Obsolete models of DNA structure
تصدیق شدہ ڈی این اے ڈھانچوں کی مختلف اقسام کے علاوہ، مجوزہ ڈی این اے ماڈلز کی ایک رینج موجود ہے جن کی یا تو تردید کی گئی ہے، یا ثبوت کا فقدان ہے۔ ان میں سے کچھ ڈھانچے 1950 کی دہائی کے دوران ڈبل ہیلکس کے ڈھانچے کو حل کرنے سے پہلے تجویز کیے گئے تھے، سب سے مشہور طور پر لینس پالنگ نے۔ ڈی این اے کے غیر ہیلکل یا "شانہ بہ شانہ" ماڈل 1970 کی دہائی میں تجویز کیے گئے تھے تاکہ نقل کے دوران سرکلر ڈی این اے کروموسوم کی ٹوپولوجی کے مسائل کو حل کیا جا سکے (بعد میں ڈی این اے ٹوپولوجی میں ترمیم کرنے والے انزائموں کی دریافت کے ذریعے حل کیا گیا)۔ ایکس رے کرسٹلگرافی، حل این ایم آر، اور ایٹم فورس مائکروسکوپی (صرف ڈی این اے دونوں کے، اور ڈی این اے بائنڈنگ پروٹین سے منسلک) سے تجرباتی شواہد جمع ہونے کی وجہ سے بھی ان کو مسترد کر دیا گیا۔ اگرچہ مقامی یا عارضی غیر ڈوپلیکس ہیلیکل ڈھانچے موجود ہیں، لیکن غیر ہیلیکل ماڈل فی الحال مرکزی دھارے کی سائنسی برادری کے ذریعہ قبول نہیں کیے گئے ہیں۔ آخر میں، عصری فریج تھیوریز کا ایک مستقل مجموعہ موجود ہے جو غیر تعاون یافتہ ماڈلز کی ایک رینج کی تجویز کرتا ہے۔ واٹسن-کرک ڈھانچے سے پہلے ڈی این اے ڈبل ہیلکس 1953 میں (مزید تفصیلات کے ساتھ 1954 میں) دریافت کیا گیا تھا جو ڈی این اے کی ایکس رے ڈفریکشن امیجز (خاص طور پر فوٹو 51، ریمنڈ گوسلنگ اور روزالنڈ فرینکلن کے ذریعے لی گئی) کے ساتھ ساتھ بیس پیئرنگ کیمیائی اور بائیو کیمیکل معلومات پر مبنی تھا۔ اس سے پہلے، 1950 کی دہائی میں اکٹھا کیے جانے والے ایکس رے ڈیٹا سے پتہ چلتا تھا کہ ڈی این اے نے کسی طرح کی ہیلکس تشکیل دی تھی، لیکن ابھی تک یہ دریافت نہیں ہوا تھا کہ اس ہیلکس کی صحیح ساخت کیا تھی۔ اس لیے کئی مجوزہ ڈھانچے تھے جنہیں بعد میں ڈی این اے ڈوپلیکس کی حمایت کرنے والے ڈیٹا نے الٹ دیا۔ ان ابتدائی ماڈلز میں سب سے زیادہ مشہور 1953 میں لینس پالنگ اور رابرٹ کوری نے بنایا تھا جس میں انہوں نے ایک ٹرپل ہیلکس کی تجویز پیش کی تھی جس کے اندر فاسفیٹ ریڑھ کی ہڈی تھی، اور نیوکلیوٹائڈ بیس باہر کی طرف اشارہ کرتے تھے۔ اسی سال بروس فریزر نے بھی وسیع پیمانے پر اسی طرح کا لیکن تفصیلی ڈھانچہ تجویز کیا تھا۔ تاہم، واٹسن اور کرک نے جلد ہی ان ماڈلز کے ساتھ کئی مسائل کی نشاندہی کی: محور کے قریب منفی طور پر چارج شدہ فاسفیٹ ایک دوسرے کو پسپا کرتے ہیں، جس سے یہ سوال رہ جاتا ہے کہ تین زنجیروں کی ساخت ایک ساتھ کیسے رہتی ہے۔ ٹرپل ہیلکس ماڈل (خاص طور پر پالنگ اور کوری کے ماڈل) میں، وین ڈیر والز کے کچھ فاصلے بہت کم دکھائی دیتے ہیں۔ دریافت کیا گیا ابتدائی ڈبل ہیلکس ماڈل، جسے اب بی فارم ڈی این اے کہا جاتا ہے، خلیوں میں اب تک کی سب سے عام تشکیل ہے۔ دو اضافی نایاب ہیلیکل کنفارمیشنز جو قدرتی طور پر بھی پائی جاتی ہیں، 1970 کی دہائی میں شناخت کی گئیں: اے فارم ڈی این اے، اور زیڈ فارم ڈی این اے۔ غیر ہیلکل ڈھانچے کی تجاویز ٹوپو آئسومیرس کی دریافت سے پہلے یہاں تک کہ ایک بار ڈی این اے ڈوپلیکس ڈھانچہ حل ہونے کے بعد بھی، یہ ابتدائی طور پر ایک کھلا سوال تھا کہ آیا اس کی مجموعی ٹوپولوجی کی وضاحت کے لیے اضافی ڈی این اے ڈھانچے کی ضرورت ہے یا نہیں۔ ابتدائی طور پر اس بارے میں سوالات تھے کہ یہ ڈی این اے کی نقل کو کیسے متاثر کر سکتا ہے۔ 1963 میں، ای کولی کروموسوم کے آٹوڈیگرافس نے یہ ظاہر کیا کہ یہ ایک واحد سرکلر مالیکیول ہے جو نقل کے کانٹوں کی ایک جوڑی پر نقل کیا جاتا ہے جس پر دونوں نئے ڈی این اے اسٹرینڈز کی ترکیب کی جا رہی ہے۔ لہذا نقل کے بعد دو بیٹی کروموسوم ٹپوولوجیکل طور پر جڑے ہوں گے۔ نقل کے دوران دو منسلک ڈیٹر ڈی این اے اسٹرینڈز کی علیحدگی کے لیے یا تو ڈی این اے کو خالص صفر ہیلیکل موڑ کی ضرورت ہوتی ہے، یا اسٹرینڈز کو کاٹنے، عبور کرنے اور دوبارہ شامل کرنے کی ضرورت ہوتی ہے۔ یہ واضح تضادات تھے جن کو ابتدائی غیر ہیلیکل ماڈلز نے حل کرنے کی کوشش کی جب تک کہ 1970 میں ٹوپو آئسومیرس کی دریافت نے اس مسئلے کو حل نہیں کیا۔ 1960 اور 1970 کی دہائیوں میں، متعدد ڈھانچے کا قیاس کیا گیا تھا جو ڈی این اے کی لمبائی پر خالص صفر ہیلیکل موڑ دے گا، یا تو پوری طرح سیدھا ہو کر یا دائیں ہاتھ اور بائیں ہاتھ کے ہیلیکل موڑ کو بدل کر۔ مثال کے طور پر، 1969 میں، ایک لکیری ٹیٹریمر ڈھانچے کا قیاس کیا گیا تھا، اور 1976 میں، دائیں ہاتھ اور بائیں ہاتھ کے ہیلکس کے متبادل حصوں کے ساتھ ایک ڈھانچہ دو مختلف گروہوں کے ذریعہ آزادانہ طور پر تجویز کیا گیا تھا۔ متبادل موڑ والے ماڈل کو ابتدائی طور پر ہر آدھے موڑ پر ہیلیکیٹی کو تبدیل کرنے کے ساتھ پیش کیا گیا تھا، لیکن بعد میں ہر ہیلیکل سمت کے لمبے حصوں کو بعد میں تجویز کیا گیا۔ تاہم، ان ماڈلز کو تجرباتی حمایت کی کمی کا سامنا کرنا پڑا۔ ٹورسنل تناؤ کے تحت، ایک زیڈ-ڈی این اے ڈھانچہ بی-فارم ڈی این اے کے مخالف موڑ کے ساتھ بن سکتا ہے، لیکن یہ سیلولر ماحول میں نایاب ہے۔ ٹوپو آئسومیرسز اور گائریسز، انزائموں کی دریافت جو سرکلر نیوکلک ایسڈ کی منسلک تعداد کو تبدیل کر سکتے ہیں اور اس طرح بیکٹیریل کروموسوم کی نقل کو "کھول سکتے ہیں" اور "ریونڈ" کر سکتے ہیں، نے بی-فارم ڈی این اے ہیلیکل ڈھانچے پر ٹپوولوجیکل اعتراضات کو حل کیا۔ درحقیقت، ان ٹوپولوجی کو تبدیل کرنے والے انزائموں کی عدم موجودگی میں، چھوٹے سرکلر وائرل اور پلاسمڈ ڈی این اے لازم و ملزوم معاون ڈھانچے ہیں جن کے تار ٹوپولوجیکل طور پر ایک ساتھ بند ہوتے ہیں۔ اس لیے غیر ہیلیکل ڈی این اے تجاویز کو مرکزی دھارے کی سائنس سے ہٹا دیا گیا ہے۔ ہیلیکل ڈھانچے کی تصدیق ابتدائی طور پر، اس بارے میں سوالات تھے کہ آیا حل شدہ ڈی این اے ڈھانچے استعمال شدہ ایکس رے کرسٹلگرافی تکنیک کے نوادرات تھے۔ تاہم، ڈی این اے کی ساخت کی بعد میں جیل الیکٹروفوریٹک طریقوں کے ذریعے حل میں تصدیق کی گئی اور بعد میں حل این ایم آر اور اے ایف ایم کے ذریعے اس بات کی نشاندہی کی گئی کہ کرسٹلگرافی کے عمل نے اسے مسخ نہیں کیا۔ نیوکلیوسومز، ہیلیکیسز، اور متعدد دیگر ڈی این اے بائنڈنگ پروٹینوں کے ساتھ کمپلیکس میں ڈی این اے کی ساخت نے بھی ویو میں اس کی حیاتیاتی مطابقت کی حمایت کی۔ حوالہ جات ڈی این اے ہیلسیس بائیو مالیکیولز ساختی بائیو انفارمیٹکس ویڈیو کلپس پر مشتمل مضامین متروک سائنسی نظریات