Multi-Omics Profiling Expression Database
ملٹی اومیکس پروفائلنگ ایکسپریشن ڈیٹا بیس (ایم او پی ای ڈی) ایک توسیع پذیر ملٹی اومیکس وسائل تھا جو ماڈل حیاتیات اور انسانوں پر عوامی طور پر دستیاب مطالعات سے ٹرانسکرپٹومیکس اور پروٹومکس کی معلومات کو تیزی سے براؤز کرنے میں مدد کرتا ہے۔ آج تک (2021) اس نے سرگرمیاں بند کر دی ہیں اور آن لائن ناقابل رسائی ہے۔ سسٹمیٹک پروٹین انویسٹی گیٹو ریسرچ انوائرمنٹ ایم او پی ای ڈی کو زیادہ سے زیادہ تحقیقی کمیونٹی کے لیے ڈیٹا کے موازنہ اور اشتراک کو آسان بنانے کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے۔ ایم او پی ای ڈی پروٹین کی سطح کے مطلق اور رشتہ دار اظہار کے اعداد و شمار، میٹا تجزیہ کی صلاحیتوں اور مقداری اعداد و شمار کو منفرد طور پر فراہم کرنے کے لیے معیاری تجزیہ پائپ لائن اسپائر کو استعمال کرتا ہے۔ پروسیس شدہ رشتہ دار اظہار ٹرانسکرپٹومیکس ڈیٹا جین ایکسپریشن اونیبس (جی ای او) سے حاصل کیا گیا تھا۔ مخصوص پروٹین اور جین کے لیے ڈیٹا سے پوچھ گچھ کی جا سکتی ہے، حیاتیات، ٹشو، لوکلائزیشن اور حالت کی بنیاد پر براؤز کیا جا سکتا ہے، اور غلط دریافت کی شرح اور اظہار کے ذریعے ترتیب دیا جا سکتا ہے۔ ایم او پی ای ڈی صارفین کو اپنے اظہار کے ڈیٹا کو دیکھنے اور موجودہ مطالعات کے ساتھ اس کا موازنہ کرنے کا اختیار دیتا ہے۔ مزید برآں، ایم او پی ای ڈی مختلف پروٹین اور راستے کے ڈیٹا بیسز سے منسلک ہے، جن میں جین کارڈز، پینتھر، اینٹریز، یونیپروٹ، کے ای جی جی، سیڈ، اور ریکٹوم شامل ہیں۔ پروٹین اور جین شناخت کنندگان جین کارڈز (ایم او پی ای ڈی کے ساتھ کراس حوالہ)، جین بینک، ریفسیک، یونیپروٹ، ورم بیس، اور سیکیرومیسیس جینوم ڈیٹا بیس (ایس جی ڈی) سے مربوط ہیں۔ ایم او پی ای ڈی کے موجودہ ورژن (ایم او پی ای ڈی 2.5,2014) میں تقریبا 5 ملین کل ریکارڈ شامل ہیں جن میں ~ 260 تجربات اور ~ 390 حالات شامل ہیں۔ ایم او پی ای ڈی کو سیئٹل چلڈرن ریسرچ انسٹی ٹیوٹ کی کولکر ٹیم نے تیار اور سپورٹ کیا ہے۔ ماڈل آرگنزم پروٹین ایکسپریشن ڈیٹا بیس ایم او پی ای ڈی کو پہلے ماڈل آرگنزم پروٹین ایکسپریشن ڈیٹا بیس کے نام سے جانا جاتا تھا، اس کا نام ملٹی اومیکس پروفائلنگ ایکسپریشن ڈیٹا بیس میں تبدیل کرنے سے پہلے۔ مزید پڑھنے کے لیے حوالہ جات حیاتیاتی ڈیٹا بیس پروٹومکس اومیکس