورپ اور ایشیا میں جدید ایم ٹی بی نسلوں سے شاخ دار تھا۔ کچھ تحقیق سے پتہ چلتا ہے کہ ایم۔ افریکینم مغربی افریقی آبادیوں کے مطابق ڈھال لیا گیا ہے۔ ایم۔ افریکینم دوسرے خطوں میں دوسرے ایم ٹی بی نسلوں سے مقابلہ کر سکتا ہے ؛ تاہم، جینیاتی مطالعات میں ایم۔ تپ دق اور ایم۔ افریکینم کے درمیان وائرل جینز کی تعداد یا جینیاتی تنوع میں کوئی فرق نہیں پایا گیا ہے۔ مختلف جنگلی جانور پائے جانے کے باوجود مائیکوبیکٹیریم افریکینم کے لیے کسی بھی جانوروں کے ذخیرے کی نشاندہی نہیں کی گئی ہے۔ اس میں عام ایم۔ تپ دق والے جاندار کی طرح انفیکشن کی ڈگری ہوتی ہے لیکن امیونوکمپٹینٹ فرد میں کلینیکل بیماری میں بڑھنے کا امکان کم ہوتا ہے۔ تاہم، ایم۔ افریکینم کے ایچ آئی وی مثبت مریض میں انفیکشن سے بیماری کا باعث بننے تک بڑھنے کا امکان زیادہ ہوتا ہے۔ ان ممالک میں جہاں ایم۔ افریکینم مقامی ہے، یہ ایچ آئی وی بیماری کے بعد کے مراحل کے ایک اہم موقع پرست انفیکشن کی نمائندگی کرتا ہے۔ پیتھوجینسیس یہ پوری طرح سے سمجھ میں نہیں آیا ہے کہ ایم۔ افریکینم اور ایم۔ تپ دق کے درمیان جینیاتی فرق کس طرح سابقہ کی کم پیتھوجینسیٹی کو جنم دیتے ہیں۔ تاہم، یہ معلوم ہے کہ فرق کے علاقے 9 (آر ڈی 9) میں ایم۔ افریکینم کی کمی ہے لیکن ایم۔ تپ دق میں موجود ہے۔ ایم۔ افریکینم میں لپڈ کیٹابولزم اور میٹابولزم میں بھی قابل ذکر فرق ہے۔ مزید برآں، ایم۔ افریکینم میں وائرس کے راستے جیسے ڈی او ایس آر/آر وی 0081 ریگولیشن یا ای ایس اے ٹی-6 ریگولیشن میں خلل پڑتا ہے۔ علاج مائیکوبیکٹیریم تپ دق اور افریکینم کے درمیان اسی طرح کی علامات اور نشوونما کے مختلف حالات کی وجہ سے، تشخیص کے لیے کلچر کے طریقے ناقابل اعتماد ہیں۔ سالماتی حیاتیات پر مبنی جینو ٹائپنگ نے شناخت کو بہتر بنایا ہے۔ خاص طور پر، "اسپولیگوٹائپنگ" یا "سپیسر اولیگونیوکلیوٹائڈ ٹائپنگ"، ایم ٹی بی سی میں جینو ٹائپنگ کے تناؤ کے لیے ایک تیز رفتار پولیمرس چین ری ایکشن پر مبنی طریقہ ہے۔ حال ہی میں، ایم ٹی بی سی کے تمام اراکین میں پائے جانے والے ایم پی ٹی 64 اینٹیجن کی بنیاد پر لیٹرل فلو ریپڈ ٹیسٹ تیار کیے گئے ہیں۔ ایم۔ افریکینم میں تاخیر سے فعال بیماری کی طرف بڑھنے کی شرح ایم۔ تپ دق سے کم ہے۔ ایم۔ افریکینم تپ دق کا علاج ایم۔ تپ دق کی وجہ سے ہونے والی تپ دق سے ملتا جلتا ہے۔ علاج کی مجموعی شرح ایک جیسی ہے، لیکن چونکہ ایم۔ افریکینم کے زیادہ مریضوں میں ایچ آئی وی مثبت ہونے کا امکان ہوتا ہے، اس لیے ان میں ایچ آئی وی سے متعلقہ دیگر بیماریوں سے زیادہ اموات ہو سکتی ہیں۔ ٹائپ اسٹرین اے ٹی سی سی 25420 = سی آئی پی 105147 حوالہ جات ببلیوگرافی بیرونی روابط مائیکوبیکٹیریم افریکینم این سی بی آئی ٹیکسونومی براؤزر ٹائپ اسٹرین آف مائیکوبیکٹیریم افریکینم ایٹ بیک ڈائیو-بیکٹیریل ڈائیورسٹی میٹا ڈیٹا بیس ایسڈ-فاسٹ بیسلی ٹیوبرکیولوسس افریکینم بیکٹیریا جو 1969 میں بیان کیا گیا تھا۔