Formate-nitrite transporter
فارمیٹ-نائٹرائٹ ٹرانسپورٹر (ایف این ٹی) خاندان کا تعلق میجر انٹرنسک پروٹین (ایم آئی پی) سپر فیملی سے ہے۔ ایف این ٹی خاندان کے افراد کو گرام منفی اور گرام مثبت بیکٹیریا، آرکیا، خمیر، پودوں اور نچلے یوکرائٹس سے ترتیب دیا گیا ہے۔ ایف این ٹی خاندان کے پروکیریوٹک پروٹین شاید ساختی طور پر متعلقہ مرکبات، فارمیٹ اور نائٹریٹ کی نقل و حمل میں کام کرتے ہیں۔ ساخت خمیر پروٹین (627 امینو ایسائل بقیہ) کے استثناء کے ساتھ، خاندان کے تمام نمایاں ارکان لمبائی میں 256-285 بقیہ کے ہوتے ہیں اور 6-8 پوٹیٹو ٹرانس میمبرین α-ہیلیکل اسپینرز (TMSs) کی نمائش کرتے ہیں۔ ایک معاملے میں، ای کولی فوکا (ٹی سی #1.A.16.1.1) پروٹین کی 6 ٹی ایم ایس ٹوپولوجی قائم کی گئی ہے۔ خمیر پروٹین میں اسی طرح کی ظاہری ٹوپولوجی ہوتی ہے لیکن اس میں تقریبا 400 باقیات کی ایک بڑی سی-ٹرمینل ہائیڈروفیلک توسیع ہوتی ہے۔ ای کولی کا فوکا ایک سمیٹرک پینٹیمر ہے، جس میں ہر ذیلی یونٹ چھ ٹی ایم ایس پر مشتمل ہوتا ہے۔ فائیلوجینی فائیلوجینیٹک ٹری فنکشن اور نامیاتی فائیلوجینی کے مطابق کلسٹرنگ دکھاتا ہے۔ پائروویٹ فارمیٹ لائز (پی ایف ایل) سے وابستہ بیکٹیریا کے پوٹیٹیو فارمیٹ افلوکس ٹرانسپورٹرز (ایف او سی اے ؛ TC#s 1.A.16.1.1 اور 1.A.16.1.3) کلسٹر I پر مشتمل ہوتے ہیں۔ فارمیٹ ڈی ہائیڈروجنیز سے وابستہ بیکٹیریا اور آرکیا کے پوٹیٹیو فارمیٹ اپٹیک پرمیسیس (ایف ڈی ایچ سی ؛ TC#s 1.A.16.2.1 اور 1.A.16.2.3) کلسٹر II پر مشتمل ہوتے ہیں۔ بیکٹیریا کے نائٹریٹ اپٹیک پرمیسیس (این آر سی، TC#s 1.A.16.2.5، 1.A.16.3.1، اور 1.A.16.3.4) کلسٹر III پر مشتمل ہوتے ہیں، اور خمیر پروٹین کلسٹر IV پر مشتمل ہوتا ہے۔ فنکشن ایف این ٹی خاندان کے پروٹین کے لیے توانائی کے جوڑے کے طریقہ کار کو بڑے پیمانے پر نمایاں نہیں کیا گیا ہے۔ ایچ سی او اور این او اپٹیکس کو ایچ + سمپورٹ کے ساتھ جوڑا جا سکتا ہے۔ ایچ سی او کا اخراج جھلی کی صلاحیت کے ذریعے یونیپورٹ میکانزم یا ایچ + اینٹی پورٹ کے ذریعے چلایا جا سکتا ہے۔ ای کولی کا ایف او سی اے دو طرفہ فارمیٹ ٹرانسپورٹ کو متحرک کرتا ہے اور چینل قسم کے طریقہ کار کے ذریعے کام کر سکتا ہے۔ فوکا، شارٹ چین ایسڈ کی نقل و حمل کرتا ہے۔ ایف او سی اے اپنے عمل کے طریقے کو اعلی بیرونی پی ایچ پر غیر فعال برآمدی چینل سے کم پی ایچ پر ثانوی فعال فارمیٹ/ایچ + درآمد کنندہ میں تبدیل کرنے کے قابل ہو سکتا ہے۔ پی ایچ 4 پر سالمونیلا ٹائیفیموریم فوکا کی کرسٹل ساخت سے پتہ چلتا ہے کہ اس تبدیلی میں پینٹامیرک چینل میں انفرادی پروٹومرز کے امینو ٹرمینی کی ایک بڑی ترتیب شامل ہے۔ امینو-ٹرمینل ہیلیکس ایک مربوط، تعاون پر مبنی عمل میں نقل و حمل کو کھولتے یا روکتے ہیں جو اس بات کی نشاندہی کرتا ہے کہ ایف او سی اے کو پی ایچ پر منحصر طریقے سے کیسے گیٹ کیا جاتا ہے۔ الیکٹرو فزیولوجیکل مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ پروٹین پی ایچ 7 پر ایک مخصوص فارمیٹ چینل کے طور پر کام کرتا ہے اور یہ پی ایچ 5.1 پر منتقل ہونے پر بند ہو جاتا ہے۔ نقل و حمل کا رد عمل ایف این ٹی خاندان کے مختلف ممبروں کے ذریعہ اتپریرک ہونے والے ممکنہ نقل و حمل کے رد عمل یہ ہیں: (1) آر سی او یا این او (آؤٹ) آر سی او یا این او (ان)، (2) ایچ سی او (ان) ایچ سی او (آؤٹ)، (3) ایچ ایس − (آؤٹ) ایچ ایس − (ان)۔ اراکین ایف این ٹی خاندان سے تعلق رکھنے والے موجودہ درجہ بند اراکین کی نمائندہ فہرست ٹرانسپورٹر درجہ بندی ڈیٹا بیس میں مل سکتی ہے۔ کچھ خاص اراکین میں شامل ہیں: FocA اور FocB (TC#s 1.A.16.1.1 اور 1.A.16.1.2، بالترتیب)، Escherichia coli سے، فارمیٹ کی دو طرفہ نقل و حمل میں شامل ٹرانسپورٹرز۔ ایف ڈی ایچ سی، میتھانوبیکٹیریم میریپالوڈس (ٹی سی #1.A.16.2.3) اور میتھانوتھرموبیکٹر تھرموفارمیکم (ٹی سی #1.A.16.2.1) سے، ایک ممکنہ فارمیٹ ٹرانسپورٹر ہے۔ این آر سی، ای کولی (ٹی سی #1.A.16.3.1) سے، ایک ممکنہ نائٹریٹ ٹرانسپورٹر۔ کلیمیڈوموناس رین ہارٹی (کلیمیڈوموناس سمتھئی) کا نار 1 (ٹی سی #1.A.16.2.4)، 355 امینو ایسائل کے باقیات کا نائٹریٹ اپ ٹیک پورٹر۔ B. سبٹیلس فرضی پروٹین YwcJ (iPA-48R) (TC #1.A.16.3.2)۔ پروٹین خاندان میمبرین پروٹین ٹرانس میمبرین پروٹین ٹرانس میمبرین ٹرانسپورٹرز ٹرانسپورٹ پروٹین انٹیگرل میمبرین پروٹین