Small Molecule Pathway Database
سمال مالیکیول پاتھ وے ڈیٹا بیس (ایس ایم پی ڈی بی) ایک جامع، اعلی معیار، آزادانہ طور پر قابل رسائی، آن لائن ڈیٹا بیس ہے جس میں 600 سے زیادہ چھوٹے مالیکیول (یعنی۔ میٹابولک) راستے جو انسانوں میں پائے جاتے ہیں۔ ایس ایم پی ڈی بی کو خاص طور پر میٹابولومکس، ٹرانسکرپٹومکس، پروٹومکس اور سسٹمز بائیولوجی میں راستے کی وضاحت اور راستے کی دریافت میں مدد کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے۔ یہ جزوی طور پر پانچ قسم کے چھوٹے مالیکیول راستوں کے رنگین، تفصیلی، مکمل طور پر تلاش کے قابل، ہائپر لنکڈ خاکے فراہم کرکے ایسا کرنے کے قابل ہے: 1) عام انسانی میٹابولک راستے ؛ 2) انسانی میٹابولک بیماری کے راستے ؛ 3) انسانی میٹابولائٹ سگنلنگ راستے ؛ 4) منشیات کے عمل کے راستے اور 5) منشیات کے میٹابولزم کے راستے۔ ایس ایم پی ڈی بی راستوں کو گوگل میپس جیسے انٹرفیس کا استعمال کرتے ہوئے انٹرایکٹو طور پر نیویگیٹ، دیکھا اور زوم کیا جا سکتا ہے۔ تمام ایس ایم پی ڈی بی راستوں میں متعلقہ اعضاء، سب سیلولر کمپارٹمنٹس، پروٹین کوفیکٹرز، پروٹین کے مقامات، میٹابولائٹ کے مقامات، کیمیائی ڈھانچے اور پروٹین کواٹرنیری ڈھانچے (شکل۔ 1)۔ ایس ایم پی ڈی بی میں ہر چھوٹا مالیکیول ایچ ایم ڈی بی یا ڈرگ بینک میں موجود تفصیلی وضاحتوں سے ہائپر لنک ہوتا ہے اور ہر پروٹین یا انزائم کمپلیکس یونیپروٹ سے ہائپر لنک ہوتا ہے۔ مزید برآں، تمام ایس ایم پی ڈی بی راستے تفصیلی وضاحت اور حوالہ جات کے ساتھ ہوتے ہیں، جو ہر خاکہ میں دکھائے گئے راستے، حالت یا عمل کا جائزہ فراہم کرتے ہیں۔ صارفین ایس ایم پی ڈی بی کو براؤز کر سکتے ہیں (شکل۔ 2) یا متن کی تلاش کے ذریعے اس کے مندرجات کو تلاش کریں (شکل۔ 3)، ترتیب کی تلاش، یا کیمیائی ساخت کی تلاش۔ مزید طاقتور سوالات بھی ممکن ہیں جن میں جین یا پروٹین کے ناموں، منشیات کے ناموں، میٹابولائٹ کے ناموں، جین بینک آئی ڈیز، سوئس-پروٹ آئی ڈیز، ایجیلینٹ یا ایفیمیٹریکس مائیکرو ارے آئی ڈیز کی فہرستوں کے ساتھ تلاش کرنا شامل ہے۔ یہ سوالات مماثل راستوں کی فہرستیں تیار کریں گے اور ہر راستے کے خاکے پر مماثل مالیکیولز کو نمایاں کریں گے۔ ایس ایم پی ڈی بی کے نقشہ سازی انٹرفیس کے ذریعے جین، میٹابولائٹ اور پروٹین کے ارتکاز کے اعداد و شمار کو بھی دیکھا جا سکتا ہے۔ ایس ایم پی ڈی بی میٹابولومکس ڈیٹا بیس کے ایک مجموعے کا حصہ ہے جس میں ہیومن میٹابولوم ڈیٹا بیس، ڈرگ بینک، اور ٹاکسن اینڈ ٹاکسن ٹارگیٹ ڈیٹا بیس (ٹی 3 ڈی بی) بھی شامل ہیں۔ جبکہ ڈرگ بینک میں 7000 ادویات اور 4200 سے زیادہ غیر ضرورت مند منشیات کے اہداف، انزائمز، ٹرانسپورٹرز اور کیریئرز کے بارے میں معلومات شامل ہیں، ایچ ایم ڈی بی میں انسانی جسم میں پائے جانے والے 40,000 سے زیادہ چھوٹے مالیکیول میٹابولائٹس موجود ہیں۔ سوٹ کو ٹی 3 ڈی بی نے اپنے 3100 سے زیادہ عام زہریلے مادوں اور 1300 سے زیادہ متعلقہ زہریلے اہداف کے ساتھ مکمل کیا ہے۔ ایس ایم پی ڈی بی کا پہلا ورژن یکم جنوری 2010 کو جاری کیا گیا تھا۔ اس ریلیز میں چھوٹے مالیکیول کے راستوں کے لیے 350 سے زیادہ امیج میپڈ راستے شامل تھے۔ ناظرین کا انٹرفیس 3 مراحل (چھوٹے، درمیانے، بڑے) زومنگ کے ساتھ اسکرول بار امیج نیویگیشن تک محدود تھا۔ اس پہلے ورژن میں راستے 1) انسانی میٹابولک راستے ؛ 2) انسانی میٹابولک بیماری کے راستے ؛ اور 3) انسانی میٹابولائٹ سگنلنگ راستے تک محدود تھے۔ ایس ایم پی ڈی بی کا دوسرا ورژن 2014 میں جاری کیا گیا تھا۔ اس ورژن میں 620 سے زیادہ چھوٹے مالیکیول راستے شامل تھے۔ کلک-این-ڈریگ امیج نیویگیشن اور لامحدود، انٹرایکٹو زومنگ کے ساتھ گوگل میپ جیسا انٹرفیس شامل کرنے کے لیے ناظرین کے انٹرفیس کو بڑھایا گیا تھا۔ اس دوسرے ورژن میں راستوں کو وسعت دی گئی جس میں شامل ہیں: 1) عام انسانی میٹابولک راستے ؛ 2) انسانی میٹابولک بیماری کے راستے ؛ 3) انسانی میٹابولائٹ سگنلنگ راستے ؛ 4) منشیات کے عمل کے راستے اور 5) منشیات کے میٹابولزم کے راستے۔ کے ای جی جی ایچ ایم ڈی بی ڈرگ بینک ری ایکٹوم میٹا سائیک حیاتیاتی ڈیٹا بیس کی فہرست حوالہ جات میٹابولومک ڈیٹا بیس طبی ڈیٹا بیس حیاتیاتی ڈیٹا بیس بھی دیکھیں۔