Alfalfa mosaic virus
الفالفا موزیک وائرس (اے ایم وی)، جسے لوسرن موزیک وائرس یا آلو کیلیکو وائرس کے نام سے بھی جانا جاتا ہے، دنیا بھر میں تقسیم شدہ فائٹوپاتھوجن ہے جو تجارتی طور پر اہم فصلوں سمیت پودوں کی ایک بڑی قسم پر نیکروسس اور پیلے رنگ کے موزیک کا باعث بن سکتا ہے۔ یہ برومووائریڈی خاندان کا واحد الفامو وائرس ہے۔ 1931 میں ویمر جے ایل۔ الفالفا (میڈیکاگو سٹیوا) میں اے ایم وی کی اطلاع دینے والا پہلا شخص تھا۔ وائرس کی منتقلی بنیادی طور پر کچھ ایفیڈز (پودوں کی جوؤں)، بیجوں کے ذریعے یا جرگ کے ذریعے بیج میں ہوتی ہے۔ وائرولوجی ڈھانچہ وائرین میں کیپسڈ (کوٹ پروٹین) ہوتا ہے لیکن کوئی لفافہ نہیں ہوتا ہے۔ کیپسڈ کی آئکوساہیڈرل سمیٹری گول سے لمبی ہوتی ہے۔ وائریون ذرہ کی لمبائی کی حد تقریبا 30-57 nm ہے۔ اے ایم وی ایک ملٹی پارٹیٹ وائرس ہے اور یہ 18 این ایم کے قطر کے ساتھ چار ذرات (تین بیسیلفارم اور ایک کروی) پر مشتمل ہے۔ جینوم اے ایم وی کا جینیاتی مواد تین لکیری مثبت احساس والے اسٹرینڈ آر این اے (آر این اے 1، آر این اے 2 اور آر این اے 3) اور ایک ذیلی جینومک آر این اے (آر این اے 4) پر مشتمل ہوتا ہے جو آر این اے 3 کے منفی احساس والے اسٹرینڈ کی نقل کے ذریعے حاصل کیا جاتا ہے۔ آر این اے 1 اور 2 نقل کے لیے درکار پروٹین کو انکوڈ کرتے ہیں۔ خلیے سے خلیے کی حرکت کے لیے ذمہ دار پروٹین کی ترکیب کے لیے آر این اے 3 کی ضرورت ہوتی ہے۔ آر این اے 4 کیپسڈ کو انکوڈ کرتا ہے۔ اینکیپسیڈیشن اور حرکت میں اس کے کردار کے علاوہ، وائرل کوٹ پروٹین آر این اے کی نقل کے آغاز میں ایک کردار ادا کرتا ہے۔ اس خاصیت کو جینوم ایکٹیویشن کہا جاتا ہے اور اس کا مطلب یہ ہے کہ جینومک نیوکلک ایسڈ کیپسڈ کے بغیر متعدی نہیں ہے۔ انفیکشن کے لیے آر این اے 3 '-ٹرمینل سیکوینس یا سبجینومک ایم آر این اے کے ساتھ کوٹ پروٹین کی مخصوص ایسوسی ایشن ضروری ہے۔ بیسیلفارم ذرات میں الگ الگ آر این اے 1، 2 اور 3 ہوتے ہیں۔ کروی ذرات میں سے ہر ایک میں آر این اے 4 کی دو کاپیاں ہوتی ہیں۔ مکمل جینوم کی نیوکلیوٹائڈ ترتیب کا تعین کیا گیا ہے اور جینوم کی لمبائی 8274 نیوکلیوٹائڈز (یا 9155 بشمول ذیلی جینومک آر این اے) ہے۔ آر این اے 1، 2، 3 اور 4 بالترتیب 3644 (3.65kb)، 2593 (2.6kb)، 2037 (2.2kb) اور 881 (0.88kb) نیوکلیوٹائڈز لمبے ہیں۔ ریپلیکیشن سائیکل اے ایم وی سائیکل کو پانچ مراحل میں تقسیم کیا جا سکتا ہے: پہلا مرحلہ: اے ایم وی سیل میں داخل ہوتا ہے اور ذرات جدا ہو جاتے ہیں۔ کیپسڈ پروٹین آر این اے کے 3 '-سرے پر کوٹ پروٹین بائنڈنگ سائٹ (سی پی بی) سے منسلک رہتا ہے۔ میزبان کے ابتدائی عوامل ایل ایف 4 اے، ایل ایف 4 ای اور ایل ایف 4 جی ٹوپی (5 '-اینڈ) سے جڑے ہوتے ہیں۔ دوسرا مرحلہ: کوٹ پروٹین ایک ابتدائی عنصر کے ساتھ تعامل کرتا ہے۔ اس سے آر این اے 1 اور 2 کا نقل پروٹین پی 1 اور پی 2 میں ترجمہ ہوتا ہے۔ پیچیدہ P1/P2 RNA سے جڑا رہتا ہے۔ تیسرا مرحلہ: پی 1/پی 2 کے ذریعے ٹونوپلاسٹ تک آر این اے کو نشانہ بنانا۔ کیپسڈ سی پی بی سے الگ ہو جاتا ہے۔ سی پی بی ٹی ایل ایس (ٹی آر این اے جیسی ساخت) میں ایک تشخیصی تبدیلی سے گزرتا ہے۔ پی 1/پی 2 مائنس اسٹرینڈ پروموٹر سے جڑا ہوتا ہے جو ٹی ایل ایس اور ہیئر پن ای سے بنا ہوتا ہے (کچھ نقل کی شروعات کی ہدایت کرتا ہے)۔ چوتھا مرحلہ: مائنس اسٹرینڈ آر این اے کی ترکیب کی جاتی ہے۔ پانچواں مرحلہ: پلس اسٹرینڈ آر این اے اور وائرل پروٹین کی ترکیب کی جاتی ہے۔ ویرون جمع ہوتے ہیں۔ (نقل کے چکر کی زیادہ تر تفصیلات اب بھی نامعلوم ہیں)۔ پیتھولوجی اے ایم وی 70 خاندانوں (تجرباتی اور قدرتی میزبان) میں پودوں کی 600 سے زیادہ انواع کو متاثر کرتا ہے۔ کچھ میزبان: آلو (سولانم ٹیوبروسم)، مٹر (پیسم سیٹیوم)، تمباکو (نیکوٹیانا ٹیباکم)، ٹماٹر (لائکوپرسیکن ایسکولینٹم)، بلیو بیئرڈ (کیریوپٹیرس انکانا)۔ علامات مرجھانے، سفید فلیکس، ڈوارفنگ، رنگ سپاٹ، موٹلز، موزیک سے لے کر نیکروسیس تک مختلف ہوتی ہیں جو وائرس کے تناؤ، میزبان کی قسم، انفیکشن میں نشوونما کے مرحلے اور ماحولیاتی حالات پر منحصر ہوتی ہیں۔ انفیکشن کی علامات برقرار رہ سکتی ہیں یا تیزی سے غائب ہو سکتی ہیں۔ میزبان پودے کے ہر حصے میں وائرس کا پتہ لگایا جا سکتا ہے۔ وائرینز بنیادی طور پر متاثرہ پودے کے سائٹوپلازم میں پائے جاتے ہیں (شمولیت کے جسم کے طور پر ؛ الفالفا موزیک وائرس کی شمولیت)۔ ان وٹرو اے ایم وی کی لمبی عمر 1 سے 4 دن (بعض اوقات بہت زیادہ) ہوتی ہے۔ درجہ حرارت اور روشنی ماحولیاتی عوامل ہیں جو پودے میں اے ایم وی کے ضرب اور حرکت پر سب سے زیادہ اثر ڈالتے ہیں اور اس طرح بالواسطہ طور پر علامات پر۔ کم درجہ حرارت کے تحت مثال کے طور پر نیکروسس کی ظاہری شکل اعلی درجہ حرارت کے مقابلے میں کم ہوتی ہے۔ وائرس عام طور پر 60-65 °C پر اپنے غیر فعال درجہ حرارت تک پہنچ جاتا ہے۔ تاریک حالات وائرس کے ضرب کو سست کرتے ہیں، جبکہ روشنی اسے تیز کرتی ہے۔ اس رجحان کا ایک مفروضہ یہ ہے کہ شیڈنگ فوٹو سنتھیسز کے ذریعے اے ٹی پی کی پیداوار میں کمی کا سبب بنتی ہے۔ ایس اے پی میں اے ایم وی کے لیے زیادہ سے زیادہ پی ایچ تقریبا پی ایچ 7-7.5 پایا گیا (میزبان پرجاتیوں پر منحصر ہے)۔ یہ ثابت ہو چکا ہے کہ اہم چارہ گھاس الفالفا میں، اے ایم وی کے ذریعے ہونے والا انفیکشن سی یو، فی، ایم این، پی اور زیڈ این کی مقدار میں کمی کا باعث بنتا ہے۔ دوسری طرف، این (وائرل پروٹین) میں اضافہ دیکھا گیا۔ متاثرہ الفالفا کو بھی گھریلو جانوروں کے لیے نقصان دہ نہیں دیکھا گیا۔ اے ایم وی پودوں کا ایک بہت ہی متغیر وائرس ہے اور معمولی فرق کے ساتھ کئی تناؤ موجود ہیں (تناؤ ق، تناؤ ایس، تناؤ 425، تناؤ اے ایل ایم وی-بی، تناؤ اے ایل ایم وی-ایس،)۔ امتیاز ایک یا دو منتخب میزبانوں میں مختلف علامات پر مبنی ہوتا ہے اور مثال کے طور پر، تفریق جسمانی-کیمیائی خصوصیات پر بھی۔ ٹرانسمیشن ویکٹر ہیمیپٹیرا آرڈر کے کیڑے ہیں، خاندان ایفیڈیڈی ؛ سبز آڑو ایفیڈز (میزس پرسیکی) اور کم از کم 14 دیگر انواع اس کردار کو ادا کرنے کے لیے جانی جاتی ہیں۔ اے ایم وی کو بیج، جرگ، پودوں کے رس کے مکینیکل ٹیکہ کاری اور پرجیوی پودے کے چارہ (کسکوٹا) کے ذریعے بھی منتقل کیا جا سکتا ہے۔ بیج سے متاثرہ پودوں کے امتزاج اور ایفیڈز کے ذریعے پھیلنے کے نتیجے میں زیادہ تر انفیکشن کی سطح زیادہ ہوتی ہے۔ معاشی اہمیت وائرس کی میزبان رینج وسیع ہے اور اس میں خوراک اور چراگاہ کی فصلیں (مٹر، دال، آلو، کلوور) شامل ہیں۔ اے ایم وی کے ذریعے انفیکشن پیداوار میں اہم نقصان کا سبب بنتا ہے، موسم سرما میں بقا کو کم کرتا ہے اور دوسرے پیتھوجینز کے ذریعے متاثرہ پودے کے انفیکشن کو آسان بناتا ہے۔ ایفیڈز کے خلاف کیڑے مار ادویات کا انتظام اے ایم وی کو کنٹرول کرنے کے لیے مؤثر نہیں ہے۔ سفارشات میں صحت مند بیج کی بوائی (کچھ بیج کمپنیاں اے ایم وی کے لیے جانچ شدہ بیج فروخت کرتی ہیں)، گھاس پھوس کا انتظام، متاثرہ چراگاہ سے ملحقہ فصلوں کو اگانے سے گریز اور اے ایم وی کو کم کرنے کے لیے دیگر ثقافتی طریقے شامل ہیں۔ ٹرانسجینک اے ایم وی مزاحم پودے بنانے پر کام کیا گیا ہے۔ مثال کے طور پر، کیپسڈ کے لیے جین کو انکوڈنگ کرنے والے اے ایم وی سے حاصل کردہ ڈی این اے کو الفالفا پودوں میں داخل کیا گیا ہے۔ اس سے پودوں کی اے ایم وی کے ذریعے انفیکشن کی حساسیت کم ہو گئی اور پودے دوسرے پودوں میں پھیلنے کے لیے وائرس کے ذخائر سے کم ہوں گے۔ الفالفا موزیک وائرس کوٹ پروٹین بائنڈنگ (سی پی بی) آر این اے الفالفا موزیک وائرس آر این اے 1 5 ′ یو ٹی آر اسٹیم لوپ آلو کی وائرل بیماریاں حوالہ جات بیرونی روابط برومووائریڈی وائرل پلانٹ پیتھوجینز اور بیماریاں