TMEM131
ٹرانس میمبرین پروٹین 131 (ٹی ایم ای ایم 131) ایک پروٹین ہے جو انسانوں میں ٹی ایم ای ایم 131 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ TMEM131 پروٹین نامعلوم فنکشن 3651 (DUF3651) کے تین ڈومینز اور دو ٹرانس میمبرین ڈومینز پر مشتمل ہے۔ اس پروٹین کو ٹی سیل فنکشن اور نشوونما میں کردار کے طور پر شامل کیا گیا ہے۔ TMEM131 ایک لوکس (2q11.1) میں بھی رہتا ہے جو حذف ہونے پر نیورجیلٹ سنڈروم سے وابستہ ہوتا ہے۔ ٹی سیل فنکشن میں کردار ٹی ایم ای ایم 131 کو ڈاؤن سنڈروم کے مریضوں میں ہائپر میتھیلیشن کی نمائش کے لیے دکھایا گیا ہے۔ اس مطالعے کے مصنفین نے تجویز پیش کی کہ، ٹی سیل کی نشوونما اور فنکشن میں ٹی ایم ای ایم 131 کے متوقع فنکشن کو دیکھتے ہوئے، یہ ہائپر میتھیلیشن ڈاؤن سنڈروم کے مریضوں میں دبے ہوئے مدافعتی فنکشن میں کردار ادا کر سکتا ہے۔ ٹی خلیوں کی نشوونما اور تفریق کے دوران ٹی ایم ای ایم 131 کو بھی اپ ریگولیٹ کیا گیا ہے، اور یہ دکھایا گیا ہے کہ ٹشو کی دیگر اقسام کے مقابلے میں ٹی خلیوں میں اظہار کی نسبتا زیادہ سطح ہوتی ہے۔ جین کا جائزہ TMEM131 کروموسوم 2 کے منفی ڈی این اے اسٹرینڈ (سینس دیکھیں) پر 98,372,799-98,612,354 سے واقع ہے۔ جین پروڈکٹ ایک 6,657 بیس جوڑی ایم آر این اے ہے جس میں انسانی جین میں 41 پیشن گوئی شدہ ایکسون ہیں۔ اینسمبل دس متبادل اسپلیس فارموں کی پیش گوئی کرتا ہے، جن میں سے چار پروٹین کوڈنگ ہیں۔ پروموٹر پیشن گوئی اور تجزیہ جینومیٹکس سافٹ ویئر پیج کے ذریعے ایل ڈوراڈو کا استعمال کرتے ہوئے کیا گیا تھا۔ پیش گوئی شدہ پروموٹر ریجن کروموسوم 2 کے مائنس اسٹرینڈ پر 98,611,892 سے 98,612,893 تک 1002 بیس جوڑوں پر پھیلا ہوا ہے۔ پروگرام نے دو ممکنہ نقل شروع ہونے والے مقامات کی پیش گوئی کی۔ پہلا 98,612,501 سے 98,612,716 تک 216 بیس جوڑوں پر محیط ہے۔ دوسرا 182 بیس جوڑوں کو 98,612,262 سے 98,612,443 تک پھیلاتا ہے۔ جین نیبرہوڈ TMEM131 مثبت ڈی این اے اسٹرینڈ پر ZAP70 جین (98,330,331-98,356,323) کے ساتھ ساتھ 2q11.2 لوکس پر متعدد سڈوجینز سے براہ راست متصل ہے۔ جین (وی ڈبلیو اے 3 بی) پر مشتمل ایک وان ولی برانڈ عنصر مثبت اسٹرینڈ (98,703,595-98,929,410) پر ٹی ایم ای ایم 131 سے اوپر کی طرف واقع ہے۔ جین ایکسپریشن TMEM131 جسم کے بیشتر حصوں میں کم سے اعتدال پسند سطحوں میں ظاہر ہوتا ہے، جس میں لمف نوڈس، بچہ دانی اور ٹی خلیوں میں قدرے اضافہ ہوتا ہے۔ فروٹ فلائی ایمبریوز کی نشوونما میں اظہار کا ڈیٹا بی ڈی جی پی سے سیٹو ہوم پیج پر دستیاب ہے۔ پروٹین کی خصوصیات/خصوصیات TMEM131 پروٹین کا بنیادی کام اچھی طرح سے سمجھا نہیں گیا ہے۔ انسانی شکل میں 1883 امینو ایسڈ کے باقیات ہیں، جن کا آئسو الیکٹرک پوائنٹ 8.74 اور سالماتی کمیت 205,100 ڈالٹن ہے۔ یہ بقیہ 1,091-1، 111 اور 1,118-1، 138 پر دو ٹرانس میمبرین ڈومینز پر مشتمل دکھایا گیا ہے۔ تین DUF3651 علاقے دو ملحقہ ٹرانس میمبرین ڈومینز کے N-ٹرمینل سائیڈ پر واقع ہیں۔ یہ باقیات 173-245، 502-582، اور 639-708 پر واقع ہیں۔ پروٹین کے بین سیلولر مقام کا تجرباتی طور پر تعین نہیں کیا گیا ہے، لیکن یہ خیال کیا جاتا ہے کہ یہ پلازما جھلی یا اینڈوپلاسمک ریٹیکولم میں رہتا ہے، جس میں ٹرانس میمبرین علاقوں کے این-ٹرمینل اور سی-ٹرمینل دونوں طرف ہر ڈومین سائٹوسولک ہوتا ہے۔ اس میں متعدد فاسفوریلیشن سائٹس ہیں جنہیں تجرباتی اور بائیو انفارمیٹک ٹولز دونوں کے ساتھ دکھایا گیا ہے۔ نیٹفوس ٹول کا استعمال کرتے ہوئے پروٹین کے بائیو انفارمیٹک تجزیے نے پروٹین کی پوری لمبائی میں 145 ممکنہ فاسفوریلیشن سائٹس کی پیش گوئی کی۔ ٹی ایم ای ایم 131 کے لیے پروٹین تعاملات پروٹین تعاملات کا تجزیہ کمپیوٹیشنل ٹولز کا استعمال کرتے ہوئے کیا گیا ہے۔ MINT ڈیٹا بیس کے ذریعے کسی تعامل کی نشاندہی نہیں کی گئی۔ ایک اسٹرانگ سرچ نے ٹیکسٹ مائننگ کے ذریعے پروٹین کے دس ممکنہ تعاملات کا انکشاف کیا، حالانکہ ان میں سے کسی کو بھی پروٹین-پروٹین کے حقیقی تعاملات نہیں سمجھا جانا چاہیے۔ نتائج کا قریبی تجزیہ ان پیش گوئیوں کے حقیقی ہونے کے بہت کم امکانات کو ظاہر کرتا ہے۔ انٹ ایکٹ ٹول بھی استعمال کیا گیا تھا، اور اس سے پتہ چلا کہ سپر آکسائیڈ ڈسموٹیز 2 (ایس او ڈی 2) کے ساتھ ایک ممکنہ تعامل پایا گیا تھا، جس کی شناخت خمیر ٹو ہائبرڈ اسکریننگ کے مطالعے میں کی گئی تھی۔ کنزرویشن آرتھولوگس TMEM131 اس کے تمام آرتھولوگس میں محفوظ ہے۔ پورے پروٹین کو پرائمیٹ آرتھولوگس میں انتہائی محفوظ کیا جاتا ہے، جبکہ زیادہ دور کے ہومولوگس میں DUF3651 اور ٹرانس میمبرین علاقوں میں تحفظ زیادہ ہوتا ہے۔ سان ڈیاگو سپر کمپیوٹر بائیولوجی ورک بینچ کے ذریعے BLAST اور ALIGN ٹول کا استعمال کرتے ہوئے چوانوفلیجلیٹ مونوسیگا بریویکولس کی طرح انسانوں سے دور سے متعلق پرجاتیوں میں آرتھولوگس پائے گئے۔ درج ذیل جدول TMEM131 کے ہم جنسوں کے بارے میں معلومات فراہم کرتا ہے۔ پیرالاگ TMEM131 میں ایک واحد پیرالاگ ہے، TMEM131L یا KIAA0922۔ یہ جین TMEM131 سے بہت ملتا جلتا ہے، لیکن اس میں تین DUF3651 خطوں میں سے دوسرے دو شامل نہیں ہیں۔ حوالہ جات