Liquid–liquid phase separation sequence-based predictors
ایل ایل پی ایس میں اکثر ترتیب والے علاقے شامل ہوتے ہیں جن میں منفرد فعال خصوصیات کے ساتھ ساتھ پریئن جیسے اور آر این اے بائنڈنگ ڈومینز کی موجودگی ہوتی ہے۔ آج کل ایل ایل پی ایس کو چلانے کے لیے پروٹین کے رجحان کی پیش گوئی کرنے کے چند طریقے ہیں۔ ایل ایل پی ایس میں شامل حیاتیاتی میکانزم کی حد، ان میکانزم کے بارے میں محدود علم اور ایل ایل پی ایس کا اہم سیاق و سباق پر منحصر جزو اس مسئلے کو چیلنج بناتا ہے۔ پچھلے سالوں میں، اس شعبے میں پیشرفت کے باوجود، صرف چند پیشن گوئی کرنے والے، جو ایل ایل پی ایس کے لیے مخصوص ہیں، تیار کیے گئے ہیں، جو پروٹین کی ترتیب کی خصوصیات اور ایل ایل پی ایس کو چلانے کی صلاحیت کے درمیان تعلق کو سمجھنے کی کوشش کر رہے ہیں۔ یہاں ہم جدید ترین ایل ایل پی ایس ترتیب پر مبنی پیشن گوئی کرنے والوں پر نظر ثانی کریں گے، مختصر طور پر ان کا تعارف کرائیں گے اور وضاحت کریں گے کہ انفرادی پروٹین کی خصوصیات کون سی ہیں جن کی وہ ایل ایل پی ایس کے تناظر میں شناخت کرتے ہیں۔ ایل ایل پی ایس کے میدان میں ایک اور اہم کمپیوٹیشنل وسائل پروٹین کے نظریاتی تخروپن ہیں، خاص طور پر اندرونی طور پر بے ترتیب پروٹین (آئی ڈی پی)، جو ایل ایل پی ایس کو چلاتے ہیں۔ یہ تخروپن تجربات کی تکمیل کرتے ہیں اور ایل ایل پی ایس کو چلانے والے انفرادی پروٹین کے مالیکیولر میکانزم کے بارے میں اہم بصیرت فراہم کرتے ہیں۔ ڈگنن اور دیگر کا ایک جائزہ۔ اس بات پر تبادلہ خیال کیا گیا کہ تجرباتی نتائج کی تشریح کرنے، مرحلے کے رویے کی وضاحت کرنے اور ٹیون ایبل مرحلے کی منتقلی کی خصوصیات کے ساتھ پروٹین ڈیزائن کرنے کے لیے پیش گوئی کرنے والے فریم ورک فراہم کرنے کے لیے ان تخروپن کا اطلاق کیسے کیا جا سکتا ہے۔ چیلنج ماڈل کے حل اور کمپیوٹیشنل کارکردگی کے درمیان سمجھوتہ ہے، کیونکہ آئی ڈی پیز پر مشتمل بڑے نظاموں کے تمام ایٹم سمیلیشنز کو انجام دینا اب بھی مشکل ہے۔ مزید برآں، بوند کی حالت میں آئی ڈی پیز کے درمیان سالماتی تعاملات کو اب بھی ناقص طور پر سمجھا جاتا ہے، اور تجرباتی ڈیٹا اور تخروپن کا مجموعہ ان کی وضاحت کے لیے ناگزیر ہے۔ ان میکانزم کو روشن کرنے کے لیے اگلے چند سالوں میں نمونے لینے اور تخروپن کے طریقوں میں بہتری آسکتی ہے۔ اندرونی طور پر بے ترتیب پروٹین ڈسپروٹ ڈیٹا بیس موبی ڈی بی ڈیٹا بیس حوالہ جات پروٹین ڈھانچہ ساختی بائیو انفارمیٹکس پروٹومکس نیوروڈیجینریٹو عوارض بھی دیکھیں۔