Influenza A segment 7 splice site
انفلوئنزا اے وائرس سیگمنٹ 7 پری-ایم آر این اے کی 3 'اسپلیس سائٹ دو مختلف قسم کے آر این اے ڈھانچے کو اپنا سکتی ہے: ایک سیوڈوکناٹ اور ایک ہیئر پن۔ یہ کنفارمیشنل سوئچ آر این اے متبادل اسپلیسنگ میں ایک کردار ادا کرنے کے لیے تجویز کیا گیا ہے اور اس پری-ایم آر این اے کے اسپلیسنگ سے پیدا ہونے والے ایم 1 اور ایم 2 پروٹین کی پیداوار کو متاثر کر سکتا ہے۔ جائزہ یہ ساختہ خطہ سب سے پہلے انفلوئنزا اے کے بائیو انفارمیٹکس سروے میں دریافت کیا گیا تھا جو تھرموڈینامک فولڈنگ فری انرجی اور امینو ایسڈ کوڈن دبانے پر مبنی تھا۔ ثانوی ڈھانچے کے ابتدائی ماڈل نیوکلک ایسڈ ڈھانچے کی پیش گوئی کے لیے کمپیوٹیشنل طریقوں پر مبنی تھے۔ ہیئر پن کی تشکیل کی پیش گوئی آر این اے کیلیفولڈ کا استعمال کرتے ہوئے کی گئی تھی، جبکہ ڈاٹ ناٹ کے ساتھ سیڈوک ناٹ کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ سیگمنٹ 7 ایم 1 پروٹین اور چھوٹے ایم 2 پروٹون چینل پروٹین کو انکوڈ کرتا ہے، جو آر این اے اسپلیسنگ کے ذریعے تیار ہوتا ہے۔ ایم 2 پروٹین وائرس کے لیے اہم ہے: یہ آئن چینلز بناتا ہے جو وائرین کی تیزابیت کی اجازت دیتا ہے جو غیر کوٹنگ میں متحرک ہوتا ہے۔ ایم 2 تیار کرنے کے لیے استعمال ہونے والے 3 'اسپلیس سائٹ کے علاقے کی ساخت کے حساس کیمیکلز اور انزائمز کے ساتھ تجرباتی طور پر جانچ کی گئی اور یہ پایا گیا کہ وہ محلول میں ہیئر پن اور سیوڈوکناٹ دونوں کی تشکیل کو اپناتا ہے۔ ہر کنفارمیشن اہم اسپلیسنگ ریگولیٹری سائٹس کو مختلف ساختی ماحول میں رکھتی ہے، جس میں سیگمنٹ 7 ٹرانسکرپٹ کے اسپلیسنگ کے ماڈیولیشن کے مضمرات ہوتے ہیں۔ مثال کے طور پر، اسپلیس سائٹ، پولی پیریمائڈائن ٹریکٹ، برانچ پوائنٹ، اور اے ایس ایف/ایس ایف 2 ایکسونک بڑھانے والی بائنڈنگ سائٹس سے توقع کی جاتی ہے کہ وہ ہیئر پن کی تشکیل میں زیادہ قابل رسائی ہوں گی اور سڈوکناٹ میں کم قابل رسائی ہوں گی (شکل 1)۔ سڈوکناٹ اور ہیئر پن کے درمیان توازن کو منتقل کرنے سے بالترتیب ایم 2 اسپلیسنگ کو کم کرنا یا بڑھانا ممکن ہو سکتا ہے۔ ممکنہ طور پر مشترکہ میکانزم یہ تخیلاتی میکانزم وہ بھی ہو سکتا ہے جو اسپلیسڈ انفلوئنزا ٹرانسکرپٹ کے لیے عام ہے۔ اسی طرح رکھی گئی، لیکن ساختی طور پر الگ، انفلوئنزا وائرس سڈوکناٹ/ہیئر پن کو بھی سیگمنٹ 8 ٹرانسکرپٹس کی 3 'اسپلیس سائٹ میں بیان کیا گیا تھا، جو این پی کو انکوڈ کرتی ہے اور، اسپلیسنگ کے ذریعے، این ای پی پروٹین۔ یہ ڈھانچے منظم آر این اے کے ایک خاندان کی تشکیل کرتے ہیں جو انفلوئنزا اے اور انفلوئنزا بی میزبان پرجاتیوں کے مخصوص ساختی استحکام کے درمیان مشترک ہیں۔ انفلوئنزا اے کے حصے 7 میں 3 'اسپلیس سائٹ ڈھانچے ساختی استحکام میں میزبان پرجاتیوں کے مخصوص رجحانات کو ظاہر کرتے ہیں۔ ساختی طور پر مستحکم تغیرات کی سب سے بڑی تعداد پرندوں کے مخصوص تناؤ میں ہوتی ہے، جبکہ سب سے زیادہ ساختی طور پر غیر مستحکم تغیرات انسانی تناؤ میں ہوتے ہیں: خنزیر درمیان میں گرتے ہیں۔ استحکام میں یہ عمومی رجحان: پرندے، خنزیر، انسان، تقریبا اس درجہ حرارت کی پیروی کرتے ہیں جس پر انفلوئنزا وائرس ہر میزبان نوع کے اندر دوبارہ پیدا ہوتا ہے۔ پرندوں کی آنت اور خنزیر اور انسانی پھیپھڑوں کا درجہ حرارت بالترتیب 42، 37 اور 34 ڈگری سیلسیس ہوتا ہے۔ یہ مشاہدہ انفلوئنزا اے کوڈنگ کے سلسلے میں عالمی رجحان کی ایک مقامی مثال ہے، جہاں پرندے، خنزیر اور انسانی تناؤ مختلف استحکام ظاہر کرتے ہیں۔ ایسا ہو سکتا ہے کہ آر این اے کا ڈھانچہ میزبانوں میں زیادہ مستحکم ہو جہاں فعال ڈھانچے یا اہم ساختی توازن کو برقرار رکھنے کے لیے نقل کا درجہ حرارت زیادہ ہو۔ سیڈوکناٹ نان کوڈنگ آر این اے نیوکلک ایسڈ سیکنڈری ڈھانچہ حوالہ جات بیرونی روابط سیڈو بیس + +-آر این اے سیڈوکناٹ سیکنڈری ڈھانچے کا ڈیٹا بیس ٹرنر لیب سی آئی ایس-ریگولیٹری آر این اے عناصر سالماتی جینیات انفلوئنزا