Serratus (virology)
سیراتس زمین کے وائروم کے کل جینیاتی تنوع کو بے نقاب کرنے کے لیے ایک بڑے پیمانے کا وائرو انفارمیٹکس پلیٹ فارم ہے۔ ناول کورونویرس کو بے نقاب کرنے کے مقصد کے ساتھ شروع ہونے والے اس منصوبے میں تمام آر این اے وائرسوں کو شامل کرنے کے لیے توسیع کی گئی، جو وائرل آر این اے پر منحصر آر این اے پولیمرس (آر ڈی آر پی) کو انکوڈ کرتے ہیں۔ 2020 کے آخر تک عوامی ڈیٹا بیس سے معلوم ہونے والے تقریبا 15,000 الگ الگ آر این اے وائرس کے سلسلے تھے، جن کی پیمائش الگ الگ آر ڈی آر پی (امینو ایسڈ کے سلسلے میں 10 فیصد سے زیادہ فرق) کی تعداد سے کی جاتی ہے۔ بڑے پیمانے پر کلاؤڈ کمپیوٹنگ کے لیے بہتر بائیو انفارمیٹکس ورک فلو کا استعمال کرتے ہوئے، تحقیقی ٹیم نے صرف 11 دنوں میں سیکوینس ریڈ آرکائیو (ایس آر اے) میں آزادانہ طور پر دستیاب 57 لاکھ سیکوینسنگ ڈیٹا سیٹس (خام ڈیٹا کے 20.4 پیٹا بائٹس) اور 23,900 امریکی ڈالر کی کمپیوٹنگ لاگت کا تجزیہ کیا۔ اس تجزیے سے 132,000 ناول وائرل آر ڈی آر پی حاصل ہوا، جو آر این اے وائرس کے معروف جینیاتی تنوع میں تقریبا شدت کے اضافے کی نمائندگی کرتا ہے۔ ڈیٹا بیس کے اندر، آر این اے وائرس کی درجہ بندی ان کے آر ڈی آر پی پام پرنٹ کے مطابق کی جاتی ہے، جو ایک قسم کا مالیکیولر بارکوڈ ہے۔ پام پرنٹ کو کمپیوٹیشنل طور پر موثر انڈیکس کے طور پر استعمال کیا جا سکتا ہے جس کی شناخت کے لیے ایس آر اے کی ترتیب میں ایک خاص آر این اے وائرس ہوتا ہے۔ اس طرح کا اشاریہ خام ترتیب کے ڈیٹا سیٹوں کے ہدف شدہ تجزیے کی اجازت دیتا ہے جس سے نئے آر این اے وائرس کی خصوصیت حاصل کی جا سکتی ہے۔ سیراتس کا تمام ڈیٹا آئی این ڈی ایس سی ریلیز پالیسی کے تحت آزادانہ طور پر دستیاب ہے۔ حوالہ جات بیرونی روابط پام آئی ڈی: آر ڈی آر پی سیکوینس سرچ ٹول سیراتس کوڈ ریپوزیٹری بائیو انفارمیٹکس کمپیوٹیشنل بائیولوجی وائرولوجی مطالعہ کے کمپیوٹیشنل شعبے