FAM83A
پروٹین ایف اے ایم 83 اے (خاندان کا رکن جس کی ترتیب مماثلت 83 ہے) جسے ٹیومر اینٹیجن بی جے-ٹی ایس اے-9 بھی کہا جاتا ہے ایک پروٹین ہے جسے انسانوں میں ایف اے ایم 83 اے جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ اس پروٹین میں نامعلوم فنکشن 1669 (DUF1669) کا ایک ڈومین ہونے کی پیش گوئی کی گئی ہے، جو اس پروٹین کو PLDC _ SuperFamy میں رکھتا ہے۔ اسے پھیپھڑوں، پروسٹیٹ اور مثانے کے کینسر میں ممکنہ بائیو مارکر ہونے سے جوڑا گیا ہے۔ جین ایف اے ایم 83 اے کروموسوم 8، لوکس q24.13 پر واقع ہے، اور 27,566 بیس جوڑوں پر پھیلا ہوا ہے۔ ایک پروموٹر تقریبا 4,000 بیس جوڑے اوپر کی طرف ہے جیسا کہ ٹول ایل ڈوراڈو بائی جینومیٹکس نے پیش گوئی کی ہے۔ کروموسوم کے اس حصے میں حذف ہونے، بشمول ایف اے ایم 83 اے جین، کے نتیجے میں اکثر لینجر گیڈیون سنڈروم ہوتا ہے۔ ایم آر این اے ایف اے ایم 83 اے ایم آر این اے کی 10 مختلف اسپلیس شکلیں ہیں، جس میں ٹرانسکرپٹ ورژن 1 اس مضمون کا موضوع ہے۔ یہ ایم آر این اے تقریبا 2,900 بیس جوڑوں پر مشتمل ہے۔ اس میں نامعلوم فنکشن 1669 (DUF1669) کا ڈومین ہے، اور یہ PLDC _ SF سپر فیملی کا رکن ہے۔ اسے ایف اے ایم 83 اے اور دیگر این-ٹرمینس فاسفولیپیس ڈی جیسے ڈومینز کے درمیان انتہائی مماثل ترتیب کی بنیاد پر اس سپر فیملی میں رکھا گیا ہے۔ تاہم، اس میں فنکشنل ہسٹائڈائن غائب ہے اور اس وجہ سے صرف اسی طرح کی ساخت کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ چار ایکسون اس ایم آر این اے پر مشتمل ہوتے ہیں۔ پیش گوئیاں ایم آر این اے کے غیر ترجمہ شدہ علاقوں میں کئی ممکنہ آر این اے اسٹیم لوپ کی تشکیل کو ظاہر کرتی ہیں۔ پروٹین ایف اے ایم 83 اے جین ایف اے ایم 83 اے پروٹین آئسوفارم اے کے لیے انکوڈ کرتا ہے۔ یہ پروٹین لمبائی میں 434 امینو ایسڈ ہے، اور اس کا وزن تقریبا 45 کلو ڈالٹن ہے۔ اگرچہ ساخت کی تصدیق نہیں ہوئی ہے، لیکن جی او آر 4 کا استعمال کرتے ہوئے اس کی پیش گوئی کی گئی ہے کہ اس میں چار الفا ہیلیکس اور پانچ بیٹا شیٹس ہوں گے، جس میں 8.964 کا آئسو الیکٹرک پوائنٹ ہوگا، ایسا لگتا ہے کہ کوئی سگنل پیپٹائڈ نہیں ہے اور یہ ٹرانس میمبرین پروٹین نہیں ہے۔ سی بی ایل اے ایس ٹی کا استعمال کرتے ہوئے، پروٹین 3 ایچ 0 جی کے ساتھ ایک مشترکہ ترتیب کا اشتراک کرنے کا مشاہدہ کیا گیا، تاہم، ایف اے ایم 83 اے کے پیش گوئی شدہ فعال علاقے میں نہیں۔ یہ اب بھی اس پروٹین کے ممکنہ جزوی ڈھانچے کے بارے میں قیمتی معلومات فراہم کر سکتا ہے۔ اظہار ایف اے ایم 83 اے کا اظہار انسانی جسم کے بہت سے مختلف علاقوں میں اور بہت مختلف سطحوں پر کیا جاتا ہے۔ ای ایس ٹی کے اعداد و شمار سے پتہ چلتا ہے کہ یہ جین بنیادی طور پر بالغوں میں ظاہر ہوتا ہے۔ یہ پروسٹیٹ، پھیپھڑوں اور غذائی نالی میں دیگر بلند تاثرات کے ساتھ منہ اور گردے میں نمایاں سطح ظاہر کرتا ہے۔ یہ عام سطح سر اور گردن کے ٹیومر، پھیپھڑوں کے ٹیومر، پروسٹیٹ کینسر، اور مثانے کے کارسنوما میں اور بھی زیادہ بلند ہوتی ہیں۔ مائیکرو ارے اظہار کے اعداد و شمار بھی مختلف ماحولیاتی حالات، خاص طور پر چڑچڑاپن کو ظاہر کرتے ہیں۔ اس طرح کی پریشانیاں سگریٹ کا دھواں ہو سکتی ہیں، جہاں ایف اے ایم 83 اے کو 24 گھنٹے کی نمائش کے بعد اظہار میں اضافہ کرنے کے لیے دکھایا گیا ہے، اور برونکیئل اپیتھیلیل خلیوں پر گھریلو دھول کے مائٹ کا نچوڑ، جہاں ایف اے ایم 83 اے کا اظہار بھی نمائش کے بعد بڑھتا ہے۔ جب ٹرانسکرپشن فیکٹر 2 (اے ٹی ایف 2) کو فعال کرنا ناک آؤٹ کیا جاتا ہے تو ایف اے ایم 83 اے کم اظہار کو ظاہر کرتا ہے۔ چونکہ اے ٹی ایف 2 کے پروموٹر خطے میں پابند ہونے کی پیش گوئی نہیں کی گئی تھی، اس سے پتہ چلتا ہے کہ ایف اے ایم 83 اے اور اے ٹی ایف 2 کے درمیان بالواسطہ تعلق ہے۔ ای ٹی ایف 2 کے ساتھ بالواسطہ تعلق کے ساتھ ساتھ چڑچڑاپن اور الرجین کے اظہار میں اضافے کے ساتھ، اس سے پتہ چلتا ہے کہ ایف اے ایم 83 اے سگنلنگ کے راستے میں ہو سکتا ہے۔ کینسر متعدد مطالعات ہیں جو FAM83A کے حد سے زیادہ اظہار کو پھیپھڑوں، پروسٹیٹ اور مثانے کے کینسر سے جوڑتے ہیں۔ محققین کا خیال ہے کہ یہ جین ان کینسروں، خاص طور پر پھیپھڑوں کے کینسر کا جلد پتہ لگانے کے لیے ایک اچھا امیدوار بن سکتا ہے۔ یہ معلوم نہیں ہے کہ ایف اے ایم 83 اے کو کیوں یا کیسے ریگولیٹ کیا جاتا ہے۔ مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ آرسینک ریگولیشن کا سبب بننے والے پروموٹر کو ایسیٹیلیٹ کر سکتا ہے، جس سے پتہ چلتا ہے کہ یہ کینسر میں یہ جین کس طرح غیر منظم ہو جاتا ہے اس سے ملتا جلتا طریقہ کار ہو سکتا ہے۔ پروٹین کے تعامل ایف اے ایم 83 اے کو اسٹرینگ ٹول کے ذریعے تالو، پھیپھڑوں اور ناک کے اپیتھیلیم کارسنوما سے وابستہ پروٹین (پی ایل یو این سی) کے ساتھ تعامل کرتے ہوئے دکھایا گیا ہے۔ جمع کی گئی یہ معلومات کینسر سے نمٹنے والی ٹیکسٹ مائننگ معلومات سے حاصل ہوئی ہیں۔ ہومیولوجی FAM83A ایک نسبتا نیا جین معلوم ہوتا ہے، جس میں BLAST اور BLAT صرف ہڈی والی مچھلیوں کے ذریعے آرتھولوجی کو ظاہر کرتے ہیں۔ یہ اپنے رشتہ داروں کے ذریعے انتہائی محفوظ ہے۔ DUF1669 ڈومین پروٹین کا سب سے زیادہ محفوظ علاقہ ہے، جس کے باہر کے علاقے زیادہ متغیر ہیں۔ ذیل میں آرتھولوگس کا ایک جدول ہے، جس میں کہا گیا ہے کہ یہ ایک جامع فہرست نہیں ہے: حوالہ جات