Tohoku Medical Megabank Project
توہوکو میڈیکل میگا بینک پروجیکٹ جاپان میں ایک قومی منصوبہ ہے۔ توہوکو میڈیکل میگابینک (ٹی ایم ایم) پروجیکٹ کا مشن میاگی اور ایواٹے پریفیکچرز میں ایک طویل مدتی صحت کا سروے کرنا ہے، جو عظیم مشرقی جاپان کے زلزلے سے متاثر ہوئے تھے، اور بائیو بینک قائم کرکے اور کوہورٹ اسٹڈیز کا انعقاد کرکے ذاتی طب کی ترقی کے لیے تحقیقی بنیادی ڈھانچہ فراہم کرنا ہے۔ اس کا آغاز 2012 میں ہوا۔ ٹی ایم ایم پروجیکٹ توہوکو یونیورسٹی کی توہوکو میڈیکل میگا بینک آرگنائزیشن (ٹو ایم ایم او) اور آئواٹے میڈیکل یونیورسٹی کی آئواٹے توہوکو میڈیکل میگا بینک آرگنائزیشن (آئی ایم ایم) کے ذریعے چلایا جاتا ہے۔ منصوبے مندرجہ ذیل اجتماعی مطالعات اور تحقیقی منصوبے جاری ہیں یا مکمل ہو چکے ہیں۔ ممکنہ کوہورٹ کمیونٹی پر مبنی کوہورٹ (عام آبادی) کا مطالعہ کرتا ہے۔ پیدائش اور تین نسلوں کا مجموعہ۔ بائیو بینکنگ اور ڈیٹا بیس۔ شرکاء کو نتائج کی واپسی (بشمول جینومک معلومات)۔ تحقیقی منصوبے مختصر پڑھنے اور طویل پڑھنے والی ٹیکنالوجیز کے ساتھ مکمل جینوم سیکوینسنگ۔ ایس این پی صف جینو ٹائپنگ جاپانکا صف کے ساتھ۔ جاپانی انسانی جینوم حوالہ کی تعمیر۔ این ایم آر اور ماس سپیکٹرومیٹری کے ساتھ پلازما میٹابولوم تجزیہ۔ پروٹوم تجزیہ۔ ٹرانسکرپٹوم تجزیہ۔ ایپیجینوم تجزیہ۔ زبانی مائکرو بایوم تجزیہ۔ ٹائم لائن 2013 ٹی ایم ایم کمیونٹی پر مبنی کوہورٹ کی بھرتی شروع ہوتی ہے۔ ٹی ایم ایم برتھ اور تھری جنریشن کوہورٹ اسٹڈی کی بھرتی شروع۔ 2014 جاپانی جینوم ریفرنس پینل (1 کے جے پی این)، جو 1,070 کوہورٹ شرکاء کے پورے جینوم کی ترتیب پر مبنی مختلف قسم کے ایلیل فریکوئنسی کو ظاہر کرتا ہے، جاری کیا گیا ہے (ڈرافٹ ورژن 2014، آفیشل ورژن 2015)۔ 1 کے جے پی این ہیپلوٹائپ معلومات سے فائدہ اٹھاتے ہوئے جاپانی آبادی کے لیے مرضی کے مطابق ایک ایس این پی صف، جاپونیکا صف، جاری کی گئی ہے۔ 2015 جاپانی ملٹی اومیکس ریفرنس پینل (جے مورپ) کی ایک پورٹل سائٹ کھولی گئی ہے، جو کوہورٹ شرکاء سے میٹابولوم اور پروٹوم ڈیٹا فراہم کرتی ہے۔ 2022 تک، جے مورپ میٹابولوم، پروٹوم، ٹرانسکرپٹوم، میتھیلوم کے ساتھ ساتھ جینوم ریفرنس پینل کا احاطہ کرتا ہے۔ 2016 ٹی ایم ایم کمیونٹی پر مبنی کوہورٹ کی بھرتی 80,000 سے زیادہ شرکاء کے ساتھ مکمل ہوئی۔ 2017 ٹی ایم ایم برتھ اور تھری جنریشن کوہورٹ اسٹڈی کی بھرتی 70,000 سے زیادہ شرکاء کے ساتھ مکمل ہوئی۔ دوسرا فالو اپ سروے شروع ہوتا ہے۔ 2018 جاپانی جینوم ریفرنس پینل (3.5KJPNv2)، جو 3,554 کوہورٹ شرکاء کے پورے جینوم کی ترتیب پر مبنی مختلف قسم کے ایلیل فریکوئنسی کو ظاہر کرتا ہے، جاری کیا گیا ہے (2019 میں شائع ہوا)۔ 2019 جاپانی حوالہ جینوم (جے جی 1) جاری کیا گیا ہے (2021 میں شائع ہوا)۔ 67, 000 ٹی ایم ایم کمیونٹی پر مبنی کوہورٹ نمونوں کے ڈیٹا کی تقسیم شروع ہو گئی ہے۔ جاپانی جینوم ریفرنس پینل (4.7KJPN) جاری کیا گیا ہے۔ جاپانکا صف NEO، ایک SNP صف جو جاپانی آبادی کے لیے 3.5KJPN ہیپلوٹائپ معلومات سے فائدہ اٹھا کر بہتر بنائی گئی ہے، جاری کی گئی ہے (2021 میں شائع ہوئی)۔ 2020 54,000 ایس این پی ایرے ڈیٹا کی تقسیم شروع ہوئی۔ ٹی ایم ایم برتھ اور تھری جنریشن کوہورٹ نمونوں کے ڈیٹا کی تقسیم شروع ہوتی ہے۔ جاپانی جینوم ریفرنس پینل (8.3KJPN) جاری کیا گیا ہے۔ جاپانی حوالہ جینوم (جے جی 2) جاری کیا گیا ہے۔ 2021 تیسرا فالو اپ سروے شروع ہوتا ہے۔ جاپانی جینوم ریفرنس پینل (14 کے جے پی این) جاری کیا گیا ہے۔ جے ایس وی 1، ایک ساختی تغیر پینل، جو طویل پڑھنے والے ترتیب کے اعداد و شمار کے ساتھ بنایا گیا ہے، جاری کیا گیا ہے۔ 2022 50,000 کوہورٹ شرکاء کی مکمل جینوم سیکوینسنگ مکمل کی گئی۔ جاپانی جینوم ریفرنس پینل (38 کے جے پی این) جاری کیا گیا ہے۔ 2023 69,000 کوہورٹ شرکاء کی مکمل جینوم سیکوینسنگ مکمل ہوئی۔ جاپانی جینوم ریفرنس پینل (54 کے جے پی این) جاری کیا گیا ہے۔ ڈیٹا پورٹل سائٹ، جے مورپ کے ذریعے دستیاب ہے۔ حوالہ جات بیرونی روابط توہوکو میڈیکل میگابینک آرگنائزیشن Iwate توہوکو میڈیکل میگابینک آرگنائزیشن jMorp: جاپانی ملٹی اومیکس ریفرنس پینل iMETHYL: انسانی DNA میتھیلیشن، جین کے اظہار، اور جینومک تغیر کا ایک مربوط ڈیٹا بیس۔ بائیو بینک تنظیمیں کوہورٹ اسٹڈیز میڈیسن ان جاپان 2012 اسٹیبلشمنٹ ان جاپان توہوکو یونیورسٹی آئواٹے یونیورسٹی جینیٹکس ڈیٹا بیس