CheShift
CheShift-2 (تلفظ/tche ʃift/) ایک ایپلی کیشن ہے جو 13Cα اور 13Cβ پروٹین کی کیمیائی شفٹوں کا حساب لگانے اور پروٹین کے ڈھانچے کی توثیق کرنے کے لیے بنائی گئی ہے۔ یہ 20 امینو ایسڈ کے ٹورسنل اینگلز (φ، si، ω اور χ1، χ2) کے فنکشن کے طور پر 13Cα اور 13Cβ کیمیکل شفٹ کے کوانٹم میکانکس کے حسابات پر مبنی ہے۔ چی شفٹ-2 پی ڈی بی فائل سے نظریاتی کیمیائی شفٹ اقدار کی فہرست واپس کر سکتا ہے۔ یہ اپ لوڈ شدہ پی ڈی بی فائل اور کیمیائی شفٹ ویلیوز پر مبنی تھری ڈی پروٹین ماڈل بھی ظاہر کر سکتا ہے۔ تھری ڈی پروٹین ماڈل پانچ رنگوں کے کوڈ کا استعمال کرتے ہوئے رنگین ہے جو نظریاتی بمقابلہ مشاہدہ شدہ کیمیائی شفٹ اقدار کے فرق کو ظاہر کرتا ہے۔ مشاہدہ شدہ اور پیش گوئی شدہ 13Cα اور 13Cβ کیمیائی شفٹوں کے درمیان فرق کو ایک حساس تحقیقات کے طور پر استعمال کیا جا سکتا ہے جس کے ساتھ پروٹین کے ڈھانچے میں ممکنہ مقامی خامیوں کا پتہ لگایا جا سکتا ہے۔ اگر 13Cα اور 13Cβ دونوں مشاہدہ شدہ کیمیائی تبدیلیاں فراہم کی جاتی ہیں تو چی شفٹ-2 متبادل χ1 اور χ2 سائیڈ چین ٹورسنل زاویوں کی ایک فہرست فراہم کرنے کی کوشش کرے گا جو مشاہدہ شدہ اور کمپیوٹڈ کیمیائی تبدیلیوں کے درمیان فرق کو کم کرے گا، ان اقدار کو پروٹین کے ڈھانچے میں خامیوں کی مرمت کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ چی شفٹ-2 تک آن لائن رسائی حاصل کی جا سکتی ہے http://www.cheshift.com، یا پی ایم او ایل پلگ ان کے ذریعے۔ ڈھانچے کی توثیق بائیو انفارمیٹکس کمپیوٹیشنل بائیولوجی سے متعلق سافٹ ویئر کیا ہے اگر سافٹ ویئر PROCHECK پی ایس وی ایس بیرونی لنکس چی شفٹ پی ایم او ایل پلگ ان گٹ ہب ریپوزیٹری حوالہ جات بائیو انفارمیٹکس سافٹ ویئر