TMEM212
ٹرانس میمبرین پروٹین 212 ایک پروٹین ہے جسے انسانوں میں ٹی ایم ای ایم 212 جین کے ذریعے انکوڈ کیا جاتا ہے۔ پروٹین 5 ٹرانس میمبرین ڈومینز پر مشتمل ہوتا ہے اور پلازما جھلی اور اینڈوپلاسمک ریٹیکولم میں مقامی ہوتا ہے۔ TMEM212 میں ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں آرتھولوج ہوتے ہیں لیکن الٹی ہڈی والے جانوروں میں نہیں۔ TMEM212 افریقی امریکیوں میں چھٹپٹ پارکنسنز کی بیماری، چہرے کی پروسیسنگ، اور چربی سے وابستہ رہا ہے۔ TMEM212 جین کروموسوم 3 پر 3q26.3 پوزیشن پر ہے اور پلس اسٹرینڈ پر واقع ہے۔ جین کو پوزیشن 171,561,140 سے 171,577,108 تک انکوڈ کیا جاتا ہے۔ اس کی سب سے لمبی آئسوفارم 4 ایکسون، 1881 کے نیوکلیوٹائڈز کی کوڈنگ ترتیب، اور ایک اپ اسٹریم ان فریم اسٹاپ کوڈن پر مشتمل ہے۔ کوڈنگ کی ترتیب جین TMEM212 کے 36-660 بیس ہیں۔ جین کے پڑوس میں موجود دیگر جینوں میں شامل ہیں: پی ایل ڈی 1، آر این یو 6-348 پی اور ایف این ڈی سی 3 بی۔ ٹرانسکرپٹ جین TMEM212 میں 2 آئسوفارم ہوتے ہیں۔ TMEM212 کے mRNA اسپلیس متغیرات آخری ایکسون پر مختلف ہوتے ہیں۔ مختلف حالتوں میں سے ایک نے آخری ایکسن کے حصے کو الگ کر دیا ہے-جس سے یہ 537 نیوکلیوٹائڈز کو چھوٹا بنا دیتا ہے۔ اس آئسوفروم میں 1343 نیوکلیوٹائڈز کی ایم آر این اے ترتیب ہے۔ بعد کی قسم کو این سی بی آئی میں تسلیم نہیں کیا گیا ہے۔ پروٹین ٹی ایم ای ایم 212 میں 5 ٹرانس میمبرین ریجنز ہوتے ہیں، جو اسے ٹرانس میمبرین پروٹین بناتے ہیں۔ 5 ٹرانس میمبرین علاقے بنیادی طور پر غیر قطبی امینو ایسڈ ہیں۔ تاہم، ٹرانس میمبرین کے 2 علاقوں میں قطبی، چارج شدہ امینو ایسڈ ہوتا ہے۔ پروٹین 194 امینو ایسڈ لمبا ہے اور اس کا حساب شدہ سالماتی وزن 21kDa ہے۔ آئسو الیکٹرک پوائنٹ تقریبا 8 کے پی ایچ پر ہے۔ TMEM212 کے امینو ایسڈ کی ترتیب میں کوئی اندرونی تکرار نہیں ہے۔ اس کے علاوہ، تمام امینو ایسڈ عام کثرت میں ہوتے ہیں۔ انسانی TMEM212 ٹیبل 1 میں دکھائے گئے اس کے آرتھولوگس سے ملتے جلتے سالماتی وزن اور آئسو الیکٹرک پوائنٹ کو ظاہر کرتا ہے۔ ٹیبل 1: انسانوں اور آرتھولوگس میں ٹی ایم ای ایم 212 پروٹین کی خصوصیات ثانوی اور ترتیری ڈھانچہ فائر 2 اور علی 2 ڈی پیش گوئی کرتے ہیں کہ ٹی ایم ای ایم 212 میں الفا ہیلیکس سے بھرپور ثانوی ڈھانچہ ہے، خاص طور پر ٹرانس میمبرین علاقوں میں۔ الفا ہیلیکس کو میملز سے لے کر رینگنے والے جانوروں تک آرتھولوگس میں محفوظ کیا گیا تھا۔ مزید برآں، ڈینا نے پیش گوئی کی ہے کہ TMEM212 6 سسٹین امینو ایسڈ کے درمیان 3 ڈائیسلفائڈ بانڈز پر مشتمل ہے: C46-C88، C105-C154، اور C135-C16۔ ترتیری ساخت میں جھلی کے اندر 5 علاقے ہوتے ہیں۔ جین لیول ریگولیشن پروموٹر جینومیٹکس کے مطابق، ٹی ایم ای ایم 212 میں 3 ممکنہ پروموٹر ہیں۔ تاہم، TMEM212 کے لیے سب سے زیادہ ممکنہ پروموٹر براہ راست TMEM212 کے جین کے اوپر کی طرف ہے اور یہ 1654 بیس جوڑے (GXP _ 277729) ہیں۔ اظہار ٹی ایم ای ایم 212 آر این اے کا اظہار زیادہ تر بافتوں کی اقسام (جی ڈی ایس 1096) میں کم اور ہر جگہ کیا جاتا ہے۔ ٹی ایم ای ایم 212 کا اظہار اعضاء، دماغ، پھیپھڑوں، دل، گردوں، خصیوں میں قدرے زیادہ سطح پر ہوتا ہے۔ TMEM212 کا اظہار دماغ کے مخصوص حصوں میں کیا گیا جس میں پونس اور ٹرائیجیمینل گینگلین شامل ہیں۔ معتدل اظہار والے دیگر بافتوں میں ایڈرینل پرانتستا اور ضمیمہ شامل تھے۔ تمام دستیاب آر این اے ترتیب کے اعداد و شمار سے پتہ چلتا ہے کہ ٹی ایم ای ایم 212 پھیپھڑوں میں پایا جاتا ہے۔ ٹرانسکرپٹ لیول ریگولیشن 5 'غیر ترجمہ شدہ خطہ 35 بیس جوڑے لمبا ہے۔ 3 'غیر ترجمہ شدہ خطہ لمبائی میں 1221 بیس جوڑوں پر مشتمل ہے اور یہ بیس 661 سے 1881 تک واقع ہے۔ 5 'یو ٹی آر اور 3' یو ٹی آر کے لیے سب سے کم توانائی کے ڈھانچے کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ مختصر لمبائی کی وجہ سے، 5 'یو ٹی آر میں 1 اسٹیم لوپ ہونے کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ 3 'یو ٹی آر میں 17 اسٹیم لوپس ہونے کی پیش گوئی کی گئی ہے۔ پروٹین لیول ریگولیشن ترمیم یہ پیش گوئی کی گئی ہے کہ ٹی ایم ای ایم 212 میں دو سلفیشن سائٹس اور ایک فاسفوریلیشن سائٹ ہے۔ امینو ایسڈ 23 اور 24 کے درمیان ایک ممکنہ کلیویج سگنل پیپٹائڈ ہے۔ فاسفوریلیشن سائٹ اور کلیویج سگنل پیپٹائڈ کی موجودگی آرتھولوگس میں عام ہے۔ سب سیلولر لوکلائزیشن بنیادی سب سیلولر مقامات میں پلازما جھلی اور اینڈوپلاسمک ریٹیکولم شامل ہیں۔ TMEM212 کا سب سیلولر لوکیشن آرتھولوگس میں محفوظ ہے۔ ٹی ایم ای ایم 212 اینٹی باڈیز کے امیونو فلوریسنٹ سٹیننگ سے پتہ چلتا ہے کہ ٹی ایم ای ایم 212 نیوکلئس میں موجود ہے، لیکن وجہ نامعلوم ہے۔ TMEM212 انسانوں میں زیادہ تر پروٹین سے کم مقدار میں پایا جاتا ہے۔ ارتقاء پیرالاگ TMEM212 کا ایک معروف پیرالاگ ہے: میمبرین-اسپیننگ 4 ڈومینز A7 (MS4A7)۔ یہ جین کروموسوم 11 پر 11q12.2 پر واقع ہے۔ MS4A7 ممکنہ طور پر TMEM212 435-475 ملین سال پہلے سے تیار ہوا۔ یہ دائیں طرف دکھایا گیا ہے جہاں مختلف پروٹینوں کے انحراف کی شرحوں کا موازنہ کیا گیا ہے۔ ہومو سیپینز میں آرتھولوگس TMEM212 انتہائی محفوظ ہے۔ یہ ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں پایا جاتا ہے لیکن ریڑھ کی ہڈی والے جانوروں میں نہیں اور اس میں بہت سے آرتھولوج ہیں جن میں ممالیہ جانور، پرندے، رینگنے والے جانور، امفیبیئن اور مچھلی شامل ہیں۔ نیچے دیا گیا ٹیبل 2 ممالیہ جانوروں، رینگنے والے جانوروں، پرندوں، آبی حیات اور مچھلیوں میں TMEM212 کے آرتھولوگس کو دکھاتا ہے۔ جیسا کہ دائیں طرف متعدد ترتیب کی صف بندی میں دکھایا گیا ہے، میملز اور رینگنے والے جانوروں جیسے سخت آرتھولوگس میں انتہائی محفوظ علاقے ہوتے ہیں۔ زیادہ تر محفوظ علاقے وہاں گرے جہاں ٹرانس میمبرین کے علاقے مقامی ہیں۔ ٹی ایم ای ایم 212 حوالہ ترتیب سائٹوکروم سی اور فائبرینوجن الفا کے مقابلے میں اعتدال سے تیزی سے تیار ہو رہا ہے۔ یہ ٹی ایم ای ایم 212، ایم ایس 4 اے 7، سائٹوکروم سی، اور فائبرینوجن الفا کی انحراف کی شرحوں کا موازنہ کرتے وقت دائیں طرف دکھایا گیا ہے۔ * ایم وائی اے = لاکھوں سال پہلے پروٹینوں کا تعامل تین پروٹینوں کو ٹی ایم ای ایم 212 کے ساتھ ممکنہ طور پر تعامل کرنے کے لیے ظاہر کیا گیا: ٹی ایم ای ایم 45 اے، جی پی آر 137 سی، اور ایچ این آر این پی ایل۔ ان پروٹینوں کی شناخت تجرباتی طور پر شریک اظہار یا وابستگی کیپچر-آر این اے کے ذریعے کی گئی تھی۔ ٹیکسٹ مائننگ کا استعمال کرتے ہوئے بھی ان کی شناخت کی گئی۔ ٹی ایم ای ایم 45 اے اور جی پی آر 137 بھی پلازما جھلی میں پائے جاتے ہیں، جو ٹی ایم ای ایم 212 کی طرح اس تعامل کو ممکنہ بناتا ہے۔ ٹیبل 3: پروٹین جو TMEM212 کلینیکل اہمیت TMEM212 کے ساتھ تعامل کرتے ہیں وہ افریقی امریکیوں میں چربی، چہرے کی پروسیسنگ، اور چھٹپٹ پارکنسنز کی بیماری سے وابستہ ہو سکتے ہیں۔ افریقی امریکیوں میں ٹی ایم ای ایم 212 (ایم آر این اے یا پروٹین) اور اعلی بی ایم آئی میں اضافے نے ایک ربط دکھایا ہے کیونکہ ٹی ایم ای ایم 212 کے قریب ایک لوکس پر ایس این پیز کو بڑھتی ہوئی چربی سے منسلک کیا گیا ہے۔ مزید برآں، جین TMEM212 چہرے کی پروسیسنگ میں بھی شامل ہو سکتا ہے۔ چہرے کی پروسیسنگ جینیاتی طور پر کنٹرول کی جاتی ہے، اور چہرے کے تاثرات کے جواب میں، ٹی ایم ای ایم 212 میں پایا جانے والا ایک عام ایس این پی دماغ کے دائیں فیوسفارم گائرس علاقے کو چالو کرنے کا باعث بنتا ہے، جو چہرے کی پروسیسنگ کے لیے اہم ہے۔ یہ خاص طور پر 3q26.31 پر ہوا۔ ایس این پی کا نمبر rs12485367 ہے۔ جی ایل ای والے لوگوں میں سی ہوموزائیگوٹس کے مقابلے میں زیادہ فعالیت تھی۔ TMEM212 پارکنسنز کی بیماری سے بھی منسلک ہو سکتا ہے۔ ٹی ایم ای ایم 212 جین میں ایس این پی آر ایس 2270568 (کروموسوم 3 پوزیشن 172048861) میں تبدیلیاں بیس ٹی کو سی میں تبدیل کرنے سے وابستہ تھیں اور اس سے اسپوراڈک پارکنسنز کی بیماری کے واقعات میں اضافہ ہوا۔ حوالہ جات