Viperin
ریڈیکل S-adenosyl methionine ڈومین پر مشتمل پروٹین 2 ایک پروٹین ہے جسے انسانوں میں RSAD2 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ آر ایس اے ڈی 2 وائرل عمل میں ایک کثیر فعال پروٹین ہے جو ایک انٹرفیرون محرک جین ہے۔ یہ اطلاع دی گئی ہے کہ وائپرین کو یا تو آئی ایف این پر منحصر یا آئی ایف این سے آزاد راستوں سے متاثر کیا جا سکتا ہے اور بعض وائرس اپنی انفیکشن کو بڑھانے کے لیے وائپرین کا استعمال کر سکتے ہیں۔ اس پروٹین کو پہلے وائرس انابائٹری پروٹین، اینڈوپلاسمک ریٹیکولم سے وابستہ، انٹرفیرون انڈسیبل (وائپرین) کہا جاتا تھا۔ نیوکلیوٹائڈ اینالاگس پیدا کرنے والے ہومولوگس پروکیریوٹک انزائمز کو بیان کرنے کے لیے اس کے نامناسب استعمال کی وجہ سے وائپرین نام کو درست کیا گیا ہے۔ زندگی کے تمام شعبوں میں موجود انزائموں کو این سی-آئی یو بی ایم بی کی سفارشات کا استعمال کرتے ہوئے ایس اے ایم پر منحصر نیوکلیوٹائڈ ڈی ہائیڈریٹیس (ایس اے این ڈی) کا نام دیا جاتا ہے۔ فنکشن وائپرین ایک انٹرفیرون سے متحرک جین ہے جس کا اظہار بہت سے ڈی این اے اور آر این اے وائرس کو روکتا ہے جن میں سی آئی کے وی، ایچ سی ایم وی، ایچ سی وی، ڈی ای این وی، ڈبلیو این وی، ایس آئی این وی، انفلوئنزا، اور ایچ آئی وی شامل ہیں۔ ابتدائی طور پر انسانی سائٹومیگالو وائرس (ایچ سی ایم وی) سے متاثرہ میکروفیجز میں آئی ایف این-جی ایم سے متاثر اینٹی وائرل پروٹین کے طور پر شناخت کی گئی، یہ بتایا گیا کہ وائپرین کو فائبر بلاسٹ میں ایچ سی ایم وی گلائکوپروٹین بی سے متاثر کیا جا سکتا ہے، لیکن ایچ سی ایم وی وائرل انفیکشن کو روکتا ہے اور وائرل ساختی پروٹین کو کم کرتا ہے۔ وائرس کا پروٹین وائپرین کو اپنے خلاف کیوں اکساتا ہے اس کی وجہ ابھی تک واضح نہیں ہے ؛ تاہم، وائپرین کی وائرل پر مبنی دوبارہ تقسیم وائرس کی اپنی اینٹی وائرل سرگرمیوں سے بچنے کے طریقہ کار کی عکاسی کر سکتی ہے۔ وائپرین کو ایچ سی ایم وی وائرل پروٹینوں کے ساتھ بھی حوصلہ افزائی اور تعامل کیا جا سکتا ہے اور سیلولر میٹابولزم میں خلل ڈال کر وائرل انفیکشن کو بڑھانے کے لیے ایچ سی ایم وی وائرل متاثرہ خلیوں میں مائٹوکونڈریا میں منتقل کیا جا سکتا ہے۔ وائپرین ایک ریڈیکل ایس اے ایم انزائم ہے جو چین ٹرمینیٹر ڈی ڈی ایچ سی ٹی پی (3-ڈی آکسی-3′، 4Â-ڈی ہائیڈرو-سی ٹی پی) تیار کرنے کی صلاحیت رکھتا ہے، جو وائرل آر این اے پر منحصر آر این اے پولیمرس (آر ڈی آر پی) کو روکتا ہے۔ ڈی ڈی ایچ سی ٹی پی امینو ایسڈ اور مائٹوکونڈریل تنفس کی میٹابولزم کو بھی ختم کرتا دکھائی دیتا ہے۔ انفلوئنزا وائرس کے ابھرتے اور خارج ہونے کی روک تھام میں، وائپرین کو تجویز کیا جاتا ہے کہ وہ آئسوپرینائڈ بائیوسنتھیس کے راستے میں ایک ضروری انزائم، فرنسیل ڈائیفاسفیٹ سنتھس (ایف پی پی ایس) کی انزائم سرگرمیوں کو باندھ کر اور کم کرکے سیل کی پلازما جھلی پر لپڈ رافٹس کو متاثر کرے۔ وائپرین کو میزبان ایچ وی اے پی-33 اور وائرل این ایس 5 اے کے ساتھ اس کے تعامل کے ذریعے ایچ سی وی کی وائرل نقل کو روکنے اور نقل کمپلیکس کی تشکیل میں خلل ڈالنے کی تجویز دی گئی تھی۔ انسانی وائپرین 361 امینو ایسڈ کا ایک واحد پولی پیپٹائڈ ہے جس کا متوقع سالماتی وزن 42 کے ڈی اے ہے۔ وائپرین کا این-ٹرمینل 42 امینو ایسڈ ایمفیپیتھک الفا-ہیلکس بناتا ہے، جو مختلف انواع میں نسبتا کم محفوظ ہوتا ہے اور وائپرین کی اینٹی وائرل سرگرمی پر معمولی اثر ڈالتا ہے۔ وائپرین کا این-ٹرمینل ڈومین ای آر اور لپڈ بوندوں میں اس کی لوکلائزیشن کے لیے ضروری ہے۔ وائپرین کے امینو ایسڈ 77-209 ریڈیکل S-adenosyl methionine (SAM) ڈومین کی تشکیل کرتے ہیں، جس میں چار محفوظ نقش ہوتے ہیں۔ موٹف 1 میں تین محفوظ سسٹین کے باقیات ہیں، سی ایکس ایکس سی ایکس سی، جو کہ فی-ایس بائنڈنگ موٹف ہے اور اینٹی وائرل سرگرمی کے لیے بھی ضروری ہے۔ وائپرین کے سی-ٹرمینل 218-361 امینو ایسڈ مختلف انواع میں انتہائی محفوظ ہیں اور وائپرین ڈائمرائزیشن کے لیے ضروری ہیں۔ سی-ٹرمینل دم ایچ سی وی کے خلاف اینٹی وائرل سرگرمیوں کے لیے اہم معلوم ہوتی ہے کیونکہ وائپرین کا ٹیگ شدہ سی-ٹرمینل پرچم اپنی اینٹی وائرل سرگرمی کھو دیتا ہے۔ جب وائپرین ایس اے ایم سے منسلک ہوتا ہے اور سائٹیڈائن ٹرائی فاسفیٹ (سی ٹی پی) یا یوریڈائن ٹرائی فاسفیٹ (یو ٹی پی) کو سبسٹریٹ کے طور پر استعمال کیا جاتا ہے، تو مختلف حرکی پیرامیٹرز حاصل کیے جاتے ہیں۔ یہ پیش گوئی کی گئی ہے کہ سی ٹی پی سبسٹریٹ سبسٹریٹ کی کم کلومیٹر قیمت کی وجہ سے وائپرین کے ساتھ بہت زیادہ مضبوطی سے جڑا ہوا ہے۔ تاہم، یو ٹی پی-اور سی ٹی پی-پابند مرکبات دونوں کی مجموعی ساخت ایک جیسی ہے۔ فرق یہ ہے کہ یوراسل کا حصہ کم موثر ہوتا ہے تو بائنڈنگ اور آرڈر کرنے پر سائٹوسین کا حصہ اے اور بی میں بدل جاتا ہے۔ نیوکلیوٹائڈ سے پاک وائپرین میں (βα) 6 جزوی بیرل ہوتا ہے اور اس میں ایک بے ترتیب این-ٹرمینل ایکسٹینشن اور جزوی طور پر آرڈر شدہ سی-ٹرمینل ایکسٹینشن ہوتی ہے۔ جب سی-ٹرمینل دم کا حکم دیا جاتا ہے، تو ایک چھ باقیات والا α-ہیلکس، ایک آٹھ باقیات والا P-لوپ (جو CTP کے γ-فاسفیٹ کو باندھتا ہے)، اور ایک 310-ہیلکس ظاہر ہوتا ہے۔ سیلولر لوکلائزیشن وائپرین کو عام طور پر اس کے این-ٹرمینل ڈومین کے ذریعے اینڈوپلاسمک ریٹیکولم (ای آر) میں مقامی بنایا جاتا ہے، اور لپڈ بوند میں بھی مقامی بنایا جاتا ہے، جو ای آر سے اخذ کیے جاتے ہیں۔ تاہم، یہ ایچ سی ایم وی سے متاثرہ فائبربلاسٹ میں مائٹوکونڈریا میں بھی پایا جاتا ہے۔ حوالہ جات بیرونی لنکس