Morphobank
مورفو بینک مشترکہ ارتقائی تحقیق کے لیے ایک ویب ایپلی کیشن ہے، خاص طور پر فائیلوجنیٹک سسٹمیٹکس یا کلاڈسٹکس، فینوٹائپ پر۔ تاریخی طور پر، فائیلوجنیٹک سسٹمیٹکس پر تحقیق کرنے والے سائنسدانوں نے انفرادی طور پر یا چھوٹے گروپوں میں کام کیا ہے جس میں روایتی سنگل یوزر سافٹ ویئر ایپلی کیشنز جیسے میک کلیڈ، میسکائٹ اور نیکسس ڈیٹا ایڈیٹر کو استعمال کیا گیا ہے۔ جیسا کہ زیر مطالعہ مفروضے زیادہ پیچیدہ ہو گئے ہیں، بڑی تحقیقی ٹیمیں تخمینہ شدہ <ID1 ملین> ملین زندہ پرجاتیوں اور فوسلز سے معلوم ہونے والی ہزاروں مزید معدوم پرجاتیوں کے لیے ٹری آف لائف کو دریافت کرنے کے مسئلے سے نمٹنے کے لیے جمع ہوئی ہیں۔ چونکہ فینوٹائپ بنیادی طور پر بصری ہے، اور چونکہ فینوٹائپ پر مبنی فائیلوجنیٹک مطالعات میں سائز میں اضافہ ہوتا رہا ہے، اس لیے یہ ضروری ہو جاتا ہے کہ مشاہدات کو لیبل شدہ تصاویر کے ذریعے بیک اپ کیا جائے۔ اس وقت وسیع پیمانے پر استعمال ہونے والی روایتی ڈیسک ٹاپ سافٹ ویئر ایپلی کیشنز ٹیم پر مبنی تحقیق یا امیج ہیرا پھیری اور اسٹوریج کے لیے مضبوط تعاون فراہم نہیں کرتی ہیں۔ مورفو بینک فینومکس کے بڑھتے ہوئے سائنسی شعبے کے لیے خاص طور پر ایک اہم ذریعہ ہے۔ مورفو بینک کی ترقی، جس کا آغاز 2001 میں ہوا تھا، کو نیشنل سائنس فاؤنڈیشن کے ڈائریکٹوریٹ برائے جیو سائنسز، بائیولوجیکل سائنسز اور کمپیوٹر اینڈ انفارمیشن سائنس اینڈ انجینئرنگ نے مالی اعانت فراہم کی ہے۔ مورفو بینک پر سائنسی کام کی اہمیت کو دیگر اشاعتوں کے علاوہ نیویارک ٹائمز (یہاں اور یہاں) میں نمایاں کیا گیا ہے۔ فوائد ٹری آف لائف کی تعمیر کے لیے فائیلوجینیٹکس کا مطالعہ کرنے والی سائنس دانوں کی ٹیمیں انواع کے بارے میں مشاہدات کی بڑی اسپریڈشیٹ جمع کرتی ہیں (جسے "میٹرکس" کہا جاتا ہے)۔ ان ٹیموں کو سائنسی تحقیقی منصوبے کے دوران ٹیم کے ڈیٹا کی ایک واحد اور محفوظ کاپی تک ٹیم کے ہر رکن کی طرف سے بیک وقت رسائی کی ضرورت ہوتی ہے۔ اعداد و شمار کی یہ واحد کاپی بھی اعداد و شمار جمع کرنے کے مرحلے کے دوران بڑی تعدد کے ساتھ تبدیل ہوتی ہے۔ ہومیولوجی بیانات کو دستاویزی شکل دینے کے لیے بہت مددگار ثابت ہونے والی تصاویر کو ہومیولوجی بیانات کی ترقی کے ساتھ ہی ظاہر، لیبل اور شیئر کیا جانا چاہیے۔ یہ صرف ڈیسک ٹاپ سافٹ ویئر پیکیج کے ساتھ خوبصورتی سے پورا نہیں کیا جا سکتا کیونکہ ڈیسک ٹاپ ماحول میں ہر ساتھی پروجیکٹ ڈیٹا کی اپنی نجی کاپی پر کام کر رہا ہوتا ہے۔ ایک شریک کی طرف سے کی گئی تبدیلیاں خود بخود دوسروں کو پھیل نہیں سکتی ہیں، جو شراکت داروں کو ایک دوسرے کے ڈیٹا میں ترامیم دیکھنے سے روکتی ہیں جب تک کہ وہ دستی طور پر (اور اس میں شامل کوششوں کی وجہ سے، اکثر وقتا فوقتا) ایک "سچے" ڈیٹا سیٹ میں ضم نہ ہو جائیں۔ ٹیموں کے سب سے چھوٹے اور سب سے زیادہ نظم و ضبط کے علاوہ، فائل ورژن کنٹرول اور ڈیٹا کی متعدد کاپیوں پر کی گئی تبدیلیوں کا مصالحہ پیداوری پر اہم ڈریگ کے طور پر تیزی سے سامنے آتا ہے۔ مورفو بینک ان مسائل کو حل کرنے کی ایک کوشش ہے جس میں ویب اور جدید ویب پر مبنی ایپلی کیشن تکنیک کا فائدہ اٹھایا جائے، بشمول ایجیکس، ویب سروس لیئرز، اور بھرپور ویب ایپلی کیشنز تاکہ فائیلوجنیٹک ریسرچ کے لیے ایک مکمل خصوصیات والی، نیٹ تک رسائی کے قابل باہمی تعاون کی جگہ فراہم کی جا سکے۔ خاص طور پر، مورفو بینک اسے آسان بناتا ہے: جغرافیائی طور پر الگ الگ ٹیم کے ممبروں کے ساتھ ہر قسم کے ڈیٹا کا اشتراک کریں، بشمول درجہ بندی، کردار اور نمونہ ڈیٹا، میڈیا (بشمول تصاویر، ویڈیو اور آڈیو)، فائیلوجنیٹک میٹرکس (بشمول وسیع پیمانے پر استعمال ہونے والے ڈیٹا NEXUS اور TNT فارمیٹ میں) اور دیگر ڈیٹا جیسے دستاویزات اور جینیاتی ترتیبات۔ ویب پر مبنی تصویری اینوٹیشن ایپلی کیشن کا استعمال کرتے ہوئے اعلی ریزولوشن والی تصاویر کو لیبل کریں۔ بلٹ ان ویب پر مبنی میٹرکس ایڈیٹر کا استعمال کرتے ہوئے پروجیکٹ ڈیٹا جیسے فائیلوجنیٹک میٹرکس میں باہمی تعاون سے ترمیم کریں۔ ایڈیٹر لیبل شدہ تصاویر کو میٹرکس کے انفرادی خلیوں سے جوڑنے کی اجازت دیتا ہے۔ پروجیکٹ ڈیٹا تک رسائی کا انتظام کریں۔ رسائی ٹیم کے اراکین کے لیے مکمل رسائی سے لے کر ممکنہ جائزہ لینے والوں کے لیے گمنام صرف پڑھنے تک رسائی تک ہوتی ہے۔ ایک مستقل یو آر ایل کے ساتھ شائع شدہ کاغذ کی حمایت میں ویب پر مکمل پروجیکٹ ڈیٹا شائع کریں۔ ٹیکسون مثالی تصاویر کے لیے انسائیکلوپیڈیا آف لائف تلاش کریں۔ ہائی ریزولوشن سی ٹی ڈیٹا اسٹور کریں میٹرکس خلیوں کو اپ ڈیٹ کرنے اور آباد کرنے کے لیے آنٹولوجیز بنائیں۔ زیادہ تر موجودہ سافٹ ویئر ایپلی کیشنز میں یہ کام مشکل یا ناممکن ہیں۔ 