Bacteriophage T12
بیکٹیریوفیج ٹی 12 ایک بیکٹیریوفیج ہے جو سٹریپٹوکوکس پائجینز بیکٹیریا کو متاثر کرتا ہے۔ یہ کاڈوویرالس کی ترتیب میں خاندان سیفوویریڈی کی ایک مجوزہ نوع ہے جسے دم والے وائرس بھی کہا جاتا ہے۔ یہ بیکٹیریا کے بے ضرر تناؤ کو ایک خطرناک تناؤ میں تبدیل کرتا ہے۔ اس میں سپی اے جین ہوتا ہے جو erythrogenic toxin A کے لیے کوڈ کرتا ہے۔ سپی اے کو سٹریپٹوکوکل پائجینک ایکزوٹاکسن اے، اسکارلیٹ فیور ٹاکسن اے، یا یہاں تک کہ اسکارلیٹینل ٹاکسن کے نام سے بھی جانا جاتا ہے۔ نوٹ کریں کہ جین "سپی اے" کا نام اٹالیسائزڈ ہے ؛ ٹاکسن "سپی اے" کا نام اٹالیسائزڈ نہیں ہے۔ اریتھروجینک ٹاکسن اے سٹریپٹوکوکس پائجینز کے ایک بے ضرر، غیر وائرل تناؤ کو لائسوجینی کے ذریعے ایک وائرل تناؤ میں تبدیل کرتا ہے، ایک لائف سائیکل جس کی خصوصیت جینوم کی میزبان خلیے کا حصہ بننے کی صلاحیت ہے اور اسے نسلوں تک مستحکم طریقے سے برقرار رکھا جاتا ہے۔ لائسوجینک لائف سائیکل والے فیجز کو معتدل فیجز بھی کہا جاتا ہے۔ بیکٹیریوفیج ٹی 12، خاندان سیفوویریڈی کا مجوزہ رکن جس میں متعلقہ سپی اے لے جانے والے بیکٹیریوفیجز بھی شامل ہیں، سٹریپٹوکوکس پائجینز کے تمام سپی اے لے جانے والے فیجز کے لیے بھی ایک پروٹو ٹائپک فیج ہے، جس کا مطلب ہے کہ اس کا جینوم ایس پائجینز کے ایسے تمام فیجز کے جینومز کا پروٹو ٹائپ ہے۔ یہ سرخ بخار کی وجہ سے مرکزی مشتبہ ہے، جو ایک متعدی بیماری ہے جو چھوٹے بچوں کو متاثر کرتی ہے۔ دریافت اور مزید تحقیق سپی اے کی پیداوار میں بیکٹیریوفیج کی شمولیت کا امکان پہلی بار 1926 میں متعارف کرایا گیا تھا جب کینٹاکوزین اور بونسییو نے اطلاع دی تھی کہ ایس پائجینز کے غیر وائرل تناؤ کو کچھ قابل منتقلی عنصر کے ذریعے وائرل تناؤ میں تبدیل کر دیا گیا تھا۔ فروبیشر اور براؤن نے 1927 میں اسی طرح کے نتائج کی اطلاع دی، اور 1949 میں، رپورٹوں کی تصدیق بنگیل نے بعد میں کی، 1964 میں، زیبرسکی نے اطلاع دی کہ فیج ٹی 12 ان تناؤ میں لائسوجینی کے ذریعہ سپی اے کی پیداوار کا سبب بن سکتا ہے جس کا یہ ایک حصہ بن گیا۔ 1980 میں، جانسن، شلییورٹ اور واٹسن اس کی تصدیق کرنے میں کامیاب ہوئے اور یہ ظاہر کرنے میں کامیاب ہوئے کہ سپی اے کی پیداوار کے لیے جین بیکٹیریا کے ٹاکسیجینک تناؤ سے لائسوجینی کے ذریعے غیر ٹاکسیجینک تناؤ میں منتقل کیا گیا تھا۔ ان کے تجربے میں، ہر تبدیل شدہ، زہریلا پیدا کرنے والی بیکٹیریل کالونی لائسوجینک تھی، یعنی۔ اس میں T12 جین موجود ہے۔ اس کے علاوہ، ٹی 12 جینوم پر مشتمل کالونیوں میں سے کوئی بھی سپی اے کے لیے منفی نہیں تھی، اور اس لیے یہ نتیجہ اخذ کیا گیا کہ تمام لائسوجینز ٹاکسن پیدا کرتے ہیں۔ تاہم، میک کین اور فریٹی نے 1981 میں اطلاع دی کہ فیج ٹی 12 کے ایک بے ساختہ تغیر نے سپی اے کی پیداوار کو وائرل طور پر متاثر کیا۔ یہ میوٹینٹ، بیکٹیریوفیج T12cp1، لائٹک سائیکل میں داخل ہوا، ایک لائف سائیکل جس میں میزبان خلیہ تباہ ہو جاتا ہے۔ 1983 میں، جانسن اور شلییورٹ نے T12 جینوم کا ایک نقشہ شائع کیا، جس میں یہ بھی انکشاف کیا گیا کہ جینوم میں پیکیجنگ کے تین دور ہوتے ہیں۔ اگلے ہی سال، جانسن اور شلییورٹ اور ویکس اور فیریٹی نے بھی آزادانہ طور پر پایا کہ بیکٹیریوفیج ٹی 12 سپی اے کے لیے ساختی جین رکھتا ہے۔ 1986 میں، جانسن، ٹومائی اور شلییورٹ نے سپی اے جین سے متصل ٹی 12 کے لیے منسلک سائٹ (اے ٹی پی) کا نقشہ بنایا، اور یہ ثابت کیا کہ ٹاکسن پیدا کرنے والے تمام بیکٹیریل تناؤ یا تو فیج ٹی 12 خود، یا قریب سے متعلق بیکٹیریوفیج رکھتے ہیں۔ اور آخر کار، 1997 میں، میک شان اور فریٹی نے شائع کیا کہ انہیں ٹی 12 کے لیے دوسری منسلک سائٹ (اے ٹی آر) مل گئی ہے، جبکہ ایک اور اشاعت میں بھی انکشاف کیا گیا، جس کا سہرا تانگ کو بھی دیا گیا تھا، کہ بیکٹیریوفیج ٹی 12 ایک جین میں داخل ہوتا ہے جو میزبان میں سیرائن ٹی آر این اے کو انکوڈ کرتا ہے۔ جینوم T12 جینوم کا فزیکل نقشہ سرکلر پایا گیا جس کی کل لمبائی 36.0kb تھی۔ فیج جینوم میں سپی اے جین ہونے کی اطلاع ہے، جو کہ فیج ٹی 12 جینوم کا ایک 1.7kb حصہ ہے جو سیل آئی اور ہند III سائٹس سے بھرا ہوا ہے۔ فیج انٹیگریز جین (انٹی) اور فیج اٹیچمنٹ سائٹ (اے ٹی پی) فیج جینوم میں سپی اے جین کے بالکل اوپر کی طرف واقع ہیں۔ بیکٹیریوفیج T12 ایک جین کے اینٹی کوڈن لوپ میں سائٹ مخصوص ریکومبینیشن کے ذریعے S. پائجینز کروموسوم میں ضم ہو جاتا ہے جو سیرائن tRNA کے لیے کوڈ کرتا ہے۔ بیکٹیریل اٹیچمنٹ سائٹ (اے ٹی بی) میں فیج اٹیچمنٹ سائٹ کے لیے 96 بیس جوڑی کی ترتیب یکساں ہوتی ہے اور یہ ٹی آر این اے جین کے 3 'سرے پر اس طرح واقع ہوتی ہے کہ ٹی آر این اے جین کی کوڈنگ ترتیب پروفیج کے انضمام کے بعد برقرار رہتی ہے۔ فیج ٹی 12 گرام مثبت، کم جی سی مواد والے میزبان سے فیج کی پہلی مثال ہے جو اس قسم کی انضمام سائٹ کا استعمال کرتا ہے۔ پیتھوجینسیس میں کردار سرخ بخار اور سٹریپٹوکوکل ٹاکسیک شاک سنڈروم جیسی بیماریاں لائسوجینائزڈ سٹریپٹوکوکل تناؤ کی وجہ سے ہوتی ہیں جو سپی اے پیدا کرتی ہیں۔ یہ بیماریاں جسم کے اندر گردش کرنے والے سپی اے کے لیے نظامی ردعمل ہیں۔ اسکارلیٹ بخار، جسے اسکارلیٹینا بھی کہا جاتا ہے، اس کی وجہ یہ ہے کہ اس کی خصوصیت روشن سرخ دھبے کی وجہ سے ہے۔ یہ چار سے آٹھ سال کی عمر کے بچوں میں سب سے زیادہ عام ہے۔ علامات اور علامات سرخ بخار کا پہلا مرحلہ عام طور پر سٹریپ گلے (سٹریپٹوکوکل فرینگائٹس) ہوتا ہے جس کی خصوصیت گلے میں خراش، بخار، سر درد اور بعض اوقات متلی اور الٹی ہوتی ہے۔ دو سے تین دنوں میں، اس کے بعد ایک پھیلے ہوئے اریتھیمیٹس دانے کی ظاہری شکل ہوتی ہے جس میں ریت کے کاغذ کی ساخت ہوتی ہے۔ دانے پہلے گردن پر ظاہر ہوتے ہیں، پھر سینے، کمر اور جسم کے اعضاء تک پھیل جاتے ہیں۔ پیلے رنگ کی سفید کوٹنگ زبان کو ڈھانپ دیتی ہے، اور بعد میں اسے بہایا جاتا ہے، جس سے زبان اسٹرابیری کی شکل اور سوجن والے پیپلی کے ساتھ رہ جاتی ہے۔ بیماری کے آغاز کے پانچ سے چھ دن بعد دھبے ختم ہو جاتے ہیں، اور اس کے بعد جلد کا چھلکا، خاص طور پر ہاتھوں اور پیروں پر نکل جاتا ہے۔ علاج پینسلن، ایک اینٹی بائیوٹک، سرخ بخار کے علاج کے لیے پسند کی دوا ہے جیسا کہ کسی دوسرے ایس۔ پائجینز انفیکشن کے لیے ہے۔ جن لوگوں کو پینسلن سے الرجی ہے، ان کے لیے اینٹی بائیوٹکس erythromycin یا clindamycin استعمال کیا جا سکتا ہے۔ تاہم، ان دوائیوں کے خلاف کبھی کبھار مزاحمت کی اطلاع ملی ہے۔ سٹریپٹوکوکل ٹاکسیک شاک سنڈروم (اسٹریپ ٹی ایس ایس) میں، متاثرہ سٹریپٹوکوکل تناؤ سے پیدا ہونے والا سپی اے ایک سپر اینٹیجن کے طور پر کام کرتا ہے اور انسانی مونوسیٹس اور ٹی لیمفوسائٹس کے ساتھ تعامل کرتا ہے، جس سے ٹی سیل کے پھیلاؤ اور مونوکائنز کی پیداوار (جیسے۔ ٹیومر نیکروسیس فیکٹر α، انٹرلیوکن 1، انٹرلیوکن 6)، اور لیمفوکائنز (جیسے۔ ٹیومر نیکروسیس فیکٹر β، انٹرلیوکن 2، اور گاما-انٹرفیرون)۔ یہ سائٹوکائنز (ٹی این ایف اے، ٹی این ایف بی اے) بیماری کے بخار، صدمے اور اعضاء کی ناکامی کی خصوصیت میں ثالثی کرتی دکھائی دیتی ہیں۔ علامات اور علامات اسٹریپ ٹی ایس ایس ایک شدید، بخار کی بیماری ہے جو ہلکے وائرل جیسے سنڈروم سے شروع ہوتی ہے جس کی خصوصیت بخار، سردی لگنا، دمنی، اسہال، الٹی اور متلی ہوتی ہے اور اس میں معمولی نرم ٹشو انفیکشن شامل ہوتا ہے جو صدمے، کثیر اعضاء کی ناکامی اور موت کی طرف بڑھ سکتا ہے۔ علاج اگرچہ پینسلن ہلکے انفیکشن کا ایک موثر علاج ہے، لیکن شدید صورت میں یہ کم موثر ہے۔ سٹریپ ٹی ایس ایس کے ابھرتے ہوئے علاج میں کلینڈامائسن اور انٹراوینس گاما گلوبلین شامل ہیں۔ پتہ لگانا اور اس کا خاتمہ لائسوجینک بیکٹیریوفیج ٹی 12 کی موجودگی کی جانچ پلاک اسیس کے ذریعے کی جا سکتی ہے اگر استعمال کیا گیا اشارے کا تناؤ جانچ کیے جانے والے فیج کے لیے حساس ہے۔ پلیک اسیس میں اگر پلیٹ پر اشارے کے دباؤ کے ساتھ نرم اگر کا محلول ڈالنا شامل ہوتا ہے۔ اشارے کا تناؤ بیکٹیریا کا ایک تناؤ ہونا چاہیے جو فیج سے متاثر ہو سکتا ہے جس کا پتہ لگانے کی ضرورت ہے۔ نرم اگر کو سیٹ کرنے کے بعد جن نمونوں کی فیج کی موجودگی کے لیے جانچ کی جا رہی ہے انہیں پھر نرم اگر پلیٹوں پر پھیلا دیا جاتا ہے۔ اس کے بعد پلیٹوں کو رات بھر انکیوبیٹ کیا جاتا ہے اور اگلے دن کلیئرنگ (تختیاں) کی جانچ پڑتال کی جاتی ہے۔ اگر فیج موجود ہے، تو اشارے کے تناؤ متاثر ہو جائیں گے اور عام لائسوجینک سائیکل سے گزریں گے جب کہ پلیٹیں انکیوبیٹ ہوں گی، اور پھر لائسس سے گزریں گی۔ وہ تختی جو اس بات کا تعین کرتی ہے کہ فیج موجود ہے یا نہیں، اشارے کے تناؤ کی وجہ سے ہوتی ہے۔ تختیوں کے عنوانات نمونوں کو پتلا کرکے اور تختی بنانے والی اکائیوں (پی ایف یو) کی گنتی کرکے پائے جا سکتے ہیں۔ بائیو کیمیکل ٹیسٹ جیسے سدرن بلاٹس کا استعمال اس سپی اے کا پتہ لگانے کے لیے بھی کیا جا سکتا ہے جو فیج سپی اے جین سے پیدا کرتا ہے۔ یہ جانسن، ٹومائی اور شلییورٹ کی تحقیق میں 1985 میں سٹریپٹوکوکل تناؤ کے ڈی این اے کو الگ کرکے اور بی جی ایل آئی آئی کا استعمال کرتے ہوئے پابندی ڈائجسٹ چلا کر کیا گیا تھا۔ ڈائجسٹ مکمل ہونے کے بعد ڈی این اے کے نمونوں کو ڈی این اے کو الگ کرنے کے لیے جیل پر چلایا گیا۔ اس جیل سے ڈی این اے کو پھر نائٹروسیلولوز کاغذ میں منتقل کیا گیا اور سپی اے کے لیے مخصوص تحقیقات کے ساتھ انکیوبیٹ کیا گیا۔ اس جنوبی دھبے کی تصویر اس مضمون میں دیکھی جا سکتی ہے۔ بیکٹیریوفیجز بہت آسانی سے پھیل جاتے ہیں۔ کم نمائش پر، بالائے بنفشی روشنی فیج ٹی 12 اور ایس پی اے دونوں کی پیداوار کو بڑھا سکتی ہے۔ یووی نمائش کا طویل وقت فیج کو مار سکتا ہے۔ یووی روشنی لائسوجینک بیکٹیریا پر دباؤ ڈالتی ہے، جس کی وجہ سے فیجز میزبان بیکٹیریا کے خلیوں کو پھیلاتے اور پھٹتے ہیں۔ ٹی 12 کے معاملے میں، یووی روشنی کی نمائش سے 20 سیکنڈ کی نمائش پر بیکٹیریوفیج ٹی 12 کے پھیلاؤ میں اضافہ ہوتا ہے۔ 20 سیکنڈ کی نمائش کے بعد یو وی روشنی بیکٹیریوفیج کو اس کے جینوم کو نقصان پہنچا کر مارنا شروع کر دیتی ہے۔ حوالہ جات بیرونی روابط یونیپروٹ ٹیکسونومی بیکٹیریوفیجز غیر قبول شدہ وائرس ٹیکسا