Nuclear protein in testis gene
خصیوں کے جین میں جوہری پروٹین (یعنی۔ این یو ٹی ایم 1 جین) انکوڈز (یعنی۔ ایک 1,132-امینو ایسڈ پروٹین کی ترکیب کی ہدایت کرتا ہے جسے این یو ٹی کہا جاتا ہے جو تقریبا خصوصی طور پر خصیوں، اعضاء، اور سلیری گینگلین (یعنی۔ آنکھ کے بالکل پیچھے واقع اعصابی خلیوں کا ایک پیراسیمپیتھٹک گینگلیئن)۔ این یو ٹی پروٹین کرومیٹن کے ایسیٹیلیشن کو آسان بناتا ہے (یعنی۔ ڈی این اے-پروٹین بنڈل) بذریعہ ہسٹون ایسیٹیل ٹرانسفرس EP300 خصیوں کے سپرمیٹائڈز (خلیات جو سپرمز میں پختہ ہوتے ہیں) میں۔ یہ ایسیٹیلیشن کرومیٹن ری ماڈلنگ کی ایک شکل ہے جو سپرمیٹڈ کرومیٹن کو کمپیکٹ کرتی ہے، جو سپرمیٹوجینیسیس کے معمول کے عمل کے لیے ضروری ایک اہم قدم ہے، یعنی۔ سپرمائڈز کی سپرم میں پختگی۔ جن نر چوہوں میں جین ناک آؤٹ طریقہ استعمال کرتے ہوئے ماؤس نٹم 1 جین کی کمی تھی ان میں غیر معمولی طور پر چھوٹے خصیے تھے، ان کے کاڈا ایپیڈیڈیمس میں سپرم کی کمی تھی (یعنی۔ ایپیڈیڈیمس کی دم جس میں زرخیز نر چوہوں میں سپرم ہوتے ہیں)، اور مکمل طور پر جراثیم سے پاک تھے۔ ان نتائج سے پتہ چلتا ہے کہ نر چوہوں میں معمول کی زرخیزی کی نشوونما کے لیے نٹم 1 جین ضروری ہے اور یہ تجویز کرتا ہے کہ این یو ٹی ایم 1 جین مردوں میں بھی ایسا ہی کردار ادا کر سکتا ہے۔ این یو ٹی ایم 1 جین کروموسوم 15 کے لمبے (یا "ق") بازو پر بینڈ 14 میں واقع ہے۔ 1990 کی دہائی کے اوائل میں، اس جین کو بعض ایپیٹیلیل سیل کینسر کی نشوونما میں شامل کیا گیا تھا جو: a) نوجوان لوگوں کے مڈل لائن ڈھانچوں میں واقع ہوا، b) تیزی سے مہلک تھا، اور c) ناقص طور پر مختلف (یعنی۔ کسی خاص خلیے کی قسم سے مشابہت نہیں رکھتے)، نامکمل ظاہر ہونے والے خلیات جن میں بی آر ڈی 4-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین ہوتا ہے۔ بی آر ڈی 4 بروموڈومین پر مشتمل پروٹین 4 جین ہے۔ فیوژن جین ایک غیر معمولی جین ہے جو دو مختلف جینوں کے حصوں پر مشتمل ہوتا ہے جو بڑے پیمانے پر جین اتپریورتن جیسے کروموسومل ٹرانسلوکیشن، انٹرسٹیشیل ڈیلیشن، یا الٹ کے نتیجے میں بنتا ہے۔ بی آر ڈی 4-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین ایک ٹرانسلوکیشن ہے جو ایک فیوژن پروٹین کو انکوڈ کرتا ہے جس نے این یو ٹی ایم 1 جین کے زیادہ تر پروٹین کوڈنگ ریجن کو بی آر ڈی 4 جین کے ایک بڑے حصے کے ساتھ ضم کر دیا ہے جو مختصر پر بینڈ 13 میں واقع ہے (یعنی۔ "q") کروموسوم 19 کا بازو۔ اس ٹرانسلوکیشن کو t (15 ؛ 19) (q13، p13.1) کے طور پر نشان زد کیا گیا ہے۔ بی آر ڈی 4 پروٹین پروٹین پر ایسیٹیلیٹڈ لائسین کے باقیات کو پہچانتا ہے اور ایسا کرنے سے ڈی این اے کی نقل، ڈی این اے ٹرانسکرپشن کے ضابطے میں حصہ لیتا ہے، اور اس طرح نیوپلازم کی نشوونما میں شامل کلیدی سیلولر عمل (یعنی۔ مہلک یا نرم ٹشو کی نشوونما)۔ بی آر ڈی 4-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین، بی آر ڈی 4-این یو ٹی پروٹین کی پیداوار، کم از کم 4 متعلقہ جینوں، ایم وائی سی، ٹی پی 63، ایس او ایکس 2، اور ایم وائی بی کے اظہار کو فروغ دیتی ہے۔ یہ چاروں جین آنکوجینز ہیں، یعنی وہ جین جو زیادہ اظہار اور/یا زیادہ فعال ہونے پر بعض قسم کے کینسر کی نشوونما کو فروغ دیتے ہیں۔ ایم وائی سی اور ایس او ایکس 2 جینوں کا حد سے زیادہ اظہار خلیوں کو غیر متفرق اسٹیم سیل جیسی حالت میں برقرار رکھنے کے لیے بھی کام کر سکتا ہے جو کہ بی آر ڈی 4-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ذریعے چلنے والے نیوپلازم کے خلیوں سے ملتا جلتا ہے۔ عام طور پر یہ قبول کیا جاتا ہے کہ بی آر ڈی 4-این یو ٹی پروٹین ان نوپلاسم کو ان کے نوپلاسٹک خلیوں کو مستقل طور پر غیر متفرق، پھیلاؤ والی حالت میں برقرار رکھ کر فروغ دیتا ہے۔ ان خیالات کی تصدیق اور توسیع کے لیے مزید مطالعات کی ضرورت ہے اور اس بات کا تعین کرنے کے لیے کہ آیا بی آر ڈی 4-این یو ٹی پروٹین کی حد سے زیادہ اظہار شدہ جین مصنوعات میں سے کوئی بھی بی آر ڈی 4-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین سے وابستہ نیوپلازم کی نشوونما اور/یا ترقی میں حصہ ڈالتی ہے، یا علاج کے لیے اہداف کے طور پر کام کر سکتی ہے۔ یہ سوالات نیوپلازم کی ایک وسیع رینج پر بھی لاگو ہوتے ہیں جو حال ہی میں دوسرے جینوں سے منسلک این یو ٹی ایم 1 جین سے وابستہ ہیں۔ این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین این یو ٹی کارسنوما این یو ٹی کارسنوما سے وابستہ نیوپلازم ایک نایاب، انتہائی جارحانہ بدنیتی ہے۔ ابتدائی طور پر، یہ سمجھا جاتا تھا کہ یہ اوپری سانس کی نالی، اوپری ہاضمہ کی نالی، اور میڈیاسٹینم (یعنی۔ نوجوان بالغوں اور کم حد تک بچوں اور نوزائیدہ بچوں کی چھاتی کی گہا کا مرکزی ڈبہ)۔ اس لیے اسے این یو ٹی مڈل لائن گرینولوما کہا جاتا تھا۔ تاہم، بعد کے مطالعات نے ان کارسنوما کی وضاحت ان کے مہلک خلیوں میں این یو ٹی فیوژن جین کی موجودگی کی بنیاد پر کی۔ جیسا کہ بیان کیا گیا ہے، یہ بدنیتی ہر عمر کے افراد میں ہوتی ہے اور، جب کہ عام طور پر حوالہ شدہ تنفس، معدے اور درمیانی علاقوں میں ترقی ہوتی ہے، کبھی کبھار تھوک غدود، پینکریاز، پیشاب کے مثانے، ریٹروپیریٹونیم (یعنی۔ پیٹ کی گہا کے پیریٹونیم کے پیچھے کی جگہ)، اینڈومیٹریم، گردے، بیضہ دانی اور دیگر اعضاء۔ نتیجتا، اس عارضے کا نام عالمی ادارہ صحت، 2015 کے ذریعہ این یو ٹی مڈل لائن کارسنوما سے این یو ٹی کارسنوما میں تبدیل کر دیا گیا۔ این یو ٹی کارسنوما کو ہسٹولوجیکل طور پر ٹیومر کے طور پر نمایاں کیا جاتا ہے جس میں ابتدائی ایپیٹیلائڈ خلیات ہوتے ہیں (یعنی۔ فعال میکروفیجز سے ماخوذ اور ایپیٹیلیل خلیوں سے مشابہت رکھنے والے) کیریٹائنائزیشن کے فوکیوں کے ساتھ مرکب (یعنی۔ ٹشو کے علاقے جو کیریٹن ریشوں سے بھرپور ہوتے ہیں) ؛ این یو ٹی کارسنوما کو اسکوایمس سیل کارسنوما کی مختلف قسمیں سمجھا جاتا ہے۔ مطالعات سے پتہ چلا ہے کہ ~ 66 ٹی پی 80 ٪ این یو ٹی کارسنوما میں بی آر ڈی 4-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین ہوتا ہے جبکہ بقیہ این یو ٹی کارسنوما، جسے بعض اوقات این یو ٹی ویرینٹ کارسنوما کہا جاتا ہے، میں بی آر ڈی 3-این یو ٹی ایم 1 (~ 10 سے 25 ٪ معاملات) یا شاذ و نادر ہی، این ایس ڈی 3-این یو ٹی ایم 1، زیڈ این ایف 532-این یو ٹی ایم 1، یا زیڈ این ایف 592-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین شامل ہوتا ہے۔ یہ خیال کیا جاتا ہے کہ مؤخر الذکر فیوژن جین کم از کم کسی حد تک بی آر ڈی 4-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین سے ملتے جلتے انداز میں این یو ٹی کارسنوما کو فروغ دیتے ہیں۔ ایکیوٹ لیمفوبلاسٹک لیوکیمیا (ALL) مہلک B لیمفوسائٹس (جسے B-سیل ALL کہا جاتا ہے) یا T لیمفوسائٹس (جسے T-سیل ALL کہا جاتا ہے) کا خون کا کینسر ہے جو عام طور پر شیر خوار بچوں اور چھوٹے بچوں میں ہوتا ہے۔ تین آبادی کے نمائندہ کوہورٹ کے مطالعے میں، این یو ٹی ایم 1 جین کی تشکیل نو (یعنی۔ فیوژن جینز) بی سیل آل والے بچوں کے مریضوں کے 0.28 سے 0.86% میں پائے گئے۔ کل 71 این یو ٹی ایم 1 دوبارہ ترتیب شدہ معاملات میں، این یو ٹی ایم 1 کے 10 فیوژن پارٹنرز کی نشاندہی کی گئی: اے سی آئی این 1-این یو ٹی ایم 1 ((24 معاملات)، بی آر ڈی 9-این یو ٹی ایم 1 (10 معاملات)، سی یو ایکس 1-این یو ٹی ایم 1 (15 معاملات)، زیڈ این ایف 618-این یو ٹی ایم 1 (9 معاملات ؛ زیڈ این ایف 618 زنک فنگر پروٹین 618 جین ہے) فیوژن جین، اور (ہر 1 سے 4 معاملات میں) اے ایف ایف 1-این یو ٹی ایم 1، سی 17ورف 78-این یو ٹی ایم 1 (سی 17ورف 78 کو اے ٹی اے ڈی 5 بھی کہا جاتا ہے)، سی ایچ ڈی 4-این یو ٹی ایم 1، آر یو این ایکس 1-این یو ٹی ایم 1، آئی کے زیڈ ایف 1۔ ان این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین سے وابستہ لیوکیمیا والے افراد میں ان لوگوں کے مقابلے میں نمایاں طور پر بہتر تشخیص تھی جن میں این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین منفی بی سیل ایکیوٹ لیمفوبلاسٹک لیوکیمیا تھا۔ یہ خیال کیا جاتا ہے کہ حوالہ شدہ فیوژن جین ان این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین سے وابستہ تمام معاملات کی نشوونما اور/یا ترقی میں معاون ہیں لیکن اس کے لیے سالماتی طریقہ کار (زبانیں) نامعلوم ہے۔ کچھ HOXA جین، خاص طور پر HOXA9، ان NUTM1 فیوژن جین سے وابستہ تمام معاملات کے ساتھ ساتھ NUTM1 فیوژن جین منفی ALL کے معاملات میں بھی ریگولیٹ ہوتے ہیں۔ اس بات کا تعین کرنے کے لیے مزید مطالعات کی ضرورت ہے کہ آیا ایک یا زیادہ HOXA جینوں کا حد سے زیادہ اظہار NUTM1 فیوژن جین سے وابستہ B-سیل ALL میں حصہ ڈالتا ہے۔ پوروما اور پوروکارسینوما پوروما ایک نرم، نسبتا عام جلد کا ٹیومر ہے جس میں سیلولر خصوصیات پسینے کے غدود کی نالی سے ملتی جلتی ہیں۔ یہ ٹیومر عام طور پر تلووں اور ہتھیلیوں پر ایک تنہا ڈنڈے کے بغیر نوڈل کے طور پر ہوتا ہے لیکن یہ کسی بھی علاقے میں ہو سکتا ہے جہاں پسینے کے غدود ہوں۔ پوروکارسنوما (جسے ایکرین پوروکارسنوما اور مہلک ایکرین پوروما بھی کہا جاتا ہے) پوروما کا ایک انتہائی نایاب مہلک ہم منصب ہے۔ یہ ایک دیرینہ پوروما سے پیدا ہو سکتا ہے لیکن زیادہ عام طور پر کسی بھی پیشگی پوروما سے آزادانہ طور پر تیار ہوتا دکھائی دیتا ہے۔ پوروکارسینوما ٹیومر زیادہ تر بزرگ افراد کو متاثر کرتے ہیں۔ 104 پوروما ٹیومرز کے مطالعے میں بالترتیب 21 کیسوں اور 1 کیس میں وائی اے پی 1-این یو ٹی ایم 1 اور ڈبلیو ڈبلیو ٹی آر 1-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جینز کا پتہ چلا، جبکہ 11 پوروکارسنوما ٹیومرز کے اسی مطالعے میں 6 کیسوں میں وائی اے پی 1-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کا پتہ چلا۔ این یو ٹی ایم 1 (فیوژن) پروٹین کا اظہار 25 پوروما اور 6 پوروکارسنوما کے معاملات میں دیکھا گیا لیکن جلد کے ٹیومر کی دیگر اقسام کی وسیع رینج میں نہیں۔ کلچرڈ امر انسانی ڈرمل کیریٹنوسائٹ پر مطالعہ (یعنی۔ ایچ ڈی کے) اور ماؤس ایمبریونک فائبربلاسٹ این آئی ایچ-3 ٹی 3 سیل لائنوں نے پایا کہ وائی اے پی 1-این یو ٹی ایم 1 اور ڈبلیو ڈبلیو ٹی آر 1-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جینوں نے این آئی ایچ-3 ٹی 3 خلیوں کی اینکریج سے آزاد ترقی کو متحرک کیا اور ایک ٹرانسکرپشنل بڑھانے والے عنصر فیملی ممبر (یعنی۔ ٹیڈ فیملی) رپورٹر جین۔ ممالیہ جانوروں میں ٹیڈ خاندان میں چار ارکان شامل ہیں، ٹیڈ 1، ٹیڈ 2، ٹیڈ 3، اور ٹیڈ 4 جو نقل کے عوامل ہیں، یعنی۔ پروٹین جو مختلف جینوں کے اظہار کو منظم کرتے ہیں۔ ٹیڈ فیملی پروٹین مختلف قسم کے کینسر کی نشوونما، ترقی، اور/یا میٹاسٹاسس کو فروغ دینے کے لیے پائے گئے ہیں اور، ابھی حوالہ دیے گئے مطالعات کی بنیاد پر، خیال کیا جاتا ہے کہ وہ پوروما اور پوروکارسنوما میں ایسا کرتے ہیں۔ تاہم، اس ایسوسی ایشن کی تصدیق کرنے اور اس بات کا تعین کرنے کے لیے مزید مطالعات کی ضرورت ہے کہ آیا ٹیڈ فیملی ٹرانسکرپشن کے عوامل پوروکارسنوما کے علاج کے لیے مفید اہداف ہو سکتے ہیں۔ سرکوما مذکورہ بالا کارسنوما میں این یو ٹی ایم 1 فیوژن جینز کے علاوہ، حالیہ مطالعات میں این یو ٹی ایم 1 فیوژن جینز کو غیر متفرق اسپنڈل سیل، گول سیل، اور ایپیٹیلائڈ سیل جیسی خصوصیات کے ساتھ بدنیتی میں پایا گیا ہے جنہیں سرکوما سمجھا جاتا ہے۔ این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ سارکوما عام طور پر اے) کچھ جگہوں پر پائے جاتے ہیں سرکوما بصورت دیگر شاذ و نادر ہی تیار ہوتے ہیں اور بی) ٹیومر خلیوں پر مشتمل ہوتے ہیں جو این یو ٹی ایم 1 جین کو ایم اے ڈی ایس باکس جین فیملی جینوں میں سے کسی ایک سے جوڑتے ہیں (یعنی۔ ایک ایم ایکس ڈی 4، ایم جی اے، یا ایم ایکس ڈی 1 جین)، یا، متبادل طور پر، بی آر ڈی 4، زیڈ این ایف 532، یا سی آئی سی جین۔ ایک حالیہ جائزے میں درج ذیل این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین سے وابستہ سارکوما درج کیے گئے ہیں: کولوریکٹل سارکوما: چھ کیس، یہ سب ایم ایکس ڈی 4-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ ہیں۔ پھیپھڑوں کے سرکوما: چار معاملات، ایک بی آر ڈی 4-این یو ٹی ایم 1، ایم ڈی ایکس 4-این یو ٹی ایم 1، سی آئی سی-این یو ٹی ایم 1، یا ایم جی اے-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ۔ گردے کے سرکوما: تین معاملات، دو بی آر ڈی 4-این یو ٹی ایم 1 کے ساتھ اور ایک سی آئی سی-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ۔ انتہا کے سرکوما: پاؤں کے سرکوما کے دو معاملات، ایک ایم جی اے-این یو ٹی ایم 1 کے ساتھ اور ایک ایکس-این یو ٹی ایم 1 کے ساتھ (یعنی۔ ایکس اس بات کی نشاندہی کرتا ہے کہ فیوژن پارٹنر کی شناخت نہیں کی گئی ہے) فیوژن جین ؛ ران کے سارکوما کے دو معاملات، ایک بی آر ڈی 4-این یو ٹی ایم 1 کے ساتھ اور دوسرا ایم جی اے-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ ؛ اور بازو کے سارکوما کا ایک معاملہ بی سی او آر ایل 1-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ (بی سی او آر ایل 1 بی سی ایل 6 کور پریشر ہے جیسے 1 جین)۔ ہڈیوں کا سرکوما: ZNF532-NUTM1 فیوژن جین کے ساتھ مینڈیبل سرکوما کا ایک کیس اور CIC-NUTM1 فیوژن جین کے ساتھ عارضی ہڈی اور آکسیپیٹل ہڈی کے سرکوما (جو دونوں قریبی دماغ کے بافتوں میں بھی تھے) کا ایک کیس۔ دیگر مقامات: ہر ایک کیس: ایم ایکس ڈی 1-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ معدے کا سارکوما ؛ بی آر ڈی 4-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ دماغی پیریٹل پرانتستا سارکوما ؛ ایم جی اے-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ دماغی ڈیورا سارکوما ؛ سی آئی سی-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ کھوپڑی کا سارکوما ؛ سی آئی سی-این یو ٹی ایم 1 جین کے ساتھ پیراورٹبرل سارکوما ؛ ایم جی اے-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ پھیپھڑوں کا سارکوما ؛ سی آئی سی-این یو ٹی ایم 1 جین کے ساتھ ایپیڈورل سارکوما ؛ سی آئی سی-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ دماغی لیٹرل وینٹریکل سارکوما ؛ سی آئی سی-این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین کے ساتھ عام طور پر، ان این یو ٹی ایم 1 فیوژن جین سے وابستہ سارکوما کی تشخیص بہت کم ہوتی ہے اور ان کے متعلقہ سارکوما کی نشوونما اور ترقی میں ان فیوژن جینوں کے کردار کا تعین کرنے کے لیے مزید مطالعہ کی ضرورت ہوتی ہے۔ حوالہ جات کروموسومل غیر معمولی تغیر شدہ جین جین اظہار انسانی پروٹین