2001 میں نیشنل سائنس فاؤنڈیشن (این ایس ایف) نے نیویارک کے امریکن میوزیم آف نیچرل ہسٹری میں ایک ورکشاپ کو اسپانسر کیا تاکہ مورفولوجیکل فائیلوجینیٹکس کے لیے ایک باہمی تعاون پر مبنی، میڈیا سے بھرپور تحقیقی ٹول کے لیے ویب پر مبنی نظام کا خاکہ تیار کیا جا سکے۔ ورکشاپ میں پیش کردہ ایک ایپلیکیشن پروٹو ٹائپ کو بعد میں ورکشاپ کے فیڈ بیک کے ساتھ بہتر بنایا گیا اور یہ مورفو بینک ورژن 1 بن گیا۔ یو ایس نیشنل اوشینک اینڈ ایٹموسفیرک ایڈمنسٹریشن کی طرف سے ایک گرانٹ نے مزید ترمیمات کے لیے مالی اعانت فراہم کی جس کے نتیجے میں ورژن 2.0، 2005 میں جاری کیا گیا۔ این ایس ایف کی طرف سے موجودہ تعاون مورفو بینک کو موجودہ فیچر میں اضافے کے لیے فنڈ فراہم کر رہا ہے۔ مورفو بینک کی میزبانی اسٹونی بروک یونیورسٹی نے اکتوبر 2021 کے آخر تک کی اور اسے امریکن میوزیم آف نیچرل ہسٹری کی طرف سے حمایت حاصل ہوئی۔ موجودہ ورژن 3.0 ہے۔ سافٹ ویئر کے لیے استدلال جریدے کلاڈسٹکس میں بیان کیا گیا تھا۔ مورفو بینک کو این ای ایس سی ای این ٹی اور سان ڈیاگو سپر کمپیوٹر سینٹر سے بھی تعاون حاصل ہوا ہے۔ 2018 سے، مورفو بینک کو جزوی طور پر فینکس بائیو انفارمیٹکس کی حمایت حاصل ہے، جو بنیادی علوم کے لیے ڈیٹا بیس کو برقرار رکھنے کے لیے قائم کی گئی ایک غیر منافع بخش کمپنی ہے۔ مورفو بینک کا اسٹونی بروک یونیورسٹی سے فینکس بائیو انفارمیٹکس میں مستقل اقدام اکتوبر 2021 کے آخر میں مکمل ہوا۔ سان ڈیاگو سپر کمپیوٹر سینٹر اس سے قبل مورفو بینک پروجیکٹ کو تکنیکی اور میزبانی کے وسائل فراہم کر چکا ہے۔ استعمال مورفو بینک فینوٹائپز پر ہم مرتبہ جائزہ لینے والی سائنسی تحقیق کی مصنوعات کی میزبانی کرتا ہے۔ سسٹمیٹکس ڈیٹا کی بڑھتی ہوئی مقدار "بورن ڈیجیٹل" ہے اور مورفو بینک اس قسم کے مواد کو سنبھالنے کے لیے اچھی طرح سے موزوں ہے۔ 24 اگست 2007 کو مورفو بینک نے 62 فعال تحقیقی منصوبوں کے ساتھ ساتھ 6 مکمل (اور شائع شدہ) منصوبوں کی میزبانی کی۔ 2017 تک 2000 سے زیادہ سائنس دان اور ان کے طالب علم رجسٹرڈ مواد بنانے والے تھے (صارفین کو رجسٹر کرنے کی ضرورت نہیں ہے اور اس سے بھی زیادہ تعداد میں ہیں) اور تقریبا 80,000 تصاویر کے ساتھ 500 سے زیادہ عوامی طور پر دستیاب منصوبے ہیں جو سائنسی تحقیق کی مصنوعات ہیں۔ 1, 500 سے زیادہ فعال تحقیقی منصوبوں کی میزبانی مورفو بینک کرتا ہے۔ سافٹ ویئر کا استعمال ممالیہ جانوروں، چمگادڑوں سے لے کر وہیلوں، بیولیو مولسک، اراکنیڈز، جیواشم پودوں اور زندہ اور معدوم امنیٹس جیسے گروہوں پر فائیلوجنیٹک تحقیق کو جمع کرنے کے لیے کیا گیا ہے۔ اسے ارتقائی اور آثار قدیمہ کی تحقیق میں بھی زیادہ وسیع پیمانے پر استعمال کیا گیا ہے تاکہ لیسونگ کیڑوں کے گیکوس، ریپٹر پرندوں، ڈایناسور، مینڈکوں اور نیماتوڈس پر شائع شدہ تحقیق سے وابستہ کیوریٹڈ امیجز کی میزبانی کی جا سکے۔ مورفو بینک پیلیو بائیولوجی ڈیٹا بیس کے ساتھ مل کر تیزی سے استعمال ہوتا ہے۔ شائع شدہ پروجیکٹوں کی مثال: پروجیکٹ 1097: بلینک سی ای، 2013 میٹھے پانی کے ماحول میں فوٹو سنتھیٹک یوکرائٹس کی ابتدا اور ابتدائی ارتقاء-خاصیت کے ارتقاء کی روشنی میں پروٹروزوک پیلیو بائیولوجی اور بائیو جیو کیمیکل عمل کی دوبارہ تشریح پروجیکٹ 2520: کاروالہو، ٹی پی، آر ای ریس، اور جے پی فرییل، 2017 ماراکائیبو بیسن، وینزویلا سے ہوپلومیزون (سلورفارم: ایسپریڈینیڈی) کی ایک نئی نوع: ہائی ریزولوشن پروجیکٹ 2651 کا استعمال کرتے ہوئے آسٹیولوجیکل تفصیل: بیرن، ایم جی، نارمن، ڈی بی، بیریٹ، پی ایم، 2017 ڈایناسور کے تعلقات اور ابتدائی ڈی کا ایک نیا مفروضہ۔ مورفو بینک ٹیکسونومک، کردار اور میٹرکس پر مبنی ڈیٹا کو ضم کرنے کے ساتھ ساتھ اس کی باہمی تعاون کی خصوصیات کی وجہ سے اس طرح کے منصوبوں کے لیے اچھی طرح سے موزوں ہے۔ اس تحقیق کی جھلکیوں میں سائنس میں شائع ہونے والے ممالیہ ارتقاء پر ایک باہمی تعاون پر مبنی میٹرکس شامل ہے جس میں 80 سے زیادہ پرجاتیوں کے لیے 4,000 سے زیادہ فینومک کردار شامل ہیں، موجودہ بیلین وہیلوں پر ایک میٹرکس جس میں تقریبا 600 تصاویر ہیں، اور بہت کچھ۔ حوالہ جات۔ بیرونی روابط مورفو بینک کا ہوم پیج زندگی کے درخت کو جدید بنانا، سائنس، 10 جون 2003، 300:1692-1697۔ حیاتیاتی تنوع کی تشخیص کو آسان بنانے اور تیز کرنے کے لیے مورفو بینک سمیت منصوبوں کی کوششوں پر تبادلہ خیال کرنے والا مضمون۔ "مورفولوجی: دی شیپ آف تھنگز ٹو کم"، پال ڈی تھیکر، بائیو سائنس، جون 2003، جلد۔ 53 نمبر۔ 6، 544۔ مورفو بینک سمیت مورفولوجیکل تحقیق میں عصری اقدامات پر ایک رپورٹ۔ ویب ایپلی کیشنز بائیو انفارمیٹکس سافٹ ویئر پیلیوونٹولوجی ارتقاء مورفولوجی (حیاتیات) ٹیکسونومی پرجاتیوں کے فوسلز