Epigenetics of autoimmune disorders
آٹومیمون عوارض کی ایپیجینیٹکس وہ کردار ہے جو ایپیجینیٹکس (موروثی تبدیلیاں جن میں ڈی این اے کے سلسلے میں تبدیلیاں شامل نہیں ہوتی ہیں) آٹومیمون بیماریوں میں ادا کرتی ہیں۔ آٹو امیون عوارض بیماریوں کی ایک متنوع کلاس ہے جو ایک مشترکہ اصل کا اشتراک کرتی ہے۔ یہ بیماریاں اس وقت پیدا ہوتی ہیں جب مدافعتی نظام غیر منظم ہو جاتا ہے اور غلطی سے غیر ملکی حملہ آوروں کے بجائے صحت مند بافتوں پر حملہ کر دیتا ہے۔ ان بیماریوں کو اس بنیاد پر مقامی یا نظامی کے طور پر درجہ بند کیا جاتا ہے کہ آیا وہ ایک ہی جسم کے نظام کو متاثر کرتے ہیں یا اگر وہ نظامی نقصان کا سبب بنتے ہیں۔ چاہے کسی کو آٹو امیون ڈس آرڈر ہو، اس کا انحصار جینیات کے ساتھ ساتھ ماحولیاتی عوامل پر بھی ہے۔ کچھ خاندان ان حالات کے لیے جینیاتی پیش گوئی ظاہر کرتے ہیں، تاہم اکیلے جینیات اکثر یہ بتانے کے لیے کافی نہیں ہوتی کہ آیا کسی میں آٹومیمون حالت پیدا ہوگی یا نہیں۔ تمباکو نوشی، تناؤ اور غذا جینوم میں ایپیجینیٹک تبدیلیاں پیدا کر سکتی ہیں جو مدافعتی نظام کے مخصوص جینوں کے ضابطے کو تبدیل کرتی ہیں جس کی وجہ سے ان حالات کا آغاز ہوتا ہے۔ ایپیجینیٹک تبدیلیوں کے اہم میکانزم ڈی این اے میتھیلیشن، ہسٹون میں ترمیم، اور غیر کوڈنگ آر این اے کے ذریعے ریگولیشن ہیں۔ یہ ایپیجینیٹک تبدیلیاں جینوں کے اظہار کو منظم کرتی ہیں، بشمول وہ جو مدافعتی نظام میں شامل ہیں، اور اس لیے یہ تبدیلیاں مختلف نظامی اور مقامی آٹومیمون بیماریوں کے آغاز اور علامات میں کردار ادا کرتی ہیں۔ ایپیجینیٹک میکانزم ڈی این اے میتھیلیشن ڈی این اے میتھیلیشن ایک ایپیجینیٹک ترمیم ہے جو نقل میں مداخلت کرتی ہے اور جین کے اظہار کی سطح میں کمی کا سبب بنتی ہے۔ ڈی این اے نیوکلیوٹائڈز میں میتھائل گروپوں کا اضافہ ایک ایسی سطح بنا کر ٹرانسکرپشن کو روکتا ہے جسے ٹرانسکرپشن کے عوامل باندھنے سے قاصر ہیں۔ مزید برآں، ڈی این اے میتھیلیشن میتھائل-سی پی جی بائنڈنگ ڈومین پروٹینز کو بھرتی کرتا ہے جو کو-ریپریسر کمپلیکس کی تشکیل کا اشارہ دیتے ہیں جو کرومیٹن کی ساخت کو تبدیل کرتے ہیں اور ٹرانسکرپشن کو مزید روکتے ہیں۔ ہائپر میتھیلیٹیڈ ڈی این اے کی حالت جین کی خاموشی سے وابستہ ہے جبکہ ہائپومیتھیلیٹیڈ ڈی این اے کی حالت ٹرانسکرپشن اور جین کے اظہار کی بڑھتی ہوئی سطح سے وابستہ ہے۔ ڈی این اے میتھیلیشن ڈی این اے میتھائل ٹرانسفرسز (ڈی این ایم ٹی) کے ذریعے کیا جاتا ہے جو سائٹوسین نیوکلیوٹائڈ کی 5 ویں پوزیشن پر میتھائل گروپس کو جوڑتا ہے۔ ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں، جین کے اظہار کو خاص طور پر جینوم کے ایک علاقے کے اندر میتھیلیشن کے ذریعے ماڈیول کیا جاتا ہے جسے سی پی جی جزیرہ کہا جاتا ہے، جو جین کے پروموٹر کے قریب ایک خطہ ہے جس میں سائٹوسین اور گوانائن نیوکلیوٹائڈز کا زیادہ فیصد ہوتا ہے۔ ڈی این اے ڈیمیتھیلیشن ٹین-الیون ٹرانسلوکیشن (ٹی ای ٹی) انزائموں کے ذریعے کیا جاتا ہے جو 5-میتھائلسیٹوسین (5 ایم سی) کو ہائیڈروکسیمیتھائلسیٹوسین (5 ایچ ایم سی) میں تبدیل کرتے ہیں، جس کی وجہ سے ڈی این اے کے اس حصے کی ڈیمیتھیلیشن ہوتی ہے اور جین کے اظہار میں اضافہ ہوتا ہے۔ ٹی ای ٹی انفیکٹرز کی شناخت آٹو امیون بیماریوں، خاص طور پر گٹھیا کے ممکنہ علاج کے طور پر کی گئی ہے۔ ہسٹون ترمیم ہسٹون ترمیم، جس کے نتیجے میں پروٹین بائنڈنگ سائٹس میں موافقت پذیر تبدیلیاں ہوتی ہیں، آٹومیمون عوارض میں شامل ہوتی ہیں۔ ہسٹون ایسیٹیلیشن جین کے اظہار کو فروغ دے کر ٹرانسکرپشن میں اضافے کا باعث بنتا ہے۔ بنیادی طور پر، ہسٹون ایسیٹیلیشن پڑوسی نیوکلیوسومز کے درمیان کراس لنکنگ کو کم کرکے جین کے اظہار کو بڑھاتا ہے۔ ملحقہ نیوکلیوسومز کے درمیان اس تعامل کو روکنا سنکشیپن کے کلیدی محرک کے طور پر کام کرتا ہے۔ مزید برآں، ہسٹون ایسیٹیلیشن مثبت چارج شدہ ہسٹونز اور منفی چارج شدہ ڈی این اے کے درمیان الیکٹروسٹیٹک تعامل میں بھی مداخلت کرتا ہے جس سے ہسٹون کی دم پر کچھ مثبت چارجز کو بے اثر کیا جاتا ہے۔ یہ ہسٹونز کو ڈی این اے پر اپنی گرفت کو آرام دہ بنا کر جین کے اظہار کو مزید فروغ دینے میں مدد کرتا ہے۔ اگرچہ ایسیٹیلیشن ٹرانسکرپشن کے لیے ڈی این اے کو زیادہ قابل رسائی بنانے میں مدد کرتا ہے، لیکن ہسٹون ایسیٹیلیشن کی کرومیٹن کو دوبارہ تیار کرنے کی صلاحیت جین کے اظہار کو تبدیل کرنے کی صلاحیت کا ایک انتہائی اہم حصہ ہے۔ یہ ری ماڈلنگ کنڈینسڈ ہیٹروکرومیٹن کو زیادہ آرام دہ یوکرومیٹن میں تبدیل کرنے کی اجازت دیتی ہے جو جین ٹرانسکرپشن کی اعلی سطح سے وابستہ ہے۔ ایسیٹیلیشن ٹرانسکرپشن عوامل کو بھرتی کرنے کے ایک طریقے کے طور پر بھی کام کرتا ہے جو جین کے اظہار کو فروغ دیتے ہیں۔ اس بھرتی کا ایک طریقہ ٹی اے ایف 1 (ٹی اے ٹی اے باکس بائنڈنگ پروٹین سے وابستہ عنصر 1) کی سرگرمی کے ذریعے ہوتا ہے جس میں ڈبل بروموڈومین ہوتا ہے اور یہ ہسٹون ایسیٹیلیشن کی بہت کم سطح کا پتہ لگا سکتا ہے۔ ٹی اے ایف 1 ایسیٹیلیشن کا پتہ لگاتا ہے اور پھر ایسیٹیلیٹڈ خطے میں نقل کے عوامل کو بھرتی کرتا ہے۔ ایسیٹیلیشن اکثر پروموٹر علاقوں کے قریب ہوتا ہے اور اسے ٹی اے ایف 1 کے ذریعہ تسلیم کیا جاتا ہے جو ٹی ایف آئی آئی ڈی کو اس خطے میں جوڑتا ہے تاکہ ٹی ایف آئی آئی ڈی کے بنیادی پروموٹر کا پتہ لگانے اور نقل شروع کرنے کے امکان کو بڑھایا جا سکے۔ ٹی اے ایف 1 ایچ اے ٹی (ہسٹون ایسیٹیل ٹرانسفرس) کے طور پر بھی برتاؤ کرتا ہے اور بڑھتی ہوئی تعدد پر قریبی ہسٹونز کو ایسیٹلیٹ کرتا ہے۔ ایسیٹیلیشن ڈی این اے میں جابرانہ نشانات کے اضافے کو بھی روکتا ہے۔ عام طور پر، ہسٹون ڈیسیٹیلسیس (ایچ ڈی اے سی) ہسٹون کے لائسین کے باقیات سے ایسیٹیل گروپوں کو ہٹانے کا کام کرتے ہیں جس کی وجہ سے جین کے اظہار میں کمی واقع ہوتی ہے۔ ایچ ڈی اے سی سرگرمی آٹومیمون بیماریوں کی بیماری میں شامل ہے، جیسے کہ ریومیٹائڈ گٹھیا میں جہاں سینوویل ٹشوز میں ایچ ڈی اے سی کی سرگرمی کم ہوتی ہے۔ ہسٹون میتھیلیشن بھی آٹومیمون عوارض میں ملوث ہے۔ یہ ہسٹون میتھیلیشن کی روک تھام سے ہو سکتا ہے جیسے کہ سسٹمیٹک سکلیروسیس میں یا ٹائپ I ذیابیطس میں مخصوص جین لوکی پر ایلیویٹڈ ہسٹون میتھیلیشن کے ذریعے۔ ہسٹون میں ترمیم گٹھیا، اینڈوکرائنولوجیکل، اور معدے کی آٹومیمون عوارض کو جنم دے سکتی ہے۔ ہسٹون ترمیم عوارض کے لحاظ سے جین کے اظہار کو چالو کرنے یا دبانے کا باعث بنتی ہے۔ سوبرانیلو ہائیڈروکسامک ایسڈ (ایس اے ایچ اے)، جسے وورینوسٹیٹ بھی کہا جاتا ہے، ایچ ڈی اے سی کی سرگرمی کو روکتا ہے۔ وورینوسٹیٹ نے مدافعتی نظام کی خرابی کے علاج کے طور پر وعدہ ظاہر کیا ہے۔ وورینوسٹیٹ، ایچ ڈی اے سی کو روک کر، جلد کے ٹی سیل لیمفوما کا علاج کر سکتا ہے۔ اگرچہ آٹومیمون گٹھیا کے عوارض کے لیے ایپیجینیٹکس پر مبنی علاج ابھی موجود نہیں ہے، ٹی سیل لیمفوما کے علاج میں وورینوسٹیٹ کا فنکشن آٹومیمون گٹھیا کے عوارض کے ایپیجینیٹکس پر مبنی علاج کی راہ کی بنیاد ہے۔ غیر کوڈنگ آر این اے مائیکرو-آر این اے (ایم آئی آر این اے) مائیکرو-آر این اے (ایم آئی آر این اے) چھوٹے آر این اے کے ٹکڑے ہوتے ہیں، جن کی لمبائی 18-23 نیوکلیوٹائڈز ہوتی ہے، جو ٹرانسکرپشن کے بعد جین کے اظہار کو منظم کرنے کا کام کرتے ہیں۔ ایم آئی آر این اے مدافعتی ردعمل کو تبدیل کرنے میں اہم کردار ادا کرتے ہیں کیونکہ وہ اس بات پر اثر انداز ہوتے ہیں کہ آیا مخصوص مدافعتی سے متعلق جینوں سے نقل شدہ ایم آر این اے پروٹین میں ترجمہ ہوگا یا نہیں۔ مختلف ایم آئی آر این اے کی سطحوں میں تبدیلی آٹو امیون بیماری کے پیتھوجینسیس اور علامات سے وابستہ ہے۔ عارضے پر منحصر ہے، ایک مخصوص قسم کے ایم آئی آر این اے کی اپ ریگولیشن یا ڈاؤن ریگولیشن کا مشاہدہ کیا جا سکتا ہے۔ ایم آئی آر این اے منفی طور پر 3 'غیر ترجمہ شدہ خطے (3' یو ٹی آر) کے اندر تکمیلی ایم آر این اے ترتیبات کو پابند کرکے جین کے اظہار کو منظم کرتے ہیں۔ ایم آئی آر این اے سرگرمی کا یہ عمل آر این اے پولیمریز II کے ذریعہ نیوکلئس میں پری-ایم آئی آر این اے کی ترکیب سے شروع ہوتا ہے جسے پھر پری-ایم آئی آر این اے میں تبدیل کیا جاتا ہے۔ یہ پری-ایم آئی آر این اے نیوکلئس سے باہر نکلتا ہے اور ڈیسر کے ذریعے ڈبل اسٹرینڈڈ آر این اے میں کاٹا جاتا ہے جس میں سے ایک اسٹرینڈ آر آئی ایس سی کمپلیکس سے جڑا ہوتا ہے۔ یہ بائنڈنگ اس کے ہدف ایم آر این اے ترتیب کے ساتھ ایم آئی آر این اے کی ایسوسی ایشن کا باعث بنتی ہے اور ایم آر این اے کے انحطاط کی حوصلہ افزائی کرتی ہے یا ایم آر این اے کے ترجمہ کو دبانے سے جین کے اظہار میں کمی آتی ہے۔ ایم آئی آر این اے آر این اے-انڈیوسڈ ٹرانسکرپشنل سائلنسنگ (آر آئی ٹی ایس) کمپلیکس کے بائنڈنگ کے ذریعے جین کے اظہار کو بھی متاثر کر سکتا ہے۔ آر آئی ٹی ایس کمپلیکس کا ایم آئی آر این اے سے پابند ہونا ٹرانسکرپشن کے بعد ہسٹون میں ترمیم جیسے کہ میتھیلیشن کو جین کے اظہار کو مزید تبدیل کرنے کی اجازت دیتا ہے۔ لانگ نان کوڈنگ آر این اے (ایل این سی آر این اے) لانگ نان کوڈنگ آر این اے کی شناخت جین کے اظہار میں اہم کردار ادا کرنے والے کے طور پر بھی کی گئی ہے۔ یہ ایل این سی آر این اے آر این اے ہیں جو لمبائی میں 200 سے زیادہ نیوکلیوٹائڈز ہوتے ہیں لیکن کسی فعال پروٹین میں نقل نہیں ہوتے ہیں۔ ان کی شناخت ڈسکوئڈ لوپس اریتھیمیٹوسس اور ریومیٹائڈ گٹھیا جیسی بیماریوں کے ایپیجینٹکس میں کردار ادا کرنے کے لیے کی گئی ہے۔ ایک طریقہ جس کے ذریعے ایل این سی آر این اے جین کے اظہار کو منظم کرتے ہیں وہ ایکس غیر فعال ہونے کے عمل کے ذریعے ہے جو خوراک معاوضہ فراہم کرنے کے طریقے کے طور پر کام کرتا ہے۔ ایکس-ان ایکٹیویشن میں، زسٹ (ایکس-ان ایکٹیو مخصوص ٹرانسکرپٹ) ایل این سی آر این اے نقل کیا جاتا ہے اور زی کروموسوم کو کوٹ کرتا ہے جو غیر فعال ہو جائے گا، اس ایکس کروموسوم پر کروموسوم کے ارتکاز اور جینوں کے جبر کا عمل شروع ہوتا ہے۔ پھر بھی، جین کے اظہار کو منظم کرنے کے لیے ان ایل این سی آر این ایز کے استعمال کردہ طریقہ کار کو مزید سمجھنے کے لیے مزید تحقیق کی ضرورت ہے۔ نظامی آٹومیمون بیماریاں وہ ہیں جو ایک ہی قسم کے ٹشو یا اعضاء کے نظام کو نشانہ بنانے کے بجائے متعدد اعضاء کے نظام کو متاثر کرتی ہیں۔ ریمیٹائڈ گٹھیا (آر اے) ریمیٹائڈ گٹھیا ایک انحطاطی آٹومیمون بیماری ہے جو مریض کے جوڑوں کو نقصان اور سوزش کا سبب بنتی ہے۔ گلوبل ڈی این اے ہائپومیتھیلیشن ریمیٹائڈ آرتھرائٹس کی ایک پہچان ہے اور اس بیماری کے ابتدائی مراحل میں مشاہدہ کیا جاتا ہے، جب جوڑوں کا انحطاط شروع ہوتا ہے۔ جو لوگ آر اے کا شکار ہوتے ہیں ان میں ڈی این اے کے بہت سے فروغ دینے والے علاقوں میں میتھیلیشن کی عالمی سطح میں کمی واقع ہوتی ہے جن میں عام مدافعتی نظام اور مشترکہ افعال سے وابستہ علاقے بھی شامل ہیں۔ ہائپومیتھیلیشن سے یہ حد سے زیادہ اظہار مختلف جینوں جیسے آئی ٹی جی ایل، سی ڈی 40 ایل جی، پی آر ایف 1، اور بہت کچھ میں دیکھا جاتا ہے۔ آر اے میں مبتلا افراد پر گہری نظر ڈالتے ہوئے، یہ مشاہدہ کیا جا سکتا ہے کہ سینوویل خلیوں کے اندر، ہائپومیتھیلیشن کی ایک سطح ہوتی ہے جو سائٹوکائنز کے اظہار اور زیادہ پیداوار کا سبب بنتی ہے جو سینوویل سیال کے اندر سوزش کا سبب بننے والے سوزش کے ردعمل کو برقرار رکھتی ہے، جو کہ جوڑوں کے درمیان موجود سیال ہے۔ سی ڈی 40 ایل جی کا ہائپومیتھیلیشن، جو ٹی خلیوں کو مدافعتی ردعمل کے اندر بنائے گا، ٹی سیل کے حد سے زیادہ اظہار کا باعث بن سکتا ہے اور سوزش کے ردعمل میں ریمیٹائڈ گٹھیا کے کام کرنے میں ایک معاون عنصر بن جاتا ہے۔ آر اے کے مریض اکثر اینٹی سائیکلک سائٹرلینیٹڈ پیپٹائڈ (اینٹی سی سی پی) اینٹی باڈیز دکھاتے ہیں اور ان میں ریٹو ٹرانسپوسن جین ایل 1 کا ہائپومیتھیلیشن ہوتا ہے، ساتھ ہی ساتھ آئی ایل 6 اور ای آر اے پروموٹر میں میتھیلیشن میں کمی واقع ہوتی ہے۔ ٹی ای ٹی پروٹین، خاص طور پر ٹی ای ٹی 1-ٹی ای ٹی 3 انزائم اور ٹی خلیوں میں ٹی ای ٹی 2 ڈی میتھیلیٹ ڈی این اے کر سکتے ہیں جو آر اے کے ابتدائی مراحل کو ترتیب دینے اور واضح کرنے میں مدد کرتا ہے۔ مریض میں ہسٹون کے ڈی میتھیلیشن سے آر اے کی نشوونما آئی ایل-6 کی اعلی سطح کے اظہار کا باعث بن سکتی ہے جو جوڑوں میں تباہی کا سبب بنتی ہے۔ می آر این اے گٹھیا کی نشوونما میں بھی اہم کردار ادا کرتے ہیں، خاص طور پر می آر این اے-246 اے اور می آر این اے-150 کی اپ ریگولیشن۔ اگرچہ مزید تحقیق کی ضرورت ہے، لیکن اس بیماری میں ایک کردار ادا کرنے کے لیے ایل این سی آر این اے کو شامل کیا گیا ہے کیونکہ اس عارضے کے لیے استعمال ہونے والے موجودہ علاج ٹوسیلیزوماب اور اڈالیماماب پر آر اے کے مریضوں میں 85 مختلف ایل این سی آر این اے کے تبدیل شدہ اظہار کو ظاہر کرتے ہیں۔ سسٹمیٹک لیوپس erythematosus (SLE) سسٹمیٹک لیوپس erythematosus لیوپس کی سب سے عام شکل ہے اور یہ ایک ایسی حالت ہے جس میں مدافعتی نظام صحت مند جسمانی بافتوں پر حملہ کرتا ہے جس کی وجہ سے بہت سے اعضاء کے نظام میں وسیع پیمانے پر سوزش اور بافتوں کو نقصان پہنچتا ہے۔ ہائپومیتھیلیشن کا مشاہدہ پورے ایپیجینوم میں ان لوگوں میں کیا جاتا ہے جن میں سسٹمیٹک لیوپس ہوتا ہے۔ آئی ٹی جی ایل، سی ڈی 40 ایل جی، اور سی ڈی 70 سمیت بہت سے جینوں کے فروغ دینے والے علاقوں کو ہائپومیتھیلیٹڈ ہونے کے ساتھ ساتھ 18 ایس اور 28 ایس رائبوسومل جین پروموٹرز دکھایا گیا ہے۔ خاص طور پر، یہ ڈی این اے ہائپومیتھیلیشن ٹی خلیوں کے کرومیٹن ڈھانچے کو تبدیل کرنے کے بارے میں سوچا جاتا ہے جو اس حالت میں مبتلا افراد میں مشاہدہ کردہ مدافعتی اور سوزش کے ردعمل کو بڑھاتا ہے۔ جینوم وسیع یہ دکھایا گیا ہے کہ جب ایک جیسے جڑواں بچوں کے جوڑوں کے ایپیجینومز کا موازنہ کیا جاتا ہے جس میں ایک جڑواں بچہ اس حالت سے متاثر ہوتا ہے اور ایک نہیں ہوتا ہے، تو یہ حالت رکھنے والے جڑواں بچے اپنے جینوموں کی میتھیلیشن میں عالمی سطح پر کمی کو ظاہر کرتے ہیں۔ یہ ہائپو میتھیلیشن ان جینوں کا سبب بنتا ہے جو روایتی طور پر میتھیلیشن کے ذریعے دبے ہوئے ہوتے ہیں اور خاص طور پر سی ڈی 4 + ٹی خلیوں میں حد سے زیادہ ظاہر ہوتے ہیں۔ یہ تجویز کیا گیا ہے کہ ڈی این ایم ٹی 1 کی روک تھام نظامی لیوپس سے متاثرہ افراد میں مشاہدہ کردہ میتھیلیشن کے نقصان کو پیدا کرتی ہے۔ ڈی این ایم ٹی 1 ایک ڈی این اے میتھائل ٹرانسفرس ہے جو ڈی این اے کی نقل کے عمل میں میتھیلیشن کے نمونوں کو برقرار رکھتا ہے، اس بات کو یقینی بناتا ہے کہ ڈی این اے کی نئی کاپیاں اصل پیرنٹ اسٹرینڈ پر مشاہدہ کردہ میتھیلیشن پیٹرن پر مشتمل ہوں۔ ڈی این ایم ٹی 1 کی روک تھام سے میتھیلیشن کے نمونے نسلوں میں ختم ہو جاتے ہیں اور اس کے نتیجے میں ایپیجینوم وسیع ہائپومیتھیلیشن کا مشاہدہ کیا جاتا ہے۔ خاص طور پر، یہ مشاہدہ کیا گیا ہے کہ مدافعتی ٹی خلیوں میں ڈی این ایم ٹی 1 کا اظہار کم ہوتا ہے۔ سسٹمیک سکلیروسیس (ایس ایس سی) سسٹمیک سکلیروسیس (ایس ایس سی) ایک آٹومیمون بیماری ہے جس کی خصوصیت نظام میں زیادہ کولیجن کے ذخائر ہیں۔ یہ جوڑوں اور مختلف اندرونی اعضاء کے نظام پر ایکسٹرا سیلولر میٹرکس پروٹین کے بے قابو جمع ہونے کی وجہ سے مریض کی جلد اور مربوط بافتوں کو سخت اور سخت کرنے کا سبب بنتا ہے جو مریضوں میں قبل از وقت موت کا باعث بن سکتا ہے۔ فلائی 1 ایک ٹرانسکرپشن عنصر ہے جو کولیجن کی پیداوار کو منفی طور پر منظم کرتا ہے جیسے کہ فلائی جین کا اظہار جتنا زیادہ ہوگا، کولیجن اتنا ہی کم پیدا ہوگا۔ ایس ایس سی مریضوں میں، فلائی 1 پروموٹر خطے میں سی پی جی جزائر کی ہائپر میتھیلیشن کا مشاہدہ کیا جاتا ہے، جو فلائی جین کی نقل کو روکتا ہے اور عام سطح سے آگے کولیجن کی پیداوار میں اضافہ کرتا ہے جس کی وجہ سے کولیجن کی تعمیر اور ریشے دار کنیکٹو ٹشو کی زیادہ پیداوار ہوتی ہے۔ اس سے جوڑوں کو نقصان پہنچتا ہے، داغ پڑتے ہیں اور جلد موٹی ہو جاتی ہے۔ ایس ایس سی کے مریضوں میں ان کے سی ڈی 4 + ٹی خلیوں میں ڈی این اے میتھائل ٹرانسفرسز (ڈی این ایم ٹی) کی سطح میں کمی بھی دیکھی جاتی ہے جو مدافعتی نظام میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ یہ کم شدہ میتھیلیشن مدافعتی بیماری اور ایس ایس سی کی ترقی اور اس کے سوزش کے اثرات سے وابستہ ہے، تاہم اس مضمرات کو مزید سمجھنے کے لیے مزید تحقیق کی ضرورت ہے۔ سسٹمیٹک سکلیروسیس کے مریض کولیجن جینز COL23A1 اور COL4A2 کی ہائپومیتھیلیشن بھی ظاہر کرتے ہیں۔ ان کولیجن جینوں کا یہ حد سے زیادہ اظہار کولیجن کی خصوصیت کی زیادہ پیداوار کو ٹشو فائبروسس کی طرف لے جاتا ہے۔ ٹی جی ایف-β سگنلنگ پاتھ وے اور ڈبلیو این ٹی/β-کیٹینن سگنلنگ پاتھ وے بھی اس بیماری میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ ٹی جی ایف-β سگنلنگ کا راستہ جسم میں مدافعتی ردعمل کے اندر ہومیوسٹاسس کو منظم کرنے کے لیے خلیوں کی تفریق اور خلیوں کی نشوونما میں نقل مکانی سے کئی سیلولر ردعمل کے لیے ذمہ دار ہے۔ ٹی جی ایف-β سگنلنگ کا راستہ فائبر بلاسٹ کی اس سرگرمی میں شامل ہے جو فائبراسس سے پہلے ہوتا ہے۔ جین، آئی ٹی جی اے 9 جو الفا انٹیگرن 9 کے لیے کوڈ کرتا ہے اور اس راستے میں شامل ہوتا ہے، اس حالت میں ان لوگوں میں ہائپومیتھیلیٹڈ ہوتا ہے جس کی وجہ سے انٹیگرن کا زیادہ اظہار ہوتا ہے جو فائبروسس کا باعث بنتا ہے اور اس راستے کو مثبت فیڈ بیک فراہم کرتا ہے جو فائبرو بلاسٹ ایکٹیویشن کی مزید حوصلہ افزائی کرتا ہے۔ انٹیگرن ایک قسم کا رسیپٹر ہے جو ایک ٹرانس میمبرین رسیپٹر ہے جس کا مطلب ہے کہ یہ ایک خلیے سے دوسرے خلیے میں بات چیت کرنے کے قابل ہے اور خلیے کو قریبی خلیوں سے منسلک ہونے اور ان پر قائم رہنے میں مدد کرتا ہے۔ مقامی ڈرمیٹولوجیکل آٹومیمون عوارض ڈسکوئڈ لوپس اریتھیمیٹوسس (ڈی ایل ای) ڈسکوئڈ لوپس اریتھیمیٹوسس جلد کی ایک بیماری ہے جس کی خصوصیت مدافعتی نظام کے ذریعہ صحت مند ایپیڈرمل ٹشو پر حملہ ہوتا ہے جس کی وجہ سے جلد پر زخم، سوزش اور دھبے پڑتے ہیں۔ اس کے نتیجے میں روغن میں تبدیلیاں، جلد پر داغ پڑنے کے ساتھ ساتھ بالوں کے گرنے کا امکان بھی پیدا ہو سکتا ہے۔ ایل این سی آر این ایز اور سرک آر این ایز کا متفرق اظہار، جس کی شناخت ژوان اور دیگر کے مطالعے میں کی گئی ہے۔ ، میوکوسا کو تبدیل کریں، جو کہ ایپیڈرمس کا اندرونی پرت اور نم حصہ ہے جیسے کہ منہ اور ناک کے اندر ؛ ڈی ایل ای سے متاثر ہونے والا یہ تفریق اظہار اس ٹشو کو بعض اوقات سوجن اور کرسٹ ہونے کا سبب بنتا ہے۔ میوکوسا اس بیماری کی بیماری میں ایک اہم حصہ کے طور پر کام کرتا ہے۔ ایل این سی آر این اے اور سرک آر این اے جیسے نقل موجود ہیں جن کا اظہار ڈی ایل ای والے افراد کے متاثرہ بافتوں میں پایا گیا ہے۔ یہ نقل غیر متاثرہ صحت مند بافتوں کو کنٹرول کرنے کے مقابلے میں ڈی ایل ای سے متاثرہ افراد کے بافتوں میں زیادہ کثرت سے ظاہر کیے گئے تھے۔ اظہار شدہ ایل این سی آر این اے اور سرک آر این اے کا نمونہ ڈی ایل ای کے متاثرہ بافتوں اور صحت مند غیر متاثرہ بافتوں کے خلاف امتیازی سلوک کرنے میں مدد کرتا ہے جو حوالہ کے لیے قابل استعمال نمونہ قائم کرتا ہے۔ مزید برآں، ایل این سی آر این اے کے فنکشن اور اظہار کے تجزیے کے ذریعے دریافت کیا گیا، ایل این سی آر این اے کا تعلق آئی ایل 19، سی ایکس سی ایل 1، سی ایکس سی ایل 11، اور ٹی این ایف ایس ایف 15 کے اظہار سے ہے جو سبھی مدافعتی ردعمل سے متعلق ہیں جس سے اس راستے کی نشاندہی کرنے میں مدد ملتی ہے جس میں ڈی ایل ای کو انکرنا کے غیر معمولی اظہار سے مقامی طور پر ظاہر کیا جاتا ہے۔ مطالعہ کا ایک اور اہم حصہ ژوان اور دیگر کے ذریعہ انجام دیا گیا۔ ڈی ایل ای میں شامل بہت سے ٹارگٹ جینز کے ضابطے کو متاثر کرنے کے لیے ذمہ دار ایک کلیدی ٹرانسکرپشن عنصر کے طور پر ایس ٹی اے ٹی 4 کی شناخت تھی۔ ایس ٹی اے ٹی 4 ایک بہت اہم ٹرانسکرپشن فیکٹری ہے کیونکہ اس کا تعلق پیتھوجینسیس سے ہے اور یہ ڈی ایل ای کی ترقی ہے، ایس ٹی اے ٹی 4 جین کے بہت سے اہداف کو ترقی میں شامل مختلف فعال راستوں کو تقویت دینے کے لیے کام کرتے ہوئے دیکھا گیا ہے۔ psoriatic arthritis (PSA) psoriasis جلد کی ایک سوزش کی حالت ہے جس کی خصوصیت ٹی سیل ایکٹیویشن اور جلد کے خلیوں کی زیادہ پیداوار کی وجہ سے جلد پر سکلی ریڈ پیچ کی نشوونما ہے۔ سوراسس کو پلاک سوراسس اور سورائٹک گٹھیا میں توڑا جا سکتا ہے۔ سورائٹک گٹھیا پلاک سوراسس سے مختلف ہے کیونکہ سورائٹک جلد کے زخموں کے ساتھ سوزش، جوڑوں کا درد، اور جوڑوں کی سختی بھی ہوتی ہے جو سوراسس سے پیدا ہونے والی مدافعتی نظام کی پیچیدگی سے منسوب ہوتی ہے۔ سورائٹک گٹھیا کے مریض مدافعتی ریگولیٹڈ سائٹوکائنز اور کیموکائنز کی اعلی سطح کا اخراج کرتے ہیں۔ یہ دکھایا گیا ہے کہ ایپیجینٹکس میں تبدیلیاں اس حالت کی علامات اور پیتھوجینسیس میں نمایاں کردار ادا کرتی ہیں۔ ایم آئی آر این اے کے اظہار کی سطحوں میں تبدیلیاں بہت سی ایپیجینیٹک تبدیلیوں میں سے ایک ہیں جو اس بیماری کے آغاز کے ساتھ ہوتی ہیں۔ خاص طور پر، سورائٹک گٹھیا کے مریضوں میں ایم آئی آر این اے-203 کی سطح کم ہو جاتی ہے اور اس کا تعلق سورائسس پیتھوجینسیس سے ہے۔ مائی آر این اے-203 سائٹوکائن سگنلنگ 3 (ایس او سی 3) کے دبانے والوں کو نشانہ بنانے کے لیے ذمہ دار ہے اور اس بات کو یقینی بناتا ہے کہ مدافعتی ردعمل کو قابو میں رکھا جائے۔ تاہم، جب ایم آئی آر این اے-203 کی سطح کم ہوتی ہے، تو سائٹوکائن سگنلنگ اعلی سطح پر ہوتی ہے جس کی وجہ سے مدافعتی ردعمل بڑھ جاتا ہے۔ ایک ایسا علاج تیار کرنا جو ایم آئی آر این اے-203 کی سطح کو بڑھا سکتا ہے، اس حالت کے مریضوں میں پائے جانے والے سوزش مدافعتی ردعمل کو کم کرنے کے طریقے کے طور پر شامل کیا گیا ہے۔ سوراسس کے مریضوں میں ایچ ڈی اے سی اور ایچ اے ٹی کا غیر معمولی اظہار بھی دیکھا گیا ہے۔ پردیی خون کے مونو نیوکلیئر خلیات، جو مدافعتی نظام کے خلیوں کا مجموعہ ہیں، psoriasis کے مریضوں میں ہسٹون 4 کے ایسیٹیلیشن میں عالمی سطح پر کمی کے ساتھ ساتھ ایچ ڈی اے سی-1 کی سطح میں اضافہ ظاہر کرتے ہیں۔ ایچ ڈی اے سی انفیکٹرز کی شناخت psoriasis کے ساتھ ساتھ بہت سے دیگر سوزش آٹومیمون عوارض کے ممکنہ علاج کے طور پر کی گئی ہے۔ سجوگرنس سنڈروم ایک ڈرمیٹولوجیکل آٹومیمون ڈس آرڈر ہے جو لیکریمل اور تھوک غدود پر حملہ کرتا ہے جس کی وجہ سے آنسوؤں اور تھوک کے سراو میں کمی واقع ہوتی ہے۔ اس کے نتیجے میں سوزش، آنکھیں خشک اور منہ خشک ہو جاتا ہے۔ اس حالت کے مریضوں کو تھوک غدود میں سفید خون کے خلیوں کی تشکیل کا تجربہ ہوتا ہے جسے لیمفوسیٹک انفلٹریٹ کہا جاتا ہے۔ موجودہ تحقیق بڑی حد تک ان بیماریوں کے پیتھوجینسیس میں پیدائشی مدافعتی نظام کے کردار پر مرکوز ہے۔ سجرجن کے مریضوں میں، پی بی ایم سی میں ایم آئی آر این اے-246 اے کو اپ ریگولیٹ کیا جاتا ہے اور یہ اس بیماری کے پیتھوجینسیس سے وابستہ ہے۔ ایم آئی آر این اے-246 اے ٹول نما رسیپٹر (ٹی ایل آر) سگنلنگ کو منفی فیڈ بیک فراہم کرکے مدافعتی نظام کو منظم کرنے میں اہم کردار ادا کرتا ہے جو پیدائشی مدافعتی ردعمل کو شامل کرنے کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ جب ایم آئی آر این اے-246 اے کو اپ ریگولیٹ کیا جاتا ہے، تو ٹی ایل آر سگنلنگ کے لیے یہ منفی ردعمل کم ہو جاتا ہے جس کی وجہ سے سوزش اور مدافعتی ردعمل بڑھ جاتا ہے جو صحت مند خلیوں کو نقصان پہنچا سکتا ہے جیسے کہ لیکریمل اور لالی غدود میں۔ می آر این اے-150 اور می آر این اے-149 بھی سجرجن کے مریضوں کے تھوک غدود اور لیمفوسائٹس میں ریگولیٹ ہوتے ہیں۔ یہ ایم آئی آر این اے ایم آر این اے کو نشانہ بناتے ہیں جو مدافعتی فنکشن اور سوزش سے متعلق سائٹوکائن کی سطح کو منظم کرنے میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ ان ایم آئی آر این ایز کا حد سے زیادہ اظہار اس طرح ایک بلند اور غیر منظم مدافعتی ردعمل کا باعث بنتا ہے۔ اس حالت میں مدافعتی نظام میں سی ڈی 4 + ٹی سیل کے جینوں میں ایپیجینیٹک تبدیلیاں بھی مشاہدہ کی جاتی ہیں۔ خاص طور پر، تحقیق نے سی ڈی 70، ایک ٹی سیل کاسٹیومولیٹری جین کے ہائپومیتھیلیشن کو سجوگرین سنڈروم کی نشوونما سے جوڑا ہے۔ ایف او ایکس پی 3 جین کا کم اظہار، جو ڈی این اے ہائپر میتھیلیشن کا باعث بنتا ہے، ان سی ڈی 4 + ٹی خلیوں میں بھی دیکھا جاتا ہے۔ یہ سی پی جی ہائپر میتھیلیشن کا سبب بنتا ہے جس کی وجہ سے بہت سے خلیات کو کم کیا جاتا ہے جو مدافعتی نظام کو قابو میں رکھنے کے لیے ضروری ہیں۔ مقامی اینڈوکرائنولوجیکل آٹومیمون عوارض ہاشیموٹو کا تھرایڈائٹس ہاشیموٹو کا تھرایڈائٹس ایک اینڈوکرائن بیماری ہے جس میں مریض کا مدافعتی نظام ان کے تھرایڈ غدود پر حملہ کرتا ہے۔ ہاشیموٹو کا تھائرایڈائٹس عام طور پر ہائپوتھائیرایڈزم کے ذریعے ظاہر ہوتا ہے، جس کی خصوصیت تھائرایڈ میں سفید خون کے خلیوں کی تعمیر اور تھائرایڈ آٹو اینٹی باڈیز کی پیداوار ہے۔ تحقیق سے پتہ چلتا ہے کہ جب ہاشیموٹو کے تھائرایڈائٹس جیسی آٹو امیون تھائرایڈ کی بیماریوں کے ساتھ ساتھ ہاشیموٹو کے تھائرایڈائٹس کی پیتھولوجی میں ایک ایپیجینیٹک کردار کی بات آتی ہے تو ایک مضبوط جینیاتی حساسیت ہوتی ہے۔ تھائروگلوبلین (ٹی جی) جین، ایک جین جو تھائیرائڈ ہارمونز، تھائروکسین اور ٹرائیوڈوتھیرونائن کی ترکیب میں شامل ہوتا ہے، ہاشیموٹو کے تھائیرائڈائٹس کے پیتھوجینسیس میں اہم کردار ادا کرتا ہے۔ ہاشیموٹو کے مریضوں میں، تھروگلوبلین (ٹی جی) پروموٹر میں ہسٹون میتھیلیشن پیٹرن میں تبدیلی سے جین کے اظہار میں کمی واقع ہوئی ہے اور اس طرح تھائیرائڈ ہارمونز کی پیداوار میں کمی واقع ہوئی ہے۔ آئی آر ایف-1 ٹی جی کے لیے نقل کا ایک عنصر ہے جس کی بائنڈنگ ہسٹون میتھیلیشن پیٹرن سے متاثر ہوتی ہے۔ سکویڈ ایکس کروموسوم کی غیر فعالیت کو آٹو امیون تائیرائڈ کی بیماریوں میں بھی شامل کیا گیا ہے۔ ایکس کروموسوم کی غیر فعالیت ایک ایسا عمل ہے جس کے ذریعے خواتین میں دو ایکس کروموسوم میں سے ایک کو نقل شدہ طور پر غیر فعال ہیٹروکرومیٹن میں تبدیل کر کے خاموش کر دیا جاتا ہے۔ سکویڈ ایکس کروموسوم کی غیر فعالیت غیر فعال ہونے کی مقدار میں عدم توازن ہے جو زچگی اور پدرانہ ایکس کروموسوم کے درمیان ہوتا ہے جس کی وجہ سے ایک ایکس کروموسوم دوسرے کے مقابلے میں اظہار کی حمایت کرتا ہے۔ گریوز اور ہاشیموٹو کی بیماری کے مطالعے میں، ایک ہی ٹشو میں ایک ایکس کروموسوم کی طرف دوسرے پر ایکس کروموسوم کی غیر فعالیت کا رخ گریوز یا ہاشیموٹو کی بیماری کے بغیر کنٹرول کے مقابلے میں نمایاں طور پر زیادہ ہے۔ تاہم، یہ واضح نہیں ہے کہ ایک ایکس کروموسوم کے ترجیحی اظہار سے ان بیماریوں کا خطرہ کیوں بڑھ جاتا ہے۔ ایک مطالعہ میں سکویڈ ایکس کروموسوم ایکٹیویشن نے اسے ایک ہی ٹشو میں ایک ایکس کروموسوم کے دوسرے پر ایکٹیویشن کا 80:20 تناسب قرار دیا۔ ٹرنر سنڈروم میں، ایک کروموسومل اسامانیتا جس میں ایک شخص ایکس کروموسوم مونوسومی ظاہر کرتا ہے، مریضوں کو آٹو امیون تھائیرائڈ بیماری ہونے کا بہت زیادہ خطرہ ہوتا ہے کیونکہ ان کا جینوٹائپ ایکس کروموسوم کی غیر فعالیت کی ایک انتہائی شکل کی نقل کرتا ہے کیونکہ صرف ایک ایکس کروموسوم ہوتا ہے جس کا اظہار کیا جا سکتا ہے۔ اگرچہ کوئی قطعی طریقہ کار موجود نہیں ہے جس کے ذریعے سکویڈ ایکس کروموسوم کی غیر فعالیت آٹو امیون تھائرائڈ بیماری کو متاثر کرتی ہے، لیکن ایک امکان کا مطالعہ کیا جا رہا ہے کہ تھائمس میں سکویڈ ایکس سی آئی تھائمک اظہار کی کمی کا باعث بن سکتا ہے، جو بالآخر ناکافی ٹی سیل کے خاتمے کا باعث بنتا ہے۔ ایکس کروموسوم کی غیر فعالیت ایک عام اور وسیع پیمانے پر مطالعہ شدہ ایپیجینیٹک رجحان ہے۔ گریوز ڈیزیز گریوز ایک آٹومیمون بیماری ہے جس میں تھائروٹوکسکوسس شامل ہوتا ہے، جس میں جسم تھائیرائڈ ہارمون کی زیادہ پیداوار سے متاثر ہوتا ہے جس کے نتیجے میں مدافعتی نظام تھائیرائڈ غدود پر حملہ کرتا ہے۔ تائیرائڈ ہارمون کی زیادہ پیداوار کو ہائپرتھائیرائڈزم کہا جاتا ہے۔ تھائروٹوکسکوسس ہائپرتھائیرائڈزم، تھائیرائڈائٹس اور دیگر حالات کی وجہ سے ہو سکتا ہے۔ یہ عام طور پر امیونوگلوبلین اینٹی باڈیز میں اضافے کی وجہ سے ہوتا ہے جو تائیرائڈ کو متحرک کرنے والے ہارمون ریسیپٹر کو چالو کرتے ہیں۔ ہاشیموٹو کے تائیرائڈائٹس کی طرح، گریوز کی بیماری ایک آٹو امیون تائیرائڈ بیماری کے طور پر اہل ہے۔ ہاشیموٹو کے تھائرایڈائٹس میں شامل ایپیجینیٹک عمل بھی گریوز کی بیماری میں شامل ہیں۔ یعنی، یہ ٹی جی میں ہسٹون میتھیلیشن کی ترمیم اور سکویڈ ایکس کروموسوم کی غیر فعالیت ہیں۔ گریوز کی بیماری کے مخصوص معاملے میں، بعض سی پی جی سائٹس پر غیر معمولی ڈی این اے میتھیلیشن کی شمولیت کو ظاہر کرنے والی دریافتیں کی گئی ہیں۔ یہ غیر معمولی ڈی این اے میتھیلیشن گریوز کی بیماری کے معاملات میں انٹرفیرون سگنلنگ اور دیگر غیر منظم مدافعتی نظام سے متعلق عمل کا باعث بنتی ہے۔ مدافعتی خلیوں میں ظاہر ہونے والے بہت سے جینوں کے سی پی جی پروموٹر علاقوں کو گریوز بیماری کے مریضوں کے ایپیجینیٹک تجزیے میں ہائپومیتھیلیٹڈ دکھایا گیا ہے، جس کا مطلب ہے کہ یہ جین ان مدافعتی خلیوں میں زیادہ ظاہر ہوتے ہیں۔ مثال کے طور پر، حال ہی میں گریوز کی بیماری کی تشخیص ہونے والے مریضوں میں سی ڈی 40 ایل پروٹین کی سطح زیادہ پائی جاتی ہے۔ یہ دکھایا گیا ہے کہ سی ڈی 40 ایل جین میں ہائپومیتھیلیشن کا مشاہدہ کیا جاتا ہے۔ یہ جین سی ڈی 40 لگینڈ پروٹین کے لیے کوڈ کرتا ہے جو سی ڈی 40 رسیپٹر کو باندھتا ہے اور یہ بائنڈنگ مدافعتی ردعمل کو متحرک کرتی ہے۔ اس طرح اس جین کے حد سے زیادہ اظہار کو آٹو امیون ثالثی ہائپرتھائیرائڈزم کے آغاز سے منسوب کیا گیا ہے۔ مزید برآں، گریوز کی بیماری والے افراد میں پردیی خون کے مونو نیوکلیئر خلیوں میں ہسٹون میتھیلیشن غیر معمولی ہے۔ یہ اسامانیتا، جو ہائپر میتھیلیشن کے طور پر ظاہر ہوتی ہے، ایپیجینیٹک ماڈیفایر جینز جیسے کہ سی ڈی 3 جین فیملی میں مشاہدہ کی جاتی ہے جو ٹی سیل کے رویے کے ساتھ ساتھ دیگر مدافعتی فنکشن جینز کے اظہار کو بھی منظم کرتی ہے۔ اس کے نتیجے میں گریوز کی بیماری والے افراد میں سی ڈی 3 جین خاندان کے افراد کے اظہار میں کمی واقع ہوتی ہے۔ مزید برآں، کچھ غیر کوڈنگ آر این اے کے تفریق اظہار کو حال ہی میں گریوز کی بیماری کی نشوونما میں شامل کیا گیا ہے، تاہم مزید تحقیق کی ضرورت ہے۔ یہ غیر کوڈنگ آر این اے ممکنہ طور پر مزید مطالعہ پر گریوز کی بیماری کی تشخیص کے لیے بائیو مارکر کے طور پر کام کر سکتے ہیں۔ ٹائپ I ذیابیطس ٹائپ I ذیابیطس ایک اینڈوکرائنولوجیکل بیماری ہے جس میں مدافعتی نظام کے ٹی خلیات پینکریاز کے بیٹا خلیوں پر حملہ کرتے ہیں، جس سے انسولین کی پیداوار میں خلل پڑتا ہے۔ اگرچہ ٹائپ I ذیابیطس کی پیتھولوجی کا اب بھی مطالعہ کیا جا رہا ہے، لیکن ٹائپ I ذیابیطس میں بعض ایپیجینیٹک میکانزم کو شامل کیا گیا ہے۔ ٹائپ I ذیابیطس کی خصوصیت عالمی ہائپر میتھیلیشن ہے جو ہومو سسٹین میٹابولزم میں تبدیلیوں کے نتیجے میں پیدا ہوتی ہے۔ خیال کیا جاتا ہے کہ پروموٹر علاقوں کی بڑھتی ہوئی میتھیلیشن جین کے اظہار کو ان طریقوں سے تبدیل کرتی ہے جو مدافعتی خلیوں کی خرابی کا سبب بنتی ہیں۔ ہومو سسٹین میٹابولزم دو راستوں سے ہوتا ہے۔ ایک راستہ ہومو سسٹین کو میتھیونائن میں اور اس کے بجائے ایس-اڈینوسیلمیتھیوئنائن (ایس اے ایم) میں توڑ دیتا ہے۔ ایک اور راستہ، ٹرانس سلفرشن کا راستہ، متعدد مراحل سے ہومو سسٹین کو گلوٹاتھیونائن میں توڑ دیتا ہے۔ ٹائپ I ذیابیطس کے مریض انسولین کی کمی کا مظاہرہ کرتے ہیں اور انسولین کی سطح میں یہ کمی ہومو سسٹین بریک ڈاؤن کے دو راستوں میں سے ایک کے لیے درکار ٹرانس سلفورشن کو روکتی ہے۔ نتیجے کے طور پر، ہومو سسٹین کی سطح میں اضافہ ہوتا ہے اور وہ راستہ جو ہومو سسٹین-> میتھیونائن-> ایس اے ایم کو تبدیل کرتا ہے، ہومو سسٹین بریک ڈاؤن کا بنیادی طریقہ بن جاتا ہے۔ اس کو ایڈجسٹ کرنے کے لیے، ایس-اڈینومیتھیونائن میں ڈی این ایم ٹی میتھیونائن کی خرابی کو متحرک کرتے ہیں اور ڈی این ایم ٹی کی سرگرمی میں اضافہ کرتے ہیں جو عالمی ہائپر میتھیلیشن کا باعث بنتا ہے جو جین کے اظہار میں وسیع پیمانے پر تبدیلیوں کا سبب بنتا ہے۔ ایچ او ایکس اے 9 ٹرانسکرپشن فیکٹر کے لیے جین میں ڈی این اے ڈیمیتھیلیشن کا مشاہدہ کیا جاتا ہے اور ایف او ایکس پی 3 امیون رسپانس جین پروموٹر ریجن میں ڈی این اے ہائپرمیتھیلیشن کا مشاہدہ کیا جاتا ہے۔ HOXA9 ایک پروٹین کے لیے کوڈ کرتا ہے جو ہیمیٹوپوئیٹک اسٹیم سیل نسل میں شامل ہوتا ہے اور ٹائپ I ذیابیطس کے معاملے میں ہائپومیتھیلیٹڈ ہوتا ہے۔ حال ہی میں، مختلف متغیر سی پی جی پوزیشنوں کی افزودگی کی نشاندہی کی گئی ہے، جو ٹائپ I ذیابیطس پیتھوجینسیس میں تبدیل شدہ ڈی این اے میتھیلیشن کی سطح کی شمولیت کی نشاندہی کرتی ہے۔ اس محاذ پر مزید تحقیق کی ضرورت ہے۔ ٹائپ I ذیابیطس میں امیون ایفیکٹر خلیوں میں ڈی این اے میتھیلیشن کی بڑھتی ہوئی تغیر نے ٹائپ I ذیابیطس کے پیتھوجینسیس سے متعلق دیگر عمل میں بھی ڈی این اے میتھیلیشن کی شمولیت کا مظاہرہ کیا ہے۔ مقامی معدے کی آٹومیمون عوارض سیلیاک بیماری سیلیاک بیماری ایک ایسی بیماری ہے جس میں ان لوگوں میں چھوٹی آنت کو نقصان پہنچتا ہے جن کے جسم ٹی سیل کے ردعمل کی وجہ سے گلوٹین کو پروسیس کرنے سے قاصر ہوتے ہیں جو اس وقت چالو ہوتا ہے جب گندم یا رائی جیسے کھانے سے گلوٹین آنتوں میں موجود ہوتا ہے۔ سیلیاک بیماری میں کئی ایپیجینیٹک میکانزم شامل ہیں، جیسے ڈی این اے میتھیلیشن، ہسٹون ترمیم، اور غیر کوڈنگ آر این اے۔ یہ ایپیجینیٹک میکانزم سیلیاک بیماری کے پیتھوجینسیس میں شامل ہوتے ہیں اور ساتھ ہی ان لوگوں میں تبدیل ہوتے ہیں جن میں سیلیاک بیماری کی پیش گوئی ہوتی ہے۔ مزید برآں، بنیادی این ایف-کے بی راستے میں شامل جینوں میں غیر معمولی میتھیلیشن، جو پیدائشی قوت مدافعت کا ایک ریگولیٹر ہے، سیلیاک بیماری کے پیتھوجینسیس میں ملوث ہے۔ سی پی جی کے ڈی این اے میتھیلیشن کی اعلی شرح سیلیاک بیماری والے افراد میں چھوٹے آنتوں کے ایڈینوکارسنوما کی نشوونما میں معاون ہے، جو مہلک ٹیومر ہیں۔ یہ سی پی جی ہائپر میتھیلیشن ایم ایل ایچ-1 جین کے اظہار کے نقصان سے منسلک ہے، جو ڈی این اے کی مرمت میں شامل ہے۔ مزید برآں، اے پی سی جین کی ہائپر میتھیلیشن، ایک ٹیومر دبانے والا جین، سیلیاک بیماری والے افراد میں بے ترتیب مرمت کے طریقہ کار میں نقائص کا سبب بنتی ہے۔ ہسٹون ایسیٹیلیشن میں اضافہ، خاص طور پر H3K27ac، سیلیاک بیماری کے بائیوپسیز میں بھی پایا گیا ہے۔ سیلیاک بائیوپسیز میں سائٹوٹاکک ٹی لیمفوسائٹس کے جواب میں تین مختلف سائٹوکائنز کے جینز کا موازنہ کرتے وقت، پروموٹر اور بڑھانے والے علاقوں میں H3K27ac میں اضافہ سائٹوکائن INF جینز میں پایا گیا۔ سیلیاک بیماری والے افراد میں سیلیاک بیماری کے بغیر افراد کے مقابلے میں بعض مائیکرو آر این اے کا ضابطہ نمایاں طور پر مختلف ہوتا ہے۔ یہ اختلافات کچھ مائیکرو آر این اے کے ڈاؤن ریگولیشن اور دوسروں کے اپ ریگولیشن کی شکل میں پائے گئے۔ یہ تفریقی ضابطہ ممکنہ طور پر مائکرو آر این اے کے لیے ہوتا ہے جو آنتوں کی رکاوٹ کی تقریب کو تبدیل کرنے میں شامل ہوتے ہیں، حالانکہ سیلیاک بیماری کے لیے مزید مطالعہ کی ضرورت ہے۔ مقامی اعصابی آٹومیمون عوارض ایک سے زیادہ سکلیروسیس (ایم ایس) ایک سے زیادہ سکلیروسیس ایک اعصابی بیماری ہے جس کی خصوصیت مدافعتی نظام اعصابی ریشوں کو ڈھانپنے والی مائیلن شیٹھوں پر حملہ اور تباہ کرتا ہے۔ ان مٹھوں کی تباہی اعصابی خلیوں میں پیغامات کی برقی ترسیل کو سست یا ضائع کرنے کا باعث بنتی ہے اور اس کے نتیجے میں مریضوں کو کمزوری، درد اور بینائی کی کمی کا سامنا کرنا پڑتا ہے۔ یہ دکھایا گیا ہے کہ وٹامن ڈی کی کمی کا تعلق ایپیجینیٹک مارکر اور ایم ایس پیتھوجینسیس میں تبدیلی سے ہے۔ وٹامن ڈی آٹو امیونٹی اور خاص طور پر Th17 آٹو امیونٹی کو دبانے میں اہم کردار ادا کرتا ہے۔ Th17 ٹی ہیلپر خلیوں کا ایک ذیلی مجموعہ ہے جو سوزش سے متعلق انٹرلیوکن (آئی ایل)-17 کا سراغ لگاتا ہے۔ روایتی طور پر وٹامن ڈی آئی ایل 17 اے پروموٹر کو ایچ ڈی اے سی 2 کی بھرتی کے ذریعے آئی ایل 17 کی نقل کو روکتا ہے، تاہم ان لوگوں میں جن میں وٹامن ڈی کی کمی ہے، آئی ایل 17 کی نقل میں اضافہ ہوتا ہے جس کی وجہ سے سوزش کا مدافعتی ردعمل بڑھ جاتا ہے۔ پی بی ایم سی خلیوں میں ایم آئی آر این اے-326 کا بڑھتا ہوا اظہار ایم ایس والے خلیوں میں بھی عام ہے اور یہ ٹی ایچ 17 سیل تفریق کی حوصلہ افزائی کے لیے جانا جاتا ہے۔ ہسٹون ایچ 3 سائٹرلینیشن، جو ارجنائن کے باقیات کی میتھیلیشن کو تبدیل کرتی ہے اور اس کے نتیجے میں کرومیٹن کی ساخت اور جین کے اظہار میں، ایم ایس مریضوں کے دماغوں میں بھی اضافہ ہوا ہے۔ اگرچہ اس طریقہ کار کو سمجھنے کے لیے مزید تحقیق کی ضرورت ہے کہ کس طرح ہسٹون H3 سائٹرلینیشن ڈیمیلینیشن میں حصہ ڈالتا ہے، تحقیق سے پتہ چلتا ہے کہ اس سائٹرلینیشن میں شامل انزائموں کے انفیکٹر اس بیماری کے نقطہ نظر اور ترقی کو بہتر بناتے ہیں۔ میستھینیا گریوس (ایم جی) میستھینیا گریوس ایک آٹومیمون بیماری ہے جو بڑے پیمانے پر اعصابی نقصان کے نتیجے میں مریض کے کنکال کے پٹھوں کی کمزوری اور خرابی کا سبب بنتی ہے جو اعصاب اور پٹھوں کے درمیان رابطے کو تباہ کر دیتی ہے۔ یہ پایا گیا ہے کہ جن افراد کو میستھینیا گریوس ہے ان میں ایسیٹیلکولین ریسیپٹر اینٹی باڈی، اے سی آر-اے بی کی اعلی سطح ہوتی ہے، جو اعصابی جنکشن پر موجود اے سی ایچ ریسیپٹرز کو تباہ کرنے کے لیے مدافعتی نظام کو بھرتی کرتی ہے۔ کنٹرول کے مقابلے میں ایم جی مریضوں میں سی ٹی ایل اے-4 خطے میں میتھیلیشن کی نمایاں طور پر زیادہ سطح مشاہدہ کی جاتی ہے۔ سی ٹی ایل اے-4 جین کا اظہار ٹی-ریگ خلیوں کے منفی ریگولیٹر کے طور پر کام کرتا ہے اور مدافعتی ردعمل کو دباتا ہے۔ جب سی ٹی ایل اے-4 خطے کے اظہار کی بندش ہوتی ہے، جیسا کہ ایم جی والے لوگوں میں دیکھا جاتا ہے، تو ٹی سیل ایکٹیویشن میں اضافہ ہوتا ہے اور مدافعتی ردعمل میں اضافہ ہوتا ہے۔ سی ٹی ایل اے-4 پیدا کرنے والے سائٹوکائنز کے اظہار جو اے سی آر-اے بی آٹو اینٹی باڈیز کو منظم کرتے ہیں ان کے عمل کے طریقہ کار کو بہتر طور پر سمجھنے کے لیے مزید تحقیق کی ضرورت ہے۔ حوالہ جات آٹو امیون بیماریاں ایپیجینیٹکس