METTL26
METTL26، جسے پہلے C16orf13 نامزد کیا گیا تھا، میتھائل ٹرانسفرس لائک 26 کے لیے ایک پروٹین کوڈنگ جین ہے، جسے JFP2 بھی کہا جاتا ہے۔ اگرچہ اس جین کا کام معلوم نہیں ہے، لیکن مختلف اعداد و شمار سے پتہ چلتا ہے کہ یہ کینسر کے مختلف بافتوں میں اعلی سطح پر ظاہر ہوتا ہے۔ اس جین کے غیر اظہار کو انسانوں میں بیماری کے نتائج سے بھی جوڑا گیا ہے۔ جین METTL26 انسانوں میں کروموسوم 16 کے چھوٹے بازو پر تیرہویں کھلے پڑھنے کے فریم میں واقع ہے۔ اس جین کی نقل کی پانچ قسمیں ہیں، جن کے نام 1، 2، 3، 4، اور 7 ہیں۔ سب سے طویل سی ڈی این اے ٹرانسکرپٹ (ٹرانسکرپٹ ورژن 1) میں 854 بیس جوڑے ہوتے ہیں۔ یہ نقل چھ ایکسون پر مشتمل ہے، یہ سب پروٹین میں شامل بڑے سپر فیملی، میتھائل ٹرانسفرسز سپر فیملی میں حصہ ڈالتے ہیں۔ اس جین کی بنیادی نقل 1,919 بیس جوڑے لمبی ہے۔ انواع کی تقسیم ڈاٹلیٹ پروگرام کا استعمال کرتے ہوئے، انسانی جین کا اس کے چمپینزی آرتھولوگ سے موازنہ کرتے ہوئے ایک ڈاٹ پلاٹ بنایا گیا تھا۔ پلاٹ جین کے آغاز اور اختتام پر ترتیب کے تحفظ کی نشاندہی کرتا ہے، جو 5 'اور 3' غیر ترجمہ شدہ علاقوں میں تحفظ اور مماثلت کی تجویز کرتا ہے۔ 5 'یو ٹی آر اور 3' یو ٹی آر میں یہ ترتیب مماثلت ماضی کے ممالیہ پرجاتیوں میں توسیع نہیں کرتی ہے، اور انسانی جین کے ڈاٹ پلاٹ میں دور سے متعلق پرجاتیوں، جیسے زینوپس ٹراپیکلس کے ساتھ تقریبا کوئی مماثلت نہیں دکھاتی ہے۔ ایس ڈی ایس سی بائیولوجی ورک بینچ کا استعمال کرتے ہوئے کی جانے والی ایک سے زیادہ ترتیب کی صف بندی جین کے اوپری حصے میں پرائمیٹس کے مقابلے میں زیادہ دور سے متعلق پرجاتیوں کے درمیان بہت کم ترتیب کی مماثلت ظاہر کرتی ہے۔ انسانی C16orf13 جین میں ٹرانسکرپشن سائٹ کے آغاز کے قریب، پرائمیٹس کے درمیان اعلی تحفظ موجود ہے جس میں اپ اسٹریم ڈیٹا دستیاب تھا، خاص طور پر انسان، اورنگوٹان، اور ریسس بندر C16orf13 جین آرتھولوگس۔ پریمیٹس کے درمیان اعلی ترتیب کی مماثلت پروموٹر ریجن، 5 'یو ٹی آر، اور سی 16ورف 13 جین میں واضح ہے۔ نیچے دیا گیا گراف C16orf13 ٹرانسکرپٹ ورژن 1 کے لیے منتخب جین آرتھولوگس کو دکھاتا ہے۔ یہ اعداد و شمار این سی بی آئی بلاسٹ سے جمع کیے گئے ہیں۔ ٹشو کی تقسیم این سی بی آئی یونی جین کے انسانی اظہار پروفائل سے پتہ چلتا ہے کہ اس جین کا جسم کے بہت سے مختلف بافتوں میں وسیع پیمانے پر اظہار ہوتا ہے۔ اس اظہار پروفائل سے پتہ چلتا ہے کہ یہ جین ایک "ہاؤس کیپنگ جین" ہے، جو ٹشو سے قطع نظر تمام خلیوں میں اہم اثرات رکھتا ہے۔ اظہار کی سب سے زیادہ سطح ایڈرینل گلینڈ، پھیپھڑوں اور پیرا تھائیرائڈ میں دکھائی دیتی ہے۔ ان سب سے اونچے تین مقامات کے علاوہ بہت سی اضافی جگہیں ہیں جہاں جین کا اظہار اعلی سطح پر ہوتا ہے۔ ایسا لگتا ہے کہ ان چند بافتوں میں کوئی حقیقی مماثلت نہیں ہے جہاں جین کا اظہار نہیں ہوتا ہے۔ ایسا لگتا ہے کہ یہ اظہار ڈیٹا مخصوص فنکشن میں کوئی سراغ نہیں دیتا، سوائے اس کے کہ یہ جین تقریبا تمام خلیوں کے "ہاؤس کیپنگ" فنکشن میں شامل ہے۔ C16orf13 جین کروموسوم 16 کے اختتام کے قریب واقع ہے، ممکنہ طور پر حذف شدہ تغیرات کے تابع ہے۔ C16orf13 جین کے آس پاس کے جینوں میں دائیں طرف فرضی پروٹین LOC100287175 اور LOC100138285 اور بائیں طرف RAB40C اور WFIKN1 شامل ہیں۔ یہ جین ایل او سی 100138285 کے ساتھ مائنس اسٹرینڈ پر واقع ہے۔ آس پاس کے دوسرے جین پلس اسٹرینڈ پر مخالف سمت میں مبنی ہوتے ہیں۔ جین کے پڑوس کی نمائندگی ذیل میں اسکیم میں کی گئی ہے، اصل میں این سی بی آئی جین سے۔ پروٹین وہ پروٹین جس کے لیے یہ جین کوڈ کرتا ہے اسے یو پی ایف 0585 کے نام سے جانا جاتا ہے، جہاں یو پی ایف نامعلوم پروٹین فنکشن کا اشارہ دیتا ہے۔ اس پروٹین کی پانچ آئسوفارم ہیں، جو جین کی پانچ اسپلیس اقسام سے مطابقت رکھتی ہیں۔ آئسوفارم کو a، b، c، d، اور g کا نام دیا گیا ہے جیسا کہ اوپر بتایا گیا ہے، اس امینو ایسڈ کی ترتیب کی BLAST تلاش میں پایا جانے والا محفوظ ڈومین ایک میتھائل ٹرانسفرس سپر فیملی ہے۔ تحفظ ایس ڈی ایس سی بائیولوجی ورک بینچ میں پروٹین ٹولز کا استعمال کرتے ہوئے کی جانے والی ایک سے زیادہ ترتیب کی صف بندی دور سے متعلق پروٹین آرتھولوگس کے درمیان کچھ ترتیب کی مماثلت کو ظاہر کرتی ہے، جہاں تک کہ آرکیا تک، اس خطے میں جو میتھائل ٹرانسفرس ڈومین کے کوڈ کے لیے جانا جاتا ہے۔ پروٹین کا میتھائل ٹرانسفرس سپر فیملی حصہ انواع کی متنوع صف میں بہت سے قریب سے متعلق آرتھولوگس پروٹینوں میں زیادہ محفوظ نظر آتا ہے۔ انواع کی تقسیم C16orf13 میں بہت سی انواع میں ہومولوگس ہیں، جن میں فنگی اور پودوں میں دور دراز کے آرتھولوگس بھی شامل ہیں۔ اس پروٹین کے کوئی معروف پیرالاگس نہیں ہیں۔ یہ جین اور اس کا پروٹین پریمیٹس اور ممالیہ جانوروں میں، خاص طور پر فنکشنل میتھائل ٹرانسفرس ڈومین میں بہت زیادہ محفوظ ہیں۔ نیچے دیا گیا گراف C16orf13 ٹرانسکرپٹ ورژن 1 کے لیے منتخب پروٹین آرتھولوگس کو دکھاتا ہے۔ یہ اعداد و شمار این سی بی آئی بلاسٹ سے جمع کیے گئے ہیں۔ پیشین گوئی شدہ خصوصیات پروٹین کے اندر الفا ہیلیسیس اور بیٹا شیٹس کی موجودگی کی پیشین گوئی کرنے کے لیے الگورتھم کا استعمال کرتے ہوئے پروٹین کے ثانوی ڈھانچے کی پیشین گوئی کی جا سکتی ہے۔ پروٹین کی ساخت کا تجزیہ ایس ڈی ایس سی بائیولوجی ورک بینچ میں چوفاس، جی او آر 4، اور پیل الگورتھم کا استعمال کرتے ہوئے کیا گیا۔ تجزیہ کو یکجا کیا گیا اور ملحقہ خاکہ میں شامل کیا گیا۔ صرف وہ ڈھانچے شامل کیے گئے جو ایک سے زیادہ آؤٹ پٹ میں نمودار ہوئے۔ تعاملات اس پروٹین کے لیے چند معروف تعاملات ہیں۔ جین کارڈز ڈیٹا بیس یا MINT ڈیٹا بیس میں کوئی تعامل نہیں پایا گیا۔ ایک زبردست تلاش کے نتیجے میں دو جین آؤٹ پٹ سامنے آئے۔ یہ دونوں جین تعاملات، اگرچہ، جین پڑوس کے ثبوت کے زمرے میں ہیں، جو ضروری نہیں کہ یہ جین کسی بامعنی انداز میں تعامل کر رہے ہیں، یا یہاں تک کہ ایک ہی وقت میں اظہار بھی کر رہے ہیں۔ اس پروٹین کے ساتھ تعاملات کے لیے فی الحال کوئی مضبوط ثبوت موجود نہیں ہے۔ مائیکرو ارے تجربات سے بیماری کے تعلق کے اعداد و شمار نے اس جین کے زیادہ اظہار کو مختلف بافتوں، خاص طور پر چھاتی اور معدے کے کینسر سے جوڑا ہے۔ اس کے علاوہ، اس جین کے اظہار کے تحت بیماری، خاص طور پر کنیکٹو ٹشو کی بیماری، غذائیت اور میٹابولک عوارض، اور ہاضمہ کی خرابی سے بھی منسلک ہے۔ کین ایس اے آر ورک بینچ ڈیٹا بیس مائیکرو ارے ڈیٹا کو ظاہر کرتا ہے جو C16orf13 جین کے اظہار کے اوپر یا اس کے تحت انسانی کروموسوم 16 پر مختلف کارسنوما حوالہ جات جینوں سے منسلک ہو سکتا ہے۔