Sean Ekins
شان ایکنس ایک برطانوی فارماکولوجسٹ اور اے ڈی ایم ای/ٹکس، کمپیوٹیشنل ٹاکسیکولوجی اور کیمفارمیٹکس کے شعبوں میں ماہر ہیں جو کیمسٹری میں تعاون، کارپوریٹ کمیونیکیشنز فرم کولیبریشنز ان کمیونیکیشنز کا ایک ڈویژن ہے۔ وہ جان ولی اینڈ سنز کے لیے چار کتابوں اور ایک کتابی سیریز کے ایڈیٹر بھی ہیں۔ سوانحی شان ایکنس ایک سائنسی رہنما ہیں جن کا منشیات کی دریافت میں تیئیس سال سے زیادہ کا وسیع تجربہ ہے۔ وہ 2 مارچ 1970 کو انگلینڈ کے کلیتھرپس میں جان ایکنز اور ایلسی مئی ایکنز کے ہاں پیدا ہوئے تھے۔ وہ گریمزبی میں پلا بڑھا۔ ایکنس نے ایڈورڈ اسٹریٹ پرائمری اور مڈل اسکول کے بعد ہیولاک اسکول میں تعلیم حاصل کی۔ اس کے بعد ایکنز نے ناٹنگھم ٹرینٹ یونیورسٹی (سابقہ پولی ٹیکنک، 1988-1991) سے ایچ این ڈی سائنس اپلائیڈ بائیولوجی حاصل کی، اور 1991 میں برطانیہ کے فلمر میں دوا ساز کمپنی سرویر میں سینڈوچ سال (1989-1990) کے ساتھ گریجویشن کیا جہاں منشیات کی دریافت میں ان کی دلچسپی قائم ہوئی۔ اس کے بعد ایکنز نے ابرڈین یونیورسٹی میں کلینیکل فارماکولوجی (1991-1992) میں ایک مقالے کے ساتھ ایم ایس سی حاصل کیا جس کا عنوان تھا "سائٹوکروم P450 کے متعلقہ کرداروں پر قیاس آرائیاں اور S12363 کے میٹابولزم میں مونو آکسیجنیز پر مشتمل فلاوین" اس کے بعد انہوں نے 1996 میں ابرڈین یونیورسٹی میں کلینیکل فارماکولوجی میں پی ایچ ڈی حاصل کی، جس کی مالی اعانت سرویر نے کی، اور "عین مطابق کٹے ہوئے جگر کے ٹکڑوں میں زینو بائیوٹک میٹابولزم کی دیکھ بھال اور کریو پریزرویشن" کے عنوان سے ایک مقالہ لکھا۔ الگ تھلگ ہیپاٹوسائٹس کے متبادل ان وٹرو ماڈل کی تشخیص "۔ اپنی پی ایچ ڈی کے دوران انہوں نے جانوروں کے نمونوں کے استعمال کے متبادل کے طور پر کمپیوٹیشنل طور پر منشیات اور منشیات کے تعاملات کی پیش گوئی کرنے میں دلچسپی پیدا کی۔ 1996-1998 سے ایکنز نے ایلی للی اینڈ کمپنی لیبارٹریز میں پوسٹ ڈاک کے طور پر اپنی تحقیق جاری رکھی جس میں کم معروف CYP2B6 کی خصوصیت تھی اور اس انزائم پر کمپیوٹیشنل طریقوں کا اطلاق کیا۔ انہوں نے دیگر P450s کے لیے منشیات اور منشیات کے تعامل کے ڈیٹا اکٹھا کیا اور فارماکوفورز تیار کیے۔ انہوں نے ماڈلز کی جانچ کے لیے ٹیسٹ سیٹ بنائے، جو بالآخر شائع ہوئے۔ انہوں نے اس بارے میں بنیادی خیالات شائع کیے کہ کس طرح اس طرح کے ماڈلز کو منشیات اور منشیات کے تعاملات کی پیش گوئی کے لیے مرکبات کی لائبریریوں کو پروفائل کرنے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ 1998 کے آخر میں ایکنز نے فائزر میں شمولیت اختیار کی اور منشیات سے منشیات کے تعاملات اور اے ڈی ایم ای کی خصوصیات کی پیش گوئی میں اپنی دلچسپی جاری رکھی۔ 1999 میں وہ پیش گوئی کرنے والا اے ڈی ایم ای/ٹاک گروپ بنانے کے لیے للی چلے گئے۔ 