Fuzzy complex
فجی کمپلیکس پروٹین کمپلیکس ہوتے ہیں، جہاں ساختی ابہام یا کثرت موجود ہوتی ہے اور حیاتیاتی فعل کے لیے ضروری ہوتی ہے۔ تشخیصی طور پر مبہم علاقوں کی تبدیلی، کٹائی یا ہٹانا متعلقہ کمپلیکس کی سرگرمی کو متاثر کرتا ہے۔ مبہم کمپلیکس عام طور پر اندرونی طور پر بے ترتیب پروٹین سے تشکیل پاتے ہیں۔ ساختی کثرت عام طور پر ایک مبہم منطق کے بعد پروٹین کمپلیکس کی فعال کثرت کی بنیاد رکھتی ہے۔ نیوکلیوسوم کے مخصوص بائنڈنگ طریقوں کو بھی مبہم ہونے کا ایک خاص معاملہ سمجھا جاتا ہے۔ تاریخی پس منظر تقریبا 50 سالوں تک سالماتی حیاتیات دو عقائد پر مبنی تھی: (i) پروٹین کے حیاتیاتی فعل کو ایک منفرد تین جہتی ڈھانچے کے برابر کرنا اور (ii) پروٹین کمپلیکس میں شاندار مخصوصیت کو فرض کرنا۔ پروٹین اور اس کے لگینڈ (ایک اور پروٹین، ڈی این اے، آر این اے یا چھوٹے مالیکیول) کے درمیان تشکیل پانے والے تعاملات کے غیر واضح سیٹ کے ذریعے خاصیت/انتخاب کو یقینی بنایا جاتا ہے۔ تاہم بہت سے پروٹین کمپلیکس، فعال طور پر اہم/اہم علاقوں پر مشتمل ہوتے ہیں، جو کمپلیکس میں انتہائی متحرک رہتے ہیں یا مختلف تشکیلات کو اپناتے ہیں۔ اس رجحان کی تعریف مبہم پن سے کی جاتی ہے۔ سب سے زیادہ مناسب مثال سائکلین پر منحصر کینیز انفیکٹر Sic1 ہے، جو فاسفوریلیشن پر منحصر انداز میں Cdc4 کے SCF ذیلی یونٹ سے جڑا ہوا ہے۔ فاسفوریلیشن پر کوئی باقاعدہ ثانوی ڈھانچہ حاصل نہیں ہوتا ہے اور کمپلیکس میں مختلف فاسفوریلیشن سائٹس کا تبادلہ ہوتا ہے۔ فجی کمپلیکس کی درجہ بندی پروٹین کمپلیکس میں ساختی ابہام ایک وسیع میدان عمل کا احاطہ کرتا ہے۔ پولیمرفک کمپلیکس میں، پروٹین ایک ہی پارٹنر کے پابند ہونے پر دو یا زیادہ مختلف کنفارمیشنز کو اپناتا ہے، اور ان کنفارمیشنز کو حل کیا جا سکتا ہے۔ کلیمپ، فلینکنگ اور بے ترتیب کمپلیکس متحرک ہوتے ہیں، جہاں مبہم تشکیلات ایک دوسرے کے ساتھ بدل جاتی ہیں اور انہیں حل نہیں کیا جا سکتا۔ مبہم کمپلیکس میں تعاملات عام طور پر مختصر نقشوں کے ذریعے کیے جاتے ہیں۔ جب تک امینو ایسڈ کی ساخت کو برقرار رکھا جاتا ہے، کنارے والے علاقے ترتیب کی تبدیلیوں کے لیے روادار ہوتے ہیں، مثال کے طور پر لنکر ہسٹون سی-ٹرمینل ڈومینز اور ایچ 4 ہسٹون این-ٹرمینل ڈومینز کے معاملے میں۔ مبہم علاقوں کے ذریعے ریگولیٹری راستے مبہم علاقے عارضی تعاملات کے ذریعے بائنڈنگ انٹرفیس کے تشکیلی توازن یا لچک کو تبدیل کرتے ہیں۔ متحرک علاقے بائنڈنگ سائٹس کے ساتھ بھی مقابلہ کر سکتے ہیں یا انہیں ہدف تک پہنچا سکتے ہیں۔ مزید تعاملات، یا ترجمے کے بعد کی تبدیلیوں کے ذریعے مبہم علاقوں کی تبدیلیاں پابند وابستگی یا خاصیت کو متاثر کرتی ہیں۔ متبادل اسپلیسنگ مبہم علاقوں کی لمبائی کو تبدیل کر سکتی ہے جس کے نتیجے میں سیاق و سباق پر منحصر پابند ہوتا ہے (جیسے۔ ٹشو کی مخصوصیت) کمپلیکس پر۔ ای جی ایف/ایم اے پی کے، ٹی جی ایف-β اور ڈبلیو این ٹی/ونگ لیس سگنلنگ راستے ٹشو کے مخصوص مبہم علاقوں کو ملازمت دیتے ہیں۔ حوالہ جات پروٹین ڈھانچہ سٹیریو کیمسٹری