ORF10
او آر ایف 10 ایک اوپن ریڈنگ فریم (او آر ایف) ہے جو سارس-کوو-2 کورونا وائرس کے جینوم میں پایا جاتا ہے۔ یہ 38 کوڈن لمبا ہے۔ یہ تمام سربیکو وائرس (بشمول سارس-کوو) میں محفوظ نہیں ہے۔ کووڈ-19 وبائی مرض سے متاثر ہونے والے مطالعات میں، او آر ایف 10 نے تحقیقی دلچسپی کو اپنی طرف متوجہ کیا کیونکہ یہ دو وائرل آلات پروٹین جینوں میں سے ایک ہے جو سارس-کوو اور سارس-کوو-2 کے درمیان محفوظ نہیں ہے اور ابتدائی طور پر اسے ممکنہ طور پر مثبت انتخاب کے تحت پروٹین کوڈنگ جین کے طور پر بیان کیا گیا تھا۔ تاہم، اگرچہ اسے بعض اوقات سارس-کوو-2 آلات جینوں کی فہرستوں میں شامل کیا جاتا ہے، تجرباتی اور بائیو انفارمیٹکس شواہد سے پتہ چلتا ہے کہ او آر ایف 10 ممکنہ طور پر ایک فعال پروٹین کوڈنگ جین نہیں ہے۔ او آر ایف 10 کی خصوصیات این جین کے نیچے کی طرف واقع ہے، جو کورونا وائرس نیوکلیوکیپسڈ پروٹین کو انکوڈ کرتی ہے۔ یہ جینوم کے 3 'سرے تک سب سے دور تشریح شدہ اوپن ریڈنگ فریم ہے۔ یہ ایک 38 امینو ایسڈ فرضی پروٹین کو انکوڈ کرتا ہے۔ اظہار اور فنکشن اس بات کا امکان نہیں ہے کہ او آر ایف 10 کا ترجمہ قدرتی حالات میں کیا جائے، کیونکہ او آر ایف 10 خطے پر مشتمل سبجینومک آر این اے کا پتہ نہیں چلا ہے، حالانکہ کچھ رائبوسوم فٹ پرنٹنگ سگنل موجود ہے۔ جب تجرباتی طور پر حد سے زیادہ اظہار کیا جاتا ہے، تو او آر ایف 10 پروٹین کو زیڈ وائی جی 11 بی اور اس کے کولن-رنگ لیگیز پروٹین کمپلیکس کے ساتھ تعامل کرنے کی اطلاع دی گئی ہے۔ تاہم، یہ تعامل وائرل لائف سائیکل کے ان وٹرو مطالعات میں قابل رسائی ثابت ہوا ہے۔ ارتقاء سارس-کوو-2 جینوموں کے کچھ مطالعات نے او آر ایف 10 کو فعال اور مثبت انتخاب کے تحت ہونے کا امکان بیان کیا ہے۔ تاہم، SARS-CoV-2 متغیرات اور بہت سے سربیکو وائرس کے سلسلے میں قبل از وقت اسٹاپ کوڈن کی نشاندہی کی گئی ہے، جس سے یہ پتہ چلتا ہے کہ وائرل نقل کے لیے تخیلاتی پروٹین پروڈکٹ ضروری نہیں ہے۔ او آر ایف 10 کے نقصان نے بھی وٹرو میں تجرباتی حالات کے تحت نقل پر کوئی اثر نہیں دکھایا ہے۔ بائیو انفارمیٹکس تجزیہ کے ذریعے یہ تجویز کیا گیا ہے کہ سارس-کوو-2 او آر ایف 10 میں ظاہری ترتیب کا تحفظ پروٹین کوڈنگ فنکشن کی وجہ سے نہیں ہو سکتا، بلکہ اس کے بجائے خطے میں محفوظ آر این اے ثانوی ڈھانچے کی وجہ سے ہو سکتا ہے۔ محفوظ علاقہ، جو خود او آر ایف 10 سے آگے تک پھیلا ہوا ہے، کورونا وائرس 3 'یو ٹی آر سڈوکناٹ خطے کے ساتھ اوورلیپ ہوتا ہے، جو ایک ثانوی ڈھانچہ ہے جو جینوم کی نقل میں شامل ہونے کے لیے جانا جاتا ہے۔ حوالہ جات کورونویرس پروٹین