HYPHY (software)
HYPHY () ایک مفت ملٹی پلیٹ فارم (میک، ونڈوز اور UNIX) کمپیوٹیشنل فائیلوجنیٹکس سافٹ ویئر پیکیج ہے جس کا مقصد جینیاتی ترتیب کے ڈیٹا کا زیادہ سے زیادہ امکانات کا تجزیہ کرنا ہے اور مختلف شماریاتی مفروضوں کی جانچ کرنے کے لیے ٹولز سے لیس ہے۔ HYPHY نام "PHYlogenies کا استعمال کرتے ہوئے ہائپوتھیسس ٹیسٹنگ" کا مخفف ہے۔ مارچ 2018 تک، تقریبا 2,000 ہم مرتبہ جائزہ لینے والے سائنسی جریدے کے مضامین ہائپی کا حوالہ دیتے ہیں۔ اہم خصوصیات ہائپی پہلے سے طے شدہ معیاری ماڈلز یا ارتقاء کے صارف سے متعین ماڈلز کا استعمال کرتے ہوئے نیوکلیوٹائڈ، پروٹین اور کوڈن کے سلسلے کے تجزیے کی حمایت کرتی ہے۔ پیکیج بڑے اور پیچیدہ تجزیے ترتیب دینے اور نتائج پر کارروائی کرنے کے لیے گرافیکل یوزر انٹرفیس کے ساتھ ساتھ بیچ زبان کے ذریعے تعامل کی حمایت کرتا ہے۔ ہائ فائی میں انفرادی امینو ایسڈ سائٹس اور/یا نسلوں پر انکولی ارتقاء کا پتہ لگانے کے لیے ورسٹائل طریقوں کا مجموعہ شامل ہے، بشمول نیلسن-یانگ پی اے ایم ایل اور سوزوکی-گوجوبوری طریقوں اور بہت سے دوسرے طریقوں کی عمومی کاری۔ ہائپائی کی ترقی 1997 میں شروع ہوئی، 2000 میں پہلی عوامی ریلیز اور دسمبر 2020 تک کا تازہ ترین ورژن 2.5 تھا۔ سافٹ ویئر/کوڈ کی دستیابی اور لائسنس HYPHY کو ایم آئی ٹی لائسنس کے تحت جاری کردہ سورس کوڈ کے ساتھ فری ویئر کے طور پر تقسیم کیا جاتا ہے۔ میک او ایس ایکس اور ونڈوز کے لیے مرتب کردہ بائنری ڈاؤن لوڈ کے لیے دستیاب ہیں۔ سورس کوڈ دستیاب ہے تاکہ صارفین ہائی فائی ایپلی کیشن کو پوزیکس سسٹمز پر مرتب کر سکیں۔ انکولی ارتقاء کا پتہ لگانے کے لیے ہائپی طریقوں کا ایک ذیلی مجموعہ بھی ٹیمپل یونیورسٹی میں ہائپی ٹیم کے ذریعے ڈیٹا منکی کلسٹر پر دستیاب کرایا گیا ہے۔ نوٹ بیرونی لنکس: HYPHY ہوم پیج: ڈیٹا منکی سرور، جو مختلف قسم کے HYPHY ٹولز (بغیر کسی قیمت کے) کی حمایت کرتا ہے۔ : HYPHY/DataMonkey فائلوجینیٹکس سافٹ ویئر کی حمایت کرتا ہے