Human Metabolome Database
ہیومن میٹابولوم ڈیٹا بیس (ایچ ایم ڈی بی) انسانی جسم میں پائے جانے والے چھوٹے مالیکیول میٹابولائٹس کا ایک جامع، اعلی معیار، آزادانہ طور پر قابل رسائی، آن لائن ڈیٹا بیس ہے۔ یہ بنیادی طور پر ہیومن میٹابولوم پروجیکٹ کے ذریعہ تخلیق کیا گیا ہے جس کی مالی اعانت جینوم کینیڈا نے کی ہے اور یہ پہلے وقف شدہ میٹابولومکس ڈیٹا بیس میں سے ایک ہے۔ ایچ ایم ڈی بی انسانی میٹابولومکس تحقیق کو آسان بناتا ہے، جس میں این ایم آر سپیکٹروسکوپی، جی سی-ایم ایس سپیکٹرومیٹری اور ایل سی/ایم ایس سپیکٹرومیٹری کا استعمال کرتے ہوئے انسانی میٹابولائٹس کی شناخت اور خصوصیت شامل ہے۔ اس دریافت کے عمل میں مدد کے لیے، ایچ ایم ڈی بی تین قسم کے ڈیٹا پر مشتمل ہے: 1) کیمیائی ڈیٹا، 2) طبی ڈیٹا، اور 3) سالماتی حیاتیات/بائیو کیمسٹری ڈیٹا (شکل۔ 1-3)۔ کیمیائی اعداد و شمار میں تقریبا 10,000 این ایم آر، جی سی-ایم ایس اور ایل سی/ایم ایس سپیکٹرا کے ساتھ تفصیلی وضاحت کے ساتھ 41,514 میٹابولائٹ ڈھانچے شامل ہیں۔ طبی اعداد و شمار میں> 10,000 میٹابولائٹ-بائیو فلوئڈ کے ارتکاز اور 600 سے زیادہ مختلف انسانی بیماریوں کے بارے میں میٹابولائٹ کے ارتکاز کی معلومات شامل ہیں۔ بائیو کیمیکل ڈیٹا میں 5,688 پروٹین (اور ڈی این اے) کے سلسلے اور 5,000 سے زیادہ بائیو کیمیکل رد عمل شامل ہیں جو ان میٹابولائٹ اندراجات سے منسلک ہیں۔ ایچ ایم ڈی بی میں ہر میٹابولائٹ اندراج میں 110 سے زیادہ ڈیٹا فیلڈز ہوتے ہیں جن میں 2/3 معلومات کیمیائی/طبی ڈیٹا کے لیے وقف ہوتی ہیں اور باقی 1/3 انزیمیٹک یا بائیو کیمیکل ڈیٹا کے لیے وقف ہوتی ہیں۔ بہت سے ڈیٹا فیلڈز دوسرے ڈیٹا بیس (کے ای جی جی، میٹا سائیک، پب کیم، پروٹین ڈیٹا بینک، چیبی، سوئس-پروٹ، اور جین بینک) اور مختلف قسم کے ڈھانچے اور راستے دیکھنے والے ایپلٹس سے ہائپر لنکڈ ہیں۔ ایچ ایم ڈی بی ڈیٹا بیس وسیع متن، ترتیب، سپیکٹرم، کیمیائی ساخت اور متعلقہ استفسار کی تلاشوں کی حمایت کرتا ہے۔ یہ میٹابولومکس، کلینیکل کیمسٹری، بائیو مارکر کی دریافت اور جنرل بائیو کیمسٹری کی تعلیم میں بڑے پیمانے پر استعمال ہوتا رہا ہے۔ چار اضافی ڈیٹا بیس، ڈرگ بینک، ٹی تھری ڈی بی، ایس ایم پی ڈی بی اور فو ڈی بی بھی ڈیٹا بیس کے ایچ ایم ڈی بی سوٹ کا حصہ ہیں۔ ڈرگ بینک میں 1,600 منشیات اور منشیات کے میٹابولائٹس کے بارے میں مساوی معلومات ہوتی ہیں، ٹی 3 ڈی بی میں 3,100 عام زہریلے مادوں اور ماحولیاتی آلودگیوں کے بارے میں معلومات ہوتی ہیں، ایس ایم پی ڈی بی میں 700 انسانی میٹابولک اور بیماری کے راستوں کے لیے راستے کے خاکے ہوتے ہیں، جبکہ ایف او او ڈی بی میں 28,000 کھانے کے اجزاء اور کھانے کی اضافی اشیاء کے بارے میں مساوی معلومات ہوتی ہیں۔ ایچ ایم ڈی بی کا پہلا ورژن 1 جنوری 2007 کو جاری کیا گیا تھا، اس کے بعد اس کے بعد کے دو ورژن 1 جنوری 2009 (ورژن 2)، 1 اگست 2009 (ورژن 2)، 18 ستمبر 2012 (ورژن 3) اور 1 جنوری 2013 (ورژن 3)، 2017 (ورژن 4)، 2022 (ورژن 5) پر جاری کیے گئے۔ ایچ ایم ڈی بی کے ہر بڑے ورژن (ورژن 5 تک) کی تفصیلات ٹیبل 1 میں فراہم کی گئی ہیں۔ دائرہ کار اور رسائی ایچ ایم ڈی بی میں موجود تمام ڈیٹا غیر ملکیتی ہے یا غیر ملکیتی ماخذ سے حاصل کیا گیا ہے۔ یہ آزادانہ طور پر قابل رسائی ہے اور کسی کے لیے بھی دستیاب ہے۔ اس کے علاوہ، تقریبا ہر ڈیٹا آئٹم مکمل طور پر ٹریس ایبل ہے اور واضح طور پر اصل ماخذ کا حوالہ دیا گیا ہے۔ ایچ ایم ڈی بی ڈیٹا عوامی ویب انٹرفیس اور ڈاؤن لوڈ کے ذریعے دستیاب ہے۔ مزید دیکھیں کے ای جی جی ڈرگ بینک ایس ایم پی ڈی بی میٹا سائیک بووائن میٹابولوم ڈیٹا بیس میٹابولوم میٹابولومکس حیاتیاتی ڈیٹا بیس کی فہرست حوالہ جات میٹابولومک ڈیٹا بیس طبی ڈیٹا بیس حیاتیاتی ڈیٹا بیس فوڈ ڈیٹا بیس انسانی میٹابولائٹس