ZNF548
زنک فنگر پروٹین 548 (ZNF548) ایک انسانی پروٹین ہے جو ZNF548 جین کے ذریعے انکوڈ کیا گیا ہے جو کروموسوم 19 پر واقع ہے۔ یہ مرکزے میں پایا جاتا ہے اور آر این اے پولیمیرس II کے ذریعے نقل کے ضابطے میں ایک کردار ادا کرنے کے لیے قیاس کیا جاتا ہے۔ اس کا تعلق کرپل سی 2 ایچ 2 قسم کے زنک-انگلی پروٹین خاندان سے ہے کیونکہ اس میں بہت سے زنک-انگلی ریپیٹس ہوتے ہیں۔ یہ پروٹین کوڈنگ جین 4987 بی پی لمبا ہے اور ٹرانسکرپٹ ورژن 1 کو انکوڈ کرتا ہے جو کہ سب سے طویل زیڈ این ایف 548 آئسوفارم ہے۔ یہ کروموسوم 19 پر پایا جاتا ہے ؛ اس کی صحیح پوزیشن پلس اسٹرینڈ میں 19q13.43 ہے۔ جین میں 4 ایکسون ہوتے ہیں جو کرپل سے وابستہ باکس (کے آر اے بی ڈومین) کے لیے انکوڈ کرتے ہیں اور 11 زنک فنگر ریپیٹس ہوتے ہیں۔ ZNF548 جین کا پروموٹر 1198 بیس لمبا ہوتا ہے اور کروموسوم 19 پر 57388850-57390047 پر واقع ہوتا ہے۔ پروموٹر کا علاقہ 6 آرتھولوگس میں محفوظ ہے: ریسس مکاک (ریسس بندر)، پین ٹروگلوڈائٹس (چمپینزی)، اوریکٹولگس کونکولس (یورپی خرگوش)، ایکوس کیبلس (گھوڑا)، کینس لوپس فیملیس (کتا) اور سوس سکروفا (سور)۔ ٹرانسکرپٹ ٹرانسکرپٹ ورژن 1 سب سے طویل ٹرانسکرپٹ ہے اور طویل ترین پروٹین آئسوفارم (ZNF548 آئسوفارم 1) کو انکوڈ کرتا ہے جو 545 امینو ایسڈ لمبا ہے۔ ٹرانسکرپٹ ورژن 2 میں ایکسن 2 غائب ہے اور ZNF548 آئسوفارم 2 کو انکوڈ کرتا ہے جو 533 امینو ایسڈ لمبا ہے۔ پروٹین ZNF548 کا تعلق کروپل C2H2 قسم کے زنک فنگر پروٹین خاندان سے ہے کیونکہ اس میں 11 Cys2His2 قسم کے زنک فنگر ریپیٹس ہوتے ہیں۔ ہر زنک انگلی میں ایک محفوظ ββα ڈھانچہ ہوتا ہے جہاں زنک ایٹم کو C2H2 کے باقیات سے طے کیا جاتا ہے۔ زیڈ این ایف 548 اپنے سی 2 ایچ 2 زیڈ این نقشوں کے ذریعے 44 بی پی طویل ترتیب پر ڈی این اے سے منسلک ہونے کے قابل ہے، ہر ایک 4 ڈی این اے اڈوں سے جڑا ہوا ہے۔ پروٹین میں ایک کروپل سے وابستہ باکس (کے آر اے بی) بھی ہوتا ہے جو این ٹرمینس پر پایا جانے والا ایک ڈومین ہے اور اس میں متعدد چارج شدہ امینو ایسڈ ہوتے ہیں۔ یہ ڈومین نقل میں ایک کردار ادا کرتا ہے ؛ یہ کے اے پی-1/ٹی آئی ایف-1 بیٹا کو-ریپریسر کے رنگ-بی باکس-کوائلڈ کنڈلی (آر بی سی سی) ڈومین سے منسلک ہوتا ہے۔ ZNF548 کے ترتیری ڈھانچے کی پیش گوئی I-Tasser کا استعمال کرتے ہوئے کی گئی تھی۔ ZNF548 کا سالماتی وزن 64 kDa ہے اور اس کا پیش گوئی شدہ آئسو الیکٹرک پوائنٹ 8.21 ہے۔ ZNF548 کے ساختیاتی تجزیے سے پتہ چلا کہ ایلنائن توقع سے کم فیصد پر پایا گیا جبکہ ہسٹائڈائن انسانی ZNF548 میں توقع سے کہیں زیادہ فیصد پر پایا گیا۔ سب سیلولر اظہار پروٹین نیوکلئس میں پایا جاتا ہے اور اس کا پتہ سائٹوپلازم یا مائٹوکونڈریا میں بھی لگایا جا سکتا ہے۔ انسانوں میں ٹشو کا اظہار ZNF548 دیگر پروٹینوں کے مقابلے میں نسبتا کم ہے۔ اس میں بافتوں کی خاصیت کم ہوتی ہے ؛ اس کا اظہار اور پتہ تمام انسانی بافتوں میں لگایا جاتا ہے۔ دیگر پروٹینوں کے ساتھ تعاملات انسانی زیڈ این ایف 548 پروٹین کا نیوکلیئر ڈسٹری بیوشن پروٹین نیوڈ-لائک 1 (این ڈی ای ایل 1) اور ڈسپرٹڈ ان شیزوفرینیا 1 (ڈی آئی ایس سی 1) پروٹینوں کے ساتھ تعاملات کو دو ہائبرڈ فریگمنٹ پولنگ اپروچ کا استعمال کرتے ہوئے تجرباتی طور پر درست کیا گیا ہے۔ 36 (ایل آر آر سی 36)، میوٹوبولرن 1 (ایم ٹی ایم 1)، میوٹوبولرن سے متعلق پروٹین 4 (ایم ٹی ایم آر 4) اور آر این اے بائنڈنگ موٹف پروٹین 39 (آر بی ایم 39) پر مشتمل لیوسین سے بھرپور ریپیٹ کا بھی پتہ چلا ہے کہ وہ افینیٹی کیپچر-ماس سپیکٹرومیٹری کے ذریعے زیڈ این ایف 548 پروٹین کے ساتھ تعامل کرتا ہے۔ فنکشن ZNF548 جین کے اظہار سے وابستہ رہا ہے کیونکہ یہ نیوکلک ایسڈ کے ساتھ ساتھ زنک آئنوں سے بھی جڑا رہ سکتا ہے۔ دیگر کے آر اے بی-زیڈ این ایف پروٹینوں کے افعال کی بنیاد پر یہ قیاس کیا جاتا ہے کہ یہ آر این اے پولیمیرس II کے ذریعے نقل شدہ پروٹین انکوڈنگ جینوں کی نقل کے ضابطے میں ایک کردار ادا کرتا ہے۔ خاص طور پر یہ ایک ڈی این اے بائنڈنگ ٹرانسکرپشن عنصر ہے جو کچھ جینوں کی نقل کو بڑھاتا ہے یا روکتا ہے جو آر این اے پولیمیرس II کے ذریعے نقل کیے جاتے ہیں۔ یہ ٹرانسکرپشن فیکٹر ریکگنیشن سیکوینس سے جڑے رہنے کی صلاحیت رکھتا ہے جو اپنی زنک انگلیوں کے ذریعے ٹرانسکرپشن اسٹارٹ سائٹ کے طور پر اسی اسٹرینڈ (سی آئی ایس) پر ہوتا ہے اور نیوکلیوپلازم میں کے آر اے بی-زیڈ این ایف/کے اے پی کمپلیکس کا حصہ بن جاتا ہے۔ KRAB-ZNF پروٹین کو دبانے والے کے طور پر جانا جاتا ہے۔ لہذا، جب ایک کے آر اے بی-زیڈ این ایف پروٹین، جیسے کہ زیڈ این ایف 548، ڈی این اے سے جڑا ہوتا ہے اور بیک وقت اس کے کے آر اے بی ڈومین کے ذریعے کے اے پی 1 کو-ریپریسر سے جڑا ہوتا ہے، تو مختلف انزائم، جیسے ہسٹون ڈیسیٹیلسیس، ہسٹون میتھائل ٹرانسفرسیس اور ہیٹروکرومیٹن پروٹین، کرومیٹن ڈھانچے کو کمپیکٹ کرنے اور اس کے نتیجے میں ٹرانسکرپشن کو روکنے کے لیے بھرتی کیے جاتے ہیں۔ ہومولوگس آرتھولوگس زیڈ این ایف 548 پروٹین کے آرتھولوگس صرف ممالیہ جانوروں کے مختلف آرڈر میں محفوظ پائے گئے ہیں۔ یہ اس حقیقت سے مطابقت رکھتا ہے کہ C2H2 جیسے فولڈ گروپ ممالیہ نقل کے عوامل میں بہت عام ہیں۔ کے آر اے بی ڈومین کے ساتھ ساتھ زنک فنگر ریپیٹس آرتھولوگس میں انتہائی محفوظ ہیں۔ پیرالاگس ZNF548 میں انسان میں 25 پیرالاگس پروٹین ہوتے ہیں جیسا کہ نیچے دیے گئے جدول میں دیکھا گیا ہے۔ کلینیکل اہمیت ZNF548 کی شناخت میٹا وائرس سگنیچر (MVS) میں ایک جین کے طور پر کی گئی تھی جس کا استعمال وائرل انفیکشن والے افراد کو بیکٹیریل انفیکشن والے افراد کے ساتھ ساتھ صحت مند افراد سے ممتاز کرنے کے لیے کیا جا سکتا ہے۔ زیڈ این ایف 548 مائیکرو آر این اے اظہار اعضاء کے کینسر کی تشخیص کے لیے ایک مارکر کے طور پر کام کر سکتا ہے۔ ZNF548 بلڈ جین ایکسپریشن بائیو مارکر کو خودکشی کے مارکر کے طور پر بھی استعمال کیا جا سکتا ہے۔ حوالہ جات انسانی کروموسوم 19 زنک فنگر پروٹین پر انسانی پروٹین جین