Eukaryotic transcription
یوکرائیوٹک ٹرانسکرپشن ایک وسیع عمل ہے جسے یوکرائیوٹک خلیات ڈی این اے میں ذخیرہ شدہ جینیاتی معلومات کو نقل کرنے کے قابل تکمیلی آر این اے نقل کی اکائیوں میں نقل کرنے کے لیے استعمال کرتے ہیں۔ جین ٹرانسکرپشن یوکیریوٹک اور پروکیریوٹک دونوں خلیوں میں ہوتا ہے۔ پروکیریوٹک آر این اے پولیمریز کے برعکس جو تمام مختلف قسم کے آر این اے کی نقل کا آغاز کرتا ہے، یوکیریوٹس (بشمول انسانوں) میں آر این اے پولیمریز تین تغیرات میں آتا ہے، ہر ایک مختلف قسم کے جین کا ترجمہ کرتا ہے۔ یوکرائیوٹک خلیے میں ایک نیوکلئس ہوتا ہے جو نقل اور ترجمہ کے عمل کو الگ کرتا ہے۔ یوکرائیوٹک ٹرانسکرپشن نیوکلئس کے اندر ہوتی ہے جہاں ڈی این اے کو نیوکلیوسومز اور اعلی درجے کے کرومیٹن ڈھانچوں میں پیک کیا جاتا ہے۔ یوکرائیوٹک جینوم کی پیچیدگی جین کے اظہار پر قابو پانے کے لیے بہت زیادہ تنوع اور پیچیدگی کی ضرورت ہے۔ یوکرائیوٹک نقل تین ترتیب وار مراحل میں آگے بڑھتی ہے: آغاز، لمبائی، اور خاتمہ۔ نقل شدہ آر این اے متنوع افعال انجام دیتے ہیں۔ مثال کے طور پر، رائبوسوم کے ساختی اجزاء کو آر این اے پولیمریز I کے ذریعے نقل کیا جاتا ہے۔ پروٹین کوڈنگ جینز کو آر این اے پولیمریز II کے ذریعے میسنجر آر این اے (ایم آر این اے) میں نقل کیا جاتا ہے جو ڈی این اے سے معلومات کو پروٹین کی ترکیب کے مقام تک لے جاتے ہیں۔ سیل کے ٹرانسکرپشنل آؤٹ پٹ کی بڑی اکثریت کے لیے نام نہاد غیر کوڈنگ آر این اے زیادہ کثرت سے بنائے جاتے ہیں۔ یہ غیر کوڈنگ آر این اے مختلف قسم کے اہم سیلولر افعال انجام دیتے ہیں۔ آر این اے پولیمریز یوکیریوٹس میں تین نیوکلیئر آر این اے پولیمریز ہوتے ہیں، جن میں سے ہر ایک کے الگ کردار اور خصوصیات ہوتی ہیں۔ آر این اے پولیمریز I (پول I) 5S کے علاوہ تمام آر آر این اے جینوں کی نقل کو متحرک کرتا ہے۔ یہ آر آر این اے جین ایک واحد نقل اکائی میں منظم ہوتے ہیں اور ایک مسلسل نقل میں نقل کیے جاتے ہیں۔ اس پیش رو کو پھر تین آر آر این اے میں پروسیس کیا جاتا ہے: 18 ایس، 5.8 ایس، اور 28 ایس۔ آر آر این اے جینوں کی نقل نیوکلئس کے ایک خاص ڈھانچے میں ہوتی ہے جسے نیوکلیولس کہا جاتا ہے، جہاں نقل شدہ آر آر این اے کو پروٹین کے ساتھ ملا کر رائبوسوم بنائے جاتے ہیں۔ آر این اے پولیمریز II (پول II) تمام ایم آر این ایز، کچھ ایس این آر این ایز، ایس آئی آر این ایز، اور تمام ایم آئی آر این ایز کی نقل کے لیے ذمہ دار ہے۔ بہت سے پول II نقل عارضی طور پر سنگل اسٹرینڈ پریکسرر آر این اے (پری-آر این اے) کے طور پر موجود ہیں جن پر مزید عمل کیا جاتا ہے تاکہ بالغ آر این اے تیار کیے جا سکیں۔ مثال کے طور پر، پروٹین کے ترجمہ کے لیے نیوکلیئر سوراخ کے ذریعے سائٹوپلازم میں باہر نکلنے سے پہلے پیشگی ایم آر این اے (پری-ایم آر این اے) پر بڑے پیمانے پر کارروائی کی جاتی ہے۔ آر این اے پولیمرس III (پول III) چھوٹے غیر کوڈنگ آر این اے کو نقل کرتا ہے، بشمول ٹی آر این اے، 5 ایس آر آر این اے، یو 6 ایس این آر این اے، ایس آر پی آر این اے، اور دیگر مستحکم مختصر آر این اے جیسے ربن نیوکلیز پی آر این اے۔ آر این اے پولیمیرس I، II، اور III بالترتیب 14، 12، اور 17 ذیلی اکائیوں پر مشتمل ہیں۔ تینوں یوکرائیوٹک پولیمرس میں پانچ بنیادی ذیلی اکائیاں ہوتی ہیں جو ای کولی آر این اے پولیمرس کے β، β '، αI، αII، اور ω ذیلی اکائیوں کے ساتھ ہم آہنگی کی نمائش کرتی ہیں۔ ایک جیسی ω جیسی ذیلی اکائی (آر بی پی 6) تینوں یوکرائیوٹک پولیمریز کے ذریعہ استعمال ہوتی ہے، جبکہ وہی α جیسی ذیلی اکائیاں پول I اور III کے ذریعہ استعمال ہوتی ہیں۔ تین یوکرائیوٹک پولیمرس آپس میں چار دیگر مشترکہ ذیلی اکائیوں کا اشتراک کرتے ہیں۔ بقیہ ذیلی اکائیاں ہر آر این اے پولیمریز کے لیے منفرد ہیں۔ پول II سے متعلق پول I اور پول III میں پائی جانے والی اضافی ذیلی اکائیاں پول II نقل کے عوامل کے لیے یکساں ہیں۔ آر این اے پولیمریز I اور II کے کرسٹل ڈھانچے ذیلی اکائیوں کے درمیان تعاملات اور جوہری تفصیل میں یوکرائیوٹک ٹرانسکرپشن کے سالماتی طریقہ کار کو سمجھنے کا موقع فراہم کرتے ہیں۔ آر پی بی 1 کا کاربوکسیل ٹرمینل ڈومین (سی ٹی ڈی)، جو آر این اے پولیمریز II کا سب سے بڑا ذیلی یونٹ ہے، پول II نقل کی ترکیب اور پروسیسنگ کے لیے ضروری مشینری کو اکٹھا کرنے میں اہم کردار ادا کرتا ہے۔ طویل اور ساختی طور پر بے ترتیب، سی ٹی ڈی میں ہیپٹاپیپٹائڈ ترتیب وائی ایس پی ٹی ایس پی ایس کے متعدد تکرار ہوتے ہیں جو ٹرانسکرپشن سائیکل کے دوران فاسفوریلیشن اور دیگر پوسٹ ٹرانسلیشنل ترمیمات کے تابع ہوتے ہیں۔ یہ ترامیم اور ان کے ضابطے سی ٹی ڈی کے لیے ٹرانسکرپشن کی شروعات، لمبائی اور اختتام کو کنٹرول کرنے اور ٹرانسکرپشن اور آر این اے پروسیسنگ کو جوڑنے کے لیے آپریشنل کوڈ تشکیل دیتے ہیں۔ ابتداء یوکرائٹس میں جین ٹرانسکرپشن کا آغاز مخصوص مراحل میں ہوتا ہے۔ سب سے پہلے، ایک آر این اے پولیمریز عام نقل کے عوامل کے ساتھ جین کے پروموٹر ریجن سے جڑا ہوا ایک بند کمپلیکس بناتا ہے جسے پری انیشی ایشن کمپلیکس کہا جاتا ہے۔ کمپلیکس کی بند حالت سے کھلی حالت میں منتقلی کے نتیجے میں دو ڈی این اے اسٹرینڈز کے پگھلنے یا علیحدگی اور ٹیمپلیٹ اسٹرینڈ کی آر این اے پولیمرس کی فعال جگہ پر پوزیشننگ ہوتی ہے۔ پرائمر کی ضرورت کے بغیر، آر این اے پولیمرس ربن نیوکلیوٹائڈ کے انتخاب اور پولیمرائزیشن کیمسٹری کی رہنمائی کے لیے ٹیمپلیٹ ڈی این اے اسٹرینڈ کا استعمال کرتے ہوئے ایک نئی آر این اے چین کی ترکیب شروع کر سکتا ہے۔ تاہم، بہت سی ابتدائی ترکیبیں اس سے پہلے کہ نقل ایک اہم لمبائی (~ 10 نیوکلیوٹائڈز) تک پہنچ جائیں، ختم کر دی جاتی ہیں۔ ان غیر فعال چکروں کے دوران، پولیمرس مختصر نقل بناتے اور جاری کرتے رہتے ہیں یہاں تک کہ وہ ایک نقل تیار کرنے کے قابل ہو جاتا ہے جو لمبائی میں دس نیوکلیوٹائڈز سے تجاوز کر جاتا ہے۔ ایک بار جب یہ حد حاصل ہو جاتی ہے، تو آر این اے پولیمریز پروموٹر سے گزر جاتا ہے اور نقل طول و عرض کے مرحلے میں آگے بڑھتا ہے۔ یوکرائیوٹک پروموٹرز اور عام نقل کے عوامل پول II-نقل شدہ جین ٹرانسکرپشن اسٹارٹ سائٹ (ٹی ایس ایس) کے فوری آس پاس کے علاقے پر مشتمل ہوتے ہیں جو ابتدائی کمپلیکس کو باندھتے اور پوزیشن کرتے ہیں۔ نقل کی شروعات میں اس کے ضروری کردار کی وجہ سے اس خطے کو بنیادی پروموٹر کہا جاتا ہے۔ پروموٹروں میں ترتیب کے عناصر کی مختلف کلاسیں پائی جاتی ہیں۔ مثال کے طور پر، ٹاٹا باکس بائنڈنگ پروٹین، ٹی بی پی کے لیے ٹاٹا باکس انتہائی محفوظ ڈی این اے شناخت کی ترتیب ہے، جس کی بائنڈنگ بہت سے جینوں پر ٹرانسکرپشن کمپلیکس اسمبلی کا آغاز کرتی ہے۔ یوکرائیوٹک جینوں میں بنیادی پروموٹر سے باہر ریگولیٹری ترتیبات بھی ہوتے ہیں۔ یہ سی آئی ایس-ایکٹنگ کنٹرول عناصر بنیادی پروموٹر سے نقل کو بڑھانے یا کم کرنے کے لیے ٹرانسکرپشنل ایکٹیویٹرز یا ریپریسرز کو باندھتے ہیں۔ اچھی خصوصیات والے ریگولیٹری عناصر میں اضافہ کرنے والے، سائلنسر اور موصلیت شامل ہیں۔ یہ ریگولیٹری ترتیبات ایک بڑے جینومک فاصلے پر پھیلے ہو سکتے ہیں، بعض اوقات بنیادی پروموٹروں سے سینکڑوں کلو بیس واقع ہوتے ہیں۔ ٹرانسکرپشن کے عمومی عوامل پروٹین کا ایک گروپ ہوتے ہیں جو ٹرانسکرپشن کے آغاز اور ضابطے میں شامل ہوتے ہیں۔ ان عوامل میں عام طور پر ڈی این اے بائنڈنگ ڈومینز ہوتے ہیں جو بنیادی پروموٹر کے مخصوص ترتیب کے عناصر کو باندھتے ہیں اور ٹرانسکرپشنل اسٹارٹ سائٹ پر آر این اے پولیمرس کو بھرتی کرنے میں مدد کرتے ہیں۔ آر این اے پولیمریز II کے لیے عام نقل کے عوامل میں ٹی ایف آئی آئی ڈی، ٹی ایف آئی آئی اے، ٹی ایف آئی آئی بی، ٹی ایف آئی آئی ایف، ٹی ایف آئی آئی ای، اور ٹی ایف آئی آئی ایچ شامل ہیں۔ ابتدائی کمپلیکس کی اسمبلی ٹرانسکرپشن، عام ٹرانسکرپشن عوامل کا ایک مکمل مجموعہ اور آر این اے پولیمرس کو بنیادی پروموٹر پر جمع کرنے کی ضرورت ہے تاکہ 25 لاکھ ڈالٹن ابتدائی کمپلیکس تشکیل دیا جا سکے۔ مثال کے طور پر، ان پروموٹروں کے لیے جن میں ٹی ایس ایس کے قریب ٹاٹا باکس ہوتا ہے، ٹی ایف آئی آئی ڈی کی ٹی بی پی ذیلی اکائی کے ذریعے ٹاٹا باکس کی پہچان ٹرانسکرپشن کمپلیکس کی اسمبلی کا آغاز کرتی ہے۔ داخل ہونے والے اگلے پروٹین ٹی ایف آئی آئی اے اور ٹی ایف آئی آئی بی ہیں، جو ڈی این اے-ٹی ایف آئی آئی ڈی کمپلیکس کو مستحکم کرتے ہیں اور ٹی ایف آئی آئی ایف اور اضافی نقل و حمل کے عوامل کے ساتھ مل کر پول II کو بھرتی کرتے ہیں۔ ٹی ایف آئی آئی بی ٹاٹا سے منسلک ٹی بی پی اور آر این اے پولیمریز کے درمیان پل کے طور پر کام کرتا ہے۔ یہ نقل شروع کرنے کے لیے پولیمریز کے فعال مرکز کو صحیح پوزیشن میں رکھنے میں بھی مدد کرتا ہے۔ ابتدائی کمپلیکس میں بھرتی کیے جانے والے آخری ٹرانسکرپشن عوامل میں سے ایک TFIIH ہے، جو پروموٹر پگھلنے اور فرار میں اہم کردار ادا کرتا ہے۔ پولی II-نقل شدہ جینوں کے لیے، اور بیکٹیریل آر این اے پولیمریز کے برعکس، پروموٹر پگھلنے کے لیے اے ٹی پی کے ہائیڈرولیسس کی ضرورت ہوتی ہے اور اس کی ثالثی ٹی ایف آئی آئی ایچ کرتا ہے۔ ٹی ایف آئی آئی ایچ ایک دس ذیلی یونٹ پروٹین ہے، جس میں اے ٹی پی ایز اور پروٹین کینیز دونوں سرگرمیاں شامل ہیں۔ جبکہ اپ اسٹریم پروموٹر ڈی این اے کو ٹی ایف آئی آئی ڈی کے ذریعہ ایک مقررہ پوزیشن میں رکھا جاتا ہے، ٹی ایف آئی آئی ایچ نیچے کی طرف ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے کو پولیمریز کے شگاف میں کھینچتا ہے، جس سے ڈی این اے اسٹرینڈز کی علیحدگی اور ابتدائی کمپلیکس کی بند حالت سے کھلی حالت میں منتقلی ہوتی ہے۔ ٹی ایف آئی آئی بی پگھلے ہوئے ڈی این اے کو باندھ کر اور ٹرانسکرپشن بلبلے کو مستحکم کرکے کھلی پیچیدہ تشکیل میں مدد کرتا ہے۔ ایک بار ابتدائی کمپلیکس کھل جانے کے بعد، پہلے ربن نیوکلیوٹائڈ کو فعال جگہ پر لایا جاتا ہے تاکہ پرائمر کی عدم موجودگی میں پولیمرائزیشن رد عمل شروع کیا جا سکے۔ یہ ایک نوزائیدہ آر این اے سلسلہ پیدا کرتا ہے جو ٹیمپلیٹ ڈی این اے اسٹرینڈ کے ساتھ ہیٹرو ڈوپلیکس بناتا ہے۔ تاہم، لمبائی کے مرحلے میں داخل ہونے سے پہلے، پولیمریز قبل از وقت ختم ہو سکتا ہے اور ایک مختصر، کٹی ہوئی نقل جاری کر سکتا ہے۔ اس عمل کو اسقاط حمل شروع کرنا کہا جاتا ہے۔ پروموٹر سے پولیمیرس کے فرار کو فروغ دینے کے لیے نقل کی کافی لمبائی تک بڑھنے سے پہلے اسقاط حمل کی شروعات کے بہت سے چکر ہو سکتے ہیں۔ اسقاط حمل کے آغاز کے چکروں کے دوران، آر این اے پولیمریز پروموٹر سے جڑا رہتا ہے اور نیچے کی طرف ڈی این اے کو اس کے اتپریرک شگاف میں سکرینچنگ قسم کی حرکت میں کھینچتا ہے۔ پروموٹر فرار جب کوئی نقل دس نیوکلیوٹائڈز کی دہلیز لمبائی تک پہنچ جاتا ہے، تو یہ آر این اے کے اخراج چینل میں داخل ہوتا ہے۔ پولیمرس پروموٹر عناصر اور ابتدائی کمپلیکس سے وابستہ کسی بھی ریگولیٹری پروٹین کے ساتھ اپنے تعاملات کو توڑ دیتا ہے جس کی اسے اب ضرورت نہیں ہے۔ یوکرائٹس میں فروغ دینے والے فرار کے لیے اے ٹی پی ہائیڈرولیسس کی ضرورت ہوتی ہے اور، سی ٹی ڈی کے پول II-فاسفوریلیشن کے معاملے میں۔ دریں اثنا، نقل کا بلبلہ 12-14 نیوکلیوٹائڈز پر گر جاتا ہے، جو فرار کے لیے درکار حرکی توانائی فراہم کرتا ہے۔ لمبائی پروموٹر سے فرار ہونے اور آغاز کے لیے نقل کے زیادہ تر عوامل کو ختم کرنے کے بعد، پولیمرس نقل کے اگلے مرحلے کے لیے نئے عوامل حاصل کرتا ہے: لمبائی۔ نقل کی لمبائی ایک عملیاتی عمل ہے۔ اینزائم کے سامنے سے داخل ہونے والے ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے کو آر این اے کی ترکیب کے لیے ٹیمپلیٹ اسٹرینڈ حاصل کرنے کے لیے کھول دیا جاتا ہے۔ آگے بڑھتے ہوئے پولیمریز سے الگ ہونے والے ہر ڈی این اے بیس جوڑے کے لیے، ایک ہائبرڈ آر این اے: ڈی این اے بیس جوڑا فوری طور پر تشکیل پاتا ہے۔ ڈی این اے اسٹرینڈز اور نوزائیدہ آر این اے چین الگ الگ چینلز سے باہر نکلتے ہیں۔ دو ڈی این اے اسٹرینڈز ٹرانسکرپشن بلبلے کے آخری سرے پر دوبارہ مل جاتے ہیں جبکہ سنگل اسٹرینڈ آر این اے تنہا ابھرتا ہے۔ طول و عرض کے عوامل پولیمریز میں بھرتی ہونے والے پروٹینوں میں طول و عرض کے عوامل ہوتے ہیں، اس لیے کہا جاتا ہے کیونکہ وہ نقل کی لمبائی کو متحرک کرتے ہیں۔ طول و عرض کے عوامل کی مختلف کلاسیں ہیں۔ کچھ عوامل نقل کرنے کی مجموعی شرح میں اضافہ کر سکتے ہیں، کچھ عارضی طور پر رکنے والی جگہوں کے ذریعے پولیمریز کی مدد کر سکتے ہیں، اور کچھ کرومیٹن کے ذریعے نقل کرنے کے لیے پولیمریز کی مدد کر سکتے ہیں۔ توسیع کے عوامل میں سے ایک، پی-ٹی ای ایف بی، خاص طور پر اہم ہے۔ پی-ٹی ای ایف بی باؤنڈ پول II کے سی ٹی ڈی ریپیٹس (وائی ایس پی ٹی ایس پی ایس) کے دوسرے باقیات (سر-2) کو فاسفوریلیٹ کرتا ہے۔ پی-ٹی ای ایف بی بھی فاسفوریلیٹس کرتا ہے اور ایس پی ٹی 5 اور ٹی اے ٹی-ایس ایف 1 کو چالو کرتا ہے۔ ایس پی ٹی 5 ایک یونیورسل ٹرانسکرپشن فیکٹر ہے جو سر-5 پر سی ٹی ڈی فاسفوریلیٹڈ کے ساتھ پول II میں 5 'کیپنگ انزائم کو بھرتی کرنے میں مدد کرتا ہے۔ ٹی اے ایف-ایس ایف 1 آر این اے اسپلیسنگ مشینری کے اجزاء کو سیر-2 فاسفوریلیٹڈ سی ٹی ڈی میں بھرتی کرتا ہے۔ پی-ٹی ای ایف بی پولیمریز کے عارضی وقفے کو دبانے میں بھی مدد کرتا ہے جب اسے آغاز کے فورا بعد کچھ ترتیبات کا سامنا کرنا پڑتا ہے۔ نقل کی وفاداری نقل کی وفاداری متعدد میکانزم کے ذریعے حاصل کی جاتی ہے۔ ٹرانسکرپشن کی غلطیوں کو روکنے کے لیے آر این اے پولیمرس درست نیوکلیوسائڈ ٹرائی فاسفیٹ (این ٹی پی) سبسٹریٹ کا انتخاب کرتے ہیں۔ صرف این ٹی پی جو ڈی این اے میں کوڈنگ بیس کے ساتھ صحیح طور پر بیس جوڑوں کو فعال مرکز میں داخل کیا جاتا ہے۔ آر این اے پولیمرس غلط طور پر شامل نیوکلیوٹائڈز کا پتہ لگانے اور انہیں ہٹانے کے لیے دو معروف پروف ریڈنگ افعال انجام دیتا ہے: پائروفاسفوریلیٹک ایڈیٹنگ اور ہائیڈرولائٹک ایڈیٹنگ۔ سابقہ پولیمرائزیشن رد عمل کے سادہ الٹ پلٹ کے ذریعے غلط طور پر داخل کیے گئے ربنیوکلیوٹائڈ کو ہٹا دیتا ہے، جبکہ مؤخر الذکر میں پولیمریز کا بیک ٹریکنگ اور غلطی پر مشتمل آر این اے پروڈکٹ کے ایک حصے کو الگ کرنا شامل ہے۔ طول و عرض کا عنصر ٹی ایف آئی آئی ایس (؛ ٹی سی ای اے 1، ٹی سی ای اے 2، ٹی سی ای اے 3) پولیمریز میں ایک موروثی ربنیوکلیز سرگرمی کو متحرک کرتا ہے، جس سے محدود مقامی آر این اے انحطاط کے ذریعے غلط مربوط اڈوں کو ہٹانے کی اجازت ملتی ہے۔ نوٹ کریں کہ تمام تعاملات (فاسفوڈیسٹر بانڈ کی ترکیب، پائروفاسفورولائسس، فاسفوڈیسٹر بانڈ ہائیڈرولیسس) آر این اے پولیمرس کے ذریعے ایک فعال مرکز کا استعمال کرتے ہوئے انجام دیے جاتے ہیں۔ ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے کے ساتھ ٹرانسکرپشن کی لمبائی کو روکنا، پوائز کرنا، اور بیک ٹریکنگ کرنا کوئی ہموار سفر نہیں ہے، کیونکہ ٹرانسکرپشن کی لمبائی کے دوران آر این اے پولیمرس وسیع پیمانے پر شریک ٹرانسکرپشنل وقفے سے گزرتا ہے۔ عام طور پر، آر این اے پولیمریز II مستقل رفتار سے جین کے ذریعے نقل نہیں کرتا ہے۔ بلکہ یہ وقتا فوقتا بعض ترتیبات پر رکتا ہے، بعض اوقات نقل دوبارہ شروع کرنے سے پہلے طویل عرصے تک۔ یہ رکنا خاص طور پر نیوکلیوسومز پر واضح ہوتا ہے، اور جزوی طور پر پولیمرس کے ذریعے پیدا ہوتا ہے جو ٹرانسکرپشن کے لحاظ سے نااہل بیک ٹریک حالت میں داخل ہوتا ہے۔ ان وقفوں کی مدت سیکنڈ سے لے کر منٹ یا اس سے زیادہ ہوتی ہے، اور طویل وقفوں سے باہر نکلنے کو ٹی ایف آئی آئی ایس جیسے طول و عرض کے عوامل سے فروغ دیا جا سکتا ہے۔ اس وقفے کو بعض اوقات پروف ریڈنگ کے لیے بھی استعمال کیا جاتا ہے۔ یہاں پولیمریز بیک اپ کرتا ہے، کچھ آر این اے کو مٹا دیتا ہے جو اس نے پہلے ہی بنا لیا ہے اور ٹرانسکرپشن کا ایک اور طریقہ ہے۔ انتہائی صورتوں میں، مثال کے طور پر، جب پولیمرس کو کسی تباہ شدہ نیوکلیوٹائڈ کا سامنا کرنا پڑتا ہے، تو یہ مکمل طور پر رک جاتا ہے۔ زیادہ تر، ایک لمبا پولیمریز پروموٹر کے قریب رک جاتا ہے۔ ابتدائی لمبائی کے دوران پروموٹر-پراکسیمل وقفہ ایک عام طور پر استعمال ہونے والا طریقہ کار ہے جو تیزی سے یا مربوط انداز میں ظاہر ہونے والے جینوں کو منظم کرنے کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ رکنے کی ثالثی ڈی ایس آئی ایف (ڈی آر بی-حساسیت پیدا کرنے والا عنصر جس میں ایس پی ٹی 4/ایس پی ٹی 5 شامل ہے) کے تعاون سے این ای ایل ایف (منفی لمبائی عنصر) نامی کمپلیکس کے ذریعے کی جاتی ہے۔ ایک بار جب پولیمریز کو ایک ایکٹیویشن سگنل موصول ہوتا ہے، جیسے کہ پی-ٹی ای ایف بی کے ذریعہ سی ٹی ڈی دم کے سیر-2 کا فاسفوریلیشن، تو رکاوٹ خارج ہو جاتی ہے۔ ای ایل ایل اور ٹی ایف آئی آئی ایس جیسے دیگر طول و عرض کے عوامل پولیمریز کے رکنے والے وقت کی لمبائی کو محدود کرکے طول و عرض کی شرح کو متحرک کرتے ہیں۔ آر این اے پروسیسنگ لانگٹنگ پولیمرس مختلف قسم کے آر این اے پروسیسنگ کے لیے درکار پروٹین عوامل کے ایک سیٹ سے وابستہ ہے۔ جیسے ہی یہ پولیمریز کے آر این اے-ایگزٹ چینل سے نکلتا ہے ایم آر این اے کو بند کر دیا جاتا ہے۔ کیپنگ کے بعد، سی ٹی ڈی ریپیٹس کے اندر سیر-5 کا ڈیفاسفوریلیشن کیپنگ مشینری کی علیحدگی کا ذمہ دار ہو سکتا ہے۔ سیر-2 کا مزید فاسفوریلیشن آر این اے اسپلیسنگ مشینری کی بھرتی کا سبب بنتا ہے جو بالغ ایم آر این اے پیدا کرنے کے لیے غیر کوڈنگ انٹرن کو ہٹانے کو متحرک کرتا ہے۔ متبادل تقسیم یوکرائٹس میں پروٹین کی تکمیل کو بڑھاتا ہے۔ جس طرح 5 '-کیپنگ اور اسپلیسنگ کے ساتھ، سی ٹی ڈی دم 3'-پولیڈینایلیشن کے لیے ذمہ دار انزائموں کی بھرتی میں شامل ہے، حتمی آر این اے پروسیسنگ ایونٹ جو نقل کے خاتمے کے ساتھ مل کر ہوتا ہے۔ نقل کا آخری مرحلہ ختم کرنا ہے، جو مکمل نقل کی علیحدگی کا باعث بنتا ہے اور ٹیمپلیٹ DNA.The عمل سے RNA پولیمریز کی رہائی تین RNA پولیمریز میں سے ہر ایک کے لیے مختلف ہوتی ہے۔ نقل کے تین مراحل میں سے ختم کرنے کا طریقہ کار سب سے کم سمجھا جاتا ہے۔ عنصر پر منحصر پولیمریز پول I کے ذریعے پری-آر آر این اے جینوں کی نقل کا خاتمہ ایک ایسے نظام کے ذریعے کیا جاتا ہے جس کے لیے ایک مخصوص نقل کے اختتامی عنصر کی ضرورت ہوتی ہے۔ استعمال شدہ طریقہ کار پروکیریوٹس میں رو پر منحصر خاتمے سے کچھ مشابہت رکھتا ہے۔ یوکرائیوٹک خلیات میں سینکڑوں رائبوسومل ڈی این اے کی تکرار ہوتی ہے، جو بعض اوقات متعدد کروموسوم میں تقسیم ہوتے ہیں۔ نقل کا خاتمہ رائبوسومل انٹرجینک سپیسر کے علاقے میں ہوتا ہے جس میں پول I کے رکنے والے مقام کے اوپر کی طرف نقل کے خاتمے کے کئی مقامات ہوتے ہیں۔ ابھی تک نامعلوم طریقہ کار کے ذریعے، نقل کے 3 '-سرے کو الگ کیا جاتا ہے، جس سے ایک بڑا بنیادی آر آر این اے مالیکیول پیدا ہوتا ہے جسے مزید پختہ 18 ایس، 5.8 ایس اور 28 ایس آر آر این اے میں پروسیس کیا جاتا ہے۔ جیسے ہی پول II جین کے اختتام تک پہنچتا ہے، سی ٹی ڈی کے ذریعے لے جانے والے دو پروٹین کمپلیکس، سی پی ایس ایف (کلیویج اینڈ پولیڈینایلیشن سپیسیفیکٹی فیکٹر) اور سی ایس ٹی ایف (کلیویج اسٹیمولیشن فیکٹر)، نقل شدہ آر این اے میں پولی-اے سگنل کو پہچانتے ہیں۔ پولی-اے باؤنڈ سی پی ایس ایف اور سی ایس ٹی ایف آر این اے کلیویج اور پھر پولیڈینایلیشن کرنے کے لیے دیگر پروٹین بھرتی کرتے ہیں۔ پولی-اے پولیمریز ٹیمپلیٹ کے بغیر آر این اے کے کلے ہوئے 3 'سرے میں تقریبا 200 اڈینائنز کا اضافہ کرتا ہے۔ لمبی پولی-اے دم پول II کے بنائے ہوئے نقل کے لیے منفرد ہے۔ پول I اور پول II کے ذریعے نقل کو ختم کرنے کے عمل میں، آر این اے کے الگ ہونے کے فورا بعد لمبا کمپلیکس تحلیل نہیں ہوتا ہے۔ پولیمریز ٹیمپلیٹ کے ساتھ ساتھ حرکت کرتا رہتا ہے، جس سے لمبائی کمپلیکس سے وابستہ دوسرا آر این اے مالیکیول پیدا ہوتا ہے۔ یہ بتانے کے لیے دو ماڈل تجویز کیے گئے ہیں کہ آخر میں اس کا خاتمہ کیسے کیا جاتا ہے۔ ایلوسٹرک ماڈل میں کہا گیا ہے کہ جب نقل اختتامی ترتیب کے ذریعے آگے بڑھتی ہے، تو یہ طول و عرض کے عوامل کو الگ کرنے اور/یا اختتامی عوامل کی اسمبلی کا سبب بنتی ہے جو طول و عرض کے کمپلیکس کی تشکیلی تبدیلیوں کا سبب بنتی ہے۔ ٹارپیڈو ماڈل سے پتہ چلتا ہے کہ 5 'سے 3' ایکسونوکلیز دوسرے آر این اے کو خراب کرتا ہے کیونکہ یہ طول و عرض کے کمپلیکس سے نکلتا ہے۔ پولی میریز اس وقت خارج ہوتا ہے جب انتہائی پروسیسو ایکسونوکلیز اس سے آگے نکل جاتا ہے۔ یہ تجویز کیا گیا ہے کہ ایک ابھرتا ہوا نظریہ ان دونوں ماڈلز کے انضمام کا اظہار کرے گا۔ عنصر سے آزاد آر این اے پولیمریز III اضافی عوامل کی شمولیت کے بغیر ٹرانسکرپشن کو مؤثر طریقے سے ختم کر سکتا ہے۔ پول III اختتامی سگنل تھائمینز (نان ٹیمپلیٹ اسٹرینڈ پر) کے ایک حصے پر مشتمل ہوتا ہے جو بالغ آر این اے کے 3 'سرے سے 40 بی پی کے نیچے کی طرف واقع ہوتا ہے۔ پولی-ٹی ٹرمینیشن سگنل پول III یوکرائیوٹک ٹرانسکرپشنل کنٹرول کو روکتا ہے یوکرائٹس میں جین کے اظہار کا ضابطہ کنٹرول کی کئی سطحوں کے تعامل کے ذریعے حاصل کیا جاتا ہے جو مقامی طور پر انفرادی جینوں کو کسی مخصوص سیلولر ضرورت کے جواب میں آن یا آف کرنے اور عالمی سطح پر کرومیٹن وسیع جین کے اظہار کے نمونے کو برقرار رکھنے کے لیے کام کرتا ہے جو سیل شناخت کی تشکیل کرتا ہے۔ چونکہ یوکرائیوٹک جینوم نیوکلیوسومز اور اعلی درجے کے کرومیٹن ڈھانچے بنانے کے لیے ہسٹون کے ارد گرد لپیٹا جاتا ہے، اس لیے نقل کرنے والی مشینری کے لیے سبسٹریٹ عام طور پر جزوی طور پر چھپے ہوتے ہیں۔ ریگولیٹری پروٹین کے بغیر، بہت سے جین کم سطح پر ظاہر ہوتے ہیں یا بالکل ظاہر نہیں ہوتے ہیں۔ ٹرانسکرپشن کے لیے پوزیشن میں موجود نیوکلیوسومز کی نقل مکانی کی ضرورت ہوتی ہے تاکہ ٹرانسکرپشن مشینری کو ڈی این اے تک رسائی حاصل کرنے کے قابل بنایا جا سکے۔ نقل کے تمام مراحل کسی حد تک ضابطے کے تابع ہیں۔ ٹرانسکرپشن کا آغاز خاص طور پر وہ بنیادی سطح ہے جس پر جین کے اظہار کو منظم کیا جاتا ہے۔ سیل کے لیے توانائی کے اخراجات کے لحاظ سے شرح کو محدود کرنے والے ابتدائی مرحلے کو نشانہ بنانا سب سے زیادہ موثر ہے۔ ٹرانسکرپشن کی شروعات کو ڈی این اے کے ریگولیٹری علاقوں کے اندر سی آئی ایس-ایکٹنگ عناصر (بڑھانے والے، سائلنسر، آئسولیٹر) کے ذریعے منظم کیا جاتا ہے، اور ترتیب سے متعلق ٹرانس-ایکٹنگ عوامل جو ایکٹیویٹرز یا ریپریسرز کے طور پر کام کرتے ہیں۔ جین ٹرانسکرپشن کو شروع ہونے کے بعد لمبا پولیمریز کی حرکت کو نشانہ بنا کر بھی منظم کیا جا سکتا ہے۔ عالمی کنٹرول اور ایپیجینیٹک ریگولیشن یوکرائیوٹک جینوم کو ایک کمپیکٹ کرومیٹن ڈھانچے میں منظم کیا جاتا ہے جو صرف ڈی این اے تک باقاعدہ رسائی کی اجازت دیتا ہے۔ کرومیٹن کا ڈھانچہ عالمی سطح پر "کھلا" اور نقل کے لحاظ سے زیادہ قابل اجازت، یا عالمی سطح پر "گاڑھا" اور نقل کے لحاظ سے غیر فعال ہو سکتا ہے۔ سابقہ (یوکرومیٹن) ہلکے سے پیک ہوتا ہے اور فعال نقل کے تحت جینوں سے بھرپور ہوتا ہے۔ مؤخر الذکر (ہیٹروکرومیٹن) میں جین کے غریب علاقے جیسے ٹیلومیرس اور سینٹرومیرس شامل ہیں بلکہ وہ علاقے بھی شامل ہیں جن میں عام جین کی کثافت ہوتی ہے لیکن نقل مکانی سے خاموش ہو جاتے ہیں۔ نقل کو ہسٹون ترمیم (ڈیسیٹیلیشن اور میتھیلیشن)، آر این اے مداخلت، اور/یا ڈی این اے میتھیلیشن کے ذریعے خاموش کیا جا سکتا ہے۔ خلیے کی شناخت کی وضاحت کرنے والے جین کے اظہار کے نمونے خلیے کی تقسیم کے ذریعے وراثت میں ملتے ہیں۔ اس عمل کو ایپیجینیٹک ریگولیشن کہا جاتا ہے۔ ڈی این اے میتھیلیشن قابل اعتماد طریقے سے مینٹیننس میتھیلیز کے عمل کے ذریعے وراثت میں ملتا ہے جو نقل کے ذریعے پیدا ہونے والے نوزائیدہ ڈی این اے اسٹرینڈ میں ترمیم کرتا ہے۔ ممالیہ خلیوں میں، ڈی این اے میتھیلیشن نقل شدہ طور پر خاموش علاقوں کا بنیادی مارکر ہے۔ خصوصی پروٹین مارکر کو پہچان سکتے ہیں اور خاموش کرنے کو دوبارہ قائم کرنے کے لیے ہسٹون ڈیسیٹیلیز اور میتھیلیز کو بھرتی کر سکتے ہیں۔ خلیے کی تقسیم کے دوران نیوکلیوسوم ہسٹون میں تبدیلیاں بھی وراثت میں مل سکتی ہیں، تاہم، یہ واضح نہیں ہے کہ آیا یہ ڈی این اے میتھیلیشن کے ذریعے سمت کے بغیر آزادانہ طور پر کام کر سکتا ہے۔ ٹرانسکرپشن کی شروعات کے دو اہم کام آر این اے پولیمرس کو پروموٹر تک رسائی فراہم کرنا اور پولیمرس کے ساتھ عام ٹرانسکرپشن عوامل کو ٹرانسکرپشن انیشی ایشن کمپلیکس میں جمع کرنا ہے۔ جین پروموٹر پر روک تھام کے اشاروں کو ختم کرکے نقل شروع کرنے کے متنوع طریقہ کار کی نشاندہی کی گئی ہے۔ یوکرائیوٹک جینوں نے وسیع ریگولیٹری ترتیبات حاصل کیے ہیں جو بڑی تعداد میں ریگولیٹر بائنڈنگ سائٹس کو گھیرے ہوئے ہیں اور پروموٹر سے مجموعی طور پر کلو بیس (بعض اوقات سینکڑوں کلو بیس) پھیلاتے ہیں-اوپر کی طرف اور نیچے کی طرف۔ ریگولیٹر بائنڈنگ سائٹس کو اکثر اکائیوں میں اکٹھا کیا جاتا ہے جسے اضافہ کہتے ہیں۔ افزودہ کرنے والے کئی نقل کے عوامل (جو افزودوں کو تشکیل دیتے ہیں) کی انتہائی باہمی تعاون پر مبنی کارروائی کو آسان بنا سکتے ہیں۔ ریموٹ بڑھانے والے فاصلے پر نقل کے ضابطے کی اجازت دیتے ہیں۔ بڑھانے والوں اور فروغ دینے والوں کے درمیان واقع موصلیت ان جینوں کی وضاحت کرنے میں مدد کرتے ہیں جن پر اضافہ کرنے والا اثر ڈال سکتا ہے یا نہیں۔ یوکرائیوٹک ٹرانسکرپشنل ایکٹیویٹرز کے الگ الگ ڈی این اے بائنڈنگ اور ایکٹیویٹنگ افعال ہوتے ہیں۔ اس کے سی آئی ایس عنصر کے پابند ہونے پر، ایک ایکٹیویٹر براہ راست پولیمریز کو بھرتی کر سکتا ہے یا نقل شدہ مشینری کے لیے درکار دیگر عوامل کو بھرتی کر سکتا ہے۔ ایک ایکٹیویٹر نیوکلیوسوم ترمیم کاروں کو بھی بھرتی کر سکتا ہے جو پروموٹر کے آس پاس کرومیٹن کو تبدیل کرتے ہیں اور اس طرح شروعات میں مدد کرتے ہیں۔ متعدد ایکٹیویٹرز مل کر کام کر سکتے ہیں، یا تو ٹرانسکرپشنل مشینری کے مشترکہ یا دو باہمی انحصار والے اجزاء کو بھرتی کرکے، یا ایک دوسرے کو ان کے ڈی این اے سائٹس سے منسلک کرنے میں مدد کر کے۔ یہ تعاملات متعدد سگنلنگ ان پٹ کو ہم آہنگ کر سکتے ہیں اور سیلولر ضروریات کو پورا کرنے کے لیے پیچیدہ نقل کے ردعمل پیدا کر سکتے ہیں۔ جین مخصوص جبر یوکیریوٹک ٹرانسکرپشن ریپریسرز اپنے پروکیریوٹک ہم منصبوں کے ذریعہ استعمال ہونے والے کچھ میکانزم کا اشتراک کرتے ہیں۔ مثال کے طور پر، ڈی این اے پر کسی ایسی سائٹ پر پابند ہونے سے جو ایک ایکٹیویٹر کی بائنڈنگ سائٹ کے ساتھ اوورلیپ ہوتی ہے، ایک ریپریسر ایکٹیویٹر کے پابند ہونے کو روک سکتا ہے۔ لیکن زیادہ کثرت سے، یوکرائیوٹک ریپریسرز ایک ایکٹیویٹر کے فعال ڈومین کو ماسک کرکے، اس کے نیوکلیئر لوکلائزیشن کو روک کر، اس کے انحطاط کو فروغ دے کر، یا کیمیائی ترمیم کے ذریعے اسے غیر فعال کر کے اس کے کام کو روکتے ہیں۔ ریپریسرز پروموٹر کے اوپر کی طرف کسی سائٹ پر پابند ہوکر اور ٹرانسکرپشن مشینری کے ساتھ تعامل کرکے ٹرانسکرپشن کی شروعات کو براہ راست روک سکتے ہیں۔ دبانے والے بالواسطہ طور پر ہسٹون ترمیم کاروں (ڈیسیٹیلیز اور میتھیلیز) یا نیوکلیوسوم ری ماڈلنگ انزائموں کو بھرتی کرکے نقل کو دبا سکتے ہیں جو ڈی این اے کی رسائی کو متاثر کرتے ہیں۔ ہسٹون اور ڈی این اے میں ترمیم کو دبانا بھی ٹرانسکرپشنل سائلنسنگ کی بنیاد ہے جو کرومیٹن کے ساتھ پھیل سکتا ہے اور متعدد جینوں کو بند کر سکتا ہے۔ لمبائی اور اختتامی کنٹرول لمبائی کا مرحلہ لمبائی کمپلیکس کی اسمبلی مکمل ہونے کے بعد شروع ہوتا ہے، اور اس وقت تک آگے بڑھتا ہے جب تک کہ اختتامی ترتیب کا سامنا نہ ہو۔ آر این اے پولیمریز کی آغاز کے بعد کی حرکت اہم ریگولیٹری میکانزم کے ایک اور طبقے کا ہدف ہے۔ مثال کے طور پر، ٹرانسکرپشنل ایکٹیویٹر ٹی اے ٹی ایچ آئی وی ٹرانسکرپشن کے ضابطے کے دوران آغاز کے بجائے طول و عرض کو متاثر کرتا ہے۔ در حقیقت، بہت سے یوکرائیوٹک جینوں کو ٹرانسکرپشن کی لمبائی کے لیے ایک بلاک جاری کرکے منظم کیا جاتا ہے جسے پروموٹر-پراکسیمل پوزنگ کہا جاتا ہے۔ رکنا جین کی سرگرمی کو آسان بنانے کے لیے پروموٹروں پر کرومیٹن کے ڈھانچے کو متاثر کر سکتا ہے اور جب خلیات ایکٹیویشن سگنل کے سامنے آتے ہیں تو تیز یا ہم وقت نقل کے ردعمل کا باعث بن سکتا ہے۔ رکنا دو منفی طول و عرض کے عوامل، ڈی ایس آئی ایف (ایس پی ٹی 4/ایس پی ٹی 5) اور این ای ایل ایف، کے طول و عرض کمپلیکس کے پابند ہونے سے وابستہ ہے۔ دیگر عوامل بھی رکے ہوئے پولیمریز کے استحکام اور مدت کو متاثر کر سکتے ہیں۔ وقفہ ریلیز پی-ٹی ای ایف بی کنیز کی بھرتی سے شروع ہوتا ہے۔ نقل کا خاتمہ بھی نقل کے ضابطے کے ایک اہم شعبے کے طور پر ابھرا ہے۔ ختم کرنے کو پولیمرس کی موثر ری سائیکلنگ کے ساتھ جوڑا جاتا ہے۔ نقل کے خاتمے سے وابستہ عوامل جین لوپنگ میں بھی ثالثی کر سکتے ہیں اور اس طرح دوبارہ آغاز کی کارکردگی کا تعین کر سکتے ہیں۔ ٹرانسکرپشن-جوڑے ڈی این اے کی مرمت جب کسی جین کے نقل شدہ اسٹرینڈ میں زخم کی موجودگی سے ٹرانسکرپشن کو روک لیا جاتا ہے، تو ڈی این اے کی مرمت کے پروٹین کو رکے ہوئے آر این اے پولیمریز میں بھرتی کیا جاتا ہے تاکہ ٹرانسکرپشن-جوڑے کی مرمت نامی عمل شروع کیا جا سکے۔ اس عمل کا مرکز عام ٹرانسکرپشن عنصر TFIIH ہے جس میں ATPase سرگرمی ہوتی ہے۔ ٹی ایف آئی آئی ایچ پولیمریز میں ایک تشکیلی تبدیلی کا سبب بنتا ہے، تاکہ اندر پھنسے ہوئے نقل کے بلبلے کو بے نقاب کیا جا سکے، تاکہ ڈی این اے کی مرمت کے انزائموں کو زخم تک رسائی حاصل ہو سکے۔ اس طرح، آر این اے پولیمریز سیل میں نقصان محسوس کرنے والے پروٹین کے طور پر کام کرتا ہے تاکہ ان جینوں کی مرمت کے انزائموں کو نشانہ بنایا جا سکے جو فعال طور پر نقل کیے جا رہے ہیں۔ پروکیریوٹک اور یوکیریوٹک ٹرانسکرپشن کے درمیان موازنہ یوکیریوٹک ٹرانسکرپشن پروکیریوٹک ٹرانسکرپشن سے زیادہ پیچیدہ ہے۔ مثال کے طور پر، یوکرائٹس میں جینیاتی مواد (ڈی این اے)، اور اس وجہ سے نقل، بنیادی طور پر نیوکلئس میں مقامی ہوتا ہے، جہاں یہ نیوکلیئر جھلی کے ذریعہ سائٹوپلازم (جس میں ترجمہ ہوتا ہے) سے الگ ہوتا ہے۔ یہ نیوکلئس میں آر این اے کو الگ کرنے کے ذریعے جین کے اظہار کے عارضی ضابطے کی اجازت دیتا ہے، اور بالغ آر این اے کو سائٹوپلازم میں منتخب نقل و حمل کی اجازت دیتا ہے۔ بیکٹیریا کا کوئی الگ نیوکلئس نہیں ہوتا ہے جو ڈی این اے کو رائبوسوم سے الگ کرتا ہے اور ایم آر این اے نقل ہوتے ہی پروٹین میں تبدیل ہو جاتا ہے۔ دونوں عملوں کے درمیان جوڑ پروکیریوٹک جین ریگولیشن کے لیے ایک اہم طریقہ کار فراہم کرتا ہے۔ آغاز کی سطح پر، پروکیریوٹس (خاص طور پر بیکٹیریا) میں آر این اے پولیمریز پروموٹر کے علاقے سے مضبوطی سے جڑا رہتا ہے اور نقل کی اعلی بنیادی شرح کا آغاز کرتا ہے۔ قریب سے کھلی منتقلی کے لیے کسی اے ٹی پی ہائیڈرولیسس کی ضرورت نہیں ہے، پروموٹر پگھلنا بائنڈنگ رد عمل سے چلتا ہے جو پگھلی ہوئی تشکیل کو پسند کرتے ہیں۔ کرومیٹن یوکرائٹس میں نقل و حمل میں بہت زیادہ رکاوٹ ڈالتا ہے۔ پروموٹر مخصوص شروعات کے لیے بڑے ملٹی پروٹین پری انیشی ایشن کمپلیکس کی اسمبلی ضروری ہے۔ یوکرائٹس میں فروغ دینے والے پگھلنے کے لیے اے ٹی پی کے ہائیڈرولیسس کی ضرورت ہوتی ہے۔ نتیجے کے طور پر، یوکرائیوٹک آر این اے پولیمیرس ٹرانسکرپشن کی شروعات کی کم بنیادی شرح ظاہر کرتے ہیں۔ کینسر میں ٹرانسکرپشن کا ضابطہ ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں، جین پروموٹروں کی اکثریت متعدد سی پی جی سائٹس کے ساتھ سی پی جی جزیرے پر مشتمل ہوتی ہے۔ جب جین کے بہت سے پروموٹر سی پی جی سائٹس کو میتھیلیٹ کیا جاتا ہے تو جین خاموش ہو جاتا ہے۔ کولوریکٹل کینسر میں عام طور پر 3 سے 6 ڈرائیور میوٹیشنز اور 33 سے 66 ہچائکر یا مسافر میوٹیشنز ہوتے ہیں۔ تاہم، ٹرانسکرپشنل سائلنسنگ کینسر کی ترقی کا سبب بننے میں تغیر سے زیادہ اہمیت کا حامل ہو سکتا ہے۔ مثال کے طور پر، کولوریکٹل کینسر میں تقریبا 600 سے 800 جین سی پی جی آئی لینڈ میتھیلیشن کے ذریعے نقل شدہ طور پر خاموش ہو جاتے ہیں (کینسر میں نقل کا ضابطہ دیکھیں)۔ کینسر میں ٹرانسکرپشنل جبر دیگر ایپیجینیٹک میکانزم کے ذریعے بھی ہو سکتا ہے، جیسے کہ مائیکرو آر این اے کے تبدیل شدہ اظہار۔ چھاتی کے کینسر میں، بی آر سی اے 1 کا ٹرانسکرپشنل جبر بی آر سی اے 1 پروموٹر کے ہائپر میتھیلیشن کے مقابلے میں زیادہ اظہار شدہ مائیکرو آر این اے-182 کے ذریعے زیادہ کثرت سے ہو سکتا ہے (چھاتی اور اعضاء کے کینسر میں بی آر سی اے 1 کا کم اظہار دیکھیں)۔ یہ بھی دیکھیں کہ بیکٹیریل ٹرانسکرپشن ریگولیشن آف جین ایکسپریشن آر این اے پولیمریز ٹرانسکرپشنل ریگولیشن ٹرانسکرپشن فیکٹر ٹرانسکرپشنل میموری حوالہ جات جین ایکسپریشن مالیکیولر بائیولوجی