Exonic splicing silencer
ایکسونک اسپلیسنگ سائلنسر (ای ایس ایس) ایک ایکسون کا ایک مختصر خطہ (عام طور پر 4-18 نیوکلیوٹائڈز) ہوتا ہے اور یہ ایک سی آئی ایس-ریگولیٹری عنصر ہوتا ہے۔ ایف اے ایس-ہیکس 3 کے نام سے جانے جانے والے 103 ہیکسانوکلیوٹائڈز کا ایک مجموعہ ای ایس ایس کے علاقوں میں وافر مقدار میں دکھایا گیا ہے۔ ای ایس ایس پری-ایم آر این اے کی تقسیم کو روکتے ہیں یا خاموش کرتے ہیں اور آئینی اور متبادل تقسیم میں حصہ ڈالتے ہیں۔ خاموش کرنے کے اثر کو ظاہر کرنے کے لیے، ای ایس ایس پروٹین بھرتی کرتے ہیں جو بنیادی اسپلیسنگ مشینری کو منفی طور پر متاثر کریں گے۔ ایکشن کا میکانزم ایکسونک اسپلیسنگ سائلنسر پری-ایم آر این اے اسٹرینڈز کے اسپلیسنگ کو روک کر یا ایکسن سکپنگ کو فروغ دے کر کام کرتے ہیں۔ واحد پھنسے ہوئے پری-ایم آر این اے مالیکیولز کا ترجمہ کرنے کے لیے ان کے انٹرنک اور ایکسونک علاقوں کو جوڑنے کی ضرورت ہوتی ہے۔ ای ایس ایس بنیادی اسپلیسنگ کمپلیکس کے اجزاء، جیسے ایس این آر این پی، یو 1 اور یو 2 میں مداخلت کرکے ان سے متصل اسپلیس سائٹس کو خاموش کر دیتا ہے۔ اس کی وجہ سے وہ پروٹین جو اسپلیسنگ مشینری میں بھرتی ہونے کے لیے اسپلیسنگ کو منفی طور پر متاثر کرتے ہیں۔ ای ایس ایس کے چار عمومی کردار ہیں: ایکسن کی شمولیت کو روکنا انٹرن برقرار رکھنے کو روکنا متبادل 5 'اسپلیس سائٹ کے استعمال کو منظم کرنا متبادل 3' اسپلیس سائٹ کے استعمال کو منظم کرنا جینیاتی بیماریوں میں کردار میوٹونک ڈسٹروفی میوٹونک ڈسٹروفی (ایم ڈی) سب سے زیادہ قابل ذکر طور پر ڈی ایم پی کے جین میں غیر مستحکم سی ٹی جی ٹرپلٹ توسیع کی وراثت کی وجہ سے ہوتا ہے۔ صحت مند جینوٹائپ میں انسولین ریسیپٹر ایم آر این اے ٹرانسکرپٹ کی دو آئسوفارم موجود ہیں۔ آئسوفارم IR-A میں ایکسون 11 کی کمی ہوتی ہے اور خلیوں میں ہر جگہ اس کا اظہار ہوتا ہے۔ آئسوفارم آئی آر-بی میں ایکسن 11 ہوتا ہے اور اس کا اظہار جگر، پٹھوں، گردے اور ایڈیپوسائٹس کے خلیوں میں ہوتا ہے۔ ایم ڈی والے افراد میں، آئی آر-اے کو کنکال کے پٹھوں میں زیادہ مقدار میں ریگولیٹ کیا جاتا ہے جس کی وجہ سے بیماری فینوٹائپ ہوتی ہے۔ ای ایس ایس نیوکلیوٹائڈ کی ترتیب انٹرن 10 کے اندر موجود ہے اور خیال کیا جاتا ہے کہ یہ ایکسن 11 کی تقسیم کو خاموش کرنے کے لیے سی یو جی ٹرپلٹ ریپیٹ پر منحصر ہے۔ ایکسن 11 اسپلیسنگ کو خاموش کرنے سے IR-A آئسوفارم کی نقل و حمل میں اضافہ ہوتا ہے۔ سسٹک فائبروسس سی ایف ٹی آر جین میں تغیرات سسٹک فائبروسس کا سبب بننے کے ذمہ دار ہیں۔ ایک خاص تغیر سی ایف ٹی آر پری ایم آر این اے میں ہوتا ہے اور ایکسن 9 کو خارج کرنے کا باعث بنتا ہے، ایم آر این اے میں اس ایکسن کی کمی ایک کٹے ہوئے پروٹین (ایک تغیر کے ذریعے چھوٹا پروٹین) کو جوڑ دیتی ہے۔ ایکسان 9 کو خارج کرنے کی ثالثی ایک پولیمرفک لوکس کے ذریعے کی جاتی ہے جس میں متغیر ٹی جی دہرایا جاتا ہے اور ٹی نیوکلیوٹائڈز کے پھیلاؤ ہوتے ہیں-اسے مختصر طور پر (ٹی جی) ایم ٹی (این) کہا جاتا ہے۔ یہ لوکس ایک ایکسونک اسپلیسنگ سائلنسر ہے اور ایکسن 9 اسپلیس سائٹ (سائٹ 3 سی) کے اوپر کی طرف واقع ہے۔ خاموشی کا تعلق ٹی جی ریپیٹس کی زیادہ تعداد اور ٹی ریپیٹس (ٹی ٹریکٹس) کے کم ہونے والے حصوں سے ہے۔ ان دونوں عوامل کے امتزاج سے ایکسن سکپنگ کی سطح میں اضافہ دکھایا گیا ہے۔ ٹی ڈی پی-43 پروٹین ایکسونک اسپلیسنگ سائلنسر (ٹی جی) ایم ٹی (این) کے ذریعہ بھرتی ہونے کے بعد ایکسن اسپلیسنگ سائٹ کو جسمانی طور پر خاموش کرنے کا ذمہ دار ہے۔ ٹی ڈی پی-43 ایک ڈی این اے بائنڈنگ پروٹین اور ریپریسر ہے، یہ ایکسون 9 کو چھوڑنے کا سبب بننے کے لیے ٹی جی ریپیٹ سے جڑا ہوتا ہے۔ ٹی ٹریکٹس کا کردار اچھی طرح سے سمجھا نہیں گیا ہے۔ ریڑھ کی پٹھوں کی ایروفی ریڑھ کی پٹھوں کی ایروفی ایس ایم این 1 جین کے ہوموزیگس نقصان کی وجہ سے ہوتی ہے۔ انسانوں میں ایس ایم این (سروائیول موٹر نیوران) جین کی دو آئسوفارم ہوتی ہیں، ایس ایم این 1 اور ایس ایم این 2۔ ایس ایم این 1 جین ایک مکمل نقل تیار کرتا ہے، جبکہ ایس ایم این 2 ایکسن 7 کے بغیر ایک نقل تیار کرتا ہے جس کے نتیجے میں ایک کٹا ہوا پروٹین بنتا ہے۔ ای ایس ایس جو بیماری کے فینوٹائپ میں حصہ ڈالتا ہے وہ یو اے جی اے سی اے نیوکلیوٹائڈ ترتیب ہے۔ یہ ترتیب اس وقت پیدا ہوتی ہے جب ایس ایم این 2 جین کے ایکسون 7 میں + 6 پوزیشن پر سی-ٹو-ٹی اتپریورتن ہوتا ہے۔ یہ ٹرانزیشن پوائنٹ میوٹیشن ایم آر این اے ٹرانسکرپٹ سے ایکسن 7 کو خارج کرنے کا باعث بنتا ہے، یہ ایس ایم این 2 اور ایس ایم این 1 جین کے درمیان واحد فرق بھی ہے۔ خیال کیا جاتا ہے کہ یو اے جی اے سی اے ای ایس ایس ایک ایکسونک اسپلیسنگ بڑھانے والے میں خلل ڈال کر اور پروٹین کو اپنی طرف متوجہ کرکے کام کرتا ہے جو ایکسون 7 پر بائنڈنگ سیکوینس کے ذریعے اسپلیسنگ کو روکتا ہے۔ اے ٹی ایم جین میں اتکسیا ٹیلانجیکٹاسیا تغیرات اتکسیا ٹیلانجیکٹاسیا کے لیے ذمہ دار ہیں۔ یہ تغیرات عام طور پر سنگل بیس جوڑی کے متبادل، حذف، یا مائیکرو اندراج ہوتے ہیں۔ اے ٹی ایم جین کے انٹرن 20 کے اندر 4-نیوکلیوٹائڈ کا حذف ہونا ایک ایکسونک اسپلیسنگ سائلنسر میں خلل ڈالتا ہے اور بالغ نقل میں 65-نیوکلیوٹائڈ خفیہ ایکسن کی شمولیت کا سبب بنتا ہے۔ خفیہ ایکسون کی شمولیت کے نتیجے میں پروٹین کی کٹوتی اور غیر معمولی اسپلیسنگ پیٹرن ہوتے ہیں۔ حوالہ جات جینیات