1999 اور 2001 کے آخر کے درمیان انہوں نے پی-گلائکوپروٹین، پی ایکس آر اور انزائمز سمیت مختلف پروٹینوں کے لیے فارماکوفورز اور شماریاتی ماڈل تیار کیے۔ دسمبر 2001 میں انہوں نے ایک اسٹارٹ اپ کمپنی، کنکرنٹ فارماسیوٹیکلز (اب ویٹا فارماسیوٹیکلز) کے لیے ایسوسی ایٹ ڈائریکٹر، کمپیوٹیشنل ڈرگ ڈسکوری کے طور پر کام شروع کیا۔ وہ اے ڈی ایم ای/ٹاکس اور دلچسپی کے اہداف کے لیے کمپیوٹیشنل ماڈل تیار کرنے کے ذمہ دار تھے۔ اس دوران انہوں نے اے ڈی ایم ای/ٹاکس پروٹین کی پولی فارماکولوجی میں دلچسپی پیدا کی۔ 2004 میں انہوں نے جینیگو (جو اب تھامسن رائٹرز کی ملکیت ہے) میں کمپیوٹیشنل بائیولوجی کے نائب صدر کے طور پر شمولیت اختیار کی اور میٹا ڈرگ پروڈکٹ (پیٹنٹ زیر التواء) تیار کیا۔ 2005 میں انہوں نے اپنی ڈی ایس سی حاصل کی۔ ایبرڈین یونیورسٹی سے سائنس میں "انسانوں میں منشیات کے تعاملات کی پیش گوئی کے لیے کمپیوٹیشنل اور ان وٹرو ماڈل" کے عنوان سے ایک مقالہ کے ساتھ۔ 2006-2016 سے ایکنس نے کئی کمپنیوں کے لیے مشاورت کی بشمول باہمی تعاون پر مبنی منشیات کی دریافت کے لیے۔ 2011 میں ایکنز کے شریک بانی فینکس نیسٹ سنفلیپو سنڈروم کے علاج پر کام کر رہے ہیں۔ 2015 میں، ایکنز نے کولیبریشنز فارماسیوٹیکلز کی بنیاد رکھی، جو ایک نجی ملکیت والی کمپنی ہے جو متعدد نایاب اور متعدی بیماریوں کے جدید علاج پر تحقیق اور ترقی کرتی ہے۔ ابتدائی پری کلینیکل سے کلینیکل مرحلے کے اثاثوں کی شناخت اور ترجمہ کے لیے ماہرین تعلیم اور کمپنیوں کے ساتھ فارماسیوٹیکل شراکت داری۔ ایکنز نے منشیات کے ٹرانسپورٹرز کے لیے فارماکوفورز، امیونواسے کراس ری ایکٹیویٹی کی پیش گوئی کے لیے کیمینفارمیٹکس، نیوکلیئر ریسیپٹر-لیگینڈ شریک ارتقاء کا مطالعہ کرنے کے لیے ماڈل، پی ایکس آر ایگونسٹس اور مخالفین کے لیے کمپیوٹیشنل ماڈل کے ساتھ ساتھ بڑے ڈیٹا سیٹس اور کراؤڈ سورسنگ ڈیٹا کے تجزیے سمیت موضوعات پر آزاد تحقیق اور باہمی تعاون پر مبنی تحقیق بھی کی ہے۔ 2010 میں شان ایکنس ڈیٹا شیئرنگ اور دواسازی کے ڈیٹا کو مزید کھلے اشاعت کے کاغذات بنانے کے ارد گرد بنیادی کاغذات کے شریک مصنف تھے: 1. پری کلینیکل اے ڈی ایم ای/ٹکس ڈیٹا کو قبل از مسابقتی بنانے کی طویل مدتی ضرورت پر 2. فارماسیوٹیکل انڈسٹری میں کراؤڈ سورسنگ کا استعمال کیسے کیا جا سکتا ہے 3. سائنسی برادری کے ذریعہ فارماکو اکنامکس کے لیے کمپیوٹیشنل ماڈل کیسے شیئر کیے جا سکتے ہیں 4. کیمینفارمیٹکس میں اب بھی کن ٹولز کی ضرورت ہے اور ماڈل شیئرنگ کے طریقے کیسے اہم ہوں گے 5۔ دوا ساز کمپنیاں اوپن سورس مالیکیولر ڈسکریپٹرس اور الگورتھم کو کس طرح استعمال کر سکتی ہیں جو علمی اور نظر انداز شدہ بیماری برادری کے ساتھ کمپیوٹیشنل ماڈل کے اشتراک کو آسان بنائے گی۔ یہ کام اہم ہے کیونکہ یہ پری کلینیکل اور پوسٹ مارکیٹنگ ڈیٹا اور ماڈل دستیاب کرنے کے ساتھ ساتھ اس طرح کے طریقوں کی فزیبلٹی کا مظاہرہ کرنے کے لیے وسیع پیمانے پر نقطہ نظر بنانے کی پہلی نمایاں وکالت تھی۔ ایکنس نے کیم اسپائیڈر کے مشاورتی گروپ میں خدمات انجام دیں اور ڈیٹا بیس کو دواسازی کے ڈیٹا سیٹ کی ایک صف فراہم کی تاکہ اسے کمیونٹی کے لیے دستیاب کیا جا سکے۔ تپ دق اور ملیریا کی تحقیق باہمی تعاون سے منشیات کی دریافت کے لیے کام کرتے ہوئے، (بل اور میلنڈا گیٹس فاؤنڈیشن کی مالی اعانت سے) انہوں نے دواسازی کی صنعت کی طرف سے پبلک ڈومین کو فراہم کردہ اعداد و شمار کا تجزیہ کیا۔ خاص طور پر یہ 13,000 سے زیادہ مرکبات کے لیے گلیکسو اسمتھ کلائن سے ملیریا کی جانچ کا ڈیٹا تھا۔ اس کام کے نتیجے میں سائنسی برادری کو اس طرح کے اعداد و شمار کو فیس ویلیو پر قبول کرنے میں ایک اہم احتیاط فراہم کی گئی۔ ان اعداد و شمار کا موازنہ ملیریا اور تپ دق کے دیگر اعداد و شمار سے کیا گیا۔ اس کے علاوہ انہوں نے تپ دق کے اعداد و شمار کی بہت بڑی لائبریریوں کے تجزیے فراہم کیے جو اہم فزیکو کیمیکل خصوصیات کو اجاگر کرتے ہیں۔ ایکنز نے ٹی بی کی تحقیق میں فرق کو اجاگر کیا ہے، خاص طور پر کس طرح کیمینفارمیٹکس اور دیگر کمپیوٹیشنل ٹولز کو کارکردگی کو بہتر بنانے کے لیے مربوط کیا جا سکتا ہے اور اس کی مثالیں فراہم کی ہیں کہ ٹی بی کے خلاف فعال مرکبات کی اسکریننگ میں مدد کے لیے کمپیوٹیشنل طریقوں کو کس طرح استعمال کیا جا سکتا ہے۔ فروری 2011 میں ایکنز نے باہمی تعاون والی منشیات کی دریافت کے حصے کے طور پر ایم ایم 4 ٹی بی پروجیکٹ میں حصہ لینا شروع کیا۔ پروفیسر سٹیورٹ کول کی قیادت میں۔ سائنس موبائل ایپلی کیشنز ایکنز نے انٹونی جان ولیمز کے ساتھ مل کر ایک ویکی تیار کیا جسے سائنس موبائل ایپلی کیشنز کہا جاتا ہے جس کا آغاز 21 جون 2011 کو ہوا۔ ابتدائی طور پر یہ کیمسٹری ایپس (جمع کردہ پیپر کے لیے) اور پھر کیمسٹری کلاس روم میں سائنس کے لیے ایپس کو ٹریک کرنے کی خواہش سے پیدا ہوا۔ ڈیٹا بیس کا معیار اپنے متعلقہ بلاگز کا استعمال کرتے ہوئے، ایکنز اور انٹونی ولیمز نے این سی جی سی این پی سی براؤزر کے جاری ہونے کے چند دنوں کے اندر سائنسی برادری کو خبردار کر دیا۔ کہ مالیکیول ڈھانچے میں اہم غلطیاں تھیں۔ یہ مشاہدات بعد میں ڈرگ ڈسکوری ٹوڈے میں ادارتی طور پر شائع ہوئے۔ 2015 میں، شان نے تعاون فارماسیوٹیکلز کی بنیاد رکھی تاکہ تعاون اور منصوبوں کو آگے بڑھایا جا سکے جو مشین لرننگ کے طریقوں کا استعمال کرتے ہوئے لاگو ہوتے ہیں۔ ان منصوبوں میں نظر انداز شدہ بیماریاں جیسے تپ دق، چاگاس بیماری اور نایاب بیماریاں جیسے بیٹن بیماری، پٹ ہاپکنز سنڈروم اور دیگر شامل تھے۔ آج تک انہوں نے 5 نایاب یا نظر انداز شدہ بیماریوں میں 8 یتیم منشیات کے عہدے حاصل کیے ہیں، اور اپنے نتائج کو ہم مرتبہ جائزہ لینے والے جرائد میں بڑے پیمانے پر شائع کیا ہے۔ [ایس ای 1] کمپنی نے آج تک این آئی ایچ اور ڈی او ڈی گرانٹس سے 7.6 ملین ڈالر سے زیادہ کی فنڈنگ حاصل کی ہے۔ 2014 سے ایبولا ریسرچ شان نے 19 مضامین شائع کرتے ہوئے ایبولا منشیات کی دریافت پر کام کیا ہے۔ ان میں سے ایک ایبولا (یہاں) کے خلاف فعال مرکبات کی شناخت کے لیے مشین لرننگ ماڈل کا پہلا استعمال تھا۔ [SE2] اس نے وٹرو میں تین فعال مرکبات (ٹیلورون، کویناکرائن اور پائرناریڈائن) کی نشاندہی کی جن کا بعد میں ویو میں تجربہ کیا گیا اور چوہے میں فعال پایا گیا (آرٹیکلز 1,2,3) (حال ہی میں پائرناریڈائن کو گنی سور میں ایبولا کے خلاف ویو سرگرمی میں کچھ دکھایا گیا تھا۔ ان مالیکیولز نے ماربرگ کے خلاف بھی سرگرمی دکھائی ہے، اور ایبولا گلائکوپروٹین کو باندھتے ہیں۔ 2015 میں شان نے ایک مشین لرننگ ماڈل تیار کیا تاکہ T.Cruzi کے خلاف سرگرمی والے مالیکیولز کی پیش گوئی کی جا سکے، یہ پرجیوی ہے جو چاگاس بیماری کا سبب بنتا ہے۔ پائرناریڈائن ان کئی مالیکیولز میں سے ایک تھا جس کی شناخت ان وٹرو اور ان ویو سرگرمی کے ساتھ کی گئی تھی۔ سارس-کوو-2 ریسرچ 2020 میں ایبولا کے خلاف سرگرمی کے ساتھ شناخت کیے گئے تین مالیکیولز کا سارس-کوو-2 کے خلاف تجربہ کیا گیا اور یہ ممکنہ دلچسپی کے حامل تھے کیونکہ ٹیلورون کو ایم ای آر ایس کو روکنے کے لیے دکھایا گیا تھا اور یہ دوسرے وائرس کو روکنے کے لیے مشہور ہے۔ سافٹ ویئر پروڈکٹس کولیبریشنز فارماسیوٹیکلز انکارپوریٹڈ نے کئی سافٹ ویئر پروڈکٹس تیار کیے ہیں جن میں ایسی سنٹرل ®، میگا ٹکس®، میگا ٹرانس® اور میگا پریڈیکشن® شامل ہیں جو منشیات کی دریافت اور کمپیوٹیشنل اے ڈی ایم ای/ٹاکس کے لیے متعلقہ ماڈلز کو تیار کرنے کے لیے ڈیٹا کیوریشن اور مشین لرننگ کا فائدہ اٹھاتے ہیں۔ ایڈیٹرشپ ایکنس نے ولی کے لیے 4 کتابوں میں ترمیم یا شریک ترمیم کی ہے جن میں شامل ہیں: کمپیوٹر ایپلی کیشنز ان فارماسیوٹیکل ریسرچ اینڈ ڈویلپمنٹ (2006)، کمپیوٹیشنل ٹاکسیکولوجی: رسک اسسمنٹ فار فارماسیوٹیکل اینڈ انوائرمنٹل کیمیکلز (1007)، ڈرگ ایفیکیسی، سیفٹی، اینڈ بائیولوجیکس ڈسکوری (2009) اور کولیبریٹو کمپیوٹیشنل ٹیکنالوجیز فار بائیو میڈیکل ریسرچ (2011) تمام کتابوں کا کمپیوٹیشنل ٹیکنالوجیز اور فارماسیوٹیکل آر اینڈ ڈی کے لیے ان کی درخواست سے بنیادی تعلق ہے۔ ان کی سب سے حالیہ ترمیم شدہ کتاب کمپیوٹیشنل ٹاکسیکولوجی: رسک اسسمنٹ فار کیمیکلز ہے جو سابقہ کتاب کمپیوٹیشنل ٹاکسیکولوجی: رسک اسسمنٹ فار فارماسیوٹیکل اینڈ انوائرمنٹل کیمیکلز سے ملتی ہے۔ پیٹنٹ ایکنس چار جاری کردہ امریکی پیٹنٹ کے موجد ہیں، اور حوالہ جات بیرونی روابط شان ایکنس لنکڈ ان پروفائل کیمسٹری میں تعاون شان ایکنس پریزنٹیشنز شان ایکنس بلاگ انگریزی فارماکولوجسٹ برطانوی ٹاکسیکولوجسٹ 1970 پیدائشیں زندہ لوگ ابرڈین یونیورسٹی کے سابق طلباء