Nitrosopumilus
{{ٹیکسو باکس | امیج = ThaspiviridaeFig1rv2.png | امیج _ کیپشن = نائٹروسپومیلس میریٹیمس، جزوی طور پر نائٹروسپومیلس اسپنڈل کی شکل کے وائرس 1 (تھاسپیویریڈی) کے وائرینز کے ساتھ منسلک ہے۔ | ڈومین = آرکیا۔ فائیلم = نائٹروسفوفیروٹا۔ کلاسس = نائٹروسفوفیریا۔ آرڈو = نائٹروسپومیلیلس۔ فیملییا = نائٹروسپومیلیسی۔ جینس = نائٹروسپومیلس۔ جینس _ اتھارٹی = کن اور دیگر۔ 2017۔ ٹائپ _ سپیسز = نائٹروسوپومیلس میریٹیمس۔ ٹائپ _ سپیسز _ اتھارٹی = کن اور دیگر۔ 2017 | سب ڈویژن _ رینکس = سپیسز۔ سب ڈویژن = این۔ ایڈریاٹیکس "سی اے۔ این۔ ایسٹوریمسس "" سی اے۔ این کیٹالینینسس "" این۔ کوبالامینجینز "" این۔ سمبسٹلا "" این۔ ڈیٹریٹیفیرس "" این۔ ہیکساڈیلا "" سی اے۔ این۔ کورینسیس "" سی اے۔ این۔ لیمنیٹکس "این۔ میریٹیمس" این۔ آکسیکلینی "این۔ پیرانینسس" سی اے۔ این۔ سالاریس "" سی اے۔ این۔ سیڈیمینس "" این۔ یوریفیلس "این۔ زوسٹیرا۔ مترادفات =" سی اے۔ نائٹروسپومیلس "کنیک اور دیگر۔ 2005 "سی اے۔ نائٹروسومیرنس "اہلگرن اور دیگر۔ 2017} نائٹروسپومیلس میریٹیمس سمندری پانی میں رہنے والا ایک انتہائی عام آثار قدیمہ ہے۔ یہ گروپ 1 اے نائٹروسافیروٹا (سابقہ تھمارچیوٹا) کا پہلا رکن ہے جو خالص کلچر میں الگ تھلگ ہے۔ جین کے سلسلے سے پتہ چلتا ہے کہ گروپ 1 اے نائٹروسافیروٹا اولیگوٹروفک سطح سمندر کے ساتھ ہر جگہ موجود ہیں اور سیارے کے ارد گرد زیادہ تر غیر ساحلی سمندری پانیوں میں پائے جا سکتے ہیں۔ یہ سب سے چھوٹے جانداروں میں سے ایک ہے جس کا قطر 0.2 مائیکرو میٹر ہے۔ این میریٹیمس پرجاتیوں کے خلیات مونگ پھلی کی شکل کے ہوتے ہیں اور انفرادی طور پر اور ڈھیلے مجموعوں میں دونوں میں پائے جا سکتے ہیں۔ وہ امونیا کو نائٹرائٹ میں آکسائڈائز کرتے ہیں اور این میریٹیمس کے اراکین امونیا کو 10 نینوملر کی سطح پر آکسائڈائز کر سکتے ہیں، جو اس کی زندگی کو برقرار رکھنے کے لیے حد کے قریب ہے۔ پرجاتیوں این میریٹیمس میں آرکیا آکسیجن کی کمی والے رہائش گاہوں میں رہتا ہے۔ امونیا آکسیکرن کے لیے درکار آکسیجن نئے راستے سے پیدا ہو سکتی ہے جو آکسیجن اور ڈائنائٹروجن پیدا کرتا ہے۔ این۔ میریٹیمس اس طرح ان حیاتیات میں شامل ہے جو اندھیرے میں آکسیجن پیدا کرنے کے قابل ہیں۔ اس جاندار کو ڈیوڈ اسٹہل (یونیورسٹی آف واشنگٹن) کی قیادت میں ایک گروپ نے سیئٹل ایکویریم میں ایک ٹراپیکل ٹینک میں تلچھٹ سے الگ کیا تھا۔ حیاتیات لپڈ جھلی این میریٹیمس کی آبادی شاید سمندر میں گلیسرول ڈائیکل گلسرول ٹیٹریتھرز (جی ڈی جی ٹی) کا بنیادی ذریعہ ہے، ایک ایسا مرکب جو ان کی یک پرت لپڈک سیل جھلی کو برقرار قطبی لپڈ (آئی پی ایل) کے طور پر تشکیل دیتا ہے۔ یہ جھلی کی ساخت پروٹون محرک قوت کو زیادہ سے زیادہ کرنے کے بارے میں سوچا جاتا ہے۔ ان حیاتیات کی جھلی میں پائے جانے والے مرکبات، جیسے جی ڈی جی ٹی، آئی پی ایل، اور کرینارچیول، پانی کے کالم میں نائٹروسافیروٹا گروپ سے تعلق رکھنے والے حیاتیات کی موجودگی کے لیے بائیو مارکروں کے طور پر مفید ہو سکتے ہیں۔ یہ آرکیا درجہ حرارت (جی ڈی جی ٹی سائیکلائزیشن کے ذریعے)، نشوونما، میٹابولک اسٹیٹس، اور، اگرچہ ڈرامائی طور پر کم ہوں، پی ایچ کے سلسلے میں اپنی جھلی کی ساخت کو تبدیل کرنے کے لیے بھی پائے گئے ہیں۔ سیل ڈویژن یوریارچیوٹا، تھرموپروٹوٹا، اور نائٹروسافیروٹا آرکیا کے تین بڑے فائیلا میں سے کچھ ہیں جو سیل ڈویژن کو نقل کرنے کے لیے استعمال کرتے ہیں۔ یوریارچیوٹا اور بیکٹیریا سیل ڈویژن میں ایف ٹی ایس زیڈ میکانزم کا استعمال کرتے ہیں، جبکہ تھرموپروٹوٹا سی وی ڈی مشینری کا استعمال کرتے ہوئے تقسیم ہوتا ہے۔ تاہم، نائٹروسافیروٹا جیسے این میریٹیمس ایف ٹی ایس زیڈ اور سی ڈی وی دونوں میکانزم کو اپناتا ہے۔ اس کے باوجود، مزید تحقیقات کے بعد، این میریٹیمس کو سیل ڈویژن کے دوران ایف ٹی ایس زیڈ کے بجائے بنیادی طور پر سی وی ڈی پروٹین کا استعمال کرتے ہوئے پایا گیا۔ اس صورت میں، سی وی ڈی سیل ڈویژن میں این maritimus.Mosier، انیکا سی۔، ایرک ای ایلن، ماریہ کم، اسٹیون فیریرا، اور کرسٹوفر اے فرانسس کے لیے بنیادی نظام ہے۔ "کینڈیڈیٹس نائٹروسپومیلس سلاریا" بی ڈی 31 کا جینوم سیکوینس، سان فرانسسکو بے ایسٹوری سے ایک امونیا آکسائڈائزنگ آرکیئن "۔ جرنل آف بیکٹیریاولوجی 194، نمبر۔ 8 (15 اپریل 2012): 2121-22۔ https://doi.org/10.1128/JB.00013-12۔ لہذا، 1.645Mb کے جینوم کی نقل تیار کرنے کے لیے، این۔ میریٹیمس 15 سے 18 گھنٹے گزارتا ہے۔ فزیولوجی جینوم امونیا آکسیڈائزنگ بیکٹیریا (اے او بی) غیر نامیاتی کاربن کے استعمال سے کیمولیتھو آٹوٹروفک نمو کے لیے جانا جاتا ہے، این میریٹیمس، ایک امونیا آکسیڈائزنگ آرکیا (اے او اے) نشوونما کے اسی طرح کے عمل کا استعمال کرتا ہے۔ جبکہ اے او بی کیلون-باسھم-بینسن سائیکل کو کلیدی انزائم کے طور پر-فکسنگ انزائم ربولوز بسفاسفیٹ کاربوکسیلیز/آکسیجنس (روبسکو) کے ساتھ استعمال کرتا ہے۔ ایسا لگتا ہے کہ این میریٹیمس بڑھتا ہے اور جینوں اور انزائموں کی کمی کی وجہ سے ایک متبادل راستہ استعمال کرتا ہے۔ لہذا، 3-ہائیڈروکسی پروپیونیٹ/4-ہائیڈروکسی بیوٹیریٹ کی ایک قسم کو این میریٹیمس آٹوٹروفک طور پر تیار کرنے کے لیے استعمال کرتا ہے، جو اس کی غیر نامیاتی کاربن کو جذب کرنے کی صلاحیت کی اجازت دیتا ہے۔ کیلون سائیکل کے بجائے 3-ہائیڈروکسی پروپیونیٹ/4-ہائیڈروکسی بیوٹیریٹ راستے کے طریقہ کار کا استعمال کرتے ہوئے، این میریٹیمس ترقی کا فائدہ فراہم کر سکتا ہے کیونکہ یہ عمل زیادہ توانائی سے موثر ہے۔ اس کی اصلیت کی وجہ سے، این میریٹیمس کاربن اور نائٹروجن سائیکل امونیا آکسیڈائزنگ میں ایک اہم کردار ادا کرتا ہے۔ این میریٹیمس جینوم کی تنہائی اور ترتیب نے نائٹروسافیروٹا گروپ سے تعلق رکھنے والے حیاتیات کی فزیولوجی میں بصیرت کو بڑھانے کی اجازت دی ہے۔ این میریٹیمس پہلا آرکیئن تھا جس کا مطالعہ امونیا آکسیڈائزنگ میٹابولزم کے ساتھ کیا گیا تھا۔ یہ جاندار سمندری ماحول میں خاص طور پر فوٹک زون کے نچلے حصے میں عام ہے جہاں امونیم اور آئرن کی مقدار اس کی نشوونما کو سہارا دینے کے لیے کافی ہے۔ این میریٹیمس کی فزیولوجی بعض پہلوؤں کے تحت غیر واضح ہے۔ یہ نائٹریٹ کی تشکیل کے ساتھ امونیا کے آکسیکرن اور آکسیجن کی کمی سے اپنے اہم افعال کے لیے توانائی کو محفوظ رکھتا ہے۔ کاربن کا ماخذ ہے۔ یہ 3-ہائیڈروکسی پروپینیٹ/4-ہائیڈروکسی بیوٹیریٹ کاربن سائیکل کے ذریعے مائکروجنزم کے ذریعے طے اور جذب ہوتا ہے۔ این میریٹیمس پانی کے کالم کے ساتھ نائٹروجن سائیکل میں کلیدی کردار ادا کرتے ہوئے نائٹریفیکیشن کا پہلا مرحلہ انجام دیتا ہے۔ چونکہ یہ آکسیڈائزنگ رد عمل صرف تھوڑی مقدار میں توانائی جاری کرتا ہے، اس مائکروجنزم کی نشوونما سست ہوتی ہے۔ این میریٹیمس کے جینوم میں ایمو اے جین شامل ہے، جو امونیا مونو آکسیجنیز (اے ایم او) انزائم کے لیے انکوڈنگ کرتا ہے۔ یہ مؤخر الذکر امونیا کو ہائیڈروکسیلیمائن (NH2OH) میں آکسیکرن کی اجازت دیتا ہے۔ اس کے بجائے، جینوم میں ہائیڈروکسی لیمین آکسیڈوریڈیکٹس (ایچ اے او) کے لیے جین انکوڈنگ کا فقدان ہے جو انٹرمیڈیٹ (این ایچ 2 او ایچ) کو نائٹرائٹ میں آکسائڈائز کرنے کا ذمہ دار ہے۔ ہائیڈروکسیلامائن ایک میٹابولائٹ کے طور پر تیار کیا جاتا ہے، اور یہ میٹابولک رد عمل کے دوران فوری طور پر استعمال ہوتا ہے۔ اس میٹابولک راستے کے دوران پیدا ہونے والے دیگر انٹرمیڈیٹس یہ ہیں: نائٹرک آکسائڈ (NO)، نائٹروس آکسائڈ (N2O)، نائٹوکسیل (HNO)۔ یہ زیادہ ارتکاز پر زہریلے ہوتے ہیں۔ ہائیڈروکسیلیمائن کو نائٹریٹ میں آکسائڈائز کرنے کا ذمہ دار انزائم ابھی تک اچھی طرح سے معلوم نہیں ہے۔ این میریٹیمس کے میٹابولک راستے کے لیے دو مفروضے تجویز کیے گئے ہیں جن میں دو قسم کے انزائم شامل ہیں: تانبے پر مبنی انزائم (کیو-ایم ای) اور نائٹریٹ ریڈکٹیز انزائم (این آر کے) اور اس کا الٹا: پہلے میں امونیا کو اے ایم او کے ذریعے آکسائڈائز کیا جاتا ہے جس سے ہائیڈروکسیلیمائن بنتا ہے ؛ مؤخر الذکر، اور نائٹرک آکسائڈ کا ایک مالیکیول، بدلے میں، تانبے پر مبنی انزائم (کیو-ایم ای) کے ذریعے نائٹریٹ کے دو مالیکیول تیار کرتے ہوئے آکسائڈائز کیا جاتا ہے۔ ان میں سے ایک نائٹریٹ ریڈکٹیس (این آر کے) کے ذریعے کم ہو کر این او ہو جاتا ہے اور کیو-ایم ای انزائم میں واپس چلا جاتا ہے۔ الیکٹرانوں کا ٹرانسلوکیشن ایک پروٹون موٹیو فورس (پی ایم ایف) پیدا کرتا ہے اور اے ٹی پی کی ترکیب کی اجازت دیتا ہے۔ دوسرے میں امونیا کو اے ایم او کے ذریعے آکسائڈائز کیا جاتا ہے جو ہائیڈروکسیلیمائن بناتا ہے اور پھر دو انزائم، نیر کے اور کیو-ایم ای، ہائیڈروکسیلیمائن کو نائٹرک آکسائڈ میں اور اسے نائٹرائٹ میں آکسائڈائز کرتے ہیں۔ مناسب کردار اور جس ترتیب میں یہ انزائم کام کرتے ہیں، اس کی وضاحت کرنی ہوگی۔ مزید برآں نائٹروس آکسائیڈ 'اس قسم کے میٹابولزم سے خارج ہوتا ہے۔ یہ ایک اہم گرین ہاؤس گیس ہے جو ممکنہ طور پر میٹابولائٹس کے ابیوٹک ڈی نائٹریفیکیشن کے نتیجے میں پیدا ہوتی ہے۔ ٹیکسونومی فی الحال قبول شدہ ٹیکسونومی پروکیریوٹک ناموں کی فہرست پر مبنی ہے جس میں اسٹینڈنگ ان نامی (ایل پی ایس این) اور نیشنل سینٹر فار بائیوٹیکنالوجی انفارمیشن (این سی بی آئی) ایکولوجی ہیبیٹیٹس نائٹروسفوفیروٹا فیلم کی خصوصیت، این میریٹیمس بنیادی طور پر پیلیجک زون کے اندر اولیگوٹروفک (غذائی اجزاء میں ناقص ماحول) کھلے سمندر میں پایا جاتا ہے۔ ابتدائی طور پر سیئٹل میں دریافت کیا گیا، ایکویریم میں، آج این میریٹیمس متعدد ماحول کو آباد کر سکتا ہے جیسے ذیلی ذیلی شمالی بحر الکاہل اور جنوبی بحر اوقیانوس یا بحر الکاہل میں میسوپیلیجک زون۔ این۔ میریٹیمس ایک ایروبک آرکون ہے جو غذائی اجزاء کی انتہائی کم مقدار کے ساتھ بھی بڑھنے کے قابل ہے، جیسے اندھیرے گہرے کھلے سمندر میں، جس میں این۔ میریٹیمس ایک اہم اثر کے طور پر ہوتا ہے۔ سمندری نائٹریفیکیشن این میریٹیمس پرجاتیوں کے اراکین امونیا کو آکسائڈائز کر کے نائٹرائٹ تشکیل دے سکتے ہیں، جو کہ نائٹروجن سائیکل کا پہلا مرحلہ ہے۔ امونیا اور نائٹریٹ وہ دو غذائی اجزاء ہیں جو نائٹروجن کے غیر نامیاتی پول کی تشکیل کرتے ہیں۔ ناقص ماحول کی آبادی (نامیاتی توانائی کے ذرائع اور سورج کی روشنی کی کمی)، امونیا کی آکسیکرن بنیادی پیداواری صلاحیت میں حصہ ڈال سکتی ہے۔ در حقیقت، نائٹریٹ فائٹوپلانکٹن کی بنیادی پیداوار کا نصف ایندھن بناتا ہے لیکن نہ صرف فائٹوپلانکٹن کو نائٹریٹ کی ضرورت ہوتی ہے۔ اعلی امونیا کی وابستگی این میریٹیمس کو بڑی حد تک دوسرے سمندری فوٹوٹروفس اور کیموٹروفس کے ساتھ مقابلہ کرنے کی اجازت دیتی ہے۔ فی یونٹ بائیو ماس امونیم کے کاروبار کے حوالے سے، این میریٹیمس اولیگوٹروفک ہیٹروٹروفس کے کاروبار سے تقریبا 5 گنا زیادہ ہوگا، اور زیادہ تر اولیگوٹروفک ڈائیٹمز کے معروف کاروبار سے تقریبا 30 گنا زیادہ ہوگا۔ این میریٹیمس کے ذریعہ ان دو مشاہدات نائٹریفیکیشن کا حساب لگانا سمندری نائٹروجن سائیکل میں کلیدی کردار ادا کرتا ہے۔ کاربن اور فاسفورس کے مضمرات ایک متبادل راستے (3-ہائیڈروکسی پروپیونیٹ/4-ہائیڈروکسی بیوٹیریٹ راستہ) کے ذریعے غیر نامیاتی کاربن کو ٹھیک کرنے کی اس کی صلاحیت این میریٹیمس کو عالمی کاربن بجٹ کے بہاؤ میں مؤثر طریقے سے حصہ لینے کی اجازت دیتی ہے۔ امونیا-آکسیڈائزنگ راستے، این میریٹیمس اور دیگر سمندری تھامارچیا کے ساتھ مل کر، تقریبا سمندروں میں منرلائزڈ نامیاتی کاربن کا 4.5 فیصد ری سائیکل کرتا ہے اور 4.4 فیصد ڈیٹریٹل فاسفورس کو نئے فاسفورس مادوں میں تبدیل کرتا ہے۔ مزید پڑھنے والے سائنسی جرائد آرکیا جنرا حوالہ جات کی فہرست بھی دیکھیں۔ سائنسی کتابیں سائنسی ڈیٹا بیس بیرونی روابط آرکیا جنرا کینڈیڈیٹس ٹیکسا میرین مائکروجنزم