RNA motif
آر این اے موٹف آر این اے کے ایک گروپ کی وضاحت ہے جس کی ایک متعلقہ ساخت ہوتی ہے۔ آر این اے موفٹس بنیادی ترتیب اور متعلقہ آر این اے کی ثانوی ساخت کے اندر خصوصیات کے ایک نمونے پر مشتمل ہوتے ہیں۔ اس طرح، یہ آر این اے ثانوی ساخت کو شامل کرنے کے لیے سیکوینس موٹف کے تصور کو بڑھاتا ہے۔ "آر این اے موٹف" کی اصطلاح پیٹرن اور اس سے مماثل آر این اے کی ترتیب دونوں کا حوالہ دے سکتی ہے۔ آر این اے کے نقشوں کی وضاحتیں آر این اے کے نقشوں کو دو اہم شکلوں میں بیان کیا جا سکتا ہے: ایک سے زیادہ ترتیب کی صف بندی یا ایک واضح تلاش کا نمونہ۔ صف بندی کو عام طور پر متفقہ ثانوی ڈھانچے کے ساتھ بڑھایا جاتا ہے، یعنی۔ وہ ساخت جو تمام یا زیادہ تر آر این ایز میں مشترک ہو۔ صف بندی میں ترتیبات پھر تحفظ کے ایک نمونے کی واضح طور پر وضاحت کرتے ہیں جسے، مثال کے طور پر، آر این اے کی اضافی مثالیں تلاش کرنے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ یہ تلاش کی حکمت عملی، دوسروں کے درمیان، انفیرنل سافٹ ویئر پیکیج کے ذریعے نافذ کی جاتی ہے۔ آر ایف اے ایم ڈیٹا بیس متعدد ترتیب کی صف بندی کا ایک مجموعہ ہے جو قابل اعتماد طور پر معروف آر این اے موفٹس اور متعلقہ معلومات کے ایک بڑے ذیلی سیٹ کی وضاحت کرتا ہے۔ اس کے ڈیٹا کو انفیرنل سافٹ ویئر کے ساتھ استعمال کیا جا سکتا ہے تاکہ ترتیب کے ڈیٹا بیس میں اس طرح کے آر این اے کی مثالیں تلاش کی جا سکیں، جیسے۔ جینوم کی ترتیبات۔ متبادل طور پر، آر این اے موفٹس کو واضح تلاش کے نمونوں کا استعمال کرتے ہوئے بھی بیان کیا جا سکتا ہے، جو مخصوص بنیادی ترتیب کے نمونوں کی وضاحت کرتے ہیں اور اس کی رکاوٹوں کے ساتھ مل کر کہ ہیلیکس کہاں بننا چاہیے۔ اس طرح کے نمونوں کو ایک بڑے ترتیب والے ڈیٹا بیس میں مماثل تسلسل تلاش کرنے کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔ کئی سافٹ ویئر پیکجز اس طرح کی تلاش کو نافذ کرتے ہیں، جیسے۔ آر این اے روبو اور آر این اے موٹف۔ نوول آر این اے موفٹس کی دریافت نوول آر این اے کو دریافت کرنے کے بہت سے طریقے ایک تقابلی نقطہ نظر کا استعمال کرتے ہیں، جس میں محفوظ آر این اے کے خصوصیت والے اشاروں کا پتہ لگانے کے لیے مختلف ترتیبات کا ایک ساتھ تجزیہ کیا جاتا ہے۔ جب اس طرح کے طریقے کامیاب ہوتے ہیں، تو اس کے نتیجے میں نئے محفوظ شدہ آر این اے کو آر این اے موٹف کے طور پر دیکھا جا سکتا ہے، جس کا اظہار صف بندی یا نمونے کا استعمال کرتے ہوئے کیا جاتا ہے۔ ایک ابتدائی مثال ٹی باکس کے ارد گرد مبنی آر این اے موٹف ہے، جس کا تعین 1993 میں امینو ایسیل-ٹی آر این اے سنتھٹیس جینوں سے کیا گیا تھا۔ جس طریقہ کار کے ذریعے یہ آر این اے موٹف جینز کو منظم کرتا ہے اس کا بعد میں مظاہرہ کیا گیا، اس طرح آر این اے موٹف کی فعال اہمیت قائم ہوئی۔ بعد میں، 1997 میں، بی 12-باکس نامی ایک محفوظ آر این اے موٹف کو بی 12 میٹابولزم سے متعلق جینوں کے اوپر کی طرف پایا گیا۔ یہ آر این اے موٹف بعد میں ایک رائبوسویچ کے ایک حصے سے مطابقت رکھتا پایا گیا جو شریک عنصر اڈینوسائلکوبالامین کو باندھتا ہے، جسے اکثر کوبالامین رائبوسویچ کہا جاتا ہے۔ (بعد کے متغیرات کو دیگر کوبالامین مشتقات کو باندھنے کے لیے دکھایا گیا۔) آر این اے موفٹس کی بہت سی دوسری مثالیں جن کے افعال کا بعد میں تعین کیا گیا، خاص طور پر رائبوسوچز کے تناظر میں معلوم ہیں۔ تاہم، آر این اے موفٹس کی دیگر اقسام کو فعال طور پر نمایاں کیا گیا ہے، جیسے کہ 6 سی آر این اے جیسے بیکٹیریل ایس آر این اے، جسے 2007 میں ایک موفٹ کے طور پر دریافت کیا گیا تھا اور 2016 میں فعال طور پر نمایاں کیا گیا تھا، یا ٹوسٹر رائبوزیم جیسے رائبوزیم، جس کا پتہ آر این اے موفٹ کے طور پر لگایا گیا تھا اور اسی اشاعت میں فعال طور پر نمایاں کیا گیا تھا۔ حوالہ جات آر این اے