Genomespace
جینوم اسپیس جینومکس سافٹ ویئر ٹولز اور ایپلی کیشنز کے لیے ایک ماحول ہے۔ یہ صارفین کو ویب ایپلی کیشنز اور ڈیسک ٹاپ ٹولز سمیت متعدد متنوع ٹولز پر مشتمل اپنے تجزیے کے ورک فلوز کو منظم کرنے میں مدد کرتا ہے اور خودکار شکل میں تبدیلی کے ذریعے ٹولز کے درمیان ڈیٹا کی منتقلی کو آسان بناتا ہے۔ تجزیہ مقامی یا کلاؤڈ پر مبنی اسٹورز سے ڈیٹا استعمال کر سکتے ہیں۔ جینوم اسپیس صارفین کے لیے ویب پر مبنی یوزر انٹرفیس (UI) پر مشتمل ہوتا ہے، اور ڈویلپرز کے لیے جینوم اسپیس کے ساتھ اپنی ایپلی کیشنز کو مربوط کرنے کے لیے ایک نمائندہ اسٹیٹ ٹرانسفر (RESTful) ایپلیکیشن پروگرامنگ انٹرفیس (API) اور جاوا پر مبنی کلائنٹ ڈویلپمنٹ کٹ (CDK) دونوں پر مشتمل ہوتا ہے۔ جینوم اسپیس ٹولز جینوم اسپیس جینومکس تجزیہ کے لیے کئی ٹولز اور ڈیٹا ذرائع سے منسلک ہے: سائٹوسکیپ، گلیکسی، جین پیٹرن، جینومیکا، جی ورک بینچ، انسلیکو ڈی بی، انٹیگریٹیو جینومکس ویوئر (آئی جی وی)، اور یو سی ایس سی جینوم براؤزر۔ یہ پروگرام مختلف قسم کے جینومک تجزیے فراہم کرتے ہیں، جن میں نیٹ ورک تجزیہ اور تصور، ترتیب کا تجزیہ، مکمل جینوم تجزیہ، عمومی شماریاتی طریقے، جین کے اظہار کا تجزیہ، پروٹومکس، فلو سائٹومیٹری، اگلی نسل کے ترتیب کا تجزیہ، اور جینومک ڈیٹا سیٹ شامل ہیں۔ دیگر جینومکس سافٹ ویئر کے ڈویلپر اپنے ٹولز کو شامل کرنے کے لیے جینوم اسپیس API کا استعمال کر سکتے ہیں۔ تعاون کار جینوم اسپیس پروجیکٹ براڈ انسٹی ٹیوٹ میں میسیروف اور ریجیو لیبارٹریوں کا تعاون ہے۔ اسٹینفورڈ یونیورسٹی میں چانگ لیبارٹری ؛ یونیورسٹی آف کیلیفورنیا، سان ڈیاگو میں آئیڈیکر لیبارٹری ؛ پنسلوانیا اسٹیٹ یونیورسٹی میں نیکروٹینکو لیبارٹری ؛ ویزمین انسٹی ٹیوٹ آف سائنس میں سیگل لیبارٹری ؛ اور یونیورسٹی آف کیلیفورنیا، سانتا کروز میں ہاؤسلر اور کینٹ لیبارٹریز۔ جینوم اسپیس کو نیشنل ہیومن جینوم ریسرچ انسٹی ٹیوٹ آف نیشنل انسٹی ٹیوٹ آف ہیلتھ کی طرف سے مالی اعانت فراہم کی جاتی ہے۔ حوالہ جات بیرونی روابط مفت بائیو انفارمیٹکس سافٹ ویئر