Interferon-inducible GTPase 5
انٹرفیرون انڈسیبل جی ٹی پیس 5 جسے امیونٹی سے متعلق جی ٹی پیس سنیما 1 (آئی آر جی سی 1) بھی کہا جاتا ہے ایک انزائم ہے جسے انسانوں میں آئی آر جی سی جین کے ذریعے کوڈ کیا جاتا ہے۔ اس کے پی 47-جی ٹی پی ایز جیسے اور آئی آر جی خاندانوں میں دوسرے پروٹینوں کی طرح برتاؤ کرنے کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ یہ خصیوں میں سب سے زیادہ ظاہر ہوتا ہے۔ جین IRGC کروموسوم 19 پر 19q13.31 پوزیشن پر واقع ہے اور اس میں دو ایکسون ہوتے ہیں۔ یہ فارورڈ اسٹرینڈ پر ہے اور فاسفولیپیس اے 2 انفیکٹر اور لائ 6/پی ایل اے آر ڈومین پر مشتمل پروٹین لائک (ایل او سی 105372412) کے اوپر کی طرف اور نونسینس میڈیٹڈ ایم آر این اے ڈیک فیکٹر (ایس ایم جی 9) کے نیچے کی طرف ہے۔ ہومولوجی اور ارتقاء کا پیرالاگ آئی آر جی سی کے لیے ایک پیرالاگ ہے جس کا نام آئی آر جی ایم ہے۔ IRGM، یا قوت مدافعت سے متعلق GTPase M، انٹرا سیلولر دفاع سے وابستہ ہے۔ دونوں پی 47-جی ٹی پیز نما خاندان اور پی لوپ این ٹی پیز ڈومین سپر فیملی کا حصہ ہیں۔ پیرالاگ میں آئی آر جی سی کی 12 فیصد شناخت ہے۔ آرتھولوگس آئی آر جی سی کو تمام ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں محفوظ دیکھا گیا۔ جی ٹی پی/میگنیشیم اور پولی پیپٹائڈ بائنڈنگ ریجنز اور ایک ٹرانس میمبرین ریجن پرجاتیوں کے درمیان کافی حد تک محفوظ ہیں۔ ارتقاء آئی آر جی سی کی پیش گوئی کی گئی ہے کہ وہ سائٹوکروم سی اور β-ہیموگلوبن سے زیادہ تیزی سے تیار ہوا ہے جب ہر جین کے لیے ایک ہی نوع کی فیصد شناخت کا موازنہ 500 ملین سالوں میں کیا جاتا ہے۔ امکان ہے کہ آئی آر جی سی اور آئی آر جی ایم 350 سے 375 ملین سال پہلے الگ ہو گئے تھے۔ ٹرانسکرپشن پروموٹر ایک پروموٹر ریجن تھا، GXP _ 311825، جو کروموسوم 19 پر IRGC کے لیے پایا گیا۔ یہ 1521 بیس جوڑے لمبے ہیں اور بیس جوڑے 43714694 سے شروع ہوتے ہیں۔ یہ جانچ شدہ تمام 7 آرتھولوگس ترتیبات پر محفوظ ہے اور 8.090 ٹی پی ایم پر خصیوں کے ساتھ سب سے زیادہ تعلق رکھتا ہے۔ چھ ممکنہ نقل میں سے، GXT _ 26231691 میں سب سے زیادہ CAGE ٹیگز تھے۔ ٹیسٹس کو 873 سی اے جی ای ٹیگز میں سے 839 پر لیبل کیا گیا تھا۔ ایم آر این اے آئی آر جی سی کے لیے سب سے عام نقل 1596 بیس جوڑے طویل ہے اور اس کا الحاق نمبر NM _ 019612 ہے۔ دیگر نقل میں آئسوفارم X1، XM _ 005259058، آئسوفارم X2، XM _ 011527118، اور آئسوفارم X3، XM _ 006723283 شامل ہیں۔ پروٹین بائیو کیمسٹری انٹرفیرون انڈسیبل جی ٹی پیس 5 463 امینو ایسڈ لمبا ہے، اس کا سالماتی وزن 50.3 کے ڈی اے ہے، اور پیش گوئی شدہ آئسو الیکٹرک پوائنٹ 5.22 ہے۔ سگنل پیپٹائڈ ہونے کا امکان نہیں ہے۔ بقیہ 364 اور 384 کے درمیان ایک ٹرانس میمبرین خطے کی بہت زیادہ پیش گوئی کی جاتی ہے، جس میں ترتیب کا پہلا حصہ جھلی کے باہر اور دوسرا حصہ جھلی کے اندر ہوتا ہے۔ ثانوی ساخت پروٹین کی ثانوی ساخت میں بیٹا شیٹس کے مقابلے میں زیادہ الفا ہیلیکس ہونے کی توقع کی جاتی ہے، قریبی آرتھولوگس میں انتہائی مماثل ثانوی ڈھانچے پائے گئے۔ ترتیری ڈھانچہ ترتیری ڈھانچے کی پیش گوئی متعلقہ ایکس رے کرسٹلگرافی ڈھانچوں کے ساتھ کی جا سکتی ہے۔ پروٹین کے لیے ایک ہٹ تھا، لیگپ 1 [مس مسکولس]، جس کی ای-ویلیو 2 ای-76 تھی اور پروٹین کی ترتیب کے 82 فیصد سے زیادہ 34 فیصد شناخت تھی۔ ترجمہ کے بعد کی تبدیلیاں پروٹین کے جی ٹی پی اور میگنیشیم بائنڈنگ ہونے کی توقع ہے کیونکہ اس میں کئی متعلقہ بائنڈنگ سائٹس شامل ہیں۔ اس نے باقیات 153 اور 163 کے درمیان پولی پیپٹائڈ بائنڈنگ کے لیے ہوموڈیمر انٹرفیس کے علاقوں کی بھی پیش گوئی کی ہے۔ سیر 247 اور سیر 304 میں فاسفین کے باہمی تعامل کے دو ممکنہ مقامات ہیں۔ توقع کی جاتی ہے کہ فاسفوریلیشن سیرینز اور کچھ تھریونائنز پر پوری ترتیب میں عام ہوگا، حالانکہ بقیہ 330 کے بعد مزید ہونے کا امکان ہے۔ چند گلیوسیلیشن اور گلائکیشن سائٹس کی پیش گوئی کی گئی ہے، حالانکہ کچھ پیش گوئیاں ممکنہ فاسفوریلیشن سائٹس کے ساتھ اوورلیپ ہوتی ہیں۔ سب سیلولر لوکیشن پروٹین غیر سائٹوپلاسمک ہو سکتا ہے حالانکہ اس وقت مزید لوکلائزیشن نامعلوم ہے۔ کلینیکل اہمیت کا اظہار انٹرفیرون-انڈسیبل جی ٹی پیز 5 خصیوں میں سب سے زیادہ ظاہر ہوتا ہے۔ دو اینٹی باڈیز (HPA046769 اور HPA060064) کے استعمال نے گول سپرمیٹائڈز کے مقابلے میں لمبے سپرمیٹائڈز میں زیادہ اظہار کا مظاہرہ کیا۔ لیڈگ خلیات، سپرمیٹوگونیا، اور پریلیپٹوٹین سپرمیٹوسائٹس میں کم اظہار کی اطلاع دی گئی تھی۔ ڈیوڈینم، چھوٹی آنت، اپینڈکس اور گردے میں دونوں اینٹی باڈیز کے ساتھ کم سے درمیانے درجے کا اظہار دیکھا گیا۔ مایوسائٹس اور تائیرائڈ، پیرا تھائیرائڈ، اور ایڈرینل غدود میں کچھ اظہار ہو سکتا ہے۔ کینسر کے حالات میں پیتھولوجی ایکسپریشن میں کمی دیکھی گئی ہے۔ 3 'اور 5' یو ٹی آر دونوں میں اور کوڈنگ کے علاقے میں نقل کی مختلف حالتوں کے ساتھ نامعلوم طبی تعلق ہے۔ حوالہ جات مزید پڑھنا ای سی 3.6.5