Very short patch repair
بہت مختصر پیچ (وی ایس پی) مرمت ایک ڈی این اے مرمت کا نظام ہے جو 5-میتھائلسیٹوسین کو تھامین میں ڈیمینیشن کے ذریعے پیدا ہونے والی جی ٹی عدم مطابقت کو دور کرتا ہے۔ یہ نظام اس لیے موجود ہے کیونکہ گلائکوسیلیز جو عام طور پر ڈیمینیٹڈ اڈوں کو نشانہ بناتے ہیں وہ تھامین کو نشانہ نہیں بنا سکتے (یہ ڈی این اے میں باقاعدہ چار اڈوں میں سے ایک ہے)۔ نظام کے اجزاء میوٹس ہیں، جو جی ٹی بے مطابقت سے جڑے ہوتے ہیں، وی ایس آر اینڈو نیوکلیز، جو ڈی این اے کو کاٹتا ہے، اور میوٹل، جو یو وی آر ڈی ہیلیکیس کو بھرتی کرتا ہے۔ وی ایس آر (بہت مختصر پیچ کی مرمت) اینڈو نیوکلیسیس مختلف قسم کے بیکٹیریا میں پائے جاتے ہیں۔ وہ کاٹ کر کام کرتے ہیں، یا اس کے بجائے، ڈی این اے میں نک بناتے ہیں اگر بیس جوڑی تبدیل یا خراب ہو جاتی ہے۔ فنکشن ڈی این اے کے بنیادی جوڑوں میں تغیرات حیاتیات کے لیے نقصان دہ ہو سکتے ہیں۔ خاص طور پر، سی سے ٹی تغیرات اکثر سائٹوسین کی میتھیلیشن کی وجہ سے ہوتے ہیں۔ لہذا، وی ایس آر اینڈو نیوکلیز میں خلیات کو تغیر پذیر ڈی این اے کی وجہ سے ہونے والے نقصان سے بچانے کا کام ہوتا ہے۔ میکانزم وی ایس آر ایک ٹی جی مماثل بیس جوڑے کو پہچانتا ہے، جو میتھیلیٹڈ سائٹوسینز کے بے ساختہ ڈیمینیشن کے بعد پیدا ہوتا ہے، اور یہ تھامین کے 5 'سائیڈ پر فاسفیٹ ریڑھ کی ہڈی کو الگ کرکے ایک ہی اسٹرینڈ پر ایک نک بناتا ہے۔ پھر ڈی این اے پولیمیرس I 3 'اسٹرینڈ پر ٹی اور کچھ نیوکلیوٹائڈز کو ہٹا دیتا ہے اور پھر پیچ کو دوبارہ ترکیب کرتا ہے۔ مزید برآں، اگر مرمت نہ کی جائے تو جی ٹی کی عدم مطابقت سی-ٹو-ٹی منتقلی کے تغیرات کا باعث بن سکتی ہے۔ وی ایس آر جی پر مشتمل اسٹرینڈ کے حق میں عدم مطابقت کی مرمت کرتا ہے۔ ایسچریچیا کولی میں، یہ اینڈو نیوکلیز تھائمیڈائن کے باقیات کے ساتھ سی ٹی (اے ٹی) جی این یا این ٹی (اے ٹی) جی جی کی ترتیب کے اندر ڈبل اسٹرینڈڈ ڈی این اے کو ختم کرتا ہے، جو 2 '-ڈیوکسیگانوسین سے مطابقت نہیں رکھتا ہے۔ چیرا مماثلت پر منحصر اور اسٹرینڈ مخصوص ہے۔ ساخت وی ایس آر کی ساخت پابندی والے اینڈو نیوکلیز کی بنیادی ساخت سے ملتی جلتی ہے، جس میں 3 پرتوں والی الفا/بیٹا/الفا ٹوپولوجی ہوتی ہے۔ وی ایس آر میں تین خوشبودار باقیات (فی 67، ٹرپ 68 اور ٹرپ 86) ہوتے ہیں، جو ڈی این اے کو موڑتے ہوئے اور دونوں تاروں کو الگ کرتے ہوئے بڑی نالی میں آپس میں ملتے ہیں۔ این-ٹرمینل ڈومین پروٹین اور کلییوڈ پروڈکٹ کے درمیان تعامل کو مستحکم کرتا ہے، اس طرح نک کو ڈی این اے لیگیز سے ڈی این اے پولیمیرس I کی آمد تک محفوظ رکھتا ہے۔ حوالہ جات پروٹین خاندانوں کی ڈی این اے مرمت